2C69A

Crystal structure of the human cdk2 complexed with the triazolopyrimidine inhibitor
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
298
structure length
292
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Triazolo[1,5-a]pyrimidines as novel CDK2 inhibitors: protein structure-guided design and SAR.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 292
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2005-11-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2c69A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2c69A01
5JGBA 2HY0A 3L8PA 4FKGA 5AAFA 2C6EA 4APPA 3R83A 3BU6A 2VZ6A 4FV6A 4DCAA 5C8NA 4FTIA 3N4TA 5JK3A 3UBDA 1XWSA 4TWOA 4H05A 1LP4A 2QODA 2PVKA 1PXOA 3BU5A 4YNEA 4EH2A 2UZVA 4S32A 2ITNA 4GH2A 3EQBA 5GIOE 2OIBA 4FTKA 4X6QC 5AX9A 1URWA 1SNXA 3U9NA 1CKIA 5E8UA 3U55A 5EM6A 3EMGA 5BVFA 3VUMA 3DB6A 4YGAA 4CV9A 1GZ8A 2HXLA 3MJ2A 1YVJA 4K11A 3AGLA 1VEBA 2WO6A 3PP1A 3F82A 3RAHA 2ACXA 4RIXB 3QD2B 3ZMMA 3PSBA 3ZFMA 2XVDA 5HKMA 3R7IA 3LLAA 3EOCA 2R3MA 4HPUE 2BDWA 4EYMA 5LVLA 4FTAA 4QMMA 3O7LB 4DA5A 1FGKA 2Y6OA 1W82A 4O1PA 2VWYA 5DRDA 2WQMA 4OTGA 4QYGA 3QXOA 4ASXA 4ENYA 2B9IA 4AACA 4MXXA 4ORKA 1XH7A 1G8AA 4BCKA 4FKSA 4P4CA 1OKZA 3E7VA 5IQFA 3HMIA 5BVEA 1JVPP 3NNXA 3QTQA 4WO5A 5HG9A 4IVDA 3PG1A 3PRIA 3WZEA 3PVGA 4JI9A 3LM0A 4PDPA 5BUIA 2OIQA 3C5IA 3IDCA 4EOOA 4F99A 1O6YA 3LCOA 4Y5HA 1YI3A 5AUXA 4AFEA 2OJGA 5LMKC 3P79A 5IUIA 5TO8A 5JQ5A 3UZTA 4QD6A 1PXNA 4QYEA 4E6AA 4DLIA 3PE2A 1M2QA 4J1RA 4FKQA 4J53A 4NUSA 3MW1A 5AMNA 4I5MA 2X7OA 3R9NA 4L01A 2F7ZE 2WTIA 2WXVA 3KN6A 4GV1A 4NM0A 4UWCA 4JR3A 3RHKA 2I0VA 4TPTA 3MDYA 4HYSA 2XA4A 4FSQA 3HV3A 3IG7A 5GNKA 4F6WA 4RJ5A 4II5A 3BQRA 3I60A 1A06A 1GZKA 3BGQA 4Q5EA 3CXWA 3UIBA 2J5EA 1P2AA 4F7SA 4AZVA 5EYKA 4LL0A 2IG7A 3LFEA 4EL9A 4YJNA 5DWRA 2PYWA 1LR4A 1VYWA 3A4OX 4PMTA 2YM3A 2YABA 3KRRA 4R5SA 4TYHB 4D0WA 3HMPA 3KVXA 1GIHA 5TKDA 4EONA 4DH3A 3ROCA 4FSWA 4R77A 4E6DA 5HD7A 1GIIA 1U59A 4KRDA 4QMLA 4C58A 2HXQA 5TE0A 5HTIA 