3DAKA

Crystal structure of domain-swapped osr1 kinase domain
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
290
structure length
279
Chain Sequence
SALPWSINRDDYELQEVIGSGATAVVQAAYCAPKKEKVAIKRINLEKCQTSMDELLKEIQAMSQCHHPNIVSYYTSFVVKDELWLVMKLLSGGSVLDIIKHIVAKGEHKSGVLDESTIATILREVLEGLEYLHKNGQIHRDVKAGNILLGEDGSVQIADFGVSAFLATGGVGTPCWMAPEVMEQVRGYDFKADIWSFGITAIELATGAAPYHKYPPMKVLMLTLQNDPPSLETGVQDKEMLKKYGKSFRKMISLCLQKDPEKRPTAAELLRHKFFQKAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of domain-swapped STE20 OSR1 kinase domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase OSR1
total genus 85
structure length 279
sequence length 290
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3dakA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3dakA01
1PMNA 4RA5A 4KAOA 4FTAA 3EN4A 3LPBA 2QKRA 4KRCA 5CASA 5E4HA 3RI1A 5I9ZA 4QQCA 2W99B 5DT3A 4O21A 4D28A 3DKOA 3NW6A 5AV4A 2QCSA 2PSQA 3GOKA 4ZK5A 2OJ9A 4ZTSA 4ZSGA 2C6MA 4C3PA 2X1NA 2PE2A 2FO0A 3JUHA 2F2UA 5HHWA 1KV1A 4IAFA 4O27B 3NZ0A 3FC1X 2E9OA 3GU7A 4BIEA 4FK6A 3RAWA 1V0PA 5E1SA 3ZBFA 4MKCA 2UZEA 2PMIA 1WBSA 1LPUA 2J5EA 4Z7HA 5AUWA 5FDXA 3PP1A 2J90A 3ZXTA 3CCNA 4FOBA 2CLXA 2YEXA 1RE8A 5IA3A 3G51A 3Q4CA 2GTNA 2CGWA 4YJSA 1F0QA 4ALUA 5FTGA 3F82A 2Y6MA 2OH4A 5T3QA 3IONA 1PF8A 1ZRZA 2XNBA 4ARKA 2PU8A 4JT3A 4CCBA 3BYVA 3I4BA 4WO5A 2ZB1A 2VNYA 4RIWB 4F9AA 1H27A 1Q8YA 3UVPA 3KGAA 5FM3A 3RAIA 3Q2JA 4E4MA 5LMAA 2C1BA 2I0EA 2XVDA 4GT5A 4W9XA 5FG8A 4CMTA 2Y9QA 4RX9A 2UW3A 3R8VA 3W2PA 3DK6A 1PXMA 3L9NA 3QD2B 4NM5A 5ANIA 4GG7A 4B6LA 4BYIA 5K9IA 1H24A 4XRJA 3BWFA 2BCJA 3MH2A 1EH4A 3FDNA 4FTLA 1NW1A 2A19B 4FV0A 4GK4A 5EHLA 1UWJA 5CENA 4AZEA 3HAVA 5EG3A 4QP9A 4O0VA 4X2GA 3QTIA 1DM2A 1ZOGA 4TNDA 4KUJA 4QYYA 5JRQA 3KKVA 4F0FA 4MHAA 3TWJA 4C2WA 4JX7A 2J2IB 3DB8A 2HWPA 3DNDA 4RWIA 4G17A 1VYZA 3FMLA 1M7NA 4XOYA 4QNYA 3BHTA 3HLLA 5AP1A 4BB4A 3ACJA 2AUHA 4AGDA 2FGIA 3FMJA 3NCZA 3G33A 4FIHA 3MY0A 5HCZA 2GSFA 4NFNA 4DEGA 2OZAA 5JEBA 5E8SA 2XNOA 2PVFA 3LE6A 5K4JA 5LVOA 4L68A 4YURA 4KIQA 4ZEGA 3MVLA 