2XYUA

Crystal structure of epha4 kinase domain in complex with vuf 12058
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
280
structure length
260
Chain Sequence
FAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPGKREICVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAFLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Fragment Based Lead Discovery of Small Molecule Inhibitors for the Epha4 Receptor Tyrosine Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 4,
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 80
structure length 260
sequence length 280
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2xyuA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2xyuA01
4BZDA 4FICA 4C34A 5FDXA 5GHVA 2ONLA 4X6QC 3R1YA 4CFMA 5J79A 5TE0A 2FB8A 2GTMA 3QA8A 1Z9XA 4NM3A 3HDMA 2QHMA 3EOCA 3LJ1A 3R71A 4R3PA 4KKGA 2R7IA 4YLLA 4ZEGA 1ND4A 5JRQA 3R21A 4BCPA 4MNEB 4QMQA 3ERKA 4UWBA 3ORPA 1OVEA 4KKHA 1PRYA 3FYJX 2F7XE 3BELA 3UNZA 3DQXA 3FC1X 2OK1A 3QHRA 3RNYA 2IVVA 2WMQA 5CYIA 4APPA 2RSVA 4GMYA 3IW4A 2VTRA 1KOBA 2AC3A 2JEDA 3FI8A 3UZRA 5I9XA 1G3NA 4PV0A 5K4JA 4BCQA 4FZFB 4TYGA 4B6LA 2XNEA 4X7QA 1LR4A 4G3GA 4QQTA 3THBA 5FRIA 2QVSE 3FQSA 3OOMA 2V62A 3OROA 3P23A 2ITPA 2R3FA 5EI8A 2ZDUA 3AC2A 1Y8YA 3NUSA 4CFWA 4RBLA 4NM7A 3OBJA 3DB6A 1OB3A 3GB2A 4O6LA 1OECA 4G34A 2VO0A 3A8WA 3KMUA 1G8SA 3EN7A 3UIBA 4D2WA 4NSTA 3VVHA 2BDFA 4FIGA 3ZSIA 3U51A 2ETRA 5JZNA 1XKKA 5HVKA 3O8UA 2OBJA 3FAAA 2WMRA 2VWVA 2HXQA 4FIIA 4NL0A 4FKIA 3FI3A 4O6EA 4FKGA 1E1XA 3ZSGA 4DBNA 5BUIA 3NVKI 2GQGA 5T3QA 4BFMA 3Q96A 4ID7A 3NYVA 1PKGA 4F4PA 4PP9A 2OIDA 3QC9A 3R9NA 3PPJA 5TR6A 4DCEA 4GRBA 2WEVA 5EK7A 4A9UA 1X8BA 5JK3A 2BR1A 4BCHA 2PE0A 2P2IA 3DKFA 3PPKA 4G9CA 1JKLA 4C3PA 3ATTA 3IW8A 4RWKA 2WAJA 1M52A 4D0WA 2A1AB 2I6LA 5HE0A 3KL8A 2PHKA 4NJDA 5EI2A 2OSCA 2VO7A 4S31A 4FTTA 2WMWA 2W7XA 1JSUA 2QR7A 1Y6BA 4RWLA 4QMMA 4HVIA 4L52A 4QP4A 4R78A 5KMLA 2OZAA 3EKKA 3ITZA 2PMOX 4P5ZA 4ZSJA 3RPVA 2PZYA 4OR5A 4AGUA 1XH9A 5CLPA 4YURA 5L2QA 4O0TA 4DGOA 