2WMSA

Crystal structure of checkpoint kinase 1 (chk1) in complex with inhibitors
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
264
structure length
243
Chain Sequence
EDWDLVQTLGEVQLAVNRVTEEAVAVKINIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Identification of Inhibitors of Checkpoint Kinase 1 Through Template Screening.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
total genus 75
structure length 243
sequence length 264
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wmsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wmsA01
3UP2A 2Y4IC 3PYYA 3UQFA 1KE5A 3FSFA 4GJ2A 4AA4A 3ZSGA 4FEWA 5IA5A 4EZ3A 5GIPE 4ZMFA 4AGWA 3DBQA 1Q8ZA 4GEOA 2QO7A 1XQZA 3ORNA 4P5ZA 4EJ7A 4TYGA 3OCSA 2JD5A 3BZ3A 4U9AA 4EWHA 5M09A 1Y91A 5FEEA 4GK2A 5FP6A 5TOZA 3R00A 5M4CA 4J97A 4AX8A 4Y5QA 4XBRA 2QR8A 2PZ5A 3MH2A 4QD6A 5AUVA 1H1PA 3ZHPC 3MY0A 3FMMA 3ORIA 2X1NA 4O6EA 5HE1A 4HVDA 4M15A 3VUIA 4R6VA 2VU3A 1S9IA 4J8MA 2VWBA 3BYVA 4LUEA 3UC4A 4GYIA 3KULB 4XG9A 4A4XA 4C2VA 2XYNA 3NUXA 5DPVA 3TNWA 2BTRA 5HU9A 1YXVA 5H2UA 4NK9A 3VUDA 4R78A 4IQ6A 4O0YA 2WIHA 1R1WA 4O0RA 4A9RA 5HTIA 3W2RA 1BMKA 4RPVA 5CS6A 5HG8A 1XH7A 5AR5A 3C4WA 4AS0A 2CKOA 2R4BA 4CSVA 3FMLA 1Q8YA 1FVTA 3P4KA 2HK5A 4J95A 2OXXA 4IB3A 3U9NA 4ANBA 3I0OA 4C58A 4CNHA 3WZUA 4ALVA 3TUDA 3SQQA 3FQHA 4B6LA 3E8CA 5AUZA 4ZLYA 3COKA 1PRYA 3L8PA 4RIYA 4YJSA 5D7VA 4ANSA 5J9YA 4IAZA 4GW8A 1OL7A 3D4QA 2YLFA 1Q24A 3KY2A 2AUHA 3OWJA 4CFXA 4BL1A 3P1AA 4C59A 2BRBA 2XS0A 3OHTA 3TIYA 4BZOA 4BBFA 4CVAA 4M67A 1UWHA 3RJCA 1OL1A 3COHA 5EHYA 2FYSA 4CTBA 2C6OA 4FKTA 4F7SA 1OBDA 2GU8A 2VTNA 1OL6A 1MP8A 3QWKA 5DEYA 4RX7A 4KAOA 4KBKA 3EN9A 3CR0A 4DFNA 4CZTA 2PZYA 3HV6A 2G2IA 3NNWA 4J7BA 4OAVB 2F7ZE 3CLYA 3U87A 4BTJA 5JN2A 4FSWA 5HE2A 2BPMA 2C6DA 3W8LA 5AP5A 2EB3A 3MIAA 5EM5A 5L4QA 3VBXA 3ORLA 4TWOA 3FI2A 4A4OA 3KGAA 3Q04A 1IASA 3IW7A 2YZAA 4Y73A 3GU7A 4AGUA 3Q4TA 1OPLA 4OTDA 3SGCA 4Y85A 2WMWA 5E7RA 5EM6A 5C27A 4QTEA 1WZYA 1SM2A 2W0JA 5HI2A 2YDIA 