3BHHA

Crystal structure of human calcium/calmodulin-dependent protein kinase iib isoform 1 (camk2b)
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
293
structure length
289
Chain Sequence
SMTDEYQLYEDIGSVVRRCVKLCTGHEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHSNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKCKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKEAYGKPVDIWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHKLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKNLINQMLTINPAKRITAHEALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLKKFNARRKLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Human Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase IIB Isoform 1 (CAMK2B).
rcsb
molecule keywords Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II beta cha
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 289
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2007-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3bhhA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3bhhA01
2F7ZE 2OFUA 3WF5A 2PMNX 3JVRA 5DIAA 4AXAA 5TE0A 5LWNA 5JZNA 3BZ3A 4Q9ZA 1SNXA 4S34A 3R0TA 4FEVA 2X8DA 2B4SB 2OH4A 1FMOE 3BEAA 2KTYA 2QOKA 1DI8A 2X7FA 3NUYA 4BDHA 4IC8A 2G2IA 4WKQA 4J95A 4EH4A 4CG8A 2YAAA 3LMGA 4IAIA 4DFZE 2I0HA 3MH3A 3W32A 1MP8A 2R3KA 4WG5A 2CCHA 3EN6A 4C4IA 2QLUA 2XKDA 4F0IA 3EHAA 5JQ8A 2Q0BA 5ETAA 3BHHA 3IW5A 3MIAA 4B8MA 4II5A 3FKNA 4RVLA 4CFWA 4K2RA 3WILA 3GOKA 4BZDA 4EK8A 4F0FA 4PP7A 2QHMA 3HDMA 4FV4A 4I22A 3OG7A 2VWBA 3D5VA 5AP1A 4A9RA 2H96A 4FNZA 5LCKA 4BCJA 4Z7HA 2O2UA 3ODZX 4NJ3A 2J2IB 1PMUA 2HWOA 3PJ3A 3ZU7A 1MUOA 3KU2A 4CEGA 3OXIA 4O7NA 4RJ6A 4JBOA 3IW4A 2W1ZA 3SQQA 4Y85A 3MVMA 2YFXA 1XHAA 2HCKA 4GUEA 4QTBA 3TJCA 1IR3A 4YHJA 1RJBA 3UP2A 4I6BA 2GS2A 3HEGA 3QUPA 2BRNA 4TYGA 3QTRA 3TZ7A 4BDIA 4ERWA 4BCIA 4FMQA 3DJ7A 3R7UA 4FEWA 3VRYA 4FV8A 5A4TA 4RZVA 3AD4A 3LFCA 1Q8ZA 4CFNA 2X8IA 3VW8A 3CIKA 2W7XA 4YTIA 2R3RA 3N4UA 3UIUA 1UU3A 3PDTA 5FTGA 2VO0A 3R71A 2VD5A 4YZ9A 4RIOA 2BRMA 3EN9A 4YZMA 5DN3A 3U9NA 4D1SA 4OW8A 5TOZA 3SXFA 3OBGA 4KWPA 5DVRA 