2WTKB

Structure of the heterotrimeric lkb1-stradalpha-mo25alpha complex
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
371
structure length
311
Chain Sequence
SFLPEGGCYELLTVIGKGFEDLMTVNLARYKPTGEYVTVRRINLEACSNEMVTFLQGELHVSKLFNHPNIVPYRATFIADNELWVVTSFMAYGSAKDLICTHFMDGMNELAIAYILQGVLKALDYIHHMGYVHRSVKASHILISVDGKVYLSGLRSNLSMISHGQRQRVVHDFPKYSVKVLPWLSPEVLQQNLQGYDAKSDIYSVGITACELANGHVPFDMPATQMLLEKLVPCLFSPHFHHFVEQCLQRNPDARPSASTLLNHSFFKQIKRRASEALPELLRPVTPITNFEGSQSQDHSGIFGLVTDWEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Lkb1-Strad-Mo25 Complex Reveals an Allosteric Mechanism of Kinase Activation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CALCIUM-BINDING PROTEIN 39
molecule tags Transferase/metal-binding protein
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 311
sequence length 371
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wtkB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wtkB01
1V0BA 3RM7A 4EC9A 1W82A 3S0OA 1JSTA 5D7VA 3L9MA 2WMRA 3JXWA 2W96B 3QU0A 2PE1A 2GHGA 5JK3A 4FKIA 3COHA 3KA0A 3VRYA 3OCSA 4RVMA 3I5NA 3MH2A 2VWWA 2OXDA 1O6YA 4AGWA 4BBMA 2ONLC 1TQIA 4JIKA 2QOKA 2C6MA 2W1CA 3F61A 4RIWA 5DI1A 4ZTHA 5HKMA 3MS9A 4I24A 5IQBA 3R63A 3ZEWA 1NA7A 3IKAA 4R7IA 4UMRA 4XLIA 5A6NA 1Q61A 4RIOA 4E4XA 3CD3A 2BVAA 3TJDA 4FSNA 3VW6A 4RT7A 4M97A 4I22A 3A7HA 5L4QA 3V8TA 1Z5MA 3AMYA 3TEIA 3O8PA 4H3PA 2OGVA 5HU3A 5IDPA 5KKRB 3MTLA 2X2KA 2C6OA 3GC0A 3PXQA 3QTRA 3A2CA 4QTBA 3WZEA 3BQCA 4MNEB 4C0TA 2CLXA 1OKWA 4UB7A 5A4EA 2C6KA 3K5UA 4FEWA 2ITVA 2R0UA 4TNDA 1YWNA 3K3IA 3FUPA 3NUXA 4HPUE 1OM1A 5K5XA 3GCPA 3NNXA 3SOCA 2XCHA 5KHWA 3QBNA 5AADA 4JNWA 3ACKA 4DEBA 4W9XA 2X7FA 2YIXA 4ZS4A 5C03A 5CNOA 1WBPA 1Y8YA 2QOBA 4YC8A 5JT2A 4FV3A 5M4FA 4C38A 2P2HA 2YITA 3F3UA 4L46A 2AUHA 2A4LA 3KCFA 4YU2A 1ZZ2A 5L8LA 5HNBA 3ZU7A 2OH4A 1W83A 4FBXA 1MRYA 3FQHA 4W4WA 3FLYA 4B9DA 1PMVA 3F88A 4BCFA 4ITJA 4Q5HA 3D9VA 3FI4A 5E8XA 4O7RA 2ZM1A 4QMYA 4DE4A 2RIOA 5HI2A 3ET7A 4K77A 4ARKA 4GT5A 4U79A 2C6LA 2QU6A 4GIIA 2UW8A 1V0OA 3CBLA 2W05A 5IG1A 2V5QA 4K8AA 4XBRA 2IZUA 4G3DA 1FVRA 