1L3RE 2O0UA 4XP0A 4EC8A 1OM1A 3UNKA 1UU7A 4GRBA 4Z55A 3CS9A 2YITA 4FG9A 4XG2A 2VZ6A 3WF6A 4Q5HA 3E8EA 2WQMA 4HPTE 1Y6AA 4IJPA 5IQIA 3S00A 2PVJA 1O6YA 5HORA 2BHEA 4YPDA 4ENXA 5BVFA 2H6DA 3R2YA 2GQGA 3OXZA 2BR1A 3B2WA 3BHUA 4BDEA 4E26A 2E9OA 3D7ZA 4BDGA 3WZEA 5J95A 4F7JA 1J3HA 2QOQA 4N4SA 3ZTXA 5GJDA 2C5XA 2OH0E 3FC2A 2ZM3A 4LQMA 5CTPA 3SVVA 4UALA 2XCHA 3D2KA 4L67A 5ANIA 3W2SA 3V8WA 1IAHA 3PP1A 2UZEA 2I0EA 3G2FA 2LGCA 5BUJA 2YISA 3FKLA 4LMUA 4F08A 3HP5A 2R2PA 3TWJA 3QUDA 3VW6A 1FPUA 2OW3A 4TWCA 5BVWA 4CQGA 3VBYA 3F5PA 4BRXA 2OJJA 4NKAA 2BTSA 1QPJA 5BUEA 2E9NA 5IPJA 3U4UA 1L8TA 3MVHA 5CANA 4FGRA 3LFEA 2ZAZA 3A2CA 2YAAA 3EFKA 4QT1A 2ZV2A 2O64A 2JDSA 2XEYA 2ZDUA 3DKOA 4W8EA 3V8SA 3HUCA 5BVDA 4FX3A 2WMUA 1EH4A 1ZMUA 1IG1A 2F57A 3C13A 3HA8A 5FM2A 3OVVA 4JXFA 2BUJA 3O17A 4OT5A 4TT7A 2Y8OA 3L8XA 4Q2AA 4ZTMA 3AOXA 3CQWA 3SLSA 3QTIA 4I3ZA 3VJOA 5AM6A 4D1XA 5CEPA 1Q5KA 4HVSA 3MFTA 1MRYA 2IO6A 3MTFA 4H3PA 2R7IA 5M53A 4G3FA 3QTRA 2HELA 5HGIA 4U0IA 4C3RA 3AD4A 4DE4A 4QMSA 4F99A 3RPRA 4R7HA 3SKCA 4KSQA 2JDTA 3DDPA 4CLJA 2HAKA 3SXSA 1Q3WA 4FSMA 1PXNA 4CTCA 1YWRA 3OUNB 5LMAA 2CNQA 5FP5A 2XJ0A 1GNGA 5K4IA 3OCTA 3VIDA 3HVCA 2GDOA 3KN5A 1PHKA 1KOBA 1P14A 2YM3A 3WYXA 3ZFXA 1KV2A 2C1BA 2YIWA 3KF7A 5C01A 3T3VA 4I20A 4B4LA 3IDPA 4FEQA 3QQGA 2V62A 5E8WA 4E6AA 4FKPA 4AW2A 4FV0A 2OIBA 2JAVA 4K77A 1URWA 3U54A 3JVRA 3RTPA 1TQPA 5EYDA 2RFSA 4EWQA 2BDJA 3LCOA 3MI9A 4O1OA 4AGCA 5HIEA 3PIYA 5F4NA 5B2MA 2XNPA 3NUYA 4NH1A 5M56A 3ENHA 1HCLA 1OUKA 1URCA 2GNLA 5ETFA 3F3UA 2GQRA 3MWUA 4IDVA 5K0XA 3TDWA 3QA0A 2GNJA 2XK6A 2HWOA 1H1SA 2OKRA 4Z9LA 5FXSA 4Z7HA 2GHGA 5TKDA 2OZOA 5HTCA 4O7VA 2HENA 3FLSA 4FT5A 2R3JA 3D9VA 3PJ3A 3U6JA 4L00A 2J5EA 4O7NA 4S2ZA 2WEVA 4NTTA 4AZTA 3QD4A 3NRMA 4NM5A 3SXRA 2CNUA 3DXPA 1W82A 3FY2A 4OTGA 4WG5A 1PW2A 5K3YA 3R8ZA 3RZBA 4BI1A 4DEBA 2GQSA 4LI5A 4PDSA 2QOLA 3RPOA 3ZRKA 4BGHA 5DN3A 5KCVA 2IW8A 2YDJA 3TNPC 3VF8A 3EN5A 3WF8A 4FSNA 1H00A 2CNVA 5EM8A 3IW4A 3E93A 5AR8A 2B7AA 2C4GA 4J53A 2H34A 5KMNA 