3C7QA

Structure of vegfr2 kinase domain in complex with bibf1120
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
301
structure length
286
Chain Sequence
RLPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKDFLTLEHLIYSFQVAKGMEFLASRKIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFDIKDPDVRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title BIBF 1120: triple angiokinase inhibitor with sustained receptor blockade and good antitumor efficacy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Vascular endothelial growth factor receptor 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 94
structure length 286
sequence length 301
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3c7qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3c7qA01
4R77A 5AJQA 2EB2A 5E8ZA 3N51A 4BCMA 3RPOA 2ETKA 3T9TA 2BMCA 3QXOA 1OIRA 2HZ0A 3EN6A 1H4LA 2JITA 3O96A 2VRXA 5AR4A 3CC6A 5A4TA 3ZZEA 2BILB 4AACA 5IDNA 1G8AA 5FM3A 3R04A 5BUEA 2UW7A 2VTJA 3QKKA 3HDMA 5HCZA 1V0OA 4XV1A 4L42A 5EH0A 3VUKA 5LVNA 2JKMA 3G90X 2YLEA 3SRVA 4U6RA 3QRUA 4FV7A 5HD7A 3R1QA 2XYUA 4EOKA 1JPAA 4YLKA 4D5KA 4IC8A 3OXZA 4UWCA 1WCCA 3FMNA 2E2BA 2JDRA 4ZJJA 3UVQA 3GU5A 2BDFA 4FK6A 5CX9A 1SM2A 2QOFA 2XB7A 3MY1A 4UWYA 3V5LA 5DN3A 3K3JA 4QNAA 2PE2A 3WF5A 3ZEPA 4BTJA 2GNGA 4F7LA 3GC7A 2PMOX 4BZDA 4GEOA 4MQ2A 4F9AA 3R01A 2Z8CA 4FIJA 2YCRA 5KX8A 3BX5A 1J1CA 3JR1A 2CKEA 2HOGA 3HV4A 3KVWA 2X8IA 3DPKA 1R78A 3ATTA 5AP7A 5BUIA 5AIKA 4MCVA 3ZRLA 3OWKA 1GAGA 1NY3A 3DU8A 1IAJA 5DT4A 1W8CA 3BGPA 4CKIA 2YCFA 4FUYA 4EONA 2G2FA 3CQEA 3ENHA 1GJOA 4CD0A 3H3CA 2I0HA 3UGCA 2C6EA 5KMKA 1Y57A 2J0IA 1H1WA 3VUTA 4MK0A 4N0SA 1KE7A 3RPVA 4S2ZA 3KRXA 1PKDA 2Q0BA 2ZOQA 2BZKB 3UVRA 3NWWA 4XLIA 3NZ0A 5E8SA 2X2KA 5AR2A 4AF3A 4D2WA 5J7HA 4GVJA 4JI9A 4O0UA 3QRIA 3SXSA 2CCIA 4WNOA 4JLCA 4DN5A 4M13A 3TCPA 1GIIA 3CTQA 3COKA 2NPQA 3P7BA 2BPMA 3E64A 3QTWA 3VS7A 1R0PA 3DNDA 4CVAA 3SXFA 4RSSA 2QOIA 3UNKA 1MP8A 5E8WA 3EQIA 1OITA 5M51A 3QQLA 4O7RA 5HHWA 3VNTA 1DI9A 1RW8A 5JMSA 2F49A 2XCHA 2QOLA 2ZM4A 