2YWPA

Crystal structure of chk1 with a urea inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
269
structure length
269
Chain Sequence
AVPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKRAVDCPENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Synthesis and biological evaluation of 1-(2,4,5-trisubstituted phenyl)-3-(5-cyanopyrazin-2-yl)ureas as potent Chk1 kinase inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 269
sequence length 269
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2007-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2ywpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2ywpA01
4Y73A 2F7ZE 1XO2B 4JRVA 4Y95A 1GZKA 4W9XA 3BHTA 3R28A 3D2KA 3NYXA 3HV5A 4PTCA 3I5ZA 4QOXA 5TOZA 4EBWA 4C8BA 3EN9A 3OT8A 2VGPA 3C4CA 4D58A 2R7BA 3F3VA 3KC3A 4J96A 5FM2A 3BPRA 3HEGA 1T46A 3CD8A 4XG2A 2V22A 1URWA 3DTWA 2UUEA 3MA6A 5ETIA 3N4VA 3ZRKA 4AZTA 4U9AA 4NZWB 2X4FA 4HVSA 1SZMA 3GCSA 2PZ5A 2QO7A 3U4WA 4BZOA 5L4QA 3QLGA 3IGOA 4I0RA 2DUVA 3D7TB 4XYFA 2BDWA 4FL1A 3MI9A 2QOKA 4M15A 3BU5A 5AV3A 5IQBA 2J51A 3BYSA 3MFTA 4FSTA 5IKWA 4JBVA 4BDHA 2XK3A 2W5AA 4B9DA 5CI6A 2WQEA 3TG1A 4EH7A 5K4JA 2YABA 1Z57A 4FNZA 4D9UA 3ZFXA 4TZRA 4EHGA 3ZDIA 2PL0A 3FI3A 1BL6A 4I92A 3EHAA 4LUEA 4TRLA 4QTEA 4F0IA 4PL5A 4W9WA 1YW2A 4FYNA 3ZTXA 4M3QA 4IZYA 3TEIA 3WYYA 3W2SA 1B6CB 2FSLX 3POZA 1S9IA 4FV0A 5D41A 3RGFA 3F66A 4D28A 1RW8A 2QVSE 3EKKA 3FLYA 5DN3A 3IPHA 3NNXA 4QTAA 4EKLA 2XEYA 2UW3A 5F9EA 1GOLA 2PE1A 3MDYA 3OWLA 4WNPA 1SVGA 2XM8A 3C13A 1WBPA 2HIWA 4DHFA 2VTLA 4IX4A 5HBEA 4TNDA 4U3YA 3MY5A 4YURA 4QMLA 3BBWA 2V5QA 3ALOA 4UYAA 3QC4A 4BDAA 2WMBA 4YZBA 2QI8A 4L52A 5JQ5A 3BYOA 4ZTLA 2R3IA 5CXHA 4FMQA 1KE9A 5BVKA 2XKDA 3R7IA 2IZUA 5F1ZA 3V04A 1QCFA 3F7WA 1ZLTA 3E3PA 3I60A 4MEDA 3LKMA 4DT8A 1PW2A 4DITA 4FZ7A 5EG3A 1AGWA 1YI6A 2B9FA 1UWHA 2FSMX 2R3OA 3FBVA 3RTPA 3EQIA 3O96A 4QD6A 2R3KA 3PTGA 1R0PA 4O7TA 4WRGA 2B9HA 4QP2A 4FIHA 4ASXA 2C5VA 5AR7A 2YCFA 5HG7A 4RX9A 5BX0A 3F3TA 5CT0A 5FTGA 3AT2A 3MB6A 4DGLC 3P78A 3OCTA 4OTQA 4DFZE 