2WOTA

Alk5 in complex with 4-((5,6-dimethyl-2-(2-pyridyl)-3-pyridyl)oxy)-n-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyridin-2-amine
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
GGTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Rapid Generation of a High Quality Lead for Transforming Growth Factor-Beta (Tgf-Beta) Type I Receptor (Alk5).
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords TGF-BETA RECEPTOR TYPE-1
total genus 101
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2009-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wotA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wotA01
4GRBA 4ACGA 4QP6A 3RK9A 4J7BA 2VTTA 5A54A 4GJ3A 3KXMA 1Q3DA 4FTAA 5EOLA 4NM3A 3S0OA 3WZKA 3A7GA 3DDQA 5AP3A 2YFXA 3CGFA 4Y46A 3VUDA 4FTLA 3H9RA 2QOLA 2VTMA 4KIQA 5KZ0A 3ULIA 3W8LA 4FEQA 4WRGA 1H8FA 3TEIA 2J51A 1YXXA 3CLYA 4CQGA 2C69A 4M12A 3I1AA 4E20A 4FV2A 3FXWA 4I0SA 4TPTA 3MY5A 4Y73A 4AU8A 1ND4A 3R2YA 3ROYA 3ZM4A 4JQ7A 3BELA 2C6MA 5IQFA 3ENHA 2JFMA 3Q6WA 4M67A 3P5KA 1Y8YA 2PVMA 1BI7A 5KMOA 5DVRA 4Y5QA 5DRDA 5AP2A 2XKCA 2BDJA 5HIEA 4QMLA 4GT5A 3EZVA 2XP2A 3LFFA 3W2CA 2QONA 1WZYA 4QYGA 3FXZA 1K2PA 3ZMMA 3NSZA 4QMSA 2JITA 4PP7A 3BHVA 1ZZLA 3CGOA 4EHGA 1ZYSA 4M66A 4CZTA 4ZZNA 4HOKA 4FZ6A 2ONLC 4YJPA 4TL0A 1GIIA 4LOOA 5FG8A 3NS9A 3I4BA 5BX0A 5BVDA 5BUEA 5A4CA 5CEKA 2YITA 5KMJA 5HE3A 3HEGA 3ZRMA 4GK2A 4QP3A 5KMLA 3P79A 4IFGA 3A8WA 4CTCA 3VRYA 5AP5A 3EFLA 4HVDA 2XYUA 3OFMA 2WU7A 5TE0A 2J0IA 5AA8A 5JFXA 3LCDA 4FIJA 1UV5A 3M1SA 3OWKA 3PJ8A 5I9YA 2CLXA 4EHZA 3OWLA 4A06A 2B7AA 4BDKA 5HCZA 3DBDA 4KINA 5HESA 3MV5A 5B0XA 2J90A 3BGZA 5HTCA 3OY1A 1U5RA 4O27B 2CNUA 5L6PA 4J8NA 1MRYA 4FEVA 3FKOA 3KKVA 2C6DA 3IW4A 2YAKA 1JWHA 5A46A 1XQZA 5EKNA 5IA0A 2OG8A 4L68A 3NAYA 1XH9A 2PL0A 3D94A 4GK4A 4AN3A 4FSWA 3E3PA 3LCOA 2WOTA 2UW7A 3ACJA 2JFLA 4NM7A 1GJOA 5IDPA 2BPMA 3A7FA 1OI9A 3UPZA 4FICA 3PE1A 2W1GA 1Q24A 3ORNA 4WNOA 1OPLA 5D1JA 5DWRA 5CNOA 1ZYDA 2P3GX 3IGGA 4OUCA 3UP2A 5K4JA 4WG3A 3DBCA 