2UZBA

Crystal structure of human cdk2 complexed with a thiazolidinone inhibitor
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
296
structure length
295
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of a Potent Cdk2 Inhibitor with a Novel Binding Mode, Using Virtual Screening and Initial, Structure-Guided Lead Scoping.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
total genus 80
structure length 295
sequence length 296
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2007-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2uzbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2uzbA01
2R3RA 1OIRA 3JY0A 4BGQA 4BTFA 2ITUA 1GZNA 4IAAA 3DAKA 3NUXA 3MJ2A 5AUWA 3SX9A 3WF5A 4MEDA 3COKA 5TOZA 3SA0A 2IZSA 2RSVA 3RM7A 3G9LX 4QP3A 2Z7SA 5JGBA 2OZAA 2WXVA 2J6MA 4RIWB 3S95A 3N4TA 4IB1A 3ZEPA 3MVMA 5CU3A 4GL9A 1OM1A 4R7HA 4A4XA 1FGKA 3BU6A 4UB7A 4IX3A 3ZZEA 2JITA 3DK6A 4WSYA 1WVWA 3QXPA 4FIEA 3SHEA 3PXZA 3TNQB 4HCTA 4V0GB 4BDGA 5JKGA 3Q3BA 3TM0A 3R8LA 1NXKA 3LHJA 3FHIA 3VWAA 3V3VA 4EOLA 4GK2A 2R3HA 2GNLA 2OF2A 4FV4A 4MF0A 4CFUA 3QBNA 2W0JA 4HZSA 3BCEA 3PPKA 3K2LA 3RK9A 4A07A 2YCRA 4TL0A 4CSVA 3D7TB 5FDXA 1OVEA 1Q99A 3ACKA 2WD1A 3CXWA 3QKKA 5ACBC 3KXXA 2PPQA 3BEAA 3ELJA 3DZOA 2CJMA 4K33A 5ANGA 3R7IA 3SAYA 4EQUA 2WQNA 3Q53A 2BKZA 4CCBA 3Q9WA 2XK3A 4Q9ZA 5HX8A 4I94A 2WTWA 3AD4A 3UVRA 5DMZA 5JSMA 2QOIA 1ZYLA 2QOOA 3D2KA 3GFWA 3HA6A 4G9CA 4JLCA 4UBAA 5C4KA 4FR4A 1IA8A 4BF2A 5DI1A 2X2LA 4FIIA 1RQQA 5T6KA 2VO6A 4O6EA 3RPOA 3EQIA 1I44A 1YI4A 3QRJA 4I41A 3TNPC 4B4LA 2HOGA 5DA3A 3R9OA 3GEQA 2EB2A 3WZKA 3SG8A 3ZLSA 4RJ7A 4OT6A 5E8WA 3RNIA 2C0OA 3E3PA 4RJ4A 5DPVA 4AOTA 4B7TA 5J1WA 3P4KA 4H3QA 1WFCA 4JDJA 4RIXA 2FSTX 1U54B 3COIA 4CG9A 2Z7LA 2C3LA 4JOAA 3C4ZA 2WO6A 5BX0A 3SXSA 3CGFA 4OBOA 4XLVA 3VQHA 2YFXA 3C9WA 3FPMA 4QD6A 2WMTA 4W9WA 3VO3A 5AUYA 3OW4A 4GT4A 5DVRA 5AR3A 1PYXA 4GKIA 4CV9A 4YZ9A 4DFYA 2SRCA 3POZA 3L9NA 3R1QA 4BCPA 3O96A 1J7IA 4G34A 1V1KA 3C5UA 3GQIA 5DT3A 4D1XA 3UJGA 4ITIA 