3AT4A

Crystal structure of ck2alpha with pyradine derivertive
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title A detailed thermodynamic profile of cyclopentyl and isopropyl derivatives binding to CK2 kinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 110
structure length 331
sequence length 331
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3at4A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3at4A02
1YXXA 4XG2A 4H1MA 3DBCA 3TV7A 4IZYA 2QG7A 2WQEA 3L1SA 1O6LA 3GI3A 3PXRA 4YJQA 2YA9A 3HP2A 5HHWA 3EFJA 5GIOE 4C57A 3SLSA 1ATPE 4FI1A 1URCA 4G2FA 3PA5A 3NNXA 2R9SA 3VW6A 4DCEA 5KMNA 1FPUA 4L8MA 4U40A 3RJCA 4BYJA 2W1HA 4DLJA 2F7EE 4AOJA 2CKQA 4K6ZA 1Q5KA 3FQHA 3PY3A 4BB4A 2PZ5A 5DPVA 4B9DA 3QYWA 1YI4A 4U97A 3O17A 4CRLA 2C6MA 3FY2A 4YJSA 3SC1A 5M57A 1YHVA 1MP8A 3H3CA 2XCKA 3OT3A 4R7IA 5IPJA 3QD4A 4C7TA 1WVWA 2WMBA 3CJFA 5IQCA 1XO2B 3FPQA 1TQMA 4AF3A 5TE0A 3AG9A 3FLSA 2H96A 3A7FA 4AZVA 4RJ6A 4DEGA 5KMKA 4HVSA 3NMUF 4IAIA 3EQGA 1RDQE 4BI2A 2ITQA 1OM1A 4DLIA 4M67A 4WG5A 1U5RA 2NNWB 4I5HA 3JY9A 4IVCA 4LG4A 2OGVA 2W96B 3EYHA 2JDRA 3GB2A 3OMVA 4KD1A 4M12A 5TOZA 4EKLA 3F3VA 4GG7A 4TWPA 4YJNA 4APCA 3NDMA 4RX8A 1XQZA 3D5UA 3LHJA 3IK3A 5BMSA 5M07A 4I6QA 4XOZA 5HX6A 3V3VA 2Z02A 2IZTA 2OFVA 4D5HA 3AC5A 5HO7A 3FKNA 2R3MA 2QO2A 4GKIA 4G9CA 4JAJA 2O64A 2HY81 4JDJA 3RPSA 4WRSA 4J52A 4HPTE 2OI4X 3L8VA 4C4HA 2ZM1A 3TKHA 2PU8A 2VTSA 3CEKA 4QP2A 2PMNX 4RFMA 5H2UA 1H01A 3VS1A 5LMKC 1ZZLA 1ZAOA 2X2KA 3QX4A 1OBGA 3P23A 4PPAA 4I5CA 4W4WA 4ZK5A 4MF1A 4I0SA 2W5BA 3FPMA 4IFCA 3SRVA 3AQVA 3BELA 3EIDA 5KMIA 3MESA 2QONA 4XCUA 3NZ0A 4XG7A 4R77A 4C2VA 1H25A 3U55A 5C27A 2OSCA 4BWPA 2OJGA 3NYVA 3QD2B 2OLCA 3V51A 5A54A 3MVJA 3NUYA 4D4YA 3E3PA 4KUJA 3CR0A 3F3WA 2B4SB 5HE0A 1YDSE 4JNWA 5AJQA 2ITUA 3HGKA 3BQCA 3F69A 4P7EA 3F7ZA 5DR9A 3NCGA 4ID7A 3KGAA 4W4YA 2WOTA 2X6DA 3M11A 2QNJA 3WF6A 3OROA 4QQ5A 4HGSA 2JBPA 4A4LA 2RFNA 1YDTE 2YISA 3HLLA 4FBXA 2CN5A 4XS2A 5LCJA 