3BYVA

Crystal structure of toxoplasma gondii specific rhoptry antigen kinase domain
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
361
structure length
345
Chain Sequence
QGPGDVVIEELFNRIPQANVRTTSEMQSAADSLVSTSLWNGQPFRVESELGERPRTLVRGTVLGQEDPYAYLEATDETGESFEVHVPYFTEPPSNAIKQMKEEVLRLRLLRGIKNQKQAKVHLRFIFPFDLVKDPQKKKMIRVMWVLSRFFLYPRMQSNLQTFGEVLLSHSSTHKSLVHHARLQLTLQVIRLLASLHHYGLVHTYLRPVDIVLDQRGGVFLTGFEHLVRDGARVVSSVSRGFEPPELEARRATISYHRDRRTLMTFSFDAWALGLVIYWIWCADLPIGGSEWIFRSCKNIPQPVRALLEGFLRYPKEDRLLPLQAMETPEYEQLRTELSAALPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel structural and regulatory features of rhoptry secretory kinases in Toxoplasma gondii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Rhoptry kinase
molecule tags Transferase
source organism Toxoplasma gondii
total genus 108
structure length 345
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14531 Kinase-like Kinase-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3byvA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3byvA02
1W84A 3N4UA 4IZ5A 4XEYA 4NTTA 1PF8A 3NWWA 3UZTA 1IR3A 2OXYA 5HBJA 1XJDA 4EK6A 1CTPE 4S32A 4QMZA 3NPCA 2ZVAA 4EUUA 3F9NA 1P14A 5EM6A 3V5WA 2PULA 4QMUA 4AOIA 4FIEA 4MXOA 4G9RA 3GGFA 4GS6A 1NVRA 5H2UA 5K4IA 1ZOEA 5FTOA 4JDJA 3CR0A 4JR7A 3R83A 2BAQA 5ETCA 2VTIA 5D12A 2A19B 3UVPA 1Y6BA 5I9YA 2W1CA 5E92A 5AADA 4IE9A 4IX4A 5H3QA 4JT3A 2W9FB 3QLFA 3FLWA 2C0OA 5HG7A 5B2LA 2WMXA 1SM2A 2ETRA 4LOPA 4QP2A 4BCQA 2QO9A 2BRNA 3KXMA 2XK6A 3WZJA 3CPCA 3NVMB 2H34A 3F3ZA 3VS1A 2ITTA 5LCJA 2XEZA 5CNNA 3RKBA 4WG4A 3CS9A 5KHXA 2OH4A 5IEYA 1PKGA 2J0KA 3HP5A 3C4XA 5FM2A 4C4FA 2SRCA 2P3GX 4DLJA 3VIDA 5HNIX 2YERA 5TT7A 4DT9A 4U3ZA 1PYEA 3NYXA 2VWXA 2VD5A 3R73A 4YTCA 2E9OA 3NNXA 2PUNA 3E64A 3N51A 2QG7A 4LMNA 3FPMA 4E6CA 1WBTA 5AAFA 3TL8A 1G5SA 2R3PA 5C1QB 2B0QA 1PXLA 1WBPA 2X4FA 3W33A 1T45A 3LIJA 4U81A 1DAYA 1E9HA 4A06A 4E4MA 4BDGA 5JZJA 2X9EA 3DB8A 4JG6A 4HZSA 3AD6A 2B54A 4FV4A 4LG4A 4ZY5A 4FV2A 5CEOA 4DEGA 3K2LA 4RX9A 2DWBA 4BDKA 2ZDTA 1PMEA 5HZNA 3RPSA 1RW8A 3PRFA 4JG8A 1QMZA 3DTCA 3G6GA 4F70A 2V5QA 5LMKC 1SMHA 