2WQOA

Structure of nek2 bound to the aminopyridine cct241950
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
277
structure length
242
Chain Sequence
SRAEDYEVLYTIGTGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLRELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQLTLALKECHRRLKPANVFLDGKQNVKLGDGTPYYMSPEQMNRNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRYSDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLILEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title An Autoinhibitory Tyrosine Motif in the Cell-Cycle- Regulated Nek7 Kinase is Released Through Binding of Nek9.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE NEK2
total genus 75
structure length 242
sequence length 277
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wqoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wqoA01
4GG7A 4RT7A 1Q41A 3WF6A 4HJOA 5EKOA 3QD4A 2YIXA 2C3IB 5L2TA 4L00A 2C6TA 2WMTA 3AC3A 1FVRA 3QX4A 3OT3A 4RJ4A 4AFEA 2PUIA 2QD9A 2YCQA 2EXCX 4UEUA 2VTNA 5AV2A 5AAGA 3PTGA 2P3GX 4G6LA 4IVDA 2CPKE 4U6RA 3HMIA 4YZBA 3WF7A 4EYMA 2JDVA 1XBAA 4IWDA 4TYJA 3DOGA 3WE4A 2C3KA 4BCMA 5K5XA 4V0GB 2FSTX 1OPKA 2PMNX 3WILA 3Q60A 4ZXTA 1KUTA 3ALOA 3FE3A 2P4IA 2X1NA 2OWBA 4UX9A 2C47A 4GKHA 5HVYA 5M06A 3M1SA 2XYNA 4FIIA 3VS7A 4C4IA 2AYPA 4G3CA 4OGRA 3I81A 3G6GA 5HG8A 1H00A 4U9AA 3RK7A 2R7BA 4FSMA 4CFFA 4M13A 3G9LX 4EOKA 2Q0NA 2X9FA 4TRLA 3R9OA 3UGCA 3A7IA 3GUBA 2EB3A 5CXHA 3VS3A 4AQCA 2W7XA 4X7QA 5BUEA 1UA2A 4L46A 5AR4A 2WKMA 3W33A 3LMIA 3VN9A 4ENYA 4FL2A 4RSSA 5A4QA 5IH4A 4JDHA 4FSTA 3ZEPA 4KABA 4D4SA 2B52A 3UC3A 3I6UA 3NUPA 4JDIA 1YOJA 4M68A 3IDBA 3MVLA 5AV4A 2PUPA 3FXXA 3NLBA 4PQNA 4YTIA 4BBMA 4KA3A 3LQ3A 3ZLWA 4M14A 3E5AA 3KN5A 3PZHA 5LMBA 4NWMA 2GFSA 2WMWA 3GNIB 4U5JA 2WTCA 4X2KA 3MFUA 5CVFA 2C3JA 3QKKA 4L45A 4W4WA 4AGCA 3LLAA 1KE5A 1LEWA 3UIUA 4IX5A 2VTAA 4YC3A 2UZEA 4XP2A 3TG1A 1DI9A 2FH9A 3IOKA 5J9LA 2ESMA 4DEIA 4DGMA 3A7JA 4BBFA 3ZSIA 3PUPA 3P7CA 5HCXA 2YDIA 5K5NA 1TQMA 4P2KA 3FMKA 4R3RA 3O2MA 4FKOA 1OIRA 5L8JA 3W32A 2VTLA 4NYEA 1BL7A 