2C69A

Crystal structure of the human cdk2 complexed with the triazolopyrimidine inhibitor
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
298
structure length
292
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Triazolo[1,5-a]pyrimidines as novel CDK2 inhibitors: protein structure-guided design and SAR.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
total genus 81
structure length 292
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2005-11-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2c69A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2c69A01
3Q96A 2XK3A 4GFOA 1QPEA 3WI6A 3E3BX 3CQUA 4UEUA 4PP7A 4AZVA 3KXGA 4QP1A 4D4VA 2J50A 3EQRA 4D9TA 3RBWA 2VNYA 5FDPA 3ROYA 1J1BA 2JC6A 3OWPA 1URWA 2ZM3A 5TF9A 4F7NA 1GZNA 4FV9A 3R1NA 4FUYA 1OGUA 2GNLA 4QMOA 1OIUA 3PJ3A 5H8EA 3F9NA 3TJDA 4IBMA 4M12A 4GK4A 1W8CA 3G0EA 4FV5A 2W1EA 3V01A 5CU2A 1PXKA 4X0MA 2WQBA 3QKLA 4HGLA 3V8SA 3MJ1A 3ET7A 3TI1A 3DU8A 3LMIA 3DTWA 4AX8A 1ZZLA 2W4JA 3EQCA 3NYXA 4GU9A 1KE7A 2NRUA 2XIZA 5K4IA 4DCAA 3IW6A 4IB0A 2CDZA 1OIYA 4QTDA 4HGSA 3G9LX 3GU7A 3LXNA 4EK3A 2IN6A 4UMTA 3V3VA 3A7JA 2WTWA 4EOKA 2F7ZE 3VUGA 3MFRA 4I6QA 1G3NA 4QNYA 4HNIA 4JR7A 4BYIA 3NEWA 4IZYA 3JXWA 3L8XA 2REIA 3ENHA 4C36A 4F7LA 3RALA 2PZ5A 2R3KA 3DDPA 5D7AA 5J7BA 4O7WA 5JK3A 3ZEPA 3TKUA 3F66A 3OWKA 4JQEA 1WZYA 4FL2A 4PDOA 2PE1A 3BBWA 3VN9A 4D2TA 4GG5A 4ZXTA 5A9UA 3QGYA 4L7FA 3QRIA 2GTNA 3RP9A 2O63A 3F5XA 3FC2A 5AR7A 3C4CA 4ZSJA 4EH2A 3EN7A 4H3PA 4WG4A 3TZ7A 1B6CB 4FEUA 2W96B 3NW6A 2W0JA 2W1DA 2W7XA 2IG7A 4CFXA 4P5ZA 5FG8A 3MH1A 4DH3A 4F64A 2WTJA 2YM6A 4D9UA 3NX8A 4O1PA 3F61A 4FV6A 4TYGA 4JRNA 4O1OA 3DAEA 3PP1A 3R8ZA 4FNXA 5HGIA 4EOSA 5FUTA 4C3FA 4CSVA 5BUJA 3E8EA 5I0BA 5T68A 4BCJA 2BR1A 4M66A 2WTKC 4MF1A 3GVUA 2CKOA 3QD4A 4KNBA 2R3RA 1YI6A 2WEIA 4N0SA 5AAFA 1GIJA 3AC4A 1QPCA 4AZEA 4R77A 5DIAA 1Y8YA 5CF6A 5ANJA 1XR1A 4I23A 1H1WA 5DR2A 4LRJA 2GNJA 3FSFA 3SD0A 4YURA 3FMLA 4FKRA 5EM6A 3EN9A 3C13A 2ITPA 4MNFA 5HG7A 3FBVA 2BIYA 