2BDJA

Src kinase in complex with inhibitor ap23464
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
265
structure length
254
Chain Sequence
KDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMSKGSLLDFLKGETGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGLARLIEFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKEPEERPTFEYLQAFLEDYFT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis of Src tyrosine kinase inhibition with a new class of potent and selective trisubstituted purine-based compounds.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
total genus 79
structure length 254
sequence length 265
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2bdjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2bdjA01
4IACA 1O6KA 5AUTA 4XRJA 1PKDA 1OL5A 1KE8A 1RJBA 2WMWA 3DAEA 3A2CA 4NW5A 2XBAA 2BRBA 3OBJA 1M14A 5GZ9A 2G1TA 2ITPA 2W96B 2XK3A 3ETAA 4G9RA 5ANIA 5CF6A 4FNYA 3C5UA 4HCVA 4YC3A 1J1BA 4U0IA 3FE3A 4CFUA 2PVLA 1YXSA 3U9CA 4R77A 4ANNA 5B2KA 4MXXA 4A07A 4ZTMA 1SMHA 4I92A 2VN9A 3P4KA 5FG8A 1KE7A 3F3VA 4BDKA 3BLQA 5L2WA 4R1VA 5IQEA 3EIDA 3R83A 2J2IB 3GC0A 3Q9ZA 1RQQA 4BDJA 3KQ7A 4HGLA 4JDIA 3PXRA 3OCSA 4FV5A 4RJ4A 4M15A 2UW7A 1XH4A 4QMZA 2UW3A 4QMLA 5KMIA 3F66A 4HNIA 1G8SA 2WB8A 4WSQA 4HYSA 2JDVA 1OECA 1PXKA 3DKFA 2F57A 3FLNC 1OVEA 3PE2A 3RGFA 1U5RA 4FV3A 3S3IA 3EN5A 3TG1A 5M06A 4U3ZA 1MRYA 3TNWA 4R3RA 4FSNA 4O27B 5L2TA 2UZLA 3IDCA 3O8PA 4OTPA 4J98A 4UALA 2HIWA 3H4JA 3KRWA 4AE9A 4ERKA 4JIKA 4P7EA 3W8LA 2XNNA 2H9VA 3DCVA 3EH9A 4UMTA 3VULA 2B7AA 4FV2A 3TNHA 2IW6A 2YEXA 3I6UA 3PRFA 5CI6A 3LKMA 2JKOA 4H36A 4FV6A 4TYHB 5M57A 4R5SA 4ZZOA 3AC5A 2WIPA 4EQMA 5DA3A 3E63A 3C0HA 4UMRA 2X7FA 4YC6A 4EL9A 4AOJA 3LQ8A 2XS0A 3PY0A 3GENA 2Y4PA 3IDBA 3ZU7A 3SG8A 4ALWA 1FGIA 3MESA 3LXLA 4NU1A 3RAWA 3FL5A 4I23A 1UNLA 4F4PA 4IVDA 2KTYA 4LRKA 3D4QA 2OGVA 3Q96A 5A9UA 5JQ8A 2W7XA 2VWBA 1QPDA 3VBQA 2GHLA 2I0EA 2EB2A 2YIWA 3R9OA 4O7YA 3D7TA 3QUEA 4FNZA 4AZVA 2BHEA 2Y7JA 4GYGA 3ZC6A 3TUDA 3QTWA 2VO3A 4XV9A 3DB8A 3T9TA 3R7VA 