2JLDA

Extremely tight binding of ruthenium complex to glycogen synthase kinase 3
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
351
structure length
349
Chain Sequence
SKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSEKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Extremely Tight Binding of a Ruthenium Complex to Glycogen Synthase Kinase 3.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords GLYCOGEN SYNTHASE KINASE-3 BETA
total genus 102
structure length 349
sequence length 351
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2jldA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2jldA01
4QPSA 4F63A 4TN6A 4IM2A 3NUXA 5AP0A 2ERZE 3F3TA 3PA5A 1H00A 3KB7A 3C7QA 3PYYA 5C8MA 2XCHA 3KXZA 2XKFA 2WD1A 4QYFA 5ACKA 3E3PA 3GI3A 5ETCA 4NKSA 3UO5A 4U45A 3R9RA 5EH0A 5EQEA 5M57A 2WIPA 2WMAA 4QTEA 4QQ5A 4NFMA 3MA3A 1KOAA 1OUYA 4GEOA 2GQGA 4ANBA 3ROCA 1GIJA 4UMUA 4S34A 3FUPA 3DTCA 3FL4A 4B6LA 2VD5A 5M51A 1H01A 2OWBA 4ZY4A 1SYKA 1SVGA 1X8BA 3NYOA 5E92A 3SRVB 1L8TA 4M14A 3MY0A 4KABA 4YHJA 4PMTA 3U54A 3R22A 4YURA 3JXWA 3ZUTA 4KKHA 5C26A 3Q32A 2EB3A 4OT6A 4M0YA 4PDOA 3WYYA 1PJKA 2B53A 3QALE 3R8UA 1PMVA 2WB8A 2XK4A 3BEAA 3ZZEA 3P79A 3D15A 5GINE 3DBDA 4Q5HA 2VTLA 1F5QA 4YP8A 4NIFA 5LVOA 3IGGA 5D7AA 2A4LA 4CFWA 3TDVA 5IKWA 3PPZA 3WE4A 4ZY5A 5DE2A 4EHGA 3G6HA 5IU2A 2W5HA 3DBFA 3BCEA 1OL1A 4AXAA 4UALA 4X2GA 3VHKA 2W5BA 4MTAA 3D2KA 4HNFA 5E4HA 4BKZA 3FMNA 3OROA 4PY1A 3H9FA 2UW8A 4C2WA 4G1WA 3CGFA 3PIZA 5CF6A 4IAYA 5IUIA 4FKVA 4S32A 3IW5A 3BWJA 2JAVA 2OU7A 2WMSA 5CSXA 3PWYA 3Q9ZA 5HQ0A 3HX4A 2X4ZA 1YXVA 2RIOA 2VV9A 4P2KA 4ZOGA 2NPQA 5AP2A 3DXQA 3KCKA 4I5HA 3FLYA 3F82A 5C03A 1I09A 4FIGA 4IH8A 5LMAA 3WF9A 5AA8A 4XH6A 2IZRA 2XJ1A 5AV3A 4EBWA 2OFVA 3KGAA 4QMNA 2VN9A 3ANQA 5DHJA 4F6SA 2ITTA 2E9PA 4RBLA 3VVHA 3AD6A 5JKGA 4G6LA 3R7VA 4F65A 4KKGA 3UDBA 4P5ZA 1FBNA 2HW7A 4M97A 2X7GA 4GV1A 4MX9A 3DTWA 4XYFA 2HOGA 3BBWA 5IUGA 1TKIA 3NW7A 4IAFA 3QWJA 4A9TA 2BAKA 4H3BA 3VHEA 5HCXA 4A07A 3F2AA 4L46A 