2QODA 5AP6A 1IA8A 5CX9A 5EDRA 2C3KA 1VYZA 5DLSA 5KNJA 3LMGA 3R2YA 2HYYA 3JY0A 1S9JA 2OWBA 3MA3A 2WQMA 3Q3BA 4DFXE 5EI8A 2UW4A 4AW2A 4Y5HA 3FPQA 2UW7A 3LCTA 5HQ0A 2WAJA 2PU8A 3BI6A 1HCKA 3NUSA 4F0GA 3GP0A 1APME 5IUIA 5M57A 3R1NA 5F94A 4D2WA 4BR3A 4Y72A 3DAJA 4FT0A 4RVMA 4ORKA 3JVRA 3GC7A 4DBNA 1OIYA 2RFNA 4AW0A 3NYVA 4O82A 4IAIA 1Q8ZA 1T45A 4YZDA 4UX9A 4BTJA 4DA5A 4R77A 4B99A 4YC6A 5DMZA 3EJ1A 3ZSHA 2P2IA 2Z7SA 5IQHA 3FMJA 3VBWA 5AADA 2VO3A 3NUNA 1KV2A 4MQ1A 5AFVA 4BDCA 3ZONA 4D2SA 5C27A 3Q96A 4Q5EA 2OF2A 4E6AA 4RC2A 3BQRA 5E8TA 2PMLX 4AOTA 4F6SA 3NCZA 2J7TA 2WO6A 4N6YA 5I3RA 3HV7A 3UNZA 3AC3A 3ET7A 3F61A 3DY7A 2BR1A 3QQLA 2Y6MA 1J1CA 5CVFA 4YP8A 4CVAA 2JKKA 2WMSA 5ANJA 5JZJA 5TO8A 4AZSA 5AUTA 3F7ZA 3PSDA 1QL6A 4DEEA 1FVRA 4AAAA 4M0ZA 2VO7A 3PVWA 3KXZA 4A7CA 4AU8A 2CPKE 5A6OA 5F95A 2C4GA 3QRKA 3OWJA 3VHKA 4CSVA 4Z16A 2R2PA 4C35A 4QQCA 1P14A 3LFAA 2W17A 3KMUA 3LJ0A 5HX8A 4DG2E 2WB8A 2BVAA 2GTMA 1QPDA 4EOOA 2PULA 4XNEA 5A4LA 3OUKA 3UP7A 3MJ2A 4FIGA 5JT2A 2CNQA 2EXMA 1JBPE 1YOMA 2OF4A 5CEPA 3HMOA 3PA4A 1FMKA 3OS3A 1ZYCA 2ETMA 3PXRA 3CGFA 4IB3A 2QC6A 4Z9LA 2IO6A 4KWPA 4C58A 3EN4A 3EMGA 3W16A 2JITA 2VWVA 3NUUA 3LAUA 3VBVA 4MKCA 4AZFA 2CMWA 2HW6A 5CZIA 5EYCA 4DEIA 3QGYA 2ONLA 1ATPE 3ALNA 2JGZA 3EWHA 3GCQA 4FKTA 2YACA 5CYIA 3Q2MA 3TNWA 4EOQA 4DCAA 4FC0A 5I4NA 2A19B 5E90A 2YM7A 3VBQA 4ACDA 2X81A 1I44A 4X6RA 4YC3A 3V6RA 4ZY5A 4F9AA 3JS2A 3B2TA 4FUXA 3DDQA 4LV8A 3GQLA 4FODA 5FQDC 4NUSA 3GC8A 3ROYA 3C0GA 3NAYA 4O0RA 3GOKA 4M13A 3G33A 3WIGA 1OKVA 3FMHA 4BHNA 3NUXA 2VWYA 4GUEA 4F09A 4I4EA 3UOHA 3VNTA 2UZWE 5HE1A 5JFSA 1CDKA 4D5HA 2GQSA 3ZXTA 4AW5A 2J0JA 4DTAA 2WIHA 2QD9A 4FEXA 1FVTA 3DCVA 5BNJA 4FL2A 3P7BA 4QT1A 4F7JA 3ZC5A 3E93A 4OBPA 4XG3A 3PZHA 3SA0A 5JQ8A 3R73A 4QYEA 4OR5A 4UV0A 4XG9A 5L6WL 3CTHA 1UWJA 4MXOA 3TUCA 3MJ1A 3CY3A 3FMMA 3V8TA 1BKXA 4I0SA 2P0CA 3RCJA 4QMYA 4ERWA 5GIPE 3C4ZA 4UALA 4I24A 4QYYA 4X2GA 3JR1A 2XRUA 3F5GA 2R4BA 4YNOA 3C0IA 4DLIA 1M17A 1UV5A 2BMCA 4QYFA 2GNFA 2PPQA 2WTCA 3GU7A 4YJSA 4MXZA 3E8DA 1KE6A 2XNMA 5HE3A 