2R3PA

Crystal structure of cyclin-dependent kinase 2 with inhibitor
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
298
structure length
289
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-guided discovery of cyclin-dependent kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cell division protein kinase 2
total genus 86
structure length 289
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2007-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2r3pA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2r3pA01
2OJ9A 4U45A 5CAUA 4F9YA 2JITA 3ZRMA 1DAYA 4C57A 3BV3A 4QNAA 4FIEA 3UPZA 3U54A 4AE9A 3H9RA 3BGZA 3R73A 2YITA 4Z16A 1E1VA 1P14A 2HZ4A 3JS2A 2AC5A 2WIHA 3KRRA 3LCTA 3QRUA 4I5HA 3DBFA 4RZWA 2IVSA 2WMVA 4YZDA 5DWRA 3OCTA 4NTTA 3E3PA 4O38A 4KSPA 2BAJA 5BYZA 3RKBA 4EHZA 2W5HA 3FV8A 4FKGA 1Q8TA 3V3VA 1K2PA 3IW6A 3VVHA 2YM6A 3RJCA 2YIRA 5CSPA 2UW9A 5IEYA 3VF8A 4CG9A 4FTKA 3OCSA 4HOKA 4Y5QA 5CYIA 4L46A 3U6HA 1ZRZA 4MXOA 4LV5A 3RP9A 4F7NA 3F2NA 2WMSA 3GU7A 5B0XA 3IOPA 4U9AA 5CANA 3MA3A 2ZDUA 1P4OA 3NX8A 1UNGA 2B52A 3OC1A 1BYGA 4FKIA 4HYIA 3TZ9A 5AUUA 4C59A 4BIDA 1OVEA 1M2PA 3FZ1A 4XP3A 3KMWA 3BZ3A 5JRSA 3AG9A 1Y6AA 4M7IA 3QWJA 4QRCA 2UVXA 5CEIA 2XIZA 2F4JA 2I7QA 4ERWA 4NFMA 3CEKA 4C36A 3LFEA 4UB7A 4I41A 3ZRLA 2C0OA 1KSWA 2RL5A 2NPQA 2OIBA 5HI2A 3R8VA 3KXXA 3OMVA 3ZDIA 4CFNA 2WAJA 2XS0A 4K6ZA 2W9ZB 2O8YA 5ETFA 2ZM1A 4DGGA 3A60A 4CKRA 3QXOA 2VGPA 3VS4A 3ORXA 3IS5A 4RWKA 4BKJA 2C5NA 3PVUA 4Z7GA 2JFMA 4JRNA 4EOPA 3MFUA 5DBXA 3LMHA 4AT4A 3G33A 3E62A 4K0YA 3PPZA 2CDZA 3FAAA 4XEYA 3W16A 4OAVB 4O1OA 4G3DA 4E26A 3FY0A 4E6AA 3FMKA 2IPXA 3K5VA 2BMCA 3GU4A 3QD0A 4GK4A 3UVPA 3W8LA 3RZBA 4E8AA 3KVWA 2UZLA 2WQMA 4I6QA 1XKKA 4FV3A 3VUKA 4FODA 3E5AA 4TYJA 1ZOHA 4WO5A 2VUWA 3L9LA 5FG8A 2H34A 2X1NA 3PVGA 5K0KA 5HLNA 3TUBA 4K9YA 4R3CA 3ZLYA 1VJYA 4BCJA 4HGLA 5I9VA 3R7UA 4ZS4A 2BTSA 4RWJA 3CCNA 4M0ZA 4DG2E 5DN3A 2JDRA 1W8CA 1Q3WA 3I5ZA 3PXKA 4M66A 1Q4LA 2W1CA 3KK8A 4ZIMA 4WD5A 