3G33A 3IQ7A 5JSMA 4W9WA 2I40A 1ZZLA 4ANQA 5BMSA 5DN3A 4G1WA 1TKIA 4E4NA 5HTIA 1OZ1A 4FL3A 4FEUA 5L2WA 3BWFA 3TJDA 5CEQA 3FDNA 3ZH8A 1PXKA 1YOLA 4YC3A 3DA6A 5DA3A 4FX3A 5AR8A 4E5AX 3GC8A 4ZS4A 1JKTA 3NGAA 4ASEA 2C30A 2W1HA 4YJSA 3JY0A 4CFXA 4D5KA 4M3QA 3AT3A 5CSXA 2YLEA 3OCSA 2JIUA 4AZWA 1KOAA 3CY3A 3VBWA 2QODA 2UUEA 3VS4A 2GQRA 3D2IA 2UZTA 4L00A 5AM6A 1PMVA 2W1GA 5JGDA 3EQGA 1ZZ2A 3QZGA 5EW8A 2GSFA 2R3RA 3UC4A 1Q8UA 5AP0A 3ET7A 4B7TA 4DFUA 1VYZA 1ZMWA 2C5XA 4CVAA 4ITJA 2ESMA 3F3UA 4PPCA 4ZTHA 2NPQA 3DOGA 2OJFE 4DLIA 4ZY4A 2W05A 4JX3A 1YOJA 2X2LA 2WMUA 4EH5A 5BUEA 4BI2A 2OICA 1FBNA 5C4KA 5JRSA 3N51A 5CI7A 5HICA 4L68A 4NCTC 4E4MA 2WZJA 3R7GA 5JFXA 5J9ZA 4DHFA 3ZUUA 4Q5HA 2H34A 5H8BA 3DXQA 3LLAA 2UZVA 1VYWA 3WE8A 2XK6A 3QX4A 2CKEA 4F70A 3F88A 3F7ZA 4IX3A 5HHWA 3BHUA 2WHBA 5AUYA 2W0JA 3ZEPA 2Y4PA 4EEVA 4NCTA 2WU7A 4WT6A 5LJJA 3O23A 4YHTA 2CMWA 3HL7A 4EH3A 4X6RA 3A62A 3F2AA 3VUTA 4Q9ZA 5F4NA 4KABA 3A2CA 3KVXA 3IKAA 2WQMA 3CTJA 4GIIA 1OITA 1OBDA 3NX8A 3SHEA 4CQGA 4AGCA 4J7BA 1Q61A 5K0XA 5KUPA 4YJQA 4WNOA 3KKVA 2GS7A 4BY9E 4ACGA 3WZKA 3RNIA 3CQUA 4D2VA 2YIXA 3EKNA 4UEUA 5EI6A 4N6ZA 4CZYB 3CY2A 3OD6X 5EW9A 3QBNA 4XG3A 3BU3A 3D5VA 2VTOA 2GNIA 3GGFA 3ZZEA 3R6XA 3P79A 3IDCA 4TYIA 3GOKA 2PZ5A 2OJIA 4X21A 4GK4A 3AGLA 3W2RA 4YJOA 4R7IA 4M14A 4BIEA 3RPOA 5BUJA 3H10A 4YJPA 5DHJA 2J9MA 3LM5A 3P86A 4NWMA 3FXXA 4LQMA 2JFLA 4FEXA 5CF6A 3M42A 4RA5A 3ANRA 4NM0A 1XHAA 4FIJA 3F5UA 2VWUA 4MXYA 3UJGA 3W18A 4EOIA 2XJ0A 5LVLA 4OTPA 5EDRA 3VS1A 4E5WA 2CKPA 5KHWA 4RC4A 2R0IA 3PJ2A 2YZLA 4KWPA 4MH7A 5E8SA 2WTVA 5AR7A 5J1WA 3KRRA 5CSWA 3WILA 3VS3A 3U54A 4OBQA 2C0OA 2J0MB 3QALE 4FUXA 5K3YA 2HENA 5GINE 2XH5A 4YLKA 4K0YA 1YXSA 3RBWA 3PSDA 3OW4A 4AZEA 3IDBA 2YCQA 4B0GA 4FV1A 1ZYSA 3LCSA 3R8ZA 2WTCA 1Q97A 1J91A 3FMHA 2WQNA 4XOZA 5E92A 3W2OA 3DKOA 4G3EA 4U3YA 5EOBA 4EOSA 4C62A 4AN2A 2BVAA 3IONA 3ZOSA 4D2TA 2IWIA 4WKQA 3WYYA 4EI4A 3ORKA 4C57A 4L01A 4PL4A 3VN9A 3FEGA 4X3FB 2XYNA 5K4IA 2DS1A 4FODA 5C8NA 4LMUA 4E20A 4GFGA 4O1OA 4JG6A 5HORA 4B99A 4F9CA 