3DK3A

Crystal structure of mutant abl kinase domain in complex with small molecule fragment
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
270
structure length
266
Chain Sequence
DKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVSAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTFTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDPSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESSI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of mutant ABL kinase domain in complex with small molecule fragment
rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ABL1
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 87
structure length 266
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3dk3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3dk3A01
4RIWB 1Q8TA 3NS9A 4ALUA 4JX3A 3ZRKA 4CFMA 1CDKA 4WA9A 5DWRA 1MUOA 3CTJA 2JGZA 2XKFA 5CF4A 5JFSA 3OEZA 1G5SA 2QHMA 3R01A 4EOSA 3JY9A 2NP8A 3LCTA 2F9GA 3ORZA 4AOTA 4D2VA 5CASA 5AM7A 5HG8A 4C3FA 4L00A 5FM3A 4D9TA 4G1WA 3WF8A 2J0KA 5GHVA 2JDVA 1BKXA 2BZJA 3FMNA 2PZIA 2X2MA 3EFWA 4IB0A 4Y85A 3ETAA 1OIUA 4WRGA 3U8WA 3MFRA 3NW5A 2VGOA 4BGGA 3BX5A 1DAWA 1GZ8A 2C68A 1YOLA 3MVJA 3A4PA 5GIPE 4FNYA 5DEYA 2XKDA 3DFCB 5FEQA 3W2RA 2ZDTA 4AT5A 2ETRA 4FC0A 5B7VA 4MF0A 4Y8DA 4IDTA 4KB8A 3QQGA 3HRBA 3R04A 3MI9A 4NFNA 3KULA 3C4EA 3D5VA 2ITVA 4ZJIA 3TWJA 3U6IA 3ORTA 2HWPA 2X0GA 4BVUA 2OG8A 5L8JA 3BWFA 4FEXA 1WCCA 4QQ5A 2ZMCA 4ZTSA 4D5KA 2QU5A 2YZLA 3QRKA 4QP7A 3DKCA 2ZYBA 3UO4A 2UV2A 3BE9A 4U81A 2G2HA 3E88A 3VHKA 3FLNC 4YNEA 4MXAA 5CEQA 3IDCA 4GUEA 4O96A 2G1TA 3ZXTA 4W4VA 3FMEA 3PJ1A 3UTOA 3ID6C 4ZLYA 2XIYA 4I4FA 3DBDA 3IW8A 3NGAA 4C8BA 1W82A 1YWVA 2Y9QA 1MQBA 3F3ZA 3F2RA 4NJ3A 4QYEA 3ZDUA 4MQ2A 2WQEA 5AV4A 1REJA 2P0CA 3AMBA 4GK4A 3MVMA 4QP3A 3RGFA 4U9AA 3LMIA 1KV2A 5M4CA 3BYOA 2R3LA 3EN9A 3WI6A 3EYGA 4YJRA 1U5QA 2UZWE 2B1PA 2ZV8A 3OWKA 2PY3A 4FSWA 5JH6A 2R7IA 2OJFE 3LLAA 4ZTNA 3GQLA 2WMTA 2C3LA 2XK7A 3FZRA 2ITWA 4L3JA 4D1ZA 1O6LA 4BDHA 3QTXA 3R9NA 1Q8YA 2ITOA 4YHJA 5KNJA 4UWYA 