2X7GA

Structure of human serine-arginine-rich protein-specific kinase 2 (srpk2) bound to purvalanol b
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
368
structure length
344
Chain Sequence
PVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAELLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Human Serine-Arginine-Rich Protein- Specific Kinase 2 (Srpk2) Bound to Purvalanol B
rcsb
molecule keywords UNCHARACTERIZED PROTEIN SRPK2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 344
sequence length 368
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2x7gA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2x7gA01
3CS9A 4ZLZA 4DCAA 5T3QA 1Q8TA 4JQ8A 4PX6A 3L9NA 4ZK5A 3U51A 3VS3A 4A4XA 3MVHA 4EHVA 3PZHA 5LMKC 1R3CA 2C5YA 4FICA 4R78A 3OFMA 3RPYA 5KMJA 2ETMA 4K9YA 4UMUA 3Q32A 2YACA 1OIQA 3KCFA 3PIYA 2FSLX 4OTHA 5JH6A 1XR1A 3QHWA 4FF8A 4QTDA 5HOAA 4ERWA 3OS3A 3M11A 3QCSA 4FOCA 2UW3A 5LVNA 1FVVA 2B4SB 2RL5A 5CT0A 5AP6A 4YZBA 2FSTX 4JT3A 5E1EA 5M09A 5F20A 4NWMA 5TOZA 3MH1A 4XJ0A 2DWBA 1ZZLA 4EEVA 2WTIA 2C6DA 5HGIA 3C50A 5L6WL 3HRFA 3MV5A 3E93A 2GHLA 3O0GA 4M67A 2EWAA 1VR2A 4PDSA 3OCTA 2ITPA 3W2CA 4F7JA 3ELJA 2CNVA 3GCUA 1IG1A 2OO8X 3UYSA 2O8YA 3UPXA 4D2SA 4CQEA 1PW2A 4O86A 3NLBA 1Q3WA 3DKFA 4IW0A 3PJ2A 5E8XA 5AV4A 2W9FB 3CJGA 2QODA 2R3MA 2EUFB 2QOKA 4AZTA 4IDVA 5CEOA 3OCBA 3OWLA 4M0ZA 5CEPA 2C5VA 4MD7E 2UW7A 4YJVA 5ANOA 4MHAA 5TO8A 5DGZA 4XRJA 4EQUA 2NRUA 3FLYA 3MFTA 4BWXA 5H3QA 4CVAA 3PDTA 3QRJA 5TF9A 2UZOA 4MH7A 3WZJA 3KN6A 4ZXTA 4BI0A 3QQUA 2W0JA 4X3FC 1XHAA 4BCMA 1ZARA 4BCFA 3AT4A 3NIZA 4NIFB 2EXMA 5IEXA 4PMMA 5HE0A 5JSMA 4QMNA 2BR1A 5HO6A 4FV8A 4XOZA 4EL9A 2FO0A 4W4WA 3NRMA 3MFRA 5AUWA 1PJKA 3A7FA 3HMNA 5A6NA 3CCNA 5H8EA 2QOOA 3O17A 2W1IA 4RWIA 5M06A 2YCFA 4TWOA 2IN6A 5IH5A 5CF5A 2X4FA 4XEYA 3RHKA 1REJA 2E9NA 3QYWA 4JR7A 1PMVA 3ZXTA 1L3RE 5IG1A 1U59A 2QC6A 3IPHA 5ANKA 4HVSA 4FSQA 4QP1A 3HEGA 1ZAOA 3WF5A 4O0RA 5CAQA 5L2SA 5DIAA 4X7QA 4B9DA 1YHWA 1JQHA 3RJCA 3TKUA 