3H10A 3OBJA 3H3CA 4EORA 3LM0A 3IW7A 3QTRA 2QG5A 3Q5IA 5IH5A 4YJNA 3SOCA 4L44A 3LVPA 3NIZA 3SV0A 3OP5A 4FTQA 3W1FA 4JS8A 3WF9A 2CSNA 2WIPA 4GFGA 5CU6A 4IC8A 4GK4A 4EH6A 4LMNA 4QQTA 4PP7A 4U79A 3OWPA 4FSNA 4O83A 4XV3A 2X6EA 4F9YA 2Y4IC 4LGDA 4O22A 3CEKA 4XBUA 1BX6A 3A7IA 3BLQA 1DI9A 2OG8A 3FY0A 3U51A 4FICA 4EH9A 5M09A 3PJ2A 3UJGA 5FBOA 3R30A 4L6QA 2OSCA 3OBGA 3D15A 4C4HA 3CD3A 2VTTA 3KEXA 2IVSA 3I81A 3D0EA 3QQHA 4X3FC 5HG8A 3F2AA 5I3OA 2LAVA 4EOMA 3EN5A 3C9WA 4XV9A 1U59A 2XNOA 5E8WA 3RZFA 2C30A 4E4XA 1YQJA 2UW8A 3P08A 4QP4A 3MH3A 1WVYA 4DE4A 4CEGA 5CVGA 4BWPA 5AP7A 1H00A 3CP9A 3GEQA 3OY1A 4MD8E 5EHOA 4F99A 4YTCA 2ITZA 4M69B 4IX3A 5CEQA 4ZY6A 1YWRA 3TZ8A 1JKSA 3BELA 3EIDA 3QAME 3R7OA 2KTYA 3JXWA 2WD1A 2C6IA 4O21A 5EW3A 5A9UA 5CEKA 5IQAA 3DAKA 4C4IA 5AUUA 3R9RA 5GIOE 2J0IA 3IDCA 4C3PA 4CD0A 3TZMA 4B8LA 4HZSA 3GOPA 2GNHA 5AR5A 3OVVA 3Q4TA 3JUHA 4A9TA 5HNIX 5J9LA 4H3BA 2AC3A 2BRBA 2PVFA 3G51A 5EI6A 3VBYA 4IM3A 3F6XA 4RJ8A 3RMFA 3UIMA 4DFBA 2VRXA 5CASA 3TI1A 3PXZA 2NNWB 2JKMA 1KV1A 4Y5QA 4C33A 4BCFA 2BTSA 5AIKA 3TZ9A 3KCKA 4XMOA 2R3RA 3D9VA 5CF4A 1PXMA 4CQEA 3L8VA 2EXEA 5IDNA 1HCLA 2CDZA 4ZSEA 4CTBA 2GS7A 4EUTA 4D55A 4XV2A 2RSVA 3L8XA 4PRJA 2I7QA 2GU8A 2OXDA 2UZBA 4CCBA 3DLZA 1H08A 3MPMA 4Q5HA 4HNFA 4NIFA 4DF3A 5JMSA 3G9LX 4QQJA 1ZARA 3BGQA 2GHLA 2X8EA 4JG6A 4XP0A 1YHSA 3GFWA 5LVMA 2IWIA 3F5UA 3LM5A 3ODZX 5M07A 4K2RA 2W1FA 4KB8A 4QTCA 3VWAA 3BLHA 1XWSA 2IJMA 1MP8A 2XBJA 4IXPA 3UPZA 1UNGA 1YXUA 2Z2WA 4GJ3A 4TYHA 3LFCA 4ITHA 3QD3A 5DT4A 5AR3A 3PIZA 4FKGA 4PUZA 3M11A 4FG9A 4HGSA 4R8QA 3EFLA 4RG0A 3UP2A 3ZO4A 3MVHA 4USEA 1F5QA 3KRLA 3VS3A 3ZRLA 4QPAA 4CQGA 2ZYBA 1PMNA 1K9AA 2ZOQA 2QHMA 2BDFA 3PA3A 2YM4A 4FK3A 4O91A 3KXHA 5KX8A 2B0QA 2VGOA 2VNWA 5K5XA 3DK7A 4QYHA 5AAFA 3CIKA 4HVHA 3D5UA 1BLXA 3RI1A 5CWZA 4FIEA 2ERKA 4HYSA 1PKDA 3WOWA 4ZZNA 1OPJA 4MXYA 3TUBA 4BCOA 4TWOA 2FYSA 3LFDA 3GCUA 5TF9A 3VS5A 4OW8A 4Z7GA 5BVFA 1IAJA 3SW4A 1ZYDA 2W9FB 3WE8A 4FTMA 1W83A 2VTMA 2VWIA 5E8ZA 4EOLA 4ZTRA 2V55A 4OT5A 3PXYA 5GZ8A 3FXXA 4GVJA 4GYIA 4W8DA 