3AXWA

Crystal structure of human ck2alpha complexed with a potent inhibitor
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Structure-Based Design of Novel Potent Protein Kinase CK2 (CK2) Inhibitors with Phenyl-azole Scaffolds
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 106
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3axwA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3axwA02
4G6LA 4KS8A 4Z9LA 4R1VA 3BYMA 2VO3A 2W1HA 3HUBA 3PJ8A 5EYCA 3VRZA 5AX9A 1Q8YA 1XBAA 2C6IA 4QMQA 1J7IA 1YVJA 3RK7A 5CLPA 4K6ZA 2R0UA 4X3FB 4FV0A 3GU8A 4ZTRA 3FLQA 3W2OA 1QPCA 1I09A 4DTBA 2B55A 5IUHA 5L6PA 3VAPA 2NO3A 4AX8A 4BCGA 3HRBA 3CSVA 2VWXA 1L8TA 5KMKA 3LJ1A 3UZRA 2JITA 3O0GA 4RA4A 3E87A 3KXZA 4FK6A 5D12A 3W2CA 3FI3A 3G6HA 3PY1A 4LUEA 5LARA 1TQIA 2WMSA 3C50A 4D4RA 3BLQA 2W1ZA 2B53A 3R2BA 3ORNA 3SX9A 3GU7A 4ID7A 4JAIA 2X2LA 4G5JA 4XG2A 3AC8A 4KAOA 4QTDA 3V5JA 2X8DA 2UV2A 3BEGA 2GPHA 3W16A 4LFIA 3WF9A 4ZMEA 4XRLA 5L2TA 3EFLA 2CLXA 4YZMA 4BDAA 3VC4A 5HGIA 5L2QA 4YUQA 3KKVA 4RMZA 4M69A 2HOGA 4J53A 4CV9A 5E1SA 4DEBA 4EH8A 1ZOHA 2YDJA 2YHVA 3VHKA 3DXPA 5C8KA 4KIOA 1Y57A 2XJ1A 3K54A 4IZAA 2PVJA 4ACCA 3G51A 2YEXA 3Q60A 5AUXA 3TWJA 2W1FA 4ENYA 2Q0BA 2C6EA 5JRQA 4R78A 3R02A 4FK3A 4JG7A 4WRGA 3CKWA 5LCKA 2FA2A 2PL0A 2ZJWA 1DI9A 3CTQA 3H30A 3HMIA 4PPAA 4FKVA 4FZ7A 2OW3A 5EM8A 1Q8UA 4IBMA 4RJ8A 3R9DA 4H36A 4GG7A 5HE2A 2YM3A 4WBBB 4CSVA 5JGDA 2UW6A 2V7OA 2EXEA 2YIYA 3R8ZA 4DF3A 3KU2A 3Q6WA 5EOLA 3BU3A 4QQJA 3EH9A 2GNGA 3LCTA 4FZAB 1U59A 4NTTA 2W1DA 2UZNA 5GZ9A 3A7GA 4WUAA 1NT2A 4DFUA 2PMLX 3O17A 3U54A 4CXAA 2W06A 1KOBA 5CXHA 2XA4A 3D83A 1WBPA 4CYIA 5KMNA 4BDCA 2IZSA 4IAIA 2PYWA 3DCVA 3SG9A 1H8FA 2WZJA 4NH1A 1TQPA 3JR1A 2B4SB 4LI5A 2X7GA 2XK8A 4G5PA 2I1MA 5CS6A 1ZZ2A 4ACHA 2WEVA 2C5OA 3L8VA 4O0YA 1OUYA 4A4XA 4Y8DA 3ACKA 3FAAA 5CI7A 3EYHA 2XP2A 4I4FA 2RFNA 4FNYA 4W4XA 5DMZA 2P33A 4AT4A 4C7TA 2BROA 5BQ0A 5A14A 3DB6A 1XO2B 2W1CA 1RE8A 4D1XA 1Q99A 2ONLC 