4ZS4A 3ZSGA 1URWA 3HV7A 1YOJA 3KC3A 4PPAA 3FI8A 2J90A 2R3KA 1ZARA 4QMSA 3UMXA 2FSMX 2OWBA 4H3QA 3G0EA 2YAKA 1KOBA 4ITIA 1U59A 3BEAA 3DK7A 5ANGA 3ZO2A 3TV7A 4GUBA 5JMSA 3TN8A 4BR3A 3PWDA 3E3BX 2VTHA 3I0OA 5AR4A 4F6SA 2IVTA 5BPYA 4D1XA 2UUEA 2B0QA 2C69A 1FVVA 4EHEA 4UY9A 2BFXA 3OD6X 2CGUA 4M69A 3FXXA 4RWKA 4XS2A 3ZZEA 5BVFA 2HXQA 3QZGA 4K11A 3ZFYA 4M67A 1Y6AA 3E3PA 4RC4A 5DIAA 5IH4A 3U6JA 2X4ZA 2ZM1A 3QTQA 2AC5A 5HOAA 4E73A 4DH5A 4WG4A 3EOCA 1JSUA 4D2RA 4MNEB 3EN6A 2HELA 2R3RA 4MF1A 2ZAZA 2XKCA 3IS5A 5LWNA 1JOWB 4AT3A 1NT2A 3GCVA 3R8MA 5IQIA 1NVQA 2RFSA 3RHXA 4QMOA 2RGPA 4KKHA 5CTPA 4C02A 4C59A 3A99A 3PFQA 4MVFA 3W16A 3UNKA 3SQQA 4DHFA 4QO9A 3QRUA 1QPJA 3TG1A 3PXQA 4FL2A 4ZZMA 3LHJA 3QKLA 3SDJA 3NNWA 3BQRA 3OC1A 2UW0A 2PZRA 4UYAA 3JUHA 2J6MA 3UOHA 1LUFA 3GQIA 4ZP5A 4R8QA 3VJOA 3I0QA 3DB8A 3ANRA 3LCDA 3Q6UA 2BIKB 4IDVA 4IW0A 4FV8A 4RZVA 3MPMA 4U7ZA 5DG5A 3DT1A 4FOBA 5EW3A 5LMBA 4FG7A 4IM3A 5BVDA 3K5UA 5E8SA 1GIJA 3ORXA 4GVJA 3SW7A 3I7BA 3ZO4A 2BDWA 2W9FB 3F5PA 4S30A 3FYJX 3EIDA 4D9UA 4HVGA 4EKLA 4OW8A 4USFA 2YDJA 4BIDA 3JXWA 1GZOA 2GDOA 3PY3A 1UU3A 3KK8A 2O3PA 3QTRA 3IW7A 3V5QA 1OM1A 1GAGA 2R3MA 4BKZA 3O17A 3QWJA 4JIAA 2PMIA 4EOPA 3S4QA 2DYLA 3ITZA 3MTLA 3WZEA 3V5PA 5K5NA 5DT3A 2JIIA 3P08A 1H25A 3B8RA 4AAAA 5CAQA 3UE4A 1J91A 4FUYA 5EDQA 4EH9A 4RJ8A 3LVPA 2F7EE 3W2PA 3GB2A 5E8ZA 3ZRMA 3C9WA 4BDGA 4FA2A 2C3JA 3FZSA 2OFVA 4AZFA 4V0GB 2J0JA 3KXMA 4JDJA 4C4JA 5HLWA 5GJGA 2FYSA 4AA5A 4EL9A 1Q97A 2IWIA 3U6HA 2BKKA 3F3TA 3PTGA 4I6BA 2VTOA 2RFNA 3AOXA 4J8MA 4RJ6A 5M4IA 4XCUA 1YQJA 2YM4A 3R7EA 3R7UA 3ZC5A 4EUUA 3HV6A 4FYNA 4YO6A 4AQCA 3MY5A 3A7FA 3Q60A 4XV9A 3ZLYA 5AUTA 3EB0A 3VWAA 5KMJA 4XV3A 3UODA 2C6DA 3NWWA 4NKAA 4X2JA 3MWUA 3E92A 4FICA 1IA8A 2A27A 3DJ7A 3L8PA 1YW2A 4I0TA 4LUEA 4QYGA 1XH4A 2Q0NA 2UW9A 3EQGA 3LZBA 4XOZA 2ERKA 2YIYA 5CI7A 5HCZA 4FEWA 3M2WA 3RKBA 4CKJA 2WTJA 5DGZA 3QQJA 5KBRA 2XKEA 1IASA 4NUSA 2X4FA 3UO6A 5KMKA 1WVYA 4D0WA 5J9LA 2GMXA 4X3FB 4GCJA 2IVVA 2WMWA 2IJMA 4WIHA 3HLLA 3TIYA 2Y0AA 3U4WA 2BIYA 2NO3A 2GNIA 2PZPA 3VS3A 4C3PA 