4PDSA 2Y0AA 3CTJA 3F69A 4BGGA 3OEZA 4GIHA 4G6NA 4MD9E 2EXEA 3VUTA 4ASXA 3PE1A 3Q9WA 4J8NA 2W05A 3LMHA 5E8YA 3VHKA 4ZSGA 2QO7A 4IW0A 4C8BA 4UZDA 1X8BA 3A4PA 1H28A 5HORA 2R4BA 4O6LA 4OTRA 4FF8A 4EZ7A 2O8YA 1Q61A 3HP2A 4X21A 3EL7A 1SVEA 1TQMA 2WKMA 4QP4A 4M7IA 3F5PA 3BCEA 4MBLA 3AQVA 1M2PA 1UU3A 2AYPA 2C1BA 2VWYA 2ZV7A 4FBXA 4FKSA 3S2PA 3H3CA 1H24A 5IH5A 3ZLXA 4OAVB 2I0YA 1H1SA 3TIZA 3GT8A 2ZOQA 5E91A 2WXVA 4FKOA 2QURA 2R2PA 3G6HA 4YJPA 3PJCA 1YDTE 1WBWA 1WVWA 2YWPA 4FSRA 3UOHA 5M06A 2CLXA 5IUGA 3HMNA 2JBPA 3PVGA 3ZFYA 4AW2A 1WBTA 3CCNA 3KMWA 4R1YA 3SDJA 3DKOA 1CSNA 1OITA 3C4XA 4JAIA 4YZ9A 1NVRA 2PVRA 3HA6A 2VWVA 3H10A 1V0PA 5D11A 2H9VA 2OW3A 4BIBA 4GEOA 3SKCA 3BWJA 4EC9A 4WO5A 4YC8A 5TE0A 2C6IA 1H26A 5C03A 2A4LA 4ANLA 4RT7A 3D5UA 3DJ7A 1Q3WA 4GV1A 4C02A 4G3FA 5AV3A 3BLRA 3QQLA 4ACGA 5IMEA 5CAVA 1VYZA 3UC4A 2WD1A 1MRYA 4MTAA 4OBQA 4RQVA 5HCXA 1YXSA 3V6RA 5A46A 2R3GA 4I4FA 5CAUA 2VTSA 5FDXA 5EQEA 4ASZA 5GJGA 3QZHA 3R1SA 4FI1A 1OBGA 3L9NA 4EJNA 1OL6A 5BMMA 2OIDA 5AADA 2B4SB 3BX5A 4MXCA 4S34A 3WE4A 3R9NA 2WMQA 2YIWA 4NYEA 4EH8A 4S30A 2PVFA 4LV5A 3R00A 5CU6A 3ZZEA 2JIVA 3RM6A 2PUIA 2VO0A 3CD8A 5CANA 3QTUA 2GQGA 3GNIB 3HMMA 4JAJA 4HGEA 4XP3A 3NUPA 4NW5A 3PSCA 1JSTA 4P5QA 1YHWA 3EQDA 2PVMA 4JRVA 1LUFA 4C4FA 3TTJA 4WKQA 2OJJA 4QYHA 3ERKA 4C57A 1LEZA 5DEYA 4S32A 5AX3A 4YSMA 4AE6A 5BNJA 4A9SA 3MVJA 3HKOA 2C5NA 3FQEA 4PF4A 3AC8A 4AT4A 4F63A 4QTEA 4Z3VA 2BZHB 4XX9A 4YZMA 3W16A 4EH6A 3NGAA 4M84A 2ONLC 3MBLA 3S0OA 4BTFA 1OI9A 4FG8A 4PTCA 2VGOA 4XNEA 2WO6A 5CSVA 4ZMFA 2GNGA 4USFA 4C34A 2P2HA 4L42A 3VF8A 2C0IA 3IW8A 3AT2A 3PVUA 3QRTA 2OBJA 4KSPA 4RA5A 2W9FB 4UMQA 5H2UA 2OGVA 4BI0A 1AGWA 2CLQA 4EOIA 4F9WA 5M4IA 4PPCA 4CLIA 2Z60A 1AD5A 1OPKA 5FRIA 1FOTA 4D28A 3QTXA 4LV8A 4DEBA 3GUBA 4RFMA 1Q8YA 1WAKA 3ZOSA 4HVSA 2FO0A 5IU2A 2PYWA 3ANQA 1ZYSA 3TUCA 2W5AA 2XM8A 4BDAA 4FTJA 5IEXA 4CRLA 3ITZA 3VS5A 5IH6A 4O7YA 4GW8A 4JIKA 4YP8A 5GZ9A 3ZDUA 4ZTLA 3RNIA 1XH9A 5CF4A 2BMCA 5JQ5A 2G2HA 2W1CA 3I0QA 4G2FA 4RWIA 