2C1BA 4QP2A 2QOQA 4AG8A 1H08A 1BL6A 3LKMA 4S33A 4U6RA 4C33A 2ZB0A 3IECA 1H1SA 4MX9A 4FT3A 2WU6A 4U5JA 2OF4A 3UODA 4FNXA 3FEGA 4O7YA 5FGKA 3JVSA 5I9ZA 5BVFA 4WO5A 4HVIA 1H01A 2P2IA 2W4OA 3I5NA 2OKRA 1E9HA 3FL5A 1SNUA 3E8EA 2UZDA 3C7QA 1E1XA 4A9UA 3B2TA 5HZNA 3I60A 5HQ0A 3R02A 4N6YA 2IW9A 4YGAA 5HE2A 4G5JA 5I0BA 4EONA 3SRVA 3SGCA 4C4FA 2Y4PA 4OAUC 3F3TA 2YCSA 2IO6A 3HP5A 4U7ZA 5DT0A 2I7QA 3UIBA 1LEZA 5CQUA 3MY0A 4FGBA 2B9JA 1WCCA 5KZ0A 4CCBA 5HLPA 1IAHA 3HMOA 1B38A 4LOQA 2QONA 5E91A 3R9RA 2OSCA 4PTCA 4I6FA 4X6QC 3EN4A 4E93A 3AGMA 1M2QA 5CAPA 2Y6MA 3UZRA 4L01A 2VWZA 5L8JA 4EH5A 5L4QA 3UNKA 2YITA 3KC3A 5CAUA 2AC3A 3GGFA 3W2QA 4YR8A 3QF9A 3PP1A 1P4OA 2BRBA 4XV2A 3GBZA 1ZYSA 5DVRA 2VTJA 4LGHA 1U4DA 3FLNC 4CD0A 4EH9A 4CFXA 5DT4A 4DCEA 2WFYA 4EC8A 5CSWA 2QG5A 3RI1A 3LXPA 2C6IA 4QP8A 1OKYA 1T46A 2IVVA 3M42A 2PVMA 3CQUA 4WA9A 3R28A 5AR8A 3TIZA 5D12A 3C0GA 3PJCA 3WBLA 2BAKA 5D41A 2R3JA 2NP8A 5A4LA 3RNYA 3UTOA 4OAVB 4U44A 2VTOA 4TWCA 2C3JA 3ZU7A 4QPSA 5EYDA 4OUCA 1I44A 3GU7A 4YLJA 5F1ZA 3R7UA 4E6AA 5JFVA 4JS8A 2W99B 4C57A 2ZOQA 3WILA 5IQDA 3QL8A 1NA7A 5KO1A 4CRLA 4GIHA 4F65A 4IB1A 4TZRA 3LCKA 3ALOA 3DAKA 2P55A 2XS0A 5FRIA 3VULA 5BVDA 4J53A 3BGPA 4QP7A 4B6LA 1CSNA 2JIUA 4W4XA 3ZZEA 2BDFA 3D5WA 2XBAA 5KBQA 4OGRA 2W96B 1QPEA 5GNKA 4EUTA 4PL5A 4O2PA 3ZS5A 1Q3DA 1BL7A 5DHJA 4CKIA 3AD6A 2IZUA 3D7TA 4E5WA 5DMZA 3CC6A 4IWQA 2JKMA 4QP6A 2XRWA 1G5SA 1SM2A 2VWVA 3VBQA 3TM0A 5C4KA 3G0FA 2HXQA 4TY1A 2W7XA 4P5QA 2CGUA 1O6LA 3RAWA 4BVUA 4HVHA 5DPVA 2J4ZA 2XM8A 3QU0A 4FX3A 3OUNB 3UO6A 1KUTA 4QTAA 4WUAA 5A4TA 4WOVA 3HKOA 3RWPA 2IJMA 3R71A 3FMNA 2VNWA 1J3HA 3UG2A 2CHLA 3RZBA 5IH6A 1U5QA 3DOGA 4F0FA 1W8CA 3AC5A 3WF7A 2O3PA 1KE5A 3D5VA 4RLKA 5KMNA 2JITA 4O7TA 3PWDA 4M69B 1R1WA 3Q4TA 2PUUA 4BDEA 3UQCA 4B4LA 4F70A 4ACMA 3GU8A 1PMEA 4V01A 4KB8A 5J7BA 2BIYA 4C4EA 2Z60A 5FDXA 4OTFA 4CEGA 2R3GA 2XIRA 3FQSA 5HG9A 4RJ3A 4DEBA 2ITQA 4KBCA 5M55A 4DH8A 3HGKA 3MBLA 3MVJA 3ANRA 1XH9A 4JAJA 1WBOA 3ODYX 1V0OA 4Y46A 5CY3A 3R83A 4Y5QA 