1CMKE 1PKGA 3EFKA 1IR3A 2XIYA 4J71A 4D0XA 2KTYA 2J0IA 2C6TA 1WAKA 3IG7A 4YNOA 1XH8A 5KMJA 3TDVA 4IC7A 5FXRA 2WTJA 2BHHA 4FGBA 4DFXE 2J50A 4LL0A 4XG6A 2QU5A 3LKMA 3UIUA 3IOPA 3GI3A 4GYIA 2E2BA 3VS3A 4D2VA 1GZNA 3OOMA 5AR5A 5DEWA 3V5JA 2X9EA 2R0UA 5J79A 2IPXA 4YC6A 4O6LA 1NY3A 1G3NA 4C57A 3QQGA 4DGLC 2WPAA 4WBOA 4D4VA 3ROYA 3AXWA 4CV8A 3FMEA 4IJ9A 4C62A 4YNEA 3EQBA 4YJOA 1ZOHA 3OCSA 2R3MA 3RMFA 1M7QA 5CX9A 3NUSA 2Z02A 3AT4A 4QP2A 4WUNA 2YABA 5BYLA 4UYNA 1UKHA 2C0OA 3FXXA 4NIFA 5ANGA 5M4UA 4MYGA 3MV5A 4WNMA 3LMIA 1UKIA 3W55A 4PNKA 5E8UA 4I22A 1PYXA 2VTHA 2HOGA 4M84A 5HG8A 4R3RA 3VUGA 1W0XC 4X6RA 4Q2AA 3R7EA 3VJOA 4L43A 3F3UA 4DGOA 5LMKA 3ZLYA 4KKGA 3CIKA 3D5VA 3OWLA 4UB7A 5DRDA 3MY1A 4F1OA 3U87A 1FINA 2OXDA 2WGJA 4DBXA 1XWSA 3SC1A 4I3ZA 4ANQA 1MP8A 3I0OA 5CLPA 2VN9A 1OKYA 4FYNA 4AX8A 4EBVA 3C0IA 4I0RA 2W1GA 4JVGA 4Y5QA 1YWRA 5L2SA 1GZOA 1IA9A 1JLUE 2J7TA 3PPZA 5B2KA 3TNPC 4FT7A 3ODZX 3RP9A 2P2IA 3EYHA 4RC3A 3HGKA 3DU8A 4CKJA 2C0TA 3A99A 3RPSA 2FH9A 4G6NA 1ZYLA 3P4KA 4BKZA 2OI4X 1DI9A 3GFWA 1SM2A 1ZYDA 2V7AA 2XBAA 3AC5A 4KS8A 4PPBA 3SXSA 3TNWA 4F7LA 4YSJA 4KKHA 5FD2A 4FV8A 5G1XA 4W9WA 3PG3A 2I1MA 4EOJA 5BMMA 4D5KA 5AUUA 1E1XA 1Y91A 2R3JA 5EKNA 3VULA 4EONA 5DRBA 1NVQA 3ZU7A 4HVHA 3ZO2A 3FZSA 3BBTB 4IFCA 5L4QA 2W9ZB 2ZDTA 3E7VA 2YCRA 3ID6C 2RL5A 4HVIA 4ERKA 3C9WA 5F94A 3TIYA 3QGWA 5A6OA 4I20A 3Q9YA 1WZYA 5DA3A 4CGAA 3F7ZA 4N70A 5FP5A 3RZFA 4AG8A 4BR3A 2YDJA 3MH3A 5H2UA 3RCDA 3RK9A 3VS2A 3ZOSA 4CG8A 4H1JA 3ZUTA 1Z5MA 3OD6X 5BVWA 3QWKA 3MYGA 4D2RA 4FIIA 3VS6A 4WRSA 3SKCA 2W17A 2F57A 3DV3A 1J7LA 4WSQA 1JKKA 2WMTA 2IG7A 4UEUA 4CYJA 4AW2A 1YXSA 5HNBA 5LXMA 4MBLA 5AWMA 1U59A 4D4SA 4EH5A 1U54A 2PUIA 2PVJA 4WOVA 2HK5A 2UV2A 3CXWA 3DAEA 4MCVA 1OL2A 2YJSA 4FV9A 3JY9A 4LMUA 4PL3A 2ITUA 4QMWA 5ETAA 4EWQA 3F66A 2YM8A 3AC2A 3QD4A 5DG5A 4BDBA 4N57A 4C7TA 3UZRA 1OI9A 2R4BA 1Q8WA 2QG7A 5FEEA 3QQJA 4IW0A 2GNFA 3GCPA 3Q60A 2QKWB 4I1ZA 4XEYA 3UE4A 5HTIA 1ZXEA 2DWBA 2VUWA 2IZSA 3O8UA 4YJQA 3WZDA 3N4UA 2CNQA 2W4OA 2WXVA 2BTRA 4FKUA 5A4EA 5C1QB 2GTMA 3DT1A 