2R3KA

Crystal structure of cyclin-dependent kinase 2 with inhibitor
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
298
structure length
277
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARVVTLWYRAPEILLGKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-guided discovery of cyclin-dependent kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cell division protein kinase 2
total genus 79
structure length 277
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2007-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2r3kA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2r3kA01
4QP8A 1W98A 3P4KA 2G1TA 3EL7A 1OVEA 4PRJA 3R9DA 4UMPA 3BLRA 4DT9A 4MCVA 5F94A 3D0EA 2I0VA 3Q9ZA 3FYJX 1IASA 3FZ1A 2B9HA 3NUYA 3UO6A 4LYNA 2PZPA 2ZB0A 4ANSA 2CMWA 3BQRA 1CMKE 4I5CA 4F0IA 5D7VA 1NT2A 1KV2A 3DTCA 3TDVA 2PVRA 4ZMFA 2R3HA 3SRVA 2ZMCA 2YWVA 1LEZA 2X8EA 4L68A 1CKIA 2B0QA 2JDRA 4J1RA 2OIBA 3NWWA 4DTAA 4XBUA 3NCZA 5J7BA 4JR3A 4G5JA 4PDOA 4NEUA 5EOLA 3VS6A 4TWCA 5ITAA 3QKKA 3E63A 4DFYA 5CF5A 4XH6A 4BCNA 4ACDA 2X8IA 4XBRA 5A4EA 4KSQA 2CN8A 2UW6A 3UOLA 3EQCA 1ND4A 3FMDA 4AZEA 4IJPA 5KMKA 5IA2A 1ZRZA 3F7ZA 4BI0A 1OBDA 2WMXA 2B1PA 4E4MA 3BELA 1YI3A 1J91A 2PMOX 3LM0A 4EUUA 4YO6A 4BDGA 3RTPA 3FHIA 3WF9A 2PVMA 4RLKA 5CZHA 4X7QA 4BHZA 2PULA 3IO7A 4PMSA 2JKMA 3IDBA 4EWHA 5HU9A 2ITOA 1YKRA 3AOXA 4H3PA 1FGIA 2VN9A 3O2MA 4BC6A 4O7YA 4QP9A 2CGVA 4U81A 2UVXA 3BGPA 3O8TA 3HRCA 4H1MA 5AAEA 1Q8TA 5ETAA 2RF9A 5HNBA 2JDOA 5FEQA 4CXAA 3ID6C 4DYMA 2WEVA 5KHXA 4BKYA 2DUVA 4KIQA 4WT6A 3MV5A 4UEUA 4YSMA 5HG5A 5CXHA 1Y8YA 2BRMA 2YCSA 4ZXTA 1JNKA 3P23A 5C01A 4O0SA 4U40A 3C0HA 1OECA 1J7LA 4C58A 4GK2A 1ATPE 4N4SA 3F82A 3KCKA 1ZOGA 4FR4A 5K3YA 2H8HA 4KKHA 2YERA 4BCQA 3AG9A 4EK5A 5B2MA 2UZTA 2GQGA 4GCJA 4ZEGA 2YAAA 1M17A 3NCGA 3OXIA 4D4YA 3KXHA 4E20A 3ELJA 4BGGA 4RIYA 3S1HA 5IEXA 3KMWA 1Q5KA 4YJNA 4G3GA 3POOA 4BN1A 4FMQA 2GNGA 4L42A 5A54A 4C4FA 4AT5A 3LQ3A 3DNEA 4JQEA 4NM0A 4PTEA 2H34A 3P86A 4FSMA 4ERWA 3NEWA 4G9CA 