5CVGA 5GJDA 3BQCA 4X7QA 1XJDA 2GPHA 4LYNA 3A4PA 4YNEA 4KIKA 3VS0A 3VUKA 3GU6A 3L8PA 3QC9A 4IBMA 4H36A 2J6MA 5J7HA 2WMRA 2YN8A 3C4WA 1JPAA 5AUTA 2C6LA 4ZTLA 1OZ1A 2WB8A 4L42A 2XNNA 2VTAA 2R3LA 4USEA 4LGHA 3GNIB 3E7OA 4CXAA 3WE8A 2W1HA 4YJUA 4AE6A 3VJOA 2O63A 1JWHA 1VYWA 2WU7A 5DRDA 3DXQA 4OBPA 3R9RA 1OL2A 1M2QA 3OBJA 4TYJA 5M53A 1PXOA 2QOQA 2JGZA 3UPZA 3D83A 1UKHA 3EKKA 5L6OA 3OWJA 4UY9A 4LI5A 5CALA 3QTIA 2W05A 5HO8A 2PULA 3CQUA 4TYHB 3I4BA 1PMVA 2WOUA 1ZOHA 4NZWB 3R7YA 3DFCB 3R1QA 2C68A 1BI8A 3OTVA 4BGGA 2W5HA 4IZAA 3BYSA 5EK7A 2OBJA 3PIYA 5LMKA 4BHZA 5HE2A 4XG3A 3FQSA 1Q4LA 4O82A 1OKYA 3AQVA 4DEEA 2OU7A 2YIYA 3E3PA 3NNVA 4ZTQA 2QOIA 5T3QA 3DZOA 3FMMA 2W1EA 4N6ZA 4MYGA 3HMOA 1OECA 3FSKA 3O51A 4ZTHA 2PU8A 5AX9A 2YWPA 5DE2A 4F09A 4QMZA 2WTKB 4R5SA 4OTFA 3NRMA 5IQHA 5HCZA 3QHRA 4EH6A 4IXPA 4AZWA 2PE0A 1Q97A 3POOA 4NWMA 4IB0A 3U6IA 3MFUA 4BKYA 4G9RA 1O9UA 2WMXA 3PP0A 4H3QA 2LAVA 1UKIA 4RA5A 5IA2A 3CEKA 4MXCA 4F7JA 1BMKA 1VR2A 2W4JA 3GCVA 3MGYA 4LV8A 3M2WA 4MVFA 3RVGA 4UZHA 5A14A 3DDQA 4BCOA 5IEYA 3OW3A 3Q4ZA 5D7VA 1LR4A 3LHJA 3KGAA 1PJKA 1WAKA 4H58A 4HZRA 3RMFA 3SVVA 2C47A 2ZMCA 5HCYA 1UWHA 2PHKA 4F9AA 3V6SA 5L8KA 3G0EA 3FY0A 4JDKA 3FHRA 2HENA 2HW7A 2QOLA 2V7OA 1PXIA 3A7JA 3QTUA 4E1ZA 5D12A 2BPMA 2GQSA 3NYOA 3FHIA 4ZZMA 2A1AB 2F2CB 5EI2A 1QMZA 1AQ1A 1YHSA 2WMQA 4YJVA 2BROA 3QWJA 4FTCA 4RVKA 4UBAA 3VUMA 5L6PA 3E87A 5JRSA 1O6LA 2YCFA 2Z7SA 3MPMA 3NNXA 2UVYA 4MWHA 4C57A 4WIHA 2BALA 5FTOA 4PDYA 4DBXA 1JBPE 1ZZ2A 2QNJA 4FIJA 4P90A 3POZA 4YPDA 4AZSA 1BKXA 4DG0E 4DINA 1TQPA 3DV3A 2OXXA 3QKMA 4YSJA 1V0PA 5EM5A 2G15A 3V5PA 4JBQA 4YO6A 3FMHA 2Y8OA 3GGFA 4X2KA 4BDKA 5I3RA 3C1XA 4WD5A 4EOMA 1CM8A 2ZB1A 5I9UA 1OVEA 1WMKA 2YITA 5CXHA 4EZ5A 4RX8A 3DBCA 4RIXA 4C3FA 5BVFA 3P1AA 2HY81 4E6DA 1IA9A 4JDJA 4W4YA 5E9EA 4HOKA 3R1SA 3U87A 5FUTA 3R21A 4FKJA 3KQ7A 3HUCA 2W5BA 3UO4A 1UWJA 4RJ5A 3P08A 3P4KA 3ZFYA 3R8UA 5K0KA 4H1JA 5JFSA 3VS6A 4GIIA 4F4PA 2FUMA 3LCDA 4EHVA 4DG3E 3BX5A 3GFWA 3DQWA 3W2OA 4DTBA 4D4SA 4FTNA 3ZZWA 3EQRA 3E8CA 5G1XA 3ZO4A 1U5QA 2WTVA 4IQ6A 1YI3A 3RJCA 4XYFA 3E88A 2YM5A 5DR9A 2XP2A 4FG8A 2PUPA 5FM2A 4IB5A 