2J50A 3TN8A 2P3GX 4JQEA 4GVJA 4DAWA 4GFGA 2QC6A 2XCHA 3ORXA 5A6OA 1ZYCA 3NAXA 4QP8A 3FQEA 3OWKA 4QTAA 4DBNA 5BYYA 3TDVA 4JG8A 2B53A 3O50A 4FG9A 4YZBA 2J0MB 4CRSA 4NKSA 3CSVA 4N6ZA 4DTBA 3A2CA 4D55A 5BVNA 5H8GA 1OUKA 2YM7A 4AW5A 1V0OA 3MH3A 4IB1A 3PVWA 1CTPE 3L8SA 1XBAA 1OM1A 2UZUE 2UW7A 3DFCB 4J52A 1JKTA 4FVQA 5CAUA 4LOOA 2XP2A 4AX8A 4F63A 4MWIA 2R3IA 2I0HA 1YHWA 4BDJA 2R3NA 4UZDA 2HW7A 4QPMA 5IZFA 2I6LA 2E9OA 5E8VA 4L6QA 4RWLA 2XKDA 3L1SA 4ACMA 4XP2A 4HJOA 3I7CA 4XBUA 4X7QA 3OXZA 4EEVA 4BDAA 4RPVA 1F3MC 4D5HA 3PXZA 5AM6A 4AG8A 2R5TA 5AUWA 2XZSA 4UB7A 4FYOA 2JDRA 3CPCA 3PUPA 4KINA 3VUIA 4OAUC 2A1AB 3MTFA 3NIEA 5AADA 4G3GA 4XG4A 3FEGA 2VGPA 2C6LA 2YAKA 4IAYA 4G1WA 4L7FA 4XV1A 4A9TA 5IA3A 1PMVA 1WVWA 2C1BA 4AGWA 1JQHA 3FLSA 5HX6A 4WNKA 5LVPA 3D83A 4TN6A 1KE5A 3VJOA 4AGCA 3FC2A 4EC8A 4AT3A 4YU2A 5CAOA 3MWUA 3GXLA 1W0XC 4FT5A 4FSUA 4PNKA 3F7WA 3EZRA 4FBXA 4HGEA 4ZJIA 1Y8GA 1SMHA 3ID6C 5HOAA 3HV4A 3GP0A 4BKZA 4GL9A 3DBCA 4MX9A 3S3IA 3UYTA 4NFNA 1KUTA 4IC8A 2VX1A 2VO7A 3CY3A 3UDBA 1Q97A 3QGYA 4L52A 2VTHA 1O9UA 3C1XA 2ITQA 4O7VA 3A4PA 3QRTA 1FMOE 1YWVA 3PY0A 3RAWA 4HGLA 4YSMA 3HAMA 4QMYA 3VULA 5H8BA 4LGHA 3S0OA 2QG7A 2W4KA 3ET7A 3D5WA 3R01A 3V5PA 2OO8X 4EK8A 5M44A 1G8SA 1Z5MA 3TG1A 1UWJA 3LXLA 5TOZA 5EI2A 4PP7A 3VC4A 4ZMFA 3Q53A 2CCIA 2XM8A 3HV5A 4CLIA 1R78A 3LVPA 1HCKA 4A4XA 3FMMA 4LFIA 4O38A 3TJDA 3VW8A 4LRMA 4FE2A 4LRKA 3C13A 2JKMA 4EJ7A 2VWWA 4IX4A 5L2SA 3EQFA 2HWOA 5CENA 2FYSA 3MBLA 2QHMA 3W2OA 3NNUA 3F3UA 5ANKA 2OF4A 3L9PA 3MPMA 4W8DA 3ANQA 5DOSA 3KF7A 5M08A 2H96A 2X6DA 4NZWB 5BQ0A 2OJIA 3ZM4A 5EQPA 2VWXA 5KE0A 1WBNA 3H0ZA 2UW6A 3Q9XA 5CY3A 2CN8A 2WPAA 1SM2A 2PVHA 3NX8A 4ZSEA 4ZSLA 4H58A 4JLCA 3LE6A 3WZKA 4L3LA 3MSSA 3OXIA 4DG3E 3ZO1A 2BFXA 3MY0A 4X3FA 3WE8A 2IZUA 2UZWE 4GFOA 5D11A 1BI8A 2WIHA 4EWHA 4EK4A 5HE0A 3M11A 2XH5A 2RL5A 4TW9A 4WIHA 4WSQA 5HG5A 4EOQA 3TUCA 2R64A 4QPSA 2YISA 4FKWA 1KOAA 4KKGA 4XLIA 4I6HA 3R7EA 1Z9XA 5B2LA 2XYNA 2HK5A 5AA9A 3LZBA 5CF6A 4AOJA 2UVXA 