3VF9A 5AIKA 4MXCA 3NUPA 1IA9A 3OW3A 2IWIA 1PXPA 4DFXE 2JKKA 1YI6A 5EYMA 4D58A 3RHXA 3ORKA 3IG7A 5HIBA 3L8VA 5C01A 1H24A 4W9WA 4YBJA 3MY5A 2I0EA 4CTCA 2IG7A 2VD5A 2PVFA 3VRYA 1QCFA 3DDPA 4IQ6A 4IZ5A 1UWJA 3NUXA 3E92A 5CZHA 5E8ZA 3SXRA 4F1OA 4F9CA 2C0IA 3V8WA 3KRLA 1BMKA 4CMUA 4RVLA 2OZOA 3ROYA 3ZFXA 2QOHA 4EOKA 4YPDA 2JIUA 4B7TA 4FIIA 4HVGA 2YWPA 5HTBA 5CXHA 3KQ7A 3ZZEA 4HPTE 5DGZA 3UTOA 4JBQA 5HTCA 4M67A 5ETAA 4QP8A 3DY7A 2WMUA 5CT7A 4JAIA 2HZ0A 4YLLA 5HX8A 3PPKA 4FKPA 3HP2A 3NAYA 4FSUA 3QQKA 4KBCA 2PU8A 3CSVA 2CNVA 2XKEA 5ANIA 4FT9A 3M11A 3RAKA 3FUPA 3FLSA 4WG3A 3WARA 2Q83A 3KF7A 3SXFA 4CRSA 3MA6A 3GVUA 4KSQA 3TKIA 3TNIA 5LVMA 5EOLA 2G2IA 1MP8A 2VTIA 4PRJA 4NZWB 1KWPA 4CZYB 3HAMA 4HYUA 2PMOX 4OTFA 4XV1A 1Y8GA 3VUHA 4O7TA 4J7BA 3LFCA 2XA4A 3QKKA 3CY3A 4G3EA 4O84A 3OWPA 3GUBA 4EQCA 2BIKB 3GC7A 4QMYA 4DEAA 5B2LA 1AGWA 3ODZX 5JH6A 3RHKA 3RPOA 3PUPA 5JFWA 3G2FA 5J9LA 4MF1A 4FYNA 4G2FA 5AR3A 2E9VA 2ONLC 3PSBA 1H1QA 1KOBA 2YLFA 3R71A 4GFGA 4AQCA 3LMGA 3PY0A 4NK9A 4O27B 3FLNC 3DLZA 4FKWA 4FL3A 4J97A 2ITUA 2QOBA 2QO7A 3EZVA 3Q9XA 2UZNA 5J8IA 3QRKA 5JGBA 3TKHA 3LKMA 4YLJA 2BDFA 3R30A 4QYEA 2XK8A 4CV8A 5A14A 4O0VA 5AFVA 5CSVA 5KMMA 3BE2A 4QPAA 4GT3A 4YJNA 4G3GA 2XNEA 5HG9A 4O7WA 4I5CA 1G3NA 2PWLA 3E8CA 5DA3A 2JDSA 4FVPA 3DJ7A 4ZOGA 2R7BA 5AR8A 4H05A 4OBQA 2C6OA 2ZB1A 3NUSA 4MXYA 2IZSA 1WAKA 2QOKA 3BYUA 5HCYA 2Y6OA 2ITTA 4UWBA 4YC8A 5IA5A 5TOZA 4CVAA 4R7BA 2UUEA 3KA0A 3ALNA 3CIKA 4E4NA 1QPEA 2PHKA 3FLZA 4ZY6A 5HNBA 2XM8A 4QPMA 5CF5A 5K5NA 5CEMA 2QODA 5KKRC 1H0WA 4ZP5A 3FQHA 4JX3A 3RAIA 2QKWB 3OUNB 4BF2A 4XG3A 2IO6A 2O63A 5LVPA 3ORIA 3DK6A 3Q6WA 3TV6A 3D2KA 3IDPA 3UDBA 4A9SA 1J1BA 4AGUA 2X9EA 1WFCA 1ZMWA 2YM3A 4UALA 4BTMA 2FVDA 2F7ZE 5IEVA 2IVTA 5FDXA 4OTQA 4QTDA 4BDJA 4CT1A 3MYGA 4GJ2A 2R3GA 3KL8A 1J7UA 2VO0A 3H0ZA 3L9NA 4M14A 5HICA 3RPVA 4YZNA 3MY0A 3DK3A 2WFYA 4A9UA 4MEDA 3FQEA 1KOAA 3R9HA 3P86A 3QQJA 5M06A 4YJTA 3K54A 2G2HA 2JKOA 4DEIA 4QD6A 2P3GX 3ZZWA 3ZTXA 3IECA 2O65A 3GQIA 