4KS8A 3UNJA 4CG9A 4ASDA 1K3AA 3F6XA 2PVYA 3EFKA 3OWPA 3QA0A 5D9HA 3TXOA 1Y91A 1H00A 4YTCA 3PYYA 5BUIA 4BYIA 3IGGA 3PIXA 1FMOE 3DJ6A 2ZJWA 3R1SA 5E8YA 2OJGA 2YDKA 4BI0A 4ZAUA 2SRCA 4UMUA 4L3PA 4RC2A 3NW7A 3CIKA 1P5EA 3BZ3A 4PMSA 4AZVA 2R0UA 5M08A 2WQOA 4JX7A 1KE7A 2E9NA 5JGAA 4I5PA 3UIBA 3GC0A 4QPAA 1WBOA 3C7QA 4ANQA 5HQ0A 2OXYA 5IA2A 3QX4A 4ZIMA 1MP8A 5GZ8A 4FKWA 2B54A 4WSYA 4D4RA 5I3OA 1H1SA 3RAHA 3FBVA 4X2KA 1WVWA 3VRZA 4EUTA 4J95A 5A9UA 2GNFA 3TUBA 1T45A 5KHWA 3LAUA 4I41A 4BKJA 3KRJA 2BZIB 3OCSA 4RJ3A 3ZCLA 4I6FA 2C0TA 5BVKA 4L9IA 1B6CB 3VAPA 4D2WA 1F3MC 4R3PA 4QMMA 2PVKA 2J0IA 2VTSA 3KQ7A 3FC2A 4TKSA 5DFPA 4DH3A 2ITYA 4XG6A 3NUYA 3DTWA 4HYIA 2X9FA 5HE1A 5DR9A 3OCTA 2XIRA 4EK6A 2F2CB 4ZZNA 2PMNX 4UALA 2UZVA 2ITXA 2BTRA 3GCQA 4Y73A 4UMRA 3I60A 1Q41A 4LGDA 1W83A 2PE0A 4EK4A 3WF6A 4HCTA 4K0YA 4FNZA 4E93A 2H8HA 2PL0A 3DBFA 2W9ZB 4I92A 4ZZOA 5GJDA 1R78A 2XBAA 5JFWA 4KSQA 2CDZA 4TYGA 4RPVA 2W5BA 2R0IA 2OZAB 3BBWA 4TYEA 4I3ZA 2KULA 5CAUA 3PVUA 3BKBA 5J8IA 5JZJA 4N70A 3V6RA 2WTWA 4X6QC 3NSZA 4ITHA 3RZBA 2HOGA 4BDEA 1PY5A 3AT2A 2ZOQA 2Z60A 2BRHA 1CKJA 2CGVA 4A06A 2Y4IB 4HYUA 1CM8A 2BALA 4RJ5A 1J1BA 3SHEA 2CKPA 3BBTB 3F66A 4GFMA 4NM7A 4R3CA 2UZNA 1YXUA 3KCKA 4PNIA 5A6NA 4TTHB 5F95A 5IQGA 4WHZA 4EONA 3ZBFA 4ZY5A 3UQCA 2HY81 4P5ZA 1Q61A 2QO7A 1Q8WA 1VZOA 5IF1A 1H1WA 3HRCA 3DGKA 3IPHA 3A61A 3CQUA 3IW4A 2GSFA 3EQDA 4FIGA 4UV0A 2GU8A 3MDYA 3Q9XA 4RC3A 5HCYA 3TL8A 4BDIA 3KXZA 3KEXA 4L45A 4NJDA 1STCE 4X7QA 2CNQA 3QZFA 5TE0A 4QMWA 1M52A 4YLJA 4CKIA 4AFEA 3OXTA 4RIYB 2XK9A 3UMWA 2PZ5A 5DI1A 3V5LA 4F6WA 4FMQA 4IAAA 4G6LA 1VEBA 2VU3A 4HPTE 4BCKA 5HG5A 5CEPA 5J7BA 2W1IA 4RVKA 3DB6A 4ZTHA 1KSWA 5TF9A 4H3PA 3VUKA 3PG3A 4L6QA 4DE4A 5IQEA 2W96B 3R00A 3EL8A 5DNRA 1M17A 2PK9A 3ZUUA 4ALWA 5KKRB 4ZK5A 4F7JA 4FTQA 4F1MA 4ZJVA 3VHEA 3E87A 3BEGA 1OIYA 3DA6A 4C3RA 5CALA 4F70A 4B6LA 5A4LA 4B4LA 5M4FA 2VGPA 2C5NA 5HX8A 4CQGA 4FSYA 4BL1A 4G5JA 2JFLA 4WRSA 4O86A 1BX6A 4C33A 4IB3A 5AUVA 4LOOA 4DLJA 1UU8A 2UZLA 4FVRA 4IB5A 4X2GA 2E2BA 5CAPA 2O63A 5CAVA 2VNYA 4F1TA 3R28A 