2WEVA

Truncation and optimisation of peptide inhibitors of cdk2, cyclin a through structure guided design
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Truncation and Optimisation of Peptide Inhibitors of Cyclin-Dependent Kinase 2-Cyclin a Through Structure-Guided Design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
total genus 86
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2009-04-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wevA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wevA01
4FKJA 3F3UA 3TZ7A 2X7OA 3P86A 3E8DA 4DC2A 3A8WA 4Q9ZA 3VS4A 5LQFA 3NLBA 4EOKA 3A99A 4AT3A 3F7WA 4JJRA 4NUSA 2IO6A 3N51A 4AA0A 3PJ1A 4QP1A 4J52A 3UPZA 2JKOA 3FXZA 2XNMA 5JFXA 4HOKA 4HVSA 4K0YA 2HZ0A 4OTIA 4J97A 4FIEA 4C36A 2X2LA 1IRKA 3OC1A 4YU2A 4MXYA 4EH6A 3A8XA 3EIDA 3UNKA 4U0IA 1Y8YA 3LCKA 5JFWA 2B1PA 4BCOA 3TG1A 4ZS0A 3TCPA 1UVRA 3F2NA 4EZ7A 1QL6A 2OU7A 3HV6A 4TYJA 5L3AA 3EQHA 3QTZA 4C4FA 4ANSA 5FTQA 4TL0A 4G6LA 2Y6MA 4L45A 4IB1A 4GT4A 2C1AA 2B55A 2IW6A 2IZRA 3PJCA 4GRBA 2H8HA 3KK9A 4U81A 4DLIA 2IZSA 3DTCA 5AX9A 3K5UA 4QMQA 4UMUA 1PXPA 2WTIA 4YR8A 2VZ6A 5E9EA 3HMIA 5JGBA 4LRJA 3FLQA 1YXXA 5FXRA 5IQIA 2JAVA 4EQCA 1R1WA 3KN5A 3IW6A 4BZOA 2QO9A 3DBCA 2B9IA 4ZTHA 2RKUA 4IVDA 5EOLA 2PE2A 2RIOA 4PV0A 3CBLA 3BX5A 3NW5A 5E4HA 4JDJA 2R0IA 3UG1A 1NVQA 4KUJA 3R04A 4TY1A 3VS2A 3CD3A 4ZZMA 1UU8A 4AGUA 2EXCX 4G6OA 2AUHA 4ANMA 3VUDA 2EB2A 5I9YA 5HU9A 4RX7A 4CV8A 5GNKA 5GJDA 4O6EA 4BGHA 2Y8OA 4I0TA 3GU5A 5C9CA 4AXAA 2J5FA 5IQBA 2W5HA 3QUEA 5ETIA 4ACCA 4OGRA 4M13A 1OZ1A 4EUTA 4CT2A 3QCYA 3QALE 5CALA 2VWWA 3FL4A 3OROA 4N6ZA 4OW8A 4ZSEA 1PXJA 4I6BA 4JG6A 5EG3A 3TEIA 3ZUTA 3ZDIA 4E3CA 3O71A 3PXQA 2C4GA 3ZXTA 4BTFA 5GZAA 1GZNA 5IA0A 2XK9A 3PA5A 3HMNA 5BYYA 2I0HA 2GQSA 4PP9A 4O0WA 5ETCA 3KULB 1J3HA 4IHPA 3TACA 5AR3A 3SV0A 2ETRA 5CQUA 3QXOA 4Z7GA 5J7HA 3LM5A 4K8AA 4EKKA 2R7IA 4QQ5A 5M55A 4ERKA 2BZKB 4Y95A 5DG5A 5JFVA 4XV9A 1Q8UA 4XBUA 3VBYA 2GTMA 5LCKA 3ORLA 4GU6A 4DTBA 