4X21A 2VWXA 3ANQA 1H07A 3R7OA 3OWLA 4FTCA 4QMQA 4TYGA 3ZUTA 3F66A 3LW0A 4W4WA 5J95A 3ROYA 4BYJA 4PY1A 3UOJA 1TKIA 2F2UA 3IOPA 3FLWA 4CV8A 3NUPA 4BDKA 1H1SA 2W1GA 1OKYA 3TKIA 3ZFYA 2CN5A 4A9RA 5I9XA 3PIXA 3QWJA 4MBJA 2EVAA 4BL1A 3DXPA 1RW8A 1WVXA 1ZOEA 3KVXA 5HG8A 1XH8A 4X2FA 1U46A 4IJPA 3PRFA 2X6EA 4GEOA 3QX4A 3U54A 2BZHB 2V7AA 2WQBA 2XIXA 4WD5A 2OGVA 3KFAA 3REPA 4GSBA 1P4OA 4CYJA 5CASA 3TNHA 5I9VA 2HYYA 2C5XA 3EN4A 3FE3A 3R9NA 2ZDUA 1H1PA 4W4XA 3UO6A 2PSQA 4AE6A 4EKKA 4EQCA 3ORLA 3KQ7A 5GJGA 4M0ZA 4FV6A 2YWVA 2W4OA 3LXPA 3WARA 3U9CA 4ASEA 4V04A 2VX3A 3IONA 4UYAA 4EH9A 3ZRLA 3NNUA 4D0WA 3TXOA 3UPXA 4HVSA 3TTJA 1HOWA 2H96A 4IFGA 4ZJVA 2ITYA 4KAOA 4U81A 3F2NA 3CD3A 5DGZA 3NUNA 4DT9A 2XYUA 3FKLA 3TIZA 3EYHA 3QCQA 3M2WA 2XM8A 4BWKA 4MX9A 2HENA 4DG2E 3IKAA 3GCSA 1PKDA 3EFWA 5JRQA 4DH8A 5AA8A 3KB7A 4OUCA 2JAMA 1Z5MA 4KBCA 2QO9A 2R0IA 2H8HA 3F5PA 1R39A 4G3GA 4C3RA 4IHPA 1JSTA 3VS7A 3PVWA 5E4HA 1H1WA 4F4PA 3I7CA 4LFIA 4PTGA 3E63A 2HW7A 4W4YA 2X7OA 4LM5A 5EOBA 5AX9A 3LFCA 5HBHA 4ZTMA 3RCDA 3DKCA 4EYJA 1BKXA 2I7QA 4RZVA 3R7UA 3KXZA 3E93A 5KBRA 4G6OA 1GIHA 5AMNA 4CZYB 5M57A 2NP8A 4IC8A 3BU3A 3JY9A 3PPZA 3PY1A 4FKJA 1OL6A 1FOTA 2IJMA 4RVKA 2QU5A 4XCUA 3S2PA 2HY0A 5B7VA 3PP1A 4EWHA 2XNNA 4KIQA 3ZLXA 3POOA 2YIWA 4RVMA 3DY7A 4AW1A 4O7YA 3ZUUA 4OTHA 3ORZA 3FI4A 3D83A 5HBJA 3O71A 4ANSA 3KC3A 5FXRA 5TF9A 2WTKC 3S1HA 4YJQA 5ETAA 2VU3A 4O81A 2B52A 3ZXTA 1R78A 2HWPA 3PXYA 5JT2A 1PXIA 4IQ6A 3JPVA 2CCHA 5IU2A 4TTHB 3H10A 4F7LA 2BRMA 4I0SA 2NNWB 4EOSA 2FYSA 4RJ8A 3UQCA 4OTWA 1OL1A 2PVJA 4R5YA 5M06A 4FSQA 3OBGA 3ZBXA 4FGRA 2IW8A 5J1VA 1OKZA 4MNEB 4I3ZA 5E90A 4ARKA 5EM6A 3WF7A 5JGAA 3RAIA 3R9DA 4I0RA 4QMWA 4FE2A 5F95A 5HICA 4P5QA 4BCIA 4RC4A 3NS9A 4DGLC 4GYGA 5BYYA 3DCVA 4AQCA 4FV3A 2YDKA 4IX6A 5KCVA 2VUWA 5BYLA 3DBQA 3PYYA 4H39A 4RQKA 3VC4A 4DG0E 3MTLA 2A19B 2B55A 2ETKA 2QOQA 3NYOA 4QP1A 4UZHA 2I1MA 4FVPA 5EFQA 2ZV8A 2OH0E 2PE0A 3MH2A 3TNWA 3F69A 5GZ9A 4X6RA 4Q5EA 4IDVA 2WNTA 2PE2A 4BTJA 5LJJA 3ATTA 3QUEA 4KABA 1CMKE 