5JT2A 4I92A 4O0XA 5IA5A 3EN7A 5AJQA 4U79A 3QZGA 4FYOA 3V5PA 2FUMA 4A9RA 4YHTA 4C37A 4X3FC 2QLQA 2C6IA 3MSSA 4WNOA 2YDJA 3CR0A 3Q4ZA 1H1RA 2BUJA 4O2ZA 2ZB1A 5JH6A 4H58A 3WIKA 3MPMA 5IZFA 4LQMA 1FBNA 4G3CA 4XLIA 2IVSA 4CT1A 1NA7A 3HRBA 5E8XA 3V3VA 4PX6A 4EOSA 5CSWA 2WMVA 3CY3A 4FT7A 4IBMA 1PXMA 4RJ4A 5CVHA 1H1QA 2BTRA 3H10A 2W0JA 2W17A 3HVCA 3OFMA 3I81A 3NW7A 3TZ8A 4WNMA 3TZ9A 4BCFA 4DH7A 4D2SA 5DT0A 1NVQA 1WBTA 2AC5A 4Y95A 5L6PA 3EFLA 3KRLA 1XBAA 4L7FA 3A61A 2NNWB 1ZMVA 4KBKA 4XG4A 4CQGA 4EZ5A 3W2QA 3LJ2A 3QRIA 5DYJA 4IANA 3QQGA 4ACCA 3MESA 4AT4A 2XIKA 1UA2A 3G90X 3GGFA 3KXMA 4QMMA 4C3FA 2XNBA 5I9XA 1A48A 4BZNA 3W2CA 3BHTA 2J4ZA 4U97A 4HYHA 4UX9A 2PWLA 3R7VA 3NIZA 1KV1A 2VNWA 4IFGA 4FUYA 5HIBA 4CSVA 4QMQA 5K5XA 3UNKA 2H9VA 5IDPA 4G1WA 2X2LA 3PIXA 1B38A 4LL0A 3ZO2A 3SA0A 2IJMA 3HV5A 2VWVA 2YHVA 3VBQA 3SQQA 3Q60A 4O86A 4I5HA 2AC3A 2GCDA 5DG5A 3DZQA 2VO0A 4BCGA 4DLIA 2FSTX 2JITA 2R3MA 4YJOA 1T46A 3DBEA 4M12A 4NSTA 2B9IA 4N6YA 4RWJA 4UBAA 5CAOA 3LJ1A 4RA5A 4I0SA 2WKMA 2QOBA 1R1WA 4IE9A 5HU3A 5J1WA 4DA5A 4IB3A 4RT7A 4FX3A 4I4FA 2WHBA 3FMLA 5DR6A 4KNBA 3IW7A 3RM7A 4O96A 4L44A 4QPAA 4J95A 4IADA 3WZDA 5JKGA 2A1AB 2GNFA 3I4BA 3EN5A 3PP1A 3F6XA 3I0OA 4PUZA 3E8CA 4OTGA 3W1FA 4CVAA 2VTTA 3VUIA 2J0KA 4O0VA 4CMTA 4E5BA 4O7VA 2B7AA 3KVXA 5EW8A 3S95A 4ALUA 2B52A 3DBDA 4Q2AA 2QKRA 3QCSA 2WIPA 3PXQA 3R6XA 4IACA 4FNWA 1K3AA 2WMTA 3RAHA 5CT0A 5LXMA 3BEGA 3U9NA 4RJ5A 1GNGA 2PZ5A 3TUBA 4O0RA 4GK4A 2OJJA 4FTCA 5I9VA 4O38A 2PPQA 2BMCA 4H3BA 2JFLA 3U87A 4H05A 2HZIA 3HMNA 5TF9A 2PUPA 4FT5A 2IVVA 4IAAA 2JLDA 2XNNA 4MQ1A 2WMAA 4F9BA 1KE5A 3IONA 3L1SA 3PJ8A 4JLCA 2W4KA 2BCJA 4OW8A 4M3QA 5BVDA 4LRMA 2G2HA 4AA4A 3QLFA 5AR7A 3KCFA 1JOWB 3H0ZA 3DTWA 5A14A 3H4JA 2F57A 3UQCA 4NW6A 2XP2A 4C0TA 3PVUA 4Y8DA 5K0XA 1OUKA 4PMMA 1UKIA 4E6QA 4DITA 2Z8CA 4CFMA 3REPA 3CIKA 5HBEA 1PXLA 3VUHA 4OBPA 3ROYA 3ZEPA 3ZUUA 3FPMA 5CF6A 3QX2A 5M08A 4BY9E 3OWKA 1IG1A 4W9WA 5HLWA 4IWQA 4EBVA 3FEGA 5M06A 4YBJA 5HNGA 2XIYA 2ITUA 3OT3A 5HLNA 3NUAA 