3CE3A

Crystal structure of the tyrosine kinase domain of the hepatocyte growth factor receptor c-met in complex with a pyrrolopyridinepyridone based inhibitor
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
307
structure length
293
Chain Sequence
DLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKFLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of pyrrolopyridine-pyridone based inhibitors of Met kinase: synthesis, X-ray crystallographic analysis, and biological activities.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 69
structure length 293
sequence length 307
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ce3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ce3A01
3O71A 3CC6A 5IQDA 4AGCA 2X9EA 4RFZA 2JFLA 3C1XA 4TWCA 4KB8A 5AWMA 3D7ZA 5FD2A 3D83A 3FMKA 2PYWA 4IBMA 4U3YA 1Y8GA 3JY9A 4PWNA 4R6VA 4C58A 2CLQA 3LVPA 3QF9A 1OB3A 2W1EA 4BL1A 4CFMA 1R78A 2F4JA 5CAVA 1J1CA 2A19B 4F99A 3MVMA 1TVOA 2PMIA 1FVVA 3PXRA 3S2PA 3U51A 3FY2A 2X81A 3OG7A 4QMQA 4AXAA 2YLFA 1AGWA 4CQGA 4XJ0A 3NUYA 3TKIA 4DLJA 4O82A 2ERKA 3KN6A 3W2CA 4PMSA 5HTCA 2WELA 4YTFA 4LGDA 4PNIA 3NS9A 5EM8A 4XX9A 2VWBA 5FEQA 5AV3A 4BVUA 4NFMA 4BDKA 2PMOX 3RBWA 2F2CB 3SD0A 5CEPA 5KBRA 5KMKA 3RINA 3DFAA 4A9UA 1YRPA 4ASZA 5AUWA 3ZCLA 3FQSA 5B2MA 3ZONA 3CP9A 3DGKA 1I09A 4JBQA 2JAVA 5AP4A 5ANKA 1B38A 3QQGA 5IQBA 2QLUA 3HNGA 4JR7A 3BGQA 4O0UA 4FZAB 2C6IA 2VO0A 2UZBA 4D4SA 3GCUA 3ORPA 3CCNA 3OBGA 4F4PA 1FBNA 1VYZA 4J8MA 4CFUA 3FI2A 3OTUA 2XK4A 2OBJA 4ID7A 3AXWA 4GEOA 4R8QA 4YJVA 4YHTA 5HD7A 4F1TA 1ZARA 3BLHA 4GVJA 4D4VA 2FSLX 3PZEA 3D5XA 3V5WA 4NL0A 3NPCA 2DQ7X 4U6RA 3FZRA 3POZA 5CANA 3RCDA 3VF9A 2G9XA 1E1XA 2IN6A 3E5AA 3PY1A 3QZGA 4RIYA 3MA6A 4G3DA 3UTOA 4RJ3A 2YM4A 3D9VA 4EQCA 4L67A 1H1PA 4OTGA 5BVEA 2AC3A 3PJ8A 5FBOA 2EB2A 1JLUE 3JVSA 4IX5A 5DT4A 