4ZZMA 3A7IA 4BTKA 4EOOA 2CGUA 3DBEA 4A06A 2FSLX 2Z7QA 3GT8A 4BCIA 2QG5A 4R7BA 1OKVA 4UWYA 3MDYA 3SV0A 3FHIA 2X6DA 3S95A 5AFVA 4NEUA 3N4TA 3NW6A 4MKCA 5B0XA 4ZJVA 4F7NA 3PXFA 5J9LA 3BEGA 1URCA 2ITUA 4E73A 4TZRA 3BIZA 3CGFA 2F9GA 4I92A 5B7VA 5HIBA 4D4YA 3VS6A 1PJKA 3K2LA 2C1BA 3CD8A 4D28A 3H9OA 4DEGA 1HCLA 4X2KA 3K5UA 4KBCA 1QPEA 1MRYA 3M11A 1H00A 3NW5A 2WIHA 4PL5A 5C1QB 3RK5A 4PPAA 4ITHA 4GCJA 4EHGA 1H1QA 2R3IA 3U8WA 2PTKA 3UOJA 1NVQA 4DFZE 5M4UA 1ZY4A 2VTIA 5DR6A 3CE3A 2FA2A 2WD1A 4QYGA 5M4CA 1YVJA 2XKDA 3AC5A 3IPHA 3LLTA 5I5ZA 5GZAA 5H9BA 4GVJA 4O7ZA 3VW6A 3OT3A 5ANEA 5KMMA 5IQGA 4BDAA 2YACA 2XNOA 4LOQA 2YCSA 2Y8OA 5IEYA 5LOHA 1OBGA 3HX4A 3DJ5A 4BDHA 4X2FA 1J7IA 5C4LA 5IU2A 1F3MC 3E3PA 3VUMA 2YDIA 1WBSA 4AZTA 2BRBA 4G3FA 4L7SA 4QNAA 4TNBA 4K11A 4UN0C 5KNJA 5ETFA 2J2IB 3MH2A 5KHXA 3H0YA 2RG6A 3E7VA 3PVBA 3DAEA 5BVNA 4AWIA 3NNUA 4BCJA 3BEAA 1L3RE 3A7HA 3W32A 5FQDC 3PVGA 4RFYA 5HTBA 2OWBA 3F3WA 3FMJA 1NY3A 1M2RA 3PP0A 4JI9A 4B8MA 5CVFA 5AP7A 5AV3A 4TT7A 5A14A 1QPJA 4BBEA 1UNGA 4F7LA 3EQCA 2EUFB 2QC6A 2OO8X 5DEYA 1QL6A 4IZ7A 3OP5A 3F82A 4AQCA 1FINA 2BAKA 4ZTRA 4GKIA 4PDYA 3SQQA 3OOGA 2UZUE 4II5A 3ZS5A 3F5PA 4FIFA 3QFVA 2X2KA 2Z7SA 3RP9A 1IG1A 5AWMA 5HNGA 5M09A 1TVOA 4O0UA 3C4EA 3A4PA 1Q41A 3UMWA 3FPQA 4HGLA 4F09A 4YZ9A 4ZAUA 5FDPA 2R5TA 4YZCA 3N9XA 4GT5A 1O6LA 4RIYA 4PMSA 4FV3A 3RK9A 3FZSA 4BDDA 4IACA 3WZDA 5CVHA 5LQFA 3LQ5A 4FTQA 4W9XA 3QD4A 4QMSA 5HVJA 2W5HA 5LVOA 4QMUA 3U6IA 1PMUA 1Y6AA 2UZEA 2R3LA 4XG7A 3OTUA 3TACA 3EQHA 2YJRA 5IKWA 4RFZA 4LV5A 4DA5A 3ZM9A 5HO8A 3S1HA 5AP4A 4CTCA 5JQ8A 2PMNX 3A7JA 3GFWA 3QWJA 3BHHA 2QO7A 3IG7A 5CVGA 3UDBA 2YFXA 4DGMA 4MAOA 5CY3A 1ZY5A 2BDJA 5AX9A 3DT1A 2RL5A 2RKUA 4GH2A 4L53A 4WNMA 3ZBFA 3VS2A 3AOXA 4E6CA 2FSTX 5DIAA 1WAKA 3HRBA 2EWAA 3NNWA 4KB8A 5DFPA 4ZK5A 3C5UA 4DTKA 1M2QA 2JBOA 4GV1A 1H1PA 4MBJA 2QKWB 4L43A 3GXLA 3OY3A 5JMSA 3L8XA 4O22A 3HMIA 2WOTA 4KINA 4LUDA 4E7WA 4J1RA 1L8TA 3GCVA 3T8OA 4EHVA 1R0PA 4WNKA 2IW6A 3QAME 3UVRA 2XUUA 3RHXA 2C0IA 5L6PA 3PFQA 5IQCA 2WQEA 5IH4A 