2W7XA

Cellular inhibition of checkpoint kinase 2 and potentiation of cytotoxic drugs by novel chk2 inhibitor pv1019
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
301
structure length
285
Chain Sequence
SVYPKALRDEYIMSKTLGSGAGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDKVVGNKRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cellular Inhibition of Chk2 Kinase and Potentiation of Camptothecins and Radiation by the Novel Chk2 Inhibitor Pv1019.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK2
total genus 92
structure length 285
sequence length 301
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2w7xA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2w7xA01
4H3BA 4FTJA 2ZJWA 1J7IA 3HEGA 1YXTA 2C6TA 4RC4A 4R8QA 4JQEA 1T46A 2B54A 4NEUA 4ZP5A 3JY9A 4QTEA 2OJJA 4I5PA 5HCYA 5AM7A 5DRDA 2RFDA 1Q99A 2CKEA 1H1RA 2F57A 2UZOA 3C0HA 4HCTA 4I4FA 4XRLA 4KRDA 3R7OA 3ZFYA 5CEOA 2YERA 3FYJX 4JS8A 5FTOA 4DH3A 3ROYA 5KMKA 2ZM3A 4FC0A 3AD4A 5KKRB 1UKHA 5C9CA 3U6HA 2JFLA 4BCNA 1ZMVA 3QQLA 3A8WA 5LMBA 3KMUA 2OZAA 5ANIA 5ITAA 2R9SA 4X2JA 3EL8A 4HCVA 2XKFA 2HW7A 2Y0AA 4YNEA 3MH2A 1ZXEA 3ITZA 4F7LA 5IQAA 3D15A 4P5ZA 1OKVA 4Z7GA 2JFMA 1LEZA 1Y91A 2ITYA 2PSQA 3QZIA 1IR3A 1W8CA 3DBDA 4RX8A 4C34A 5E90A 4CZYB 4EK6A 5KMNA 3SVVA 5FLFA 4EK8A 2E9PA 4OTHA 3Q9ZA 2X2KA 2I0EA 2R3KA 4QYFA 4GFMA 1P14A 3FXXA 4IXPA 4FL2A 4MXXA 4NTSA 4QD6A 4RIOA 3R7IA 4DA5A 4K77A 2YJSA 5DMZA 1YVJA 5HCZA 5GZ8A 5HLNA 2YLEA 1PXPA 4C3FA 4QTDA 4L3LA 4LV5A 5AP3A 3WARA 3ZZWA 4RVMA 4AAAA 2YIQA 1M7QA 4UMTA 4DFUA 5IMXA 3P08A 3R21A 4IM0A 4RFMA 4EC9A 1U54B 4CQGA 2IZUA 5FEEA 3PTGA 5L4QA 3OY1A 3WILA 3MVHA 3BHTA 2W1DA 1VJYA 3ALNA 3HNGA 3U87A 3C0IA 3VBQA 4ZTLA 3ULIA 2H96A 4PV0A 4E4XA 1YI6A 3GC9A 2P33A 4WBOA 3DLSA 1DI9A 2XNEA 2YM5A 3TDVA 4I21A 5FDXA 1GNGA 5C4KA 3OFMA 5IH5A 