3DPKA 5LOHA 3TNPC 5E8VA 4C59A 3I0QA 1YWNA 5M55A 4EHGA 1JNKA 3MSSA 2C69A 2OIBA 2QOLA 5DOSA 2F7EE 5CAPA 5M4FA 4X2NA 4UYNA 5GJDA 4RVTA 3E8NA 4BDCA 3MVJA 3BV3A 2XEZA 4DT9A 2C0OA 4K77A 4IZYA 4LG4A 1PKGA 3MFUA 4GW8A 2H96A 1G5SA 2J2IB 4YJTA 5IG1A 2WPAA 4QP8A 4Z9LA 1Y8YA 1Z57A 3HGKA 3HDNA 3PJCA 3T3UA 1CMKE 5E8ZA 3Q6UA 3OY1A 4WUNA 2YACA 3P1AA 3W1FA 4I0RA 1DI8A 1SMHA 4BI1A 3G15A 5IEVA 2GU8A 4EBWA 3F82A 4BICA 4FSNA 4RIWB 2XKDA 4TTHB 1YKRA 4K0YA 3FXWA 3OD6X 5HI2A 3RZBA 5JFSA 4IB1A 1FGKA 1OZ1A 3R8UA 1B6CB 2WHBA 3R9DA 3TNQB 2YCSA 2VTPA 4TT7A 4OTIA 4TYEA 4E6AA 3CR0A 3WZDA 4EOJA 3PVUA 4DGOA 3FE3A 3SG8A 3ZO4A 4RLLA 1MQBA 4EWQA 4PRJA 2BHHA 4JIAA 4MBLA 4O0RA 1O6LA 3AC1A 1UWJA 3R2YA 5HNIX 3ZBFA 4RC2A 2Z7SA 4TYHA 2DUVA 4BDDA 4IC7A 4BZOA 4NFNA 2YDKA 5HBEA 3QU0A 2XCHA 3BV2A 3LFEA 4YJRA 4YPDA 2CKOA 4FTAA 5IH5A 4UB7A 4OBQA 4NU1A 3UGCA 2EUFB 3P7CA 3U4UA 2BCJA 5JFVA 3NW7A 1M7QA 4GVAA 3KF7A 4R77A 5HTIA 3BKBA 2OICA 3PVWA 3ZC6A 2NRYA 3HRBA 2O2UA 3AD6A 3DK6A 4BHNA 3EHAA 5AR3A 5CAUA 3FJQE 3R7EA 2QOCA 4WHZA 3MB6A 5KKRB 3LJ1A 4JVGA 4OT5A 5EFQA 3TNHA 4D2TA 2B9FA 3JY0A 4L3JA 2QC6A 4L8MA 4AZWA 3DZOA 5HCYA 5JGBA 2YIRA 2GTMA 5L6PA 3QXOA 4XG4A 2XNGA 4DG3E 5L2TA 3DJ7A 1I44A 3H0YA 3FYKX 4XBRA 3UVPA 3H9OA 1K2PA 4FSMA 3ZEWA 4EH5A 4F0IA 4FZ7A 3AMYA 3BWFA 4BBEA 3GU7A 4FT9A 3UG1A 3FLNC 5KO1A 2XNBA 3WF7A 3R04A 2C0TA 3MTFA 4JT3A 3EQHA 2BALA 3VS1A 5GZAA 3GQLA 5ETIA 2VTHA 3R1NA 5GHVA 3NUSA 2YAKA 3LFBA 2QD9A 4U7ZA 4O1OA 5CSXA 4CGAA 2I0EA 3SX9A 4LYNA 2UW5A 5AV0A 1OPLA 4S31A 3UDBA 3OT3A 3VS2A 2WFYA 4HJOA 3WI6A 3EKKA 4RVMA 3CQWA 2CJMA 2W1ZA 3K5UA 4UWBA 4ZZMA 4E6DA 3RPSA 4OTWA 4F7LA 3GI3A 4GS6A 4QP4A 5AP2A 3VBYA 4KUJA 4IVCA 3DBEA 5IQIA 2W7XA 2JKQA 4H39A 4I4EA 3VJNA 1M2QA 5EDQA 5A14A 1Z5MA 1XO2B 3AMBA 3AT4A 5DEWA 3BEAA 5JZNA 3RAIA 2YZAA 3B8QA 4FIFA 4E4XA 3TUBA 1OUYA 1KE7A 2C3IB 2VWWA 