3A61A

Crystal structure of unphosphorylated p70s6k1 (form ii)
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
285
structure length
254
Chain Sequence
RPECFELLRVLGKGGYGKVFQVRKVTGANTGKIFAMKVLKAERNILEEVKHPFIVDLIYAFQTGGKLYLILEYLSGGELFMQLEREGIFMEDTACFYLAEISMALGHLHQKGIIYRDLKPENIMLNHQGHVKLTDFGGTIEYMAPEILMRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGAPPFTGENRKKTIDKILKCKLNLPPYLTQEARDLLKKLLKRNAASRLGAGPGDAGEVQAHPFFRHINWEELLARKVEPPFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of human p70 ribosomal S6 kinase-1 regulation by activation loop phosphorylation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ribosomal protein S6 kinase beta-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 57
structure length 254
sequence length 285
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3a61A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3a61A01
2QOBA 4KUJA 2W1IA 2EB2A 4G5PA 2QOQA 2P55A 2XVDA 1M7NA 3NYOA 2XA4A 3AGMA 1U4DA 5ITAA 3NS9A 1K3AA 4MNFA 4GFOA 4QOXA 2CGWA 4AX8A 4IAIA 4AS0A 2Z60A 4FKQA 1OKZA 3M11A 5IQHA 4HYIA 3OOGA 3PVWA 3QYWA 2VTOA 2B9JA 3GFEA 1FVRA 3GCPA 4DLIA 3U6IA 5JFVA 3MWUA 1BKXA 1M14A 2FSOX 4IWQA 5J87A 3ZHPC 2PZPA 4IH8A 4YBJA 4AP7A 4HVHA 5JT2A 4O84A 2G2IA 4TKSA 4UMPA 2WMXA 3PFQA 4FODA 3RM6A 4FIFA 3K5VA 3L9LA 2P2HA 4F99A 4IM3A 2X8DA 4PUZA 3RM7A 3FZRA 3SG9A 4CFFA 3MIAA 3MV5A 4GFMA 4F64A 4K33A 2UVYA 4I6BA 3VNTA 5KZIA 2VD5A 3GENA 4O27B 1B39A 4A9SA 4WRSA 2V0DA 4D4YA 1ZYCA 4I0SA 4NYEA 4B99A 3QRUA 1KUTA 2UZEA 3ZC5A 3KXMA 4P90A 3V5WA 4XBUA 2QOKA 4CQEA 1FBNA 3QD0A 3QZGA 5EHOA 3NYVA 4Q9SA 3DB6A 3K54A 3KMUA 5GHVA 4NCTA 1KV2A 4IB3A 1H24A 3IDPA 3EQHA 4YO6A 5CU4A 2QOHA 4XBRA 4GT4A 1ERKA 5HG5A 4F1TA 4O7YA 5M09A 3OCTA 3ZZWA 4BR3A 3POOA 3VBVA 4C35A 1H26A 1AGWA 1PMUA 2BHEA 2CKEA 3P23A 4FG7A 2ZB0A 4RFMA 3W8LA 3UQFA 4GG5A 3FQSA 4HPTE 1U46A 3E87A 2Z8CA 4AF3A 4AZEA 2WTKB 2BTSA 4CFNA 5CF6A 4FGBA 4AT3A 4Q2AA 2O8YA 2XIYA 3QGWA 5K0XA 1GJOA 1TQMA 2B1PA 2VTJA 1DAWA 1OI9A 1SZMA 4RMZA 5AV0A 5L6OA 3R9RA 3WOWA 1V1KA 4G34A 3SHEA 5C26A 4L67A 4JBVA 3RI1A 3IGGA 3OOMA 5A4EA 3Q9XA 