5TO8A 4U5JA 2WELA 4HNIA 3A7GA 5M57A 4MBLA 3BYMA 4GJ2A 3PYYA 2ZVAA 5BVOA 5K9IA 3KCKA 4I21A 5CF5A 2ETMA 4O27B 4LGDA 4CCUA 3UQFA 2C4GA 4U40A 2BROA 4FVQA 1MUOA 3LFEA 3P7BA 3TNQB 3G5DA 3MH3A 2QONA 2X9EA 5HGIA 4L9IA 1JNKA 2VTPA 3R2YA 4BHZA 4I6HA 3EFKA 4WUNA 3N4VA 2OU7A 3I4BA 4BCMA 1Y57A 4WSQA 3MVLA 2A2AA 5HVYA 2VX1A 3HDNA 5CWZA 4R6VA 4MEDA 3PDTA 2R2PA 4M13A 5FUTA 5JFVA 3LMGA 4EH4A 4Z3VA 2PVLA 2YM3A 1M17A 3MJ2A 3SOAA 3S4QA 4WBBB 5C8KA 1SVHA 4L3PA 4FG9A 1APME 4QQCA 3R9OA 4WG3A 3RPRA 4YBKA 5AV2A 1OL5A 3Q9XA 3P5KA 4C4JA 2R3HA 3ELJA 1W7HA 4JDKA 1E1VA 4XH6A 3R8VA 3BHYA 4ZTSA 3NMUF 3DBFA 4TWPA 5HIEA 4FKWA 3PA5A 1TQIA 4QMVA 3V51A 5M06A 2YEXA 3BGPA 3BV2A 2DQ7X 2XBJA 5HOAA 3PZHA 2OXDA 4FKLA 3D5XA 1U5RA 4F0FA 3HAMA 4UYAA 4XP0A 5KZ0A 1MQ4A 4S30A 2YM6A 3ENMA 3PUPA 4IJPA 4IJ9A 4U8ZA 1OMWA 5ANDA 5F20A 2WNTA 2VNWA 4IX4A 4D4VA 2B9FA 2WQOA 1O9UA 5KZIA 3F7WA 5JGAA 3U9CA 3HAVA 2I7QA 2J0LA 3OXZA 2PPQA 4J96A 4FSUA 4KS8A 4RFMA 5FXQA 4FUYA 1FMKA 3QQUA 1REJA 5KE0A 1PXLA 3TZ8A 3WF9A 4BDEA 3JVSA 3E7OA 3PJ1A 4NTSA 5HIDA 2QNJA 3VIDA 4EBWA 3MESA 1UU3A 2PK9A 4XUFA 2PVRA 4IB0A 4FTJA 3A61A 5DVRA 3QUDA 3R7IA 3I6WA 3DZQA 3HV3A 3C4ZA 2FVDA 3FQEA 5HBEA 5BVWA 4IXPA 4CYIA 5HX8A 2BHEA 3W2SA 1QMZA 2CNVA 2CGVA 5A4TA 2WMBA 4JRNA 4FV8A 1OIRA 4TN6A 4UMPA 4EHZA 4LUEA 4JBPA 3R7YA 4FG8A 3KCFA 4BIDA 4LM5A 2FSMX 4I94A 4FKPA 4QPAA 2OIBA 4XP2A 1P14A 3ORXA 4AT5A 2XNNA 3GC9A 3LMHA 4QYFA 2WGJA 2XK4A 3OUKA 2R3OA 5B2LA 4DT9A 3R2BA 4J98A 3TUDA 1VZOA 3QYZA 2YM7A 5E8VA 5HNBA 4CLJA 4BDGA 1JBPE 2WMXA 4FTLA 4R7HA 4EQUA 3GQIA 5HZNA 2WMAA 3O2MA 2PE1A 4OLIA 3EH9A 4AA4A 5EG3A 3MGYA 4A4OA 3AC4A 3DTCA 3TNPC 2ITNA 2J0KA 2VNYA 1U54A 4MD8E 3W2PA 4ORKA 4XLIA 3TCPA 2WTKB 4BN1A 5BVFA 3SXRA 4BDCA 4EK6A 4O7VA 3NAYA 4CFNA 5K0KA 4EL9A 3TV4A 3FXWA 3KN6A 5DRDA 2J7TA 4BCKA 3DAKA 4YSJA 4DT8A 1PHKA 4TNDA 4AE9A 1MP8A 4CYJA 4XG9A 1HCKA 4HVDA 4GYIA 5FD2A 1G5SA 3NYXA 2VTAA 4RJ7A 3PJCA 3OHTA 2VX3A 5D11A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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