5HD4A 5LMKA 4FEQA 3HX4A 4A7CA 3K3IA 2PMIA 4FSZA 1CM8A 2FSOX 4QTAA 2UZDA 2HZ0A 3FLZA 4RIYA 1VR2A 2WU6A 1P4FA 4WUNA 1O6YA 4RIWA 1RQQA 4U3ZA 2X8EA 3KF4A 3WZJA 4O81A 3R0TA 2X4FA 4RLLA 1UNGA 3AC2A 3QCXA 4FKTA 4R3PA 3AC5A 1PXLA 3JY9A 2CN5A 3OXIA 3NNXA 4X2JA 5AP7A 4CRSA 3WIGA 3Q60A 4KUJA 2ITXA 2QOLA 1T46A 4H1JA 2BRBA 5EW8A 4QMLA 2HW7A 3F5UA 4YNEA 4BDGA 5CXZA 3BE9A 4CVAA 4CTCA 3TKHA 3OD6X 1H0WA 2B54A 2X9EA 4FV4A 5A4LA 3UO4A 5KKRC 4EWHA 2OZAA 5I4NA 3FE3A 3NIZA 4FTKA 1BL7A 4M69B 2CSNA 2XBJA 3A7GA 4FSNA 3GCSA 2OJ9A 1MP8A 1Q8ZA 2OXXA 3CY2A 4MWIA 2PVJA 3DK6A 3GQIA 4ZZMA 2PVNA 4W8DA 3VQHA 4B8LA 4UMUA 5BVKA 5J7HA 1VEBA 3U6HA 2Z7RA 3PLAE 5L4QA 3C4WA 5AX9A 4YTFA 4FOCA 1OKWA 4DGNA 3LXKA 3NNWA 4FKUA 4LRKA 2VO7A 2ITTA 4P7EA 1Q8TA 4K1BA 3NDMA 5K4JA 3WBLA 2BDFA 3TNWA 3MPAA 1YQJA 4AA5A 4X3FC 3SX9A 3SW4A 4IC8A 3QTQA 2XK9A 3A4OX 4LUEA 4PMTA 3R9HA 2J0MB 3DKCA 3PXFA 1F3MC 1PXPA 2YITA 3KKVA 3PPKA 4TRLA 5IEVA 3OW3A 5AR5A 4BHZA 4W9WA 2IVVA 2V7AA 1F5QA 4NT4A 2VTIA 5L6OA 1ZMWA 1ZWSA 3LQ5A 5HNIX 1YRPA 2BPMA 2GCDA 2YAAA 4QYGA 2XBAA 2FVDA 3D7TA 2WMSA 4JDJA 4ZY6A 5IF1A 5CNOA 4DGGA 1BI7A 4M14A 2F49A 1ATPE 4L3LA 4A4OA 2WOUA 1AQ1A 3FZRA 4UWYA 3POOA 4ZJIA 4YJRA 4O83A 4D0WA 2XEZA 5GHVA 4B7TA 5J9YA 4KINA 3FQSA 4JQ7A 2UW0A 4KD1A 3WOWA 4TYEA 4JBPA 5ETAA 5LCKA 3WILA 2QOHA 4BL1A 4L9IA 2W1IA 3R8PA 4E26A 5AUUA 2P55A 2XIKA 4QQTA 1ZARA 2VNWA 3M11A 4G5PA 4FT5A 4NSTA 3DDQA 4YC6A 2PWLA 3M2WA 5FTQA 5JFVA 2YJSA 5A4CA 2Z2WA 4NFMA 2CCIA 5HBHA 5HTIA 1ZRZA 2C6EA 4K0YA 4BICA 3I79A 4C3PA 4EZ3A 4Z9LA 3TCPA 1SMHA 4O2PA 4IANA 4RA4A 4E5AX 4DTBA 3DB8A 3DTCA 5CENA 2E9VA 4EH4A 3D15A 2X6EA 3WYYA 4YMJA 2CNQA 4D2WA 4D1SA 3E64A 2B1PA 4L43A 3SC1A 2HXQA 3E8DA 4I20A 2PE2A 4FKIA 4WUAA 4ALVA 5AAGA 1UA2A 3QUDA 4C3RA 3KULA 3NCZA 5AMNA 4ASDA 5J8IA 5HESA 1R0EA 3VULA 4U45A 2XIYA 3TL8A 3D83A 4JBVA 4UZHA 3P79A 4P4CA 2YM8A 5AM7A 4ANNA 3PPJA 4GU6A 5AJQA 4APPA 3P5KA 2WU7A 4EBWA 2JAVA 2PZPA 2XNGA 3NUXA 4G3DA 4IAFA 4WNKA 3P4KA 1B39A 2LAVA 1G5SA 3FXZA 4HVIA 5FXRA 3KXNA 