2WMBA 4FIHA 3C0IA 3M42A 4R7HA 3D7TB 5AM6A 4CYIA 4AZSA 4RFMA 3AQVA 2PHKA 4PTGA 1UV5A 4LRMA 3QXOA 5IG1A 4ZTNA 3BE2A 2PZRA 5EW8A 4G3FA 1BKXA 3BEGA 4XV1A 4Z9LA 3BQCA 3LFQA 1Q8WA 4UWYA 2GPHA 4CRSA 5IDNA 2XMYA 5CU3A 3MYGA 3W8LA 2W1EA 2UZNA 3OC1A 5DR2A 1PXOA 3R73A 4XOZA 2I0EA 1OECA 4IQ6A 5E7RA 4C8BA 3I5NA 4KIOA 2PUIA 5AIKA 4TYGA 4UZHA 2VWXA 2X7OA 4JQ8A 4AZWA 4EBVA 3CSVA 4Q9SA 4H58A 3MFSA 1JKKA 2E9NA 3RNYA 1CKPA 4KBCA 3ZFYA 3MFUA 1Q3DA 2BHEA 3C13A 4FV7A 4BGGA 5HG8A 3QRUA 3P78A 4FMQA 3DK7A 3CQEA 3MESA 1QMZA 3PUPA 4X6RA 1VEBA 4E3CA 3UOLA 5AX3A 4TYJA 3DXPA 4BCOA 3TIZA 2VO0A 2BALA 3RK9A 5IQBA 1R39A 3RPOA 2ETMA 3MGYA 1OL7A 3QQKA 3SRVA 4WKQA 4B8MA 5C8NA 4USFA 3A7GA 5E9EA 3DKGA 2F9GA 2XK7A 3CR0A 4QD6A 5JQ5A 2V5QA 1H1RA 4XRLA 1MRVA 4TYHB 3LKMA 4EEVA 3BGPA 5JMSA 2ZMDA 4LMNA 2JKMA 4F1TA 5JT2A 2H8HA 5H2UA 1JQHA 1M7NA 3PY1A 4ERWA 3ATTA 4IX5A 4PQNA 5BVEA 4BN1A 4FSNA 5L4QA 5HLPA 3ZU7A 4IWOA 4ACGA 5K5XA 3U6JA 4FT9A 3QCYA 3SVVA 4E4NA 3DPKA 1PXPA 1H1PA 2VTIA 4RWKA 2VWWA 2OJGA 4C7TA 3FLWA 4XP0A 3RAWA 3Q2MA 4OTFA 3UO6A 3RPRA 4RIWB 2I0VA 5B0XA 4YPDA 2XS0A 2GDOA 2IWIA 3I81A 4JBVA 5J95A 3TXOA 4BHNA 3KRLA 2F7EE 2OBJA 3OHTA 1Y6BA 3WARA 2QO7A 3EQPA 4FEXA 3L9MA 5HIEA 5KMJA 3D5WA 1Q8TA 3RAIA 3DBQA 4CG8A 3QTRA 4D4VA 3UZTA 1PMUA 2I1MA 1TQPA 3DDQA 3NUNA 4QMLA 4PRJA 4XG4A 3M11A 4ACDA 2EWAA 5I9WA 2C1AA 3EKNA 4FYNA 3UNZA 3EKKA 5IA0A 5BMSA 1QPJA 4M84A 2PK9A 3HAMA 3HDMA 3A99A 4FUYA 3LQ8A 4BDGA 3VUKA 2YCFA 2XK9A 3KN6A 2PE2A 4DTKA 3IQ7A 3EN7A 4M7IA 3SXSA 1P2AA 3V5PA 4UMRA 3FZOA 3Q53A 5H8GA 2X2KA 3OT3A 4ZZOA 5JFVA 5A9UA 4FL3A 4RX7A 4X2FA 5TR6A 2WQMA 2WMWA 3SQQA 4AOTA 3PP0A 4BFMA 4HW7A 4RLKA 3D7TA 3CKWA 1T46A 4E4LA 1H07A 3LFBA 4MEDA 3WZJA 5I9VA 2QO2A 5ANKA 5ITAA 3S4QA 2GU8A 2YIRA 3DBEA 3V8SA 4JOAA 2PL0A 2WEVA 4IZ5A 4RVTA 2JD5A 4S33A 3O2MA 1YI4A 4MBLA 3OWPA 2GHLA 2P4IA 4EHVA 4M3QA 3IK3A 3VS2A 3RP9A 5HO8A 2YM7A 2OKRA 4HGEA 3C0HA 3VBYA 3BV3A 4M12A 5LVPA 4OAVB 3NAXA 2I40A 5CI6A 5HVKA 1FINA 4H1MA 3IKAA 2HCKA 5KMLA 2WKMA 3F7ZA 2QQ7A 1IAHA 3CPBA 