5L6WL 3VIDA 4E93A 2YDJA 3DXNA 4AN2A 4G5PA 5IPJA 3KRWA 3Q6UA 4O38A 4WA9A 4F63A 2ITYA 3CE3A 3CKXA 4EC8A 4I94A 5ANJA 4PDYA 4RIYA 3ZO1A 4E3CA 4MAOA 1BI8A 4UWYA 4GUEA 3F3TA 2C1AA 3FHIA 3MN3A 2BMCA 2HIWA 4EC9A 5TT7A 4MVFA 5DOSA 4MXAA 2OJJA 2YJRA 3P1AA 4RWJA 3VHEA 4OBQA 4DFNA 3C0GA 3PXZA 1YHWA 5CSPA 2R7IA 3RPYA 3A99A 3NNUA 4A9RA 5HVKA 4F1TA 3AMYA 5BVEA 3RP9A 2JIVA 4I4EA 4G3DA 4IFCA 3FZ1A 3LFCA 4TT7A 5H8EA 4LMUA 1Z9XA 3UOKA 2VGOA 3MY0A 4X2GA 5FDPA 2E9UA 2WMAA 3R9RA 2BHHA 3UTOA 5IQGA 4S31A 3BBTB 3P9JA 2PSQA 5DEWA 3AGMA 4DFUA 3KK8A 3ZEWA 2UZWE 5K0KA 3S1HA 3ZYAA 4YLKA 3OW3A 4R5YA 4RGJA 4XLVA 4CYIA 1UWHA 1WBOA 4RPVA 4HCTA 2HXLA 4RWIA 2JGZA 5HO6A 2ZM3A 5CU4A 3ZRKA 4BVUA 4DEEA 5EQYA 3D5XA 3TV4A 3ZBXA 3VO3A 4PDSA 3V6SA 4O7VA 3HUCA 2ZDTA 2PVNA 4I6QA 1J91A 1KOAA 3BU6A 1YXUA 1SVEA 5A6NA 4EZ5A 2G2HA 5IA4A 3FQEA 3AOXA 3NEWA 4TYHB 4FV4A 4BCHA 4R3PA 4RRVA 3UNKA 1PMNA 1W82A 4FT5A 3E3BX 5AIKA 1Q3WA 3R7YA 2B55A 3G9NA 3TNQB 5AR5A 3W32A 3ORPA 4NJ3A 3AQVA 1JQHA 4E26A 4QD6A 3TWJA 4FNWA 1Y57A 2WTKB 2P33A 3D2IA 4PNKA 3JS2A 3R22A 5AV1A 1FMOE 4D2TA 5JGAA 3TM0A 4LG4A 4BCPA 5CVHA 2I0EA 3EFJA 5EM7A 4K18A 3I0QA 4FT3A 2QOIA 2VU3A 3GI3A 1XBCA 3QKLA 5AAGA 3PPZA 4O84A 3RTPA 1YI4A 3F9NA 1GOLA 3QTIA 4P5QA 4P5ZA 2XK4A 1ZLTA 2WMUA 5A4TA 4PMPA 4HW7A 4AOJA 5L6OA 1M2RA 3PVGA 3VHKA 2R64A 2BROA 2VWVA 2PPQA 5EYDA 2YISA 3GGFA 2P2HA 3NCGA 2IW8A 3QXOA 1RW8A 3HMNA 2Y4IC 2BKZA 3CTHA 4P7EA 4MD7E 4I5CA 4CMTA 4R1YA 2ERZE 3FMHA 3Q4TA 3NPCA 3Q9ZA 2JLDA 1DS5A 3IDBA 5E92A 4M0YA 4BYJA 5GZAA 2C6EA 3I79A 1HOWA 2FSLX 2PE0A 2ACXA 5AM7A 5LMAA 3UBDA 3ETAA 4OTQA 1ZMWA 4A9SA 3BQRA 4ZSJA 3NAXA 3TV6A 2JD5A 3SOCA 4QPAA 4IM0A 3QD3A 3MJ2A 4KIKB 2ETKA 4PTEA 1SZMA 1SMHA 3A60A 4TW9A 3V5QA 4AGUA 3NUNA 4WSYA 5CZHA 1ZOHA 4KD1A 2R3PA 5L8KA 2PVYA 1U59A 4EK3A 1K3AA 4FEUA 2WFYA 5IQDA 3QZFA 4QP1A 2R2PA 5LJJA 1R78A 5IKWA 2FSTX 4YZDA 4DEGA 1FINA 2PTKA 3I5ZA 1YHVA 2YJSA 4PL5A 1J7IA 4KNBA 4NFMA 2WEIA 5AP4A 4QMNA 3AMAA 4Y95A 4FL1A 4UZDA 3CBLA 2B4SB 3R8UA 3T3UA 2J0KA 3ERKA 1KOBA 4JAJA 