3K3JA 3PJ1A 1YHSA 2Z8CA 5A4LA 3NUUA 4J98A 3TKHA 4BDEA 4MBLA 3BYUA 3AT2A 1ZOGA 4QMOA 3E8DA 4DFUA 4YP8A 2QKRA 4LRMA 2CSNA 1YI6A 1RW8A 2BZKB 4J7BA 2X4ZA 3ZUTA 1WZYA 4FTAA 5H9BA 3FY0A 1XH8A 4ZTSA 1JWHA 4GU9A 5T6KA 3FMLA 1JPAA 1H1RA 4D1XA 4I6QA 3D7TA 1H28A 4U42A 5I5ZA 3E3PA 2QOCA 4G9CA 2PZ5A 3LW0A 4AF3A 4IZ5A 4LGGA 4EZ3A 1FMKA 4F08A 3CEKA 4D2VA 4DEAA 4USFA 2R3GA 3ERKA 2WQOA 1U59A 4FE2A 4HVDA 5EW8A 3M11A 1JKTA 4BL1A 2F7XE 2C30A 2PYWA 3NR9A 4BI0A 4WHZA 3ODZX 2EXMA 1OL1A 3R30A 4C61A 1A9UA 1WVYA 3NCGA 3QD2B 4WNMA 3II5A 4TYGA 3MJ1A 5CS6A 2UW6A 2VNWA 2VWIA 3DNEA 3KXGA 2YAAA 4GEOA 4C2VA 4C02A 4CRSA 2BRMA 3ZSGA 3LXLA 4PWNA 5FDXA 3VBXA 2P55A 2AC3A 5BVEA 3V5WA 3MVMA 3CQWA 4FI1A 3BEAA 4FSZA 4Q2AA 3P79A 3ZZEA 5LOHA 4QMZA 1R0PA 5E7RA 3DB8A 3VS1A 3AOXA 5AR7A 4D28A 4EK5A 4NW5A 3EZVA 4DLJA 3PYYA 4W8EA 1OIUA 3BV3A 4ZEGA 1KE9A 4IZ7A 4JNWA 2R3JA 5T3QA 2FB8A 4I0TA 2GCDA 4AE6A 4GFGA 4NT4A 4HVIA 2GNLA 2XBAA 1YOLA 1V0OA 4IC8A 4DG2E 5HORA 1Q97A 3PVUA 2DUVA 1Y57A 4QNYA 3LJ0A 5IDPA 3BHUA 5L8LA 4QP4A 5IF1A 2RFEA 4X6RA 3FI2A 4O1PA 3QRUA 2X8DA 4FNZA 2W96B 4C7TA 5ETFA 4UYNA 4IIRA 5DMZA 3NYXA 4G9RA 3CIKA 3HP2A 4ASXA 4UWYA 4XG7A 4IJPA 3V5LA 3HV5A 4EK8A 4UXLA 4EOIA 1L3RE 3GCSA 3V5PA 3CR0A 4ENXA 3LFBA 4IWQA 4R7IA 3GU6A 1GNGA 2V22A 2GMXA 1P2AA 4HZRA 4QYFA 4YO6A 4CKIA 4O7WA 2WTJA 2VZ6A 3CTJA 4X3JA 1ZYSA 5DR2A 1AQ1A 1UKHA 4OTDA 4HGSA 3EQCA 4I20A 3MH3A 5EW9A 4FSWA 3Q96A 3PPKA 1YW2A 2A2AA 4YLJA 4U8ZA 4JQEA 4EBWA 3FMEA 2H34A 5A14A 5AP1A 5AUUA 3T3VA 3HAMA 2IPXA 5IQEA 4RVMA 3GCUA 5D7AA 4C59A 1FVVA 2RF9A 2VWBA 4IWOA 3RINA 3FMHA 4I22A 4JT3A 5KZ0A 4BDCA 1IR3A 4WNOA 2E9VA 3UNZA 4EH6A 4XX9A 4CEGA 3DU8A 3UO4A 1REKA 4J99A 4PMMA 3ZCLA 5LWNA 3SVVA 3VHEA 4ZJIA 4DEHA 3ID6C 4GFOA 2C3LA 5LJJA 3V5QA 1TKIA 3QD0A 4BI1A 2V5QA 3L9NA 2HOGA 3RZFA 3BX5A 3P5KA 4NIFB 5HD7A 3FZ1A 3BHVA 2C6KA 3PE2A 3Q04A 1PXMA 1Q3DA 3QTXA 3QYWA 2C1AA 1KOAA 2ZDTA 4N4SA 4YNOA 3SRVA 4UMUA 4K0YA 1YKRA 1IRKA 3OCGA 4PL5A 4AGWA 5JGDA 4BIBA 4I5PA 3VS5A 5J5SA 5BPYA 4I3ZA 4D1ZA 2OICA 4EQUA 4DEDA 1K3AA 5C26A 1YI3A 5DT4A 4MX9A 1JLUE 1G8AA 3FLWA 