3AD5A

Crystal structure of triazolone derivative bound to the kinase domain of human lck, (auto-phosphorylated on tyr394)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
271
structure length
270
Chain Sequence
KPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPSGIKLTINKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNETAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYQLMRLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Ab initio fragment molecular orbital study of ligand binding to leukocyte-specific protein tyrosine (LCK) kinase
rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase LCK
total genus 88
structure length 270
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ad5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ad5A01
5DT3A 5FLFA 4KIKA 3S2PA 2NNWB 4WUNA 2SRCA 5IA4A 3SLSA 2B53A 2IW8A 3C4XA 4TY1A 3GCSA 2HXQA 2O3PA 2VTLA 2Q0NA 2UW3A 3CTHA 4W4VA 1OBGA 5A4EA 4O2ZA 3DXQA 4A9TA 3W55A 3CD8A 5HVYA 2E9VA 5ANIA 3ZO4A 4ACHA 4QQ5A 4RC4A 4FZFB 2FSLX 4BYJA 4ANSA 1YKRA 5J9ZA 4XBUA 3MFRA 2PULA 2VTSA 2WEIA 4FSWA 4NUSA 3VUGA 4E1ZA 2OO8X 5HGIA 1NVQA 4KBKA 3BBWA 3MPMA 2C3JA 2XJ2A 2O65A 2JEDA 3QRTA 4FV6A 5DWRA 2OJ9A 2WXVA 2NPQA 3MWUA 5EDRA 5EHLA 3W10A 2QOKA 1U5QA 3COKA 5LQFA 1BUHA 3MH3A 4M97A 4Y73A 4EH9A 2H8HA 4O7NA 2BCJA 2XNPA 4O7ZA 3QWKA 3KRXA 4AT5A 4O84A 2XB7A 2J0LA 2ZB1A 3WZKA 3DKGA 3C4WA 2VTMA 4TYJA 5CVGA 5CEMA 3UOJA 4I6QA 4QTDA 3F3TA 3I7BA 1JLUE 3HP5A 3V5LA 3D2IA 3HUCA 2F7EE 4I3ZA 1ZZLA 5FWKK 2VO6A 2IWIA 3CIKA 4K9YA 3WE8A 1H1QA 4CFWA 3OG7A 4ZY5A 2R0UA 3I1AA 3Q32A 4M68A 4IW0A 3C4FA 1E9HA 5AIRA 2QLQA 3DA6A 4MAOA 4FSRA 4QMMA 5HHWA 3R22A 3DXNA 4QT1A 4FA2A 2VWIA 4X21A 3L8XA 5HIBA 3LE6A 1NY3A 2ZJWA 3JUHA 3NIZA 4HPTE 3QTIA 4YJQA 2WQMA 4A9SA 4RIXB 4EC8A 4IMYA 3T8OA 4BZNA 5CZHA 3KN5A 5LMKC 1SVHA 5CAPA 1WVXA 5CVFA 4JR3A 4C57A 2VTTA 2VTAA 4E7WA 4LYNA 3FZOA 3GCPA 4CQGA 2RG5A 2VTNA 4QP2A 5DFPA 5JEBA 2WMTA 3Q6WA 2J51A 2OH0E 4DH5A 3EWHA 4YZNA 1H08A 2C5XA 5IQEA 2JDSA 4IVBA 3O8UA 3GU7A 3MB6A 3DCVA 2PVLA 2VX1A 4I0TA 