2DQ7X

Crystal structure of fyn kinase domain complexed with staurosporine
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
263
structure length
262
Chain Sequence
KDVWEIPRESLQLIKRLGNGQFGEVWMGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPESFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFGLARLIEDNETARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMNNREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQSFLEDY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of human Fyn kinase domain complexed with staurosporine.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
total genus 68
structure length 262
sequence length 263
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2006-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2dq7X02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2dq7X01
3GP0A 1JPAA 4GV1A 4CYJA 3PXZA 5BNJA 1AD5A 4TYGA 3T3UA 2XIRA 2OH4A 2IO6A 5D12A 4CTBA 4I6BA 2BKKA 1FVTA 4FVRA 1FMOE 3DFCB 5LCKA 4D1XA 3BHTA 5B2KA 4JQ8A 4EOOA 1PRYA 5KUPA 3G0EA 4FSYA 1XH7A 4YPSA 2YA9A 3ZEPA 5LMKC 2QD9A 5L6PA 1H0VA 1KE9A 3ODYX 5I9XA 4C3RA 2UZTA 4IWPA 2PVJA 3VBWA 3ZUUA 3R01A 5C4KA 4JR3A 3KL8A 1OL1A 2OG8A 1H26A 4MKCA 4Y95A 3PXQA 5AX3A 5HBHA 1Y6BA 4B99A 4RJ7A 5AWMA 4KS8A 3CS9A 5CS6A 4ANNA 2UZLA 3QQKA 2V7OA 1DS5A 4FA2A 4U6RA 2LGCA 3BWFA 4F6WA 4AACA 3TZ8A 3CLYA 3HX4A 4QNAA 5CENA 4PF4A 3VUHA 4GRBA 4UYNA 1XO2B 4NKSA 4ZSEA 5IQCA 4TT7A 1Q41A 3QGYA 1XH8A 2XK6A 4M97A 3A4OX 4OR5A 4BDBA 4R78A 2ITTA 4I93A 3DAEA 3LFQA 4ANQA 1UVRA 4OTFA 3DA6A 4LQMA 2R3KA 2UV2A 5HE3A 2FVDA 3G90X 3KRWA 4FIFA 5I9VA 4OBQA 3C7QA 5FM3A 4WBBB 2J4ZA 3ZRKA 2ONLA 5J9YA 3ID6C 5A54A 5HTCA 3ZZEA 5CU3A 3NSZA 3B2TA 3DT1A 3DBDA 4YZDA 3G0FA 4IHPA 3WF9A 2WU7A 2CLXA 4QTBA 4QYEA 5FDXA 3O7LB 4FC0A 2WMVA 3LMIA 1W83A 3RVGA 4QYYA 3I0QA 4C4EA 3NUSA 1JSVA 3UGCA 3FQHA 5L2TA 3G6HA 3VS3A 4J96A 2F2UA 2RG5A 4UX9A 5FQDC 1ZOHA 2QO9A 3MTFA 1SZMA 5IQDA 1FPUA 3OS3A 1AQ1A 4ALUA 3I79A 3W2SA 4UMUA 2VWYA 4RMZA 5E4HA 4G6OA 4MHAA 4JX7A 5BVFA 2VNWA 1BX6A 5L3AA 4FEXA 4ZTMA 3S4QA 3POOA 