4I4EA 4M12A 4XLIA 4LMUA 1OPKA 3BI6A 2ZV7A 3SD0A 1YOLA 4YU2A 2UZWE 2F57A 4C3PA 5IUGA 2ITTA 2XNGA 4RFZA 3CQEA 3IQ7A 5E8YA 4CTBA 4R7IA 3PE2A 3V5WA 1U5QA 3TG1A 5CU0A 4O7VA 3OXIA 1OL2A 1GJOA 3E8NA 3QCSA 4H36A 4IB5A 4UYNA 3NLBA 4YPSA 1Y91A 4GJ3A 2UZTA 1GAGA 2PMNX 2CLXA 4ZLYA 3A62A 5KHWA 5LWMA 4S32A 4CFMA 4EHVA 1XBAA 4W9XA 2CGVA 3HL7A 4U41A 4P5ZA 3ACJA 4ALWA 4UEUA 4FKOA 4OBQA 4XV1A 5DOSA 4NCTA 4CKRA 3FBVA 3MJ1A 1UVRA 4WT6A 3AGLA 5IA3A 5IA4A 4RWKA 3R9HA 4YJVA 3T9IA 3I4BA 3W2SA 4PMTA 4QMLA 3ZRKA 4YSJA 1WVYA 1P2AA 1WBSA 2JKOA 5ANEA 4GVJA 5AUUA 1J7UA 4BGGA 2QLQA 3W10A 4ANQA 1G8SA 3D5VA 3EN7A 1AQ1A 4XHKB 5FQDC 3ITZA 2C6EA 5DE2A 3W18A 4FTLA 5CALA 4WBOA 4JS8A 3G0EA 4YZCA 1VZOA 3VUKA 1ZMWA 4XRJA 3IDCA 2GNFA 1H01A 2HK5A 3ZO2A 4BIDA 4USEA 2ZVAA 4EHZA 2YM4A 4GFOA 4UMPA 4O21A 2IO6A 3L8VA 1ZMVA 3BYMA 2P55A 2OKRA 2Z7QA 3TTIA 4IIRA 4QMOA 2VTJA 3CR0A 4I23A 4QYFA 3QC9A 2XKCA 2YCQA 3ZSHA 4E4MA 5A6OA 5KMJA 2XS0A 3IG7A 3NUYA 3TEIA 3VNTA 3LQ8A 1Q8ZA 4MXZA 1U54A 2B54A 4C37A 4QTEA 3ALOA 4WUNA 3GBZA 4C2WA 3LE6A 4YLLA 5DR2A 5KE0A 3OTUA 4A06A 2I0EA 1OBDA 3BHTA 2ITZA 3ANRA 4AA5A 2NO3A 3PWYA 3BYSA 2UV2A 4PRJA 3R0TA 2CMWA 4P2KA 5LMAA 4E93A 3ZTXA 2WIPA 1PXJA 4ZK5A 5L4QA 4DE4A 4FV5A 3CJGA 3HV4A 3ZU7A 3HA8A 3AT2A 4G3FA 3LMGA 3OUNB 5HO8A 4N6YA 3FXZA 2YAAA 2J2IB 3C4XA 2WTJA 3UYTA 2YACA 2EXEA 4DFBA 3N9XA 3NVKI 3KXGA 2OO8X 2ITOA 4ERWA 3UG2A 2NPQA 5BYZA 1REJA 1Y8GA 2OU7A 3OCGA 2ITPA 4DAWA 2XRWA 1YDRE 2RKUA 5HORA 4LGHA 4OTIA 5HU9A 5LMBA 3DA6A 2HIWA 4WNOA 5EG3A 4DEIA 2NRYA 2WTKB 3KEXA 5A4LA 2ZMDA 2XKEA 1AD5A 2GQRA 1KE8A 3UIBA 5CSPA 5CAUA 4E6AA 3QHWA 3VS6A 2CKQA 3C0IA 4JG8A 2O3PA 5ETCA 3THBA 1SVEA 2XIZA 3NYXA 5CT0A 5EH0A 4DGGA 3G6GA 4IADA 4K9YA 4XG6A 2C30A 4U3YA 4AZSA 4MTAA 4AE9A 4CFVA 2XCHA 5FD2A 3BWJA 4ZS4A 4MWIA 2WMBA 4DINA 4IVBA 4EH4A 2O63A 4HGSA 2YLFA 4IZ5A 4C33A 5AX3A 3FL4A 4FNYA 1NW1A 5H8BA 3V8TA 3O2MA 5IQCA 4OR5A 1ZZLA 3FZ1A 3T3VA 3TJCA 2JAVA 5IKWA 5AWMA 4MWHA 5K4IA 2GNIA 4IWQA 1H1QA 3QUPA 3NYNA 4L67A 5K0XA 1GIJA 3DXNA 4I92A 3R1NA 