2WMXA

Crystal structure of checkpoint kinase 1 (chk1) in complex with inhibitors
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
263
structure length
248
Chain Sequence
EDWDLVQTLGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Identification of Inhibitors of Checkpoint Kinase 1 Through Template Screening.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
total genus 77
structure length 248
sequence length 263
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wmxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wmxA01
1A48A 3QALE 2WAJA 2V55A 3AT2A 4QP1A 4EOMA 4ZY5A 2W1ZA 5FEDA 2HCKA 4LOPA 3GFWA 4P5ZA 4BZOA 5FDPA 5AP1A 2GNIA 4NEUA 2NRUA 2ZDTA 3CC6A 4TYHA 2XBAA 4CKJA 3AQVA 2W1HA 2WMSA 2WQNA 3OBJA 3MI9A 4CRLA 2QOBA 1PJKA 2HXLA 3EQPA 3LXNA 3MN3A 3R63A 2CGWA 2VU3A 4CFUA 3OW4A 2ZV9A 3TZ8A 4UV0A 4O7RA 5DIAA 3ID6C 3GCPA 5E1EA 5EYCA 3WZUA 3RAHA 3RVGA 4IXPA 2C3LA 3QCQA 3D2KA 4RVTA 5EHYA 2WMVA 4O0YA 5LXMA 1R3CA 1MUOA 3CTHA 3KVXA 3MYGA 4M8TA 1U54B 4FSZA 5DGZA 5A6NA 3PJ2A 2YISA 2FVDA 3VJOA 4CFXA 3VBTA 4ASDA 5EG3A 3LXPA 4YHFA 4MQ2A 4JLCA 2IVTA 3UG2A 5L2IA 1GY3A 4FTUA 4APCA 5FBNC 2R3LA 3REPA 1UU8A 4PMTA 3QKKA 3ZO2A 3EYHA 2XK8A 1VYZA 4MKCA 4S31A 5CLPA 1W0XC 3T9TA 5KBRA 5L2TA 3WF9A 5G1XA 4RC4A 1FINA 3HMMA 3L8VA 2V7OA 3FLSA 4BVUA 2R3NA 3RI1A 4EYJA 4E8AA 2BKZA 4MXAA 2J0JA 2HOGA 2CJMA 3OF0A 1ZARA 3ORPA 3HV7A 4BCNA 4DTKA 4H36A 3MTFA 4DYMA 3JY0A 3KEXA 2BPMA 4PQNA 3QZFA 5LARA 4BBFA 5JRQA 4BTMA 2VX1A 2C1BA 3Q4CA 5C8KA 2PVYA 4YC6A 4EL9A 5E9EA 2QODA 4FTIA 4FSTA 3ZYAA 2W06A 5M06A 4KS8A 3WILA 3FI4A 5DR2A 2CNUA 4O84A 3GU8A 3MBLA 1HCLA 5TO8A 4ZLOA 2X9FA 2QVSE 4I5HA 3UP7A 4U41A 3V01A 2XP2A 3VUHA 5EK7A 2OF4A 3EOCA 3ZXTA 2YLFA 4W9XA 3UGCA 4F0IA 2CGXA 2B7AA 2XNEA 5CU3A 2RF9A 4RZWA 2WTKB 4BKZA 5IU2A 4DGGA 3GFEA 4AZTA 2QHMA 2IG7A 3UBDA 4S32A 4IB0A 4FV0A 2VTTA 4S33A 2C3IB 3Q2JA 4G3FA 4BDBA 2CKOA 4MVFA 5CNOA 3D9VA 4V0GB 4DEDA 4CKRA 5ANKA 3KN6A 5AR2A 4CKIA 2ITZA 3FMEA 2C0IA 3DY7A 4EK5A 3WZEA 