4OR5A 4W4WA 1ZRZA 4N0SA 1WBWA 4XP2A 3RGFA 5J1VA 4DF3A 2J50A 2PZIA 4R7HA 4F7LA 2VWYA 3OXTA 2CKQA 1CKPA 3ZFYA 2ITUA 4YC8A 3SW4A 2F9GA 3Q4CA 2PUPA 5CF4A 5E4HA 3V5WA 3SQQA 3EMGA 4CTBA 4ENYA 1YKRA 2QOFA 5AFVA 4IW0A 1Z57A 3LFAA 3UVPA 3AMBA 4AT5A 4BDJA 2LGCA 1REJA 2UZDA 3TIZA 3LCTA 3QHRA 3VAPA 3ZBFA 3R9HA 2BRGA 3ORZA 3CP9A 2P2IA 4WHZA 4J8MA 4DC2A 3L9PA 3QRUA 1YW2A 5K5NA 3CD3A 3ZC5A 2VWZA 1YI3A 3HMIA 3UZPA 1UU3A 4FZ7A 4IQ6A 4W8DA 3QLGA 3UQCA 2VTQA 4GU6A 4QPMA 3QD2B 2XK9A 5K3YA 1PRYA 2O5KA 4EH2A 2Q0BA 3MA6A 4TYHA 1H07A 2BAKA 3ELJA 5H8BA 4DN5A 1F0QA 4A9UA 4EK5A 4G3GA 2QLQA 3MVJA 4FC0A 1WBSA 3BPRA 3EQHA 4BL1A 4A9YA 5CAQA 3IW8A 2W5HA 4ZLOA 3A61A 3FLYA 3VQHA 5M4CA 4TYGA 2DUVA 4TYIA 3U8WA 2WMVA 3VF9A 2UZOA 3QQUA 3GFEA 4H3QA 4YTIA 2XRUA 4QYYA 1JBPE 3FSFA 2QOCA 3CPBA 2OJFE 2YABA 4NH1A 5EFQA 4AF3A 4U45A 3OOMA 3RPVA 5JZJA 1LEZA 2XIZA 4K77A 4L01A 4DH5A 5LVNA 5IUIA 4WKQA 3GC9A 3UE4A 2OZOA 3LFBA 3W2OA 5CXZA 4F9AA 2XZSA 1O6YA 1XO2B 3P0MA 3R8VA 4EJNA 1OZ1A 2XCHA 4W9WA 1UU8A 3HA6A 3NGAA 4NT4A 3OS3A 4EBWA 2BRNA 2W4JA 4B0GA 2X9FA 4XG9A 3IG7A 3VS2A 4E6CA 2PMLX 4OTPA 4BIDA 2XK3A 4RJ7A 5CVFA 4EQUA 4FV9A 2NO3A 3UDBA 3CSVA 2ZMCA 2BZHB 5DE2A 4YLJA 3R04A 1J1BA 3RWQA 1QMZA 1AGWA 3OCSA 4LYNA 3UNJA 4K8AA 4IAZA 1PXLA 3ZSGA 3Q60A 3PJ1A 3FV8A 3MTFA 2PMOX 4I92A 1NXKA 1ERKA 2ZAZA 3QX4A 4KKEA 3HKOA 3K3JA 5DR2A 5EQEA 2XIYA 1GNGA 3I7CA 2EWAA 3E7OA 3OEFX 2EB3A 4PPAA 4HYHA 3MH0A 3LXLA 4GEOA 4JOAA 3TACA 4DEDA 4G17A 4XOYA 3SC1A 3IECA 5CEMA 2OF4A 4USFA 5F9EA 1IEPA 3QQJA 1L8TA 3CQUA 2BTSA 2A4LA 2QHNA 4HVGA 2RKUA 4BTMA 3JXWA 4C38A 4FEXA 2F2CB 3NDMA 4AA5A 4BDIA 5HBJA 5DYJA 5DHJA 2OIDA 4GIHA 4HGSA 4I3ZA 3T9TA 4C4FA 2OFVA 2W7XA 1A9UA 3OVVA 3DU8A 3SLSA 2WHBA 3LHJA 4BBMA 3EQBA 5BUIA 2QKWB 3T3VA 1F5QA 4ORKA 3M11A 2A2AA 1BUHA 3EQPA 4RLLA 4DFXE 4E6AA 2C6TA 4EH8A 4WNMA 2CGVA 3FY0A 4UEUA 3T9IA 1XJDA 2RFSA 1W7HA 3KXHA 2OJGA 3PA3A 3G33A 4L43A 4U7ZA 5CY3A 3O8TA 3AGLA 3QZGA 5EH0A 2YAAA 4J96A 3BRBA 2B9IA 3OOGA 3NWWA 2W4OA 4LI5A 3UC4A 4U8ZA 4FV6A 4AFJA 5EYKA 1H08A 