1M7NA 3QTSA 4XG4A 4YJRA 4ZMFA 3TV6A 4XV9A 3E87A 3PP1A 3E8DA 4XG7A 2EU9A 4RIWB 2RGPA 4QTAA 4J52A 4QMQA 2HAKA 1BI8A 1SM2A 4IVBA 1OUYA 2C5OA 5I9WA 2HW6A 2UZDA 2CGWA 4RC3A 5HIBA 3RHXA 2REIA 1X8BA 3IONA 2WMSA 4W8DA 4BCMA 4U9AA 5DPVA 1YVJA 2W1EA 3BKBA 3PZHA 3QUDA 3UO6A 1YWRA 4TWNA 1NVSA 2C6IA 2I40A 3RJCA 4C3PA 3KXGA 2BUJA 4FV9A 3ORZA 1OB3A 4AZTA 5TE0A 2CSNA 2PMLX 3OP5A 5AA8A 2BPMA 1U5QA 4D5HA 3IGGA 3QQFA 2C3JA 4CFFA 4LRJA 5EHOA 3FLSA 3JR1A 3WYYA 3HV7A 3F7ZA 4FSWA 3WE4A 2J0KA 4NTTA 4TPTA 5FTQA 2PUIA 3QCYA 3HUCA 5LJJA 4ZLYA 5IA0A 4O0VA 4NM0A 2WTDA 4CCUA 4E6DA 1BL7A 3E5AA 3UMWA 2J4ZA 5CS6A 3NWWA 1Q8YA 3TJCA 2WB8A 3U4WA 4A07A 4UMUA 3F3TA 3ORIA 5DIAA 1GZNA 1AGWA 2ZV8A 5HCZA 2YISA 3EYGA 3HUBA 3RPYA 5ICPA 5C4KA 3VULA 3PY0A 1XHAA 3FZRA 3GC8A 2XP2A 3C4CA 3K2LA 3R9NA 3Q9ZA 4BFMA 4PDPA 3R30A 2F49A 5D11A 4IC7A 3E92A 4BGGA 2I0EA 4Y95A 4EYMA 2HCKA 4EKLA 3MPTA 2BDJA 1XH4A 2UZBA 3LQ8A 1FPUA 3P7CA 4I5CA 4XS2A 3V51A 4DLIA 1PXIA 2OG8A 3UQCA 4RX8A 1V1KA 3AC2A 3UOKA 1H25A 2PVLA 4ZTQA 3WZDA 2RKUA 3OMVA 1WCCA 1TKIA 2WELA 1APME 4OTWA 3EN5A 4EOSA 1GZOA 1S9JA 2XKCA 3ZXTA 3DZOA 3C0HA 4L53A 4WA9A 3OG7A 5HTCA 2XK9A 3PY3A 2BDFA 3MY5A 4FKUA 4M14A 3EQFA 4D5KA 2RL5A 4G2FA 4FVQA 4P5ZA 4LUDA 4PMTA 3DV3A 3LCDA 4AGUA 2W1ZA 2PUNA 3C7QA 2B9IA 3FSFA 4AE9A 3P79A 5J87A 4IBMA 3R1NA 3GC7A 2WMAA 4K18A 4FTKA 3LCOA 2X9FA 3I5ZA 3KCKA 3SOAA 3WIGA 4CCBA 2BZHB 4EH3A 5L2IA 4EK6A 4CG8A 4MKCA 1UNHA 3MVLA 4FSMA 3N4UA 5AUTA 5AAGA 5CF5A 5E4HA 4RG0A 4EQMA 4I41A 2B9JA 3KEXA 4TRLA 3N51A 2OIBA 2R7BA 3IS5A 2CDZA 2ZV7A 2VU3A 4GFOA 4ZXTA 1PXLA 3F82A 3MH1A 3LJ1A 3KVXA 3UG1A 4OTIA 3AD4A 4FSRA 3W1FA 1V0PA 4XNEA 4PUZA 2QLQA 4HYIA 5KZIA 3DAEA 4FL2A 3ZYAA 3EL8A 2PVRA 3LFCA 2WHBA 4U80A 3VS0A 3TCPA 3WZJA 4DFYA 3JUHA 3BGQA 1QPDA 2OBJA 5L3AA 4GW8A 1H0VA 3TV7A 4FVPA 3VUMA 5TF9A 4DH8A 2X4ZA 1YDSE 4MHAA 2WMVA 4X2KA 5DR2A 3EH9A 5C1QB 4FTOA 4E6AA 4DEIA 4GS6A 3OW4A 2LAVA 3MIYA 4HZRA 5LVOA 3QF9A 4IH8A 5FTGA 4CLIA 2R3MA 1CKIA 3M2WA 5DEYA 5CTPA 1TVOA 4MD7E 4RFZA 3ITZA 3A7IA 3CEKA 5KZ0A 2XRWA 3QLGA 5HHWA 4GG7A 2JDRA 3NVKI 5J9ZA 2C6EA 2X81A 2YCQA 3DKFA 