3ENHA 4MNFA 4NTTA 4QQCA 5HE0A 2PPQA 4CQGA 4AZFA 4FSQA 3LFDA 4NM0A 3MJ2A 5EM8A 1VZOA 4CG8A 4FG8A 3QHWA 4IW0A 4FI1A 4H1MA 2PVKA 2R7IA 3IK3A 4L8MA 4FGRA 4DH1A 4B99A 2I40A 4YHJA 5A14A 3O96A 1J1BA 3MFRA 4FOBA 2WMAA 5DNRA 5EQYA 4USEA 4ZTLA 2WQMA 2QHNA 2X8EA 1DAYA 4M84A 3V5JA 2J5EA 2OU7A 2WTCA 4JIKA 4XV3A 3CPCA 3Q9ZA 2RSVA 4G3GA 2XK7A 3OS3A 5DE2A 4YSMA 5IMEA 3D5WA 2BRNA 2OO8X 4TN6A 2I0EA 2J0MB 2HENA 3BHHA 4FVRA 3CCNA 3ELJA 2OJ9A 2C5VA 3POOA 2V22A 3UQGA 4D9UA 3WARA 5K3YA 3N4VA 1BL7A 3PY3A 3C4FA 4BIEA 3BLRA 3ZSHA 3BELA 3LHJA 3HRFA 5I3RA 3TACA 3MB6A 1OKWA 3P7CA 4Z9LA 4CV9A 4F7NA 4LGGA 5L2WA 5IA0A 2F2CB 5LOHA 2Y0AA 4U80A 4ZTMA 1ZLTA 3W8LA 1BUHA 2XZSA 4I0RA 4ZY6A 3R83A 4BCOA 3U6JA 5K5XA 5HKMA 4FNZA 3ZSIA 4UN0C 4FKWA 3R7GA 1Z9XA 3FLWA 4HYIA 4AW2A 3DAKA 4GL9A 4OTIA 4FGBA 3R1QA 3UZPA 3FV8A 1FVTA 2C5XA 3QYZA 1PXIA 4TYGA 3LXKA 3RAKA 2XKFA 3DK6A 3Q3BA 1OM1A 2FYSA 3THBA 3QLFA 4KA3A 3V8WA 4FSNA 3ZFYA 2XEZA 4EOOA 1OVEA 2VWXA 2NP8A 5CSVA 2FSMX 4OTPA 1TVOA 5GZ8A 2UZTA 3ZONA 2C3KA 1Y91A 5GHVA 4C36A 3FY0A 3GCUA 4GIHA 4P5QA 4DN5A 3ETAA 3PXQA 4GKIA 3MS9A 4F7LA 2BAKA 4QMSA 5HICA 3RM6A 3TG1A 2VRXA 4WOVA 5GINE 5FTOA 4J8NA 2GPHA 2XNOA 2W4KA 4HOKA 4ITHA 4IANA 4K33A 3B2TA 2JKOA 5JGAA 1YOMA 4TYHB 3WF7A 3QQKA 1WCCA 4ZOGA 4BKJA 4ANQA 1OKZA 4IB3A 5DT3A 1W7HA 4X6QC 1CKPA 4K11A 3OT3A 4L00A 3NUYA 2HZ4A 4MYGA 4RWKA 3VBYA 5D9HA 2PHKA 4F65A 3R7IA 5HTCA 1UV5A 4PDOA 5GJFA 4F0GA 2G15A 1IR3A 5CQWA 5EKNA 3ROYA 2VO6A 4NW6A 4NZWB 2XKEA 3H0ZA 4RVLA 4XG8A 4QTEA 4IX6A 4EBVA 3LMHA 2OW3A 4FIJA 2BDFA 1YXSA 4DH8A 5EDQA 3VS6A 1ZY5A 5L6OA 2ZM3A 5D1JA 2QNJA 5B0XA 3QRUA 2JAMA 3UMXA 2E9PA 1NVSA 1BYGA 5BPYA 2WKMA 3CD3A 3CY3A 3G9NA 4FV3A 4CFVA 3ENMA 2R3OA 4DCAA 3G90X 2DWBA 4CZYB 1PMUA 3PIXA 4O2PA 4F08A 5F20A 3TUDA 2C69A 4BF2A 1KV1A 2Z8CA 2UW5A 3JPVA 2WTIA 2JLDA 1Y8YA 2EWAA 3CKWA 2GTMA 2OLCA 4J97A 5CI7A 2G2HA 1YKRA 4OBOA 5E8ZA 5HG7A 2H6DA 3QUEA 3R7OA 4AGCA 5BX0A 5IG1A 2C1AA 1W83A 3HDMA 3LJ2A 1ZZ2A 1PXNA 4FSRA 3CQWA 3RZBA 1PXKA 5EM6A 