1H28A 3GU5A 3Q4UA 3QRJA 4BCGA 4RVKA 3G6GA 4YJOA 2BR1A 5EHOA 1E1VA 2XRWA 3GU4A 3IONA 4DH7A 3KB7A 2C3KA 1M17A 4N4SA 3N51A 4X7QA 4YBJA 4PNIA 1CKIA 4ZS0A 3N9XA 4LFIA 4F1OA 1WMKA 1XH4A 3VC4A 2RFEA 4L7FA 2YEXA 2UZVA 4FIGA 4RVLA 3WF9A 5CQWA 4R6VA 1S9JA 2X2MA 5FEEA 5AR8A 4QT1A 4XMOA 4XP3A 5CT7A 3UO4A 4O7NA 2YHVA 1FPUA 2BFXA 3UVQA 1T46A 3MDYA 1FGIA 4ZTHA 2QC6A 4BHZA 3BLHA 3QBNA 3OZ6A 2C6LA 4IX4A 4PV0A 1YRPA 4D55A 4Z16A 5IQAA 4R7BA 2FA2A 4M69B 1XKKA 4MQ2A 1ZYLA 5K0XA 2PUUA 3LFQA 1RE8A 3F5XA 3ODYX 3UIMA 3SXRA 2XA4A 5M4UA 3OY3A 2VWBA 4YSJA 1PW2A 4AOIA 3R71A 5DLSA 4ZS4A 2Z7RA 4JQEA 5M09A 3PUPA 5HBEA 4CG8A 3IK3A 1U4DA 3MBLA 4FOCA 3QD4A 4NUSA 3C0HA 3NVKI 5CEIA 3ZCLA 3AXWA 3PYYA 4C8BA 4PDOA 3SHEA 4QMTA 5AV4A 4I6HA 5G1XA 4MEDA 4XUFA 2WQEA 2PE1A 4NM0A 3FPQA 4EOOA 4BGHA 4II5A 2WTDA 4RQKA 1JSTA 4RJ3A 3KVWA 5HNBA 2WMSA 4TWPA 4CT1A 4AN9A 3QXPA 3GOKA 5GHVA 1W98A 4DINA 4V05A 3G15A 1CTPE 3IQ7A 2VTPA 4TKSA 4AZEA 3A8XA 5JQ8A 3ACKA 4LGGA 4D1XA 5JMSA 3W33A 5EM5A 4X3JA 4DG3E 3LCSA 4I0RA 1ZWSA 3KRLA 3MB6A 4S33A 3DK3A 3TUDA 2IWIA 5D9HA 3TZ9A 4ASDA 4WG5A 2VO6A 1SYKA 4AZWA 3HZTA 2PVLA 3R1SA 3JVSA 2B1PA 4IZYA 5ICPA 4XCUA 2GHLA 3PRIA 4KA3A 4L46A 5FM2A 4FMQA 4Q9SA 5HVJA 3VS6A 2CDZA 2BIKB 4NJDA 3UG1A 4TNDA 3W10A 2VX0A 5EDPA 4IAIA 1PKDA 5JEBA 2WMXA 4EOKA 3GCUA 4IMYA 4NM5A 3GFWA 4MNFA 4TYJA 4U79A 4YBKA 1IAHA 2ONLA 5CSXA 4B99A 3A4PA 5CX9A 1AQ1A 4IVBA 5ANOA 5E7RA 3DB8A 1P2AA 4OBOA 5I9ZA 5CF5A 5M44A 4BCQA 4BDEA 4E5WA 1TVOA 2V62A 4PRJA 1YDRE 4ALVA 4GVJA 2JDTA 3O96A 4BDHA 5DFPA 2G9XA 3KL8A 4O81A 3HYHA 4QYFA 4YUQA 2Y4IB 4FV3A 3ZO3A 5LMKA 3BV2A 3MESA 4G5JA 5C8KA 2IN6A 4C2WA 2B52A 4YR8A 3FMKA 4U81A 2JBPA 5AUVA 1KE6A 5AUUA 3O17A 3D0EA 5EK7A 4CQEA 2BFYA 4IAFA 3OUNB 4CFVA 4ALUA 5D11A 4A7CA 1H1RA 3MPAA 4UMUA 4CFNA 1OUKA 3SD0A 3TG1A 3PSBA 4QMPA 5G6VA 4CLJA 4FSNA 1H0VA 3KCFA 1OKYA 5AR2A 2ITWA 3CXWA 3DV3A 4QQCA 4BCMA 4LQMA 3MH2A 4D5HA 4A07A 4OW8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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