3COIA

Crystal structure of p38delta kinase
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
352
structure length
344
Chain Sequence
SLSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPFQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMGLKFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of p38delta kinase.
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 13
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 102
structure length 344
sequence length 352
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3coiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3coiA01
3A7FA 4F9CA 4YZNA 2UZLA 2GNIA 4YHJA 3ZLWA 2UW0A 2WOTA 4JX7A 1UKHA 4CKJA 4GW8A 2WMTA 3F66A 1ZYDA 2P0CA 1G8AA 4HZSA 4TWNA 1FOTA 2BTSA 5DEWA 3QZIA 4M67A 5CSHA 1REJA 3F3VA 3P86A 2V22A 4I5PA 5HG9A 3K5UA 4U44A 4X2KA 3GT8A 1E9HA 2UW7A 3DBDA 2E9UA 3IW8A 4IX5A 5L2QA 4F7JA 4N57A 5JFWA 2VWZA 1WBTA 3KMWA 4DGGA 5IQIA 3NRMA 4QT1A 3RM6A 3GU4A 5HICA 5A6NA 3B2WA 1P14A 4IHPA 5CVGA 3KRJA 5EFQA 2WGJA 3R9DA 2RF9A 2R3GA 2X8DA 3JUHA 1YHWA 3D5UA 4GRBA 4YBKA 5AP6A 4AT3A 5HCYA 3UVRA 4B8MA 1W0XC 2BVAA 2XNMA 2XIXA 2YA9A 1PYEA 2C0OA 2EB3A 3QZFA 4QP9A 2GFCA 4B7TA 1UV5A 5EI6A 4IX4A 2ETKA 1W8CA 1ZRZA 2G2IA 5I4NA 2QOIA 4CT1A 5I9WA 2C5VA 3ANRA 3KXGA 3LFNA 3PE2A 2J90A 4QNYA 4RWKA 4WA9A 3LE6A 3EQPA 5IKWA 2B1PA 3UJGA 2QODA 3ULIA 4ID7A 4H05A 3TV4A 3ORLA 3EQBA 1ZYSA 4IVCA 1KE8A 2YAKA 4WRGA 4KABA 4XG4A 3JVSA 3D0EA 5DWRA 3K3IA 4IAYA 4NWMA 3LQ8A 5AUUA 3PWDA 3CIKA 4BCJA 4XS2A 3ZYAA 4FL1A 4EKLA 3P79A 4C4GA 1TQMA 4EHVA 1WAKA 4HZRA 4HPUE 1IA9A 3UQGA 3I5NA 1I44A 1GZKA 4FYOA 2B55A 1QPEA 3Q96A 1W7HA 3FKNA 1FINA 4GK2A 3PRIA 4D5HA 4G34A 3MH1A 4H3BA 2WIHA 4EWQA 3C4CA 4YTHA 3VBYA 4UN0C 5TT7A 2Q0BA 5K4IA 3TKHA 5DT4A 1YVJA 4PMTA 3ZZEA 4EH9A 2AYPA 4AWIA 4DFLA 3FI8A 2R2PA 4LRKA 4FTAA 3ZDUA 1YDRE 4GIIA 5EI8A 4EH5A 5EQPA 4NCTA 2I7QA 3KRLA 3SW4A 2W1CA 4CMUA 2C3JA 4RWIA 2CNVA 3DKGA 3K5VA 4TYIA 3V5JA 4F9AA 2YDKA 4MXZA 2F7XE 4J53A 2PL0A 4NIFA 3DY7A 4RFYA 4TTHB 