3CPBA 4FI1A 3IS5A 3OWJA 4M12A 3ORIA 3ZFYA 5KMJA 1PKDA 4BDAA 3ZRLA 3I5NA 2A0CX 4FMQA 3R7IA 3BX5A 2P0CA 4YUQA 3EQBA 2YCQA 5JFXA 4PMMA 3CJGA 4HYUA 4L7FA 4Y73A 5BYZA 1XQZA 4G3GA 4KA3A 1PRYA 4M3QA 4XV9A 3OW4A 4AA5A 4B6LA 5GINE 1H1RA 3MY5A 3QWKA 1A48A 2X8EA 3KRRA 4QMYA 2X39A 5BYLA 1Q61A 4O7YA 3KGAA 2W1HA 3C5UA 3L8SA 4QP3A 4AW5A 3HL7A 2BAJA 4ZZNA 2BRMA 4FV0A 4EI4A 4PDYA 5AUZA 2BRHA 2C6OA 4ZSJA 3P5KA 3R73A 2UZOA 5J1WA 2FO0A 4PQNA 3O17A 5AEPA 3VBTA 4M69A 3WZKA 3SW7A 4JL9A 2G15A 4L6QA 4HVHA 1ZZ2A 4RIWA 2FUMA 4N6YA 4NKSA 5L6WL 3MA3A 3NNVA 4AT3A 3OWKA 1YW2A 3R7UA 4NK9A 5LCKA 3Q53A 4LRJA 2AYPA 3KRJA 4I93A 3DAJA 3WE8A 5IF1A 4FNXA 5CNOA 3TZ9A 3I81A 3MPMA 4J7BA 4WUAA 1F3MC 1R1WA 1XR1A 2CKEA 2UZLA 3HMNA 1ZYSA 5DFPA 3RK9A 5JSMA 4DCAA 5AR5A 3G33A 4M97A 4H3PA 5FGKA 2BZIB 1GZOA 4KS8A 5ACKA 2GSFA 2GHLA 3HV5A 3DB8A 3PRIA 4Q5EA 5M4IA 5FUTA 5ICPA 2BAKA 2PUPA 3SQQA 5C4LA 1JKKA 2OJFE 5CALA 5AIRA 2BMCA 3DQXA 2OGVA 4OW8A 5C27A 5FWKK 2I0HA 3ZUVA 3DLZA 3W2SA 3UIXA 5F9EA 3D2IA 2XCKA 4JLCA 4ANNA 4X6QC 5AADA 4YNOA 4MQ2A 4CRSA 4FKLA 4HVDA 4R3RA 3TKHA 3CD8A 2VWXA 3C4FA 4E8AA 1Q41A 3KQ7A 3ALNA 4S33A 1IEPA 2ITVA 3E7OA 2UUEA 2IJMA 4I0TA 1UU8A 4A07A 4FX3A 1YI4A 4EKLA 2RKUA 4L53A 5LWNA 3N4TA 4APCA 3FC1X 4M0ZA 4K11A 3CQUA 2HZ4A 2BIKB 1OL6A 2Y4PA 3ULZA 4BC6A 2YM5A 3GB2A 3HEGA 1OM1A 3AT2A 2PVYA 3EQCA 3QLGA 5H3QA 2VO3A 2PUUA 3E63A 4B7TA 3KU2A 4G3EA 3O8TA 5F94A 3EN9A 4D1XA 2YIXA 2WIPA 5FQDC 3I79A 4IAYA 4M67A 2JDVA 3R63A 4X3JA 3O8PA 5HGIA 4BCHA 4CFXA 3NUPA 1P4FA 4KSQA 4A4OA 4FV5A 2WMAA 3MYGA 3CKWA 4I5HA 2HZNA 4F9CA 4O38A 2VO6A 4EOSA 4FT5A 4LV5A 4YLKA 5AMNA 3VULA 1YWRA 1LPUA 2OZAA 4QMTA 4E20A 5J79A 5HG8A 2V55A 5IA5A 3H10A 3LXNA 4JBOA 4D1SA 4FV7A 1ZYCA 5AP1A 1LR4A 3W2OA 4DH3A 4XUFA 4YGAA 5GZ9A 5EW3A 3OCTA 4QMNA 5IZFA 3GU5A 4U45A 4YC3A 2YIQA 4RPVA 4GV1A 3RAWA 4YZNA 4QMVA 4IM0A 