2E2BA 1WBPA 4CKJA 5HO6A 3N4TA 4AW1A 1PXOA 4A07A 3LQ5A 3N4UA 1S9IA 4O7VA 3O0GA 4BTFA 3VBTA 3F7WA 3O8TA 3R8ZA 3V5WA 4FSTA 3QCYA 2R0IA 4HVIA 4F7JA 3U6IA 1H1WA 4NCTC 4DGOA 5BVKA 3WE4A 4AZFA 2R64A 1SVHA 2ETRA 4GVAA 3AC3A 3EN7A 5CF6A 4UZHA 1YXVA 5EKNA 3QZHA 3WE8A 5HBHA 3UP2A 4MD8E 4WNOA 4MH7A 5H9BA 5FXSA 1TVOA 4NM3A 5AP2A 1YOJA 2JDVA 3R1SA 3BWJA 2GU8A 4C38A 4DLJA 1RQQA 3KXGA 3QTQA 5HO7A 1H8FA 4O0YA 4JBVA 2C6IA 2OG8A 2OXYA 4AZEA 2F57A 3F3TA 3HECA 4FV4A 4F0IA 5EW9A 4YTCA 3BI6A 1QMZA 2ZV2A 4YC6A 5BVDA 1H26A 4FV8A 4O86A 5H8BA 3QRTA 3QYZA 2WMQA 5CAVA 4FTJA 5HCXA 3VS6A 1YXUA 4KS8A 4LRKA 1YWNA 2RSVA 2W4KA 3RBWA 3UZTA 3HVCA 2XNMA 2R9SA 3KULA 2ACXA 4WNKA 3NIEA 5EH0A 3CKWA 4EH6A 5EI8A 3FI8A 3MWUA 3DXPA 4EH8A 3W18A 4K8AA 2ZMDA 3F66A 1ERKA 3BYMA 3UOJA 3DTWA 4IM3A 2E9UA 3SV0A 4L44A 5CNNA 3EQBA 4EQMA 2YISA 4E5WA 4ZTMA 3C5UA 2VX3A 3OEFX 4U0IA 4CSVA 5LWMA 3GC8A 4ZTRA 1CKJA 2CMWA 2ITZA 4ZLYA 3AC2A 3CD8A 4OTHA 4XRJA 1FGIA 2A0CX 4GH2A 3F88A 4GIIA 4PV0A 1J1CA 2RFDA 4FG8A 3LFSA 3T9TA 3HEGA 5EM6A 3E87A 4JS8A 5CSXA 4RFZA 4EC8A 2OK1A 3UJGA 2E9OA 4Z7HA 2O2UA 3H4JA 3IQ7A 3D5VA 3S95A 1JKLA 2ITXA 4MQ2A 4QP3A 4CT2A 2X4ZA 1ZYSA 2J51A 4AZTA 4CYIA 3V8TA 4O7NA 4LRJA 2EXCX 3D14A 2OO8X 4AU8A 5I3OA 3SA0A 4H3QA 4QYGA 4JOAA 5M51A 4X3JA 4ACCA 3O71A 4F9AA 3DS6A 3V5PA 2YHVA 2ITQA 4IVDA 4PDPA 1Q24A 4XJ0A 4RFMA 4RSSA 4ORKA 3GENA 1H1RA 3QUPA 3BHUA 4BFMA 3LIJA 2QOQA 4YJSA 3EQPA 4HW7A 4FV7A 4AZWA 4O7LA 3RWPA 3SVVA 3NGAA 4RJ8A 2PVRA 3KEXA 3PE2A 4FK3A 5FTQA 3VWAA 4BWPA 4DINA 5AAGA 4FKOA 3L8SA 2HCKA 3OCBA 2GNJA 1UA2A 3JXWA 2W5AA 3OOGA 3QZFA 2I0YA 4LL0A 3TXOA 5EHYA 4AG8A 5IQEA 1ZY4A 5JFSA 4GKHA 1WBTA 4EOJA 1PMEA 2CHLA 5EI6A 3PSDA 1XBAA 1VR2A 1OL5A 3P5KA 3UNJA 1STCE 1YHVA 4MHAA 4EH9A 3OZ6A 3EFWA 4MQ1A 5CNOA 2A27A 4FUXA 4D2WA 3GC0A 5IU2A 3MN3A 3TTIA 3A61A 3HMMA 4W8EA 3RGFA 4ASDA 2JBOA 3ZC5A 4ZSEA 5AMNA 3UNKA 2B1PA 3FZTA 2UW5A 4AXAA 1YXXA 2EWAA 4YSJA 4WHZA 1URCA 3SOAA 4EQUA 2DWBA 3ZDUA 4BZDA 1PMVA 3OP5A 3F5PA 3R2BA 4ACHA 5CI7A 