4FTJA 4JBVA 3SAYA 4I94A 3GB2A 3T9IA 3GUBA 4MBIA 5FBOA 5CEKA 3G9LX 3VBQA 3P5KA 3LOKA 2WMWA 4E4LA 4BDEA 2BPMA 3OROA 5CT0A 4D4YA 3GU6A 3S95A 4YLJA 3QHWA 3P9JA 3TTIA 3MFUA 3BGPA 4AP7A 4EC9A 3QRJA 2VTRA 4KS7A 3RVGA 2OLCA 4K8AA 3C1XA 2OG8A 5AP2A 4RA5A 3D83A 5M07A 4FYOA 2J2IB 3DJ6A 4HOKA 2QCSA 5LXMA 3LVPA 1GNGA 2R5TA 3MVJA 3ORXA 3QRUA 4J99A 5AAEA 3NVKI 4RSSA 4IH8A 5D7AA 3VULA 1UWHA 1GIJA 5FRIA 5HO6A 4XYFA 4EOOA 3T3VA 1PHKA 3D4QA 4O27B 3NIEA 4GEOA 4PQNA 5EW9A 3W16A 4DG3E 5IMXA 4YZBA 4IE9A 3NAYA 3AG9A 2QG7A 3UJGA 3HEGA 1YOMA 4XRJA 2BROA 3PVGA 3AGLA 5IH4A 3K2LA 4BN1A 2CKPA 1PMEA 3FKOA 2WTWA 2RGPA 2PU8A 1KOBA 3GP0A 3R7VA 3HV7A 3EN9A 3CBLA 4M69B 3UO4A 4IAYA 2AC5A 1HCKA 1IAJA 2WEVA 4IB1A 1PMNA 2RF9A 1YDSE 4ASXA 4D4VA 4BDAA 4BGHA 3DBEA 3HAVA 3O50A 2VD5A 2CHLA 4RVTA 4FKVA 1P4FA 4IX6A 2YCQA 5JMSA 3NWWA 4FX3A 3SOCA 2R3MA 3V5JA 5LMKA 4FK3A 4JS8A 4ZP5A 3R00A 3GOKA 4FK6A 3E63A 5M08A 3ZLXA 3M42A 4ZXTA 1Y6AA 1Y91A 5IU2A 3EOCA 4X3FC 5IA0A 2QURA 2YM4A 3QRIA 4AN3A 3H9RA 3WF5A 4DCAA 3LCOA 2W0JA 4C58A 2HXLA 2AUHA 3DBCA 1Q41A 1OKZA 4H39A 4QO9A 4O81A 3OOMA 1L3RE 5ANDA 2R7BA 2WQNA 3NGAA 2GNFA 3OZ6A 3PIYA 2JAVA 4NTTA 4BZDA 4EHVA 3HAMA 1OITA 4KWPA 3TN8A 2Z7SA 2VUWA 3BQRA 5HO8A 4MD7E 2BRMA 3K5UA 2YIWA 4GK2A 4LGHA 4G5PA 4OBPA 4M69A 4MQ2A 1F0QA 3W2QA 1IASA 4HW7A 2YM6A 3WILA 5CYIA 3GCVA 3FMDA 3QCQA 3WF8A 4AGWA 3F3WA 3OFMA 4WNOA 4YLLA 3AC5A 3VBYA 1Q8YA 5KMNA 1Q4LA 2XNOA 5I4NA 5ACBC 4GVJA 1SYKA 3KMMA 4RWLA 1W83A 3UIBA 3QTQA 5HG5A 5HD4A 1IG1A 4GKIA 4DFZE 1PF8A 1W8CA 3HX4A 4AT3A 1PMUA 3C4EA 3EB0A 3O8TA 5FG8A 4RVMA 4D1SA 3NUPA 4V05A 4LI5A 4UZDA 5EFQA 3DFAA 4C8BA 4MXZA 5JK3A 2QKRA 2GNGA 4D4RA 4UMUA 3UNZA 5JGBA 4C3PA 2UUEA 5AUVA 1JOWB 1XQZA 3RAHA 2YM5A 4GVAA 2YABA 4H3QA 3IS5A 4JT3A 4O0UA 5FM2A 1DAWA 4EBWA 4ZTLA 3LFQA 3G33A 3TV7A 3W2SA 4M3QA 3ELJA 3ZEWA 4QTEA 5CANA 3DTCA 1Z57A 4W9WA 4D2VA 4X3FB 3RM6A 3O71A 1KSWA 2XKEA 2YAKA 3KQ7A 4U7ZA 3PPKA 1YOJA 1REKA 5H9BA 3AC1A 3ORZA 1STCE 3QA8A 3LFDA 3HKOA 1W0XC 3EH9A 5ANEA 4ENYA 3CP9A 3CQWA 3TV6A 2W1CA 3AGMA 3BHVA 5J1VA 1ZYCA 4XV2A 