1M2PA 2F57A 3A7JA 4I3ZA 3TV4A 3OZ6A 2BZHB 3IK3A 4ZY5A 4R5YA 3MH1A 2J51A 4IEBA 4TYHA 2JDVA 4BTFA 4CKRA 4BCGA 3R21A 5AUXA 3VUMA 3FLNC 1Q3DA 4ANSA 2OXXA 3UMWA 3GT8A 4M14A 4FV4A 4JIKA 2VX0A 3Q32A 3BEAA 4NW6A 2KULA 3E62A 3R8LA 5A6NA 1ZYJA 3W8LA 2G15A 4EH7A 2FSMX 5M44A 2WEIA 2C47A 4U79A 3V01A 4I5HA 5CAQA 2XIKA 4YHFA 1XH4A 3MYGA 3QCSA 4AZVA 2BIKB 2GTMA 2W9ZB 3A7GA 4KIKA 4CFMA 4G6LA 3FL5A 1O6LA 4S33A 5AR8A 2PVRA 2QOIA 3QWKA 5EOLA 4HGSA 4FG9A 4D2PA 3FQEA 5EW9A 2WFYA 3PPJA 3QAME 3QTZA 4DN5A 1PXIA 4IVAA 3N51A 1J1BA 3KRJA 3OWJA 4FV5A 4P5QA 2DS1A 4IZYA 4NM3A 3OBJA 4G3CA 5KNJA 2PUIA 3H30A 2ETMA 3CJFA 4EH8A 4PTGA 5AP4A 5H9BA 1XWSA 4BTJA 5J9LA 3NNVA 4U3ZA 2ERZE 2Z2WA 4WKQA 2PPQA 4GYIA 4CYIA 1OIYA 3UOJA 1BL7A 4LG4A 2RF9A 3MY5A 1XH5A 3MWUA 4YJOA 5FXQA 3U9CA 1CKIA 3G51A 4JRNA 5EYDA 3FZRA 3SLSA 3COIA 3THBA 4GK4A 3QU0A 4GIIA 1LP4A 1U46A 1H00A 3NX8A 3BU3A 4AN9A 3BX5A 2W1FA 4CMOA 5I4NA 2AC3A 3A60A 4FI1A 3A8WA 4BCQA 3F5GA 3TXOA 2QHMA 4J8MA 4OAUC 5E7RA 3CE3A 1PXJA 3HGKA 4WT6A 2O64A 2YIQA 3DJ6A 3EFLA 4TTHB 2WMSA 3H10A 1LEZA 3FMMA 3ORZA 5CU6A 1QMZA 1FOTA 5AUVA 3VBTA 1YDRE 4BDIA 3G33A 2XRUA 3FY0A 4DH7A 5AUYA 4EK3A 3VS7A 2VTSA 3KXNA 4LI5A 4PL4A 2ITNA 2R4BA 4ACGA 4RX7A 3U55A 2JKQA 3ATTA 1YOJA 3EFWA 1HOWA 3KXGA 4AX8A 1LPUA 2C30A 3WOWA 4K8AA 5GZ9A 1TKIA 3FZ1A 4CLIA 4BTMA 5AMNA 4RFZA 3UQGA 5M08A 4RA5A 5ACKA 1G3NA 1I09A 4RIWA 5FEDA 2OW3A 2UW9A 3LXPA 4WO5A 2JIUA 3OCGA 2GPHA 4F0IA 3MVMA 4S34A 1WFCA 1NVQA 5DHJA 3R63A 2HOGA 4AZWA 4FTUA 4DEDA 5LARA 1J3HA 3EZVA 3KCFA 4C3FA 3QQLA 3IW8A 2HY81 4C62A 4DEEA 1KE8A 4FZ7A 4V0GA 3DK3A 1IAJA 5HNBA 5BVKA 4M68A 3OCSA 4QRCA 1JKLA 4O91A 4ANLA 1OBGA 3FMJA 3ERKA 3LJ1A 4KABA 5CSHA 3GU5A 5HBJA 4KSPA 4WSYA 3EKKA 4IM0A 4XEYA 3TZ7A 5L6WL 3QUDA 2YAKA 3QXPA 4C36A 2UZBA 4MXOA 1M17A 3FZTA 4M7IA 4ARKA 3RGFA 3TKUA 2B55A 4CT1A 4CLJA 4ZS0A 5CSWA 4MXYA 3EYGA 2GQRA 2GS7A 2QONA 3HV7A 2I0HA 2PMOX 2PL0A 3AQVA 4MXZA 5CU2A 5DOSA 2YHVA 3HDMA 4EH4A 5AA9A 4FSZA 3FC1X 4CCUA 3OMVA 4YJUA 2VTJA 2BFXA 3QCXA 2ETKA 3Q9XA 5AIRA 5K0KA 1Q8TA 5CEIA 4OT5A 4FL2A 2FB8A 2VWIA 4FUYA 2XEYA 