3MN3A 3P7BA 4BCQA 4AAAA 3SGCA 3M1SA 4XP2A 2DWBA 2VTRA 4MBIA 3RK7A 4G17A 2PPQA 3HZTA 3ZLWA 2R3JA 2JKOA 4FTNA 3GC7A 1FGKA 5L8JA 5IEYA 5BQ0A 2JLDA 2CGVA 3AD6A 3DNDA 4PP9A 2R3PA 2QOIA 3DGKA 3F5GA 4PWNA 4XOZA 3SHEA 2VTAA 3PVBA 3ZMMA 4YLJA 4AOIA 5AUVA 3GCQA 4YJNA 4AP7A 2HZ4A 3HNGA 2PL0A 2X7OA 2YIYA 4BCMA 2XA4A 4IEBA 5E7RA 2HWOA 2BVAA 3KN6A 4FEWA 3FI8A 4OBPA 3QQJA 5GJDA 3WZUA 3TG1A 2RFDA 5J1WA 2O5KA 3FYJX 4DTAA 1YI4A 3GQLA 1Q97A 1XBCA 4G16A 2DUVA 3OW4A 3KA0A 3FMDA 4HW7A 4AFJA 3ANRA 5BVNA 2O0UA 2C3JA 2XYUA 4QYEA 4RX7A 4G6OA 1R78A 4G3CA 2FSLX 3C1XA 3F88A 3QRUA 4GIIA 5ANDA 3F7ZA 4FIGA 4H3BA 3PG3A 5DVRA 5E8SA 3ULZA 4EL9A 3R9RA 1S9JA 5CEQA 3EOCA 1FGIA 4BGQA 5BVFA 1YHVA 2OZOA 1WVYA 4YTIA 3PJ1A 3QHRA 5GINE 3QRKA 4EI4A 4Z55A 2JKKA 3I6UA 3PE2A 3BHUA 5EKNA 3DA6A 4H58A 2NRYA 4G31A 1NW1A 1HOWA 2C3LA 1I09A 4AGWA 5J1VA 4FMQA 4IH8A 1G8AA 4ZMEA 2R3NA 3BYVA 5K3YA 5LQFA 2HWPA 4RLKA 3HUCA 1OL7A 3BLQA 4EOJA 5HHWA 3N4UA 2W5HA 3H0ZA 5IUHA 1Y6BA 5M07A 4DEEA 3QFVA 2VWBA 3NPCA 5D1JA 1IG1A 3FKNA 3ATTA 3IGGA 3FHIA 1CKIA 3DFCB 4RX8A 5IQCA 4XV9A 4FVQA 1O6LA 1OIRA 2I0VA 4QMXA 4F6WA 3NNUA 4XG4A 4CKJA 2BUJA 3FHRA 4UYAA 5HTCA 2UW3A 4PX6A 4WSQA 2WTKB 3OT8A 5IA4A 4N4SA 2F4JA 3KGAA 4E4MA 4AG8A 2UZNA 4BKZA 2BAJA 5IDPA 4MCVA 1WBPA 3MWUA 4BWKA 4FNYA 4B99A 2GTMA 1M7QA 1OBDA 3GI3A 4IVAA 4C4IA 4G1WA 4RJ5A 5CAOA 3SXFA 1J91A 2W4KA 2C5XA 2VX0A 5HLWA 3VUHA 4O0VA 5DT3A 3NZ0A 4K2RA 4M3QA 4S2ZA 3SV0A 3UOKA 5CEOA 1IRKA 3A8XA 3BV2A 3FZTA 3DLSA 3I7CA 4IDVA 3GU5A 4PDPA 4CMUA 1Q62A 3HECA 5LARA 2UW4A 4YJQA 3KXMA 3QBNA 3Q9YA 3WF7A 2XK7A 3QQUA 3Q3BA 5HEZA 4DG3E 4L01A 4KRDA 2PULA 3COHA 3NWWA 4KIKB 3BHHA 3HV3A 1RJBA 5IA2A 5CVHA 2ZYBA 1H27A 3DKFA 3V5PA 2UZBA 4ZSAA 1PXMA 3H9OA 1SNUA 1UV5A 3QX4A 4J97A 4CV9A 2YA9A 3OOGA 1ZMVA 3QCQA 4RFYA 3RPSA 5CASA 2E9PA 1MUOA 5BYLA 3ZLYA 4FKPA 4RJ4A 5C01A 3MIYA 4YPDA 4MBJA 4YZCA 5ACBC 4RC3A 4DLIA 3R8VA 3AT4A 2C6LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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