3UNJA 5L3AA 2CCHA 4M13A 3R28A 3C4EA 4U8ZA 5FM2A 3E7OA 4LMNA 2PWLA 4C35A 4CZYB 3H10A 3DFCB 1OKZA 4YSJA 1SNUA 3HX4A 4JRVA 3S95A 1RE8A 1M52A 3F7WA 3QYWA 4L42A 3E5AA 5CWZA 3C13A 4QP1A 1UU9A 5JFVA 5F9EA 4PDPA 3W10A 3LXKA 3Q60A 5CY3A 3SAYA 5LVNA 1Y57A 1XJDA 3AD4A 2NRUA 3PJ1A 4O7NA 3JXWA 2R4BA 3PA5A 4QP7A 2IPXA 3CSVA 3HMNA 4BGQA 3VUMA 2EXCX 2HZNA 4I92A 4CCUA 4RJ4A 2JITA 4ZZMA 3QL8A 3R7OA 3C5IA 4L7FA 5EYKA 5JT2A 3LW0A 3E7VA 3C0IA 4XRJA 2JGZA 5KNJA 4ACDA 4PY1A 1FMKA 4KBAA 1XO2B 2BRGA 4FKLA 5JRSA 4OTPA 3BHTA 4HYHA 2ZM1A 3PXFA 1VJYA 2OU7A 3OF0A 4AGCA 1VEBA 4H39A 2HY0A 4QTAA 1Z9XA 3ZZWA 5L2SA 1FQ1B 3A7IA 2XK6A 3LXLA 5DN3A 2WMUA 2ZMDA 3CY2A 3UOLA 1Q3DA 4KIPA 4I6FA 1S9IA 5AX3A 4PDYA 3VS2A 2KULA 2E2BA 1YXVA 4R7HA 4Z7GA 2XRWA 3EQCA 2QD9A 4J1RA 1KE7A 3LM0A 5E91A 4AZTA 3BCEA 1H1WA 3OCBA 2XK9A 1UU8A 3A7HA 4RRVA 2R3JA 3MB7A 4M84A 2OXXA 3ITZA 4FKOA 3SC1A 5D7AA 3PWYA 2J50A 4EUUA 4BN1A 3ORPA 3EQHA 4AU8A 5HIEA 3LQ5A 5EDQA 4ZTHA 3EN4A 1OIRA 1ZYLA 4AZSA 4EK8A 2HWPA 4U3YA 3SXSA 2HIWA 3UIUA 2QHMA 4QTCA 5E7RA 3F9NA 3VBTA 4HGSA 4A9SA 4CEGA 4FIGA 2QC6A 3I81A 4JNWA 3R73A 4DEIA 3UZTA 2KTYA 5AUVA 4ENXA 2HK5A 3MTLA 2RIOA 3GI3A 3O96A 2R7BA 4O86A 2QOHA 3V6RA 2F49A 5AUXA 4HVDA 4BCIA 4O0YA 3G0EA 3CKXA 3OMVA 2OO8X 4JQ8A 4MNEA 4WNMA 3NNVA 4CNHA 3LXNA 1ZOHA 2YJSA 2E9OA 2OH4A 2QOFA 5FP5A 2X7GA 3QQFA 4FNWA 4WO5A 4ZLOA 4FTCA 4IADA 4FA2A 2B54A 3BPRA 5M07A 3FYKX 4FTUA 3CLYA 2QNJA 4X3FA 2BZJA 4FSQA 2CHLA 3KXHA 5LVLA 2PMOX 2QG7A 5CEOA 4AX8A 2XNOA 1XBBA 4QQTA 2OW3A 1PW2A 4FEQA 4YURA 1WBNA 3UO4A 4XOYA 4IXPA 2CN8A 1O9UA 3CTJA 4FZ6A 5JGBA 3SXFA 4BDKA 4BGHA 1NW1A 3RHXA 2E9NA 4ACMA 2CKQA 2HELA 3MW1A 4CYJA 2J5FA 3ATTA 3HA8A 3TDWA 3L8PA 4HOKA 4ZTRA 3VS4A 3ZU7A 4EHEA 3ACJA 2WMAA 4U9AA 1CKIA 2ACXA 3H0ZA 4PMMA 3TNQB 2UW9A 4OBOA 4W4XA 3V5LA 3WE8A 2O8YA 3EKKA 4ASEA 1XHAA 3Q4UA 2ITQA 5CLPA 1PXPA 3QQGA 3WIKA 4E26A 1V1KA 5GNKA 4TRLA 3QGYA 3RZFA 1Q97A 2A0CX 3R9HA 3RM7A 3UBDA 3NCZA 4O0UA 4O1OA 1H00A 3WARA 3PUPA 5FDPA 1GOLA 2V55A 3EN6A 3Q9WA 1FMOE 