3ZO2A 4H1MA 4CFNA 4I5PA 3WF8A 5HVJA 4RJ7A 1Y8GA 4ASDA 5E9EA 5AV2A 3TIZA 1XQZA 4YHTA 4DAWA 4IM0A 4DEDA 5EK7A 1XH9A 3MYGA 3PP0A 3WF7A 4HGTA 3DA6A 1OECA 4QO9A 4DH7A 4MF1A 4FOBA 3C0HA 3V5PA 2RIOA 4DH8A 5M53A 2XYUA 4F70A 3FSKA 4FTUA 2F7XE 2ERZE 2VX0A 3IS5A 4I5HA 5KMOA 3PIYA 3PVBA 2OJ9A 4U42A 2C5OA 4V0GA 3BV3A 5CTPA 5E8SA 4AS0A 1JQHA 4Z7HA 5K5NA 4BICA 5CXZA 4WG5A 5J87A 4KSPA 3W32A 3K5UA 5HBJA 1NVQA 3R00A 4GSBA 2XJ0A 1U54B 3FL5A 4RX7A 4YJPA 3SLSA 2C6OA 2O65A 5J1WA 4O81A 4XRJA 1JSVA 1OIUA 5H8GA 4PPCA 2F2CB 2R3LA 4YTIA 2E9NA 4FE2A 5AP5A 4DCEA 2XK6A 3U9NA 4S34A 1PXNA 2R5TA 4LI5A 2C0IA 2J2IB 2ITPA 3GC0A 4FVPA 4EEVA 3LFFA 2XEZA 2R3HA 3QALE 4IAZA 4OTHA 3D14A 4K1BA 3WZJA 5GZAA 3BHUA 2HENA 4C3RA 2X8DA 1LEZA 5EKNA 2NO3A 3WBLA 4CKRA 4A9YA 2WZJA 1G3NA 3DKCA 2CGUA 4HJOA 2Q0BA 2QQ7A 4C2WA 3R7GA 1SYKA 2X9EA 2ZMCA 4G31A 4U7ZA 4IACA 3PYYA 2CCHA 2HZ4A 3RK7A 3EL7A 4TWPA 3WZDA 5I9ZA 3A7FA 4FKSA 5AX9A 5HD7A 3ZS5A 4P2KA 3VQUA 3K2LA 1V0OA 3O8TA 3GCVA 3HV6A 4BCHA 2Y4IB 5TKDA 2C69A 4M14A 5EYMA 5M4UA 3Q2JA 3ITZA 4X2NA 5LVNA 4F65A 4XBRA 5EM6A 3MBLA 4C36A 2WNTA 3FPMA 1OZ1A 2XCKA 4IQ6A 3OFMA 2EU9A 4H58A 3ZLXA 5LQFA 4AF3A 3KRRA 4X3FB 3BGZA 3PRIA 4P5ZA 4CCUA 2YDJA 5KKRC 2E9VA 2VNYA 3F3UA 4IVAA 5CY3A 4YTHA 4D1ZA 4BIBA 1J7UA 3I1AA 1PYXA 3KKVA 3SKCA 3T8OA 5HIDA 3AD4A 2GCDA 4IAYA 4UMTA 1P5EA 4C62A 1IASA 2JBPA 1W7HA 2XNNA 2F2UA 1ZAOA 5BMSA 2J0MB 2BRHA 4C4EA 3BIZA 2C3JA 4BVUA 2VX1A 3AC1A 4MH7A 1VEBA 2GTNA 2C5YA 2JDSA 4ONAA 4IH8A 4RA4A 3F3ZA 5LVLA 4AT5A 1UU9A 5KZ0A 1JLUE 3R1YA 4KS8A 1OUKA 4JDIA 2R7IA 4EQMA 4JI9A 4Y8DA 2J9MA 5L2QA 3OTVA 3PPZA 2VWXA 3RWQA 4D4YA 4Z55A 3NNWA 1EH4A 2BHHA 4RVTA 3PLSA 3NZ0A 4WNMA 1STCE 3VS0A 4F6UA 3LJ2A 4CKJA 2BIKB 2WMVA 5T3QA 3PJ3A 3QWJA 2JLDA 2PSQA 1YHWA 3F88A 4HVIA 3E64A 5BVOA 3PPKA 5AWMA 2XA4A 3KULB 5J7HA 5T6KA 4I1ZA 2P33A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Y73 A;  2F7Z E;  1XO2 B;  4JRV A;  4Y95 A;  1GZK A;  4W9X A;  3BHT A;  3R28 A;  3D2K A;  3NYX A;  3HV5 A;  4PTC A;  3I5Z A;  4QOX A;  5TOZ A;  4EBW A;  4C8B A;  3EN9 