2YCSA

Crystal structure of checkpoint kinase 2 in complex with pv788
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
301
structure length
281
Chain Sequence
SVYPKALRDEYIMSKTLGSGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDKVVGNKRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILTSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Characterization of Inhibitor Complexes with Checkpoint Kinase 2 (Chk2), a Drug Target for Cancer Therapy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 281
sequence length 301
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2ycsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2ycsA01
4RC4A 5ANOA 4RZWA 3U87A 3LFBA 5AAGA 4UYNA 3W8QA 4K33A 2E9NA 4LGGA 3QXPA 1AQ1A 5EH0A 3KA0A 2C3LA 1UWHA 3K5VA 3P23A 4C4GA 1YHWA 2VGOA 3AT3A 3UVPA 3TDVA 5IA3A 3ACJA 2FA2A 3ZZWA 3C7QA 2PVFA 4XEYA 4OBOA 3R7OA 2YIWA 3UIBA 4QPSA 2Y6OA 3R7UA 4CMOA 3ELJA 4YJVA 4ZMFA 3HUBA 3UP7A 2BAQA 4IFGA 4XG6A 5AP4A 1IRKA 1RDQE 3O8PA 4A06A 5HLNA 4QD6A 4KKGA 5CU0A 4EOKA 2QG7A 1NA7A 2XK4A 1Q61A 3E8EA 3PXRA 4IX4A 3SOAA 4NFNA 4R3PA 5CZIA 4BWXA 2HYYA 3QD0A 4B4LA 4FTQA 3PJ3A 3RPOA 4DYMA 3K54A 4CKJA 2J0MB 1BYGA 2Y8OA 3IGOA 5HCXA 4F70A 3D4QA 5J7HA 3O7LD 2WELA 2W1HA 4NWMA 2WTCA 3MDYA 3OCGA 5JH6A 3IS5A 4IDTA 3Q9YA 3QC4A 4FF8A 5FXSA 1H01A 4CXAA 2E9OA 5LJJA 4KA3A 3R8ZA 3P0MA 3TZMA 3PJ8A 1P4OA 3PRIA 4M3QA 4A07A 4FIGA 2CSNA 4O2PA 2FSOX 4XV2A 5AFVA 3R8UA 2LGCA 2Z02A 3HECA 3ZLSA 3WF5A 4WNOA 3A99A 3C4EA 4R3RA 3LHJA 3Q4TA 2Z60A 1AGWA 2QOIA 3THBA 5IA2A 4FODA 4PL3A 4WT6A 5EDRA 3FI3A 3QQFA 5EW8A 4C3PA 4DG0E 1XH7A 4UWBA 4OTRA 2IG7A 3PPZA 2WXVA 4U9AA 2XM8A 2F9GA 2WEVA 5AX9A 3DQXA 3O7LB 5JGBA 2WMQA 2C6KA 4DEAA 1Q24A 1J1CA 3U8WA 4CT2A 3R00A 2JDVA 4I5MA 4UALA 1H27A 4AP7A 4CQGA 4D2SA 1R0PA 4EEVA 5J9LA 4FNZA 3DPKA 3GT8A 4YC3A 2XIZA 5AM7A 3PG3A 4FEVA 2JIUA 2QONA 4D9UA 4UZDA 2B9JA 4DHFA 5C01A 3R9RA 2FO0A 4PL5A 1YWRA 1FBNA 2QOCA 2JKQA 2WQNA 4AUAA 3POZA 3E3BX 2VNWA 1MQ4A 3OOMA 3R1QA 3N4VA 4EH6A 2BRGA 5HE1A 4FL3A 