4RIYA 4O86A 5BUIA 1OIUA 5I9XA 4TWOA 4PL5A 2W4OA 5IA1A 2UW8A 5E8UA 2PMLX 3BE9A 3BELA 3BRBA 4FSZA 2P2HA 4FL3A 4ZSGA 3VBVA 3VNTA 4IE9A 1H01A 4WO5A 5KMKA 1FGIA 4N6YA 2W1IA 1CSNA 4OR5A 4YO4A 3FLYA 3G5DA 5A6OA 3C4ZA 4QMSA 5BYZA 3ZFXA 5KMIA 3LE6A 1IASA 2JDTA 2XYUA 4O22A 4YPSA 4G31A 5C4KA 4O1OA 3O2MA 4FOBA 2G01A 2X6EA 3ZLYA 2BDFA 4KBAA 4DGMA 3GB2A 4F99A 4FKRA 2ZB0A 4J1RA 5EFQA 3PXYA 5EM7A 5EHLA 4LMUA 1YVJA 2CGWA 3ORKA 2YABA 1YW2A 4RLKA 2WTKC 3NEWA 3BV3A 4BCGA 5CAOA 2HIWA 4BTKA 4Q2AA 3LLTA 3MVHA 3TKHA 5IQCA 3B8RA 4LUDA 5LQFA 1R0EA 4EYJA 4CFUA 1U46A 3KRRA 3ODYX 2NRYA 3MS9A 1FPUA 4H05A 2HZNA 3VBQA 5CNNA 3C50A 4G6NA 4O21A 4O96A 2V0DA 4JR7A 2QCSA 4OGRA 4P2KA 3WYXA 4RJ8A 1K2PA 1ZARA 2BMCA 5E8SA 4QYEA 4RFZA 4GT5A 1Q99A 4DN5A 3OVVA 5CENA 2ZM1A 3FWQA 1SZMA 1V1KA 4X2FA 4AN2A 2X6DA 4WRGA 1U59A 4CT1A 3FZSA 4GG7A 2ITZA 4D0WA 5CF8A 4CGAA 3JS2A 4FKUA 4KUJA 3OHTA 5H9BA 3V8WA 3AC8A 4XG6A 3UVPA 4DAWA 4IZ7A 2WEVA 4X0MA 4DEDA 4D2WA 4BCNA 1RW8A 2XNPA 3CGFA 4FSNA 2WGJA 4G3DA 4FTMA 2Y4IC 3PXFA 1ERKA 4NUSA 4TRLA 2X7OA 3DY7A 1GIJA 2BKZA 3FZTA 4WNOA 4X2GA 3PPZA 3QX4A 4DFNA 2JIUA 2OO8X 2YJSA 1SYKA 2VTNA 4JQ8A 4DGNA 2VWXA 4G5JA 1B39A 3MA6A 3CQEA 1Q41A 3BU3A 5CTPA 3RCJA 4AZTA 5AP6A 3QAME 2J0KA 2PMOX 4JJRA 3FJQE 2VRXA 1XBAA 4DT9A 3REPA 2BAKA 4FYNA 5H8BA 4DFUA 3K5UA 2EXEA 2I6LA 3GOPA 3QA0A 3QYZA 4FR4A 3RNIA 1YRPA 5IH4A 1A48A 4CD0A 4RJ7A 1PXMA 2ETRA 3VQUA 3D5WA 4A9UA 1PYEA 3C7QA 1M52A 4K1BA 4AW5A 3QU0A 2UW5A 4JXFA 3SG8A 3K3JA 3NCGA 2BVAA 2JAMA 3KXGA 2GNIA 3ORTA 5ANEA 5M55A 4IW0A 2GCDA 5AP5A 5ACKA 3SRVB 4GG5A 4U6RA 4X3FC 4M97A 3EQCA 1GZOA 5EHOA 5DBXA 5KZ0A 4BRXA 2XKEA 3EB0A 4C58A 2B0QA 3FMKA 4EC8A 5AUZA 5KX8A 4ZJVA 3T9TA 5CSVA 5CASA 2B53A 4RWIA 4AOIA 1RE8A 4ZY4A 5FD2A 3ZC6A 3H9RA 4FTTA 2FYSA 3PWYA 4IWOA 2YHVA 3E7VA 3NX8A 3ZBFA 3BGPA 1PXLA 4YP8A 2XK8A 3EL8A 3LFFA 2A2AA 2XIKA 1PXJA 3NPCA 2ESMA 2X2LA 3DAKA 4K9YA 5DA3A 1CTPE 3KFAA 2QURA 4PTGA 3GC9A 4E93A 2CCIA 3COHA 3KXHA 2OZAA 5KHWA 4M12A 4MK0A 1XH9A 4PDOA 3R30A 3T8OA 4NTSA 4K11A 2XRWA 4G5PA 5IU2A 3QQHA 1FQ1B 1OKWA 4QMWA 4DHFA 4JDHA 4IAYA 5AR4A 2YCRA 1DAWA 1A06A 2XBJA 1Z9XA 3AC4A 4G3FA 4NM3A 