2BPMA

Structure of cdk2-cyclin a with pha-630529
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
PLVDMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 3-Aminopyrazole Inhibitors of Cdk2-Cyclin a as Antitumor Agents. 2. Lead Optimization
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
total genus 90
structure length 302
sequence length 302
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2005-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2bpmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2bpmA01
4QTAA 5CEPA 1W82A 4BY9E 1SYKA 2JDTA 3QL8A 2W1DA 4P5ZA 2FSOX 4XLVA 3R9DA 3IDBA 3UOHA 4D2SA 3OXZA 5DRBA 2BKZA 3SD0A 4F0FA 3V01A 3BWFA 3EFWA 4QQCA 3OWPA 5IA2A 2F7ZE 1P5EA 3GNIB 5AR4A 5FXSA 3E8CA 3ZXTA 4BTJA 4A9UA 4XOYA 5KX8A 4J7BA 1ZYJA 1U5RA 5HNBA 4F4PA 1OL5A 3PVGA 4YZBA 2WQNA 4RZWA 5F95A 3ZDUA 3B8RA 4DCEA 3LHJA 3CD3A 3RJCA 3ZEWA 4E20A 5JH6A 3PPJA 4LGGA 4L00A 3H4JA 3H9RA 4A4LA 4O7VA 5DR9A 1WFCA 2FSLX 2I1MA 1TKIA 5AP5A 2YCSA 2GHLA 3EQRA 3EKKA 2ACXA 2YIYA 3ODZX 5CS6A 3A61A 3RWQA 4UZHA 3SC1A 3RALA 1ZZ2A 2CNQA 4D9TA 4E4MA 1ZMVA 3IW4A 4MWIA 3BYUA 5CEQA 1P14A 1WVYA 3VS7A 4O0YA 3R1QA 5FLFA 4PPAA 4FT5A 2J90A 2QONA 2WXVA 3C4ZA 1OIQA 4CFUA 2FUMA 4HVDA 3HMMA 5J1WA 4DE4A 3GB2A 3Q3BA 5G6VA 1KWPA 1PYEA 2B52A 3V5JA 5CASA 4P4CA 2DYLA 3DAKA 1OKZA 2J0KA 1H0VA 4L8MA 1STCE 3IGOA 3D5XA 2HCKA 2Y9QA 4GIHA 4XG2A 2I7QA 3VUHA 4W4YA 3WYXA 3U6JA 5H3QA 5HZNA 2W1IA 2UZEA 3EN5A 4ASZA 4XV3A 4FIIA 1BI7A 3C7QA 3KU2A 3IOPA 4ANLA 3OW3A 4NK9A 3H0YA 4FSWA 2WKMA 1TQPA 4F99A 4FIJA 4A4OA 4GUEA 4YLKA 3ZUUA 1FQ1B 4JG6A 2E9OA 4HYUA 1T45A 5EH0A 3COHA 5J1VA 4EEVA 4EH6A 2YJRA 3LE6A 4M14A 3CE3A 2WTVA 4QYGA 1KSWA 3COMA 3NX8A 2QHMA 4C38A 5K0KA 2WMVA 4AA0A 2YEXA 5LARA 4DT9A 2Z60A 4QP4A 4CG9A 3G90X 5IZFA 1TVOA 2JKOA 1TQMA 3OG7A 3PLAE 4O21A 5ANJA 2FGIA 2VTJA 3QALE 3NAYA 4GSBA 5IG1A 2PE0A 3W33A 4EKLA 3ZXZA 1YOLA 3R63A 5ANDA 4C58A 4JS8A 4BCHA 2P2HA 4WRGA 4GCJA 3UTOA 3SKCA 1F5QA 1GIJA 2ONLC 