2XIXA

Protein kinase pim-1 in complex with fragment-1 from crystallographic fragment screen
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
274
structure length
272
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystallographic Fragment Screen Identifies Cinnamic Acid Derivatives as Starting Points for Potent Pim-1 Inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords PROTO-ONCOGENE SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE PIM-1
total genus 79
structure length 272
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2xixA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2xixA01
3FL4A 3KXNA 3EB0A 4XG8A 4M69A 4OTWA 3BCEA 4MTAA 3SV0A 4E5WA 4ZXTA 5GIPE 4ZSJA 3I1AA 4L46A 3V5WA 1TQPA 4KBAA 4LFIA 4P90A 1J3HA 4TNBA 4TWCA 1SVEA 3VUGA 4GEOA 2OZOA 4U0IA 2R4BA 2XVDA 3HV3A 3BZ3A 4FKSA 3QGWA 5ANJA 4EWHA 5EQEA 1REJA 4HGLA 4YZDA 1WMKA 2HW6A 3MFSA 4FSUA 3KGAA 5EKOA 3VC4A 5IZFA 2FO0A 3FMHA 4H1JA 5AR2A 1J7IA 3KKVA 3QGYA 3RPRA 2IZTA 5CSHA 4QYHA 4FL1A 4TXCA 2RFDA 2E9UA 2XNBA 3KL8A 3ZUVA 4F7JA 3FYJX 4X2GA 3IG7A 2C6MA 3KMMA 4IXPA 4ALWA 1U5RA 2ITNA 4S30A 3UIMA 4FTMA 4MBIA 5L6WL 4EC9A 4LGDA 1E9HA 1JKTA 2ZV9A 3EMGA 3PTGA 3R7EA 4YBKA 4FZFB 4HZSA 3Q4ZA 5BVDA 4YJUA 3FEGA 2JBOA 4ASXA 5IG1A 3ROYA 4QYFA 3S2PA 4MNFA 3RNYA 5M4UA 2JAVA 1H0VA 4AZSA 3R8MA 2UZOA 5KMKA 4BDEA 4PX6A 4F9AA 4FTRA 4KABA 1PYXA 3RI1A 3Q5IA 3SXFA 4A9TA 4DH5A 2F57A 3FZRA 3GC0A 4FKIA 4WBBB 4YGAA 3QQFA 5HTIA 4PNIA 3QLGA 3RHXA 5K9IA 3GP0A 4O0RA 1Q8TA 3L8VA 4HCTA 5HNBA 2X6DA 2OXYA 5KNJA 3TIYA 2BFYA 4RJ5A 4FVRA 5M57A 3V5LA 2VWUA 3MSSA 3GC8A 4O1OA 3L8SA 3BHVA 4RZWA 4O2ZA 4RT7A 1PY5A 5HE2A 1H25A 2LGCA 1SYKA 2IVUA 4MYGA 3F3VA 4GH2A 2IG7A 2R3IA 3BHUA 4IVDA 3WIKA 1SVHA 4GMYA 5FEQA 4ZK5A 2W4JA 1OM1A 2B9HA 2YDKA 3IOPA 2ZJWA 3P5KA 3F2NA 3FXXA 3P7AA 3EIDA 2WTWA 4L43A 3R9OA 3VBYA 5E8WA 2OICA 4NKAA 5IA3A 5CNOA 2JDOA 4FC0A 3BQRA 1OPKA 3QTUA 2OJFE 2VWBA 4RWIA 3BHTA 2XNNA 4I93A 5DPVA 5ANDA 5IMXA 2BDJA 3Q52A 3UVQA 2VTQA 4E93A 4FG7A 4KINA 