2YM5A

Crystal structure of checkpoint kinase 1 (chk1) in complex with inhibitors
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
263
structure length
248
Chain Sequence
DWDLVQTLGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-Guided Evolution of Potent and Selective Chk1 Inhibitors Through Scaffold Morphing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 248
sequence length 263
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2ym5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2ym5A01
2X4ZA 3RAHA 3MJ1A 4JVGA 2WZJA 3GBZA 4KBKA 5DPVA 3VBQA 5EKNA 5KKRB 2UZOA 4MBLA 2Y7JA 3SD0A 2BTSA 2R3PA 2OIQA 4K0YA 3FPQA 3QD4A 5FUTA 2XMYA 3H10A 2XEZA 3TWJA 2Y0AA 3R04A 3KULB 4M0ZA 5EYMA 3SW4A 2VNWA 2OZOA 2X4FA 4JOAA 4YJVA 1YXUA 3CQEA 1BUHA 3M42A 4MWIA 3W16A 5GZAA 4GCJA 2Z2WA 5AM7A 2ZOQA 5BYYA 3H30A 4OT6A 3COIA 3NUNA 2UW8A 4EL9A 4F70A 1YXXA 2G9XA 4WSYA 3ZC6A 4X3FA 3PY1A 2ERZE 4D2SA 5EYCA 3LKMA 2QU5A 5A6OA 4FSMA 3Q9XA 4UXQA 5KKRC 3W2QA 4GSBA 1SNXA 4IWPA 3ZS5A 5LVMA 4RLLA 3CJFA 3D5UA 2X8DA 3FQEA 3GUBA 4TWNA 2R3LA 3NIEA 4TY1A 5D12A 4EWQA 4UBAA 4RVMA 4AA4A 5L6OA 2E9OA 4WT6A 4KWPA 4I0RA 4OUCA 2WTJA 4E73A 1E1XA 3VF9A 2F2UA 2OW3A 3FHRA 2XM8A 4NU1A 3DTCA 4CMTA 4F6SA 3BELA 4M69B 1OKYA 4AS0A 5IZFA 3ULIA 5KBRA 2V0DA 4MD8E 5M44A 4EOLA 4DT9A 4QT1A 4F9BA 4QPMA 5FWKK 4YNEA 2PVJA 2VGOA 3Q4ZA 4TYHA 3KRRA 3FI2A 2XH5A 3W8LA 5JRQA 1OB3A 4O0RA 3DBFA 4AT4A 3TG1A 3C5IA 4BYIA 4C61A 2R0IA 3EQRA 5EH0A 5KE0A 4BY9E 3C4WA 2X6EA 3EQDA 4FKPA 4GT5A 1H4LA 3E3PA 4PMTA 3V5LA 5HLNA 1AQ1A 3W2RA 4ZZMA 5L8JA 2WTCA 4W4WA 3QYZA 4IZ5A 3R8LA 2R64A 5T68A 1KE6A 2WPAA 3UO5A 3DKCA 3F2NA 2NRUA 3QTSA 4DG2E 3A61A 4E7WA 4IXPA 4B0GA 4I6QA 3FE3A 3HMPA 4EEVA 1YI6A 4PTCA 3R8ZA 1YXTA 3A7IA 5AP1A 1Q8WA 2PVNA 2XVDA 5M57A 5FXSA 3N51A 4M0YA 4DEHA 3UOHA 3BHTA 2B9JA 2XJ1A 3F3VA 3G0FA 3LM5A 3QQJA 4FT5A 2VTAA 2UZWE 3FMDA 4NKSA 3T3UA 1OL1A 2YM3A 4FV7A 2E9VA 4OTWA 4WUNA 4F9WA 3GEQA 2XCKA 4KKEA 3FMJA 4IACA 3NUYA 1OPJA 3JY0A 