2YIRA

Structural analysis of checkpoint kinase 2 in complex with inhibitor pv1352
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
300
structure length
286
Chain Sequence
SVYPKALRDEYIMSKTLGSGACGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKLNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDKVVGNKRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-Ray Structures of Checkpoint Kinase 2 in Complex with Inhibitors that Target its Gatekeeper-Dependent Hydrophobic Pocket.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK2
total genus 94
structure length 286
sequence length 300
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2yirA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2yirA01
3VS6A 5JQ8A 2VO0A 2XK6A 1F0QA 2XK3A 4RVKA 1Q99A 3EYHA 4UALA 4XG8A 3TG1A 3UC4A 3KREA 1QPCA 2UZLA 3MVLA 4XP3A 4G2FA 3PRFA 2VWWA 4N70A 5C26A 1OUYA 5DT0A 1CMKE 1KE8A 3BU5A 3F7WA 4GK3A 4ACHA 1H1QA 4MAOA 2W1GA 5E91A 3NVKI 2UW0A 3QUDA 3Q32A 1Q62A 4G6NA 4CZUA 1Q61A 5M55A 4EH4A 3JXWA 4BGHA 1OMWA 4GG7A 4QYHA 3WZJA 3GNIB 2EXCX 4XOYA 4X2KA 3QTSA 1FOTA 4FKGA 4I0TA 4CD0A 2JDOA 4XG6A 5HNGA 4E6CA 4G1WA 3EQPA 3IONA 4NIFB 1QL6A 4O1PA 4F9YA 5IQBA 4ZS4A 2C6OA 2WOUA 5KX8A 4RWKA 3VW8A 1W7HA 2RIOA 4N4SA 1PXNA 2VV9A 5HVYA 5TF9A 2UUEA 2G2IA 3BZ3A 2HIWA 3E8NA 4HW7A 3OBGA 5AUTA 4IJPA 3UYTA 4ALVA 4M15A 4BFMA 3F2AA 4AZVA 4X3FA 3KFAA 5D1JA 3EJ1A 4ZLYA 4BTMA 3VIDA 5LVOA 5I9VA 2JKQA 5F9EA 2G9XA 3R1SA 3TDWA 5AEPA 1H1PA 2BAJA 2XKDA 4YJVA 4A9RA 4O81A 2VX1A 3NNWA 2VWUA 1XBCA 4XP0A 3W55A 2UW3A 4XV9A 4ZMFA 3CC6A 4QP7A 2PE0A 1YW2A 3ZUVA 4JBPA 4X2JA 1PKGA 1NVRA 2VTLA 1JAMA 3ZDIA 2F4JA 3BX5A 3RKBA 2XRUA 3FHRA 4EI4A 3FZ1A 5CNNA 3HP2A 4J1RA 2XIXA 4FT5A 4F6UA 4TW9A 3TZ8A 4QMQA 3C13A 3FSKA 2WQEA 2ZYBA 3R30A 4TYJA 3UVQA 1G5SA 4PX6A 4U9AA 4EL9A 3B8QA 3NUXA 2R3NA 4GUEA 3OWPA 1O6YA 3UP7A 1XH8A 1DM2A 1G8AA 4YMJA 3DQXA 2F7ZE 2B7AA 2UZVA 4FTUA 5E8XA 4CKIA 5HE3A 2PSQA 4U3YA 4BTFA 1YOJA 4O0VA 3RJCA 1ZXEA 3ORMA 3SOAA 3NX8A 5IF1A 3MY5A 4E5WA 2ZM3A 3MFUA 1H26A 