4OTHA 1OI9A 3V6SA 3C4WA 5IQAA 4UV0A 5AJQA 4EHEA 1Y57A 4AN9A 5CALA 4M84A 4BIEA 4RC3A 1XQZA 3TUDA 1M2QA 3R7OA 4EBWA 3QWKA 5EG3A 3ORMA 1GZOA 4YJRA 4AW5A 3P86A 5CEMA 3FQSA 4GFGA 2UZTA 5L8KA 4FUXA 2DQ7X 4UZDA 5LMKC 3KK9A 2RFNA 2Y9QA 3PYYA 2I0VA 2JDTA 4PRJA 4U5JA 4BTKA 4MNEA 4MXOA 4FZ7A 5KZ0A 3VF8A 5CYIA 4FSQA 2CPKE 3BYUA 2CJMA 3WZKA 1YXTA 3C4ZA 2WQMA 3IW4A 5AAGA 5HO7A 2ZDTA 4AQCA 4J98A 4C58A 4H3QA 4CZUA 3QTSA 3E64A 4BCIA 2BRHA 1CM8A 4E3CA 1WAKA 4B6LA 2V0DA 3LQ5A 4H58A 3DK3A 4RA4A 2ITQA 1DI8A 3UPXA 3Q9XA 5HBHA 2FSTX 2JC6A 3E8DA 3KY2A 3COIA 3PXKA 4DEIA 5EYMA 2ZM4A 4C2VA 3ETAA 3TZ9A 4DTKA 3AC1A 5GNKA 1BI7A 1ZMWA 3UYTA 5AR4A 5HG8A 3HMOA 4ZTNA 3SW7A 5AUWA 4N70A 4B99A 4C4JA 2XK6A 4F6WA 3RMFA 3V3VA 4MBJA 2YM4A 1X8BA 4I20A 4O0VA 1V0PA 1XBAA 4RVLA 5DWRA 3BYMA 5LMAA 5HLNA 2PE2A 3N4TA 4FSNA 3JY0A 4I1ZA 3MW1A 3JUHA 3NYOA 3QHWA 2XNPA 3PA4A 4L3JA 3ORIA 4CFWA 2E9NA 3M1SA 3SW4A 4UMTA 5HESA 5FTQA 1H1PA 3ZLYA 1MQ4A 4D1ZA 4UZHA 4MBLA 3W2RA 4DEBA 5HNIX 3TACA 3ITZA 1PKDA 4B8LA 2PK9A 3ZZWA 4FIJA 4YU2A 3UIUA 1OL7A 4C33A 4XP2A 3R9NA 3KVWA 4YMJA 3G5DA 2KULA 4KIQA 5AP1A 3UMWA 4A9UA 3UVPA 3EYHA 3UIXA 1E1XA 4FKUA 3TZ8A 5C27A 2YM6A 3D5VA 1H0WA 4WSYA 2B7AA 3WF7A 1OIQA 3AQVA 5M51A 3SRVB 3NNVA 3V5QA 4BIBA 2GQGA 4WG4A 5E8UA 3V8SA 2FGIA 4APPA 3LCTA 4HOKA 2BVAA 3VBQA 2C6EA 2XK9A 2HIWA 1KE8A 4NTSA 1FQ1B 5HIBA 5IA5A 3B2TA 3AT2A 2C6DA 1GZNA 4RWJA 4WUNA 4YO4A 5DT4A 4AA4A 3R2YA 5TE0A 5A4TA 1W82A 3CEKA 3OY1A 3DFCB 4EK5A 4NZWB 4K1BA 4P7EA 2GDOA 4IAIA 4JXFA 4I5PA 2V5QA 4IHPA 2BKZA 3P1AA 5FXQA 3VW6A 3MFUA 1FVTA 3QRKA 4PDPA 4PY1A 4G5JA 4JG8A 2RF9A 2ZM1A 3MTFA 1PXKA 3QCYA 1J91A 1Z9XA 4LMUA 4YJSA 5HIDA 3COHA 4UMPA 4PPCA 4CZYB 3R63A 4GU9A 1HCLA 4R3RA 3E7OA 1A9UA 4R3CA 4R8QA 3OS3A 5BVNA 5DMZA 5EFQA 3SD0A 2JEDA 4F4PA 5FBNC 2PU8A 4RJ8A 5DHJA 4RX9A 4GT3A 4EORA 1R1WA 3FLSA 2QOCA 3F5PA 2QNJA 3PSBA 4EJ7A 4ITHA 4RSSA 3EFKA 4XG2A 2UVYA 4EOPA 2I40A 1YHSA 3E92A 4PP9A 4BCHA 5L8LA 2CGVA 2OZAA 2B9FA 4AT5A 4YHJA 3R22A 4O6LA 4EH8A 2B9JA 3IQ7A 2GFSA 3LLTA 3SA0A 