2WKMA 5T68A 3ZDUA 3ZMMA 2GDOA 4TYGA 2A4LA 2LGCA 5M55A 3LFNA 4X2FA 4OT6A 4FMQA 3BU5A 1XH7A 3EB0A 2C47A 5J8IA 3S95A 1UV5A 3TTIA 3UMXA 4ANMA 4YTFA 3RP9A 2SRCA 5E8VA 5H2UA 5CU2A 5K5NA 4PTEA 3D15A 4BGQA 4GEOA 4WSQA 2XNBA 4ANSA 3I7BA 4H05A 3MTFA 1KV2A 3FL5A 3V8SA 1YOMA 4D58A 1FVTA 2QKWB 4EKKA 5CVHA 4FVQA 4D1ZA 5DNRA 4LGGA 5HORA 4CKIA 5FD2A 4FV2A 1OBDA 5AR7A 3MBLA 1R0EA 2R3LA 4G3FA 5HO6A 1UWJA 3DS6A 4R5YA 1PW2A 2C3KA 5BYYA 5E8SA 2QU6A 4Z7GA 4AN9A 5ETFA 1YDTE 1PJKA 4FF8A 3A2CA 4N0SA 3A61A 3EQFA 4LMNA 1ZYJA 1NY3A 5AV4A 4QPSA 3I5ZA 3OCGA 4E1ZA 1YXSA 2RL5A 3F5UA 3OF0A 3R1SA 5HLPA 3G6GA 5L4QA 2JDVA 5HIDA 5HD4A 2VTIA 3BHYA 3GU6A 3ALOA 3NW6A 3OWPA 4XNEA 3V5WA 1ZOEA 2BILB 1J7UA 4AFJA 5AFVA 2GHLA 3MFUA 4AP7A 3QALE 4PX6A 3RPSA 2WTIA 3ULIA 1SZMA 5EDQA 5JGAA 2C3JA 5AR8A 1CMKE 5B2MA 2ERZE 3T3UA 3NIZA 2QO2A 3WF6A 4EORA 4EZ7A 3TJDA 3E7VA 2BZIB 4UY9A 3HECA 3NPCA 4GMYA 5CU3A 3KXMA 2JFLA 4DAWA 4EJNA 4NM5A 4RVKA 3RPRA 3HMPA 3R9HA 1NW1A 2C30A 4O6EA 5KO1A 3PPZA 2J6MA 4QMWA 3O51A 5CAUA 1M7NA 3FZOA 4PDYA 4DGGA 3TM0A 3BGPA 4BZDA 3GOPA 2PUPA 5J7BA 3PY3A 5F20A 4FUYA 5C03A 4ZJIA 5CEMA 2QOQA 4YBKA 3SXFA 3R73A 4D2SA 3VS1A 3RM6A 5I3OA 1W0XC 5L2IA 5IQGA 4EK5A 5HG9A 4BIEA 4F70A 2UW4A 3FKLA 2BRHA 3QKLA 4BICA 3B8QA 3H3CA 5IA0A 5J79A 2X7OA 2PVHA 3UOLA 2WIPA 5CU4A 4QP7A 3R63A 4FUXA 5AEPA 3W2QA 4FSMA 3LOKA 4HGLA 4USDA 3SW7A 4FOBA 1TKIA 4U43A 3HV3A 5CSVA 4JDHA 3T8OA 2XNMA 1YI3A 2I0HA 4IEBA 3VN9A 3W32A 2RFEA 4RVMA 4TYEA 4YJSA 5F94A 1H08A 4YC6A 3ZXZA 4QMXA 4AZTA 5HBHA 1Q4LA 2Z7RA 5LOHA 3B2TA 4C4EA 4FL2A 3UG2A 5A6NA 3AC4A 4AW5A 4QP2A 3WI6A 4DC2A 1UA2A 5FDPA 4YPSA 3GT8A 2W9ZB 3R04A 4RPVA 2OZAA 4F1OA 3OXTA 2VNYA 2YM6A 2DQ7X 3WILA 5IDPA 3V5PA 3U6IA 2XYUA 2XIRA 3F5GA 3QTZA 3Q5ZA 4BHNA 4N4SA 5A4QA 5A3XA 2ZB0A 1YW2A 2WMQA 4HVDA 3LXLA 4ZAUA 2WQEA 5JK3A 1MUOA 5B7VA 3FMHA 2XCHA 2UVXA 3BPRA 5AR3A 4TWPA 4FZ6A 2BIYA 2I7QA 4F4PA 2C0TA 5HOAA 2BAJA 2JEDA 1V0BA 2C5VA 4XH6A 1OL5A 2P2HA 3NCZA 2Y0AA 