2YN8A

Ephb4 kinase domain inhibitor complex
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
281
structure length
253
Chain Sequence
KEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKESCVAIKTLKGGYTERQRREFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIASGMRYLAEMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPPDCPTSLHQLMLDCWQKDRNARPRFPQIVSALDKMIRNPASLKIVA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Stability and Solubility Engineering of the Ephb4 Tyrosine Kinase Catalytic Domain Using a Rationally Designed Synthetic Library.
pubmed doi rcsb
molecule keywords EPHRIN TYPE-B RECEPTOR 4
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 253
sequence length 281
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2yn8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2yn8A01
4LG4A 1ZMWA 5J9YA 2PUUA 3TG1A 4W8EA 4XRJA 4RVTA 3UC4A 3ZRLA 3DZOA 4FT9A 3OT8A 3UNZA 2GNIA 4FKPA 4GV1A 4PV0A 4CG8A 4AZWA 5EHYA 4NFNA 4AW0A 4FSWA 4CFUA 4RJ7A 4U97A 3FE3A 3QZIA 3UE4A 2PY3A 4I6QA 1FOTA 3DOGA 3FMJA 4PL3A 5HCYA 1ZZLA 4Z7GA 2EUFB 2XIKA 5JFWA 2CGWA 2YLFA 4AN2A 4CFNA 1PMUA 5AIRA 4ZSGA 2DUVA 1GZKA 4TNBA 2OIQA 3LLTA 4IM0A 4BRXA 5A9UA 1H27A 3C13A 1GZNA 3AT3A 4FE2A 4YLLA 4UWCA 3VUIA 4BHNA 5EYDA 4X6RA 3QF9A 4GK3A 3ZZWA 4GFMA 4EK3A 5B0XA 3UNJA 4EH4A 5JRSA 3U8WA 4NYEA 3PJCA 4O0YA 3V5TA 4D5HA 1MUOA 2F57A 1JKSA 3Q9WA 4AA5A 3OBJA 3ZLXA 1JSTA 3AC5A 3HKOA 3VHEA 4FTAA 3FJQE 3FKOA 4BCNA 4L3LA 3EZVA 2WMTA 4FTTA 2XNOA 3LCOA 4M69A 4I21A 4G2FA 2BRBA 5HIBA 3TIZA 3C1XA 3KF7A 5E8SA 2HY81 4KRDA 5EG3A 4QP3A 2XA4A 3R8LA 4FR4A 3GGFA 4K2RA 3NCGA 4QP2A 1DI8A 3FAAA 5LXMA 3OCTA 4PWNA 1OM1A 4R5YA 4RJ3A 4XEYA 4QP4A 4AE6A 2J6MA 4O22A 5EDQA 4O0SA 2JAMA 3D2IA 2WU6A 3O50A 3UIMA 3QTZA 4GEOA 4EK6A 4Q2AA 4F65A 3EQFA 5AWMA 4DH3A 5DBXA 5AAFA 2C5VA 2OW3A 4P5ZA 4TY1A 3VW8A 2OO8X 3D2KA 3SLSA 4UXQA 5AV2A 1CKIA 1OIUA 1OPKA 3DKCA 4K6ZA 4XP2A 3BWFA 4D0XA 4HGEA 4TWCA 4DEGA 4ACCA 5GINE 4DCEA 5BPYA 3DT1A 5CF5A 4KIKA 4LRJA 2BALA 3GUBA 3E7VA 3MVHA 4E5AX 2C0IA 2YIYA 1G5SA 2JLDA 4X2FA 