3HMIA 3QRTA 1ZY5A 1OGUA 4QMUA 2F7EE 2O2UA 5EW3A 4YLLA 3L8VA 4AW1A 4EOLA 3BU5A 2QLUA 3QZHA 5LVOA 2P33A 4WBBB 3BBTB 3TNPC 1MRYA 3QKLA 4RA4A 4BDAA 3A7JA 3MTLA 5KCVA 2W5HA 3ODYX 4GT3A 4EWHA 2CNQA 3NYXA 3JPVA 4GK2A 3TACA 3DKOA 2PY3A 3DAEA 4C0TA 4F7LA 3PFQA 4EQMA 3H30A 2C4GA 2YCQA 2WMXA 2BZJA 4FIJA 3W2CA 2VWBA 3TV6A 2RF9A 1VEBA 2ZVAA 2CHLA 4M69B 2PZYA 3QUEA 4O84A 3DBDA 2X9EA 3H3CA 4F1OA 1A9UA 4J52A 4F99A 3GFWA 3A62A 4TNDA 5LVLA 3FE3A 3DCVA 3DNDA 4TTHB 4XP0A 3FXZA 4ZZNA 2NNWB 3UOJA 4GL9A 3TNIA 4QP7A 1TQMA 4HZRA 2XIXA 4ORKA 4FVRA 4EONA 2W1ZA 3RPRA 5FTOA 1K3AA 5CSWA 4IAZA 5M51A 3LM0A 3WZKA 1KE5A 5TE0A 1PXLA 1F0QA 4DC2A 2XBJA 3R63A 5T3QA 3CGFA 4FKGA 2QHMA 1J7UA 4BCFA 3UDBA 4U43A 4AXAA 3UIMA 3UIXA 4JVGA 3RP9A 3BZ3A 3V5WA 4R78A 4I0TA 2KULA 2Z2WA 3KF7A 3JS2A 3SDJA 2WO6A 2I6LA 2IW9A 3CP9A 5BVFA 5H3QA 4PMMA 4BGQA 5E8UA 4EH3A 4KWPA 1NY3A 3N9XA 4F9AA 3EKKA 2WMVA 4TT7A 4YURA 3C1XA 2VTLA 3CPCA 4QPMA 2XNPA 3PXKA 2X2MA 3OEFX 3PXQA 4IB3A 3EFJA 1IAHA 4X2JA 4QMNA 1W83A 3DKFA 3OCSA 3R2YA 3TTJA 3F7ZA 3IO7A 2GHMA 1Q3DA 2I0YA 2R4BA 4WBOA 4ZLZA 5CI6A 3HMMA 4V0GA 4XJ0A 2IW8A 4GT5A 4F9WA 5EM6A 3G6GA 2YIYA 4JBQA 2CDZA 4F7JA 3AGLA 3D7ZA 2IJMA 4F09A 3DKCA 3FJQE 4F4PA 4YZBA 3ULZA 4ENYA 2YLFA 4D2WA 2REIA 2OH0E 4CD0A 3FSFA 5C1QB 3BU6A 5AV1A 3RCJA 5HX6A 2JAVA 3SRVB 2JIVA 3ZFMA 3ANQA 4TYHB 4MX9A 2ZM1A 3LZBA 3HP2A 4UWCA 3TUDA 3NMUF 4BGHA 2X81A 3UPZA 4J7BA 3KKVA 1CMKE 3PSDA 3P5KA 5L8LA 3EH9A 3HP5A 4Y83A 4AT4A 5GZ9A 4AGDA 4EH9A 2CN5A 2WPAA 3RJCA 4FV8A 3BPRA 3RK9A 3EQRA 2W99B 4RX8A 4YNEA 5FP5A 5KNJA 4IVDA 2UZOA 4DFZE 4EH8A 4GUEA 2YCRA 2GFCA 5H8BA 1KE8A 2A19B 2JLDA 3DZOA 4TY1A 4RIOA 3ATTA 2EU9A 2QU5A 4FKUA 4RIWB 4YJTA 4XOYA 1ZOGA 3GENA 4E8AA 2BZHB 3ZBXA 3SD0A 1MQBA 1OIUA 2ZM4A 1FMOE 3FMDA 4EK3A 2PK9A 3DBFA 5I9WA 2WOTA 2XIRA 3DDPA 3U6IA 5HORA 3PUPA 4GV1A 2OK1A 4BICA 5D7AA 4BDBA 4HVDA 3OFMA 3EYGA 4F0GA 5BPYA 1BI7A 2J6MA 4FVQA 1OIRA 4FICA 1KE7A 2RIOA 4L01A 2KTYA 5HBHA 3WF7A 3GCSA 4HNIA 3EQDA 5EHYA 5EHLA 5HG5A 4FV3A 1WAKA 1Q99A 3QTWA 4I20A 3OOGA 