1OKZA 2UW3A 4JQ7A 4XRJA 3OXIA 5ETAA 3OUKA 4RQKA 1KUTA 3QU0A 4J52A 4O2ZA 4KIQA 4FEUA 4FNXA 4YP8A 3WYYA 2OK1A 5M07A 4L44A 1Q5KA 3LFDA 4TL0A 3O8PA 2PE1A 5KCVA 4TWPA 2YABA 1XJDA 1OITA 3KKVA 3UIUA 5CYIA 1OPKA 5K0KA 4EOMA 5DOSA 4R1VA 3IW5A 5DT4A 2YLEA 2OIDA 5CF8A 4EHVA 2J7TA 4HGTA 3KF7A 3UC4A 5IUIA 4DTKA 4FUXA 1SM2A 3A62A 4Z16A 5KBQA 2VTPA 3CJFA 3PIYA 4C34A 2RF9A 3K3IA 5D41A 4NM5A 5FLFA 3TJCA 3E8CA 3OWLA 3DCVA 3O50A 4U97A 1P2AA 1UVRA 3MA3A 3RHKA 3ZUTA 2PU8A 1H4LA 5CY3A 1OL7A 3UQGA 4RLKA 3LMGA 2J9MA 4MNEA 2GQRA 3QTIA 3NUXA 4PL5A 1OL6A 1BL7A 1YRPA 2QODA 4RZWA 4F0FA 4O2PA 4F7LA 2DWBA 2WMSA 5M51A 3EQCA 1U54A 4CLIA 4FTTA 4FK3A 4IWPA 4ZSAA 2UZTA 4GSBA 1M2PA 5TR6A 4DEIA 4EQUA 3I7CA 3CQEA 3DXNA 2HZNA 4UMPA 3QALE 3KRWA 3WILA 4E7WA 5EM8A 5CAOA 1FQ1B 5JK3A 1NA7A 3LQ3A 4WBBB 3QHRA 2ZV9A 3PVGA 4O0WA 3O0GA 2X6DA 1YHVA 4O21A 5B0XA 5E8XA 3QBNA 3ORMA 4JBQA 4IBMA 4XBUA 4EOQA 4PL3A 2IO6A 4NM3A 2EUFB 2IW6A 3FC1X 4PMTA 2WMBA 5AR7A 4U40A 1V0BA 4F9AA 4G9RA 2YWVA 2W7XA 3TNWA 4UEUA 4WNPA 4RJ7A 4JAJA 3T8OA 3VS5A 5EI8A 4YJNA 3R8VA 3ATTA 1Q99A 4CZTA 3OHTA 2JFMA 2YEXA 4NM0A 3L9LA 4JLCA 1G8SA 5EDPA 1JKLA 3Q5IA 2WKMA 2R2PA 3RZFA 4APCA 5AV2A 1E1VA 4BWXA 4ASZA 5EQYA 4M14A 2ZM3A 3P9JA 3M1SA 4K8AA 1FMKA 2GNJA 2XBJA 3EQHA 4OUCA 2PUNA 3SOCA 4UZDA 3QCSA 5CNNA 4BTKA 3FLWA 4F1OA 4O6EA 3MJ2A 5FG8A 4ACHA 3DDQA 4EQMA 5IA1A 2YACA 3TM0A 2BZKB 2OFUA 5HD7A 4FL3A 4FKOA 5AV1A 1J1CA 4OT6A 4EZ7A 1SZMA 3U9NA 4DT8A 5B2KA 4DAWA 4V0GA 4CD0A 4XV2A 4GL9A 4O0XA 3VUHA 1G8AA 4ZTMA 1SVHA 5BMMA 2ERZE 2YIXA 4OTPA 4CFXA 3AD5A 4Z55A 3DV3A 3EZRA 3RPYA 3L9NA 3LJ1A 4FIHA 4YTHA 4LUDA 1NXKA 3RI1A 4A9RA 4FE2A 3FLQA 5A4QA 3I6UA 2C47A 2UZBA 3IONA 3ERKA 3NYXA 5GZ9A 5L2TA 1ZYSA 5E4HA 5IQFA 3DBEA 2DUVA 2IZRA 3TACA 4K1BA 4EZ3A 4X3JA 1YWNA 3IG7A 3R8ZA 4NL0A 5IQHA 2W4JA 2NRUA 5IQDA 5KMNA 1IAHA 3QYWA 4HVIA 3ORNA 2R5TA 3OG7A 2UW7A 3A8XA 3FY2A 4EHGA 3DNDA 4I4EA 4UX9A 3L8XA 4QP4A 3CTQA 4OTQA 1RDQE 3HGKA 5CVHA 4FV4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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