1OIRA 4L42A 4C36A 4MK0A 1OKZA 3OXZA 3WILA 2W5HA 4R5SA 3SD0A 3U51A 2UW5A 3G90X 3GOKA 3BV3A 2UVZA 4C4EA 4RIYA 2IPXA 4K8AA 2RFNA 3ZLXA 4IVAA 1YI3A 3GC0A 4MXCA 2NPQA 3DLSA 4K0YA 5EHLA 3Q4CA 2DS1A 3CJFA 4AWIA 4PPCA 4CCUA 4EHVA 5JH6A 3MJ1A 3RHXA 2P55A 3UGCA 4XBRA 3UIBA 4W9WA 3F5GA 2ZB1A 3PVWA 5DN3A 3AG9A 3HMOA 4RLLA 4ZTHA 4EUTA 3D7TB 5JFWA 5CTPA 3QQUA 4FTLA 4NJDA 2PVRA 4NK9A 4YZMA 1BL6A 4PX6A 5BQ0A 5HI2A 2CCIA 2QOOA 4TWNA 2YWPA 3IW5A 3AOXA 2RFDA 2WMUA 4RJ6A 5DBXA 4ANMA 4FA2A 2CGWA 3HV6A 3AC5A 2PHKA 3KMMA 2I0VA 4G5PA 5CAVA 3COHA 4L53A 1YW2A 3F2RA 5ANDA 4YJSA 3BHHA 5DA3A 3WZKA 1OIQA 2C3KA 4DFUA 5DPVA 1EH4A 3PXKA 3NUNA 3E63A 4JBVA 3RM7A 2X6DA 4ASZA 1O6KA 2P33A 4FVRA 3C9WA 4NFNA 5E8TA 3TUCA 2FGIA 1FGKA 2PL0A 2P0CA 3UMXA 4F7JA 3PE1A 4O7LA 2W1IA 2PVHA 2GNHA 4NCTC 5JGBA 4QYFA 5B7VA 2UZUE 5CEMA 4BCMA 1ZY4A 4RLKA 3EN9A 3CQEA 3WF5A 4F9AA 5LXMA 4Z9LA 4ASXA 3PXFA 3R7UA 4D28A 2ZMCA 3PJ2A 3IGGA 4I4FA 4TYHA 3UO4A 3R7YA 4BBEA 2VX0A 4ANOA 4F6UA 5AAGA 2YCFA 1NW1A 3CY2A 4Y83A 3BZ3A 2WD1A 2Z7RA 5CWZA 5HGIA 4DFBA 2B4SB 3ZEPA 3N4VA 2ZV8A 2A0CX 2XNPA 4ANSA 3MS9A 4YC6A 1FGIA 3TKUA 3FLQA 2QO7A 3KRLA 3BGQA 4D55A 4FKLA 4GCJA 4S30A 2JAMA 3KXHA 4TY1A 4LM5A 4NT4A 3RAIA 2WTKB 3NAYA 4HJOA 2OO8X 3ITZA 3W8LA 4DGNA 4M68A 4DG0E 4E4NA 1YHVA 3ALNA 3SW7A 4MYGA 5EM7A 2WQOA 5HD7A 1JOWB 5L2TA 1KOAA 4GJ3A 4RVLA 4BRXA 3DK6A 3S0OA 4BN1A 4UMTA 3GU7A 5AP5A 4F08A 2YWVA 2YM3A 4AT5A 3V5TA 4MF0A 4EYJA 2W1GA 4BYIA 3C7QA 4WG5A 5IQDA 3OXIA 3ZEWA 3IW7A 3KN6A 3EQRA 3PZHA 4FT0A 5EFQA 4PL5A 5J5SA 1OECA 4XG6A 4XP3A 1YRPA 3PWYA 4EKKA 1XH6A 2P2IA 1H8FA 2YABA 4KRCA 2QOQA 2WQEA 1P5EA 3FXWA 3RPRA 3ZSIA 2X7GA 2PE1A 3AGLA 4E8AA 4DHFA 5EHOA 5ACKA 4AN9A 1UV5A 5J7BA 4JOAA 5AV0A 4WUNA 3O17A 4JIAA 5AP6A 3TNHA 4DFYA 2VWZA 4C3RA 5E8SA 5CNOA 4ZAUA 5KKRC 2QLQA 5IUHA 3CKWA 3TNIA 1Z5MA 3DAKA 3E7VA 4M69A 3R7OA 3LVPA 1PHKA 1OPKA 2ITOA 3CJGA 3EFKA 2B1PA 3QTWA 3P86A 1GOLA 3MDYA 4F7LA 4O81A 1H25A 3M11A 4WBOA 4JQ8A 3R02A 5KMOA 2C5VA 3BKBA 5JFVA 2FSMX 4AACA 2I0HA 4FKWA 4JXFA 3DU8A 3GCVA 1J7LA 4EC9A 2BAKA 3CY3A 4J95A 4BCKA 5GZ9A 3LE6A 5E8VA 1H1QA 3FQHA 4F99A 3O8TA 4QP4A 5CS6A 