4K2RA 3WIKA 1J1BA 4OR5A 3S3IA 1CMKE 2PE0A 3IK3A 3C4CA 3ORMA 4IVCA 4KKHA 5ITAA 4GFGA 5HG9A 3TKUA 2QOHA 4NYEA 2I0VA 3QRUA 5AIRA 3R7VA 3UOHA 1WBWA 5CF6A 4YJTA 3RK9A 3DXQA 5HESA 4XP2A 2O63A 5BVEA 2OI4X 4EZ5A 3BIZA 1DS5A 3DBFA 3PPJA 5H9BA 5CEMA 3LVPA 2B9JA 2Z7LA 5AV1A 3W1FA 4C8BA 3CGOA 3DZOA 3GC7A 3LPBA 3RAWA 2QOIA 3LCSA 4PMMA 4UWCA 2BAQA 5FRIA 4FGBA 2H96A 4NT4A 1VZOA 2YM7A 4N57A 4YC3A 4I6QA 5J87A 1ZY4A 3FXWA 2R7BA 2XIRA 4PMPA 3GU4A 2OLCA 3RHKA 3QYWA 4WUAA 2RL5A 1BLXA 3F69A 5IQGA 2YM5A 3BBWA 3CD3A 3I5ZA 1JWHA 4EHEA 5H3QA 3UODA 3ZFMA 2G1TA 4EHVA 3KRRA 4BIBA 4K6ZA 1YDTE 3VRYA 3KRXA 5CZIA 2QG7A 2PMNX 5CT7A 4YLKA 1Q4LA 3NIEA 4GT3A 4RJ7A 2PL0A 3PXKA 4FKSA 4GV1A 4F9BA 3I60A 2RFDA 5CSWA 3IW5A 3TZ9A 5E9EA 4PWNA 4QP1A 2PMIA 5ETAA 3VUMA 3S2PA 4OBQA 3R9RA 3QYZA 3I6UA 3AXWA 4BN1A 2C3LA 4R7BA 3BCEA 4DEEA 3LAUA 4V04A 2QOOA 1KE7A 4U42A 4JL9A 4CFFA 1MRVA 4TW9A 1R0EA 5DGZA 3ZCLA 3ZEWA 4N0SA 3FI4A 4ITHA 4J71A 4YZNA 1BL6A 2V0DA 5FDXA 4EQCA 3CKXA 3IW8A 2BHHA 4DBNA 5CAQA 1ZYJA 3FSKA 3SOAA 3KCFA 3PXYA 3C5IA 2GNGA 4ID7A 3SXFA 3F5GA 3AMBA 3ZYAA 4EH2A 3NCZA 4EYJA 2J90A 2WTWA 4UX9A 1KSWA 3TZ7A 3EMGA 4RMZA 2O8YA 4U5JA 5CAOA 3CJFA 3G9NA 3HMPA 3RAIA 4IZYA 2W5AA 2Z8CA 4R7IA 2FO0A 3TTJA 4YSJA 3MBLA 4DEHA 4CFVA 2R64A 1MQBA 3DK7A 3C1XA 5CEKA 5LWNA 2PZIA 2GS2A 4V0GA 4IHPA 4D4SA 5IDNA 4D4YA 3I79A 4FTKA 3UE4A 3I5NA 4MXCA 3ZONA 3U4WA 4U3YA 1OKYA 2Y4PA 3WE8A 3LE6A 4EBWA 3KMWA 3GT8A 4QQJA 4ACMA 2R3LA 3A8XA 3R04A 4AOIA 2PVRA 5HKMA 4QNYA 4C4HA 4FKGA 2HXLA 5KMIA 3L8SA 4FEVA 1ZAOA 1REKA 3GP0A 2V55A 3UO4A 4JAJA 4MEDA 1U4DA 4HNIA 4I5MA 3RCDA 1BX6A 3LQ8A 4FTAA 2XCKA 2ZV8A 5IMXA 3BU6A 1LEZA 3F7ZA 5M51A 3IDBA 4YHFA 2PUNA 4IWPA 3P7CA 2YCSA 3O23A 4EHZA 1CKPA 2OZAA 2KTYA 4YPSA 4IB0A 2ZYBA 4HCTA 4IB1A 5AWMA 4A9SA 4KABA 4QNAA 5J7HA 3UOLA 3GEQA 2YIRA 4W4WA 1CM8A 2C30A 2ZMDA 4HCUA 3FY0A 3VBVA 2XKCA 3NYOA 2Z7SA 4PF4A 5A46A 2B1PA 4E4LA 5L6OA 3EYHA 3GB2A 5K4JA 3NIZA 5HOAA 4CG9A 5CT0A 1UKHA 2YM8A 2BILB 3R21A 2BZJA 3FYKX 2YM4A 4GUEA 3RAHA 