5LVNA 4IEBA 3RCDA 2ITNA 3BEAA 4CYJA 5CNOA 1JSTA 4FTOA 4UMUA 3I7CA 4ZSGA 4BDCA 2Q83A 2FVDA 2XJ1A 3G9NA 2CPKE 4ONAA 3ZLWA 2UZTA 4PTEA 1OL2A 3FUPA 4BHZA 3MIYA 3VBXA 3DA6A 3EQFA 2PVKA 4W9WA 3ZOSA 4EC8A 3ORIA 2WHBA 4LV8A 1HOWA 3GVUA 4CFMA 1BLXA 4AT5A 1KV1A 3UOHA 1PYXA 2C5XA 1WMKA 4UYAA 3ZFYA 4FE2A 4E4XA 3MPAA 2R9SA 5F1ZA 1SNXA 4ANMA 3KVXA 4EYJA 5LVMA 4G5JA 2HWOA 2OXXA 3VUIA 2CGWA 3Q9ZA 4FTNA 1SYKA 3RPYA 2UVYA 3ZZEA 4Q5EA 4DGLC 3R7IA 2XM9A 1ZOEA 1YQJA 4XG8A 4CTCA 3L8SA 5EW9A 3BHVA 4RFMA 4JG8A 2XK9A 2V22A 2QHNA 4LUEA 5JFXA 3F7WA 3NPCA 4EH2A 2PUIA 3ZLYA 3I4BA 1R1WA 1DM2A 3WIGA 5IH5A 4Q9ZA 4NCTA 5BVNA 5IG1A 3E8DA 4NW5A 3W2RA 5LWNA 5E8ZA 1BX6A 3FL4A 2A4LA 1MP8A 4WUAA 3VBVA 4U44A 4KSPA 1F3MC 3NW5A 4HVSA 4KIKB 4Z16A 3LJ0A 3FSKA 3KRRA 2IZTA 3FKOA 3O2MA 4ASXA 4FNYA 5C27A 4XLIA 5EI8A 4M13A 3LCSA 1FQ1B 5FTGA 4K0YA 5BVWA 1R3CA 2QOBA 3VNTA 5IF1A 4ZP5A 3AD5A 1A48A 2OIQA 4YJOA 3LXLA 3ZSHA 4DLIA 4NM5A 3F2RA 4TYIA 4LOPA 3MI9A 4Q5HA 5M56A 1NVSA 3EN5A 2QC6A 2QD9A 3AQVA 3G0FA 3EKNA 2OF4A 2O5KA 1XBCA 4MQ1A 5HIDA 4I92A 5AUVA 3RBWA 4Y8DA 3G51A 4KRDA 2FSMX 3D5UA 4KS7A 3FPMA 4R7BA 1M17A 4C57A 2IVUA 3KK9A 4RJ8A 3RHKA 2V5QA 4LGDA 4XV1A 4DCEA 3UO5A 3A60A 4FTJA 5FD2A 3MH0A 3QZGA 2CCHA 4QP6A 1YRPA 4BF2A 5KHXA 3HZTA 4LRJA 3ALNA 3F82A 4O0WA 1WBSA 1Q8UA 3QCSA 5M4UA 4M8TA 2YM8A 2YM6A 4ANOA 5TKDA 1QPEA 2GNLA 1SNUA 3AT2A 4Y5QA 2R7IA 3CLYA 4P90A 4FT0A 2PVRA 4IB0A 2XJ0A 4L00A 1OL6A 3Q5IA 2VTJA 3PPKA 5IDNA 4IE9A 3MPTA 1ZOHA 5HE2A 3SA0A 4RPVA 1KE6A 3RAWA 4EUUA 5D7VA 3IW8A 5CX9A 4R1VA 4K18A 1K9AA 4CV8A 4PL4A 4BCQA 4BZNA 3LFAA 5CEPA 1R78A 4R8QA 5AR2A 5M57A 4HCTA 3R9NA 4O0VA 4ZLOA 2HWPA 5C4LA 4S34A 3UZTA 3FQHA 4JT3A 4KAOA 5J1VA 2HZ0A 4J99A 5FLFA 3R7VA 3I6WA 4C4JA 4UMRA 3P78A 3NUSA 4CFVA 3GI3A 5CAVA 5M07A 3GOKA 4O0UA 4Y95A 4I94A 2GDOA 2BFYA 2VU3A 2J5EA 3BI6A 5AIKA 3SG8A 3LFEA 2C5OA 1ZY4A 5C03A 1Y91A 5DH3A 4E4MA 5KKRB 2EB3A 4ID7A 4DGNA 4WNPA 3R6XA 5BYZA 4BY9E 3O71A 3QAME 1TVOA 4KKEA 5K9IA 3RM6A 2RFEA 4E20A 1SZMA 4H58A 2YWVA 2RFSA 4H1MA 4PDPA 4PX6A 