1KE6A 3LFQA 4YZNA 2XM9A 3LMHA 4FT5A 2J0LA 4HW7A 1J3HA 3OUKA 4TKSA 4QTCA 4C2WA 2W1CA 2WNTA 2EWAA 3BPRA 3QCYA 4YTCA 3KK8A 2Y4PA 3MFRA 3C7QA 5EM8A 1M2QA 2AUHA 4WT6A 1FPUA 3BYVA 5AV0A 2OF4A 2VO7A 4BB4A 2QOQA 4FZ7A 2YLFA 3HX4A 2OJJA 2QURA 3NIZA 5CTPA 4V05A 3POZA 3FI4A 4AZSA 2WEIA 2WTWA 5K0KA 2VO3A 5FQDC 4KAOA 2CKQA 4LV5A 5K4IA 3CGFA 3BV2A 3GT8A 3OY3A 4U43A 5BVNA 3R2BA 3DXNA 3VUGA 3ZBXA 4YZMA 1PY5A 2Z60A 3E8CA 5DHJA 2QG5A 3NGAA 3KMWA 4R5SA 4D9TA 3RK5A 4FL3A 4W9XA 5HG9A 3RTPA 3UYTA 3IW4A 3FI3A 5IEYA 4L8MA 4IAAA 3D2KA 4FIGA 4K1BA 4EH3A 3LLTA 1ZMVA 3VW8A 4O7NA 5LVNA 1CMKE 5E1SA 5F1ZA 3EFWA 3HRCA 2BDJA 2XIKA 3DCVA 5CYIA 5AUXA 5HGIA 3IGGA 5AX3A 3E62A 5KKRC 4ITHA 4O0XA 4M69A 3C50A 4Q5EA 4NUSA 4D1SA 3FEGA 5GNKA 3KGAA 4RJ5A 1UVRA 2BRGA 1UWHA 2X81A 2B9HA 3QBNA 4C3FA 5LVPA 5LCJA 2OFVA 1PKDA 4IZAA 4GSBA 2Q83A 3FJQE 2QG7A 4JQ7A 3MB7A 3SLSA 3DGKA 3ZLYA 3QFVA 2E9NA 4NW6A 4Y46A 4U3ZA 3RWPA 3QTUA 4ACMA 4UMQA 4DF3A 3DFCB 2PK9A 3CKXA 4UY9A 4G6NA 3KF4A 3PSBA 3OXZA 3TV4A 3OUNB 3HNGA 4M7IA 3NYNA 4RMZA 4RFYA 1XWSA 1XBCA 4ZSEA 2VX0A 4FR4A 4LL5A 3OWLA 3LMGA 4MYGA 3QA0A 1IA9A 2HZ0A 4ZSJA 3BU5A 2PE2A 2JDRA 4TWNA 3P08A 3SW4A 5K0XA 2CJMA 3RAHA 3KL8A 3O50A 1QPEA 1YHWA 4A4OA 2GQGA 3UTOA 5CNOA 2VAGA 1GZKA 4IB0A 5FEDA 3W2RA 4HGEA 2F2CB 4GCJA 5J8IA 4BI2A 2PUUA 3IW7A 5AP6A 1BL6A 3V3VA 5KKRB 3LFAA 3S00A 2GQSA 2IWIA 2W1IA 4ERWA 5M07A 2UW5A 2XNPA 2W06A 5E8SA 2UW7A 4RIWB 2WQBA 3D14A 2ETRA 4UWBA 4W4YA 3D83A 3GC7A 3FDNA 4CRLA 2P2HA 2J0KA 5K9IA 2I0YA 3TEIA 3L9PA 4HNFA 2HWPA 2OH4A 2XRWA 2ZM3A 5DR6A 2PSQA 3Q3BA 1WMKA 4OT6A 5IQDA 2CN5A 3AXWA 4QP7A 5JZJA 5BUIA 3OC1A 4FT3A 1W84A 3GXLA 4HCUA 3W2CA 2FO0A 3Q5ZA 2QOKA 4D5KA 3FPMA 3FBVA 4AZEA 1Q62A 4KSPA 5M56A 2R3QA 4E5BA 3SXSA 2W0JA 2XRUA 4G3FA 5DRDA 2J0MB 1H1QA 3HV7A 2QR7A 4H36A 4R5YA 2X2MA 2IVVA 3A61A 4IX3A 4AT5A 2HW7A 2HXQA 3H3CA 4RQVA 3TWJA 4CZYB 2W5BA 4MNEA 2OIDA 4BDBA 3PLAE 1YXXA 2YCFA 2HXLA 4GK4A 4PDYA 3PA5A 3A8XA 2ZV8A 4IZYA 4IBMA 4L6QA 4MXZA 4TWPA 4ZJJA 5HIEA 2BRBA 3HRBA 5FWKK 4D2TA 4O84A 4BZOA 4XHKB 2R3PA 4QP8A 3FXZA 4TNDA 4TYIA 3C13A 