2HWOA

Crystal structure of src kinase domain in complex with covalent inhibitor
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
279
structure length
251
Chain Sequence
LAKDAWEIPRESLRLEVKLGGCFGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSPIYIVTEYMSKGCLLDFLKGEMGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKDPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure-guided development of affinity probes for tyrosine kinases using chemical genetics.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
total genus 67
structure length 251
sequence length 279
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2006-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2hwoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2hwoA01
1IAJA 1Q5KA 3QQHA 5L6WL 3PE1A 4C0TA 4IAIA 3AXWA 3PVWA 5BNJA 2V22A 4G17A 3OCGA 4PL4A 1CSNA 4RQVA 3VW6A 4A9TA 4ZJVA 3O96A 2B52A 4JBQA 4NCTC 4IVDA 2W17A 4O96A 3G51A 4OW8A 5EKOA 1R39A 4FV6A 1S9JA 4ANNA 3HMMA 3NIEA 3A8XA 4IWQA 5TE0A 4EC8A 3PXZA 5EI2A 4ZP5A 2PE2A 1WBOA 2GFSA 2OW3A 1WBNA 4I5PA 4LUEA 3OG7A 4GJ2A 4PDOA 4ZTNA 4CFMA 3BGZA 3QHRA 3R7UA 3F66A 3NYOA 4K2RA 4CCBA 3GB2A 3QTIA 1XQZA 2YCRA 3NEWA 1ZYCA 5CSHA 3TIYA 3A7IA 2Q0BA 2F4JA 4MTAA 4MYGA 1JNKA 1REJA 4DG0E 4FEWA 2W9ZB 4TYEA 3ZM9A 1DI9A 1YHWA 5EKNA 4ZTHA 2IW6A 2O2UA 4DBNA 3IONA 2X4ZA 2SRCA 4QP2A 5AUYA 4U43A 4WT6A 3V5QA 5J9ZA 4JDKA 2X39A 4FF8A 2VX0A 4BDFA 3OTVA 4CFXA 5CLPA 4HVHA 2YIRA 5EW9A 4TXCA 1R0EA 3EYHA 3F3TA 3I6UA 3D94A 3LFQA 4FKSA 4RFYA 4FC0A 4G9RA 1XJDA 3P0MA 4WNOA 4M69B 3GCQA 2WXVA 3EQGA 4YTFA 4K0YA 4YHJA 4FSUA 3PP1A 5EDRA 4ALWA 4DFLA 3C0IA 1Q24A 2B4SB 3G6GA 2C47A 4II5A 4FGBA 3EZVA 2BTSA 1ZRZA 3MVMA 4E6CA 2VTMA 3PZEA 3BLRA 2Z60A 2R3NA 3C13A 3C0GA 3I1AA 4Y83A 5G6VA 5CF4A 3H0YA 4KB8A 2O63A 3IOPA 4O0XA 4XEYA 1ZMUA 5CANA 1UU8A 3QKKA 4BVUA 1ZWSA 5CT0A 3UMWA 4QMVA 4U7ZA 3VW8A 4NFNA 3DLZA 4ZSAA 3TZMA 5DGZA 2WQOA 3TACA 2JIIA 3DBCA 3Q32A 1IEPA 5AWMA 5IA4A 2VWUA 4ACDA 3UJGA 3E8DA 3VS4A 4UMPA 5FP6A 1P4FA 3HZTA 5E8WA 1H0WA 3U54A 5CEPA 