2C5XA 4HYIA 3MA3A 3PSCA 4USFA 5IUHA 3QRTA 2R5TA 2W1FA 3DKFA 3OEZA 3L9MA 1WBPA 3T8OA 4NH1A 1FQ1B 1J7UA 5EQEA 3OS3A 2UW8A 4AA0A 2QC6A 3R71A 4HGSA 4KSQA 4IHPA 4EQMA 5KKRC 1UWHA 2XKEA 4GH2A 1GY3A 2UW0A 3PSBA 4NJ3A 4TW9A 2C0IA 3JPVA 3QXPA 4X2FA 4O83A 4ZS4A 3AQVA 2WD1A 2YHVA 4C4FA 2FUMA 3OF0A 3EQIA 4A9SA 5DFPA 3PA5A 4WT6A 4GU9A 2BKKA 5GJGA 1FVTA 1QPEA 3OTVA 2G15A 4LUDA 4GEOA 5E90A 4DG0E 5AIKA 4E8AA 5ITAA 1JAMA 4EK5A 5LCKA 4IX4A 1P5EA 2Z2WA 2QOHA 3QD0A 4RC2A 3UNJA 4C3FA 4A9YA 1U5RA 2W9FB 3CY2A 2WFYA 5EM8A 4Z9LA 1E1VA 1JKLA 3N4VA 4K2RA 1RJBA 5J9YA 1KOAA 5HG9A 2QOLA 3CLYA 3PUPA 4U40A 5A14A 3HV7A 1Q5KA 5HVJA 3WE4A 5EYCA 3WZKA 4BTJA 3OEFX 3VBWA 1U5QA 3ANQA 4G3CA 5CZIA 3BEGA 1BX6A 5ANJA 5CTPA 4RIWA 3FMNA 2CJMA 3R9OA 2WQOA 4C4GA 2YJRA 3G6GA 3OBJA 4QMPA 5IH5A 2OF2A 5AP2A 5J5TA 4QMOA 5ANKA 2PMOX 3TACA 2IZTA 4RFYA 3NCGA 4RIYA 3O0GA 5CU2A 3ZFXA 1XKKA 1LEZA 3MVMA 3AMAA 4D9TA 3P0MA 3QX2A 4FZ7A 4G16A 2R3QA 5C8MA 4ANLA 2OIBA 5CU0A 4D2PA 3L9LA 3QTWA 2VTTA 3F2AA 3OT8A 4IWDA 3NNUA 3RNIA 3CTHA 3ALOA 1CKJA 4MWIA 5EHYA 3H30A 4IDTA 2GQGA 3QFVA 5KHXA 4MF0A 2O0UA 4O1PA 3VRYA 2QVSE 3SG9A 3UC4A 3NNXA 3V5PA 4JL9A 5ANDA 5HQ0A 2ITTA 2VWZA 4ZLOA 3Q3BA 2GS2A 3NIEA 4A9RA 4IWQA 4RJ5A 2X4ZA 2ZMDA 4ZTNA 3SRVA 3ZCLA 4PQNA 4MAOA 4R3PA 4HOKA 2JDOA 2W1CA 3H9RA 3P7BA 4TWOA 4AT5A 4EWHA 5M4CA 2PZ5A 3W8QA 3MFUA 4MXOA 4NKSA 4OTRA 5HE1A 4TPTA 1M2QA 3PDTA 1Q3DA 5EFQA 5I9WA 4CG9A 1YOJA 3PZEA 1P4FA 4GCJA 4RGJA 3KN5A 4FZDB 3IKAA 3PRIA 3QCYA 3A60A 2CGVA 4I6BA 4F0IA 3TUDA 3HA8A 5M44A 3HX4A 3OMVA 3P7CA 4AUAA 1OBGA 2JFMA 5HD4A 3NUXA 4FT3A 4WSYA 4C35A 2WEIA 3EMGA 4U45A 4DEIA 2J51A 3IW6A 5AUVA 5L6WL 1ATPE 3FQEA 4R77A 3D5XA 4WNOA 4BBMA 3EFWA 4XG9A 5KMKA 5HLWA 3BGZA 5AM6A 2C5NA 5HG7A 2WMWA 2SRCA 2JAMA 4GU6A 2CNUA 4FG9A 3W2RA 4L7SA 1P2AA 1M14A 2J0LA 4JG6A 4QP4A 3N4TA 2WQEA 5AV3A 5H8GA 3VF9A 4DTAA 4XNEA 3HV4A 3MI9A 2UW6A 5FWKK 3C4CA 3LCOA 3ALNA 4OTWA 4EJNA 5BQ0A 3UZTA 1VYWA 3N51A 3KMUA 4X2JA 2CKPA 2I0YA 3IECA 5CI7A 4BDDA 4JQ8A 5DVRA 2B53A 5AEPA 5ACBC 3JY0A 4D1SA 1URWA 3TKHA 1NVRA 4C4HA 4QMVA 