5I3RA 2BZIB 5AM6A 3OXTA 1Q8ZA 2EUFB 3A60A 3DQXA 5HLNA 3RVGA 1OITA 2CCIA 3OWLA 1FGKA 4FKPA 2HOGA 4FGBA 2OG8A 3AD5A 4NFMA 3EQBA 4XG8A 3VUDA 1UVRA 2VO6A 3JVSA 3GQIA 5FTOA 3TNHA 1L8TA 1NVSA 3Q96A 4BHNA 3V6RA 2XRUA 4RT7A 3LXLA 4RJ3A 3S3IA 4EQCA 3DKCA 5KO1A 4BYIA 1ZY4A 3EQHA 3FSKA 3EQFA 4AG8A 4L7FA 4E4LA 2OJJA 2W1DA 3DBQA 3JY0A 3C9WA 1TVOA 2XIYA 4BDGA 4IBMA 4OTIA 2J0KA 3CCNA 5D7AA 5HG5A 1YVJA 4P90A 5KMLA 1WVYA 3TWJA 1IA9A 3VUTA 3UOHA 3BHYA 2OIQA 4HGEA 4DBNA 3OXIA 4JRVA 4EH6A 4GCJA 3QRKA 3LAUA 3RCDA 2A0CX 4FYOA 4KIQA 2B52A 3W18A 4BN1A 4DCAA 2VNYA 3NUAA 3IECA 4FSQA 5D9HA 3U8WA 3PXQA 3VUMA 4DTBA 3NNVA 2HZIA 3R2BA 2YHVA 5DR6A 3TG1A 1RE8A 3PG3A 4OGRA 5IQDA 3S4QA 4F7NA 4AOTA 3IONA 2G01A 4ZMEA 2YWPA 5D11A 2WMQA 4AZFA 2QR7A 3I81A 3GUBA 1V0PA 5M51A 3UNJA 3EL7A 4MHAA 5ANIA 4BCPA 4E5BA 2PZRA 3B8RA 4X2KA 1OMWA 3TIZA 3VRZA 4FKOA 4YMJA 1OECA 4QMSA 1W98A 1H1PA 2BIKB 1SZMA 4OW8A 5CXHA 3HX4A 4C3FA 3FMJA 2GS7A 2ZDUA 2XKCA 3CP9A 5LWNA 4QMOA 1NA7A 1FOTA 1OL6A 3DGKA 3FMNA 5AADA 1UKIA 4JI9A 4GJ3A 1ZOEA 4B8LA 3L9PA 5L2SA 3R9OA 2AYPA 3F2NA 4USEA 1ZWSA 2PZPA 3VS6A 3KC3A 3SW7A 2BFXA 2CKOA 2B54A 2FB8A 3QHRA 5FBOA 4PP7A 3D7TB 5DH3A 2GHGA 3GOKA 2CPKE 3HL7A 4LUEA 5DRBA 2P4IA 3RI1A 3I7CA 2XJ1A 3HKOA 1UU9A 3ORMA 1GZOA 4HJOA 4A9SA 4AW2A 4EZ7A 3OCSA 2OIDA 5E8TA 5KZIA 4FIIA 4F9CA 2G2FA 5AUTA 2YEXA 2X6EA 4ZY6A 4WKQA 2BAKA 3HRFA 3KRJA 3PIZA 4FV5A 3PJ8A 4GJ2A 3W2PA 3ZO1A 5J9ZA 1GIHA 3NUNA 2BMCA 2BR1A 3G51A 4OT5A 2XNPA 4BVUA 4O0SA 3HV6A 3SDJA 2J7TA 2XK8A 4FOBA 3SA0A 3H9FA 4FT5A 3MY0A 3KCFA 1XBBA 5IF1A 4M69A 1J7UA 4MXOA 2X9FA 3Q5ZA 4IM0A 4RMZA 3H9OA 4ZAUA 4GIHA 2UW9A 4IEBA 4NTTA 2ITTA 4WT6A 4TYJA 2UW7A 2C5NA 2J50A 3A2CA 3MS9A 4XV9A 4FZ7A 4G3CA 3UZPA 4FT7A 4X2JA 3PLSA 3P08A 3P1AA 3DXQA 2Z7QA 3AGMA 3FZPA 5K4IA 5CU6A 2UZTA 3Q9XA 5CZIA 2HWPA 2I40A 2F7XE 3TACA 2W4JA 4OR5A 1O6KA 3ZFMA 1PKGA 2QCSA 2PY3A 3DXPA 2PVYA 2YDJA 4TPTA 3HMMA 3PSDA 3PWDA 3LJ1A 2PUIA 3MY5A 4MXYA 4Z55A 1Q3DA 4WG3A 3CQEA 5FM3A 