3D4QA

Pyrazole-based inhibitors of b-raf kinase
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
276
structure length
264
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Potent and selective pyrazole-based inhibitors of B-Raf kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords B-Raf proto-oncogene serine/threonine-protein kinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 264
sequence length 276
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3d4qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3d4qA01
4UYAA 2B7AA 4FIEA 4BY9E 3HECA 4IWOA 3EQCA 4AX8A 4RQKA 3TV7A 4ZXTA 3ZXZA 4B6LA 4RC2A 2V5QA 3FLZA 3PP0A 1H0WA 4UMTA 4D0WA 4ID7A 3E3BX 5HLPA 4ZTMA 3RWQA 5J1WA 5LVLA 1ERKA 3DK3A 2R3KA 4FTMA 1OIUA 3FZSA 3H4JA 5KBRA 3UQCA 4GMYA 2CKPA 3C51A 4UMUA 4ZLYA 4LFIA 2ONLA 4B8LA 4E4NA 4KBCA 4YC6A 5DR6A 2Z8CA 5FGKA 4KBAA 3PLSA 4GK2A 3NMUF 5EOLA 2UZTA 5HHWA 4EOIA 2PVRA 5L6OA 2UVZA 2J6MA 4IAAA 4M0YA 3TUDA 1XH5A 3MFUA 2WMWA 1CKPA 5LMBA 4JAIA 5C4KA 3PY0A 2GS6A 4DFZE 3JR1A 3TI1A 3EQIA 3A4PA 4DH1A 5HVYA 2CN5A 4X21A 3R9DA 4BBFA 2UW8A 4IJ9A 2OH4A 4C61A 1PHKA 3QHWA 5EM8A 3I5NA 4C62A 4W8DA 3C4WA 5DOSA 4D5HA 2IG7A 2QHMA 3JVSA 2QLUA 1CKIA 1FVTA 2OFUA 3AC2A 3ZUVA 4JDIA 3QUDA 5A54A 2E9UA 3AT4A 3MGYA 2VNWA 4ITHA 2X9FA 4BL1A 1WZYA 4CFMA 5GZ8A 3FL5A 5AV3A 4AZFA 2HWOA 4QP7A 4QMVA 3SLSA 5LMAA 4I24A 3SV0A 3RTPA 4FV7A 3TTJA 1BL6A 3PVWA 1OM1A 3BGQA 3LFDA 4XNEA 4EI4A 4ZAUA 2R2PA 4NT4A 5IEYA 2H9VA 3GI3A 2E9PA 4CFFA 1WBWA 2P2IA 4A9SA 4EEVA 2OWBA 1GOLA 3T9IA 4M66A 3QKMA 4EH2A 2J7TA 4M69B 2OJFE 4FSZA 3QZFA 3WF8A 5KUPA 5CNNA 4AW5A 4Z55A 5B2KA 3V6RA 4PDOA 3UIBA 4BCFA 5B7VA 2WMXA 4JOAA 3L8SA 4I5HA 1YWNA 4MYGA 1H1PA 4BDBA 2HAKA 4DH8A 3AGLA 3UQFA 5AV1A 2R3GA 3LCDA 5ANJA 4IM0A 3S2PA 3U9CA 1VEBA 5JKGA 2E9NA 3BGZA 3DKOA 5M4IA 2GS7A 4FV0A 4BCIA 4OAVB 3PP1A 5CU2A 5IQFA 4BGQA 4CT2A 2ZOQA 4ALUA 1YI4A 3WIKA 3ACKA 2OJIA 3BV3A 4FG8A 4ZJVA 1JKTA 2WTDA 3CE3A 3OC1A 3QTZA 5M57A 2PVFA 5KKRB 3DZOA 4R7IA 