5DEWA 4RGJA 1PXIA 3UVRA 1OITA 2XNPA 4QP6A 1DI8A 4E4LA 1U54B 3TNIA 2R3GA 2CNUA 2OWBA 4ERKA 5C1QB 2JGZA 1ZOEA 3OY3A 1JWHA 4WNMA 2ONLC 2WTCA 3WF5A 4K9YA 4WA9A 4MKCA 5DT4A 4HPUE 4H05A 2P2HA 5KNJA 4YU2A 3O8TA 3PJ1A 4BBFA 2PVRA 2JKOA 3I0QA 3PXKA 4DBXA 3BRBA 2JDRA 2XK3A 1BL6A 3NUNA 3SKCA 4BHZA 3HA8A 4HVDA 4DITA 2JDOA 5J9YA 2YZAA 5IEYA 4U0IA 5FG8A 4L68A 3E7OA 4UBAA 4V0GB 2WTKB 4RVTA 4DHFA 4FVRA 4H58A 4QMYA 4R6VA 3RZFA 5AUVA 4M14A 4FSQA 2WMBA 2WTKC 2VUWA 3F82A 2BAJA 3FE3A 1RE8A 2PY3A 4MF0A 3ZRMA 5HTCA 3TT0A 3FYJX 2X9EA 3CKXA 3EYGA 4FG7A 5EI8A 4IWDA 3UZPA 1HCLA 3LXLA 3GEQA 2GS6A 3FZSA 4DLIA 3ROYA 3FI2A 1PYXA 3R1YA 3C9WA 1GNGA 4TWOA 4O21A 3FJQE 2WEIA 1KE5A 2VX3A 4EK3A 2YJRA 4RPVA 3QL8A 2XKFA 3PA4A 5FEDA 3OWKA 4TNDA 3ET7A 4FNYA 1A06A 3QCXA 5ETIA 3PRIA 3MS9A 5J5SA 2GS7A 4CFWA 4BZOA 3NNWA 4XHKB 4KNBA 4TW9A 4PDPA 4YBKA 3VHEA 2OFVA 3R6XA 3NYVA 1WAKA 3ACJA 1WBVA 3V8TA 5KZIA 1PMVA 3H30A 3MY1A 4FIGA 5JFSA 3NWWA 2R4BA 4U42A 4UWYA 2C6OA 4AUAA 4JG6A 2GMXA 3OXZA 4AOTA 2YERA 2Z7SA 4L7SA 4FEQA 2XBAA 4EYJA 4CNHA 4F70A 3MN3A 5DG5A 4BTJA 3POOA 2WU6A 1XH6A 2EB2A 3IW8A 3OW3A 4EL9A 2Y0AA 5IH4A 5E8XA 1H28A 2BDWA 4FV9A 5CSPA 3FQEA 4WO5A 3VO3A 4IC7A 5HG8A 3DTCA 4J8NA 5EDPA 5F20A 3OF0A 3ENHA 2C1BA 4DH3A 2WMUA 4B0GA 3JS2A 4IZYA 5BYYA 3W2PA 3CEKA 3NDMA 3H9FA 3LIJA 3OTUA 4MXXA 3SD0A 3RCDA 3M1SA 4IM2A 1GZ8A 4M66A 5LVNA 2IZTA 2R2PA 2VTQA 2PU8A 2C5OA 3UNZA 2C6KA 2QHMA 2YJSA 5IISA 5H8GA 3W10A 4ZLYA 4Y46A 2QHNA 4YSJA 4F0GA 5IQCA 2OZOA 4DH1A 4QYYA 4YZ9A 4ZIMA 2B9IA 4IAZA 3EIDA 5J7HA 3AD4A 4RWKA 5HX8A 2F2CB 3REPA 5FUTA 4BHNA 4UXQA 3CQUA 1PKGA 4O2ZA 4RA5A 3TXOA 4DH5A 5AA9A 3O50A 4MNFA 4I23A 2C0IA 3BWFA 2WIPA 3GQLA 1HOWA 4ITIA 3HMOA 4MNEB 3BHVA 4E73A 5CVHA 3UDBA 5J1WA 2PVKA 2Y4IB 1Y8GA 4FL1A 4PF4A 3S00A 4IIRA 3CJFA 4UWCA 5D11A 3UTOA 4OGRA 2PVNA 4ONAA 2GQGA 2X2LA 2Y4IC 3V5LA 4AW1A 5HNIX 1UKIA 2J90A 2XZSA 1KE6A 4WBOA 5JFVA 2WD1A 1A48A 4RJ4A 2R64A 2UW3A 3BX5A 5FRIA 1H26A 3A7JA 4D58A 4O81A 3ZO4A 4OAUC 5AMNA 4FIEA 3RZBA 2HZNA 4BCFA 3BKBA 2UW4A 2ZB1A 3ZLYA 5HIEA 3FDNA 4AOIA 5CAOA 