3OTVA 1LR4A 2Z7SA 5CZIA 5AR4A 4OAVB 2C47A 1KE8A 2QU6A 4TWNA 2A19B 4HCTA 5F94A 5TF9A 5A46A 4NFMA 2UZVA 4HNIA 3OW3A 1PMEA 1CKIA 5ANGA 3G5DA 4EKLA 4Z7HA 3EN6A 4AN9A 3R8PA 1U4DA 3IOKA 5BUEA 1M52A 3FMJA 5D41A 4AA5A 5C26A 4YZCA 3EQFA 4MXZA 5M4FA 4C02A 4X3FC 3NGAA 1LUFA 2WQEA 2X6DA 4QYEA 4QP6A 2RFSA 3IOPA 1S9IA 3E63A 3F82A 3NIZA 1ZMVA 4UMPA 4J8MA 5AR5A 3UMWA 4A4OA 5FQDC 4JDHA 3R73A 4IEBA 2VAGA 1KE5A 5JRSA 3GVUA 2YIYA 2CN5A 3QZIA 4FX3A 4CYJA 4MHAA 4PPAA 2YLEA 3RNIA 3CQEA 2W1FA 3W33A 2ETKA 4C59A 5C8MA 4C4FA 3BWJA 4W4YA 3VS2A 3W2CA 3BYVA 2VO7A 2QO9A 5IQAA 4MWIA 3TL8A 4I0TA 3GU6A 3MVJA 2QKWB 4HPTE 2WPAA 1UNGA 4IAFA 4TNDA 1O9UA 1JPAA 2VTMA 3OCTA 5CEQA 4E6QA 3BYSA 4QTDA 3VF9A 5IA1A 3PWDA 3SOCA 3DV3A 3IDPA 3VUMA 2ZOQA 4K8AA 4HVGA 1URWA 3TNPC 2QG5A 3G33A 4YO6A 4GT5A 4IDTA 4FKRA 4AGDA 5CT7A 4L44A 5HE3A 3TEIA 3F3TA 4AX8A 3FEGA 5HLPA 4WIHA 4OGRA 3UPXA 4RWLA 5M4IA 4K9YA 4D2WA 4O7LA 4J96A 2VGPA 2YJSA 5DEWA 3KVWA 1A9UA 3FMLA 2EXEA 4GIIA 2J90A 2XNBA 3SKCA 2A2AA 4HPUE 2JKQA 5FEQA 2HZ0A 3QXOA 4WRGA 4O7YA 1WZYA 5JQ5A 4ZJJA 2GFCA 3T3VA 4RJ5A 3BGZA 4A7CA 4CMUA 1G8AA 3PLAE 3AD4A 5H8EA 4YLKA 3SXRA 3Q4ZA 4X3FA 4DF3A 4XNEA 2Q0BA 5IEYA 3KKVA 3HRBA 4D1SA 1XBCA 3ODYX 3ORMA 3H3CA 4TYEA 4O0SA 4QP4A 2OXYA 2QO7A 2XKDA 2JBOA 2BZIB 3OBGA 4GRBA 4JQEA 3EH9A 5E92A 5FTQA 1PXJA 3K5VA 5DFPA 4E3CA 5AV4A 4GK3A 2WXVA 3A61A 3ORNA 4AN3A 4IBMA 3DJ7A 5M56A 3C4XA 1YHSA 2G01A 5M44A 5CF6A 1H24A 4QMYA 3W55A 3UOHA 4PDSA 3BU3A 1JKSA 3EWHA 1LEWA 3NUXA 3HMOA 5FUTA 3QQUA 3Q60A 1NXKA 2P0CA 1K2PA 3GP0A 4XYFA 5AUVA 3R9HA 3AC4A 4EH4A 1H1PA 5CU6A 3HEGA 5IA5A 2Z7LA 5DR9A 5BQ0A 3PPZA 2VWBA 2PVNA 5EI8A 2WMBA 4XMOA 1OL1A 1KE9A 4YP8A 4YO4A 3SX9A 4MNEB 3G6GA 3FZOA 3MH2A 2ITQA 2RFEA 3ATTA 2IZTA 3NCGA 3PPJA 3SOAA 1VJYA 4FZDB 5A4LA 3FYKX 4RA5A 4RX9A 4BGGA 2ONLA 1U5QA 3FLNC 4XHKB 2PZRA 2HK5A 3QL8A 5IPJA 2IWIA 5H8GA 3FBVA 5FDXA 4QNYA 2XK6A 3AOXA 5GZ9A 5CU0A 2QG7A 3QYWA 4K1BA 4DT9A 5E8YA 5KMIA 4JIAA 4JVGA 5IQEA 4EOQA 4BN1A 2ITPA 1NA7A 3BHVA 3E8DA 3H9OA 