3FMEA 4R5SA 4RWJA 4DITA 3EJ1A 3RAHA 3FMMA 4FTRA 5EKNA 3GNIB 3QRTA 2ZB1A 3GU4A 4G2FA 2RGPA 4MAOA 5BVKA 3VS7A 4C61A 4GT4A 2ITXA 4QMPA 4X2GA 2PE2A 3UVQA 2WTCA 1Q99A 3F5GA 3C4EA 4NWMA 5CXHA 4C57A 4E5BA 4OR5A 3R22A 2XYUA 3H9FA 2CNUA 1YHWA 2GFSA 3COHA 3GXLA 4AOJA 5HORA 3G0FA 3VAPA 4D2SA 5BVDA 3Q9ZA 4HOKA 5AM7A 2CKQA 4LV8A 1ZXEA 4BHZA 4NM5A 2ESMA 1YXTA 2R3RA 2OH4A 2UW9A 2XJ2A 2WMTA 2XZSA 3C4XA 4RSSA 3HMIA 5EI2A 3NNWA 3I4BA 4PDOA 5GIOE 4ENYA 2XM9A 3LFQA 1OVEA 4PL4A 2B54A 4BCMA 5J5TA 3NCGA 3PE1A 2PE1A 4LOQA 3QRJA 4TWPA 5GJGA 3UOJA 3E8EA 5KMMA 1CKPA 2CCHA 2C5YA 4WO5A 3A2CA 1FMOE 5FP5A 4BDJA 3EWHA 2P55A 4CCUA 4FIJA 5TR6A 3DY7A 3O96A 4V05A 2UZNA 4YR8A 1M7NA 1GIHA 4D2WA 2ZDTA 3IPHA 3GCVA 3CTHA 5BVNA 5FRIA 2HW6A 2Y6MA 3DCVA 5EDRA 5EYCA 2ITNA 2BZHB 3MW1A 3NYVA 3O50A 3QRUA 3HV4A 4J53A 3R00A 3QZIA 3WOWA 3BYUA 5DEYA 3TKUA 4QMLA 3AD5A 1MRYA 5HCZA 4U3ZA 5A3XA 4B8LA 2DWBA 3FMDA 4BTMA 3EYGA 2E9PA 1H0VA 5HU3A 4FA2A 2XRWA 3BU3A 3LJ2A 3KY2A 1WZYA 3MFRA 4BCPA 3R30A 5IQHA 4PY1A 1PW2A 2YEXA 2XF0A 4FV9A 2J0LA 4EZ5A 4C35A 4AG8A 3LE6A 3VUMA 1A9UA 2VTMA 2WTKB 4AA4A 5EQEA 5I3OA 5AUUA 3MTLA 4RA5A 4IM3A 2R3OA 3QD4A 3T8OA 4ANLA 4CYIA 4FKIA 3ATSA 4H1MA 1FMKA 2R0IA 3FHRA 5AAGA 3R1QA 5TO8A 3PXFA 4GJ3A 3TDVA 3K3IA 1BUHA 4O6EA 2C6EA 4ITHA 1QPCA 4I5MA 1XBAA 4WNOA 4DH5A 4XNEA 3PRFA 4IANA 3LFCA 4HGEA 3ZRKA 4FYNA 4U41A 3V3VA 3R8LA 3CLYA 3ZC5A 4F63A 5L4QA 3RK7A 4I94A 2ZJWA 5HESA 5F20A 3Q04A 4RJ8A 5FM2A 4YHFA 4IFCA 4M66A 4DBXA 1G3NA 3ODYX 4FKUA 5E8SA 1IA9A 4AA0A 5I9WA 5BYYA 1IR3A 3EQPA 2OJ9A 3OEFX 4LUEA 2C6DA 2EXCX 2PHKA 3UIUA 5L2WA 5LJJA 2UZEA 4C2WA 2I6LA 4X3FA 2X7OA 3SAYA 4FT7A 5CWZA 1R0PA 3KULA 3Q52A 5D12A 4IIRA 2GHMA 3EKNA 3THBA 2PMNX 2C6MA 5AA9A 4D1ZA 5LVLA 3BYMA 4XH6A 4HVGA 5E8WA 4O0VA 4CYJA 4CFNA 1GZKA 2XBAA 3COIA 2FA2A 4QPSA 2B53A 3IDBA 4TW9A 4FSQA 3O8UA 3KB7A 3PVBA 