1A9UA 3OS3A 4AZVA 5L2IA 2ZOQA 4KA3A 2G01A 2QO9A 3W10A 1WVXA 3EL8A 3DA6A 4GK2A 1WBTA 4TPTA 3NUUA 2EB2A 1YXXA 3C5IA 3RK9A 3MBLA 5CXZA 3GOPA 5K4IA 3Q53A 4DGNA 4JRNA 4I4FA 3ZONA 3QQJA 3QWJA 3WE8A 3KFAA 4MBLA 2UW9A 5KMNA 3GU5A 3F66A 1OM1A 4JL9A 2WMRA 4ZXTA 2OJFE 2ITXA 2OWBA 3DNEA 3EQDA 3LXLA 4LL0A 2PU8A 2BCJA 2UW4A 3FKNA 1OKVA 2ITYA 2VWBA 4XS2A 1CKJA 4MD7E 1XKKA 5ANIA 4DH5A 4G6NA 1OPLA 4EC9A 3GFEA 5LMKC 3R02A 5FM2A 4XX9A 2VO7A 5LMBA 4ZTHA 4OAVB 4IB1A 1OKYA 2VWWA 2JDOA 5FEDA 4EHEA 4YGAA 4C8BA 5EYMA 3SW4A 4R3RA 1JKKA 2R3LA 3E5AA 4EYMA 3QTQA 3E62A 5ANOA 4QMTA 5G1XA 1H27A 2QOIA 2P3GX 2O8YA 4OR5A 3TT0A 3QD0A 5H8BA 4II5A 4YJVA 3U4UA 2YWVA 3Q6UA 3WZKA 4EBVA 2V62A 1V1KA 2GCDA 2JIUA 2YIXA 3ANQA 1OPJA 3E87A 4DEEA 5EKOA 3HUBA 1A48A 4FEQA 2Y4IC 5E8SA 4LOQA 2HY0A 5EM8A 3MB6A 4LRJA 2Z8CA 3HDNA 3FL4A 5AR7A 2B0QA 3BGPA 3S4QA 2IJMA 4IDTA 3TACA 4XYFA 3HZTA 3C1XA 4L68A 4Y5HA 4HCTA 5K4JA 4F0IA 1GZNA 2UZOA 4C4HA 4ACDA 5L2WA 3E7VA 4DH7A 4C3PA 2C6MA 4QNAA 2QLUA 4FZ7A 5A46A 5KMIA 3COIA 3G51A 1R39A 4E5BA 3GOKA 2ITUA 4MVFA 4NFNA 5FM3A 3QQGA 4AN9A 5EQEA 2X6DA 3ORTA 4C4IA 2OICA 3QTIA 3QUEA 5DR2A 4RC3A 4MXXA 3ZUVA 1JSTA 2C5OA 3QZGA 2IW6A 3LQ8A 5IA3A 5IQFA 2YN8A 2BILB 2E2BA 4ZY4A 4FSYA 3A7JA 3PG3A 4D2VA 3R01A 4DFBA 2UVZA 3UC4A 1GIHA 4G5PA 2OGVA 2VTAA 3KB7A 3MH0A 4XG9A 4BDFA 3VF9A 2I0VA 3PIXA 2OXYA 3PY3A 1W83A 3F3VA 3CPBA 4YNEA 5ETFA 3DLZA 4O7NA 4V01A 4BDDA 3WZJA 1PY5A 4EBWA 5EW9A 4ZS4A 3IKAA 4X0MA 3WARA 4JQ8A 3R28A 5C01A 4GU9A 3NRMA 4LMNA 4BCOA 2XIRA 4M7IA 5CSPA 1Y91A 2PK9A 5EM6A 5JFVA 3CEKA 4G1WA 4AAAA 3OZ6A 2F2CB 5ETIA 2X7OA 1M2RA 5DOSA 4G3CA 4WIHA 4BWPA 4BGHA 3KVXA 4RA4A 4BDKA 4FG8A 1NY3A 5LMKA 3EN6A 3PXZA 2ZB0A 4U43A 3C0GA 3LCDA 4GG5A 4TRLA 5F9EA 3KY2A 5L2QA 3R7IA 4BI1A 3QUDA 3WF5A 5HI2A 3KF4A 3LOKA 3O0GA 5AP2A 4ACCA 3HNGA 2C5VA 4DLIA 2W9FB 3QGYA 4CKIA 4DEBA 4APCA 4G3FA 3TNPC 3QCYA 5FDPA 3P0MA 3A2CA 4Z16A 5B2LA 3OVVA 4FR4A 3QX4A 3B8QA 2H34A 2Y6OA 2F9GA 5TKDA 4C59A 2ZM3A 4BZDA 1SM2A 4C2VA 