5JFSA 5KMJA 1YXSA 3QQLA 3PIZA 2Z2WA 5B2LA 4CT1A 5J9LA 4OTRA 5CU2A 4RSSA 1FMKA 2A19B 3TTIA 4PTEA 3QGWA 4FTOA 4JBVA 4JG7A 4E5AX 1T46A 2XRWA 3QLGA 4FIGA 3BELA 3QTQA 3KCKA 3TV7A 3H9RA 1CKIA 3K3JA 2HY0A 3PRIA 3LLAA 2VTQA 2YWVA 4WNPA 2E9VA 3A62A 4AZVA 3OOGA 3GC8A 3PZEA 2OWBA 3Q9ZA 4IXPA 4E8AA 4FV4A 5DT3A 4LOPA 1DM2A 3RP9A 2UV2A 4AWIA 3OTVA 2QKRA 3MA3A 3LM0A 5IQAA 3MY5A 4UWYA 3UVQA 4QMPA 3KULA 2V7AA 4G17A 4NJDA 1PXOA 4RT7A 3ELJA 4ZLOA 4MXAA 5GZAA 4U97A 3GOPA 5CENA 1JBPE 2W06A 4IX5A 2JBOA 1YDRE 3W2OA 4YJOA 2OFVA 4L3JA 4CYIA 4CYJA 3ZDUA 5LWMA 2VTHA 4FTJA 3DGKA 2R3IA 5AR2A 1ZLTA 1SVGA 4FKWA 2PVFA 1OITA 2YIXA 2FUMA 3EOCA 4C35A 1AD5A 2OJFE 3JXWA 4EH3A 2UVZA 5I3OA 4J98A 1Q8UA 4X3FA 5AV3A 1PY5A 3UYSA 4MH7A 4EKKA 1OBGA 1MUOA 4D2TA 4FSUA 2ITPA 3HMNA 2BCJA 2PUUA 2WTDA 4LL0A 4ZZOA 1ERKA 3Q4ZA 5J9ZA 4GS6A 3UPZA 4O21A 3UOJA 3D5WA 5HBHA 3IQ7A 3QU0A 4CV9A 2Y7JA 2VWZA 2ZVAA 1SNXA 4D2VA 4IB5A 3CC6A 3KL8A 3OCBA 3KXZA 3HECA 4WNKA 3TG1A 1U5RA 3MVJA 2QU6A 4PPBA 3UVPA 2WKMA 2ONLA 4DFLA 3FE3A 3P86A 4PTGA 4AXAA 5M4UA 3LQ3A 3D7TA 1ZXEA 3RK7A 4FV6A 4ALUA 1OKWA 4GIHA 5AIKA 2HW6A 4G34A 3PA3A 2J9MA 2XNMA 4FSZA 3EQCA 3KU2A 1PF8A 1DAWA 4EJNA 2WD1A 3FMEA 4R3RA 2FA2A 4L01A 2B9IA 1IEPA 5EQEA 3TT0A 4ALWA 3WE4A 5EHLA 3W8QA 5AP3A 2W7XA 4F6UA 4QMMA 4JIAA 2W9FB 2W1ZA 4N70A 5M4IA 3NW6A 2IZTA 4JDKA 1M7QA 3E88A 5IUIA 3HNGA 3GNIB 4FTCA 4D2SA 2PPQA 2WAJA 4G3GA 3ROCA 5I0BA 2WEIA 2GNIA 2XIZA 3BV2A 3MGYA 3O8PA 4P7EA 2W4KA 4FBXA 4LMNA 4QRCA 4JG6A 5IA3A 4ZOGA 5I9YA 2WB8A 4Y5HA 3GCPA 4O7RA 4W9XA 1JLUE 3HL7A 3WILA 4EK3A 5BVNA 4BR3A 4HVIA 3C51A 3ZC5A 2RFNA 3R8VA 1J1CA 1H25A 2JDRA 2OXYA 3PP0A 3UDBA 4BCMA 5CAPA 5A4QA 2VUWA 1OZ1A 3ZH8A 1W98A 4MWIA 4RJ5A 3TKIA 1I09A 5IMEA 5J1WA 2IW9A 2PHKA 4ZS0A 5AV2A 3OC1A 5LMKA 4G6NA 5B2KA 4DCAA 4MNEB 1WCCA 4DBXA 3PZHA 3G51A 3V01A 5GZ8A 3OMVA 3R1QA 3LCTA 4TZRA 2W17A 4FTTA 2YACA 4KIPA 4RZVA 3ZC6A 4FEUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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