5IH6A 5LMKA 1P2AA 3FY2A 4CVAA 4DGLC 2WTWA 4BKJA 1KUTA 1CMKE 4Y8DA 4B7TA 3F61A 1I09A 3ZFYA 5AADA 2YIXA 4X0MA 5M53A 4FV1A 5F20A 1DAWA 3EQGA 4DGMA 4EOKA 2XF0A 4ID7A 4X6RA 4EQCA 3U55A 4NCTC 3MN3A 2ETMA 2QOCA 3BYUA 3Q2MA 4S2ZA 3E8EA 4FEXA 3ID6C 4FSTA 3G33A 4OBPA 4XH6A 3F2RA 2QKWB 5IZFA 3ATSA 3ZO3A 2IVTA 4XV2A 2VAGA 5EHYA 3FMMA 4EORA 3R8PA 3AT2A 3OEZA 1IEPA 2ZV8A 2C6IA 1BL6A 4F64A 4FKTA 4O0RA 5KMOA 3CKWA 4C57A 5G6VA 2QO2A 4XRLA 3RM6A 1GJOA 5IUIA 3GNIB 4OTFA 4D2RA 5JRQA 4EWQA 5FTOA 4I21A 2J0MB 1REKA 2J4ZA 3CBLA 4RJ6A 3F6XA 4FOBA 3PY3A 3BE9A 5HIBA 4E5AX 5HOAA 3DLSA 2QOIA 4GVJA 4KBCA 3NUXA 1M2PA 2QC6A 4RFMA 5HE3A 3I1AA 4V05A 4DF3A 3BZ3A 3FI2A 3PIZA 4IADA 4YZ9A 1Z5MA 4DFUA 3PXZA 4BBEA 1RE8A 4FZ6A 4LYNA 3QL8A 4AN9A 3QCYA 5LVPA 5CAQA 2UZWE 4A9SA 2I7QA 5GZAA 5IDPA 3RCJA 4AU8A 3D14A 4ZZNA 1JLUE 4WSYA 4AT4A 1WCCA 4NTSA 1A9UA 3QWKA 1QL6A 4TW9A 4MNFA 3AC4A 4DFLA 5AP5A 1IA9A 1XH8A 2VNYA 4PF4A 3E7OA 5HO8A 1FBNA 4PDYA 2ZV2A 3RPYA 1YWVA 2PZ5A 3TV4A 4U5JA 1YI3A 2CMWA 2QOQA 3OEFX 1IASA 4W8DA 4IZYA 5LVOA 5J9LA 1JSTA 5DG5A 4F99A 2ITQA 3KXNA 3KXXA 3NYXA 2WIHA 3OZ6A 4XUFA 3FZTA 4X21A 3JXWA 1E1XA 3OWJA 4ITJA 2QNJA 5F94A 3Q5IA 5C03A 4C4HA 2RL5A 4CSVA 2P3GX 2XNEA 3UG2A 1NVRA 4DTKA 3P5KA 3E8DA 2PVNA 5LXMA 5J7BA 4N57A 5L6OA 4LMNA 2WQOA 5DWRA 1TKIA 4FOCA 5HD4A 3ENHA 4FL2A 1JKSA 4KD1A 4PNIA 3O71A 4YBKA 2O64A 2Z7QA 3DPKA 1YW2A 4IWOA 5BMMA 2VU3A 4D4VA 4BYIA 1ZWSA 4FTMA 4R5YA 2F2CB 1WBTA 4WUAA 3KN6A 3NX8A 5D9HA 4E6AA 3NW7A 3SRVB 5KMNA 3LMHA 4FKJA 3TTIA 3FBVA 4S34A 4TYHA 1UU8A 4DC2A 1PMUA 2GMXA 4U8ZA 5D11A 3A4PA 4EH2A 4B99A 1H28A 3K54A 4IW0A 2PU8A 4H3PA 2XBJA 3QRTA 2PUUA 1FPUA 1GZNA 5HG8A 1FVVA 3IECA 4KBAA 4YUQA 1MP8A 3WZEA 4UMUA 4IX3A 4IANA 3HV5A 5GJFA 3W2PA 5DGZA 2IN6A 3TDVA 5EW9A 5HNBA 3V6SA 4G3EA 4FV7A 4FEUA 1VYWA 4HZSA 2ITNA 3QRKA 4E1ZA 2CKEA 4EHEA 1NXKA 2PK9A 3U8WA 3DNEA 5K3YA 2JKKA 1OZ1A 1H0WA 1PJKA 4FT3A 4D2SA 4HOKA 2PMOX 3MY5A 5IQCA 4BDHA 2YM6A 3QD4A 2C6KA 3NUYA 4BTMA 4K77A 4J8NA 4RBLA 5D7AA 3MIYA 5CSPA 3GC9A 4V01A 2O65A 4R1YA 3KMUA 2B0QA 4O7WA 3QUPA 