4FV0A 2JIIA 3GI3A 5CVHA 4DEHA 3QWJA 3RK5A 5LWMA 4C4HA 2R3JA 1PMVA 4DH3A 4DEGA 4IZ5A 4IACA 4FV3A 4EK5A 5HIEA 2W17A 4DFNA 3F3VA 4BIBA 4WNKA 1Y57A 3IQ7A 3F5PA 3O17A 4OAUC 2BKKA 5BVEA 4U80A 2X39A 3PJ3A 4TYGA 5DN3A 2QVSE 3Q3BA 4F6UA 2GSFA 4O91A 5JGAA 4BCKA 4AZWA 4TWOA 4F7SA 2P4IA 2YM3A 3GXLA 2BALA 3GCUA 4N6ZA 5KUPA 1M2PA 4RWIA 3TKIA 5KMMA 3U6HA 4U42A 3FAAA 4FTAA 4I6HA 2QO9A 4EORA 1XBAA 4MYGA 3JY9A 4RJ4A 4X3FA 3C51A 4D55A 5BMSA 3QTWA 1OIQA 2P2HA 2QNJA 2VRXA 1ZOHA 4Z3VA 3R9NA 4CVAA 5KMKA 5KMIA 4A9YA 4ZMFA 4W8DA 1CMKE 4FC0A 3Q2JA 2GS2A 3U8WA 4ACDA 2GNLA 3FMKA 3V8WA 5A9UA 4Y46A 1GIHA 2V5QA 3ENMA 5IQDA 2J5EA 4BI2A 2HENA 4IB0A 3DBDA 4G6NA 5HVJA 1TVOA 4WG3A 2W1HA 4G3CA 4PWNA 4RGJA 4YTHA 1KOAA 2C3KA 2B52A 3SOAA 2XH5A 2YJRA 4PMSA 2A27A 2O0UA 5EHYA 4CV9A 3QGWA 3U87A 5JQ8A 3LQ5A 5HE1A 4G3DA 1OVEA 2VAGA 1WBOA 4RX8A 4Y95A 3UOLA 2FO0A 5GZ8A 3FXWA 5KMJA 3GENA 3QQGA 2GTNA 4Y85A 4DGMA 5IEXA 4UX9A 3V01A 5J7BA 5LVNA 3TDVA 4ALVA 4B9DA 4L3LA 3EQBA 2QU6A 3UG2A 5AAGA 5LOHA 1PRYA 4U3ZA 5LVLA 4ZLYA 3L9LA 1YXVA 4EZ5A 2GHGA 3OF0A 3FQEA 4IVCA 4QPAA 3I7CA 4XCUA 5HU3A 3UQGA 2QOFA 2ZVAA 3ATTA 4UB7A 3PTGA 4FMQA 5D11A 4DF3A 5BNJA 2V62A 2OH4A 2GMXA 3CPBA 3D5UA 3DFCB 4HZSA 3LPBA 3NYOA 3BU5A 4ZY6A 2WQOA 4AU8A 5HCZA 3T3UA 3VRYA 5JRQA 1IEPA 3IDCA 4LRMA 2R3HA 3R73A 4BYIA 3ETAA 4PDYA 4RG0A 3I6UA 4FZAB 4C4FA 1E1VA 1ATPE 2JD5A 3AT2A 4BDKA 1Q5KA 4UXQA 4AFEA 2C0TA 4DEAA 1F5QA 1JNKA 3L8VA 3Q60A 5BVNA 2GU8A 4C3RA 3UBDA 2YM7A 4AZVA 3QL8A 3U6IA 4BY9E 4J96A 3NS9A 5I9ZA 3QQKA 4UWBA 3R2YA 2GDOA 4YJUA 2IPXA 4NM7A 4I5MA 3HA8A 4O1OA 1J1CA 4GMYA 5IF1A 3NVMB 1FVRA 4EHZA 5HBJA 5CF4A 2R3PA 4Z9LA 4A4OA 4DE4A 3I4BA 4ZZMA 4MEDA 3UOHA 5JZJA 3NR9A 2X7OA 1YOLA 3RTPA 3HNGA 5BVOA 4CMOA 2X6EA 4A7CA 5ITAA 4G31A 3TTJA 2VX0A 4WG5A 2ERZE 2VNYA 3OCGA 2G2FA 2X6DA 4DTBA 2XEZA 3DZQA 3Q96A 4OAVB 2GHLA 5CNOA 1PKGA 5EYCA 1P2AA 3L1SA 4GJ3A 4P90A 4TXCA 3EN5A 2UW0A 4AGUA 4EH8A 4MF0A 1JSUA 4C36A 4DEDA 5B2MA 4O7WA 1IA9A 2JGZA 4I0SA 4R3CA 4DH7A 3LMIA 3QLFA 4X2NA 3ACJA 2F7ZE 3AOXA 3ZLYA 4CCUA 1NT2A 2XZSA 5CEIA 4ITHA 