4MQ1A 4YHTA 5FXQA 5HIEA 1GAGA 4ZEGA 3QXPA 3HV7A 3R7GA 3C9WA 5LVMA 4ZSJA 3FMJA 4MF0A 3NZ0A 3OXIA 3BWFA 1L8TA 2UZWE 3Q52A 3HKOA 4GYIA 3I5ZA 4EOMA 5E1SA 4CYJA 2G01A 4QNAA 3DDQA 5KBQA 5AUVA 4IWOA 4YURA 3RTPA 4BCOA 4K33A 4RRVA 5T6KA 3R21A 4CNHA 3O50A 4ORKA 4CVAA 2VTJA 5EW8A 3RPSA 5IQEA 5KHXA 3LXLA 4FMQA 2YZAA 4FIIA 3QRIA 4UEUA 5EKOA 4ANOA 5E8ZA 3F5UA 2GSFA 4BZNA 3DKFA 5TR6A 4L8MA 4QD6A 4DE4A 3QHWA 4IB1A 4M69A 2WO6A 2QOQA 5L8JA 3W33A 4RT7A 4YPSA 4BWXA 2C1BA 3Q9WA 3QQGA 4C0TA 2BZHB 2PZRA 3E63A 3NSZA 3AMBA 4YHJA 4RFZA 1O6LA 3DK6A 4M97A 4UBAA 5AP5A 3HV3A 4F0GA 1JKTA 3KRWA 4L6QA 4RX7A 1OL6A 2WEVA 3GUBA 2VTNA 2C5XA 3KVXA 4FK3A 4IIRA 4EUTA 5CANA 3EFKA 4HJOA 3FL4A 5HE2A 2ZMDA 3QQJA 4IH8A 4USFA 4D1SA 3F5XA 4QP4A 5IA4A 2XJ0A 3KY2A 3Q3BA 4UWBA 1JLUE 1NXKA 3DJ6A 2BDWA 3OCBA 4RGJA 3FV8A 2OWBA 4K6ZA 4RG0A 5HEZA 2F2CB 2YM7A 2R3FA 3QRUA 4R7IA 4RIYA 5GJGA 3NW6A 3ROCA 3SV0A 3W32A 5FTOA 1ZY4A 4D2WA 5IEVA 4WG4A 4FSRA 4IWPA 4E4MA 4EJ7A 3DCVA 3RHXA 4QMXA 3F69A 3LAUA 3HV4A 2YWPA 4LGDA 4S32A 1XJDA 2BIKB 1O9UA 3SG8A 4QP9A 3EIDA 3EFJA 2Z2WA 4MBLA 4L67A 4NTTA 4YJTA 1S9JA 2NO3A 3EFWA 4L46A 3D83A 4QP1A 4TT7A 3G9NA 1XH5A 3NNXA 4OUCA 5G6VA 5JFVA 2R2PA 1OKYA 3GI3A 2IVVA 4MXOA 5AP6A 2R3QA 3V5LA 4HVDA 5D41A 3F3UA 4I5PA 4OLIA 3O8UA 4TKSA 2W4KA 3TNQB 3H0ZA 2CGVA 4A9SA 4NKSA 1T45A 4EOJA 5IU2A 4MNEA 3AGMA 2XNPA 4USEA 3PSDA 4O27B 5CEMA 4BRXA 4YTHA 3RBWA 1IAJA 4FV1A 5JFXA 4FTKA 3GQLA 5ANIA 3EL7A 5AUUA 2XUUA 2O5KA 3C1XA 1VJYA 3FI3A 3GGFA 4WG5A 1Y57A 4YJPA 2J0IA 2O65A 2ZB1A 4GIHA 3ZM9A 2OO8X 2BZIB 1H24A 4HCVA 3DBEA 4G3EA 2IZTA 4IM2A 4GU6A 3MTFA 2HY81 3QZIA 2YDJA 3L9NA 3PLSA 4D28A 5DRBA 5HLPA 1ZOHA 4QMWA 2HZ0A 5CLPA 5D7VA 4DLJA 4FV5A 3VS0A 3MV5A 4FSTA 4EQCA 2PUUA 2RFNA 4FNXA 3C50A 3RM6A 4FEUA 5EI2A 3UVRA 2R3KA 4DCAA 2RGPA 4F6WA 4EOLA 3ALOA 4U97A 4FYOA 4F7SA 2VZ6A 2WELA 2C6DA 4AOJA 3F2NA 2EWAA 1WVWA 3POOA 3HYHA 5EKNA 4J8NA 1J7LA 4YLLA 2W05A 3QTZA 3PPJA 3ZO3A 4J71A 4C8BA 4KIQA 2LGCA 3VO3A 5JZNA 4CMUA 3TEIA 4O0XA 2HZIA 3ZFXA 4DN5A 2QOLA 5IH6A 4O7SA 2G2HA 4FEQA 3QUEA 