4UBAA 4EUUA 5J5SA 4YNEA 2EB3A 3A8XA 2QHNA 2R9SA 4C0TA 5L8KA 4R8QA 5GJGA 3WARA 1A9UA 4GYGA 4C38A 3LQ3A 1URWA 2WMAA 4MXAA 3FL4A 4FIGA 3UBDA 2GNIA 2VD5A 5JT2A 3QFVA 4CMTA 3AC1A 3Q5ZA 4JDHA 3C1XA 3BLRA 3P7AA 3FLQA 4JDJA 3PY1A 4M13A 4QNYA 5IKWA 4IADA 4D0XA 4MX9A 4RQKA 1PY5A 4FV2A 5J87A 3PA3A 3VJOA 4BKYA 4MVFA 5AM6A 1WVWA 2ZYBA 4D1ZA 5L2SA 4DC2A 2QCSA 2UW5A 3Q6UA 3QD2B 4FTKA 2HELA 5CNNA 4BCOA 4DEAA 3ZFYA 4EEVA 3I7CA 3I1AA 1W82A 3D0EA 1ZXEA 2CKQA 4WRGA 1Z9XA 4DFBA 3D9VA 1QPDA 5IQAA 5B7VA 4P5ZA 3KA0A 1OIUA 3AGLA 4GT3A 4ZTHA 5LVMA 1O6YA 4Y85A 3LCKA 5GNKA 3DQXA 4DEGA 2ZB1A 3E92A 2IVVA 4MXXA 1XKKA 4TL0A 4HCTA 5F95A 4X6QC 2XS0A 4YJRA 1U54B 3UPZA 2ZDTA 3CY3A 3FC2A 3AD6A 3R9NA 1UNGA 4W8DA 4NM5A 4D4VA 3WZUA 5IEXA 5JEBA 3HUCA 2ZAZA 4W4WA 5EDQA 2CKEA 3BELA 3DAJA 3ELJA 4TWPA 2J0JA 4CQGA 2BZJA 4XRLA 3IGOA 3F5PA 3VUGA 3L9PA 1JLUE 1KE5A 4QMVA 4C59A 3PIYA 1PXLA 4CKJA 1NW1A 5GIPE 1GIHA 2HZ0A 3TDVA 2JFMA 3FPQA 2FH9A 3NNXA 4FSRA 4R6VA 4X3FA 2IW8A 4G3GA 4E20A 2XRWA 3FYKX 2WMUA 2JLDA 2X4ZA 2HXQA 4PY1A 4FNWA 3RP9A 4GG5A 3DS6A 2JITA 4WNPA 1M52A 3DKOA 4NCTA 4FKGA 5LOHA 3LJ2A 3G9NA 5ETCA 5LXMA 2YDJA 5CI7A 3OXZA 4EQUA 1DM2A 1UKIA 3OG7A 3QTSA 4XX9A 3TEIA 2CGUA 5BQ0A 4BR3A 5E8ZA 1TQPA 3S3IA 2CSNA 4BIBA 2YZLA 4FKVA 1BLXA 4KBCA 4C3PA 4Z7GA 3DK7A 3BGPA 4KIQA 3BKBA 1LUFA 4E5WA 3UNJA 4BDKA 5EM6A 2XJ2A 4MBLA 4I21A 4NFNA 4X0MA 3G6GA 4OLIA 4Y72A 5H8BA 4I5CA 3NWWA 4X3JA 2W1GA 3R73A 1UU7A 3FXZA 3HRFA 1DI9A 4M8TA 4QMUA 3ZO4A 3DLSA 4F0FA 4FVQA 4UXLA 4ZIMA 3BYVA 2VUWA 2WD1A 4JVGA 4ENYA 4LMNA 3FZSA 3P1AA 2VGOA 2DQ7X 3KXMA 4K0YA 4ZTSA 4YBJA 4FT3A 2OK1A 2ZDUA 4FKSA 3HAVA 2WELA 3WZKA 4FV0A 4KKEA 5HKMA 4F6UA 4PTEA 2PE2A 2PVNA 5BYLA 3UP2A 4QTCA 5DH3A 2YIXA 3ACKA 4P90A 4LRMA 4E73A 3FBVA 3MB7A 2HWOA 3O71A 4ITHA 4D58A 4A06A 3EQBA 5J79A 4RJ8A 2WMWA 3QYZA 4IM3A 5A6OA 5A9UA 3SOCA 3POZA 5FWKK 2R5TA 4O1OA 3D7TA 3BYSA 4IDTA 3R1SA 2PVYA 3KMUA 4G16A 1WZYA 4O2PA 3VUTA 4F64A 4GL9A 4JL9A 4IM2A 3CXWA 4MXCA 4PMSA 3KU2A 4QYFA 3EZRA 4U80A 5BVDA 4ZJVA 2V22A 3Q2MA 3PG1A 4R3PA 2R7BA 5DI1A 4CRSA 4FEWA 2WMQA 2G2HA 1ZY4A 