2QVSE 2WTIA 4EWQA 3IW8A 4RQVA 4KD1A 5TKDA 4PPAA 3TNQB 4JRNA 3AGLA 1ZYSA 3E92A 1NVSA 4TWNA 2VTMA 1V0OA 4YGAA 1MRYA 5IQGA 4L3LA 3D4QA 3NVKI 3I1AA 2PVMA 4BYIA 1J3HA 2GU8A 2OIDA 3WZUA 4DH1A 5L2WA 3OD6X 2JEDA 3P79A 2GHMA 4ITIA 2UW7A 3VW6A 4ZMFA 1QPJA 4FKSA 4MXOA 2SRCA 4M14A 4S31A 4ZS0A 2X8EA 3O7LD 4F1OA 5DH3A 2X7GA 5IA4A 4O7WA 2J0JA 3U55A 3GU8A 3R63A 3PJ1A 3R9HA 5C8MA 5AR8A 2UZVA 3BPRA 4XJ0A 2IVUA 2CLXA 3F3VA 4DG2E 5C8KA 2XK6A 5H2UA 4NIFA 4E5WA 1SNUA 3COMA 5K5XA 3ORMA 3AC1A 2H34A 4U40A 1HOWA 3CJGA 3OP5A 5DI1A 1URWA 2ZMDA 4XCUA 5JFWA 4DH3A 5ITAA 4RC4A 1OPJA 3U6JA 2QKRA 2XNEA 3DFAA 4EJNA 2ZV7A 3F7WA 4IFCA 4MXYA 3R7IA 3SKCA 3DKOA 4KIPA 4QMLA 1JKTA 2EUFB 5KMMA 3PA5A 3QRIA 4RX9A 5FXQA 3VBYA 3QC4A 3Q4CA 1YI6A 5B2MA 2B55A 3GFEA 2WD1A 4GJ2A 4J98A 4FIHA 1CKPA 4LUEA 4ZTNA 3FBVA 4FEQA 4I6QA 2HWPA 3O71A 5DT3A 4YUQA 5D7AA 4E4LA 4CKJA 3NCZA 3FL5A 1BUHA 4W9WA 2CN8A 4AZFA 3SLSA 4NT4A 5HE0A 4YJSA 1E9HA 4F65A 4U0IA 5HO6A 4C3RA 1GIHA 3ZYAA 2QI8A 4X3JA 4AWIA 2WQNA 5AFVA 3CY2A 3TL8A 2QR7A 3WZEA 3KRLA 4I4FA 4M15A 5IQBA 4G6LA 3UOLA 4TW9A 2QOBA 2X4FA 4C35A 3C4CA 4FTLA 5A4EA 2OIBA 3C13A 4YLLA 5AUYA 1KUTA 4RX5A 4J8MA 2PVLA 3L1SA 1GZ8A 1IG1A 5DT0A 1KWPA 2PVKA 4FC0A 3DBQA 3HX4A 4MTAA 4P5QA 4YBKA 2DUVA 3GCPA 3UGCA 5IDPA 1H1SA 1H1PA 4NFNA 4CRLA 5KBQA 3QKLA 4EHGA 4XRLA 4ASEA 3RAWA 3IS5A 5F4NA 2XYNA 5JKGA 5J5SA 4U3YA 4F1TA 1FBNA 4JS8A 2FO0A 3ZTXA 1H26A 3WBLA 4RGJA 4BN1A 4QMNA 5KMOA 4DE4A 3CR0A 2VWUA 2IVTA 1Y6BA 3GU7A 3MYGA 3BCEA 3FV8A 5M51A 4ACCA 2YLEA 3Q52A 3NUUA 4BIEA 2F57A 4FKIA 3N4TA 3T3VA 3DOGA 3HRBA 3SAYA 3AMYA 4ALUA 1GIIA 4RJ4A 2VTLA 3LM0A 2XBAA 4TZRA 5EW8A 4A4OA 4FKOA 2X2KA 5IZFA 2XIXA 5K4IA 1ZWSA 3ENMA 4W8DA 3UO6A 4APCA 1JNKA 4EH3A 2CMWA 4HVGA 3CLYA 4RLLA 4NYEA 3QQLA 2C0TA 3FKOA 4PNKA 5CQWA 5HU9A 3AMAA 3AG9A 3I6WA 2H8HA 2R0IA 4BIBA 3DLZA 4AACA 5LMAA 1OUYA 3I0QA 4D9TA 2RGPA 3FI2A 4YZDA 4JX7A 4F0GA 5IDNA 4EL9A 2IVSA 2WIPA 3A99A 4FIGA 2JKQA 3CGOA 3FI3A 4PL3A 4QTEA 4WA9A 4I6HA 2GQRA 3LJ1A 3OOGA 3PLSA 2UW3A 4Y5HA 3ALNA 4AZEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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