1RQQA 2WMXA 4WSQA 4J71A 3DCVA 4QP7A 5CSHA 3MTLA 1U46A 1H01A 4NM7A 3EB0A 3OC1A 1YWRA 3FQSA 4QP6A 4X6QC 3VUMA 4BHNA 3NYXA 4UYNA 3R8VA 4CYJA 4FSZA 3L9PA 5EI2A 4L52A 3FXXA 3DAJA 2PZRA 4LRJA 2JC6A 2XK4A 4U43A 3VS0A 2WU6A 4RSSA 5C03A 3Q9WA 4CD0A 4U79A 4CFNA 4YJTA 4EOPA 2A2AA 2X7GA 3QUEA 4P5QA 2YM7A 5IKWA 4B8LA 4FVPA 3IG7A 4E26A 5I0BA 5LWNA 4BTMA 3TIZA 5JFXA 2ZB0A 5L6PA 4O6EA 1VEBA 4MXZA 5JSMA 4DFBA 4BCHA 4QP9A 3NPCA 2HZNA 4QP2A 4YGAA 5CU0A 2R7BA 3W2PA 5IQCA 1TQMA 2JDTA 4ZTSA 1BKXA 5FBNC 4ACHA 5HZNA 4RIXB 1OUKA 2OH4A 3A7FA 4I93A 5AP5A 3ALNA 4QMOA 4FICA 1OPLA 3REPA 4EJNA 4RJ7A 4L7FA 1U4DA 5AUWA 1LPUA 4BCKA 3OXIA 3VBYA 4OR5A 4D28A 3NNWA 3QHWA 3MTFA 5AR7A 4O7SA 1KWPA 3CJGA 2GQGA 3CKWA 3SLSA 1STCE 2VX0A 4LGGA 5I4NA 2EVAA 3WF7A 3NUXA 4BCMA 3BHUA 2PE0A 4FIFA 1WCCA 2FSOX 1YWNA 1QPDA 3VHEA 3FSFA 4DT8A 3BE2A 4HVSA 1JLUE 2HENA 4MD7E 3SAYA 4WG4A 5AAEA 5HLWA 2PE2A 2VD5A 3D15A 5LXMA 4G6OA 3LQ3A 3GQIA 3RAIA 3ID6C 5AUVA 5M06A 5IU2A 4JBOA 2YZLA 2C0TA 2BZHB 2B9HA 3I4BA 4FV0A 3DT1A 4FTJA 4E93A 3D5XA 5GIOE 2BZIB 3EMGA 3R7GA 2BRBA 3I81A 3LFEA 4CG8A 2NP8A 2W1GA 3E3BX 4F1MA 5DN3A 5E1SA 3EZVA 4E8AA 5BUEA 4DCAA 1YOMA 4EK3A 2ZV8A 3D14A 4MAOA 2CCIA 3HDNA 4O2ZA 3Q6WA 3VIDA 5ANDA 3Q4TA 4TZRA 2BFXA 2GPHA 4DBXA 4C36A 4A9TA 3FMNA 1UWHA 4FZ6A 5D10A 1JQHA 2YIYA 3LFDA 3ZFXA 3PP1A 4PTGA 4UB7A 4JI9A 3PVBA 2GFSA 4J95A 4YHJA 3RKBA 4CZTA 3UP2A 3MFTA 3UODA 3ORKA 4L44A 3VBVA 4GS6A 4MH7A 3WE4A 5KMKA 4YC3A 3PJ2A 2IVSA 5IA0A 3G33A 4CG9A 2WU7A 2C3KA 3QTUA 5GJGA 4QOXA 3W8QA 2QONA 2EXEA 1IR3A 2J0LA 3CY2A 2Y4PA 3HV3A 4TKSA 1PXNA 3P0MA 4PL3A 2FO0A 3VS5A 1FGKA 4C4JA 5BVNA 2C6TA 1REKA 3DU8A 1M52A 4UX9A 5DRBA 5AFVA 4FEXA 2WD1A 4QTDA 3ZFMA 2C5OA 3EFLA 3PZHA 3QHRA 3LXPA 2P2HA 4I1ZA 5HICA 3V3VA 4XHKB 5HQ0A 3QUDA 5IF1A 2WAJA 3BU3A 3QZHA 3TUDA 4H1MA 1ND4A 2YISA 4WOVA 1NVRA 4IEBA 5KX8A 4MBJA 3LAUA 3NVMB 2J0IA 5D41A 3UOKA 2OH0E 3SGCA 4FKVA 5CU3A 4ZLZA 2XK3A 1WVWA 4GEOA 4E5AX 2BRHA 3GFWA 3RPSA 3EQGA 2Y4IB 4NM5A 4XOZA 5M4CA 3LMIA 3R21A 