4FKUA 3ALNA 4I23A 4J99A 4LGDA 3F2NA 5EKNA 4G1WA 2VTLA 4JT3A 1O9UA 2DS1A 3HLLA 3ZLXA 3AXWA 2Y4IB 4IX4A 2XK3A 1H08A 2B9FA 2BDWA 1LP4A 3BHHA 4FNXA 4QYEA 5CQWA 2PMLX 4L6QA 3FKNA 5M44A 2BR1A 5M4CA 3PIXA 3R63A 1BL7A 1FVVA 3D14A 3HV5A 4AAAA 2EXMA 2HENA 2W9ZB 4KWPA 1P5EA 3R83A 4FF8A 4TYIA 1OM1A 3BV2A 4XLVA 3R9DA 2V22A 2F2UA 3PSDA 3FLWA 5A4QA 4BTFA 4L8MA 4BHZA 1U59A 1AQ1A 4GS6A 4HOKA 2B54A 3G6HA 4BCIA 3C5IA 1YVJA 4LUDA 3RAHA 4K0YA 3G90X 5CZIA 4QT1A 4XNEA 3CSVA 3OW3A 5C1QB 3WIKA 4WBBB 4APCA 2C47A 1LEWA 3GU5A 5ETIA 4DBXA 1ZYDA 4TWPA 3CPBA 2NO3A 4D0WA 1W84A 2G2FA 3DAKA 4PQNA 4YJPA 4U45A 5CWZA 3IW6A 4F9CA 2BZJA 4APPA 3VVHA 2PVYA 4C37A 4PMPA 2C3IB 5T6KA 4GUBA 5ETAA 4QP6A 4NFNA 3L9MA 3BEAA 4RSSA 2VX0A 4QMWA 3UZPA 2JC6A 4KA3A 4XOZA 4DFYA 3VUTA 4IW0A 2QHNA 5EHLA 4MEDA 3FY0A 3M42A 3PXQA 1U5RA 3ERKA 2VAGA 5DOSA 4HYHA 5KNJA 3W1FA 1XO2B 4YJUA 5KKRB 2OW3A 5F1ZA 4XEYA 4DINA 3QHWA 3A7HA 3O50A 2IN6A 3MFUA 4ZTQA 5FRIA 4DN5A 2XJ1A 1JPAA 4G3CA 2EUFB 4LI5A 3SVVA 4EZ5A 1Q8ZA 2UW5A 3LQ8A 5G1XA 4B0GA 1DI8A 1PF8A 3FAAA 3Q4UA 3VHKA 3KC3A 3H0ZA 3EFKA 1YXTA 3ODYX 4M0YA 1M2QA 2ZV9A 5CQUA 3UP2A 2OJJA 3BGZA 3COHA 3E92A 2WFYA 4S33A 4G9RA 4HCVA 4M69B 5EDRA 5D7AA 4EOJA 3P08A 4WT6A 3OVVA 3BU6A 2E9NA 2WIPA 1S9JA 3GC7A 4C3FA 1PXNA 3WYYA 3BU5A 4D2VA 3A7FA 3EYHA 2P33A 2GHLA 5DE2A 3RNYA 4DTKA 4HVDA 2OICA 2YAAA 3KB7A 2GNJA 3D5UA 5BUIA 2J50A 2NRYA 3L9NA 4C4HA 3QRJA 1YXUA 4C59A 4I6HA 4KSQA 3CEKA 4D58A 1YDTE 1BI8A 4U0IA 2ITQA 5DT3A 3G5DA 4LYNA 5JQ8A 1LUFA 3A7IA 3MN3A 3A8XA 3F5PA 3FZTA 4FSWA 2PVFA 2R0UA 4CEGA 5T3QA 3WZJA 5E92A 4YUQA 2R3JA 2Z7SA 4LL5A 4XG3A 4HPUE 1YWVA 4HZRA 4PWNA 4ZSJA 2C5XA 3LCKA 2PY3A 3RBWA 4XV3A 3GT8A 5K4IA 3ORNA 2JDSA 3EFJA 3F5GA 3OFMA 4GJ2A 4N6YA 3W2OA 2CNQA 4NL0A 2IPXA 3QRTA 4MAOA 5IH6A 4FA2A 4IBMA 4Z9LA 2BAQA 3CTQA 3UO5A 5AP1A 1UU7A 4LFIA 3LAUA 3QRKA 2RL5A 1EH4A 2C30A 4YMJA 3QTQA 5JGBA 2P2IA 3R0TA 2BZIB 2UVZA 5JZNA 2VTTA 1W98A 1E1VA 4U3ZA 3E8DA 5GJFA 4RQKA 5CSHA 3MPTA 3EQGA 5C4KA 4WD5A 1F0QA 5HD4A 3NGAA 1GIJA 3ODZX 1KWPA 4YR8A 3VQUA 4RIOA 4FV7A 1KE8A 5ANJA 2HOGA 2R0IA 1WBNA 1XWSA 2H8HA 2ZMCA 4RFYA 3UG1A 3WI6A 