4DHFA 1IRKA 4C4IA 3PWDA 5IH5A 4U9AA 2C6IA 1JSTA 4NM5A 1UKHA 1ZWSA 1XHAA 2JBPA 3Q6UA 3ALOA 4DFNA 3BGZA 3A7GA 1HCLA 1UNLA 3NUYA 4QQCA 3DQWA 4NT4A 3S4QA 1AGWA 3KY2A 4WUAA 2XUUA 3F5XA 3GQIA 3UG1A 4FSMA 2YCFA 3FXWA 3ZSIA 2WU7A 3KN5A 3ALNA 3KU2A 2E9PA 4PPAA 3SVVA 3CIKA 3RZBA 4FR4A 3VS3A 3HDNA 2RFNA 1JWHA 2YJRA 4CQGA 4OGRA 4X21A 2PVLA 4GYIA 1CMKE 5EOBA 4XUFA 4QYYA 5CANA 2BMCA 3C4CA 4EH6A 4FZ7A 3QZHA 3R1QA 5BVOA 3N4VA 3MVJA 2J4ZA 2FSMX 3BYVA 3IK3A 4OT6A 5CVFA 4FX3A 5HU9A 2R3FA 4G2FA 1OBGA 4BRXA 4BYJA 1JBPE 4G5PA 3FMLA 3FDNA 4V05A 5EI8A 1J1CA 4GW8A 3ANRA 4W4YA 4X2FA 2O2UA 2JD5A 3F9NA 2WMRA 3P7CA 4R6VA 1YOMA 4JBVA 4ZJVA 3U6JA 4FEVA 3H0YA 5CWZA 4FKJA 3QXPA 5J5SA 1ERKA 3A8WA 3QGWA 4K33A 4DGMA 2BFYA 2B4SB 2ZDUA 2YIQA 4O0UA 4F09A 2PZ5A 4EZ5A 4QYFA 4XV2A 3SXRA 1KOBA 3MIYA 4C4HA 2YEXA 3EKKA 2NNWB 4AWIA 4JVGA 4ALUA 4R3RA 3VF9A 1A9UA 4GUEA 1PMNA 2C3LA 1SZMA 1REJA 2Q0NA 4FTMA 2R3RA 3FUPA 4FIGA 4ZP5A 1OITA 3D7ZA 3COIA 1DAYA 3C4WA 4RWIA 1CKPA 2GPHA 4O7YA 3KRXA 4FV3A 4RIWA 2XBAA 4U6RA 4ANBA 4CYIA 3F6XA 3FMDA 4BCFA 4DN5A 3RWQA 3CTQA 5L6WL 2R2PA 4FKOA 4LV5A 1PKGA 4IADA 1GIJA 1PXLA 3RHXA 2PHKA 4FSTA 3FI2A 4U79A 5JZJA 5K4JA 3R1SA 3KRJA 5GZ8A 2BIKB 2PVJA 3QFVA 4IZYA 4RT7A 4FV4A 1YOJA 3ZLWA 5J7HA 3RWPA 1L8TA 4CFMA 3LFQA 3DK3A 4WKQA 2VWIA 3QQGA 5M55A 2CJMA 2YZAA 3GU4A 5CEMA 4ZTNA 4C3RA 3BHUA 1OKVA 3BHTA 1KE7A 4N57A 1VYZA 5LQFA 4EZ3A 4F9WA 2YJSA 5CXHA 1H25A 3KXNA 3R7UA 3WARA 5IUGA 1WBTA 4TYGA 2HIWA 5JKGA 4FG7A 5KHWA 2WTJA 4C62A 2XNBA 4WBBB 3FMEA 4F1OA 3RI1A 1R0PA 4Q9ZA 3ZBFA 1FMKA 3UZRA 4A9RA 4RBLA 3R9RA 2LGCA 5I3OA 4PX6A 2X8IA 3VS6A 3KREA 4FZDB 3RNYA 1SYKA 3ORNA 5EYDA 2GQRA 2VU3A 3AT3A 4U41A 3L8XA 4O7ZA 3FLYA 1W83A 3MN3A 5FM3A 1PYEA 2XB7A 3G5DA 3OP5A 5GJFA 2WAJA 3EIDA 5HZNA 3IPHA 4FMQA 2WIPA 2AC3A 2O65A 3P78A 4G16A 3M42A 3UGCA 3JUHA 4MWHA 4MD9E 3O96A 5A46A 2JIVA 2V55A 4DEDA 4EKLA 4PRJA 3D7TA 4U43A 3BPRA 2X2MA 2VX0A 3OF0A 4NU1A 5CI7A 3VS5A 1IAHA 4S2ZA 2G1TA 2QKRA 3Q04A 3QQFA 2VO3A 4IBMA 5JEBA 4KA3A 3U4UA 