3BYUA 3R01A 3ID6C 1YOMA 3EQFA 3EFWA 4ZY6A 3KRJA 2WZJA 4GRBA 4R6VA 1AD5A 4EORA 3SW4A 4NM7A 4YTHA 4FV2A 1CSNA 4RVLA 3OP5A 4C35A 5FTQA 2BRNA 5JFVA 3F61A 4W4WA 4AACA 3OBGA 2HWPA 3F3VA 2WMUA 5CZHA 4CFMA 5CU0A 4ANNA 4E93A 4KABA 3PJCA 3W8LA 5IH6A 5E91A 1YHWA 3ATTA 4G5JA 4NIFA 3L1SA 4YUQA 4IHPA 4X3JA 4C4EA 3A7HA 4ZEGA 3R30A 2X6DA 3HP5A 4FSMA 1CKIA 2A27A 3DPKA 3WZUA 1KE5A 4XNEA 4OAUC 2B1PA 4E73A 4EKKA 4H36A 4G3CA 2B9HA 3D83A 2IPXA 3CPCA 5DT4A 3W8QA 5DYJA 1ATPE 1J1CA 3T3UA 4AE6A 3W10A 2QNJA 3DB8A 4U79A 4ACCA 4BBFA 2W05A 5GNKA 3KCKA 2R3LA 4LM5A 4AW5A 3VHKA 4RIYB 4CCUA 1BI8A 4FBXA 3KMWA 4GUBA 3LJ2A 5L6OA 1K9AA 3O17A 3BHHA 2VWUA 3I4BA 3TIYA 1PJKA 4JT3A 4E3CA 5LQFA 2BRBA 2QG7A 1VR2A 3VIDA 5KUPA 4F1OA 3RNIA 4QQCA 2RFSA 4ZJJA 3O23A 3FKOA 1LR4A 2XK7A 3MFUA 4GH2A 1OIUA 4BBEA 3PG1A 4GFOA 2CLQA 2XM8A 3Q60A 5TT7A 3SXFA 1ZOEA 4BI2A 3ACKA 4IZ7A 4HVSA 5HBJA 5K9IA 4FK6A 4D55A 4GL9A 4IADA 4UXLA 4IBMA 3DOGA 5CU6A 4EH6A 5E8ZA 1W82A 2CCIA 2XKEA 1ZYDA 3GCUA 3OF0A 4IVBA 4L7SA 4TWNA 1WCCA 3RK9A 3UVRA 2DS1A 2WQMA 1AGWA 2PL0A 5AUVA 2ZM1A 1PYXA 1PXNA 1R39A 3RGFA 3RP9A 3VBWA 3CTQA 3CQEA 3MGYA 4BN1A 4CMTA 4DH8A 3PIXA 5JGDA 2CCHA 4EZ7A 4NL0A 2R4BA 4I23A 3LPBA 1R0EA 3LLAA 3EHAA 4MQ1A 4FYOA 5HORA 4LQMA 3LQ3A 2A0CX 4B99A 4J97A 4JDJA 4MNFA 2PVMA 5CXHA 3GOPA 4A9SA 3SOCA 5HE2A 1SYKA 5IZFA 1OL1A 4K9YA 4BRXA 4WD5A 4IW0A 3VAPA 4YSJA 5BNJA 3MTLA 4O0YA 4XG4A 3OZ6A 2ZV9A 2ZMDA 3FL5A 1DM2A 3PSDA 1O9UA 1UU9A 4HZSA 4ERKA 3I1AA 4OR5A 1XHAA 4P5QA 3ZBXA 5IUHA 4CKJA 5FBNC 4FYNA 4WSYA 3RHXA 2DWBA 1GZ8A 4DT9A 4DFYA 3LCOA 3MB7A 1F0QA 5HVJA 4P90A 4QMUA 3ZXZA 4O7NA 5LARA 4QMMA 3WF5A 4RZVA 3PWYA 2IJMA 3OROA 5ACBC 3HRCA 3V6SA 3NNXA 3RPOA 2X0GA 3MFSA 2R3IA 4EHZA 2C5NA 3TUCA 1QPCA 3BE2A 5D7VA 2QOCA 3KRWA 2X6EA 3W2RA 4JG7A 5EH0A 3H4JA 4YLJA 4XBRA 3PJ8A 4E26A 3QTIA 5EQYA 3QQKA 3VQHA 2RF9A 