4WIHA 4P4CA 5HTBA 4UV0A 4YBKA 4DH7A 4H3QA 1SVGA 4I0TA 2IVUA 2I7QA 2YA9A 2HZNA 4B7TA 3A8XA 4WBBB 2JIUA 4TYHA 4EOOA 4D2VA 3PP0A 4C8BA 1W84A 2X8EA 4IQ6A 2XS0A 4PL4A 3OROA 4UWBA 3T9TA 5IH6A 4CQEA 2QNJA 5HU9A 4CRLA 4C4EA 3PXQA 2AC5A 1R0PA 2FSMX 3W10A 4I6HA 1BYGA 4AZFA 5IUHA 3TUDA 4O96A 1S9IA 3C7QA 3TKUA 3R30A 3V04A 2XNEA 3R2YA 2VTIA 4IIRA 3RPRA 5KMNA 4EEVA 4AGUA 4I6BA 2ITQA 2GS2A 3E5AA 5CAVA 3D5WA 4U80A 2IZRA 4YJRA 2QHMA 2PVJA 5CVGA 4F4PA 3L8XA 4J8NA 1JKTA 4I6FA 5A4LA 1Z5MA 2R3QA 4FX3A 3TNIA 3OTUA 4EH9A 4ZZNA 2E2BA 3AGLA 2R64A 4ZJJA 2ZOQA 5CYIA 2X9EA 3AG9A 3UBDA 2C6MA 4BC6A 4FG8A 3JYAA 5GZ8A 4DEEA 2XB7A 4F70A 3CQWA 4FKRA 4O7YA 5EKNA 2HXLA 3MV5A 5E9EA 4ENYA 4YC8A 2UZNA 3D9VA 4GU6A 1SZMA 1Y91A 3EQRA 4M69B 4RLKA 1X8BA 5EDRA 2I0HA 2OBJA 3AD5A 4XV2A 2ZVAA 5EOBA 3RI1A 4HYUA 3W18A 3WE4A 4RFMA 3VBXA 4F6UA 5AAGA 1Q99A 2ITPA 2RKUA 2YDJA 4K11A 3A2CA 3R1QA 4LOQA 3ZZEA 5HTIA 2A4LA 4L43A 3OWPA 2OJFE 4JT3A 3MIYA 1GIHA 3KXXA 3GCUA 5D1JA 3W55A 3VNTA 3SW7A 2X4FA 4O81A 3A7HA 5FD2A 4TNDA 4BTFA 4YU2A 4AZVA 4QMWA 5A4TA 3KCFA 1M14A 3HL7A 3P7CA 4OAUC 3OWJA 4RWLA 2J0MB 5LVPA 4YP8A 3DJ5A 4F7LA 3MJ1A 2HELA 3LIJA 4LV5A 3B8QA 4IVBA 4JS8A 1ZARA 3VF9A 4KIKB 4FNZA 4D1ZA 1ZWSA 5A4CA 5A3XA 4DCAA 4DYMA 3UVRA 4KWPA 4Z3VA 3CY3A 4FSTA 4PNKA 3AT2A 3ORKA 5B2MA 3PWDA 2FA2A 1PHKA 3RAWA 4CKIA 4NTTA 3V5JA 3NNVA 4NWMA 4ITHA 1E1XA 2X8IA 3QRJA 3R1SA 4TYHB 3V01A 5LVMA 1YDSE 2WQNA 4ZP5A 2IZUA 2VTJA 1FVRA 4JL9A 4GS6A 1H07A 3B8RA 4OTDA 3V5WA 1OBDA 4A4OA 2EB2A 3TV7A 5C26A 1PMVA 5G6VA 3ERKA 3G9LX 3N9XA 3ATTA 4D9TA 1JSVA 2AUHA 4JDKA 4MBIA 4M7IA 3HLLA 4PPAA 2CKQA 5J95A 2R3IA 2R2PA 3WZKA 4BDJA 2JDTA 3A60A 3MVMA 1J1BA 1H4LA 5F20A 1F0QA 5DN3A 2QLUA 3UIXA 5M51A 1V0PA 3QGYA 2CGXA 4QPSA 3FLWA 4W9XA 4DLIA 4RC2A 2J90A 2QQ7A 3UP2A 1VZOA 3MESA 4KKEA 1U54A 1WBOA 1DS5A 3B2WA 4CXAA 4D1SA 1BL7A 1WBWA 3SV0A 3V6SA 2UZUE 4X7QA 4BIDA 2WMRA 5EM5A 4XMOA 4I5CA 3FMLA 2XRUA 1OIRA 3LFCA 2C6KA 2R7IA 2XKFA 5BMSA 4GU9A 3F2NA 2WU7A 1IA8A 3BEAA 3U6IA 4XS2A 3ZO2A 5E1SA 4ZLYA 3ORIA 3ULZA 3DK3A 3KFAA 2Z7QA 4XG2A 2EXEA 4RLLA 