3FSKA 5LJJA 1PKGA 1DM2A 1YOLA 3DKOA 4D0XA 4A9TA 3KMUA 5LVPA 2WD1A 4OTGA 2ZV7A 1QMZA 2IWIA 4GT5A 4M84A 5HE3A 4E6AA 3C0IA 5K5XA 3KRXA 2ACXA 3VS2A 3BZ3A 5HO7A 4TWCA 5BVNA 3PXZA 4M66A 3F3VA 4FSRA 1Q3DA 3JS2A 2XKFA 4X6RA 5HBJA 2C6MA 4OTFA 3W2PA 4E5AX 4LV8A 4XYFA 3Q9YA 4PUZA 4MYGA 3GU4A 3COMA 3PY0A 2BHHA 2YZAA 3ZM4A 2JKMA 3G9LX 2XNGA 3AC5A 1BX6A 3EQIA 3ORIA 5M07A 2YITA 4NIFA 1H0WA 3KCKA 3IKAA 4JIKA 5GJDA 1KOAA 2W96B 1B6CB 1JNKA 4P4CA 3B8RA 2C5YA 4YJUA 4ARKA 4I6QA 5IA2A 4YU2A 1RDQE 4J7BA 5DVRA 3WZKA 2OK1A 2WMAA 1ZOGA 4U42A 4IW0A 3TV4A 1E1XA 4M69B 2FVDA 4QT1A 4H3PA 3TNWA 2QR8A 3UC4A 4CV8A 2CGXA 2F4JA 3HDMA 4JT3A 1OKYA 2QOLA 2VTTA 2VWBA 2J0IA 3KXNA 3VO3A 3F88A 4ERWA 4K33A 5B2KA 4C58A 4NFNA 3TIZA 2ITZA 3MFTA 3O96A 2C5XA 5DE2A 3I6UA 1M2QA 3L9LA 4EOSA 2V0DA 2IN6A 4FG8A 2WU6A 2YCSA 4GJ3A 2YDIA 1W98A 4NT4A 4FKJA 2G2IA 4RLLA 4AZWA 5I9WA 3D5UA 3EN9A 4OAVB 3O7LD 3BYUA 3VVHA 4YZCA 3ZRLA 5L2WA 5IZFA 3AOXA 4O7SA 4KSPA 2EUFB 4Z16A 1R78A 2OJJA 3FZ1A 3TZ8A 1PXIA 4AG8A 2FH9A 4AA5A 3TL8A 5KZ0A 1Q97A 5EDRA 5KMOA 3FSFA 2CKPA 1GIJA 2R3IA 5M57A 5BYLA 1Y8YA 2ETRA 4Y46A 4J52A 1GJOA 3EFJA 2GNJA 4YHJA 4L7SA 4YNOA 4BI0A 5K0KA 4LM5A 4OLIA 3NR9A 3ZO4A 5AP3A 2J7TA 3HUCA 2GHMA 3ORKA 3SDJA 2CNVA 4QTEA 3VUHA 5EHLA 4EOPA 5ANEA 3NNVA 2QONA 2VGOA 4IB1A 5CEOA 4ZLZA 3BIZA 2GQSA 4F0FA 3KN5A 4KBCA 3VBYA 3D2KA 2QR7A 4JRVA 5K4JA 3DLZA 2OICA 4FNWA 2F2UA 4IWPA 1P14A 3C0HA 3PFQA 3KVXA 1FMKA 1SMHA 4I6HA 1OKZA 4LL0A 5AWMA 4O0RA 1ZRZA 2IG7A 1U5RA 1PMUA 4CZTA 4QYEA 2YACA 3GCSA 1R39A 2ZV2A 5IQEA 1BLXA 4TKSA 3G0FA 1V0OA 3P1AA 4TYHA 4AFEA 3A4OX 3MSSA 4IB0A 2Z60A 3KB7A 3E3PA 3KVWA 3MB6A 2QNJA 2C4GA 4EOLA 4FVPA 2JD5A 4RSSA 3F66A 1OPKA 2VTHA 4ASDA 4C62A 2VTJA 3IG7A 1YDRE 2IVVA 3RI1A 3IDBA 4PNKA 2WTJA 4I20A 4PDPA 4MQ2A 4ZOGA 3CEKA 2VX1A 2IZRA 4WSYA 4A06A 4C2VA 5LVOA 2W4JA 4AU8A 3GC8A 3LJ0A 5E90A 5HU9A 5DOSA 2R9SA 3BV2A 3IW8A 4I0TA 5J9LA 3UGCA 2GSFA 4LOQA 3VHEA 4RX5A 4IAAA 2H96A 2R5TA 5HLNA 3NAYA 4EWHA 