3GQIA 3NYNA 3PYYA 4J7BA 3C4EA 4JX7A 4NT4A 3ZHPC 2X1NA 4QYHA 5HE3A 4YTCA 3DY7A 5M53A 2IWIA 3I5ZA 1OL6A 3O8UA 4ZLZA 1R3CA 2R7IA 2VO6A 3QD3A 4FZDB 2PUPA 3OMVA 1M2QA 1WBWA 2A1AB 5DRBA 3U9NA 2G15A 4X0MA 4BGHA 4D9UA 2XYUA 3QZGA 2QD9A 4J8NA 4JI9A 3HV6A 1A48A 4PNKA 3D4QA 3VS3A 4E6CA 4S30A 2C5VA 5JGBA 1O6YA 4H3PA 2Z8CA 1KSWA 3R9DA 4CFWA 4UXQA 4PPAA 1XQZA 3PVGA 3HYHA 4MNEB 4PP9A 3ZFXA 1L3RE 3BQRA 2JLDA 3FBVA 4NM3A 3Q53A 1Q61A 3HMMA 3G6HA 4Y83A 5EDPA 3R9RA 1H00A 4D2WA 2PWLA 5FWKK 5L2TA 1HCLA 4V04A 3BLHA 2C6OA 5AP0A 2B52A 2GNGA 4FZFB 3TWJA 3NGAA 5IA3A 3DBQA 3S00A 3SQQA 3DXQA 3MY0A 4E5BA 2OH0E 3FI3A 4IB5A 3WOWA 3KY2A 3D2IA 3QCQA 5HD4A 4FKSA 2GQRA 3UJGA 4O0XA 3N4VA 3V5PA 2ITQA 2JITA 2FSMX 2IW8A 4ANOA 3WBLA 2XNGA 3FMEA 3GGFA 5C4LA 3KRXA 2J7TA 1Q62A 3FL4A 3I5NA 3QUDA 5DWRA 2PMOX 3SKCA 5JEBA 3NIZA 2VV9A 2YIRA 3FMKA 5M55A 2YM3A 3QLFA 3PE2A 4AGCA 4BGGA 4IX5A 3MV5A 5I5ZA 1K2PA 3R2YA 3U4UA 4HVDA 2WO6A 2YM4A 3TXOA 4ALUA 2RFNA 4FZ6A 3R8MA 4GIIA 3SAYA 5J9ZA 4TWOA 4FOCA 5IPJA 5GHVA 3TKIA 3A4OX 3PP1A 4JQ8A 4I24A 4IAFA 4IDTA 3WZJA 3ZRLA 4YR8A 2XEZA 4FTMA 3F5PA 4R5YA 3AQVA 5BYYA 2R3QA 2XBJA 3UYSA 2YM6A 1NXKA 2XK6A 4IWPA 5D12A 1ZLTA 2VTTA 3QXOA 3E93A 4XJ0A 4BCHA 4FIEA 1KOAA 3A99A 4AOTA 3DDQA 1T45A 3ZSHA 3PRFA 4NCTA 5AP7A 5FXRA 3EYHA 3R1QA 1E9HA 2C6MA 4KD1A 3WYXA 3OWKA 5CEMA 4N6YA 3O0GA 4WUAA 3LW0A 4X2KA 4ZZNA 4OAVB 4OT6A 4I93A 4AG8A 3DLZA 3I0OA 5EI2A 2YWPA 3MPMA 5JQ5A 3QRKA 4FF8A 5JN2A 3DAJA 4FNZA 5EYCA 3MVJA 2VO0A 5KO1A 5HESA 3TKHA 2W0JA 5AR2A 3MFTA 4DFNA 1OGUA 2QLQA 4IIRA 4F9BA 3UVQA 4ANMA 4TYGA 2W17A 2F7ZE 4JBQA 3SA0A 4C4IA 3FI2A 4WNOA 5FXQA 1ZWSA 4UMQA 4EOQA 4YBJA 4N4SA 2FSTX 1NT2A 3EL7A 4YPDA 4EZ3A 4UWCA 4F7NA 4AA0A 5LCJA 1XH5A 4ZTHA 4WG3A 2B53A 1BL7A 3EZRA 5D9HA 3KQ7A 3V6RA 1QCFA 4AA4A 2XNOA 5A3XA 4XYFA 1WVWA 3VO3A 2OICA 4NU1A 3ZBFA 3AG9A 2P55A 5GJFA 