2HZIA 3UO5A 4B0GA 1ND4A 4BCMA 4E20A 1OL7A 1MRYA 2NRUA 3NUSA 4D9UA 3FUPA 4R1VA 1REJA 5HEZA 4ORKA 4Y83A 1LEZA 4U3YA 5E8UA 1ZYCA 3WBLA 4AUAA 3DZQA 5DPVA 2GQRA 5I9XA 4ZTHA 4OT5A 5EW8A 3HGKA 2VTTA 5HBHA 5K3YA 3AC8A 3MVJA 2IG7A 3CTQA 4ACGA 3G33A 4RJ5A 5IU2A 3OTVA 1KOAA 1Q8YA 5ETAA 2C3JA 5HQ0A 1W7HA 4EWQA 1H8FA 2XUUA 2BRMA 2C0OA 3MIAA 4CNHA 2PUPA 4CFFA 5KZ0A 3RK9A 3MPTA 4EOSA 3W32A 4D55A 5M4CA 1UU8A 3QTXA 3VUTA 1G8AA 3H10A 3VQUA 4F1MA 2CHLA 4FKOA 4O6LA 5A4EA 4FKQA 3D5XA 4NEUA 5BVDA 3QKMA 4U79A 5AP4A 2JIIA 5BX0A 1H28A 4N4SA 4FTJA 3IW4A 3CY2A 2B9JA 5ANDA 5TF9A 2HWPA 3BX5A 4TYJA 5IUIA 1WCCA 1ZAOA 4IAAA 2F7EE 2KTYA 4TWPA 5C01A 3U54A 5CASA 2XK9A 3PVUA 2CN8A 4FNXA 5CXZA 3V8SA 5IA5A 4F9AA 4WBOA 4AT4A 3ID6C 3KMWA 3L9NA 2XIRA 3NIEA 4CMOA 4F09A 2FSOX 5EOLA 2B0QA 3VS5A 5DEWA 1YHVA 2GCDA 4KA3A 2I40A 3R7IA 4E1ZA 3LPBA 4EOPA 4OTGA 3ODZX 3BHTA 4XHKB 2Y0AA 3VS7A 1DAYA 3LFBA 1OIYA 5L6WL 5IMEA 4IAIA 3E63A 1L8TA 1YXTA 4CEGA 4ZTLA 4FV8A 2NPQA 3BIZA 2O8YA 4GT5A 1U54B 4XJ0A 2C47A 5IEYA 2GPHA 4RX5A 4ASZA 4KBAA 4NM0A 5BVKA 1NVQA 1O6KA 1KE5A 4YPSA 3ZBXA 5CLPA 5CI6A 5CWZA 3R83A 4FL1A 2BVAA 5IA3A 2JKQA 3FMMA 5FBOA 4A9UA 4BDFA 1YXXA 3O17A 5J79A 5L6OA 1REKA 4FTMA 5FQDC 3COKA 3H0ZA 3O8PA 3GEQA 4TYEA 2XKCA 1Y6BA 1BX6A 3QHWA 3EOCA 1IG1A 4BCJA 2PTKA 5AX9A 4FZAB 4NK9A 3Q53A 3E8NA 2JKOA 2F2CB 4B8LA 4DITA 4G5JA 3FKLA 4V0GA 2NNWB 4EQUA 2XBAA 5DH3A 4YZBA 4YTIA 3FEGA 4AGWA 3Q4UA 3SXRA 3V8WA 5A4QA 3A7FA 3IKAA 3SQQA 4BN1A 1NXKA 1UU9A 2UW4A 3JY0A 5LWMA 4ANBA 1TKIA 1ZYLA 3ORLA 4FIIA 4G16A 4Y95A 4DEIA 2BHHA 1YVJA 2WMUA 4L00A 3QD4A 2W96B 3TTIA 2BPMA 4RJ6A 3C4XA 3I81A 3BQRA 3RAKA 4EH5A 4MXAA 3PPZA 3LKMA 2HWOA 2YJRA 3TN8A 3DAEA 3KXMA 4NU1A 3Q5ZA 4RRVA 5ICPA 2YFXA 3ANRA 3UYTA 5DR2A 4DG3E 3CBLA 4IX3A 4G1WA 4P2KA 2W5AA 2J4ZA 1R0EA 2FUMA 4CVAA 1H1WA 4RPVA 3P79A 3GI3A 3PYYA 4CKRA 4E4NA 3FPQA 2C1BA 3SC1A 3JY9A 3IECA 4DN5A 2R3GA 4BWPA 3AC1A 4ITJA 3GQLA 3S0OA 5BQ0A 3KXZA 4L7SA 4RGJA 3EYHA 1M2PA 3GU5A 4S32A 2X7GA 3EMGA 3C5UA 5C8MA 5CSPA 3DLSA 3MB6A 4OTIA 4TN6A 3S3IA 3HECA 3HAMA 1Q5KA 5D12A 3MH0A 3P7BA 