4C34A 5IQAA 5HVJA 4GKHA 4UEUA 4L00A 4ZTHA 5IA1A 4BCPA 4IANA 5KE0A 4F09A 2HZIA 4GIHA 5AUZA 5T68A 5AR2A 4L3PA 2WD1A 3AC1A 4HVIA 3ZO3A 5CS6A 3FXXA 4NTTA 2UZUE 4LOPA 4P5QA 4W8EA 4G6OA 5L2IA 1REKA 4FKTA 5L2SA 5A4LA 5A4CA 3IW4A 4RIXA 3UTOA 1GIHA 4BZDA 1YI6A 4RT7A 5FGKA 4CFXA 1JOWB 3ULIA 5JH6A 4XX9A 4XV1A 2W9FB 4MD7E 2PVHA 3NRMA 2QKWB 1XH5A 2XS0A 3WF5A 1ZYJA 3QUPA 2CGXA 4ZLYA 2B52A 1Q99A 1KV1A 2YLFA 1JLUE 3FZPA 4AN2A 4BKYA 4M7IA 3ZZEA 4D4SA 2VGPA 1OGUA 4ALUA 4XS2A 5HTCA 1OUKA 2XBJA 4FKJA 2OSCA 4OR5A 4RWIA 4AW5A 4GK2A 4NM0A 4O0VA 3S1HA 3OS3A 3O2MA 3QTIA 3G6GA 3K2LA 4MBJA 4ALWA 2ETMA 4P5ZA 3D5WA 5JRSA 2X6EA 4RLLA 1JSTA 2CN8A 2XCHA 4I92A 3GUBA 5AP3A 3HMIA 3OROA 3QXOA 4TYHA 3N4VA 2CSNA 5LMKA 4DBNA 2EXCX 3H30A 3P79A 2ITOA 2W99B 3D4QA 4TPTA 3MA6A 3BELA 2O63A 4GKIA 3QHRA 3PWYA 3UZTA 4E6AA 4IB1A 3CXWA 3CY2A 1MRVA 4NM3A 3O7LB 3RKBA 1V0PA 3V51A 3TUBA 2R7IA 1XH8A 4OBPA 3C4XA 4EKLA 4TT7A 5K5NA 2UV2A 2VNYA 5CSVA 2ERZE 3BLHA 3HYHA 3KF7A 2OXDA 4EHGA 4CV9A 3F7ZA 3B8QA 3D2IA 1PYXA 3JXWA 3KK9A 2JD5A 3OTUA 3VQHA 3ZUVA 5AEPA 1VR2A 4YSMA 5G6VA 3HUCA 4QMUA 3R1SA 2XM8A 3DJ6A 3MFRA 3PA3A 4ZTLA 3PXKA 3F5XA 2WEVA 5IQBA 5AA9A 4BL1A 4FUXA 2WTVA 3VW6A 5EM6A 3MVLA 3V3VA 2XNOA 4RC2A 4O7NA 1PKGA 3COKA 4A7CA 1KOAA 3FBVA 3FC1X 2H6DA 4CMTA 5EFQA 4EONA 3NNXA 2W5AA 5BYLA 3ZH8A 4BGHA 4FNWA 4DH3A 4FKLA 4XH6A 1H1RA 1J7UA 2PHKA 2J7TA 4EBWA 3EIDA 3S00A 3FL4A 3QKMA 4JBOA 2X9FA 3R00A 4JJRA 5AUXA 3V8SA 3UQGA 4CCUA 4GVJA 4R3PA 4JOAA 4Z55A 3AD5A 4WOVA 2XK9A 4FYNA 2EWAA 2W5HA 4OTWA 1O6KA 5IA5A 1CTPE 3DFAA 2BRMA 3WF9A 4AA0A 1Y91A 3BGPA 4ITIA 4H39A 3E64A 5LXMA 3BYOA 4FIGA 4HVSA 5AAEA 3RALA 1JQHA 4C4GA 2E9PA 4BICA 2OU7A 4R3RA 5E8XA 4KBKA 5GJDA 3R8ZA 3QTZA 3SOCA 3BWFA 4S30A 2IJMA 3VBWA 4NWMA 3TJDA 3MB7A 3EQPA 3NNWA 2PVMA 5GIOE 1YI4A 4O83A 3RP9A 1PXMA 4F1OA 4BI1A 4RJ4A 1G8AA 1PXKA 2ZV8A 4MKCA 3ZSGA 4PL5A 5CEMA 3PE1A 4ORKA 3VC4A 4IAAA 3RK9A 3RGFA 4FEWA 2FA2A 2F4JA 2OJ9A 4GIIA 4MXCA 5E8UA 3UC4A 4BCNA 2E9UA 4OTHA 4IX5A 4QMZA 3PJ2A 5TR6A 4DH7A 5L8LA 5HU3A 3U6HA 4GG7A 3O17A 5AP0A 1GAGA 3CQEA 5AJQA 2JIVA 4FC0A 5D12A 3T3UA 4BYJA 1GY3A 2YWVA 