2UZOA 4XX9A 4G3DA 4X7QA 4MYGA 3BLQA 4J95A 3VBVA 4IB3A 5C8MA 3ZH8A 2ETRA 2IN6A 2JFLA 4TYHA 4U79A 4EONA 3EOCA 5J9LA 3UPXA 3ZU7A 2XNOA 1WBPA 3MYGA 4M8TA 4F09A 4AW0A 1YKRA 3O0GA 2OJIA 3ITZA 3Q32A 4C4JA 4D4RA 3U9CA 3R02A 4MD9E 4HPUE 1M2QA 4L45A 5HI2A 3LQ5A 4BIBA 5ETCA 4F64A 3W2RA 2OXXA 4UMQA 4AZTA 4AU8A 2WAJA 2QOCA 3F82A 4BDDA 2BVAA 5BVNA 3CD3A 3R73A 2F7ZE 3L8SA 4GUEA 4W4VA 4DH1A 2RFSA 2XIZA 3FKOA 3FL5A 4AE9A 4RX7A 3V04A 3OWPA 4U0IA 4EH8A 5HOAA 3UJGA 3VBQA 4G34A 2ITVA 2KTYA 2JKOA 4DYMA 2R3KA 4FTAA 3BV3A 3DLZA 4KNBA 5EI6A 3KXGA 3EFWA 3G6HA 4GL9A 3IQ7A 1NW1A 2GNJA 3GFWA 4C0TA 4D0XA 1V1KA 2QOIA 2YWVA 3R83A 1WBWA 3PPZA 3DNDA 4DG3E 3IDPA 4FKIA 4H3QA 1J91A 3BBWA 3N9XA 4YJPA 3SXRA 3TZ7A 2YLEA 3FE3A 2VWIA 3FQEA 4FG9A 4HVHA 5EHOA 5KZ0A 4CLJA 3RK5A 5GJFA 3UQGA 1FGIA 3V6SA 2P2IA 4NCTA 4ANLA 4YLJA 4FNWA 4FVPA 5E8ZA 4J1RA 3RPRA 4PDPA 1OKWA 3ZS5A 4ZTSA 4ZTNA 2YDIA 5L6WL 2WKMA 3IDBA 5D41A 1CMKE 2QQ7A 4BDAA 3LXNA 3FYKX 4CT1A 4FTLA 4FV3A 5CAQA 2YIQA 3FC1X 3MY1A 3QRIA 4G5JA 4NKSA 4YGAA 1UU8A 4R5SA 3I4BA 1AD5A 1H1SA 3ZFYA 4QMUA 2R3PA 1G5SA 2YJRA 5C1QB 4C58A 2BDJA 4PL5A 2C3KA 4UX9A 1OL2A 5LOHA 3MWUA 1NT2A 2I0YA 4CFUA 2EVAA 2HW6A 4V0GB 4YJOA 3ZEPA 5GZAA 3TNIA 4L01A 3MH0A 3CLYA 5BVFA 4CVAA 3QXOA 4RWJA 4I0TA 4IJPA 2OKRA 3AMAA 3B2TA 3HDMA 4QMWA 3UGCA 3O50A 4BCMA 3NUPA 5DVRA 3TDVA 2WIPA 4QNYA 2B9FA 2XA4A 5CI6A 3LIJA 4FSRA 2LGCA 3EQCA 2FSTX 3ATSA 1YXSA 2W9ZB 3FLNC 4YZCA 4B8MA 1J3HA 2OH0E 3POOA 4FKWA 3FAAA 1DI8A 3FLZA 3KU2A 4YZMA 2Q0NA 3VUGA 4GYGA 3PXZA 3C4CA 4YSMA 5J95A 4E8AA 3GQLA 4ANNA 4MNEA 1PRYA 4ZSLA 1PXKA 4R5YA 3EWHA 3S00A 3OT8A 4TYEA 2ITWA 2OF4A 5LVMA 2WTKB 2WXVA 4FTTA 2A19B 4JQ7A 4M0YA 1ZARA 4FL2A 1WBVA 1M14A 1R0PA 2YM5A 3F66A 3ORXA 4GIIA 3RK7A 4JS8A 1P14A 2HW7A 3PP1A 3MBLA 4HZRA 1LPUA 3IS5A 3U4UA 2IW6A 4Q5HA 5AA9A 3AT3A 3DFCB 3GU6A 4WNOA 3PSCA 4OTHA 5JFWA 2R3JA 2XNEA 3L8XA 3D15A 4R3RA 3KMMA 5BYZA 2JFMA 5JK3A 4EYMA 3SG9A 1JVPP 4FT0A 2VWXA 3ULIA 2PK9A 5LMBA 3BHTA 