1V0OA 3CQEA 4YJSA 2IZSA 3DBQA 4NTSA 2W1FA 4FV3A 2WNTA 4MXZA 4ZTSA 5J9ZA 4X2JA 4XBUA 1IASA 2QNJA 2PZPA 2YN8A 3KXMA 4RIXB 2UW6A 4C62A 4DFLA 3BHVA 4W8EA 4W4YA 1NT2A 1OITA 3W2QA 3TDWA 2I0YA 5EDPA 2QG7A 3TT0A 4FVPA 5HE0A 3PIZA 3PXQA 3VF8A 4ZJVA 3FBVA 1OGUA 4J96A 1LP4A 2C6TA 3MJ2A 4DFBA 4G6LA 3ORTA 5EG3A 3CIKA 4Z3VA 3SRVB 4V01A 3PLAE 3GC9A 4J95A 4CFFA 4EOLA 1IAJA 3GCSA 4FK6A 2BDJA 3IK3A 5M53A 4ERKA 2PY3A 3FL5A 4ZTLA 5IMXA 4FODA 4IZ7A 2VWVA 3R9HA 2WOTA 3FUPA 2X8DA 3QD2B 2XKCA 2QONA 4WG4A 3VRYA 3MV5A 4YO6A 2W05A 1REKA 2EB3A 3EN4A 2X0GA 3E64A 5HX8A 3QXPA 4P5ZA 2UW8A 1GNGA 4TN6A 3MH1A 4FT3A 5LMKC 4WT6A 3NGAA 1Y57A 1LEZA 4EK3A 2R3QA 4L52A 2CDZA 3H0ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O71 A;  3CC6 A;  5IQD A;  4AGC A;  2X9E A;  4RFZ A;  2JFL A;  3C1X A;  4TWC A;  4KB8 A;  5AWM A;  3D7Z A;  5FD2 A;  3D83 A;  3FMK A;  2PYW A;  4IBM A;  4U3Y A;  1Y8G A;  3JY9 A;  4PWN A;  4R6V A;  4C58 A;  2CLQ A;  3LVP A;  2XAR A;  3QF9 A;  1OB3 A;  2W1E A;  4BL1 A;  4CFM A;  1R78 A;  1VLR A;  2F4J A;  5CAV A;  1J1C A;  2A19 B;  4AXF A;  4F99 A;  3MVM A;  1TVO A;  2PMI A;  1FVV A;  3PXR A;  3S2P A;  3U51 A;  3FY2 A;  2X81 A;  3OG7 A;  4QMQ A;  4AXA A;  2YLF A;  1AGW A;  4CQG A;  4XJ0 A;  3NUY A;  3TKI A;  4DLJ A;  4O82 A;  2ERK A;  3KN6 A;  3W2C A;  4PMS A;  5HTC A;  2WEL A;  4YTF A;  4LGD A;  4PNI A;  3NS9 A;  5EM8 A;  4XX9 A;  2VWB A;  5FEQ A;  5AV3 A;  4BVU A;  4NFM A;  4BDK A;  2PMO X;  3RBW A;  2F2C B;  3SD0 A;  5CEP A;  5KBR A;  5KMK A;  3RIN A;  3DFA A;  4A9U A;  1YRP A;  4ASZ A;  5AUW A;  3ZCL A;  3FQS A;  5B2M A;  3ZON A;  3CP9 A;  3DGK A;  1I09 A;  4JBQ A;  2JAV A;  5AP4 A;  5ANK A;  1B38 A;  3QQG A;  5IQB A;  2QLU A;  3HNG A;  4JR7 A;  3BGQ A;  4O0U A;  4FZA B;  2C6I A;  2VO0 A; 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