4ZTMA 4FZFB 5M4FA 4CKJA 4RBLA 4OTDA 5HIBA 4JR7A 4FKWA 2OF2A 2PE1A 1GJOA 4QNAA 4L3JA 3JUHA 4N70A 2WB8A 1W83A 2J2IB 2B54A 4BCOA 1TQPA 3FSFA 3R83A 1STCE 2W1DA 4FZAB 2B55A 3BI6A 4IHPA 3EB0A 4RA4A 3MV5A 5JGBA 4YURA 1R0PA 2UZDA 4QQJA 3ZUTA 4CKRA 3UIMA 4U40A 2G9XA 2VWYA 3QQJA 4F1MA 2C5YA 3MA3A 2HELA 5K3YA 5KMJA 4QO9A 2VX1A 3KEXA 3MFUA 4ZZNA 4RIXA 4FYOA 3V5WA 3U6HA 4TT7A 3P5KA 3WZEA 2XJ1A 3DAKA 3DXNA 1PKDA 4E5AX 3THBA 3QQLA 3QBNA 2YHVA 4OLIA 5DWRA 3UC3A 4DLJA 2UZNA 4JIKA 3SOCA 3ELJA 5AV2A 2OH4A 1QPJA 3H0ZA 4IW0A 4B8LA 4WNPA 3ZLXA 1UKHA 4QNYA 4BWKA 4J8MA 4WG3A 1URWA 2H96A 2WAJA 1YXVA 2VNWA 3WIKA 4ZEGA 1LEWA 2W5AA 1Q62A 3F5PA 1OUKA 2CCIA 5CYIA 5AR3A 4O7YA 3A7HA 1XH7A 3COKA 3NYNA 3UVQA 3QX4A 3QTSA 5JZNA 1ZY4A 3BIZA 2CJMA 4C3RA 3KQ7A 2ZDTA 3LZBA 5CZIA 2OZAA 4YUQA 2JITA 4NW5A 4OTQA 5GNKA 2CDZA 5LVLA 4D2TA 3MJ1A 3FLWA 4CGAA 2XM8A 3FHRA 3VWAA 4X3JA 2UZOA 4FT3A 4FTTA 3ANRA 3HLLA 4H1MA 4R5YA 2BRGA 2XVDA 3AD5A 5CVGA 3ZLWA 4BGGA 4IX5A 4EK4A 5GZ8A 5M53A 3IW5A 2A19B 3N51A 3BYOA 4C02A 4OTFA 3CLYA 2UVZA 3BV2A 2X6EA 5IZFA 4IAKA 4AAAA 3EN4A 3OC1A 4IADA 1Q8WA 4M8TA 3VULA 4L00A 3VS6A 2EXMA 3NS9A 4TWNA 4AZTA 4WHZA 3RAWA 4C38A 5DNRA 5FQDC 2XIXA 2C6EA 3DQXA 1G8AA 5BUJA 3T8OA 1OPJA 3VAPA 4W4WA 1J1BA 3CY3A 3SOAA 4A9SA 2EWAA 2I6LA 3EOCA 3NW6A 4NK9A 4Q9SA 5CU0A 3ZU7A 1GAGA 1Q97A 1YXTA 3I60A 3PA3A 4FZDB 4ANQA 4EKKA 1YDRE 2ZV8A 2UW9A 5I9ZA 1XH5A 2BIYA 2DYLA 3HVCA 3Q4ZA 4I92A 4EUUA 4D1SA 3QC9A 4EJ7A 2IVTA 2BZHB 5CAUA 4FV4A 4AW2A 4F9WA 5AP6A 3P7AA 3RNIA 3JY9A 3A8WA 1Q4LA 2NRUA 4D28A 4O0WA 1BI8A 4M97A 2C0TA 2RF9A 5DBXA 3FMJA 4ZXTA 2OJFE 3FZPA 5HVYA 4P4CA 3RJCA 3VBQA 4DYMA 3P08A 4TZRA 1YHVA 2P3GX 2FO0A 1OUYA 2W1FA 3OUKA 4RJ8A 4Y8DA 5KMKA 4EK5A 1U46A 5FXQA 1R1WA 5EW8A 2OF4A 5AEPA 3C50A 1H1PA 2JAVA 3LFFA 4FBXA 4MK0A 4NKAA 4EH4A 4RMZA 3D83A 3SV0A 5IUGA 2QVSE 2ERZE 3QWKA 5CEQA 4EUTA 3MH2A 3ZFXA 2JD5A 4L8MA 1MQBA 5D1JA 5KKRB 3L8VA 1Q8TA 4RVMA 4PQNA 3VQHA 1WBSA 2QR7A 3ORZA 3UG2A 3PPKA 3R21A 4FYNA 4L67A 5ANJA 3ZBXA 4JNWA 2PTKA 4FVQA 4QMMA 2WHBA 3FI4A 3R30A 4FIHA 4KA3A 