3PY1A 3WYXA 3KRXA 4HVHA 5BVKA 3VW6A 1Y8GA 3FLQA 4MF1A 1GZOA 3D14A 3I79A 4IM0A 4AOIA 2GFSA 3OXIA 2GS6A 4PTGA 4YZDA 2RKUA 4U3ZA 2YABA 4E1ZA 3OUKA 4DFUA 1BL6A 2B9HA 3LQ3A 3KB7A 4ID7A 4ITIA 3SQQA 4J52A 2Z7QA 3QQGA 2I7QA 3G0FA 4MD9E 3VUGA 3TIYA 3LJ0A 2QLQA 5IQHA 4NM7A 2IW8A 3GCSA 4XS2A 4TZRA 4RIWA 3PVWA 3GEQA 3R7YA 3ZLSA 5EQEA 4FEUA 4FSUA 3FI8A 4ZSJA 3WF8A 3R8MA 1KOAA 4YZBA 5BVFA 1FQ1B 1Q8YA 2O5KA 4IAIA 5HOAA 3TKUA 3PVBA 4RIYA 3RM7A 3O2MA 2VNWA 4RLKA 3PSDA 4OTRA 3WIGA 1B38A 5ETFA 4O0UA 4GT4A 4UXLA 4C37A 1QPDA 3BEAA 4QRCA 4AW1A 2GNHA 5B2MA 3PUPA 3E62A 4XX9A 3NNUA 4YBKA 3WBLA 3L9NA 3I6WA 4ACMA 1HCKA 4LL0A 4V04A 5I3OA 2OBJA 2ZB0A 3DKGA 5CZHA 4ALWA 4EOPA 2GNJA 4GK2A 4WT6A 2VTAA 3NCZA 2W7XA 4RT7A 3MY5A 4AT5A 3Q4TA 4O7SA 2UVZA 2WIHA 3QQLA 5ACKA 4JX3A 2WQBA 3N9XA 1JKKA 3E88A 4FKOA 3MGYA 1X8BA 4N70A 4U45A 1YDRE 3D0EA 4G31A 3A8WA 2WOUA 2WU6A 2Y4PA 2NPQA 3QD2B 4PPCA 5HIEA 1PY5A 3UVQA 4HGSA 3KRLA 5M51A 4PL3A 2JEDA 4ACGA 5A54A 3QWKA 3VNTA 4YJOA 2JIVA 4E4NA 4D4VA 4Q5HA 2YIXA 4DH7A 3R7UA 3W1FA 3KL8A 3QX4A 2QOKA 4BCIA 4XG6A 5H9BA 3VUKA 4AZEA 2HIWA 4CTBA 4AQCA 2YM7A 2PUNA 3DK3A 1CMKE 2F2UA 1JOWB 2X2LA 4U6RA 5AP5A 3BLHA 1H1RA 4UBAA 5B2KA 4QMUA 3HYHA 4AUAA 2WMWA 4R3RA 5CEMA 4YZ9A 2GS7A 3BYUA 2EB3A 5EQPA 1U5RA 4O21A 4LL5A 3DKFA 1JQHA 3R04A 4QMVA 3UDBA 3WZKA 3D5VA 3AC3A 1M7QA 1YI6A 1LEZA 4II5A 2QOOA 4O38A 4OTHA 3DZQA 1W98A 3OTUA 1U46A 4EQCA 3ORLA 4FSYA 4O7VA 4UYNA 4IIRA 4WO5A 2XIXA 4HZSA 5DRBA 4O22A 2R0IA 2HZNA 5LWMA 4CZUA 4USFA 1Q24A 1PHKA 3AXWA 4U3YA 3AG9A 2XM9A 3DQXA 3C13A 3TV4A 3F2NA 2UZBA 3U6HA 5M08A 5IA2A 2DYLA 3LPBA 3P5KA 1YRPA 4HCUA 2A1AB 3E8EA 4X3FB 3NR9A 5HE2A 3CPBA 4C3FA 4E5AX 4RMZA 4ZJIA 4LMNA 1QL6A 3AC8A 3EN4A 2VX3A 4Y5HA 3COMA 5AP2A 3UOLA 5LVMA 4A4XA 2CCIA 4FTCA 4JAJA 5FWKK 4FUYA 2WTJA 1NT2A 3F3UA 2OI4X 4O91A 1H26A 3LE6A 1DI8A 1BX6A 4UWBA 3CY2A 4KNBA 4CFNA 4JG8A 5EKOA 1YXTA 2PUPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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