3COMA 5AV2A 4M67A 3DGKA 5IDPA 1MP8A 1P2AA 3UVPA 5AP4A 4ACHA 4BCIA 4AS0A 1XBCA 5LOHA 1PMNA 3ZO4A 4JXFA 3AC2A 2W1ZA 4IAAA 4IWDA 4RC2A 5AUVA 2P3GX 3CS9A 2CKQA 3MVJA 4CFMA 3GU7A 1YOLA 2QLUA 3HX4A 4YJVA 5CS6A 3P08A 4K11A 3R7UA 3TUDA 3HDNA 4NW6A 3SX9A 1VEBA 2I0VA 3FZPA 3E62A 3P7BA 1TVOA 3TJDA 4BKZA 1A48A 2VX1A 2EXMA 3EOCA 3BHHA 4J1RA 1B39A 2YEXA 4DEGA 3Q5IA 3ZDUA 1OMWA 4KB8A 1PW2A 4A9UA 5A54A 3Q04A 5L8JA 5ANJA 3PZEA 3ORZA 3EQGA 3RJCA 2VTRA 3DPKA 3IW4A 4JQ8A 4UYAA 3VS7A 2BFYA 2BR1A 2PVJA 4FL2A 5J9YA 5EKNA 3F3ZA 3C0HA 3NIEA 2XIXA 4HPTE 3DB8A 5I9XA 2PMLX 2P33A 4H36A 2WB8A 4APCA 4KD1A 4HVIA 3MIAA 3EL7A 5M06A 3A62A 2XK4A 4L67A 4WSQA 4Y72A 4TXCA 2GCDA 3LMHA 4WG4A 2XNNA 3UMXA 4D2VA 2OJJA 3LHJA 3RAKA 3WI6A 4Q9SA 4V04A 2W1IA 5A4CA 5KO1A 3VUGA 2AYPA 1ZZLA 3SGCA 3HV4A 4OUCA 4I0SA 3ZS5A 4XP2A 2F9GA 3V01A 4A4OA 4L7FA 1JVPP 4YSMA 1J7UA 5CAVA 2OZAB 3NYOA 3UNJA 3UZTA 4NM3A 3FI3A 3QU0A 3F2RA 4FTLA 2VTOA 3DKFA 1SNUA 3EQIA 1JKKA 4CMTA 3BQCA 2XNBA 5AP7A 3EQCA 3G6HA 4QMTA 3LFSA 3LFFA 3TV4A 3DT1A 4Z55A 2VTTA 4FVPA 5DN3A 2XZSA 4IIRA 2YZAA 1KV1A 4QMZA 2YACA 2HAKA 2CNVA 4E26A 1PMVA 4D2PA 2R0UA 3UQFA 3DJ7A 3OW4A 2CKPA 3DFCB 2I6LA 4L6QA 1JSUA 3OY3A 4ZMFA 4BCQA 4DT9A 1WBTA 2QHMA 3H9OA 3G0EA 4JOAA 5AJQA 5EYKA 4AGCA 1H1PA 2XJ1A 4IJPA 4Q2AA 2GS2A 2RFNA 3ALOA 2R3JA 3BU3A 4E5BA 3NUYA 2VGOA 3QWKA 3ZO3A 2F7XE 4NIFA 3OCTA 3M1SA 2I0YA 1U46A 3EQDA 3MH0A 4IX4A 3U87A 3T8OA 2FSOX 2IVSA 3VJOA 4L8MA 5HORA 4D5HA 1M2PA 3NNXA 1Q24A 4EOSA 3F5PA 1URWA 2PUUA 3CTJA 1T45A 1Y57A 3A4PA 3GU8A 2C6IA 4A4XA 2CMWA 2A4LA 3KXMA 4CYJA 3MGYA 3DS6A 1YI6A 3GB2A 3R9DA 5KCVA 3GCQA 3LIJA 3FKNA 4IB3A 2C3KA 4AFEA 3C4FA 3NAXA 3PXFA 2YCFA 3OT8A 4UMTA 3VO3A 2PE0A 1YHWA 3FQSA 4FICA 4IX6A 4MQ2A 4CLIA 4I20A 5IA2A 3QA8A 4G3DA 2GNFA 3KXZA 4WG3A 4YJOA 3BPRA 3ZLSA 4NTSA 3BELA 3TNWA 4D2SA 4EHEA 1YOJA 4PMSA 3R8ZA 5KZIA 3U6JA 4OR5A 3T3VA 3Q3BA 4WA9A 4BI2A 5CF6A 3UP2A 3KMWA 4RA5A 5IPJA 3EFWA 2JDSA 2R2PA 5DPVA 3A4OX 2W17A 4GK2A 4BDFA 3RK5A 4PWNA 3NWWA 4I5HA 