2WEIA 3FI8A 3ZEWA 5ACBC 3POZA 4BBEA 2UZVA 3AD6A 4IX6A 5CVHA 4XP3A 4MQ2A 4G34A 5DG5A 2BIYA 4QMVA 4F08A 5CNOA 1P4OA 2IW6A 3MFTA 3U4WA 3QC9A 3F5GA 4AFEA 3EKKA 3ZDUA 2BFXA 4HGSA 1FMKA 2WHBA 4CSVA 5AA8A 3BE9A 5BMMA 2YIQA 4QMTA 1UNHA 3QHRA 4R1YA 4EC9A 2BKKA 3UQFA 2W1HA 4FNYA 5JEBA 5IH4A 4CG9A 1BI8A 3VF8A 3R7EA 3IO7A 4AS0A 4MD8E 4O7RA 4GUEA 2UVXA 5AP3A 4IB1A 3A8WA 5IQDA 3MB7A 2QOHA 2ITTA 4FMQA 5FLFA 5CSXA 2C5NA 3HMIA 4ZMFA 5CSHA 5IDPA 4NKAA 3VVHA 5JGAA 3UQCA 2H6DA 3K3IA 3QZHA 4GK4A 4RIWA 3R9HA 4WOVA 2C3IB 2EXCX 3I6WA 5IA2A 2YWPA 4H36A 2ZB0A 3KRWA 2VO0A 4LGDA 5HE2A 2OZOA 4FBXA 1WZYA 2XIYA 3DQWA 4OBPA 2XCKA 2HIWA 4W4WA 5CU4A 5KMIA 1U59A 4L8MA 2VGPA 3DBFA 5IISA 5JT2A 4LL5A 3A4OX 2W1IA 3TL8A 4A4LA 4PP7A 4OGRA 1Y8YA 2SRCA 4C4HA 2XNPA 3BU5A 3HA8A 3HMPA 2VNYA 5KMJA 1ZYJA 3DDPA 5EHOA 5M44A 2R5TA 3I79A 5AV0A 4F9CA 4QYYA 1FQ1B 2CSNA 2GDOA 2WQMA 3FZPA 3QCSA 4L01A 4JRNA 5CEOA 3HV6A 3DS6A 4C59A 5HNGA 3V3VA 4KIOA 1VYWA 5KO1A 2Z60A 3F9NA 1BL6A 4LRKA 5KX8A 5IQFA 2GTNA 4C3RA 4HZRA 5BNJA 2BRHA 3QALE 2VWBA 3H9OA 4N57A 3IS5A 2PVLA 3HRCA 3MA3A 4BDBA 2GS7A 2X39A 2OJJA 4OTHA 4WO5A 4FA2A 1H24A 5T6KA 1YQJA 4BDGA 5JRQA 1DAWA 4GFOA 4BR3A 2QLQA 2VUWA 2WGJA 4EC8A 1P4FA 3WZEA 3IW6A 3DB6A 4D58A 2YAKA 4HYSA 1XH8A 3I0QA 3LW0A 1OPJA 5A6NA 5DA3A 5HO6A 4AOTA 2XK8A 3F66A 3D94A 4QP1A 3UZTA 4K18A 2FYSA 2R3PA 2H9VA 4I5PA 5IQHA 2XYNA 4AU8A 3NCZA 4LOOA 3P08A 4DGMA 4EKLA 3W8LA 4B8MA 4FGRA 2OKRA 1M17A 3JVSA 4BZNA 2ITUA 4FZDB 4WT6A 5CVFA 3GNIB 4F0GA 3KKVA 3W2SA 5BUJA 5HVKA 3QYZA 3R1NA 3ZCLA 2ZMCA 2E9NA 4ASEA 4IDTA 3C4ZA 4R6VA 2OIBA 4F0IA 3ZM9A 4E4XA 1OECA 2QODA 2RFDA 4IXPA 4KS7A 1WVWA 5I9ZA 4R77A 4Q9SA 4EBWA 5JN2A 1YKRA 4FODA 4FVPA 4PMPA 3AC3A 5DT4A 4QTAA 3C0GA 5AP7A 2R7BA 4DFZE 4MEDA 1KWPA 4DHFA 5HX8A 1OPLA 4CGAA 3LE6A 4GYGA 4Z16A 3O8UA 4PPBA 2B9HA 2G2IA 2Z7SA 3IQ7A 4MKCA 3WZDA 4AE9A 2WMVA 3C4FA 3LMHA 2XM8A 3BKBA 4RIWB 1Y8GA 2ERZE 3R21A 4E5BA 3VS1A 3MFUA 4DA5A 4FIGA 2HCKA 3NW5A 3DBDA 4YGAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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