3OF0A 4IVAA 4L7FA 5GHVA 3UPZA 1TQPA 3LMIA 3PIZA 4L9IA 4OT6A 2YIYA 2X6EA 5CF5A 2J9MA 4G3FA 5CU6A 3RMFA 3WOWA 3ZEWA 3CQWA 5KMOA 4DAWA 1I44A 2YFXA 4YZMA 3HMIA 3QU0A 5CVGA 4GVJA 2GHMA 4ZTNA 2C4GA 4OBQA 4E5BA 4E5AX 5J1WA 3NW5A 2CSNA 4DBXA 3KMUA 2ETKA 3SAYA 3NPCA 3UG2A 4YTIA 1JOWB 4XV3A 4G9CA 5DNRA 5EDQA 3GU5A 4G16A 3A4OX 4ZTRA 5AWMA 5IEYA 2CKEA 3QGWA 4BDIA 3ZONA 2RFEA 4D2SA 4BDGA 3CPCA 4A4OA 4XG3A 3V04A 1KOAA 4FUYA 1OUKA 4JX3A 3SXRA 4RX5A 1I09A 2PVKA 4RLLA 5KHWA 3OXTA 2I0HA 2JFLA 4MX9A 4PL5A 4YJOA 2J51A 5IISA 5EI6A 4Q5HA 1JWHA 3RGFA 4DH3A 4FKWA 3KXXA 3E3PA 4IX3A 4DBNA 2R3MA 4FV3A 5BUEA 4BKZA 3BIZA 4O96A 4YNEA 3G9LX 5K4IA 2W99B 3LLAA 2UW4A 4BCNA 5TOZA 1P14A 2WTIA 1W0XC 1OM1A 2I0YA 3A4PA 4CKJA 2QO2A 5F1ZA 2C68A 3ZFYA 3AC2A 4ALUA 4ALWA 4I4FA 5BQ0A 3P0MA 4ASEA 4BDEA 4D0XA 2HOGA 5E92A 5C8NA 2Z7RA 1PXPA 3U9NA 2PMIA 4QMZA 4Y83A 4MHAA 4A4XA 3QC4A 3D0EA 4R7HA 2BVAA 1GIJA 5FGKA 4O21A 2V7AA 3H4JA 5ETAA 1U54A 5HCYA 2ZV8A 4BBEA 3A2CA 4MCVA 4FSNA 3ZH8A 4CFNA 4TYIA 2WQBA 3QXOA 4J98A 4C62A 4F7NA 5HICA 3ELJA 4YZDA 1YHSA 4M0YA 3U51A 3ZSGA 3ZUUA 4EH7A 1YOLA 2IG7A 3S3IA 2OJJA 4NFNA 5CU2A 1VR2A 4XOZA 4JXFA 4ZLZA 2YIRA 3G51A 4DFLA 2UZUE 3CKXA 4ZJJA 5HVJA 2O64A 4F1MA 2YJRA 4EH8A 3VF8A 1UKHA 3EN7A 4ZTMA 4HGEA 3OXZA 3TNWA 4CTCA 3VBWA 4B9DA 4G9RA 3TUBA 4JBQA 3TZ7A 4I1ZA 1VEBA 1ZAOA 2QC6A 3G5DA 2BAKA 1J91A 3ANRA 1DAYA 2CN5A 3EZVA 4PQNA 2BKKA 5FM3A 3N9XA 5L2IA 5BVWA 2ZJWA 4I0RA 3W18A 3BBTB 4CSVA 3RALA 3RAKA 3AC3A 5M07A 3GC7A 5EOBA 3PIYA 2QG5A 3H9FA 1WMKA 3V5TA 1OIUA 4KRDA 4YO4A 2CNUA 2QNJA 5DFPA 5HKMA 3PXRA 2B9HA 3VW6A 2VTHA 2JAVA 4X0MA 5EYKA 4Y5QA 3ZXTA 4B6LA 4E3CA 2PU8A 5DOSA 1QPJA 2YISA 2C6LA 2J0MB 3KF4A 3REPA 2IN6A 2R64A 3QF9A 4B4LA 3EYGA 4FSMA 5CXHA 3RI1A 1MQ4A 1FPUA 3E62A 4DH8A 5HBHA 3SRVA 5E8WA 4UWYA 2W5AA 3C0HA 3CGFA 3I79A 3QX2A 3GT8A 4PMPA 4ZY4A 4QYFA 2B9JA 3VC4A 2HYYA 4S2ZA 3NUAA 3U6JA 3RWPA 4BGQA 1PF8A 3IOPA 4FTQA 4JX7A 4XS2A 3R83A 1OVEA 2WMTA 5FDXA 2VUWA 1XH4A 4F65A 4FC0A 3T3UA 3HMOA 3PY0A 2BZKB 2FVDA 1LP4A 3P7CA 1RQQA 2JBPA 4BVUA 3U55A 