4I93A 1OI9A 2XEYA 4L3LA 1S9IA 3Q53A 5EDPA 4BHNA 2ZDUA 3KK8A 1PJKA 3FC1X 5JK3A 4GYIA 3DLSA 4FTJA 4LRMA 5DEYA 4AG8A 4GU9A 3T9TA 3VS0A 3D7ZA 4B7TA 3KQ7A 5AV4A 4JVGA 4WNPA 5DEWA 3LCSA 4I5PA 5J1VA 3L9NA 2OJFE 3LFQA 2R3HA 3BEAA 4QQJA 3WYYA 5J79A 1W8CA 1SYKA 3QUPA 4BI0A 3EZRA 4IM2A 4GK3A 2JITA 2UW4A 2C3IB 5CANA 1WBPA 2DWBA 4DFYA 1EH4A 2WNTA 3DU8A 4BBMA 3PVUA 1M2QA 1QPDA 4B8LA 4DGMA 1KE8A 5I9UA 2JDVA 5LVLA 4DBXA 2FSMX 4O2ZA 3WF8A 3NYNA 4E6AA 1Y6AA 3FLYA 4U45A 3OWKA 2WXVA 4UV0A 3KRWA 3Q2MA 3IW8A 4B4LA 1K3AA 5HO8A 3LJ1A 1REJA 3V5QA 3CP9A 1H27A 2Q0NA 3VS1A 4C8BA 3OS3A 5DT4A 5EM5A 2UW7A 4ASEA 5KKRC 4BR3A 1JBPE 4Q5HA 3A7IA 4FGBA 1F5QA 4C2VA 1OM1A 1CM8A 2AC5A 4IXPA 3WZUA 4QMMA 4O81A 5HVKA 3AT4A 3UMWA 2PVFA 3O23A 1BUHA 2H9VA 3CKWA 4FIJA 1G8SA 2Q83A 3QD2B 3MPMA 2PZYA 4RJ6A 3SLSA 3FV8A 2XA4A 4D1SA 2YAAA 3VW6A 4C4EA 3EQPA 4FTIA 4IVBA 3W33A 3N4TA 3CR0A 3KGAA 4MK0A 4XLIA 3BGPA 1WVYA 4O7VA 4GFOA 5AP6A 2LGCA 3DK7A 2WO6A 2X8DA 3WF6A 1CTPE 1U54A 2GMXA 1SVGA 3FMLA 5ANOA 2XNEA 4A9TA 3LLTA 2BPMA 2PVYA 5EHOA 4QRCA 4F6WA 3R9HA 5KMOA 1YWRA 4NM5A 3PY0A 5K3YA 2ZB0A 4D2WA 4DFLA 4IX3A 5KMMA 1YXUA 2B53A 4K9YA 4BGQA 5KMLA 1Z5MA 5CSHA 3REPA 5L2IA 4H05A 5K4JA 2WTDA 3IGOA 4FEWA 3U4WA 4YBJA 2YDKA 5BUEA 3O0GA 4O7RA 2BKKA 2JFMA 4K33A 4RX8A 2C6KA 2QOFA 3ZHPC 2OO8X 4AOTA 2UZNA 4XOYA 4YSJA 4O7LA 1H4LA 3PVWA 2BRGA 4A9RA 3RZFA 3R6XA 2IZTA 3VUTA 4FV9A 1YVJA 2J51A 2C5YA 4TYGA 3CJGA 1OGUA 4Y5QA 1YXSA 4G6NA 2RG5A 1YDTE 4G17A 1XH7A 2GHGA 2JIVA 2VO7A 2YJSA 3FYKX 3FY2A 3JY9A 4FTRA 5CEIA 4AE6A 3PPKA 4RPVA 1M7QA 2UW0A 2BUJA 2ITNA 2P55A 3KRJA 4AP7A 3DTWA 4TW9A 5AV1A 3BLRA 2GNIA 3PWDA 4WKQA 2QNJA 5CU3A 4EH5A 2Y4IB 2W9FB 1LUFA 4EOLA 2J0MB 2J50A 3AD5A 3QTQA 2W5BA 3OXIA 3GT8A 3MI9A 4RIXA 5TKDA 2PVMA 2HELA 2QR8A 3I0OA 3Q4CA 5B2LA 5CF5A 3D7TA 3WF5A 2CHLA 3BLQA 3R8PA 1AQ1A 4BDKA 4AUAA 2GDOA 5CTPA 5AAEA 4M7IA 3MW1A 4MXOA 4M8TA 3LZBA 4BCKA 5A46A 2O64A 5KMJA 5E8SA 5C8NA 2E9UA 2VTPA 3C5IA 5JRQA 4ZIMA 3RAHA 4FTUA 4X2GA 4XOZA 5E90A 5C1QB 