3TZ7A 4L3LA 4UYNA 4C2WA 5A9UA 4MF1A 5EQEA 3QZIA 2C6LA 4IAYA 4IC7A 5HE2A 2CGVA 2ONLA 4K6ZA 4U43A 4GV1A 5L6OA 3GT8A 3FEGA 5H3QA 5CYIA 3AT2A 3LFEA 1XR1A 3EB0A 3SRVB 4IAIA 4K77A 1BI8A 3ALNA 3ZM9A 5CALA 5FXSA 3KMMA 4LGGA 4ENXA 4GT4A 4XH6A 1XH6A 1YHSA 3Q2JA 3ZDIA 2HZIA 3VIDA 2JKOA 3SVVA 5A6OA 4I41A 2EXEA 4OT6A 2ITYA 3EZVA 3ODZX 5KUPA 3KL8A 2HY81 2RFSA 4AGWA 4FT7A 5BYZA 2WOUA 1Q8TA 1U59A 2G2IA 2W1IA 2HAKA 2YIWA 4FTMA 3V8WA 4OTWA 2H6DA 4ZAUA 5BYYA 4OAVB 2KTYA 3ORXA 3QXPA 4I0RA 4V04A 5CU2A 3A62A 4U7ZA 1VYZA 4YR8A 3QTQA 3LFQA 5EFQA 4C4JA 1UU9A 4O0YA 2BTSA 4BDHA 4C3FA 3TZ8A 2BIYA 4GIHA 4RIXB 4UWBA 4NTSA 3KC3A 1OUKA 1Q41A 4O38A 4OTRA 5D7VA 5HTIA 1V1KA 5LCJA 4E5WA 4GKHA 2OZAB 4DYMA 5KCVA 5HLWA 4ASXA 2ITZA 2OJFE 5E1EA 4WBOA 5CI7A 3O23A 4TYEA 4YUQA 5BQ0A 4NM3A 3FXXA 3Q5IA 4QMYA 5IQHA 4U8ZA 2XNMA 3WYXA 4RMZA 3C7QA 4YJOA 4YMJA 4JNWA 5HORA 5M4CA 4NZWB 4WKQA 3NCGA 4XOYA 2XBAA 1SNUA 4JR7A 4X2NA 4J8MA 4QPSA 4RWLA 3R83A 4BVUA 1P5EA 1PY5A 4C7TA 1YDTE 4BDCA 4FKWA 3SDJA 4CXAA 4TN6A 5M09A 2AUHA 1YXTA 3R8PA 3P86A 3LMHA 3DZOA 5KKRC 4FTRA 1OL1A 4S34A 4BN1A 4B6LA 4AT3A 5L2IA 2OJJA 2YM6A 2JKQA 3KU2A 3QRKA 4FSNA 4YZDA 5HBHA 4AFJA 5CTPA 2CGWA 4Z7GA 4IACA 1M52A 4PMTA 3KCKA 3VJNA 4DG3E 5JFSA 4HVGA 4RFZA 4L8MA 4IWOA 3NS9A 1CKJA 3KMWA 3B2TA 4EJNA 4XLVA 4FZDB 2CGXA 2PVRA 4R7BA 3GENA 5EM6A 4DH7A 2WIHA 3NVMB 1I44A 2ITNA 3EQDA 4ARKA 5DEYA 5CXHA 3LXPA 4DT8A 3O8UA 5AUWA 4EK4A 4EK8A 1H1SA 4F4PA 3F5XA 4TYIA 3FMHA 4YJSA 4E73A 5LJJA 4JDJA 4NM5A 4LV5A 4TTHB 3ZSIA 3EFKA 5EI2A 4E6QA 4CRSA 2W17A 3EQGA 4IM3A 3EQRA 2R0IA 1WBWA 5DH3A 3C4WA 2QOCA 5FBOA 5L3AA 3A8XA 2QOOA 4DFZE 1IA9A 3Q04A 1H26A 1H1RA 1LEZA 2PTKA 3EL8A 2FH9A 4RVMA 3HV5A 2CKQA 3BELA 2X8EA 3DK3A 3GU4A 1FMKA 3RCJA 4K8AA 5BVKA 3RZFA 3AGLA 4FOBA 4WSQA 4O7LA 2B53A 2GHMA 4E8AA 5L6PA 4FTUA 5LWMA 2C1BA 4FGBA 2XMYA 3R8LA 4QTCA 4F08A 4MKCA 3ROYA 3VHEA 3CQUA 4EK5A 4CNHA 2C6MA 3IDCA 2CJMA 3R63A 4TNBA 4X2JA 3LE6A 2DS1A 2OH0E 4QP7A 3PXKA 4JG6A 3S95A 3VS3A 3GI3A 2CPKE 2Y4IB 3FY2A 3QTRA 3V6RA 1Y6AA 3RK7A 2WPAA 3JVSA 3TKIA 5AUYA 3MS9A 