4QP3A 1CMKE 2EU9A 3S3IA 3IDBA 4EOKA 5HO7A 4C4JA 3M11A 5T6KA 4D0XA 4I6FA 4W4YA 1STCE 2UVXA 4UXQA 3UC3A 4ZY6A 4YJSA 1SM2A 4BI2A 4JT3A 2F2CB 3D0EA 4WRSA 4A9RA 2CSNA 4G1WA 3F9NA 5A6NA 2Y9QA 3VBYA 2VNYA 4A7CA 2GHLA 5L3AA 4ORKA 3LXNA 5HTCA 2YM5A 1NVSA 4FICA 3SXFA 3TZ7A 4E93A 1R39A 3PDTA 2HELA 4AA5A 2J9MA 2VO7A 3TJDA 5CF5A 1YI6A 2B1PA 3A8WA 2Y6OA 4LOQA 4E6AA 4EK3A 2BDFA 3EQPA 3FMKA 4FTUA 4EOSA 5AX3A 2R0IA 4P7EA 3QD2B 4O22A 4XG7A 3MA6A 5K9IA 5CVGA 5FP6A 4AXAA 4Z3VA 2JDVA 4ZZNA 1OGUA 2PHKA 2YDKA 3ORTA 3UMWA 3UOKA 3GC0A 3HP2A 4PMTA 4TYEA 5K5NA 3TNIA 4OTPA 4ANNA 5IDNA 4K8AA 3HDMA 3IDPA 3R28A 2ITOA 3OWJA 3VN9A 4LG4A 3MH0A 4IB5A 2Z60A 4OTRA 4BTFA 4O7NA 4GRBA 2W05A 4WBBB 1RDQE 5TT7A 1A9UA 3EQGA 3SG9A 4BIBA 1KE9A 4FYOA 2YACA 1PXIA 2QG5A 3FMEA 3Q4UA 4TNBA 5HGIA 3NUXA 1PKGA 1K2PA 2J2IB 4NM5A 5EHYA 3QQGA 2Z2WA 3P4KA 4EKKA 3RK5A 1Q3DA 1FMOE 2YM8A 3F5XA 4NTSA 4U3YA 3UO4A 2R5TA 3RWPA 3I1AA 4O0YA 2BKZA 1PF8A 2PVHA 4LI5A 4FTIA 1H1RA 4F1MA 5DA3A 5EDRA 2X39A 4FG7A 4QRCA 3ORMA 2Y4IB 5CZHA 5AAFA 4BCPA 1H4LA 2BTSA 4DGNA 1SZMA 5JGDA 3H9FA 3CS9A 4FSRA 4YBKA 4EOLA 1DM2A 2BDWA 2CNVA 3KCKA 4II5A 3COKA 3RI1A 4GK4A 1E9HA 2PE0A 3R7UA 1Y8YA 1GIJA 4BTMA 4OLIA 3K3JA 1IAHA 4QNYA 2QOFA 4KKHA 4JQ7A 5IKWA 4DA5A 4NU1A 3E7OA 1KSWA 1ZMUA 1PMEA 4YZNA 5KO1A 3GOPA 3VNTA 3AD5A 4AT5A 3Q9XA 2J0KA 2Y8OA 3W2CA 3NNXA 3ZBFA 4F63A 3HMPA 1ND4A 4F7NA 5CXZA 2GU8A 2WPAA 4F9CA 3CIKA 3LMHA 4NEUA 3UGCA 5IA5A 2XCHA 3W18A 4H1MA 2R9SA 3FDNA 3HA6A 2OICA 3HMMA 4FNZA 1VYWA 2VGOA 3P5KA 3TN8A 2YIQA 1Q4LA 2GHMA 4RGJA 2FUMA 3ZMMA 5HQ0A 3GC7A 4Y8DA 3W8QA 3CKXA 2QCSA 3WE4A 5JQ8A 4KUJA 4HGTA 4RJ6A 4UY9A 4YHFA 4KA3A 4FOBA 4IVDA 1J91A 4O7VA 5JZJA 5CAUA 1JLUE 1J7LA 1R3CA 4U97A 5ETFA 2OJ9A 3M2WA 1FQ1B 3A8XA 3PXQA 4ZTNA 5JSMA 5D41A 3DCVA 3UO6A 2NRUA 4DFXE 3MB6A 3LFAA 4YJNA 5H8EA 4ZP5A 3NZ0A 4XV3A 2H8HA 4XG4A 5DNRA 3A7IA 5M51A 3RALA 2IW9A 2XKDA 3UPZA 1JNKA 5CEIA 3MDYA 2ZB1A 1QPJA 4MCVA 3VQUA 4WKQA 4WD5A 4APPA 3QFVA 4EK5A 2FB8A 5D11A 2UW0A 4J97A 2VWBA 3D15A 