4RJ3A 1H28A 4MF1A 2WGJA 1YXSA 2CLQA 2WU6A 4ZY6A 1AQ1A 1YDSE 3NNUA 4K33A 4PDPA 2YEXA 4EEVA 4IZYA 4R8QA 3BGQA 4Z9LA 3SG9A 4K6ZA 3PVWA 4U8ZA 2OZAA 2HIWA 4KB8A 4D5KA 5KBQA 4Y72A 5AP3A 4NFMA 3ATSA 5HVJA 1WZYA 3LM5A 4AW2A 4F65A 2P33A 3S3IA 4HNFA 4E93A 2BAJA 1BMKA 2C5YA 4XRJA 2VAGA 4KWPA 4G6NA 1UU8A 4JDKA 3P0MA 2GS2A 1GZOA 4DC2A 3E8EA 4FG9A 2O2UA 4CGAA 3DQXA 3VBVA 1Q61A 2R3QA 3ZMMA 5J9YA 2XK7A 2XMYA 5LWNA 3N4VA 5L8KA 3C7QA 2XUUA 4TYHB 4IH8A 4F0FA 4EQCA 1G5SA 1OPKA 3EN4A 1M52A 2Y6OA 2ZMDA 4EL9A 3CTJA 4UB7A 2FSMX 1SMHA 4MXZA 2DS1A 4B4LA 4DT8A 2V5QA 3PG1A 4OUCA 2PL0A 3BYUA 3BLHA 4RC3A 1GZKA 3TN8A 1REKA 4C7TA 1QCFA 2EXEA 2ZV9A 3M1SA 3ORLA 2Y0AA 3RK7A 1YDTE 4LMNA 5A9UA 2GPHA 1IA9A 3OWPA 3ZFMA 2Y7JA 3C1XA 4CZYB 1DAYA 1M2QA 3OW4A 4NH1A 4F63A 4GT4A 4IB0A 3A7GA 1BI8A 4WUNA 5B0XA 5IQAA 5C8KA 4EC9A 2R2PA 1O9UA 5T3QA 4F1TA 2RKUA 3NUXA 3GFEA 1Z5MA 4FV2A 1H24A 5CU6A 1PKGA 3F5UA 3T3VA 3EB0A 5A4QA 3LPBA 1WBNA 1Q99A 4FKPA 4M84A 5FXSA 4AZWA 4LRJA 3DKOA 4J8MA 2XIRA 3A60A 4KINA 3V6RA 4C62A 4ORKA 3DZOA 3E93A 5HD4A 3MYGA 3UZPA 3RNYA 2CKOA 2W1EA 4WG4A 1L3RE 4YC6A 5EHLA 3AD6A 1FGKA 3BYSA 3PWYA 3R02A 3BQCA 3TUDA 4F09A 2ETKA 5M4IA 3CEKA 4KKGA 3JVSA 2X9EA 3EQDA 2C6KA 4DFUA 1OGUA 2RGPA 4UWCA 5BMMA 2X0GA 4YZMA 5LOHA 3TNQB 1XBBA 3OF0A 4XP0A 3R7EA 3H9FA 4AW5A 4IXPA 4C8BA 2YLEA 3RALA 4ASXA 4D2VA 3QTQA 2J50A 4IVBA 4DCEA 3P7BA 4HPUE 3QRUA 2A4LA 4IHPA 3HA6A 3L8PA 4RX7A 3JUHA 5AIRA 3UTOA 4FEUA 3HMIA 3KRXA 1F5QA 2P4IA 3M11A 2NPQA 5HKMA 1YWRA 1PF8A 4LGDA 2VWZA 4QTCA 5E8VA 2HY0A 3MS9A 2IW9A 3BHYA 5EDRA 2W4JA 5L6WL 4DN5A 1XKKA 2ESMA 3EJ1A 4PV0A 3U8WA 1H1PA 2C6OA 1CTPE 3PWDA 3PA4A 3W2PA 4FL1A 5CAPA 2UW0A 4NYEA 5AV2A 1XHAA 4O6EA 4BCPA 4XV9A 3N9XA 3U55A 2VWUA 4Y83A 4R5SA 3RZBA 2WTIA 1ZYJA 3RCDA 4KD1A 3JY9A 4FTTA 2R0IA 3QXPA 5CI6A 3U6IA 2XK4A 1H07A 5HVKA 5GIOE 1J1CA 4IAFA 2G9XA 3PE2A 5JRSA 3ZO4A 4BBMA 5IQCA 2WPAA 4OT5A 1U5RA 3QGWA 3HV7A 4BDDA 4IM0A 4I21A 2QVSE 2ITPA 5ANKA 3RP9A 1ERKA 3WE4A 3ATTA 1CM8A 3UIMA 2ZM3A 4YGAA 5L2SA 3CBLA 5FP6A 