3Q2JA 2XF0A 3C13A 5FGKA 4RWLA 3ZMMA 3V5PA 5A4QA 4PY1A 1YXUA 4NKSA 4PNIA 2XUUA 2ITQA 2RF9A 1XH5A 4FKPA 2PZIA 3SC1A 3BHTA 3ROCA 4F6SA 4QT1A 3W2PA 1ZY5A 3LJ2A 3R63A 3C4ZA 2W1FA 2WHBA 1FVTA 1UKHA 3E3BX 5KE0A 4DH1A 2X2LA 2GNIA 3R22A 3O8PA 1W82A 3IK3A 4QTDA 4YO6A 3OW4A 2UZTA 4LV8A 4R8QA 3IS5A 3P0MA 4YC3A 3BYMA 3ORKA 3JVRA 3POZA 1PXMA 2OF2A 5E8UA 3FY2A 3QD4A 3BHYA 4AA0A 4BCHA 4CFWA 1GAGA 3Q5ZA 3QTXA 4FK6A 4D58A 4GUBA 1YWVA 4O84A 3MV5A 2A4LA 2YIYA 3FI2A 3DNEA 3OCBA 3VVHA 3CTHA 4C7TA 3QZHA 4YJRA 4LGHA 3KXZA 4EHEA 4R7HA 2JFLA 4WSQA 5HX6A 3TZMA 4PF4A 4AUAA 4MNFA 3RK5A 4L7FA 4BI2A 3R2YA 3VBTA 5J5TA 5EM5A 5J7HA 4QOXA 5DLSA 2JKKA 1W83A 4JNWA 3F69A 4ZIMA 3SRVB 4QP3A 5FTQA 5FXQA 3WF9A 3EFJA 3OG7A 4YJVA 4W8EA 3OBJA 3I5ZA 4CVAA 4QMMA 3NZ0A 3QA0A 2BTRA 2IVTA 4QQ5A 2E9PA 3FSKA 1RJBA 4ACMA 2XJ0A 5L8LA 5M56A 2HELA 3BYUA 3U6HA 4CFFA 5AWMA 4UZDA 3BHUA 1PY5A 5DR9A 2PE0A 1Q3DA 5HU3A 4YJQA 5F9EA 3C51A 2R2PA 4EOMA 2ZYBA 4O86A 4DT8A 3A8WA 3PG3A 1V1KA 4K6ZA 3WF7A 3HDMA 4B7TA 4FTKA 5J8IA 5EHYA 4RRVA 4I24A 1GIJA 1XH4A 2IN6A 1H1SA 2J5FA 4UN0C 4CSVA 2VAGA 3KMWA 4S34A 4A9SA 3V8WA 4ZTLA 1GZOA 4FL3A 5JMSA 2OIBA 1MRUA 4JRNA 4OUCA 5AX3A 4XCUA 4CD0A 2CLXA 4Z7HA 3WARA 2F57A 3FDNA 3Q9XA 5FDXA 4V01A 5DGZA 1BMKA 4GMYA 4KNBA 3OVVA 3HP2A 5T3QA 5BVWA 4YU2A 3DXQA 1XBAA 3AT3A 2VUWA 4BCOA 1M2QA 5I9WA 3EKNA 3DK3A 3KVXA 4FKOA 3DKCA 4AX8A 1JKSA 3AD4A 2YLFA 2PMIA 4ZLZA 4YP8A 2I7QA 3QBNA 4EH2A 2R3KA 3FHRA 4CMUA 1MQBA 4KIOA 2V7AA 3KVWA 1GIIA 3NNUA 1CKJA 4ENYA 5HO6A 5CAOA 3MW1A 3T3UA 4FV1A 5LJJA 1F3MC 4LGDA 3HMIA 4BHZA 5AIRA 3I5NA 3MI9A 4HCUA 3EOCA 2JDOA 2ITZA 4BZNA 5M57A 3IO7A 5G1XA 2I40A 3R7EA 2R64A 2XM8A 5C8KA 2UZEA 1S9JA 4JQEA 4XG4A 1OGUA 4D0XA 2W5AA 1E1XA 4D5KA 1SVGA 5HBHA 4JAJA 4E5BA 3PIYA 5H8GA 2KTYA 2VWVA 1U5RA 3R21A 5GJFA 1P4OA 4IB1A 3OWLA 4C3FA 3FZRA 5EYDA 1Q8ZA 2W06A 3EQFA 1H01A 2CCHA 3I79A 3IPHA 4N6ZA 5F4NA 3R04A 4IZYA 3U4UA 4BDFA 1ERKA 3QTSA 4XG3A 3TUDA 4F1MA 4TN6A 5CQWA 2C5OA 3KF7A 4FOBA 2ACXA 4GJ2A 4WKQA 4ZZOA 4ZTRA 4E26A 4KS7A 4RC4A 2XJ1A 3DDQA 3OFMA 3D5UA 3FMHA 5E8YA 2NNWB 3PVBA 4O1PA 1WVYA 3CKXA 3V6SA 2HYYA 3KULA 4FKRA 3A62A 1JAMA 