4FSNA 1MUOA 4PDOA 4FV6A 3PFQA 4H1JA 2NO3A 3I6UA 4OGRA 4XLVA 1REJA 4RLKA 5K4IA 3VUTA 3FY2A 1UU9A 3DV3A 3RPYA 4RIOA 2GNJA 4ANOA 4O2PA 3DFCB 4O0SA 3UOJA 3WF6A 3QCSA 2IZTA 5HG8A 5BX0A 4CFWA 2ZV2A 3GU5A 3H4JA 3QQHA 5KMMA 5LWMA 4XG6A 3IQ7A 4BZNA 1G8SA 2ITPA 2R3MA 2YAAA 5J5TA 1E1VA 1PXOA 4UYAA 4R77A 3A8WA 4WRGA 3ZEPA 3HUBA 4RIYA 4ACGA 4QTEA 5AR8A 4BDCA 1Y8YA 5EOBA 4E5WA 3PRIA 3VW8A 4EK5A 2VTPA 3ORLA 2VWBA 2IVUA 3R71A 1YDSE 4JBPA 5AP7A 3LFBA 4GK2A 3FWQA 2UW0A 4FV4A 5J95A 2Z7RA 4TNDA 2F7XE 2UW3A 3U9NA 4DLJA 3A8XA 3OT8A 3UQCA 4JLCA 4HOKA 5HD7A 3HV6A 3R9RA 3UIMA 2Y6OA 1SMHA 1R1WA 1FVRA 3JS2A 5G1XA 1O6YA 2X81A 1W7HA 3M2WA 4CQGA 4LG4A 2XIZA 4KIPA 2J51A 4LI5A 1SM2A 2ZM3A 3G0EA 4FV1A 2RFDA 3RK5A 3UQFA 2X7OA 2B9FA 4LL5A 1J7UA 4FTUA 1QPJA 3NSZA 1H24A 3SOAA 4PY1A 4BWPA 4DEDA 2DS1A 2XNPA 4L00A 3E63A 4FKSA 1ZRZA 3TZ8A 5FP5A 4BGGA 5L8LA 2R2PA 3RCJA 2P3GX 1Q8TA 4QTBA 3R9NA 1GOLA 4GKHA 4DFXE 4IE9A 3DKGA 4J98A 2AC5A 4RPVA 3ALOA 5HG9A 3FLWA 3KXMA 4TYJA 4B4LA 3F3ZA 3I79A 4FC0A 1FQ1B 3OZ6A 4QPSA 3IDCA 3ORPA 2JBPA 5GIPE 2OI4X 1OKZA 1VZOA 5HD4A 1O6LA 2XBAA 4NW5A 4BI1A 4DEGA 4Y46A 4OTPA 5F4NA 3TL8A 4DLIA 5CAUA 1VYZA 4ZJIA 2ITTA 4E1ZA 3KN6A 4P2KA 3T9TA 3DJ5A 4EC9A 3PE2A 4PDPA 4ZLYA 3HRBA 5K9IA 1DM2A 2DUVA 2LGCA 4CYIA 5F9EA 4BIBA 2QOBA 3RALA 4O81A 3MH2A 3TNIA 4HJOA 3SDJA 4V0GB 2VRXA 4GG7A 5IQDA 3EL7A 3FZSA 5CVFA 4BHZA 3DTWA 2HIWA 4HCVA 3NYOA 3EQIA 4IHPA 3CXWA 5ANJA 3AXWA 3POOA 4IZAA 4O21A 3F7WA 3PRFA 3MS9A 4O22A 4NJ3A 4QMSA 3DQWA 5DRDA 4B99A 3ROCA 1IA9A 4ZS4A 3LCSA 3T3VA 1EH4A 4QQJA 5CWZA 2OG8A 3F5UA 4ZTNA 1Q8ZA 4NZWB 4PMPA 3C4CA 4ZXTA 4PTEA 2UZVA 2W05A 4W9XA 4FG9A 4PP7A 2ONLC 3DK6A 3PA3A 1A9UA 4TW9A 3ZRMA 1MP8A 4MXCA 4DTBA 1Z57A 2BDJA 1SVEA 1RE8A 4IB3A 5JZNA 3P79A 4NTTA 4GK4A 4FKRA 3OW4A 2J0JA 5C4LA 4AE6A 4BL1A 2C6KA 3HA8A 3KMWA 3Q4UA 4FT3A 3TNPC 4O1PA 5I5ZA 4QTAA 1VYWA 4PPAA 3PG1A 1H27A 4FKGA 4QQTA 1G8AA 2YN8A 3ZDUA 5K5NA 2WFYA 4RFZA 4YURA 3OWJA 2ETRA 4X2KA 3DNEA 3THBA 4Y72A 5EM6A 1H1WA 5KMIA 