5FD2A 2QU6A 4L42A 4MD9E 3PJ8A 3QHRA 4IANA 2P33A 3EZRA 4LUDA 1AD5A 3UGCA 5AX3A 5DT3A 3FKLA 2YIQA 1W7HA 1QL6A 4IAKA 4JG7A 2VWZA 3UO6A 2RFNA 3MESA 1DI8A 2R3PA 2RKUA 3QLFA 4YBKA 4YHTA 1IA9A 5E8VA 3I4BA 5AA8A 5CALA 4Z55A 4TYHA 4IW0A 4FKSA 5D41A 3CD8A 2RIOA 5D10A 4BFMA 1Q8TA 2WMBA 3I0OA 4ZZNA 5C8KA 4UEUA 3HEGA 3AT3A 4KINA 4RLLA 3KEXA 4X3FC 1V0BA 4S2ZA 4C62A 4YU2A 4H1JA 4QYYA 3SA0A 2HK5A 2YWPA 3ZO2A 5L6OA 2WTKC 4W8EA 2J4ZA 3ZTXA 4C3FA 1APME 3UPXA 1U54A 4CRLA 3FJQE 3CC6A 3R21A 3S1HA 3JR1A 2GFCA 4L45A 4EWHA 3CPCA 2X7FA 3F69A 2BUJA 2X2KA 4MXAA 2AUHA 4O86A 1BI8A 3QRUA 1XHAA 3DKOA 3GXLA 3I7CA 2GDOA 3QD4A 3R71A 4FNXA 4GIIA 4F7LA 4FGRA 3MPMA 5DMZA 3POZA 2VWUA 3F88A 3LFQA 4IB3A 3P08A 1NVSA 4OAUC 2BALA 1JBPE 5TO8A 5CAQA 4O7RA 3LKMA 1OKWA 2BVAA 3NW6A 1W98A 1B38A 3D4QA 2YCQA 3QC4A 3I5NA 5T6KA 3OT8A 4YZCA 3RAWA 4OT5A 3UIBA 4RIWA 3JPVA 4ZJIA 2BDWA 4O1OA 5KKRB 5LCJA 4MD8E 4DEHA 2X2MA 4JRVA 3HA8A 2QCSA 4L9IA 2E9PA 4IACA 1PKGA 4PX6A 3WE4A 4FKRA 4FICA 4RX7A 3DJ6A 1W84A 3LJ1A 2PVNA 2YM8A 4J8MA 2UZDA 3IS5A 3FMNA 3KK8A 2PVKA 4QMQA 4O82A 3L9NA 5HE1A 3EKNA 4V04A 1Y57A 4IZ7A 3UIXA 2OU7A 1X8BA 2YM7A 2P2IA 3VBWA 4CLIA 1PKDA 3KC3A 1PXLA 2YFXA 3AC8A 4ALWA 1NVQA 4ACHA 1OL7A 1QPDA 3PVWA 3D94A 3Q9YA 2HXLA 3HV4A 4I22A 4QMYA 5DFPA 5EYKA 3ZOSA 3VULA 3D5WA 2CKPA 4XP0A 5LMAA 2QKWB 2BFYA 2F2UA 3TNWA 4QMNA 4CFFA 3O8UA 2QOHA 2WGJA 4FV1A 1JKSA 3LJ0A 3QCQA 5HBEA 3MY1A 4ZLYA 5ITAA 1LUFA 2BZKB 2C3KA 3BHYA 4DEDA 3QTRA 3I6UA 5FXQA 1SVGA 2ITPA 4DFUA 2CMWA 1PXIA 4ZSAA 2OZAA 2C1AA 3AD4A 3TCPA 5HTBA 3T3UA 5LVPA 2B9FA 3P78A 3QRIA 4I20A 5CEOA 2I40A 2R3JA 3LVPA 3OP5A 2W1EA 3ZLXA 4O6EA 4J52A 5AJQA 4YSMA 4BCPA 4D4SA 5IDNA 4EK5A 4EHZA 3ORMA 4KS7A 4NFMA 3CKWA 5DT0A 5E91A 3GQIA 3A62A 4BDAA 3LMGA 2GHMA 2WB8A 3OC1A 3LCTA 1MRYA 1UWJA 3DK7A 3D7TA 3R7UA 4WG5A 2UZUE 4XHKB 2GNGA 1Y6AA 2PVRA 4ZEGA 3FLNC 4UMQA 3AGMA 4RFYA 4UX9A 3G6GA 3R9HA 4ZAUA 3H9FA 2WU6A 1Q3WA 4U45A 1UU3A 4NKAA 1NW1A 5M53A 2PUNA 3ZFYA 2RFSA 2VWXA 3NW7A 2HW6A 