3RPYA 5CENA 4BTJA 4DGGA 1GZNA 4FKPA 1U5RA 1OKWA 2W4JA 1M17A 4FX3A 4HNFA 3HVCA 4O0UA 4WRSA 5HTCA 3ORPA 3PVWA 4PDSA 2CKPA 2AYPA 3QA0A 2X8DA 5I4NA 4FSRA 4IAYA 4BC6A 4FV7A 4XG9A 5AR5A 4W4YA 1SVHA 3KMMA 4ARKA 4ALWA 4BDCA 2IZSA 3CR0A 4FT5A 3FSFA 4H58A 4EWQA 3ZC5A 2F2UA 4BWXA 2WTVA 4EJNA 4PNIA 3B2WA 3DA6A 4AZTA 5A46A 1WZYA 3MY5A 3IW4A 2VWBA 3ENHA 3JUHA 4JIKA 4Q2AA 4USEA 5BMMA 5E8TA 4DG0E 5E8UA 3QUEA 3CY3A 5DR9A 5EDRA 4D2VA 2IVSA 4TW9A 3VJNA 4HYHA 3ZYAA 4B7TA 2C1BA 4IAZA 4GT5A 3DKFA 5M44A 3PUPA 4YNOA 3KA0A 3TZ9A 3HUBA 5HIBA 5CT7A 1JBPE 1URWA 4AF3A 5C1QB 1URCA 2EU9A 5AP5A 1YI4A 3W2QA 4S33A 3U4WA 4ANBA 2XVDA 3FMJA 5CY3A 4QNAA 3FQEA 1ZY4A 4EHVA 3WF9A 1OITA 2R3RA 1PXKA 3OXTA 1NVRA 3A7FA 3MWUA 5HEZA 2BFYA 2GS6A 3H9FA 2WQBA 4XUFA 1H08A 3SC1A 1PXMA 3R9NA 3VN9A 5F1ZA 1Q97A 3GP0A 1G5SA 3QX4A 5JGAA 3I7CA 2GHMA 4W9XA 2JIVA 2NRUA 3LFDA 5LWMA 3MPAA 5LJJA 1UVRA 1WAKA 3BQCA 5H2UA 4YHFA 4L3JA 4ZTMA 2JDTA 4O83A 2P2HA 4BTMA 3QUPA 2PVRA 3DKOA 4Y85A 4D0WA 1ZYSA 1GZOA 5AA9A 1A06A 3PPJA 3G6GA 4FV6A 5K0KA 5BQ0A 4EL9A 3FMMA 3ODZX 5CU4A 4DCAA 2WQNA 5HCXA 1OB3A 4U81A 3GFWA 4HZRA 4MXCA 2CDZA 2WD1A 3CE3A 3KL8A 4QYYA 1BKXA 2WFYA 3FI8A 4ZZOA 3UMWA 4YJPA 1F3MC 1V0OA 2ZYBA 3L8PA 4MK0A 4HGTA 3ZOSA 1XJDA 2ONLA 3PA4A 2XNNA 3LFAA 4TN6A 2HZ4A 3COKA 3NX8A 1XH4A 4BKYA 3VBVA 2YAKA 4MTAA 4RIWA 2B7AA 2QC6A 3R71A 3W2OA 3LMHA 4D4VA 2CJMA 4AN9A 3TUBA 2QURA 2G9XA 5M4CA 3RKBA 2YFXA 4F0FA 1P2AA 3CTJA 4FNWA 3TIZA 3OCBA 3QC9A 4O0RA 3R9OA 4X2GA 1VZOA 4V01A 4FEVA 2XIKA 3CQUA 5FD2A 4D58A 2WNTA 4QNYA 4GKIA 3EN4A 3ZRKA 3QHWA 2XCHA 2Y8OA 4MD8E 4FVRA 3UE4A 1KE6A 4I92A 4OTGA 3K3JA 4LI5A 4BZDA 2CN5A 3PPZA 3QBNA 3QQHA 5LVMA 2OF2A 4TYHA 4WIHA 2XNPA 4DEBA 3H3CA 4AW2A 5LVPA 1U4DA 1UWHA 2HK5A 3BU3A 4N6ZA 4HVGA 3A7JA 5E4HA 3HV4A 1W84A 2OF4A 4GMYA 3IW8A 3GVUA 1J3HA 4JXFA 2FUMA 4B9DA 3GUBA 3BGQA 1M52A 