4NCTA 4BKYA 5L2WA 3A7FA 2YITA 5CNNA 1W7HA 4J8NA 3PPKA 2BRNA 2CGWA 3UPZA 2X8EA 3Q4ZA 5EI6A 4EWQA 4C7TA 2B9JA 4PY1A 5HBEA 3LXNA 4ZTLA 4GU6A 1W8CA 3EQIA 5H2UA 1B39A 4FOBA 3U8WA 3PLAE 3AC5A 2C6OA 3BQCA 3LMHA 3NUXA 5DGZA 5T68A 3I4BA 4GK2A 2CNQA 4AXAA 4BI1A 3AC8A 3QQKA 1FQ1B 5M4IA 2VGOA 4QMOA 1WZYA 4K9YA 4RLLA 4Y85A 4U7ZA 3HX4A 4FKTA 4BCHA 3LFNA 4D2VA 2OF2A 2UW3A 2WTKB 1LEZA 1ZY4A 3GB2A 2V5QA 5B2MA 2F7XE 3GOPA 1L3RE 3RKBA 3PP0A 2BDJA 1URCA 2R3LA 2RFEA 5C4LA 5E4HA 3TXOA 2ZJWA 2W06A 4FNWA 4YJVA 3V3VA 5CF8A 3LFCA 1FVTA 1Q3WA 3EN7A 1UWHA 3VO3A 4M13A 5EM8A 1Q24A 5KUPA 3EN6A 1H27A 3GC0A 1OIQA 3FLWA 4NSTA 2PUPA 2VUWA 4GJ2A 4R7BA 3ERKA 4DYMA 4I24A 3M1SA 5IMEA 5CT7A 2JIIA 4JOAA 1MQBA 3NZ0A 3FPQA 4I94A 4LM5A 2F49A 1UA2A 5JFVA 1KE6A 4AW0A 3II5A 4E1ZA 4PPBA 5LCJA 5HVYA 2JITA 3QKLA 2PU8A 4O84A 2CGVA 5F4NA 4LL5A 4F9YA 3ZEWA 3P08A 1AD5A 4I0SA 5AV1A 3I0OA 2CHLA 1WBVA 3V5LA 4XS2A 3AMYA 3EKNA 2WKMA 4L46A 2WTVA 2PL0A 1Q61A 1NY3A 4IX6A 2C0TA 4TY1A 4UMTA 5EYCA 1CSNA 4ERWA 3D5XA 5FRIA 3LJ0A 3L9LA 3H9OA 2BZJA 3TJCA 3Q5ZA 3VS1A 3MTLA 4AN2A 1M2PA 3CE3A 4QP4A 2DWBA 2CPKE 2PMLX 4FC0A 5LJJA 5L6OA 4K0YA 4JR7A 3GU6A 5A54A 4YJUA 4XX9A 4USEA 3MH0A 4JBQA 3ZXZA 4KS8A 3D2KA 2OU7A 3GU8A 3W33A 4BDIA 3A99A 5HE3A 5LCKA 3QLFA 4IQ6A 4KKEA 1YWNA 1XBBA 4AZEA 4U3YA 4FEQA 3KCFA 3BYUA 3BKBA 3PY3A 3ZUVA 1U54B 4EOJA 1H26A 2C5NA 1SNUA 2QQ7A 4Y8DA 1BKXA 1OGUA 1SVHA 3EQHA 4DE4A 5EW3A 3EL7A 5BYZA 4D2SA 3VWAA 3FYJX 1PMUA 3QLGA 3A7HA 3KL8A 4QMZA 2OXYA 3W8QA 5HBHA 4J96A 4X3JA 4BCIA 4UMQA 4EOSA 3IOKA 2BIYA 3RMFA 2JBOA 2H9VA 2YERA 5DEYA 4OTRA 3GC8A 3ZDIA 3NVKI 2PMOX 2X9FA 3CD8A 4JL9A 3WZDA 3TIZA 5AUUA 3HMNA 2I40A 3G6HA 2W0JA 1VJYA 3FI8A 4YBJA 1IAJA 3H30A 4QMUA 5LMKA 2JKOA 2ZMDA 4YJSA 5FUTA 4AFJA 2QURA 1OVEA 2I0YA 4M3QA 4QNYA 4JAIA 4DC2A 3ACKA 4NTTA 3Q60A 3LFDA 4I20A 5BUEA 2WMQA 5FTQA 3MA6A 1QPDA 2R3GA 2XJ2A 4UWYA 4G3EA 5A4CA 2J7TA 4ANNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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