3UQGA 3ZSGA 3L9PA 2B9HA 4YR8A 3MFUA 4QNAA 1W84A 3DXPA 3HKOA 4XG2A 2OWBA 3HL7A 3KEXA 4QT1A 3VBWA 3WI6A 4S31A 4QMZA 3PPJA 2BPMA 5JMSA 1OECA 3O8UA 4IAIA 2ONLA 2ITWA 3E8NA 1M7NA 4YHJA 4BRXA 1ZWSA 3F66A 4MXXA 4R7HA 3LJ2A 4AZFA 5CSXA 1CM8A 1XBAA 2BRNA 3BLHA 4M84A 3FMEA 4GK3A 4NTSA 3FLQA 3UOKA 4E26A 4FYOA 4MF1A 4USEA 4NEUA 3A2CA 2VAGA 1OUKA 5CANA 4PF4A 5EI6A 5CEKA 1PXPA 5A54A 5J5SA 2JDRA 5BUIA 4NZWB 4QPAA 1V1KA 2WB8A 4MVFA 3V5PA 2QO2A 4MNFA 1KSWA 4LYNA 2C6OA 4N6ZA 5ETFA 3NAXA 3FHRA 2ETKA 2OFVA 5IQIA 4YJPA 3FYKX 3R1NA 4IBMA 3PVBA 4DTBA 1O6YA 3COMA 5IISA 3Q4UA 4CZTA 2V0DA 2BRMA 1Q8ZA 2C6DA 3GBZA 4NCTC 3MJ2A 4FR4A 5LMKA 3SVVA 3QC9A 5DT0A 1PKGA 1ZZ2A 5AP7A 1KOBA 2J51A 2VNYA 4BWKA 4F0FA 4ZLYA 4BR3A 1U46A 1S9JA 1U4DA 4A9YA 5EDPA 5KMJA 1OIYA 3GEQA 2XCKA 4ZAUA 3O0GA 1QCFA 3CTHA 3LFSA 4WNMA 4RVMA 3ORNA 2JDSA 3AT4A 4FG7A 5LCJA 1GZKA 5L2SA 1XKKA 5IUHA 1Q8TA 4E3CA 2C6EA 2F2UA 1ND4A 2VX1A 3ZRMA 4S33A 3ETAA 3IECA 3NGAA 5DIAA 4F64A 3S0OA 4G5PA 4C2WA 4C36A 3LAUA 4O0SA 4RLKA 3WYYA 2XYUA 1H0WA 4USDA 3SW7A 1OBDA 3V6SA 1JKTA 3BX5A 5AWMA 5IA5A 1LPUA 3QZFA 3FPQA 4C59A 1WFCA 5BX0A 2XMYA 3ACKA 1Y8GA 3LMGA 3RHXA 2CKOA 2EVAA 3HRBA 2J0JA 5FGKA 3LFCA 2LAVA 3R0TA 4FKJA 4J53A 4AFEA 4CMUA 2OZAA 3FLSA 5AUUA 4Y5HA 3TL8A 4TW9A 5ETIA 2VGPA 2XEZA 2GNFA 3AD4A 4OUCA 5GJDA 3ROYA 3NWWA 4B8MA 3F3VA 5I4NA 3S00A 4EZ7A 1Y8YA 1LEWA 4GFGA 4C3FA 1Q8YA 4CYIA 5EDQA 3RKBA 5JRQA 4L44A 3LLTA 5FWKK 1WBVA 4TYHA 3GQIA 3COKA 4D58A 2JFMA 3UNKA 1PRYA 1J3HA 1GZ8A 2GSFA 3H10A 1V0OA 3O50A 4AA0A 4E4LA 2HCKA 4XS2A 1QPDA 4HJOA 1KOAA 3E93A 4FKLA 4IDVA 5ANIA 3TNWA 2P0CA 4IVBA 3WBLA 4D1SA 5HO8A 3EL7A 1PKDA 2XKDA 4JRNA 5A4LA 4NM3A 2QG5A 3V8WA 3PXYA 3PXFA 4IWPA 3FZSA 3OY3A 4RFZA 3D7TB 3DB8A 4YZDA 2VTAA 4K9YA 3ZO3A 4DEDA 4QQTA 3VS2A 2XH5A 3PYYA 3QUDA 1PW2A 2BZKB 1WBWA 3Q9XA 4IX3A 4LL5A 5HTBA 3U4WA 1LUFA 2ZDTA 5CENA 4F6SA 2B1PA 2UVXA 2X39A 3DBEA 3IW7A 4M15A 3GU4A 3DJ6A 2YIXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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