2ITQA 1H08A 2PULA 3R30A 4AZWA 5HU3A 1BI7A 4LMNA 3PJ1A 5GIOE 5C26A 3QTIA 1RE8A 4NTTA 4C3RA 5E1EA 3DTCA 3KL8A 4F09A 5E1SA 3RAIA 4FKRA 1J1BA 4IH8A 4W4XA 3Q3BA 2W1CA 2RG5A 1OB3A 5FBOA 3NYXA 4ANLA 3CLYA 2XEYA 3LJ0A 3O8UA 4FX3A 1M17A 4RIXB 5HCZA 3P7AA 4IWQA 3IDCA 1SNXA 3OT8A 2OO8X 5TE0A 4GU6A 5FEDA 4B9DA 4C37A 3VHKA 3QLGA 4XG8A 2G2HA 4MXAA 3PIXA 2V7AA 4FTLA 1UU9A 5E8WA 5I9ZA 5J7BA 2B53A 4JX7A 3QQHA 4IZ7A 4PDPA 3P7CA 3BQRA 4D58A 4M84A 5AUWA 4F6SA 3PZEA 3WZDA 4C2VA 3W33A 2X2KA 3OOMA 3C1XA 4Q5EA 1YHVA 3COIA 2GNFA 3V5QA 5KMKA 4DEEA 3GNIB 2J90A 3QD4A 4QMWA 2XNNA 1P14A 3HYHA 3BYMA 4LQMA 1U54A 2J51A 5CALA 4F1OA 2F7EE 5GJDA 4Y83A 5HG8A 1BKXA 4YZDA 4AT4A 3ZO1A 4FVQA 3P1AA 1O9UA 5K3YA 3N4TA 4XBRA 2IPXA 4Q5HA 3QRJA 1Y6BA 2YZAA 4QD6A 4I93A 3QCXA 5LVPA 2C5VA 3PJ3A 4RVKA 3OXZA 3IK3A 4TPTA 4TYGA 1FPUA 4LRMA 2R7IA 3CSVA 2X2LA 3RPYA 5DG5A 3T8OA 1OL5A 3BWJA 5J95A 3S95A 2W06A 4X3FC 2OKRA 2JFLA 4EK4A 5L2TA 2X2MA 1W83A 3LM0A 3OY3A 4FSTA 4OTWA 5ACBC 4ARKA 4AGUA 2C6MA 2CJMA 5CLPA 2C4GA 5CEOA 3VS4A 1OIQA 4H36A 4LOPA 1H26A 5KCVA 4L8MA 4LL5A 2OXYA 4KIOA 2PVKA 4RX8A 4TWPA 4F4PA 2HK5A 4KIQA 4FSMA 4USEA 4AAAA 4EWHA 2GQSA 3WZEA 5LXMA 2WTWA 1Z9XA 2P2HA 2RGPA 3OCTA 1WVYA 1AQ1A 4APCA 4EQCA 4G2FA 3OZ6A 3R7EA 4CFVA 1JOWB 4MF1A 3D94A 4DFNA 3UZRA 5A4QA 1UNLA 1ZWSA 2I6LA 2IZUA 3KRLA 2IWIA 3KFAA 4ZSAA 2QOLA 5HBHA 3LKMA 3KU2A 5EW3A 4F6UA 2VWWA 2EVAA 4IHPA 3LMIA 2C6LA 3EH9A 3Q9ZA 4EHGA 4CQEA 5BVOA 4FL3A 4CSVA 4OBQA 3QD3A 2O0UA 3LAUA 2V0DA 2F4JA 1KOBA 3K5VA 3CGOA 1OUKA 3PA5A 5D10A 2BMCA 2CPKE 5BVEA 3ZCLA 3OUNB 4ZS0A 5DEWA 4XX9A 3U9NA 3VVHA 3EQRA 4ASZA 1CM8A 4GFGA 5EYKA 3QUEA 2AUHA 1Q97A 5CX9A 3K3IA 3WILA 5AP3A 2B52A 3QRUA 2ZM4A 1H1WA 4X6QC 3QXOA 4O1OA 3E5AA 3WOWA 3EN9A 3MY0A 3MFRA 2VTIA 5IZFA 3ZSIA 3L9PA 3TZMA 5AUUA 5FXRA 4BDIA 3MW1A 2EWAA 5HZNA 2OH0E 3TL8A 4D1ZA 3I5ZA 5DWRA 3HKOA 4O83A 5JEBA 3GOKA 3IG7A 3JY9A 5EI2A 4ZTQA 4G6NA 3U6HA 3HV7A 1YKRA 2FSLX 2BDJA 5I5ZA 4O7RA 4GUBA 5HD7A 4TYHA 3RHXA 2C5YA 2VUWA 5AWMA 4I4FA 