4BVUA 3CD3A 2GS2A 3D2IA 3QKKA 4KSQA 3I6WA 1H01A 1PRYA 2R3HA 1OMWA 3SAYA 1KOAA 1MP8A 2W1EA 1WVXA 3L9LA 4FNXA 4HCUA 4OTGA 5JFSA 3C5IA 4YJVA 3NUAA 5CLPA 3Q2JA 1GNGA 3KN6A 3R02A 4QP1A 3EFLA 5CEKA 4EUUA 2PE0A 1QL6A 1STCE 4FV0A 4PTEA 4W4YA 4C4IA 5F94A 3F3ZA 4BDCA 4O21A 2WGJA 4UXQA 4C0TA 5C8KA 4WT6A 3LFCA 4FYNA 5C8MA 3U6IA 3AOXA 3HKOA 1JSTA 4GUEA 3FUPA 5HCYA 2X0GA 3BBTB 5BUIA 5E8YA 4W4WA 2FH9A 3VBTA 4AP7A 3MH0A 3DBFA 3Q6UA 1F3MC 2Q0BA 2VX0A 4FTUA 2GHGA 5I0BA 3OW4A 4M8TA 1SMHA 5D9HA 3TEIA 4R7HA 2I1MA 1XH7A 4QP8A 4BWXA 1YRPA 5EM5A 3OOGA 3BV3A 3W2SA 2YABA 2PE1A 4U40A 4X7QA 3NS9A 3VF9A 3ZYAA 3PA3A 1YXXA 4O0WA 4BCKA 3UBDA 3PSDA 3PJ3A 4ACDA 4F6SA 4RWKA 4FKJA 4I4EA 1UWJA 3CJGA 3QTXA 1M2RA 3FPQA 4M68A 2X81A 3OCBA 2FSLX 3DKOA 3MTLA 1Z5MA 3L1SA 2ITZA 4JG6A 4USDA 4CG9A 4BWPA 5L2SA 5IH4A 5AUVA 3CQUA 3ZM4A 2PVJA 2QU5A 1KWPA 1UKHA 3IDCA 4U41A 5FP6A 3A8WA 2R3FA 4BGQA 4BI0A 3FPMA 1EH4A 2B1PA 3QD3A 4K6ZA 2C3LA 4F0IA 2W99B 3D0EA 4JI9A 5F1ZA 4JR3A 4WRSA 4TYGA 3NCGA 4ZMEA 4QYYA 3FQHA 2QOOA 4AW1A 4YTHA 2YCRA 1BL6A 2HZ4A 3KULB 4PPBA 4ONAA 5M08A 4QMOA 3QWJA 4GFMA 3KVXA 4ZLYA 5A54A 2C6OA 4GRBA 5CT7A 3QF9A 5KMNA 5IQDA 1MUOA 3D5WA 4GW8A 3C7QA 1KE9A 4GKHA 1IR3A 3PSCA 3OD6X 4HNIA 3K5UA 1ZY4A 1QCFA 2VWXA 4FNYA 2CHLA 3Q60A 5IUGA 4D2SA 3UOHA 1F0QA 2HY81 3OFMA 4ACHA 2H9VA 3HMNA 1KE6A 4EOIA 1OPLA 3R7VA 2YWVA 4TWPA 4MKCA 1BMKA 2C6IA 2RSVA 4CVAA 4FV9A 4BDHA 3PXZA 2JIIA 5B2MA 4NCTC 2IJMA 3AD5A 3IGGA 4R1YA 3C4FA 3RPSA 2QLUA 5EDPA 4QMPA 3S3IA 3SC1A 4X3FB 4DEAA 3PRIA 4OAUC 4F7NA 2W9FB 3L8XA 3W8QA 3EQIA 3EWHA 5EDQA 3ZDIA 3D7TA 5JGBA 4DCAA 4AOTA 1Y91A 2OIQA 1ZOHA 3MESA 4OAVB 2XNEA 5E8ZA 2OW3A 2BZJA 2R0IA 3FKLA 1OZ1A 4BDJA 3ZTXA 4X2JA 4LG4A 4U9AA 2ZVAA 4QYGA 1WBSA 4Q9SA 2VZ6A 4ZLZA 4FBXA 4PMMA 4FK6A 4JT3A 4D5HA 4WA9A 3C13A 3FLWA 4J97A 3WBLA 2PVKA 3O0GA 5JZNA 3E3BX 3NUSA 2IVVA 4NKSA 1PXJA 3ORTA 4EOJA 2OBJA 3ODZX 4NJ3A 5HD7A 1RQQA 1TVOA 2W4KA 4C62A 1BUHA 3D14A 2AC5A 5AV4A 5LARA 1R78A 4DF3A 3ACKA 2JLDA 2GHMA 3UVRA 1RDQE 4QQTA 1P5EA 2IW8A 1YDRE 