4ONAA 4QP1A 3W2QA 4ACGA 4O7RA 1O6KA 2ITNA 3C0IA 5JEBA 4L43A 2W4KA 5LMAA 4DFYA 4F09A 4I5MA 4E4NA 2XJ2A 3PY1A 4O0RA 5HIDA 3ALNA 5L6OA 2CGUA 3GCVA 2VTMA 4BY9E 4XBRA 5AR3A 3KXNA 2FSOX 3HVCA 5DEYA 4A9SA 2QI8A 2HZIA 5HQ0A 2J0JA 3HECA 3LJ2A 3OF0A 5DGZA 1CSNA 5B2MA 4I1ZA 4YJTA 5HO6A 5BVDA 4L7SA 5IH6A 4QMMA 5E8VA 1IASA 4XEYA 4BTFA 2PVYA 5EDPA 4CMOA 2I7QA 3BHYA 3IDPA 3KXMA 4FF8A 5IQHA 5CXZA 1WVWA 4H3QA 5D10A 4GFMA 4QPAA 2ACXA 4IDTA 3D7TB 3LFEA 2PTKA 2VN9A 3R0TA 5HVKA 1YDSE 1YXUA 2ZB0A 3PWYA 3RCJA 4FTJA 3TUDA 5CAUA 3RNYA 3TCPA 4DFXE 2QO7A 2REIA 2V62A 3TV7A 4E20A 4EWHA 1ZYJA 4J8MA 1XBBA 4BKZA 2Y6OA 1ERKA 3QZFA 4LRKA 2B9JA 3V51A 2WGJA 1Q99A 3UNKA 4U79A 3GC9A 4AW2A 4C38A 4MWHA 2C0OA 1O6LA 2ITTA 5GJFA 4F63A 2C5VA 4YBKA 5I9YA 3DBEA 3NAYA 5G6VA 5I0BA 3FHRA 3AD4A 3WYXA 5AM7A 4YR8A 3VO3A 5EDRA 3HRFA 4BVUA 2XMYA 3QGYA 4FX3A 5FXSA 1PXPA 1ZOHA 3O7LB 4FEQA 4C4FA 4I0SA 3BI6A 3Q2JA 3A99A 3QXOA 3EQHA 4NM0A 4IQ6A 2YDKA 3OWPA 4L9IA 3VF9A 5CVHA 2WAJA 2YLEA 3R6XA 3A2CA 3C4EA 4F7LA 2WU6A 3P7AA 3TNIA 2PY3A 4D0XA 4ANNA 4FTQA 2GS2A 4YMJA 4KIKA 5KHXA 5HLNA 4E5AX 1PXLA 2PVKA 4ZJVA 5DN3A 3LM0A 4HNIA 4JBQA 1XJDA 3C4CA 4IC7A 4IVCA 1G3NA 4DG0E 5LMKC 1YOMA 4X2NA 2YJSA 3TIYA 2BKZA 3DZOA 5CWZA 4CCUA 5EI2A 5DG5A 3VF8A 2XKDA 5A54A 4GV1A 5EOBA 2YCRA 4JOAA 4BCGA 1H24A 4C3RA 3GVUA 4R78A 1Q8WA 4TYHA 5EYMA 4ZTLA 3D15A 3VRYA 3CLYA 1NXKA 4UZHA 5DPVA 2BHEA 4FTTA 4RIXA 1OPLA 3E8NA 3QZGA 2CCHA 3EQDA 3RZBA 1OL6A 2C1BA 4WSQA 4ACHA 4D4VA 1Q3WA 2F7ZE 3U4UA 3AG9A 4BGHA 3EOCA 5CEIA 3REPA 2WTIA 1H01A 4QYHA 4P5QA 2PVLA 5M09A 3MFSA 2ZV2A 1SZMA 4MXAA 4EUTA 3C51A 2X7FA 3CQUA 3RHXA 1QL6A 4OTGA 3OBGA 2CGWA 1LEZA 2ITVA 2JKOA 4I6FA 2XKCA 2PVJA 5ANKA 4IAFA 4L68A 5JT2A 1OBDA 1XH4A 1ND4A 3SV0A 3CE3A 4RX5A 3N4UA 3C9WA 4CGAA 4GUBA 5L6WL 1OKYA 4C37A 2C5OA 4MXCA 2PVHA 3IOPA 5E1EA 4JG7A 3ANRA 5C01A 2IZSA 4HYHA 4BCNA 3JR1A 4CG9A 4YLLA 3M42A 3EIDA 4O1OA 3QZHA 2UVYA 1OL5A 1FVTA 4I6HA 1FGKA 4NL0A 3LXNA 5FBOA 3GU5A 4TPTA 4CT2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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