3SXRA 1U54A 2JDRA 3AT3A 3DQWA 2X9EA 3NAYA 3NYXA 1GJOA 4FTKA 5A4QA 3TKHA 4LG4A 2VD5A 3IDBA 2NO3A 5K3YA 4Z16A 4CG8A 2F9GA 4DBXA 5AM6A 3CY2A 3Q52A 4IC8A 4P90A 1P2AA 2XKEA 4N0SA 5EW3A 3VS0A 4O81A 1XO2B 3EKKA 4I41A 4XHKB 2CCHA 5E8ZA 5L2QA 2YIYA 3Q6WA 3OY1A 3MB7A 4KSPA 1OKZA 4KNBA 2BVAA 4NTTA 4JRNA 5CU2A 3E8CA 2EU9A 3NPCA 3U6HA 4XUFA 1UWJA 1PKDA 2PE1A 4WSYA 4QMVA 3QRTA 4GV1A 4ZOGA 4CMUA 5EQEA 3KRJA 4C4IA 4D0WA 3ORZA 3QFVA 2QOIA 5BYLA 4M0YA 4BTJA 4FKTA 4J98A 4BIBA 3BCEA 3PA4A 2ZAZA 1FINA 4QYYA 4UWYA 3C4XA 3U55A 4FV0A 4CLJA 5HLWA 3BBTB 3THBA 3KMMA 3BEAA 5LCKA 5C4LA 3TZMA 1OUKA 3VUHA 2Y9QA 4XYFA 2WMBA 4A9YA 1TQIA 3ZLSA 5A4CA 1PXMA 2VX3A 4BDBA 5AP3A 4ALUA 5HCZA 4RIWA 5KX8A 3DAJA 5FG8A 3EQIA 3IQ7A 4F9YA 1ZYJA 2VTSA 4RVMA 2A4LA 4C62A 4F4PA 3IG7A 3PJ8A 2AUHA 3FLQA 3JUHA 4ZS0A 4HGLA 4YNEA 1PYXA 3KXMA 3LCDA 3TKIA 3W16A 3FXZA 3DK6A 4L45A 4S31A 3ZLXA 4M15A 4U3ZA 2X39A 3VS7A 4CZUA 3WYYA 2Q0NA 4EKKA 2YZAA 4ZY5A 4RQKA 3DAEA 4O0XA 1UNLA 4NCTC 5ETAA 3VBTA 2PUPA 4B7TA 5HE1A 3CD8A 3ORPA 3GCQA 4GH2A 4NFNA 3COMA 4XNEA 2FYSA 3TCPA 1KE9A 4E26A 4APCA 4K11A 3K5UA 2CGVA 2JDSA 4L52A 1NXKA 4CG9A 2Y7JA 3R00A 2YN8A 2VWUA 3F5UA 3TTJA 4BIEA 3OF0A 4C02A 2R3PA 4C35A 3FXWA 4C7TA 4BKJA 4F08A 4L53A 3CQWA 2RFSA 3ET7A 4YPSA 4FZAB 4H3QA 4KSQA 3MH3A 3HVCA 3BYUA 4J97A 3OC1A 4QP4A 4EWHA 5AAEA 5LJJA 5DWRA 3FY2A 3R1QA 3R7GA 4YHJA 3BE9A 4AW1A 3ACKA 4KBKA 2W4JA 5D7VA 3FLSA 1OIYA 3OXZA 4LOOA 5DBXA 4ZTNA 2J0KA 2EB2A 4GVAA 1URWA 4YUQA 4KIQA 2LAVA 4AOJA 3QQJA 4UYNA 4DF3A 3AG9A 3EQFA 2OJGA 1XBAA 1IA9A 3G9LX 4KKHA 4NUSA 1H8FA 5FP6A 2RG5A 4O82A 4M12A 1IRKA 4IACA 5DH3A 3Q9WA 3R9HA 3V5JA 5BUEA 4YJPA 1KE7A 3D5UA 3MN3A 3BWJA 4UMQA 2G9XA 2XNEA 4QP9A 4AP7A 4BFMA 4EH4A 4ZS4A 4WG3A 3GCSA 3UDBA 4EOMA 2GTMA 1MRUA 2HAKA 4OBPA 3BHUA 4FTAA 2R5TA 2C6KA 5EM7A 3G2FA 4IZAA 3KXZA 3CTHA 2PVNA 2PVLA 3D14A 5C9CA 3ZSGA 5LMKA 2PUNA 5FUTA 2WOTA 1SVEA 2DQ7X 2IPXA 5EFQA 5AX3A 3H30A 3W2OA 4YC6A 4AQCA 4NM3A 3IW8A 3W8LA 4D1ZA 1FBNA 3IO7A 3SLSA 2J51A 3QQFA 2GQSA 1ZZ2A 