3RAWA 4B0GA 2GNJA 3ZLYA 3GCPA 5H8EA 1O6KA 4F0GA 4FT0A 1R1WA 2C6MA 2W4JA 3DB6A 4ZSAA 5F9EA 4FZ7A 2ESMA 3EFLA 3COHA 4EK4A 2UW9A 3BLQA 4KKEA 3WIKA 3HECA 2QHMA 3LCOA 2ZM4A 2PVMA 2UZLA 5IQIA 3ZM4A 2UZUE 4RRVA 3O17A 3AG9A 3V5JA 4ZTLA 4EOQA 4YMJA 2BROA 2J90A 5K3YA 1Y8YA 4CT1A 4P90A 1ZOHA 3HLLA 1A06A 4GIIA 5I9UA 3UO5A 4C58A 3C51A 4O0SA 2YZLA 3QWKA 3FSKA 3T8OA 1YOMA 4WSQA 4D2VA 1YHVA 5L2QA 2EXCX 2ITXA 3C50A 3KULA 4U40A 2OF4A 4ONAA 5JZNA 2WMWA 2IN6A 4GK4A 4MYGA 3MIAA 1MRYA 3O23A 2IZUA 4K0YA 4PV0A 3UNJA 5DBXA 5EI8A 1Q5KA 2XCKA 4YUQA 4YLKA 3TWJA 3GU8A 3MVJA 4FV2A 4M13A 5FXSA 4D0XA 4DLIA 4AA4A 4AA0A 2W4KA 4PTCA 4BCOA 4MD8E 5BUJA 2BTSA 4C34A 4XG2A 4FSTA 4CNHA 4AAAA 3DBFA 3LXLA 5F4NA 3WOWA 3PXQA 2DYLA 3EQRA 5B2KA 3VBXA 3K3JA 3ZO1A 4XOYA 2Q0NA 2ITNA 4FSUA 3RHXA 1J7LA 2Z7RA 2BILB 2DWBA 3FLQA 3MWUA 3OXZA 4DC2A 4IWOA 4ZZNA 4MNEA 3ZBFA 4BR3A 4YR8A 3I79A 3MH1A 5D1JA 4JG6A 4RX8A 5DEYA 4BRXA 3F3ZA 1OECA 4GKHA 4CT2A 4PMSA 4XJ0A 1JNKA 4HVIA 3LM5A 3EH9A 2O8YA 5G6VA 2PMLX 3KA0A 4GCJA 2X8EA 2F7ZE 4ACMA 2XF0A 4U80A 1BYGA 3JS2A 3M42A 5ETIA 4FA2A 5TO8A 5AUTA 2C5YA 2HAKA 2WTIA 3OOMA 4FUYA 2UVZA 4C62A 3P08A 4MXCA 3O8PA 3W33A 1WCCA 3UVPA 3QRIA 4JDIA 1UV5A 2V0DA 4AZFA 5CS6A 5C01A 3FQHA 1P4FA 2HZ0A 3EL8A 2JIUA 3Q9XA 1UU9A 2EWAA 4R3PA 4BFMA 4AN3A 4EI4A 4L3JA 2WFYA 3VBWA 2GFCA 2C3JA 4HVHA 4BCJA 3AOXA 2YAKA 3QTUA 4L42A 1GZKA 1OITA 3EQPA 2WGJA 4TY1A 3MFTA 4EONA 5KO1A 5LCKA 4EOPA 3VS2A 3CJFA 4GT3A 4FG7A 3U6JA 2OBJA 4S2ZA 3VW8A 4QQTA 4C35A 4JBOA 3VUDA 2HZIA 5I4NA 2PMIA 3DOGA 3LCKA 3TN8A 3QAME 3RGFA 3I0OA 3ZS5A 4CZUA 2GDOA 1NVQA 4M7IA 2IZTA 2PUNA 5AV0A 4FTJA 4Z7HA 3UMXA 4DCEA 4G3CA 1JVPP 4BCGA 3QLGA 4KIKB 1CDKA 4F7SA 4QNYA 4A4LA 3SDJA 1A9UA 1LR4A 3KCFA 5KNJA 3FHRA 1UNLA 4H05A 2XBAA 3CKWA 3LM0A 5EDQA 4FL2A 4PTEA 4BI0A 4E1ZA 4YJOA 4G3DA 4ASDA 4BHZA 2YIRA 2BHHA 3FQSA 4IB0A 2A2AA 5AR8A 3HDNA 1M2PA 4FOBA 4Q9SA 4FEVA 3D5XA 4IAYA 1QL6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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