1UA2A 3UODA 4EJNA 2WTIA 3UVRA 5EH0A 4QMZA 5T3QA 4EH2A 1KE6A 4FEWA 3UZTA 3FL4A 4YU2A 3DU8A 4X21A 2YDKA 2Z60A 1X8BA 3OY3A 3PSBA 5IH5A 3WZUA 4EI4A 5JGBA 1IEPA 2HXQA 2YZAA 4BKZA 3OTUA 4YJRA 4X3FA 5BUIA 5ANGA 3K2LA 3IG7A 2VTRA 5TR6A 5LVOA 5AR4A 3BPRA 2I0VA 3KCKA 2RIOA 2VTQA 4XOYA 4XBRA 4BGQA 4FZ6A 4FA2A 5CY3A 1YW2A 4QMVA 1KOAA 4BICA 3R8VA 3DK7A 5EM5A 4JX3A 5CQUA 4R1VA 5DI1A 4QQCA 1JNKA 2UW6A 3FZTA 5EQPA 3WYYA 4G31A 2NP8A 3VVHA 3KN5A 4RX5A 2VTPA 4OBQA 5EQYA 2BZJA 4DFUA 3E88A 3LW0A 4C38A 3BE9A 4UXLA 3QUPA 3HVCA 4IM2A 3NUXA 5HESA 1OIUA 3BU6A 4MXZA 5CU2A 5DN3A 3TJDA 2BDFA 3WI6A 1KSWA 4QMTA 4WG4A 5FDXA 4AGWA 4AT5A 5CXZA 4Y72A 3TUCA 2VUWA 5LMAA 5EKNA 3F5UA 1HCLA 4PDSA 4ITHA 1Q3WA 3GU8A 3HMOA 3MPTA 3ORNA 4NCTC 4ACMA 5M06A 2VD5A 5I0BA 4AT3A 3ZM9A 3D9VA 2E9PA 5HLWA 5T6KA 3OW4A 3R00A 4LM5A 3QA8A 2YCSA 4FUXA 1E9HA 5FBNC 4EWHA 4HOKA 2VV9A 3FHRA 5E8SA 1XH4A 3DDQA 4USFA 3N4UA 3HNGA 5BYLA 5CALA 5E4HA 5I9VA 5IEXA 3EKKA 5C4KA 3D5XA 1BL6A 1IA8A 4TWOA 4RGJA 5M44A 2PULA 3KREA 3QX2A 1XR1A 3DZOA 4D1ZA 4HVDA 3MFUA 3PXKA 4DG2E 3QQFA 4GS6A 5IQBA 4EOQA 3TM0A 1TKIA 2PE0A 1IASA 4G6LA 3FC2A 3OUKA 4QPAA 1JKLA 4WO5A 4EK3A 4AQCA 5M09A 2F2CB 3A61A 5EYMA 3V5LA 4WNKA 5IKWA 3RMFA 1JKKA 2PVKA 4I22A 4R6VA 3PA4A 4KB8A 1VYWA 3GGFA 3LQ8A 1YI6A 4R1YA 3U4WA 3OOGA 4YBKA 5E91A 3T9TA 3PVUA 3IW5A 4OTPA 2JAMA 4O6LA 3QZFA 5M53A 1OKZA 1SVGA 1A48A 3O51A 3N51A 2E9UA 3EN7A 3ACJA 4PF4A 3ZSIA 3A7HA 2H6DA 2WTWA 4FTMA 5JRSA 4DF3A 3MPAA 4PMSA 4OBOA 4DT8A 2UZNA 4MBJA 3ALOA 1VEBA 3M1SA 3R2YA 3C5UA 5B2MA 3F88A 3PVGA 5AP7A 4KSPA 2VX3A 2JIVA 2W17A 2CDZA 4U41A 1P2AA 1PXOA 3IW7A 4IZ7A 4DC2A 4IADA 3R8UA 4PL4A 3DQWA 5E1SA 3ZSGA 5JGAA 2UW5A 1UWHA 4RJ4A 1YHWA 4AGCA 4LGHA 1YXUA 4GT5A 3U87A 2O2UA 4M97A 4O1PA 5IQAA 3QQGA 3QQKA 1XH5A 4B4LA 3R9NA 4UB7A 2CNQA 3FMKA 3DK6A 4YTHA 3OD6X 2BRGA 3SXFA 3TDWA 3CXWA 5A46A 2J90A 5EOLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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