3Q2JA 3DBCA 4RX5A 3SAYA 2X1NA 4NJ3A 5I0BA 4E26A 2PU8A 2XK4A 3D15A 3OCBA 4XRLA 1T46A 2J2IB 4YPDA 1QL6A 2XKEA 4MXYA 5A6OA 2BZHB 4F6WA 2C3JA 2ZMDA 4USFA 2BDFA 5HNIX 4IZAA 3U51A 1UKHA 3TUDA 2YWPA 3KKVA 3TTIA 4C4EA 5LWNA 3ZU7A 1VEBA 3R9NA 2XRUA 5DFPA 2VWVA 3L8PA 3QWKA 3NX8A 1OL1A 2CKPA 4MTAA 1BLXA 4H58A 4NCTC 2OG8A 5HNGA 4KNBA 3TNWA 2BRNA 5IA3A 4IM0A 4AGUA 4RX9A 3HDMA 4O2ZA 3WZEA 3IG7A 4RIWB 3TV6A 3V8WA 3TNHA 3R22A 3R8VA 2P3GX 3EQDA 3VS5A 4BDEA 4G2FA 4W4YA 4OLIA 4FZFB 2XIZA 3D0EA 3EKKA 5J5SA 4XUFA 3H4JA 4BDFA 1FMOE 4RVTA 3L8XA 3NDMA 3CTHA 2BFXA 1R78A 2PMNX 5M4UA 3NUAA 3BHTA 5J5TA 4QP4A 5TF9A 4QO9A 3W2QA 4TYGA 4ASEA 4EK4A 2XNGA 4FIEA 2Y8OA 4E1ZA 2WMTA 3LOKA 2JLDA 4J96A 4NT4A 2C5VA 4J95A 3V5LA 5AV1A 3P7CA 4Z3VA 4DEDA 4O0WA 4QYFA 3I5ZA 3L8VA 3AD6A 2R3MA 4KIKB 2RFDA 4IAKA 4IDVA 4PDSA 4ACMA 4F7SA 5BYYA 2WTWA 4W9WA 2H96A 4Z16A 2WTCA 4C36A 3V6SA 5CSXA 2WOUA 3QD2B 3HKOA 1YXSA 1YDRE 3MSSA 4F08A 4E5WA 4LV5A 5HCXA 4EC8A 4EOQA 4W8DA 5EYCA 3ATSA 2OZAB 5BVNA 5HCZA 3WE8A 3PG1A 2VV9A 4D2WA 5FTGA 4EH7A 2GNIA 5ICPA 4JG6A 3O0GA 2XEYA 4QQCA 2X7GA 2XKCA 5DLSA 1M7QA 5HIEA 4BTKA 4Y72A 3DXNA 5IZFA 3LVPA 5C8MA 3OWLA 1PW2A 4WHZA 2YM5A 1R39A 3LJ0A 3OY3A 5AP7A 3RNIA 2XP2A 2JDTA 5HLWA 2VWZA 1Q5KA 3UG2A 5C03A 4KRCA 4O6EA 4WKQA 4V0GA 4ANQA 2YJSA 1O6LA 3KA0A 5LMAA 2AYPA 3KFAA 4FSUA 4G3GA 4AGWA 2V7OA 3IQ7A 1F5QA 5DWRA 3TKHA 4F65A 2YDIA 5B2LA 4JQEA 2W0JA 3A4OX 3ORTA 4DTBA 1P14A 3CD8A 4JNWA 1U54B 4BKJA 3DXQA 3DNEA 4K6ZA 4FIHA 3C4CA 5AX9A 2PK9A 5EM7A 3RPOA 4CKIA 5IF1A 5HX8A 5JN2A 3SA0A 4RIYA 5IUIA 1ZY4A 3C5UA 3TL8A 5CAPA 2YCSA 3A62A 2DQ7X 1OKYA 5KBQA 3UMWA 2JFMA 1UU8A 4L53A 4PP9A 2GQGA 2YCQA 3HMNA 3D7ZA 1MQBA 4W4XA 2AUHA 2OKRA 2PZ5A 2HIWA 5AV3A 3ROCA 1I44A 1Y57A 5FP5A 5BVOA 3BIZA 5HD7A 4ZAUA 1JBPE 3LQ3A 3VS1A 4E73A 2CGVA 2J5EA 2A27A 4RFZA 4Y8DA 4ANBA 2E9VA 5LVOA 3C4ZA 3VS3A 4WA9A 4FL2A 3P5KA 4FTAA 5J9ZA 3ZO1A 1FINA 4W4VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3HP5 A;  4UMQ A;  4E5B A;  4ZSA A;  4C57 A;  2GNH A;  4DEG A;  4AN3 A;  4FR4 A;  5CAO A;  2XK7 A;  4JRV A;  3UC3 A;  4A4O A;  2OK1 A;  5HIC A;  4XV2 A;  