3UVPA 5A4QA 2FSTX 4Y5QA 4ZS4A 4TYJA 1U5QA 4J96A 3ZZWA 4QOXA 2H9VA 2JFLA 4H3QA 4ZMFA 5E91A 2W1EA 3RPSA 5A4LA 1XQZA 5HE0A 4HNIA 3QF9A 4NFNA 4ZZOA 4ZTRA 1Y8YA 3P7AA 2YM7A 3D2IA 3R2YA 5AWMA 3VRYA 3PY1A 5CSVA 4YNOA 2VTRA 3KN6A 3EQFA 3CY2A 3OBJA 5D1JA 5I3OA 3HA6A 3LM5A 2O5KA 3ORIA 3P5KA 2YABA 5IEVA 5CU3A 2DQ7X 2P2IA 3L9PA 3OFMA 3EN7A 3R7YA 4K9YA 3IONA 4EK6A 3DJ5A 2ITUA 1Y91A 3EHAA 3MVMA 3PG1A 5HU3A 4C61A 5J9LA 3DNEA 3DS6A 5DIAA 4MBLA 4I5MA 3V01A 3E8NA 4QMMA 3QYWA 5KMMA 1NVQA 4RZVA 2ZDTA 4HGLA 3ZHPC 1YQJA 3FE3A 5A54A 4RLKA 4CV8A 3DJ7A 3CPBA 5A4EA 5I9YA 4EWQA 5E1SA 3P1AA 5CEKA 2J0KA 2C6IA 3Q2MA 1ZYJA 2H8HA 2OG8A 4LL0A 4QPMA 3CJFA 5CAVA 4APPA 1PRYA 3BQRA 4RRVA 4BCKA 1GZOA 3ZUUA 2YZLA 2VO6A 4D58A 2RFDA 4XEYA 5AV0A 4G31A 2WGJA 4Z16A 4EQUA 3RHKA 3A8WA 4AXAA 4DEDA 1KE8A 3E8CA 3VBYA 1UU7A 4YSJA 3R9HA 5HX6A 3EMGA 3HECA 3HMNA 4ANOA 5TF9A 5CF8A 3QUEA 1MQBA 3PP1A 4OTIA 1K2PA 3F5PA 2B9IA 3WZUA 1U4DA 4EOJA 1URWA 5CY3A 5FP6A 3AOXA 3FMKA 3FI4A 1YI3A 4CFVA 2O65A 5HQ0A 4HW7A 2PZIA 2OGVA 2JD5A 1H24A 5BVNA 5C4LA 3LCTA 4KWPA 5HNIX 3KA0A 2BZJA 3CPCA 4XRJA 5IH4A 4N57A 3GOKA 3WARA 4AGDA 4XV2A 3QZHA 4DA5A 5I0BA 3PUPA 4IJ9A 3NUXA 2WTVA 2UUEA 4HOKA 5C1QB 3Q5ZA 4FV4A 4L7SA 3AGMA 5DVRA 5FWKK 2XM8A 4QP6A 3NNWA 2BIKB 3BV3A 4I4FA 2OO8X 2PZYA 3M11A 3OCTA 4FMQA 3ORZA 4H1MA 3ET7A 3KFAA 3IGOA 3R6XA 2BVAA 4RBLA 2EB3A 1XH8A 3E8DA 3KB7A 3Q4TA 4I5PA 5AX9A 2OIBA 2BFYA 2WMAA 3OY3A 2JAVA 3KXZA 5J1WA 5TE0A 4R1VA 1E1XA 5HG9A 4I6BA 4X2FA 3TT0A 3OD6X 5CAPA 3LAUA 3Q53A 4BGQA 2CNVA 4TXCA 2WNTA 4XV3A 4YJRA 2NO3A 3QD0A 5K4IA 4FEWA 4NYEA 4BDDA 3UZPA 3R71A 1KV1A 3MGYA 4O7WA 3BCEA 4P5ZA 4JIKA 4D1ZA 5LXMA 2VTTA 2UW0A 1URCA 4APCA 3NIZA 4DT9A 3H9RA 2PZ5A 1MRYA 1QPJA 2JBOA 4V05A 3W8QA 4D2PA 5D9HA 4NW6A 4KAOA 4F09A 3I4BA 1YWRA 1JNKA 2B4SB 2P55A 2FB8A 4AN3A 5CF4A 2C4GA 2I7QA 3UMWA 3IOPA 2JDTA 4M12A 3MSSA 5KZIA 3CP9A 3FKOA 5E8XA 4E5AX 3R9OA 5CVHA 2CNUA 3PRFA 4E6DA 2W9ZB 3CQWA 3FJQE 3NDMA 3QLFA 5DT0A 5CU0A 4XG4A 4E93A 3ETAA 4ANBA 4RIOA 3AC4A 2R9SA 2QC6A 5EW8A 4CG8A 4CYIA 4P4CA 3L8SA 4EC8A 3JPVA 