3IPHA 3BEAA 3O0GA 3TZ9A 3S2PA 4O0RA 4E3CA 4RJ6A 3R9RA 2J0LA 3Q2MA 4PL5A 4GJ3A 3HA6A 5HNBA 3FY0A 2CNVA 2YCSA 3AC8A 4S2ZA 3QUPA 4XLVA 5BVKA 5IA3A 5C9CA 1WVWA 3KCKA 4YLKA 3G0EA 4BDKA 3AC5A 4MEDA 4YLJA 5ACBC 2YAAA 3FMNA 5TOZA 2J0KA 2E9OA 5BQ0A 1WFCA 4EOLA 4GIIA 3E5AA 3FXXA 1FINA 5CT7A 1VYWA 4XP2A 4A4XA 4E4XA 4YLLA 2ZM3A 1TQMA 2BDFA 4W4XA 3UOKA 4AFEA 3ODYX 3R63A 2WOTA 4BDHA 3RK9A 4C2WA 5ANIA 3UODA 4CKIA 2W5HA 4OTPA 4FI1A 2B9HA 3VQUA 4O7SA 1MQ4A 4M68A 2BRMA 4ACHA 1WMKA 3F6XA 3R73A 5BVDA 2PVLA 2CSNA 4AU8A 4U45A 3GOPA 4NZWB 3QTWA 4XYFA 4D4SA 4IB5A 4UZDA 3AG9A 1QPCA 3ZBFA 5JGAA 1V0OA 1J1CA 5CEIA 1W0XC 1H01A 3VJOA 1M2QA 3VHKA 3CBLA 2ZV9A 2HYYA 5HTBA 2XS0A 5LCJA 5BVEA 3F9NA 1PXNA 3IDBA 2GPHA 1H00A 2DQ7X 2E9VA 3ALOA 2YACA 4IZ5A 2XK8A 4J99A 4BIDA 4E4NA 5FBOA 5L8KA 5ETAA 2IG7A 2VTHA 4TWCA 2UUEA 3LFEA 4G3FA 2B53A 1OBGA 3MH0A 4DGLC 1XKKA 1LP4A 5KBQA 2YLFA 3CXWA 4NEUA 3OT8A 2VTNA 4DEDA 4MXYA 5EHYA 4U9AA 3CR0A 2IN6A 3MBLA 3VS5A 5CAVA 3ITZA 1MRYA 3VC4A 5CEOA 5I5ZA 4QP3A 4XV9A 2XKDA 1G8SA 3MFRA 3UP2A 3ACKA 3ORIA 4I5HA 4I5CA 3F3ZA 3EJ1A 4G3GA 4WNKA 3RPRA 3WE8A 2XJ0A 4I4FA 2PSQA 2PWLA 3HV5A 4PP9A 5LMKA 4WKQA 3R28A 3PY1A 5A14A 1O6KA 3G9LX 2EU9A 3V6SA 1OBDA 5HGIA 3U87A 4FEXA 2W1CA 1SM2A 3BYUA 3HX4A 3QD2B 2BRNA 5L2TA 3EQCA 2W1EA 4AE9A 1U4DA 3EHAA 4ZSJA 3TI1A 4RX8A 5KKRC 4FOCA 3L8SA 1M14A 4LL5A 2WKMA 3IO7A 3VF9A 2PUPA 3QRTA 4OTWA 3D4QA 4E8AA 1OMWA 4PUZA 4BDDA 4UV0A 4D4VA 2VTOA 2BAKA 3LHJA 3PVGA 2RIOA 3MJ2A 5EDQA 3JPVA 2F57A 1QL6A 5H3QA 1H25A 2QQ7A 2YM8A 3AGLA 4MD7E 4CZTA 3KXHA 1QPEA 3KK9A 3SA0A 3QHWA 4YNOA 3VRZA 5B2KA 1XR1A 5C03A 2J5EA 4KD1A 4JG7A 1ND4A 5BPYA 4W4VA 4QOXA 4QPAA 4Q9ZA 3UYTA 2H9VA 3KFAA 3FQSA 2WNTA 3HRBA 4DTKA 4N6ZA 5D10A 3HECA 4XH6A 3QD0A 3R9NA 3R7GA 3TDVA 2DWBA 4EYMA 4KKHA 3A99A 4DEGA 5AR2A 5EFQA 5CALA 3BV3A 4CRLA 3WI6A 2GDOA 3DDQA 3ORPA 3VUIA 5DR6A 1KE8A 3ETAA 4F1OA 4IX3A 5AUXA 2ACXA 2Y8OA 3NAXA 1B6CB 4J95A 3BU6A 4V01A 3LXKA 5M4CA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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