2IW6A 4ZS4A 2HZNA 3A99A 4MVFA 4ZP5A 1R39A 5LARA 4C4JA 4Y46A 4QYHA 2P55A 4BI1A 4UMTA 4C59A 3RNIA 4OTIA 4RRVA 2BAKA 3LLAA 3LCDA 4R78A 3F3ZA 2XYUA 1J7UA 3EZRA 4C4GA 3LIJA 5HCXA 2JAMA 4CD0A 2F9GA 2R64A 3NSZA 4GU6A 4DH8A 1O6LA 4BYJA 3UODA 5M55A 4XLVA 2DYLA 1WAKA 3OY3A 3PA3A 3FDNA 3ACKA 5EM5A 1FQ1B 1ZZLA 4FKSA 3UZTA 3B8RA 3Q4TA 2C0TA 4ALVA 5I9UA 3PPKA 2WMRA 2XJ0A 4M13A 4TWNA 3G33A 1LR4A 4JBVA 3PY0A 1R78A 4FKVA 3WZKA 2OKRA 4EJ7A 3FUPA 3ZOSA 2HWOA 3QTXA 3O17A 1PXJA 4J98A 4LRKA 4CQEA 2OU7A 2YCQA 3FLWA 5L2QA 4D4VA 3DXPA 5EI6A 2O8YA 3DK3A 5AX9A 3TM0A 3HV4A 4NCTC 3E88A 2BDFA 3AC1A 3H9OA 2UZBA 4CT2A 1AGWA 3EFWA 4BDAA 5IA1A 5AR4A 4UN0C 1DM2A 5ANGA 1KWPA 3DJ6A 2GNHA 5HE1A 1WVWA 2J0IA 3EKKA 5LQFA 3BKBA 4EH9A 5JFVA 3G0FA 3QQUA 4GJ3A 3QYZA 2ETMA 3FMMA 4UALA 4CLIA 3VBXA 3NUNA 2EUFB 4EORA 4V05A 5EHYA 4FZDB 4RJ8A 3ZBFA 4BIBA 5FM2A 3LFNA 4ZSEA 2QG5A 5AEPA 4BGHA 4IM2A 2QOIA 4IVCA 5GHVA 4BKJA 2PU8A 2ONLC 5AV0A 2HZ4A 2WD1A 4RVMA 4O7NA 4EYJA 4PMPA 3BHVA 5AV4A 2VTIA 3DAKA 3P08A 4ZOGA 3VIDA 3FLNC 3ORIA 3EYHA 4IVAA 2XYNA 4FODA 4USEA 2QO7A 3R71A 4YZCA 5EHOA 2PZIA 5ETFA 3GNIB 4AOIA 3UPZA 3PVGA 3WF6A 1KE7A 2UZOA 3G51A 4WKQA 3HV3A 5JGDA 3AGMA 5G1XA 2GS7A 5L8LA 3MBLA 2VTNA 4JAIA 4L6QA 4FSTA 4RZVA 4E4XA 4P90A 4ALWA 4XG6A 3RHKA 4EUTA 1R0PA 1REJA 3GC7A 4U0IA 4DINA 2O65A 3GQLA 5KX8A 1XR1A 2EWAA 3QD0A 4GEOA 3MVHA 1V1KA 3BIZA 4F7SA 1CDKA 2I6LA 1BX6A 5HX8A 5F95A 2V7OA 4QMTA 5CALA 4S2ZA 1FVTA 2VTQA 4FV6A 3KULB 4YLJA 5EYDA 4WO5A 4FEXA 1H4LA 3SVVA 3RM6A 4EONA 4FV9A 5HORA 2EU9A 4Q9SA 5KMIA 4B99A 4F1MA 1BL7A 2BALA 4ZY4A 5FUTA 2REIA 5E1EA 4FV4A 4WRGA 4J53A 2HW7A 4O1PA 1PYXA 4EK6A 4YU2A 1QPEA 4FTUA 1IAJA 2RFNA 3FI3A 5HVYA 3OXTA 4EOQA 3DPKA 4FEVA 5TR6A 2F7EE 3OUNB 1PMNA 2WFYA 4M0ZA 1JVPP 4WSQA 4QTEA 4MXXA 2BFXA 4WNKA 4OLIA 3AXWA 3DS6A 4F6SA 4E5AX 4TYJA 3CS9A 4FKTA 2PE0A 2OJIA 2QU5A 2VTOA 3FL5A 3RKBA 3BU6A 2J90A 4F64A 1H0WA 1TKIA 1DI9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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