4CMOA 2GHMA 5HO8A 4EORA 5FM2A 2IN6A 4X3FB 3UG2A 4GVJA 2ITPA 1M2RA 3TG1A 4GJ3A 3JY9A 4IM0A 4EOMA 4D9TA 3EQIA 3GB2A 4NJDA 1Y57A 3ZFYA 3ORZA 3KXMA 2OBJA 5H8GA 2B9HA 5CU3A 4QMNA 4FIJA 3NNVA 4NKAA 4FTQA 1SZMA 3AC8A 3Q9YA 3QQUA 2ZB0A 4CD0A 3WIGA 3HLLA 3CQUA 4EH3A 5DHJA 3E7OA 3UQCA 4G17A 4IADA 1JLUE 4AFJA 4O0UA 5LMAA 4BN1A 4S2ZA 2PULA 5A6OA 3D4QA 3LHJA 4HZSA 5AM7A 5B2KA 4U8ZA 3PWDA 3JPVA 1M7NA 2WTIA 4BWKA 5L8JA 1ZWSA 1NVSA 5LQFA 3JY0A 4AZVA 3QTXA 3VIDA 4ENXA 1ZOEA 4J95A 4E4MA 5KUPA 4OT5A 5AUWA 3RI1A 3SX9A 3VNTA 4BI1A 1YOLA 4RC4A 5AP5A 5HD7A 5EM7A 1PKGA 2IZRA 3EKNA 2YACA 4R3PA 3PZEA 2AYPA 3MFRA 1G8SA 4YTFA 1YHWA 2XK4A 3E7VA 4IIRA 1VYWA 5LWNA 4X6RA 1Q61A 2YFXA 3EQHA 4R7IA 3SXSA 4EK6A 2Y7JA 4B99A 4EOLA 3RNYA 1APME 3AD4A 3BRBA 3W10A 4HJOA 4RG0A 2BKZA 2QLQA 3RPYA 4BDFA 4YJPA 5J1VA 3Q2MA 4FIFA 4RC3A 5D41A 5E8WA 2OIQA 4H3PA 2ITVA 3PXFA 3EYHA 3ZYAA 5ETIA 4EUUA 3V8SA 5DG5A 4S34A 5JZJA 3AMBA 3QF9A 4PTEA 4YC3A 3W55A 3DAEA 4CYJA 3P23A 1V0BA 2VTOA 4YJVA 3TZ8A 4AS0A 2J7TA 5IEXA 4LM5A 5AA9A 3AGLA 1H4LA 3ZH8A 2Z7SA 3V5TA 4CV9A 2HWOA 4AGDA 3C0GA 4EHVA 4F4PA 3S1HA 3OOMA 1NA7A 2C69A 4UXLA 4QYHA 2BDWA 5JK3A 2OKRA 2CN5A 3LM0A 3UBDA 1P2AA 1WVXA 1P5EA 3QA0A 4J8NA 4TXCA 4YJOA 2YAKA 5D12A 3ZONA 4FYOA 3COHA 4S32A 5AP6A 3EMGA 3NMUF 4G9CA 4KBAA 3KREA 4L01A 4YP8A 1G8AA 5IPJA 4CFFA 4YZBA 1PF8A 2HZNA 2CKOA 4A06A 4G6LA 2YDJA 3OEZA 3CD3A 4RJ7A 4GKIA 3V04A 4RZVA 4UXQA 2V62A 4DG0E 5E8SA 2WELA 3HDMA 5IKWA 4KIOA 4QO9A 1JQHA 3UO4A 5AR7A 5J7HA 2Z7LA 1JKTA 3LVPA 3DJ6A 1Y6BA 2BHHA 1H1SA 2OFUA 4QMTA 4D2VA 4EYMA 2CNUA 4JR7A 4M0YA 1F5QA 2QONA 3DZOA 1ZYLA 3RM6A 3UOHA 3RTPA 1I44A 3BCEA 3DOGA 4QTBA 1H25A 3UIMA 1Q8WA 1UWHA 4IFGA 2YIQA 3QD2B 4WKQA 5AUYA 2VTHA 4FTRA 4DEEA 5L6PA 5ACBC 4RVMA 4FICA 1YQJA 4AZSA 5AUTA 5LMBA 4O83A 4TYIA 4PMTA 4FKUA 4LMUA 4CFWA 3MI9A 3DTCA 3SDJA 1WCCA 4ZJVA 2YCSA 3Q2JA 3F3ZA 3QGWA 4EUTA 4YHTA 4EOIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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