2C3IB 3PLSA 4NEUA 4YMJA 3POOA 4F9WA 4TNBA 2AYPA 3WBLA 5M44A 3BYMA 4D1ZA 4LM5A 3PXFA 2WOTA 4XNEA 2IVTA 3KRJA 2QR7A 4RC2A 1TQPA 5HX6A 3A7IA 4EKLA 4ZSGA 4NFMA 1MRVA 3KGAA 2FVDA 2RFNA 2XKFA 3ORLA 5IQBA 3OXIA 2X0GA 4DN5A 4NM0A 3U4UA 3VS4A 3P0MA 4FR4A 4HGEA 5BVKA 4FKIA 5AR8A 1JKTA 4JG6A 3WIKA 3R7IA 1SNUA 4J71A 4CFMA 4S2ZA 5LMAA 4MVFA 2YIRA 5CF6A 2WD1A 3R02A 2WMAA 1WBPA 4AF3A 1BI7A 4FVPA 4K0YA 4JOAA 4XUFA 3R7YA 5AP5A 1ZRZA 4WSQA 2YCRA 5HE0A 3S4QA 5ANJA 1FPUA 2NP8A 3OD6X 4G9CA 2XK7A 4QP1A 3VQHA 2EXEA 3WF6A 4PPBA 3KXGA 5E92A 2PUUA 1R3CA 3JPVA 4ASDA 4FUYA 5E8ZA 4ENXA 4Q9ZA 4FL3A 1H1SA 1JKSA 1PYXA 4G3EA 4AFJA 4FGBA 2XM8A 2ACXA 2VO0A 4X2KA 4IBMA 5A46A 5JFSA 2XVDA 3OHTA 2VTJA 4RQVA 2JDRA 2OBJA 5AP7A 3C0IA 2R3KA 3AD4A 4ANNA 3NMUF 2VWXA 2GNHA 4RMZA 5HOAA 3KRWA 3QRKA 2ETRA 2GPHA 4ANLA 4JBPA 4AW2A 4NCTA 4FKSA 4ERKA 4IFCA 1H07A 3HMPA 3I6WA 3OS3A 2X7FA 4TKSA 4XP3A 4C34A 1BL7A 4JG7A 4BKJA 3VHKA 2VTQA 2PUNA 2ETKA 3UP2A 4EK6A 1KE5A 3QUPA 4MD9E 2FA2A 4K11A 5HIDA 3R7OA 2P33A 2I7QA 5T3QA 3AXWA 1ZMUA 4BCOA 3D0EA 3KB7A 2I0YA 4QMXA 2QOIA 1JAMA 3TWJA 3D9VA 5CX9A 1J7UA 2C4GA 4DFYA 4FIEA 3D7ZA 1FVVA 4JAIA 3PA5A 5BUJA 3GGFA 2YDKA 2UZDA 5AP0A 2A2AA 5ACKA 4R5YA 2C6IA 2YJSA 4QP3A 4TZRA 3E5AA 4XMOA 5IKWA 5C01A 3ZM9A 1RW8A 2BTSA 4CTCA 4KKEA 4HGLA 4NW5A 2WTIA 3DKCA 5TO8A 1YVJA 3U4WA 4U0IA 4E5BA 4IANA 3QF9A 2CN5A 3ODYX 4A06A 3QCYA 3PXYA 3PSCA 3RI1A 4BIEA 3ENHA 4IAFA 1U46A 2YFXA 4FKGA 3SRVB 3OCBA 4PL4A 4RC3A 4I20A 4DEBA 3FPMA 3MDYA 1J3HA 4UV0A 3RAKA 3HL7A 4AW5A 4NJ3A 1AD5A 3ZU7A 4HCTA 2B7AA 4R78A 1WBSA 2BHHA 4MF1A 3EZRA 5LCKA 4FSTA 5IQCA 4IWQA 5FDPA 2PVYA 3NUYA 4GYGA 2BZJA 1A9UA 4BTKA 1YWRA 2XM9A 2Q0BA 3LHJA 4FI1A 2EXMA 4ERWA 5IDPA 3P7BA 4CFXA 3DAKA 3C7QA 3PY1A 3PJCA 4ALWA 4YC8A 4AG8A 4GT5A 4K6ZA 3IOKA 5M06A 3HMNA 4LOQA 1DM2A 4XV1A 4YR8A 2ZV8A 3F2RA 4Q2AA 5EOLA 2PUIA 4TWPA 3C50A 1OUYA 1TQMA 5D12A 4FL1A 4EH5A 2BKZA 3P7CA 5KKRB 3MJ1A 4U81A 3G2FA 2WAJA 2PVRA 3CJFA 4YBJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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