4FF8A 2ONLC 2YABA 3TJCA 4WNPA 2YIYA 4QP6A 5JH6A 1S9JA 4Y72A 3DB6A 4ZS4A 1LR4A 2X0GA 4L01A 1DI8A 4PRJA 4ZZOA 3TZMA 5LXMA 4CFXA 3P0MA 3OT8A 1CKJA 4I3ZA 3FPQA 4ARKA 1R0EA 3KK8A 4FIJA 1ZOEA 3H9FA 3ODYX 3SOCA 5AMNA 3U87A 3FZSA 4KRDA 3W1FA 4EK6A 3G51A 4O2PA 5KUPA 3Q6UA 1JQHA 3LQ3A 5IQFA 5CF5A 5ANEA 1NVRA 2PE1A 3P5KA 1WVXA 2XKCA 4L3LA 4E1ZA 1M2QA 4DFYA 4GT4A 5D1JA 4NL0A 1XH7A 3UG2A 3WF8A 1KV1A 3R01A 4I0RA 3ZUTA 3NW5A 5DIAA 2B53A 1OL2A 3IO7A 5FDXA 4WSYA 2FSLX 5IH6A 5H8GA 1H8FA 5CQUA 1KWPA 2BRMA 3IS5A 2G2HA 2XF0A 1F0QA 3I1AA 1CDKA 5CSVA 3GFWA 4YLJA 1J7IA 3HRCA 4Z3VA 4IBMA 3C1XA 4F4PA 5I9VA 1SVHA 1GAGA 2XA4A 3AT4A 3V6SA 3V01A 4DH8A 3M1SA 2W1DA 2ZV9A 5J9ZA 3AMYA 3OWLA 4GK4A 2C5OA 1JSVA 2FYSA 3TNHA 4KINA 1XKKA 5A6OA 2R64A 4KKHA 4BZNA 3EKNA 4F6SA 4O7LA 2FSTX 2VTSA 4FTJA 5IQDA 4UB7A 4I4EA 5J1VA 2JFMA 4D1ZA 2IZTA 4FV4A 1LPUA 3CC6A 4FODA 4HVIA 2GDOA 1SYKA 4J97A 1KE5A 4EOQA 4LI5A 3O0GA 4QYYA 3EHAA 1GNGA 2XYNA 5L2IA 4CMOA 5IQEA 5DVRA 3PG3A 3CQUA 4FTIA 2P33A 2QOCA 4L43A 5CT0A 3R7UA 5M55A 3U6HA 3R30A 3DKCA 1FGKA 3LMHA 4UALA 5KMJA 4KKEA 1ZLTA 5E92A 3VBVA 2YIWA 4ZMFA 3AGMA 4I4FA 4XG9A 2PZIA 3QRKA 4I5CA 3DBQA 3BHYA 3QRJA 5HBJA 1JKKA 5HG8A 4V0GB 5KBQA 3ZBXA 3NUUA 3ZEPA 4AP7A 5LMKC 3LJ2A 4ERKA 1YOLA 2X1NA 3H9OA 4OTDA 5HVJA 4IM0A 4A4LA 3ALOA 4FV9A 1KE6A 4C57A 4YZBA 3ODZX 2QONA 3DFAA 3LFCA 3MJ1A 4XCUA 5FXQA 4G2FA 2UW3A 4NT4A 4XH6A 3UVQA 4AA0A 1B39A 3PYYA 4QYFA 2W06A 2XMYA 3BRBA 3UOJA 4XEYA 4GG5A 3TNPC 4XRLA 2GNFA 2VNYA 3S0OA 5AADA 4UMUA 3VQHA 3LMIA 1REKA 5CEPA 4HW7A 2DYLA 1Q8TA 2WHBA 4EEVA 2NRYA 5E4HA 4DBNA 3EH9A 3OWPA 3PA3A 4U5JA 5LWNA 4WUAA 4PPBA 3NCGA 4AN2A 4BWPA 4JAIA 3QTZA 2H34A 4TW9A 3TIZA 3WZEA 2UZVA 4D0WA 4GU9A 4YPDA 4YLKA 3R9NA 1FVTA 4AZVA 4C38A 3UTOA 4YNEA 3DPKA 3MB6A 4QTDA 4F1MA 4YTCA 3C4ZA 2GTMA 3BBTB 4U41A 4ANSA 4BTKA 3DJ5A 4GJ2A 4Y83A 3OG7A 4S31A 4C37A 3QRIA 4F9WA 4FZAB 4JLCA 3R8VA 5IA3A 1M2PA 4XV9A 4EZ7A 4EL9A 4EOOA 4OLIA 4MNFA 3N4VA 3FAAA 3MIAA 4G5JA 1PXLA 4BIDA 4TZRA 1QMZA 2CKOA 5K5NA 4ZMEA 2UVYA 