3QUPA 5IQHA 2RIOA 3IDCA 5BX0A 5J5TA 4AT5A 4G3FA 3KN5A 2JD5A 3RAHA 4EOQA 5AA8A 2J0LA 4U0IA 4BHZA 4ZMEA 2V62A 2ITXA 3VUDA 1G8SA 5L6PA 2PULA 1YOMA 3ZUVA 3VS2A 3NS9A 3H10A 1YVJA 2WNTA 4ZJIA 4GT5A 4FBXA 4PWNA 4FEVA 3R0TA 5AAFA 4N70A 3N51A 3F3VA 3PRFA 4O6LA 5HIEA 2YM8A 2Z7SA 3C4EA 4FNZA 4AACA 1S9IA 4K8AA 4QNAA 4JR3A 2P33A 3R73A 4FKQA 4F09A 3KRRA 1WAKA 3OXTA 4ZLOA 2P3GX 4JNWA 2F4JA 1GOLA 3BYVA 4DH1A 4W4YA 5DNRA 4JBPA 4F9WA 3F2AA 3TTIA 4DFNA 4Z7HA 5CF8A 3SVVA 3BU5A 4NYEA 2QO7A 1TKIA 5CU4A 4FT7A 3V8SA 4A9RA 4CFMA 2CNQA 2YISA 1OL2A 2IG7A 4YC8A 3EQGA 3FMMA 3AQVA 4O0WA 4X3FA 2JAMA 3U87A 1YOJA 2PHKA 3VJOA 5BMMA 1Y6BA 5K9IA 5JK3A 4WRSA 4FV9A 2UZWE 1RJBA 4DEGA 3PXYA 5M53A 4DA5A 1YDTE 4NM7A 3E63A 3TZ9A 1BKXA 1YQJA 3ZRKA 3C0IA 3P4KA 5L3AA 3GFEA 3II5A 4AGWA 5HX6A 3DA6A 3RPSA 4PP7A 2OIDA 3V6RA 4NKSA 4I22A 3RNIA 4TYHB 5GJFA 1Q5KA 3MESA 4D28A 4EWQA 5DYJA 2VTMA 5J9YA 3Q9ZA 2EXEA 4BDFA 3KREA 5ANDA 4QP3A 4C3RA 1WBNA 2ITOA 3Q60A 4ANOA 2QOBA 3V5LA 3ZFYA 2ESMA 4RIYB 2XNNA 4P4CA 2BKZA 4AT3A 1H27A 4NJDA 3FLZA 4I3ZA 5JFWA 4RX5A 2PZRA 4DLJA 2JIVA 3NNXA 3IDPA 2HWPA 2HZNA 1BI8A 4QYHA 3TV7A 3OEZA 3CGFA 3RAIA 2BKKA 4IX6A 4YJRA 2C30A 3DJ6A 4BCHA 2GFCA 3P9JA 4MBJA 2QLQA 2F2UA 5J8IA 2PE0A 4D5KA 3QD2B 4RVTA 4CTCA 5GJDA 4HYUA 5AR4A 3FZPA 5DT3A 4H3BA 4I0TA 4IE9A 3NW7A 2XJ2A 4KIOA 4KIKA 1A9UA 3BU6A 3QLFA 3HNGA 4OBOA 3PP0A 2UZLA 3KMUA 5AIRA 3ORLA 3LQ3A 3DZOA 4IX5A 3F3ZA 2SRCA 3WZUA 3LXKA 5FLFA 2QD9A 4AOTA 3ZM4A 4K2RA 4K6ZA 4M68A 4FSZA 1ATPE 3R8LA 4OTGA 4Q9ZA 1I09A 3VS1A 3W33A 3NUXA 5EYCA 4AUAA 3SD0A 2ETRA 4BR3A 4R7HA 1FMOE 4CZTA 3WI6A 5CF6A 4FZ7A 4H39A 3P1AA 3M1SA 1XWSA 1WBSA 3B8QA 4FEQA 4JDJA 3ODZX 3UE4A 4MKCA 4IBMA 4XOYA 1NT2A 3GQLA 4O2ZA 4RX8A 3CSVA 2GSFA 3N9XA 5FXSA 4EI4A 3ORIA 3QAME 3RPRA 1GZ8A 4B0GA 1J7IA 2OH0E 5GINE 2QO9A 3SX9A 4PY1A 5H8GA 1UU8A 4ZLYA 3EQBA 4GK3A 5K0KA 4PDOA 3GVUA 2B7AA 2VTPA 4EQMA 3HAVA 2BILB 3NCZA 3ZXZA 4BTKA 1MUOA 5I3OA 3LCSA 3TXOA 5C1QB 4QQCA 3VS5A 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