2AYPA 4A7CA 3DJ7A 2EB2A 2XB7A 5EFQA 3RPRA 4CZTA 4O82A 3OMVA 4FVRA 4YPDA 4AA4A 3S1HA 4MD9E 3ZUTA 4AACA 3CTQA 4KUJA 4I5CA 1UA2A 4O0UA 4PMTA 5GJDA 3G33A 5AR3A 2RF9A 3ZXZA 1YI4A 1NY3A 3QQFA 2YA9A 2YLFA 4O84A 3V8WA 5L6OA 2QKRA 3PA3A 5FXRA 3S2PA 4BCFA 4LQMA 4KNBA 3CLYA 4KBKA 5CSWA 2WKMA 3OWJA 2GU8A 3QZFA 4KWPA 2HAKA 4DG3E 2CCHA 2ITUA 4KAOA 4XRJA 2W1DA 5DR9A 1ZLTA 2Z7SA 4C4HA 1PXOA 4RC3A 5JQ5A 4EKLA 4ZY5A 5M06A 4ITHA 1PMUA 2BAQA 2E9UA 3FMHA 3TWJA 5IA3A 3DT1A 4TTHB 3K3IA 1U46A 3Q6UA 4GJ2A 3C0GA 3QKMA 5CAVA 1OBGA 5LXMA 4QO9A 4IB5A 4WNKA 4FTAA 3BHYA 4NKAA 4S31A 3FMDA 4BKYA 3LFCA 4IEBA 4AA5A 4KKHA 5CF6A 2AUHA 3CQUA 5HTIA 4DEAA 3WZKA 3KULB 4V01A 4FG9A 4KKEA 3DXPA 4DEDA 3MJ2A 5HORA 5JEBA 5C8KA 5I0BA 2XIKA 2JBOA 1JPAA 5H8BA 5L6WL 3OW3A 4EORA 3MH2A 5DI1A 4X3JA 3OOGA 5J87A 3DAEA 1E1XA 4PTGA 4EK4A 2JKOA 4DGNA 3MPTA 3FY0A 2YDKA 3PE2A 4IFCA 1U59A 4JT3A 2ONLC 2QU5A 4YUQA 4DFYA 2OK1A 4I6QA 3FI4A 4YJQA 4AGCA 4L3LA 5D12A 4F08A 4YLKA 3DQWA 4YBJA 3FAAA 5A9UA 3E8EA 2WFYA 3S00A 1ZWSA 5BUJA 5BMSA 3Q2JA 5EM5A 3D9VA 4RFYA 4YJRA 3QUPA 4GT3A 2BRNA 4EOQA 2WQMA 3CKWA 4ZTHA 5CSPA 3LJ2A 5HVKA 3UZRA 5L6PA 3FLYA 5CX9A 3VUMA 3OEZA 4XG9A 4EOIA 3E3BX 2C6TA 1OL1A 3QBNA 1ERKA 3KVWA 2VTAA 5EK7A 3W2PA 4KIOA 1BKXA 4XJ0A 4AT5A 3DFCB 4NT4A 3L8PA 4AW5A 4NCTA 2BMCA 3JUHA 3DAKA 2GNGA 4JAJA 3LCDA 4O7TA 3UMWA 3GU7A 4IZAA 3VBTA 4FNYA 4HVIA 1H0VA 4RJ7A 4OAVB 3TNIA 3BGZA 2GDOA 4U43A 2HZNA 3WE8A 4X2FA 1YXVA 5J1VA 2R3HA 2YJSA 1K9AA 2JIVA 1VYZA 4LL5A 2ZAZA 2XIRA 4N0SA 4H3BA 2WQOA 4PNIA 3VUIA 3KK9A 3UO4A 1P5EA 4ACMA 3G0FA 1KE6A 1K3AA 1JKKA 4I21A 1EH4A 3TDVA 4C4FA 4AQCA 3OHTA 3PJ3A 1WVXA 1R39A 3EWHA 1UU3A 2VU3A 4JIKA 5LWNA 3NMUF 2PUNA 3UOLA 4N6YA 1OPLA 3VJNA 3R8ZA 2X4FA 1ZMVA 2BPMA 3LVPA 2C3KA 4EKKA 4AAAA 1W84A 1M7QA 1PY5A 3PXYA 1Z9XA 4Z9LA 5LQFA 2PVMA 2UZOA 3AT2A 1MRUA 5AV3A 1TQIA 4O7WA 4C4GA 3D14A 3RAIA 3LFDA 3COMA 1PJKA 4J52A 3HNGA 4HOKA 2VRXA 3KL8A 3TNHA 5C01A 5E4HA 4LFIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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