2WKMA 1P4FA 4FIEA 2V22A 3I0OA 2X6DA 3OP5A 5CAVA 2HW6A 5JT2A 2VGOA 4MK0A 5ITAA 4YJUA 4P90A 5M51A 3VBTA 4WKQA 4FTJA 4U81A 3O96A 4QPSA 5HQ0A 3KK8A 3C5IA 5L6WL 1XJDA 4I41A 4FEWA 1XHAA 3LXPA 4O7SA 1JKLA 3M1SA 3N9XA 2C3IB 4UZDA 4CV9A 4EBVA 4WG5A 3AT4A 5CSWA 4EZ7A 1V1KA 4E20A 2PVMA 1Q61A 5AIKA 3PP0A 3PA4A 2QOFA 2XZSA 1R3CA 2R64A 4QYGA 1M7QA 2PZIA 3GCQA 2BDJA 4FSUA 2BTRA 2RSVA 4E8AA 3C7QA 4BFMA 4ANLA 1YVJA 5HD7A 3W10A 2BRNA 5CEMA 4U7ZA 5E8WA 5AUXA 3RK7A 3ZO2A 1H1WA 2BRMA 3JY9A 1JVPP 1FVTA 3PY1A 4WHZA 1VZOA 3F3ZA 2VO0A 2CDZA 2DUVA 4FTQA 4XOYA 4EOLA 2LGCA 5HZNA 5A4CA 2UZVA 3QTSA 4NCTA 5EQPA 4NKAA 4AOTA 1KWPA 4AGUA 4BKYA 4N6ZA 1Q8ZA 4GKIA 3R71A 3ALNA 2OICA 3QHWA 2VWXA 3QUDA 2ZOQA 4D4RA 1Q3WA 4XG4A 3B8QA 3OFMA 4XP0A 4FIJA 2B54A 1J7LA 5GNKA 5ICPA 4AT3A 3NNVA 4ZJJA 4EHVA 3LCTA 3PA5A 4L43A 3FWQA 2BROA 3ZC5A 3ZLWA 4WOVA 1PXPA 4XG8A 5AUUA 3UZRA 2QLUA 2OK1A 4DITA 3MA6A 5AV3A 4AN2A 3F3TA 4G31A 3UNJA 4A06A 3MVLA 4G17A 4JBVA 2HK5A 2XEYA 2CJMA 2C5XA 4PV0A 4YZMA 4R3CA 5EYKA 3WYYA 1UNGA 2ITOA 1BL7A 3KGAA 2PVYA 4IC8A 4KKEA 5AV2A 4D9TA 3HECA 4GW8A 5FD2A 4AGDA 2PVJA 4DEAA 2XNOA 3MTLA 3N4TA 4D4YA 3RCDA 1T46A 3FMHA 3ULZA 1LEWA 3C50A 4RZWA 4DGGA 2JDOA 5D12A 2ERKA 3SD0A 3R01A 4NFMA 1YXXA 2YCFA 5A54A 4KABA 4OLIA 3PLAE 2YLEA 3F2NA 4D0WA 4IAYA 4A4LA 3S4QA 3AC3A 2YM3A 3V5LA 2WMSA 3LCSA 5M4CA 4O0TA 4EOPA 2OU7A 4HZRA 4EK8A 3F82A 3CC6A 3TCPA 1BI8A 3FZ1A 5IMXA 3ORTA 2HENA 5HLWA 4FIGA 4J52A 1IG1A 3R30A 3EN9A 4K8AA 3VBWA 2R3JA 3KCFA 2JKQA 4WT6A 1FMOE 5K0KA 3C1XA 3LHJA 4NJ3A 2XEZA 3TL8A 5CEQA 2XJ2A 4YC8A 4BCIA 3QA8A 3VF9A 1W83A 2OKRA 3LFCA 3BHVA 1UU9A 2O63A 4AW0A 2F9GA 4M8TA 3NWWA 4CCUA 2VV9A 4ZTHA 4JQEA 2F7ZE 4YZDA 4O7ZA 3ORNA 3SC1A 3PPJA 5HCZA 4BCPA 4DLJA 5IQHA 2HWOA 3DT1A 4IM2A 5AAFA 2VTHA 2PVHA 4RGJA 3MVJA 1PHKA 3MYGA 1P4OA 4FSQA 4FTKA 4IAZA 4KSQA 5IA0A 4AS0A 5HX8A 1XBCA 4M13A 2WQNA 3R04A 4YSMA 2OJIA 2XP2A 4I6QA 4RC3A 4YMJA 4ZJIA 4BY9E 1JBPE 2HOGA 1OKZA 4DHFA 1ZYLA 2FSTX 3RK9A 3PXQA 4O84A 5DBXA 4FC0A 2B9IA 1VJYA 1BMKA 2VX3A 3WZDA 3FEGA 4ACGA 2W4OA 3RWQA 2J0KA 