A;  3OT8 A;  2VGP A;  3C4C A;  4D58 A;  2R7B A;  3F3V A;  3KC3 A;  4J96 A;  5FM2 A;  3BPR A;  3HEG A;  1T46 A;  3CD8 A;  4XG2 A;  2V22 A;  1URW A;  3DTW A;  2UUE A;  3MA6 A;  5ETI A;  3N4V A;  3ZRK A;  4AZT A;  4U9A A;  4NZW B;  2X4F A;  4HVS A;  1SZM A;  3GCS A;  2PZ5 A;  2QO7 A;  3U4W A;  4BZO A;  5L4Q A;  3QLG A;  3IGO A;  4I0R A;  2DUV A;  3D7T B;  4XYF A;  2BDW A;  4FL1 A;  3MI9 A;  2QOK A;  4M15 A;  3BU5 A;  5AV3 A;  5IQB A;  2J51 A;  3BYS A;  3MFT A;  4FST A;  5IKW A;  4JBV A;  4BDH A;  2XK3 A;  2W5A A;  4B9D A;  5CI6 A;  2WQE A;  3TG1 A;  4EH7 A;  5K4J A;  2YAB A;  1Z57 A;  4FNZ A;  4D9U A;  3ZFX A;  4TZR A;  4EHG A;  3ZDI A;  2PL0 A;  3FI3 A;  1BL6 A;  4I92 A;  3EHA A;  4LUE A;  4TRL A;  4QTE A;  4F0I A;  4PL5 A;  4W9W A;  1YW2 A;  4FYN A;  3ZTX A;  4M3Q A;  4IZY A;  3TEI A;  3WYY A;  3W2S A;  1B6C B;  2FSL X;  3POZ A; 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 5EDR A;  2C3K A;  1VYZ A;  5DLS A;  5KNJ A;  3LMG A;  3R2Y A;  2HYY A;  3JY0 A;  1S9J A;  2OWB A;  3MA3 A;  2WQM A;  3Q3B A;  4DFX E;  5EI8 A;  2UW4 A;  4AW2 A;  4Y5H A;  3FPQ A;  2UW7 A;  3LCT A;  5HQ0 A;  2WAJ A;  2PU8 A;  3BI6 A;  1HCK A;  3NUS A;  4F0G A;  3GP0 A;  1APM E;  5IUI A;  5M57 A;  3R1N A;  5F94 A;  4D2W A;  4BR3 A;  4Y72 A;  3DAJ A;  4FT0 A;  4RVM A;  4ORK A;  3JVR A;  3GC7 A;  3ML1 A;  4DBN A;  1OIY A;  2RFN A;  4AW0 A;  3NYV A;  4O82 A;  4IAI A;  1Q8Z A;  1T45 A;  4YZD A;  4UX9 A;  4BTJ A;  4DA5 A;  4R77 A;  4B99 A;  4YC6 A;  4DDG A;  5DMZ A;  3EJ1 A;  3ZSH A;  2P2I A;  2Z7S A;  5IQH A;  3FMJ A;  3VBW A;  5AAD A;  2VO3 A;  3NUN A;  1KV2 A;  4MQ1 A;  5AFV A;  4BDC A;  3ZON A;  4D2S A;  5C27 A;  3Q96 A;  4Q5E A;  2OF2 A;  4E6A A;  4RC2 A;  3BQR A;  5E8T A;  2PML X;  4AOT A;  4F6S A;  3NCZ A;  2J7T A;  2WO6 A;  4N6Y A;  5I3R A;  3HV7 A;  3UNZ A;  3AC3 A;  3ET7 A;  3F61 A;  3DY7 A;  2BR1 A;  3QQL A;  2Y6M A;  1J1C A;  5CVF A;  4YP8 A;  4CVA A;  2JKK A;  2WMS A;  5ANJ A;  5JZJ A; 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