3MWUA 3A8XA 3EL7A 4FVRA 4GFGA 3PE1A 4IM3A 4JXFA 1XKKA 3CY2A 3D0EA 2F9GA 4GU6A 4PPCA 2R3NA 3NIEA 3AT2A 4BWXA 4FKWA 3NZ0A 1BI8A 4XLVA 2BR1A 4ZJJA 2W5AA 2O64A 5I3RA 5JZNA 3D9VA 5K3YA 3MW1A 3HP5A 2UVYA 3QCYA 2R3JA 1YQJA 5T6KA 3MY1A 4CRLA 3G9NA 3DOGA 4FTTA 3I6WA 1BUHA 1YXUA 3RNIA 2C6OA 4X3JA 4IB5A 2R3GA 4IX6A 3ZZWA 5KMJA 3EN6A 3QC9A 5I9VA 1SYKA 4XV3A 3EQRA 3OXZA 3UE4A 5LXMA 3PXRA 4MAOA 2WTCA 4QQTA 3QAME 4IADA 2JDRA 4IDVA 2BRMA 4IZ7A 1H00A 4E20A 2XYNA 4FTKA 3KGAA 3TV6A 4OAUC 2WFYA 2QURA 2GS7A 3FC2A 4YZNA 5CQWA 3BYVA 4X2KA 3W33A 4AXAA 4OUCA 3DU8A 4GJ2A 1KWPA 3ANRA 2ONLA 4G9CA 4XP0A 4O6LA 5EM5A 5BVEA 4GL9A 5EOBA 5EQPA 2J0JA 3DXNA 5BVDA 4IH8A 4NK9A 3LFSA 5EYMA 3UPXA 2PVFA 2X4ZA 4CKRA 3K3JA 2W1EA 3DK3A 4YZ9A 3EZVA 4M14A 2BZKB 5K0XA 4JBQA 4OGRA 1YDSE 4X2GA 3NNXA 1IASA 5AUUA 4G3GA 2VO6A 3BHTA 2PVKA 2XIKA 2ZOQA 3F3ZA 5DG5A 5AUZA 2BFXA 3BE2A 4P7EA 1IG1A 3TKIA 4C4FA 5IQFA 2RSVA 1WVWA 3PJ1A 4IACA 4YP8A 3I0QA 2X39A 2QOOA 4X21A 5L2SA 2XEZA 5AP0A 4DT8A 5KMLA 1OL1A 3OD6X 4FTIA 5AR2A 2FO0A 3O23A 5DEWA 3Q5IA 2ITYA 4L67A 2OZAB 3FPQA 4P5QA 3RM7A 5EI8A 5IA5A 3ZC5A 2UZOA 3FL4A 5CEQA 4WG5A 4O82A 3QXOA 4JNWA 2XKEA 5CEIA 4MKCA 4EK3A 3QU0A 2A27A 2XRWA 3UYSA 2VTAA 5KBQA 1QPEA 4ZY6A 3LXKA 3BE9A 3EN7A 3QRJA 3MB7A 3PXKA 4J98A 4QOXA 3DFAA 4W9XA 2BDJA 5HNGA 5JFVA 1MQBA 4FYOA 4G31A 5DR6A 4EOJA 3BEAA 5FXQA 3H10A 3QD0A 5JFXA 5HZNA 4DINA 2W17A 3DBDA 2O2UA 3GOKA 4FTQA 3H9RA 1H01A 5FTQA 2ZM3A 3NCGA 4DTKA 2CGUA 1OUKA 3R6XA 2W1IA 4JQ8A 2VAGA 2QQ7A 3PPKA 4TTHB 3CBLA 5FRIA 4G1WA 1H26A 2J4ZA 4U6RA 3ZUVA 1UNHA 3GFWA 5D11A 2BMCA 1QPDA 2OJ9A 2R3OA 2RFDA 4ALVA 4ZZNA 4EBVA 3ORLA 4FTUA 3C51A 3CQUA 5CAVA 2PVRA 3HV6A 4F1MA 2Z02A 1KSWA 3PUPA 3UOKA 4G34A 2RG6A 2XMYA 4TRLA 3DKGA 5ANGA 4H3QA 2OU7A 2WMUA 4QMLA 4NFMA 5M44A 3TI1A 5IQDA 3UQCA 3C13A 4MH7A 5FM2A 4KIQA 2VD5A 5CU6A 2WB8A 4I5HA 3QQHA 3MGYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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