3AC1A 3DGKA 2UW3A 4K18A 5L2SA 3P23A 5CSWA 3CTJA 3OCGA 2X1NA 5JEBA 4C4JA 3LMIA 4DF3A 3UMWA 3O96A 1FOTA 4X2KA 3DFAA 4BIBA 5IH5A 4M0YA 1VZOA 2J9MA 2YLEA 3BYVA 4GW8A 5M57A 3AOXA 3R9NA 4JAIA 2ETRA 1IR3A 4FVQA 3R8UA 3EQIA 3V5PA 2JBPA 1Q41A 4EOMA 5KBRA 1HCLA 2G2IA 4BI0A 4E6DA 1F3MC 1OL6A 3FQHA 2VTNA 3ZM9A 4LQMA 4FKGA 1URCA 3QYWA 5KMJA 2XIKA 4QTEA 4H36A 1VJYA 4ITIA 4J96A 2XMYA 4JDIA 4KAOA 5IEVA 1IEPA 4XG3A 5EHLA 5J8IA 2XS0A 4QTDA 4BKJA 1ZY4A 3NUNA 4F7NA 1NVRA 2QURA 3R6XA 5CLPA 5M09A 4KIOA 2HENA 3EHAA 3UVQA 3MGYA 1YHVA 2OFUA 4A07A 4AGWA 5HG8A 5IF1A 2VNYA 4R3PA 3BBWA 3F5GA 1MQBA 2C47A 3FE3A 4ANOA 1HOWA 3EL7A 2QC6A 4IX6A 3WBLA 4C37A 3ZRKA 4P90A 1Z57A 3Q5ZA 4FKQA 4R7BA 3DBCA 3QAME 3GUBA 4BTMA 4PL3A 3PG1A 2QVSE 1YDRE 5IQDA 1XH8A 4ZS0A 3GCPA 4U8ZA 2Y0AA 2GTMA 3IDCA 3HP2A 3OWJA 4RQKA 4NWMA 2W99B 1ZMWA 5HHWA 1R78A 3U51A 3DY7A 3PRFA 4FI1A 4F1TA 5C8MA 2KTYA 2WFYA 3BYMA 3QRJA 5F94A 1L8TA 4ALVA 3BIZA 3DS6A 4GH2A 4FT7A 1I44A 3FC2A 3NCGA 3S2PA 2A19B 1R0PA 3ZS5A 1OBGA 4DCAA 1J7LA 2VNWA 4GUBA 4IDVA 5AUZA 4CCBA 2QO7A 3O8PA 5EYCA 3D15A 3NYOA 3FZTA 4I5MA 4WA9A 1ZOHA 2VGPA 4D0XA 3K5VA 2JDRA 3OUKA 2W1CA 2VTLA 3FHRA 4QMSA 5TT7A 4JBOA 4NW6A 5CQWA 3C51A 1PMEA 4GG7A 5AP1A 4PMTA 5IA5A 1KUTA 4KBAA 2WIPA 4P2KA 3O50A 5I9VA 3GT8A 2QD9A 3LFBA 4DITA 3UYSA 5AA9A 5IU2A 3FEGA 3OCSA 4O2ZA 3IW7A 2XNOA 1G3NA 3CTHA 4RJ7A 4AZEA 2AYPA 5BX0A 5LJJA 2WQOA 5ANEA 3VQHA 4NT4A 3NNUA 5HU9A 5AP4A 4ERKA 3QQFA 4C4FA 2J6MA 4FTLA 5A6NA 3HYHA 2A1AB 1V0OA 3QWKA 3VUIA 4L53A 1VR2A 3R30A 4UV0A 4WUAA 2J51A 2O2UA 3ALNA 3KRJA 3KXMA 3MYGA 2X0GA 4A9RA 3BLRA 2XF0A 2XK6A 3ORPA 4TKSA 2VN9A 3W2CA 2VTHA 3M1SA 3TEIA 4FOCA 2XK8A 3MVHA 5AUYA 1URWA 5A6OA 4FG9A 5LWNA 2O63A 4X2FA 5IUIA 5H8EA 4AACA 4D55A 4ZMEA 2P4IA 1O6YA 5EFQA 5LVLA 5HICA 4BBFA 3BE2A 4IAFA 4W8DA 4EZ3A 1KE7A 3LXPA 2CJMA 3KREA 4O0WA 5HCYA 4GT3A 1XWSA 3EFKA 3DB8A 5HTCA 5FTOA 3VQUA 4RIYB 2Z7SA 3WZDA 4YPSA 4LUEA 2OJ9A 4MBIA 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