4I6QA 5C27A 3RP9A 4CCUA 3JS2A 2CHLA 3E63A 3DB6A 1PYXA 4DHFA 5E4HA 3DAEA 4BWXA 3QBNA 3PG3A 1E1XA 5HE1A 3B8QA 2FSMX 2R0UA 3E7VA 4IAFA 1TQMA 4MNFA 1YQJA 5HE3A 4XUFA 4RX9A 4AZEA 5IEXA 5HKMA 5DIAA 1WBNA 5LQFA 2QURA 2XBAA 4RVMA 1FGKA 5IA0A 4KS8A 2F9GA 3TNPC 4QP2A 5DVRA 3BHTA 3JVRA 4XHKB 4BTKA 1FBNA 4F9AA 3LIJA 4F7SA 3LLAA 1PRYA 2VU3A 3ZTXA 4QP1A 2V7OA 4U81A 3TXOA 4YC8A 3M1SA 3L1SA 2QR8A 5IISA 4KRDA 2HW7A 3R8LA 5J9YA 2UZUE 4O0WA 3DLSA 1W8CA 5B0XA 4FV3A 2CDZA 2CCHA 3EQBA 2I0YA 1WAKA 2XJ1A 4S32A 4TRLA 4BDGA 4E6CA 4EHVA 2Z7QA 4G17A 4R3PA 4KBKA 5FG8A 5M4CA 1A48A 2CGWA 2CKQA 2PVLA 3VAPA 2AC3A 3C5UA 2QNJA 2JFMA 3D2IA 4PL5A 4RFMA 3ZDIA 2OLCA 3KF4A 2BZJA 4FZ7A 1TQPA 3I0QA 4GJ3A 3D9VA 3GEQA 2QG7A 2WEVA 4AW2A 4HPUE 3NW6A 5DPVA 5EYDA 2RFSA 4X2FA 4XV9A 4NIFB 1JVPP 2H34A 4EJNA 4KSQA 4NFMA 4QMLA 3MN3A 3O17A 3Q2MA 4F9YA 2C5XA 3NAXA 3MFTA 5CF6A 3MV5A 3SX9A 5IQHA 1Q62A 2B54A 1HCKA 4RQVA 2ZMCA 2IW6A 4H3QA 3ODYX 2EUFB 2J5EA 2C3KA 1UNGA 2Y7JA 4ZJIA 2QC6A 3R8MA 4CMOA 4TNDA 4MXXA 4E1ZA 2C3JA 4J96A 1XH6A 3TV6A 4HYIA 3PIZA 2XYUA 1DAWA 3RCJA 1QPCA 3T3UA 5C1QB 2BHHA 2WB8A 2XK4A 2Z02A 5CTPA 4CZYB 3PXRA 4DH7A 2XRWA 1M2RA 4ALVA 2WOTA 4FZDB 1YOMA 5ETCA 2F57A 3SC1A 4QYYA 3AG9A 2ITVA 4E4MA 4DG3E 2Z7SA 4O86A 4J1RA 1Q24A 5GIPE 4B8MA 5AV0A 4O2PA 2XCKA 1REJA 4HZRA 4K0YA 5TF9A 4D55A 3VWAA 3CBLA 4H58A 3QCSA 3OFMA 4U3ZA 4QP6A 1MQ4A 2PYWA 2UZNA 3T3VA 2XIZA 3V5JA 2YAKA 3CR0A 4IVBA 3ZRMA 4YBJA 4HGSA 4L53A 4PX6A 5DR2A 4NWMA 2RFDA 3RPVA 4G5PA 1Q8TA 3EL8A 4M68A 4AOJA 4GYGA 5K0XA 4C4EA 4AE9A 2O3PA 4JL9A 2XZSA 3TZ8A 3ULIA 5AR3A 4C4IA 4XLIA 4DEHA 2VTNA 4H1JA 1CDKA 2GPHA 4IAKA 3C4EA 4YJPA 4GT3A 4MNEA 4DEBA 5JH6A 3RPOA 3NDMA 5FTOA 4HGEA 3BLQA 4L3PA 3ZSGA 3JXWA 4XG2A 4XV1A 3AOXA 4WNKA 4R7BA 3TACA 3DGKA 2X6EA 3D5XA 2YJSA 2YERA 3KXMA 4EH3A 3NIZA 4UMRA 1W98A 4PDSA 2A4LA 4BBMA 2X8IA 4QQJA 5J5SA 2YDJA 4R77A 2LGCA 2WTJA 4RJ8A 5HBJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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