3QC4A 4KBAA 5CQUA 3VULA 3F2RA 3VS4A 1K2PA 2CCIA 3NW5A 5HO6A 2AYPA 3LFEA 3BYOA 5J95A 4RIXA 5AV2A 3DKGA 3W2QA 2IVSA 2E9OA 2BRMA 3ORNA 5CSPA 4OTGA 4AGDA 4ANMA 4R7HA 2BFYA 3V8TA 4C4FA 2WQBA 3KK9A 3QZGA 5IPJA 2ONLC 4FK6A 4NK9A 3ZSHA 3ZO1A 4TY1A 3RWPA 3GC9A 3ZBFA 5GZ8A 5C1QB 3OUKA 2YAAA 2OU7A 4O1PA 3MSSA 2CNVA 3OVVA 4O27B 4K2RA 3AMYA 2Z7QA 4PV0A 3PZHA 3A62A 3EYHA 1M7QA 2W4KA 2PZ5A 3OF0A 4ENXA 5JMSA 5AEPA 2CDZA 1PMVA 1UU8A 2VAGA 1YHSA 1V0OA 5BMSA 5AR7A 2BRNA 3U51A 4DGLC 4JQEA 4AFEA 1OIQA 3CIKA 4U42A 3QQUA 4FX3A 3UO6A 4WG5A 2C1AA 3IG7A 5D7VA 3GFWA 3OWLA 3TWJA 3TZ9A 3ZBXA 4HZSA 4IWOA 3ENHA 1YXUA 4FSQA 2Y8OA 4D4YA 2BTRA 2J5FA 1ZWSA 1KSWA 4MD9E 4U43A 2FGIA 2J0MB 3W1FA 1OKYA 2BIYA 2WMTA 3GVUA 4ZMEA 5K5XA 1SVEA 2WMRA 4IB1A 4KD1A 2Y4PA 4L42A 2IZUA 4FEUA 3Q5IA 1TVOA 2I40A 3BGQA 3NUUA 1FVRA 2GS6A 4L7FA 4RJ4A 3VQHA 4ZSJA 2ITVA 3LM0A 5AP5A 4CFVA 4U9AA 2HZNA 3PWYA 5DE2A 4NZWB 2Y9QA 3ITZA 4ERKA 2ETRA 1NVRA 3PA5A 4IFGA 4L68A 3QRUA 3O96A 5G6VA 3VUKA 4B6LA 2VU3A 5EM5A 3EQPA 4QQJA 3MH3A 3Q9ZA 3FI4A 3ZO2A 3ORKA 3G5DA 2BRBA 3NUXA 5CX9A 2JEDA 3NVKI 3C5UA 4O0RA 3WILA 2W1HA 2YM6A 3MPTA 3NRMA 5IUHA 4Y5QA 2QO7A 3ZLYA 2NP8A 3EL8A 4JG7A 3HRBA 4BBFA 5CF6A 3F82A 3LCDA 2XP2A 3ORTA 4M3QA 4YURA 4CV8A 4TYHB 3F3VA 2WTJA 1SNUA 3VBXA 2OIDA 2WTCA 1KE7A 3M42A 3DCVA 3PXYA 3D2IA 4U81A 3EQHA 1IRKA 3P5KA 4IB5A 1Q4LA 1GIIA 1F3MC 5HGIA 2BROA 2X6DA 2PU8A 2OWBA 4RWLA 4QMQA 2X7GA 3HUBA 4ZEGA 1ZOGA 1CMKE 3IS5A 2HZ4A 2PK9A 4I4FA 4M0YA 4N70A 3SW4A 2Q0BA 3ZUTA 2GSFA 4F7NA 1V1KA 2ITPA 2W5AA 3KULA 3WF7A 4IZ7A 2PUNA 4B0GA 2VWUA 3IW6A 3FMLA 5EW8A 4MWHA 3VS1A 3F2NA 2Y4IB 4FKPA 2VTNA 3MIYA 3IDCA 1W0XC 2I0EA 4MNFA 4F9AA 2VGPA 2XBJA 3DB6A 4LGGA 4AGCA 3MA3A 3UE4A 4I24A 4ZZMA 2GNJA 5BPYA 4YJVA 3ZRMA 4IAIA 2RKUA 4M12A 4DG3E 1YHWA 3BGZA 3GU7A 2JIIA 4YLLA 5IISA 3HVCA 4O7TA 4NSTA 3RM6A 4J8NA 4EJ7A 1FQ1B 3MH2A 4TZRA 4WRSA 4AW5A 5ETFA 3TZMA 4E6CA 4MF1A 5ANGA 1XJDA 5CAPA 5AJQA 2OSCA 3CP9A 4IAFA 3UNKA 3SRVA 1P5EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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