4EUT A;  4C2W A;  1J7I A;  2JKO A;  2WTD A;  1PMV A;  3EH9 A;  4QYH A;  3SGC A;  4EHZ A;  1WFC A;  2VO3 A;  2WO6 A;  4MQ1 A;  4BDC A;  2ACX A;  2PE1 A;  3C9W A;  3PJC A;  4S31 A;  3FHR A;  3D94 A;  4MX9 A;  4X6Q C;  2YER A;  3UNJ A;  1MRU A;  4QMY A;  3BWJ A;  4PNI A;  5AAF A;  3DT1 A;  2Q0N A;  1CKP A;  2GCD A;  3NEW A;  2NRU A;  4J1R A;  4EOI A;  4YSJ A;  2C5Y A;  4A9T A;  4H1M A;  3FLS A;  4ZS4 A;  1NA7 A;  1OKV A;  3JUH A;  5CVF A;  4OTF A;  4ZJJ A;  4NZW B;  2VWB A;  4LRK A;  1KE5 A;  4AFJ A;  4FKP A;  4GT3 A;  4PV0 A;  5KMI A;  4ASD A;  3C13 A;  1QPE A;  1UU3 A;  2BHH A;  3KXX A;  4FII A;  3QLG A;  5LVM A;  3BZ3 A;  4I4E A;  5KX8 A;  3R7O A;  5EOB A;  4FTM A;  2WQO A;  4PDP A;  2GNL A;  2R3Q A;  5HHW A;  2OZO A;  2X7F A;  3DKO A;  3R71 A;  4MXA A;  4CMO A;  1YOL A;  2YM7 A;  3H10 A;  4XG4 A;  3JYA A;  5AFV A;  2ITY A;  3SRV B;  5IH5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QOB A;  4KUJ A;  2W1I A;  2EB2 A;  4G5P A;  2QOQ A;  2P55 A;  2XVD A;  1M7N A;  3NYO A;  2XA4 A;  3AGM A;  1U4D A;  5ITA A;  3NS9 A;  1K3A A;  4MNF A;  4GFO A;  4QOX A;  2CGW A;  4AX8 A;  4IAI A;  4AS0 A;  2Z60 A;  4FKQ A;  1OKZ A;  3M11 A;  5IQH A;  4HYI A;  3OOG A;  3PVW A;  3QYW A;  2VTO A;  2B9J A;  3GFE A;  1FVR A;  3GCP A;  4DLI A;  3U6I A;  5JFV A;  3MWU A;  1BKX A;  1M14 A;  2FSO X;  4IWQ A;  5J87 A;  3ZHP C;  2PZP A;  4IH8 A;  4YBJ A;  4AP7 A;  4HVH A;  5JT2 A;  4O84 A;  2G2I A;  4TKS A;  4DHI B;  4UMP A;  2WMX A;  3PFQ A;  4FOD A;  3RM6 A;  4FIF A;  3K5V A;  3L9L A;  2P2H A;  4F99 A;  4IM3 A;  1ST4 A;  2X8D A;  4PUZ A;  3RM7 A;  3FZR A;  3SG9 A;  4CFF A;  3MIA A;  3MV5 A;  4GFM A;  4F64 A;  3KIO C;  4K33 A;  2UVY A;  4I6B A;  3VNT A;  5KZI A;  2VD5 A;  3GEN A;  4O27 B;  1B39 A;  4A9S A;  4WRS A;  2V0D A;  4D4Y A;  1ZYC A;  4I0S A;  4NYE A;  4B99 A;  3QRU A;  1KUT A;  2UZE A;  3ZC5 A;  3KXM A;  4P90 A;  3V5W A;  4XBU A;  2QOK A;  4CQE A;  1FBN A;  3QD0 A;  3QZG A;  5EHO A;  3NYV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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