4NW6A 3V5TA 4E8AA 2OJGA 4IEBA 3BELA 4YZNA 2W1IA 4I6QA 3ZH8A 4D1SA 1H24A 3V6RA 1CMKE 4ASDA 2JFMA 4KRDA 4LV5A 3LFFA 3VHEA 2HYYA 4QMUA 3U4UA 5LQFA 1WBVA 3FZPA 4BTJA 1H1SA 4A9RA 5AMNA 3C0HA 4WKQA 4F9YA 5A4QA 3KRRA 4XOYA 2J0IA 3I79A 5EKNA 2R3JA 4QMNA 3TUBA 4PQNA 3HP5A 1YI6A 4L6QA 3L9NA 2UVZA 2OXDA 2QOQA 4QP4A 3ZFMA 4X3FC 2UW0A 3KMUA 3G33A 4MF0A 4XG9A 3ORNA 3I0QA 1W8CA 2FA2A 3MH1A 4DLIA 4DFUA 5IQCA 2VUWA 4U6RA 3FXWA 2CNVA 2YDIA 1YHWA 4FTQA 5CQUA 4FX3A 4IDVA 2PVHA 5EOBA 4AUAA 2BZKB 2UW4A 2WMBA 3ZXTA 1FGIA 4BI2A 3PVGA 3R30A 4TY1A 3GU7A 2I6LA 2RIOA 5BYLA 3Q4CA 3NDMA 4U3YA 2X39A 4JNWA 4MXXA 4F1OA 3PVBA 4AZEA 1OKVA 3C51A 3S1HA 2Z7SA 1UU7A 4D2TA 4GKIA 2ERZE 2WMTA 4O86A 3IW8A 1H28A 5CTPA 3QU0A 1UWHA 2X6EA 1NT2A 2WMQA 2Y7JA 4UMQA 4KAOA 3ZZEA 4G9CA 1H00A 2FSOX 2XKFA 4MNEB 2WHBA 2QOFA 3LFSA 2P33A 4QP3A 2JKMA 3AD4A 3GC9A 2ITWA 3W2QA 4B9DA 4LOQA 2R7IA 2XKDA 5KE0A 2XCHA 1URCA 2GNHA 2OJJA 3SG9A 5CY3A 1JBPE 3PUPA 4I5MA 2QCSA 4QMTA 2YWPA 3CY3A 4F63A 2VTOA 5CSWA 4DAWA 3QHRA 3OXZA 3HGKA 5H8GA 4BL1A 3TNPC 2GNIA 3U8WA 4QMYA 5D7VA 2G9XA 5AV0A 4NFMA 3E8CA 5HHWA 1W0XC 4DN5A 2VO0A 4L52A 4JDIA 3D9VA 2WTJA 5ANEA 4KBKA 3ZLXA 4H3BA 3PJ1A 3T3VA 4GJ2A 2XNGA 1A06A 4FEQA 4FTIA 4G2FA 3LKMA 2BRMA 5HGIA 3TNQB 1Q4LA 4DT8A 4QPAA 2A19B 2X7FA 4JQ8A 4BGHA 5LWMA 1OIRA 2BZIB 3WF5A 3R2BA 4PDSA 3OT8A 3FSKA 4QRCA 5E92A 5A46A 4TL0A 4RIWB 5TR6A 4FGRA 4JX3A 4GU6A 3CPBA 4K2RA 3ZEPA 3BE2A 3SRVA 4EOKA 5BX0A 1A48A 3KB7A 5HBJA 3KRXA 2GS7A 3DTCA 4CT1A 4EH2A 3ATSA 1OITA 2C5NA 3EFWA 4EK8A 4MF1A 4UWCA 4JBVA 4O91A 3NYNA 5AAEA 3TL8A 5C01A 1Y8GA 2C5YA 3GCPA 1OIYA 2BTRA 4J8MA 3EN7A 3LFBA 3E93A 3HV4A 4AGCA 5HLWA 2BALA 3UP7A 2Z02A 2QOKA 5HCZA 4E5BA 1M14A 2BCJA 3OUKA 3G90X 4QMLA 2YIQA 2W1ZA 3Q53A 2PZRA 4GVAA 4EH9A 2HWPA 1Q8WA 3ERKA 3FLYA 2GTNA 3PE2A 4KKEA 4ID7A 4R7IA 1NY3A 3W16A 5B7VA 2BUJA 2PL0A 4ANQA 1U54B 4F70A 4QQCA 3PXRA 2XNOA 3JR1A 1KV1A 4F0FA 4QMZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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