3OOMA 1IAHA 3AQVA 4ITIA 4Q9ZA 5AV4A 3SG9A 2JBOA 3MFUA 4DH5A 3WF7A 4QPMA 2JIUA 4QMOA 3UDBA 4DYMA 3GXLA 3HRCA 4MNFA 2GDOA 4GG5A 3KXZA 3PXZA 2YAAA 4FTQA 4FV8A 3FZOA 5CI7A 5HVKA 4G16A 4U3YA 4IFCA 2Q0BA 4NJDA 3L9PA 4KBCA 5DT0A 2FVDA 4ZTRA 3T8OA 3ZRLA 4AA5A 4DGOA 5A4TA 5I9ZA 4A9SA 2XEYA 4Y83A 2ITOA 3E7VA 3PPKA 4OLIA 2VTMA 5LVNA 2R3JA 3ZSIA 4O96A 2NPQA 2GNGA 3TUBA 4BHNA 3NLBA 1XBAA 3GU7A 5HCXA 3EFLA 3QTZA 2PVYA 2PULA 1OL1A 5IEXA 2VX3A 4DITA 4F0FA 1O9UA 3HRFA 4PP7A 4CTBA 4YBKA 3H10A 3QA0A 2W1FA 5KBRA 2IW8A 1WVXA 4RGJA 3T9IA 3CGOA 4IM0A 4L52A 5BVDA 3ZLSA 4DINA 4EZ5A 1Q24A 4AW1A 5J5SA 3NUAA 3BPRA 4D2VA 5A6OA 4C62A 4AU8A 5IF1A 3R8UA 3R71A 5GINE 5L8KA 5KMMA 3HMMA 3E3PA 3IDPA 3DOGA 4ALVA 4ANMA 4EUUA 4R78A 3DB6A 5JFVA 3HECA 5JQ8A 4I6QA 5ACBC 4FUXA 4Z9LA 2YIRA 3RHKA 2QOFA 4IX6A 3O7LB 3I79A 3EFJA 4RLLA 3NRMA 1VJYA 2G01A 2J0IA 3AC5A 2H8HA 3QALE 4XEYA 5IQCA 3IW5A 2G15A 3UE4A 2W0JA 2XNMA 4DN5A 5IQIA 5LCJA 4DCAA 4BBFA 5J9YA 1B6CB 4GJ3A 4YR8A 3NVMB 2NRUA 3FXWA 5TOZA 3BYSA 4NKSA 2R3QA 3PA5A 1OITA 3QUPA 3MVJA 3OTVA 4U7ZA 1HCKA 2PE2A 4NUSA 5AR8A 2YFXA 3KL8A 1KV1A 2ZAZA 2QURA 4FZFB 4DG0E 3QGWA 1GY3A 4I92A 5AV1A 3QRKA 1LP4A 4ZZOA 1R0PA 3O50A 2YCSA 3KRRA 3VBWA 5CAVA 3HP5A 5GJFA 3OXTA 5M4UA 2AYPA 4AW0A 2EUFB 4FEUA 2OXYA 3G2FA 5F4NA 1ZMVA 3RP9A 1DI9A 2QO9A 3OZ6A 2XNPA 3F2RA 3ALOA 4FIIA 1KE6A 4EOKA 5E8VA 4JBVA 3GOKA 4C2WA 3COMA 4BCGA 5E8TA 2C0IA 3LXNA 5HG7A 4AUAA 4WNMA 1YI3A 3LFAA 3EZRA 1ZMWA 3BV3A 4OTHA 2G2IA 5HBHA 5JQ5A 3EQRA 4GFGA 5EM6A 2HY81 4OTGA 5HIDA 3UIBA 4FKPA 4ERWA 3FZPA 2H9VA 4XHKB 5AUUA 3LFEA 5IISA 1Y6BA 1SNXA 2V7AA 3EN4A 4F7LA 3NW7A 3Q3BA 5KKRC 4AFEA 4YC6A 4OTQA 5I4NA 3PRFA 4CT2A 3FAAA 4MF0A 5F95A 3ZO1A 4A9TA 3DKCA 3SHEA 5IH6A 5EHLA 1W84A 5IH4A 4I6HA 3QQJA 3CR0A 3UVPA 5M06A 4O1OA 2CGXA 5CU3A 1YHWA 4O1PA 5AIKA 5IMXA 1REJA 3O8UA 3ZH8A 3DBQA 3U55A 3EB0A 1ZLTA 4ZOGA 2PVKA 4L3PA 3FZSA 1M14A 3E8NA 3KK9A 3RM6A 3ROCA 1ZOGA 3FV8A 3HL7A 3I0OA 4AS0A 4ZJVA 1AD5A 5A4LA 5BNJA 3DTCA 3Q96A 4G9CA 5CZHA 4EK8A 1WBOA 3WOWA 2R3NA 1I44A 4YPDA 3ZXZA 3IW6A 3R8PA 2ITQA 3Q9YA 3OEZA 3PXKA 3FEGA 2JKOA 3R8LA 2XYUA 