3HX4A 5AEPA 3FKNA 5EYCA 2CNVA 3QQHA 5DT3A 3Q3BA 3W18A 3ULIA 3H4JA 4GUEA 4IAAA 2LAVA 3E87A 1BX6A 1OUYA 4BTMA 5M07A 4H1MA 2FSTX 3UYTA 4BCGA 4AGWA 4FKGA 2CHLA 3LQ5A 3PZEA 5DFPA 3FLSA 3BQCA 3D5WA 4UALA 5EW8A 4AGDA 3KKVA 5I9ZA 3SG8A 2QOBA 4G17A 4QPAA 3A7JA 2XNGA 4LYNA 5FD2A 3D9VA 4BICA 4FE2A 2VTHA 2VX3A 5IH5A 2BHEA 4IB0A 4FKTA 4IFGA 4X21A 3HA6A 3ZXTA 4ACDA 1JKTA 5CSVA 2RFEA 2YDJA 3DAJA 5LWNA 1ZXEA 3II5A 2O5KA 1FOTA 4GU9A 4L7SA 1DM2A 1HCKA 2BZHB 2BCJA 2VTOA 4M13A 3KB7A 4UMQA 4WHZA 5KMIA 3PRIA 2EWAA 4DG2E 1YQJA 3A7GA 3TXOA 2VTRA 1GY3A 3BWJA 4FV7A 1BL7A 3UG2A 3SAYA 3WE4A 4JI9A 5EI6A 1IG1A 2YAAA 4EOSA 1QCFA 4AXAA 1CSNA 2JBOA 4RJ4A 2NP8A 2RG6A 4UX9A 2OFUA 3I0OA 2YM6A 2WMRA 4MEDA 3WOWA 2ZM3A 4XRLA 4ZOGA 1IEPA 4TYJA 3C4FA 3SVVA 4EYMA 3NYVA 2VTTA 5GZAA 4YC8A 5FP5A 2C6KA 2UZVA 3ACJA 3CD3A 2R4BA 4EEVA 2F2UA 3DY7A 4EORA 2X2KA 4F0GA 2ETMA 3RAHA 4JJRA 3FZ1A 2HXQA 2OU7A 3QUDA 2RL5A 4NM5A 4IFCA 4QP6A 4QP8A 3TJDA 2UZBA 4O7WA 3QKKA 3UNJA 5I3RA 2GFCA 3I6WA 1WBVA 4RMZA 1Q97A 3E8EA 3UOJA 3QKMA 4C37A 3E92A 4FKJA 3BCEA 3PY0A 4H1JA 5DR6A 5EQEA 3LQ8A 4AA5A 3ANRA 4EK8A 1QL6A 2R3HA 3FHIA 3FSFA 4LUDA 3NW5A 1ND4A 3QXPA 2GS7A 3W10A 4QTEA 4MAOA 4BKJA 5CSXA 1WBOA 1KE8A 2V7OA 4FT5A 3C50A 1MP8A 2C6TA 3DBFA 3MSSA 4FV8A 4B9DA 2C6DA 3MJ2A 4FX3A 4JR3A 4FGBA 4AN2A 2YM5A 3IDBA 5A54A 5IG1A 5IQHA 4EZ5A 4UWYA 5L8JA 3MH2A 4ACGA 3Q04A 3HAMA 3D15A 4GG7A 3O71A 3TT0A 3ZO1A 4E7WA 2IW9A 3FPQA 2PE2A 3RP9A 4QMOA 2QU6A 2WQMA 4GVJA 4O27B 2XBJA 2X1NA 3FC1X 3TJCA 4BF2A 4F9CA 3IG7A 3ZC6A 3PVGA 2WTKC 5J9LA 3GU8A 4IIRA 1PJKA 4AGUA 4XOYA 3EMGA 4D0WA 2GQSA 5ANJA 4IC8A 4IJPA 3VBWA 3QTIA 4PPAA 4NH1A 5LVLA 2Y8OA 2YIQA 3OT3A 3RMFA 2VO3A 5TE0A 4DEBA 4USDA 3M42A 3DS6A 3FY0A 4GK4A 3ZXZA 3T9IA 5AUWA 3FC2A 4D4RA 4I23A 3LCKA 2XM9A 5HNBA 5L6WL 3VJOA 4WSYA 2HENA 1R0EA 2PVKA 4FTTA 2NO3A 1YOMA 2ZB0A 4IB5A 1OL1A 3WYXA 4AE6A 4M0ZA 3DFAA 3I81A 3RNYA 4ZS0A 1YWNA 2C30A 3RALA 1NVSA 1YDSE 3RCDA 4X6RA 4FI1A 5HIEA 4WO5A 5KMKA 3DZOA 4QMYA 2P4IA 5ACBC 3S2PA 3HAVA 3QHWA 4GSBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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