2C6DA 2G15A 5ETFA 4YTIA 2IZUA 4ZSGA 3EN4A 4ALVA 1U54A 4YHTA 3GVUA 4YSJA 3QKKA 5F1ZA 1PXMA 2OXDA 1UKHA 3W2OA 3D2KA 3H30A 4DFBA 5KUPA 4YNOA 2C6MA 5FEDA 1YQJA 2WMQA 5AP6A 2XK9A 5ETIA 3V01A 3ZM4A 4F63A 3K3IA 2CNUA 2QR8A 4RT7A 4FVPA 1KE5A 3IS5A 4II5A 4LGGA 2ZVAA 3ET7A 3UG1A 5J9YA 2H34A 3UIUA 1F3MC 3D9VA 1TQIA 1JWHA 4S32A 3QQKA 4G16A 3QC4A 4BCKA 1JKKA 2OIDA 5FDXA 4E73A 2C5NA 4FK3A 4QMUA 5KBQA 3OS3A 5BVEA 4YR8A 4KIOA 5IA4A 3SG9A 3WIGA 3ZFXA 4FYOA 4E4LA 2CCIA 4YTHA 4D58A 4NEUA 4M0YA 5CY3A 4FTOA 3OWKA 3A8XA 4XLIA 5CASA 3GP0A 4AZEA 3COKA 2IZTA 2WQBA 4BGHA 2O5KA 3QKLA 3AMBA 3WZJA 3OCGA 4WO5A 4F9CA 4FSYA 3QTQA 4K6ZA 3LFDA 2WMRA 2OH0E 4QTEA 2OZAB 4UY9A 1K9AA 4UZHA 5JGBA 4M3QA 1QPEA 3DK3A 1YOLA 4IDVA 4DBNA 4FF8A 4IQ6A 2C30A 2CN8A 2P33A 3T9IA 4FTCA 4P2KA 5FM2A 4QMNA 4FEQA 1XBBA 1OKYA 4EI4A 2CKQA 5DT4A 3EYHA 3P7CA 4ZLYA 1PXJA 3KY2A 3O0GA 5M08A 4FKWA 4WBOA 1H0VA 3Q9YA 4J1RA 3ZLSA 1ATPE 1YHSA 2QU5A 3ERKA 4NK9A 3OTUA 3FQEA 4E7WA 4GIIA 5TF9A 3D5XA 4OT5A 4U45A 3C4EA 4IZAA 3AMAA 3Q4ZA 4OTIA 4WA9A 4QYEA 4L8MA 2JD5A 2W5HA 3M11A 4FI1A 2Y6MA 1HCKA 2J50A 1GIJA 3EQCA 4O96A 2BDFA 2PY3A 3QRJA 2WAJA 4Q2AA 3ZUVA 4O82A 3COHA 2HXLA 3V8WA 4C2WA 1Q8TA 3F3UA 3LMGA 4C35A 4HVSA 3FY0A 1RW8A 2R3HA 4YO4A 5AP0A 3TV6A 1EH4A 4UB7A 2GQSA 4JOAA 3WBLA 4ZY4A 4O7RA 5JEBA 3CXWA 3FYJX 3OW4A 5A14A 2BZJA 2NRYA 3VS2A 4F65A 4CEGA 3A60A 1PMNA 4PRJA 3W2SA 3KF4A 3Q60A 4FSRA 4YHFA 3UGCA 2X2LA 1UWJA 1DI8A 4O2ZA 3REPA 4EH9A 2BPMA 4G1WA 4CQGA 3G15A 3OROA 2R7BA 3FXXA 4D2VA 3QCSA 4CLIA 2EUFB 3BU6A 4KKGA 5HEZA 5KZIA 5BX0A 3FKOA 4LRJA 2EWAA 3PPKA 3TZ7A 4ZMEA 2GDOA 1YXVA 3CD8A 1UU7A 3HV4A 4YGAA 3V04A 4EOJA 2PL0A 3D5VA 4XX9A 4EONA 2P0CA 4FTUA 4AZSA 4CMOA 3MB7A 4F9BA 4MKCA 4C4GA 3QALE 2VGPA 4FT0A 2YDJA 3HYHA 3NW6A 3HP2A 4FL1A 5AUVA 2ETKA 1E1VA 4M12A 4ACDA 5AFVA 1B6CB 2DYLA 5ACKA 1OKVA 3L1SA 3VQUA 1FVRA 4O6LA 3T3UA 3NS9A 3BE2A 4IWQA 5HCXA 3RMFA 2X4ZA 3K5VA 3CD3A 1H8FA 1OBDA 5KE0A 2EXCX 2ACXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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