4FVRA 3E3BX 4ACHA 5AAGA 3R7IA 5LQFA 3VS5A 1LR4A 1Q4LA 3DAJA 2O3PA 4JDKA 4CFNA 3R9NA 4DGGA 5K5XA 5L8JA 1R3CA 4CFUA 3G51A 3GC0A 1U54B 3REPA 5CF5A 5K3YA 4L3PA 3LFDA 5M55A 4I23A 4M68A 1ZOGA 1FGIA 4FEQA 4LI5A 3JY0A 4KIOA 4CT1A 5BUJA 3QUDA 4QYEA 2PY3A 2Z2WA 3QRJA 5IG1A 4JX7A 4CT2A 3RK5A 4PPCA 4O1OA 5CZIA 5C27A 4BB4A 3L9MA 5IUHA 2Z7RA 3G15A 4QQTA 2ERKA 1ZY5A 3BBWA 3UOJA 2WTKB 1KUTA 5EK7A 2XP2A 2X39A 5E92A 3FC2A 2VGOA 2WELA 1WVWA 1DI8A 4RWKA 3UQCA 3TJDA 5TT7A 3PYYA 5IH5A 4XX9A 5CENA 5JT2A 4O6EA 4G1WA 3PPKA 4R8QA 2E9UA 4WG3A 3BHHA 5HKMA 3NX8A 4QTAA 5HOAA 3IS5A 1KE5A 4NJDA 1OPKA 1GIHA 4JBOA 2X8DA 2PUPA 2KULA 4F6UA 3P78A 3RVGA 4F0GA 3PLSA 2A27A 1Q8WA 5M4UA 5E8UA 4C38A 2IVTA 1BYGA 3Q4CA 4HCUA 2CCHA 5DFPA 5AM7A 3VS2A 2HENA 4PNKA 2OF4A 2HWOA 2P2HA 3LFSA 2C6OA 5JZNA 3UIXA 2ZMCA 3GU7A 5K0XA 3GBZA 3Q9WA 2C6DA 2F7ZE 3IW6A 4U0IA 2Y4IC 4EUTA 4MEDA 3OWPA 4U79A 5F1ZA 3FLYA 2PMLX 2HXLA 1P4OA 4BCOA 4AWIA 4X3JA 1T45A 4Q9SA 3SHEA 5JEBA 2J51A 2W1GA 4LOPA 2Y8OA 3ORTA 3OVVA 4KRCA 4EEVA 3WF9A 5DE2A 2PE1A 2XK3A 4Z9LA 5EYMA 4FF8A 3ZRKA 4A7CA 3PG3A 3VS4A 4USEA 4EK3A 4G3GA 2ITOA 3ZFXA 4FK3A 4E4XA 2GTMA 5DEWA 2E9PA 1ATPE 3OEZA 4F7NA 3H10A 4USDA 3PDTA 5AV3A 3ZRMA 2UV2A 4FX3A 3A2CA 4ITIA 4Q9ZA 2XRWA 5D12A 5GIPE 4DINA 2C6TA 3IG7A 2JEDA 5L4QA 3FQSA 1WAKA 3DY7A 2YZAA 3TKHA 4PX6A 5TKDA 3FZPA 4GS6A 3VQHA 4DEEA 2BFXA 2C0TA 5AP5A 4FKJA 4ASEA 4JX3A 4QMNA 2IO6A 4IAZA 4FSUA 3HUCA 2OJ9A 2W05A 2GSFA 2B55A 2ZAZA 5IU2A 3EOCA 3F82A 4W4YA 4YC8A 2R4BA 2V62A 5KHWA 3QCSA 3EQHA 1H8FA 2Z7SA 4KINA 2YITA 3V04A 1PYEA 2X2MA 4IW0A 4C34A 4FT3A 4BHZA 3QQJA 2WMXA 4C3PA 2XNGA 3LOKA 5EDQA 2QKRA 1LP4A 2C69A 2X7OA 3DJ6A 3VW6A 4BFMA 2VAGA 4HVIA 3T8OA 4O6LA 3UZRA 4IVAA 4FSRA 4L44A 3S3IA 3LXKA 2XIKA 2XVDA 5K0KA 3TUDA 2PYWA 4PDYA 2BKZA 3CEKA 4MH7A 4IBMA 4LV8A 4E6CA 3NW7A 3TV4A 3DAEA 2PVKA 5HICA 4CZYB 5IQAA 5CNOA 4C4FA 4LOOA 4DGOA 4O91A 3E5AA 5C03A 4YZCA 4HPTE 4M14A 4NW5A 3EQCA 3D5WA 2RG6A 4MXXA 3V51A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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