4XMOA 3SA0A 3E88A 4KBAA 3TV6A 3KEXA 3ORZA 5T68A 4YO4A 3EFWA 3HMMA 3PZEA 4MKCA 2XA4A 2BFXA 2IVTA 2BFYA 4II5A 2Y6OA 4Y72A 4J8NA 3AG9A 3PJ2A 4YJTA 1PKGA 2BTSA 3GU7A 5GZ8A 3RPSA 5M4UA 5DT3A 2E9VA 3HA8A 3OZ6A 4N57A 4J71A 2PULA 3ZEWA 3PA4A 4BZOA 2W99B 3R02A 4QTCA 5LVNA 3U6HA 1NXKA 4IZYA 4TYHA 5DH3A 4LOQA 2P0CA 1Q5KA 3OTUA 3FY2A 2OIQA 4RQVA 5DBXA 5GJFA 1GAGA 3R8ZA 3W2OA 4GU6A 2QU6A 3AT2A 4EK8A 4Z16A 4RZWA 4F09A 4W9WA 3O51A 2VX3A 2PPQA 4BCPA 2X2LA 4JX3A 3UYTA 4OTHA 1WBWA 1URWA 2CLXA 4F99A 3AC2A 5JFWA 2EU9A 4BBMA 2QODA 1Y8YA 4S30A 3GFEA 4U79A 1YW2A 2R3LA 4K6ZA 3ZC6A 4EYJA 1OBDA 3EYGA 4ANQA 1JSVA 1YXTA 3NLBA 4GYIA 2YZLA 2WOUA 3B2TA 4ACCA 3LAUA 3T9IA 3VULA 4RFYA 4RIWA 3HV5A 3ALNA 3DAJA 3HRFA 4AUAA 1U5RA 1S9IA 2QC6A 1MRUA 3DU8A 4CFXA 2EB2A 4PTEA 3K3IA 4HVHA 5ACBC 3V5TA 3AGMA 5EOBA 5JK3A 4XJ0A 4ITIA 3CE3A 1SMHA 1FQ1B 4QTDA 4WG3A 4ZZMA 5IH4A 1NT2A 1OUKA 2XK6A 3G51A 5F1ZA 2GNGA 4USEA 4ZSAA 1H1SA 1DS5A 5KKRB 2QG7A 3A61A 4D2PA 4IAZA 3T3VA 2CNVA 2FSOX 3OXIA 2GQRA 3RZBA 2CNQA 4QMOA 1XH5A 3MSSA 4J1RA 3RHKA 3VBTA 3CEKA 3G0EA 4K33A 3O0GA 4K11A 4ZTMA 4C3RA 3GC9A 4FKLA 5L2QA 5LMBA 3FLZA 4NM7A 3TZ8A 2RFNA 3Q4TA 4U41A 3GBZA 2CSNA 4QP9A 3OWKA 3R1YA 5TF9A 2C6TA 3QUEA 3V5LA 2FH9A 4EH5A 2XJ0A 5BUIA 4QP4A 4QYEA 2BRNA 4NW6A 4UXQA 3FKOA 2UW6A 4B99A 2R2PA 5FP5A 3P9JA 4MAOA 4O84A 4LL5A 4D58A 5HKMA 4BTMA 2YDJA 4FIEA 3QRJA 5DN3A 4IFCA 5AX9A 3FWQA 5GHVA 4AZVA 3BHTA 2B9JA 2I6LA 3LCTA 3ACKA 2UZOA 5E8VA 3QTWA 1O9UA 4RJ4A 4CTCA 1SVEA 4PP7A 1NW1A 2I7QA 2BKZA 3GUBA 2UUEA 2Y9QA 3KQ7A 3AC5A 3QL8A 3ORTA 4A4XA 4OTDA 3ORKA 3C5IA 4L7FA 1ZXEA 4I6BA 4RIYB 4F9YA 1ERKA 3UODA 2OG8A 2GHMA 1OB3A 2J5FA 3D94A 3C50A 4NM0A 4EYMA 4FTOA 3Q2JA 4GFMA 2ZMCA 2I0YA 4IDVA 2ITOA 1OITA 1WVXA 4I22A 3PWDA 5KMOA 2HYYA 4XEYA 4I0RA 4YTFA 1KSWA 2OXDA 5CF5A 1A06A 3N51A 3MBLA 5KMKA 3G0FA 4J7BA 5FEDA 4MWIA 5CENA 4WG5A 4D28A 3R7EA 2XRWA 4RT7A 5CU0A 3LZBA 4C3PA 1UNHA 5K4IA 5AUWA 2UZWE 4JIKA 3DCVA 4K0YA 2W96B 5CU6A 3V04A 2BVAA 3IDCA 1J91A 3QRKA 4G3DA 4D5HA 5HX8A 2O64A 4RA4A 