5ANGA 4C8BA 1V0BA 4RX9A 2IG7A 5D12A 2XIKA 4I1ZA 4JJRA 5DEYA 3KCKA 5DE2A 3VUHA 5B7VA 2XYUA 3Q04A 5EQYA 4D55A 2RFDA 4XYFA 4DGNA 1Q4LA 5IUIA 2VTIA 4U97A 3R7GA 4ZSAA 5AAGA 3NNUA 5BYZA 1VYWA 4FZDB 2ZM4A 4CFUA 4Z16A 4LGHA 4A9YA 4O0WA 4QMOA 4FKQA 4DGOA 3IDCA 3OW4A 5K5XA 3G6HA 5J7BA 1ZXEA 4FVRA 1OL6A 4QNAA 3PA4A 4A07A 5H3QA 2BRHA 4QMNA 1IRKA 3FXZA 4U0IA 3NUYA 3R2BA 4A9UA 3SDJA 3G2FA 2AUHA 4CSVA 3SA0A 3GOPA 3LM5A 3OROA 1IG1A 2IWIA 4JBVA 2ITNA 4NEUA 3LCTA 3QX2A 5DMZA 1DAYA 3D7TB 5CSXA 5HX8A 3MESA 3A4OX 4HGEA 3QKKA 4XNEA 2UVZA 2Y4IB 5ACBC 5KCVA 3BQCA 1SVGA 2CLQA 2B0QA 2OXDA 3PP1A 4NSTA 3IK3A 1WBPA 4FKJA 2IN6A 4HCVA 1B38A 2W7XA 3SXRA 1YXTA 2RG5A 1RJBA 4LM5A 3DLZA 2W5AA 3ORXA 5J79A 3ORZA 3R1SA 3U6IA 3G15A 4FSTA 3ZO2A 1IAJA 2HZ0A 5IF1A 3FSFA 2X6EA 5HEZA 2W4OA 1CM8A 2IVUA 3DK6A 5IDPA 5LVPA 1H24A 4QMYA 4AGDA 5HNGA 4D4SA 5DT0A 3LOKA 4C02A 2JDOA 1F3MC 2YWPA 2WMSA 2C5NA 4E8AA 1BKXA 2YCFA 4ZAUA 3MGYA 4MBLA 2R3QA 4JDJA 4DH7A 4DH5A 3VF8A 5D41A 4IIRA 3UO6A 4DEEA 1LUFA 4U79A 2QOQA 5E8VA 3QGWA 1Q3WA 2UV2A 2Y4PA 4FGBA 4UWYA 4Y73A 2ZM3A 4WNKA 5IDNA 5BVKA 3SLSA 4RVMA 2V62A 4ORKA 3Q4TA 5I3RA 4MD9E 2W9FB 3T8OA 3EYGA 2X39A 3JVRA 5CALA 5ANIA 3ATSA 2REIA 1VZOA 5KO1A 2DS1A 5M09A 3QQKA 5AM6A 4KBCA 2XB7A 3CPCA 4WD5A 3SX9A 3T9TA 3RWQA 4FI1A 4MHAA 5ANJA 3TDVA 3AC2A 1WMKA 5CXZA 2B9IA 5LVMA 2CKPA 2F7EE 4ZS0A 4G3GA 2F2UA 1Y91A 5J5SA 4G1WA 2JAMA 4Z7HA 3PVWA 4BYIA 1V0PA 3WILA 1OPJA 4S33A 2WEVA 1UWJA 3RK7A 4K18A 4S2ZA 1H1SA 5I3OA 3NUNA 4BWXA 4EH2A 2HXQA 4IC8A 2RFEA 2YIQA 3QLGA 4X6RA 1H28A 1JPAA 3OFMA 4GIHA 1VYZA 2VX0A 1LEWA 2XCHA 3D5VA 3VIDA 5M4CA 4FYNA 5IMXA 3KL8A 4V0GA 1Z5MA 3LFQA 3RWPA 1YWRA 2C30A 3W2PA 1OUYA 3HRFA 1BYGA 5HG5A 3OW3A 5FTGA 4U3ZA 4LUEA 1URWA 3E3PA 3LKMA 2YM3A 3KQ7A 5EYDA 4O7TA 3W2OA 1QPDA 4YPSA 4QP2A 3E92A 1ZAOA 5H8BA 3LFEA 2XKEA 4I94A 3RMFA 1DAWA 4FSUA 4O0SA 3PP0A 4Q5HA 3V8WA 4MXYA 1U54A 3DJ6A 3VBXA 4RJ7A 2UZTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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