3NUUA 4O0YA 1Q99A 4ZTNA 4L44A 3W10A 5I3RA 4MWIA 5KMKA 1IA8A 4IFCA 4QMVA 3NUAA 2WQMA 3I1AA 2VWXA 4XX9A 3RPYA 3GU4A 1XH8A 2C3JA 4IJ9A 3FZSA 2OSCA 4BIEA 3N4VA 3E93A 4DCAA 2OWBA 2BZIB 3VUIA 4AX8A 5H8GA 2J0LA 1OKWA 3OMVA 4E93A 1LP4A 2J5EA 5LMAA 3ID6C 2ITZA 5LWNA 3CGOA 5HGIA 3UO5A 5C27A 2OJIA 3LE6A 4ZK5A 3CLYA 1OL1A 2C6TA 2IN6A 5M4IA 2WMVA 3H9FA 1ZAOA 5CZHA 2IVTA 3BV3A 3T9IA 4BZDA 1U4DA 1APME 3HRBA 4IVCA 5CY3A 3V8SA 4ZY4A 2QHNA 4J7BA 3AD4A 2FGIA 4ANLA 2XMYA 2VWBA 2V7AA 3AMYA 3LFCA 3OEZA 4BFMA 4YUQA 3MH2A 3EJ1A 3OUNB 4FA2A 4LL0A 3UIUA 2I1MA 2R3LA 3NUSA 3QQJA 4FKIA 4P2KA 4NK9A 2VWZA 3EL8A 4H3BA 5AR8A 4ZJJA 1UNHA 2DQ7X 5CASA 5JN2A 3L9LA 3HAVA 4JDHA 5CI6A 4FV4A 2JDOA 5JEBA 2QOKA 3QD4A 2YWVA 2OH4A 5M09A 2QR7A 2VWYA 4BN1A 4BYIA 4C3PA 3CSVA 1M2RA 2QVSE 1SVEA 1OUKA 3NPCA 1FMKA 2ONLA 2B7AA 1H1QA 1WVXA 3PDTA 2UZWE 2G01A 3AC4A 1ZMWA 4U43A 4FOBA 5G1XA 2P2HA 2RFSA 2WMWA 5HTBA 4MF0A 5I9VA 4FBXA 4MKCA 1O6LA 3EKNA 4F9YA 3PG1A 1SZMA 2VNYA 1GOLA 3R2BA 3NAYA 5A4LA 2LAVA 4KBKA 3CPBA 2QG7A 3GCSA 3AT2A 1YI3A 5JGDA 3THBA 5HD7A 5L4QA 4I22A 2ZOQA 1Q5KA 4E6CA 4HNIA 2V0DA 4U42A 5FM3A 2BDJA 3DBEA 1W7HA 2QU5A 4RX9A 3HV7A 3QZHA 5L8KA 1PF8A 3GBZA 1XO2B 5HD4A 2BDWA 4GVJA 3ANQA 4PPAA 5FEEA 3BQRA 4DGOA 3FMJA 2BTSA 3EZVA 4J71A 4FV6A 1A9UA 3AMAA 2R9SA 3NUPA 4LYNA 4I6FA 3IKAA 2OF4A 1FOTA 4W8DA 4ARKA 5JMSA 3MJ1A 1PHKA 3UZPA 5CAUA 2J6MA 3DDQA 3QQGA 4CMOA 3PTGA 1O9UA 2Y9QA 4FSUA 2XK6A 4TNBA 5D11A 4H3QA 1W83A 2XS0A 4H1MA 4U40A 4EK8A 1ATPE 3C50A 3K5VA 3HDMA 4EQUA 3P4KA 4EC9A 3HV5A 3FPMA 2X6DA 3GC0A 4FIHA 3UO6A 4BDIA 2HXLA 4F70A 4ZSAA 3NZ0A 2ITYA 5I3OA 4FSNA 3KXHA 3O50A 3IOKA 2CLQA 3NX8A 2W1FA 4DA5A 2R3KA 4M14A 3ZXZA 1Y91A 4RLKA 2WMUA 1UU7A 2QURA 4C4GA 4F0FA 4AZSA 1GZOA 4O7YA 3D5XA 2W99B 4LG4A 4CSVA 3PA3A 4C0TA 5IEVA 4XV2A 4DG2E 3TKHA 4FT3A 5CU0A 4ANBA 2YIQA 3WIGA 5EW8A 3PVGA 1WBNA 4EWQA 2QLQA 1W98A 2Y4IC 4BCHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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