3T9IA 2VX3A 3F5XA 2W5BA 2GQSA 2AC3A 2B1PA 3O50A 4I23A 2QO7A 4KABA 5D9HA 3V51A 4EKLA 2R3RA 3FMLA 4CFXA 5JK3A 1Q4LA 1WBPA 4FTOA 3I1AA 3H9RA 4GIIA 2BCJA 4NEUA 3BI6A 1NY3A 2PVLA 2YLFA 3LXKA 4IW0A 4JXFA 3PXRA 5FBOA 3A7JA 4UMQA 3WARA 4DGNA 3QXPA 3L8PA 1Z5MA 5FG8A 1WVYA 1LUFA 5D7AA 2YITA 4EONA 3FSKA 1PXJA 1T45A 4FUXA 5CF5A 2VO3A 3RINA 4FSUA 3RAKA 3NLBA 3DXQA 2GHLA 3RPVA 4FKUA 3QLFA 4BVUA 4RX5A 3QD3A 2YJRA 4PL5A 5AX3A 5FRIA 4U8ZA 2X1NA 4FODA 3R9DA 4U9AA 1YQJA 4YLLA 4M7IA 4C8BA 3EYHA 4IADA 3R8MA 3RP9A 2BDWA 3FKNA 3C13A 3DAKA 5ANKA 1SYKA 2C47A 5EHOA 4OAUC 3RAWA 3MVJA 3PWYA 3QKLA 2ITUA 2WKMA 4AU8A 4BIEA 4V05A 5E92A 3KL8A 4I3ZA 1BLXA 4H39A 4BB4A 3NW6A 5C26A 4E6QA 3ENMA 1JPAA 5IH6A 3FXWA 1ZOHA 4FNXA 1U5QA 5G6VA 4ALWA 3AOXA 3KN5A 5JFVA 4ZTRA 2IWIA 3PDTA 1PKDA 4QO9A 5FTOA 4OTGA 2PE1A 4QP3A 4BCFA 4QMYA 4EH7A 4BDKA 2C5YA 3MFSA 2ITYA 1ZARA 2BDFA 2OIDA 3BWFA 4LQMA 3EFKA 5AV2A 4AQCA 3IGGA 3O0GA 3UC4A 4QP4A 2CKEA 3MI9A 2O64A 4GJ2A 4F1TA 3ZDIA 1YHSA 3A7GA 1QCFA 1TQPA 2W1HA 4NK9A 1OIUA 2PMIA 4TT7A 3HAMA 2XKDA 1WZYA 2OJFE 3VS4A 4YHFA 3DPKA 3LCTA 5E8WA 1ZMVA 5DH3A 3IW5A 3E5AA 4FYOA 4A9SA 3R02A 1WBTA 3G90X 4Z55A 3CSVA 4PF4A 4R3PA 5HTCA 5HHWA 3O17A 1UA2A 2OJ9A 4JAIA 3Q32A 4CNHA 5I9YA 3E8CA 2ZJWA 5IQFA 3AMBA 2BMCA 5IA2A 3TKHA 5C01A 3SXRA 4V04A 5D7VA 4ASZA 4Y83A 1Y6BA 4NUSA 5K3YA 2HW6A 2XJ0A 3TTIA 3ZSHA 4IDVA 5EI8A 3MN3A 4JAJA 4ZTLA 3ZLXA 1PXLA 2NPQA 1MRUA 4FK3A 4ANSA 4ENYA 3AC4A 3HYHA 1H25A 3E7VA 3V8WA 1BMKA 2VWVA 5AR4A 4NCTC 4EOOA 3F9NA 5EQEA 3SVVA 3V8SA 3NW5A 5AUYA 4EZ5A 4BI2A 5I3OA 5GHVA 3CCNA 3U4WA 5KMNA 4ALVA 3RPRA 3WYXA 3KMMA 4RFMA 4V01A 4HYSA 3CIKA 3KKVA 2J50A 1PMEA 5TKDA 1OITA 3KRJA 3MSSA 3OTUA 2HY81 3OUKA 4GU6A 4C02A 4AW5A 3U6JA 1GNGA 3EIDA 3CS9A 2W4KA 1KE7A 3BYVA 4EHVA 1OPKA 2GNLA 5CF8A 4QMZA 4JG7A 5FEQA 5H8EA 4CTBA 1DS5A 2YFXA 4FSYA 5EDPA 4IVAA 4D0XA 4CFUA 2W99B 2YDIA 4MQ2A 4ZIMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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