1JAMA 4ERKA 1T45A 4X6QC 1XH7A 2YFXA 4UXLA 3FZPA 1UWHA 4AN9A 3G5DA 4YLKA 3CD8A 2UZEA 2QU5A 1MQ4A 3NYNA 1I44A 5HBHA 3QKKA 3UC3A 4DFLA 2P3GX 1FPUA 3FI4A 3TUDA 5KO1A 3SD0A 5M08A 2RL5A 4JNWA 1GZKA 3NS9A 3OBJA 3SGCA 2J2IB 3BPRA 4FUXA 2ZV8A 3ZO1A 2UVYA 1MRYA 2B52A 2ITWA 5LMKA 4EOIA 3HKOA 2P2IA 2XIRA 3DZQA 4DGMA 2UW7A 2VTOA 4H3PA 4O1PA 2BCJA 4EOPA 5IMXA 1PMEA 3R1SA 5DEWA 4GJ2A 4QMUA 4TKSA 5A6OA 1O6LA 4F70A 3GCVA 2GCDA 1WVWA 5KMNA 3ZMMA 2G01A 2BILB 2G9XA 2W4JA 3ZCLA 5AFVA 2ONLA 4LI5A 4O21A 3JVRA 4EOSA 5EQPA 5BUJA 4IW0A 3BHYA 4XX9A 4NJDA 4F7JA 4AFEA 3ODZX 5D1JA 4ID7A 2BTRA 2XNPA 4FC0A 2CN5A 4HCVA 4IAAA 4XUFA 5CEQA 4YTCA 5IISA 4E26A 4R5SA 1QPDA 2DYLA 1M14A 4RVMA 4DINA 2H96A 1H0VA 5E90A 5J7BA 4F64A 1PMNA 3RZFA 2ZJWA 4CCUA 4K8AA 3VUIA 1KUTA 4W8DA 3Q9YA 1LUFA 4I21A 2CDZA 1JBPE 1ZOGA 4WUAA 4OLIA 4YSMA 2BZIB 2C5OA 1AQ1A 1Q8ZA 3MPAA 5AR4A 5FM2A 3RVGA 4AW0A 5LWMA 3F88A 3L8XA 4C3FA 2C47A 3PIYA 1ZRZA 1XHAA 4KRDA 5L6WL 5IZFA 4NM3A 5EKOA 3ZTXA 3MY1A 1FGIA 4ASXA 3TUCA 2QOLA 5M06A 3KK8A 4E6CA 2QOHA 1IEPA 3NNVA 4BWPA 4XG6A 5LOHA 2A2AA 3UQCA 4BKYA 4B9DA 2CGWA 5EHOA 2R9SA 3KY2A 2OIBA 1WZYA 3CJFA 2ZV2A 4HPTE 4QT1A 5ANDA 3FXZA 3TNPC 4ZLYA 4WNOA 4AE6A 2W1DA 4BTJA 5I9XA 5K3YA 5HG9A 3BGZA 3TTIA 4Y46A 5IF1A 4LOPA 3ZS5A 2VTPA 5LXMA 2XNBA 2PZIA 5CZHA 1STCE 1LPUA 3OW4A 2OIDA 5C9CA 3FJQE 3FSKA 4X3FC 2E2BA 4DH1A 2HAKA 5A4QA 2ESMA 1DAYA 1FVTA 4QMPA 2GNFA 3K54A 4TYEA 4YJPA 5I3RA 3B8RA 4L3JA 4N0SA 2R3GA 4O6LA 2VTRA 4ZJIA 4HGSA 4EJNA 2WU7A 4E4MA 2XYNA 4D2VA 2WTJA 3NRMA 2C6KA 3LXLA 4P4CA 1Q8UA 2VTHA 3I60A 5KX8A 1JWHA 2XM9A 3FSFA 1R1WA 5EM6A 3SX9A 5B7VA 5DA3A 2Y0AA 2OH4A 4N6ZA 5M09A 5EKNA 4O7TA 2VX1A 4KINA 4O7VA 1ZZLA 3EN4A 4O83A 4ZSGA 3GC8A 4EC8A 2JC6A 3UP2A 1CKJA 3ET7A 2C0OA 3MVHA 5FEEA 2QLQA 4S31A 4D2RA 2UZLA 4UEUA 4EOKA 3F5UA 1OI9A 4MD8E 2YIQA 4N6YA 4AA4A 2RFEA 4E93A 3DT1A 3EFJA 3TDWA 5IH5A 3FZRA 5CNOA 3ZOSA 2QOOA 4R3CA 2KULA 1J7UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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