1R0EA 1H28A 4ASDA 1UKIA 3OXIA 3TM0A 5HE3A 3BELA 4KKHA 5CSPA 1RE8A 2WIPA 3FQSA 4JJRA 2UUEA 2PVMA 4TYHA 3TACA 3A7FA 2OICA 1ZAOA 3D4QA 2HWPA 5AR3A 5FP6A 2X6EA 5EQPA 5M4IA 5IQFA 3LM0A 3VUTA 2QOOA 1YWVA 4HVDA 2XBJA 3MBLA 3HYHA 4K2RA 4D28A 3R28A 5D41A 4RWKA 3SXFA 3OT8A 1ERKA 4G6NA 2XIXA 3R83A 4WSQA 4O7ZA 2QKWB 4QYHA 4RWIA 3QCSA 3FXXA 3CXWA 3E8CA 3WBLA 5C27A 2JITA 3EQBA 3UOLA 4ZY5A 3ZLXA 2YIQA 4HGSA 2GNIA 2IVSA 3ZM9A 4TT7A 4D4VA 4B7TA 3VBTA 4Z7GA 3AGMA 1A9UA 2GNFA 3F3WA 5EW8A 2PZIA 4O27B 5E8SA 3ZFYA 4XP3A 5L6PA 3NMUF 4YJOA 3ZM4A 2IN6A 2C0TA 1JKSA 2ZVAA 3W33A 3P86A 4JR3A 4RX5A 3NIZA 3PE2A 5E92A 5IQHA 4FT0A 5EYDA 4I0TA 4FTMA 4IM2A 4WNKA 2BRMA 1DI8A 1ZOEA 2ZMCA 3W18A 2ZM3A 4HYUA 4J8MA 4MQ1A 4OTPA 4I4EA 4YLKA 3PG3A 5AP1A 5M55A 1J3HA 2VGOA 2VZ6A 4JG6A 4BN1A 3TTJA 4CYIA 4EK5A 4DTBA 1PKDA 3KF7A 4L8MA 3CCNA 3LIJA 3PG1A 3GQLA 2VN9A 2FH9A 3F9NA 3MPAA 4PMSA 4FKJA 3S2PA 1PMEA 3TG1A 2XIKA 2WQNA 3LFFA 4PF4A 3ZONA 4BDEA 3OCGA 4CKJA 2PK9A 4H36A 4E73A 4EHZA 2BTRA 5ETAA 4ZY4A 3QX4A 3DDQA 3HNGA 4TYHB 4BR3A 2B9FA 2GHLA 4I3ZA 3FI8A 2YM7A 4M13A 2WMQA 3AT4A 3R2YA 4GU9A 5J8IA 4FTAA 3Q4ZA 1G5SA 2PE0A 2QCSA 5CENA 2IVTA 1PKGA 2VTQA 2VWYA 2W9FB 3VS2A 4FV6A 2J0JA 4AOJA 5KHXA 3CQWA 2CKQA 3PIYA 2GQSA 3GGFA 4QMZA 3R22A 4KRCA 2XNEA 3QCQA 3QD0A 3UYSA 4IX4A 1E1VA 4RA5A 3O96A 1OBDA 3VF9A 4CKIA 4YBJA 5BYLA 4C7TA 5JGDA 4IB3A 3GBZA 1JKTA 3MGYA 5AP5A 4S34A 4FZ7A 5CI6A 2VTNA 5AUVA 4F6UA 3ZRMA 4CYJA 4K33A 3V5PA 2EXEA 3QXOA 4QMPA 5AUYA 3FLWA 2QOIA 2YM5A 1UV5A 3LQ3A 3FMDA 1WBNA 3Q6UA 5AFVA 2PVHA 3R8ZA 2JGZA 4BGHA 4LRMA 2RFDA 1H07A 2YLFA 3L8VA 2R7IA 3NSZA 4ZEGA 1Y6AA 1FMKA 3DK6A 4FV4A 4U6RA 5FM2A 4IC8A 1IA8A 4EH4A 3Q53A 2QONA 2VTJA 3ALNA 5CAUA 1QL6A 2YA9A 3UGCA 2OXXA 2XK7A 3BLHA 3EKKA 4JQ7A 4I1ZA 4MQ2A 3G15A 5CSWA 3DKOA 4DGLC 4O81A 4U0IA 4BDKA 3EFWA 4QP2A 3Q32A 4USEA 4CEGA 3GB2A 3KXNA 4JIAA 5I0BA 3GU4A 2PWLA 2PL0A 3GQIA 5FLFA 2CKPA 2XRUA 3Q9WA 4V05A 1PXKA 2J0LA 3UBDA 3Q4UA 4HZSA 4LL5A 2YEXA 3ZSGA 3SV0A 4HYHA 3EN6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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