3U4WA 4ZJVA 1H25A 4KBCA 3GBZA 3WARA 2BRBA 5CNOA 5HE0A 2RG5A 2GFSA 2JKMA 3DLSA 4XP3A 5C9CA 1VZOA 1R0PA 5D10A 2PZIA 3VBXA 3MESA 3SOCA 3IOKA 4GL9A 5EW8A 4LOOA 3H9FA 2B55A 4BCPA 2CGXA 4BCMA 2UZBA 4GFMA 3H10A 4IZ7A 3R2YA 4M12A 3BQRA 5AJQA 1QMZA 5CT0A 3D7TB 2JITA 2WQNA 4DT8A 4O38A 4AOTA 3QRUA 4BGQA 3FHIA 5JQ5A 5HKMA 1TQMA 3O7LD 2XEZA 5C01A 5CEKA 1B38A 2W4JA 3ZFYA 1OPLA 5JQ8A 3I5NA 4ZLZA 4BBEA 4FEUA 2H9VA 3ATTA 2ZM1A 5CS6A 4FSQA 3NNVA 4NJDA 4QP7A 5LQFA 2PZRA 4N0SA 4V04A 5B2LA 4NUSA 3C4WA 5EYKA 2C5YA 3PJ3A 4FL3A 2PHKA 4OR5A 4RVLA 5HU9A 4D1XA 5EQPA 4JI9A 1IRKA 3QGYA 4AAAA 3E87A 4JLCA 1W83A 1PXPA 3BLHA 3BGQA 4GKIA 5JGDA 3WF9A 3EQCA 1VEBA 4L9IA 4FKWA 3F7WA 4YJNA 1U4DA 3BV2A 4M69B 3C7QA 5CEIA 5L2TA 1WMKA 1AD5A 4FTIA 3GXLA 1DS5A 4IM3A 4XMOA 5EKOA 2RFDA 3QTRA 2BZKB 5CZHA 4Z7GA 3LAUA 3TM0A 3PE2A 3GENA 3R1SA 1WBWA 1J1CA 1BL7A 2WZJA 4ITIA 3DAKA 4WG5A 4UMUA 3U8WA 2AYPA 1OBDA 2HIWA 3IDBA 4H58A 5LMKC 2EXCX 1PXKA 2Z8CA 3DS6A 3ELJA 2XKCA 3W32A 3KXXA 1Q41A 3BIZA 3HMNA 4ZJIA 3WZEA 4C4JA 4F7NA 3DJ5A 1KE7A 2OKRA 4L53A 3KF4A 2Q83A 3TN8A 3VQUA 3EZVA 4ZY5A 3H0ZA 2ITPA 3RCJA 1Y6BA 5D9HA 5J1WA 3CPBA 4O86A 4GVJA 4XV3A 3QQKA 4CMOA 4A4OA 1XHAA 4CZTA 3UDBA 3MJ2A 1NA7A 2CCIA 3ORTA 4FL1A 4L3PA 3P7AA 5L2QA 4YMJA 2YAAA 2C3JA 1K9AA 1UU8A 2CPKE 2OO8X 3E88A 4C0TA 5HO8A 4ZAUA 5IQDA 4EK6A 1A06A 4YJTA 4FV4A 4XS2A 2VWIA 2R64A 3AMBA 3PIYA 5KNJA 2X4FA 3DXQA 3GP0A 2X9FA 4ACGA 2C69A 5GIPE 2G2HA 2J6MA 3O71A 4IAKA 4JBQA 3H0YA 4QMTA 1W84A 4EQCA 4WNPA 1OGUA 5H8BA 2YM4A 2F7ZE 3MIYA 3GCSA 3P23A 4TY1A 3KFAA 2VGPA 4BCKA 2VWUA 2RGPA 2WTDA 5HO6A 2BAKA 3R7IA 4AU8A 5BNJA 3A4PA 3HDNA 3FY2A 1LUFA 5EW9A 4E7WA 2Y6OA 4CEGA 3CTQA 1V1KA 5D7AA 4NM3A 3EJ1A 5L6OA 3RPRA 1FMKA 1OB3A 3R7YA 4OAVB 4GSBA 3KN6A 1SNXA 4AE9A 3UNKA 2C4GA 4MEDA 1CM8A 4PWNA 1ZYCA 4ZZMA 5I9VA 4AN3A 1YDSE 1HCKA 2R3PA 4FSMA 4CXAA 4EOIA 4NKAA 3RK5A 3PVBA 2F49A 3ENMA 3PLSA 4BDCA 4DH3A 3NNWA 4G5JA 2XM8A 3LLTA 3TXOA 2BDWA 4NWMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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