4FV8A 4G3FA 2GS2A 3QTSA 4O7WA 1FGIA 4LL5A 5JT2A 1W98A 2YDKA 4O0VA 3T9TA 4BTFA 5KZ0A 2GFCA 4X3FA 2WMWA 3KU2A 3Q3BA 2OFVA 2G01A 4FKGA 5I9UA 4O2PA 4QT1A 4AWIA 1WVYA 3EQGA 4KS7A 4ZJIA 4DEAA 5CF8A 4DEDA 2X2MA 4YJVA 5E1SA 5EHYA 4F9CA 2IZRA 4N57A 2BHHA 2YAAA 3CPBA 3IK3A 3NW7A 1Q3WA 2GSFA 3CLYA 4YJOA 5CU2A 4BDAA 4E4MA 4BY9E 2B9FA 2JC6A 3Q5ZA 5M4FA 3PVBA 1AQ1A 1TVOA 2YISA 4ACDA 3FXZA 5HG7A 3DU8A 4I0SA 4J95A 2WHBA 3KVWA 3PXRA 2UZUE 3L9MA 4IJ9A 1MRUA 1U5QA 1XO2B 4FICA 4BICA 1OPJA 2YEXA 3PJ1A 3WZDA 4J1RA 4O21A 1BUHA 2ITPA 4YC6A 4G6OA 4CTBA 4ITJA 2VTRA 2OG8A 5IKWA 3OCSA 4K0YA 3UOHA 3KN5A 3LFEA 3OY3A 3R7YA 5AIRA 2VTMA 4DEGA 5JH6A 2C5XA 3CGOA 3KF7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4QD6 A;  4RIO A;  3R7I A;  4DA5 A;  4K77 A;  2YJS A;  5DMZ A;  1YVJ A;  5HCZ A;  5GZ8 A;  5HLN A;  2YLE A;  1PXP A;  4C3F A;  4QTD A;  4L3L A;  4LV5 A;  5AP3 A;  3WAR A;  3ZZW A;  4RVM A;  4AAA A;  2YIQ A;  5BV3 A;  1M7Q A;  4UMT A;  4DFU A;  5IMX A;  3P08 A;  3R21 A;  4IM0 A;  4RFM A;  4EC9 A;  1U54 B;  4CQG A;  2IZU A;  5FEE A;  3PTG A;  5L4Q A;  3OY1 A;  3WIL A;  3MVH A;  3BHT A;  2W1D A;  1VJY A;  3ALN A;  3HNG A;  3U87 A;  3C0I A;  3VBQ A;  3P5J C;  4ZTL A;  3ULI A;  2H96 A;  4PV0 A;  4E4X A;  1YI6 A;  3GC9 A;  2P33 A;  4WBO A;  3DLS A;  1DI9 A;  2XNE A;  2YM5 A;  3TDV A;  4I21 A;  5FDX A;  1GNG A;  5C4K A;  3OFM A;  5IH5 A;  3BYU A;  3R01 A;  3ID6 C;  1YOM A;  3EQF A;  3EFW A;  4ZY6 A;  3KRJ A;  2WZJ A;  4GRB A;  4R6V A;  1AD5 A;  4EOR A;  3SW4 A;  4NM7 A;  4YTH A;  4FV2 A;  1CSN A;  4RVL A;  3OP5 A;  2X0P A;  4C35 A;  5FTQ A;  2BRN A;  5JFV A;  3F61 A;  4W4W A;  4AAC A;  3OBG A;  2HWP A;  3F3V A;  2WMU A;  5CZH A;  4CFM A;  5CU0 A;  4ANN A;  4E93 A;  4KAB A;  3PJC A;  3W8L A;  5IH6 A; 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