3DKFA

Structure of met receptor tyrosine kinase in complex with inhibitor sgx-523
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
312
structure length
294
Chain Sequence
TVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKFLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title SGX523 is an exquisitely selective, ATP-competitive inhibitor of the MET receptor tyrosine kinase with antitumor activity in vivo.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oncoprotein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
total genus 93
structure length 294
sequence length 312
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3dkfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3dkfA01
4QMUA 5EQPA 3QL8A 4FV4A 3LFSA 4AUAA 3I6UA 3SKCA 5T6KA 3CGOA 3NYOA 4CZUA 4B0GA 4M84A 3U54A 4I5HA 5GJDA 4DEGA 2YIQA 4G9CA 3IGGA 5C8NA 1DAYA 2I40A 2OG8A 3TI1A 3VULA 4DYMA 3SAYA 5HORA 2XIZA 2QO2A 1H1WA 3D5UA 3OY3A 4NJDA 5CSWA 3KK8A 3LLTA 4Z9LA 3A7FA 4AGCA 5LXMA 2ITQA 5JRQA 2XK3A 3R1QA 4IAYA 2OJ9A 3AQVA 4FKVA 3KK9A 4QQJA 4ZP5A 5HD4A 3UBDA 3TNWA 3PVUA 4Q5EA 4XV1A 4PF4A 4QYYA 1ZYSA 5KBRA 3BBWA 2X0GA 2ITVA 2BZKB 2VX0A 4J95A 4E3CA 3KMUA 4RFMA 1M14A 2XRUA 5BPYA 3A60A 3FC1X 3PA5A 4HVGA 1XQZA 4IB5A 3ZDIA 5IA4A 4V0GA 2HENA 4FV7A 3FMKA 2XM8A 3UYSA 3JR1A 5AR7A 4CKIA 3WZUA 3HP2A 3GGFA 5IKWA 4NTTA 3QAME 3GQIA 3KXNA 4FI1A 3UOHA 5JN2A 3RWQA 4DH8A 4A9TA 3ENMA 1ERKA 3AMAA 3DT1A 5CZIA 4ZOGA 3IW8A 4IIRA 3I0QA 2BDWA 4DA5A 3DBEA 3PFQA 3UOLA 5FM3A 2ZAZA 5FEQA 2ETRA 5K4IA 3ZO3A 3S3IA 1W8CA 2ZVAA 3I5NA 5M44A 4AGUA 5EM7A 3D2KA 4KSPA 5AA8A 4C02A 3FZSA 4R1VA 4IAZA 2GNIA 2ACXA 2QHMA 1E1XA 5AV0A 1OKZA 4W4YA 3FLYA 2X7FA 2YAAA 3MIAA 3QQFA 4K6ZA 1FGIA 4MNEB 3R9DA 3OOMA 4HW7A 3ORIA 2J4ZA 2YIYA 3NAXA 5HHWA 2UW6A 3LXLA 2C1BA 1A9UA 2PVHA 3D7TA 3GP0A 5BUIA 4LUEA 4RIYB 2P55A 3W8QA 4FBXA 2UW8A 4R5YA 4AXAA 5IEXA 3LMIA 4CG9A 5ETIA 1MUOA 3DGKA 4HGLA 4KA3A 2JKQA 3A7JA 4QTDA 2VX3A 2UZWE 5IQEA 4HGTA 5C4LA 4ENYA 4D9TA 3RWPA 2I0HA 4JDHA 2CPKE 1YXUA 2Z60A 3ITZA 3IDCA 3MBLA 5EFQA 4U45A 4TW9A 3QCYA 5ANDA 3ZO2A 3CP9A 3EQGA 4EH7A 3H3CA 4W4VA 3AC4A 3OWJA 4PWNA 3NVMB 3WBLA 4C3FA 3DPKA 1UNHA 1LPUA 4HZSA 5B0XA 5E8YA 3PTGA 3TJCA 2IVTA 2WMXA 3HUBA 4ZTHA 3SGCA 4NYEA 4G34A 3OC1A 4E4MA 4I93A 3IW6A 3QCXA 5AEPA 4KIPA 2HW6A 2R9SA 3BV3A 2PTKA 2EB2A 5M06A 4JR7A 4M67A 4QMSA 4EBVA 4D4SA 3MDYA 3BELA 4C58A 2WTVA 4YLLA 5CXZA 1YW2A 5IUHA 3EFWA 4LM5A 4CRSA 3FC2A 3W2QA 4WNOA 4ZLOA 5DE2A 2C6TA 3FPQA 3R7YA 2PY3A 3CS9A 3IOPA 5I5ZA 3WE8A 3ZU7A 3TUBA 2J0JA 3RCJA 3UNKA 4BCQA 1Z5MA 1JOWB 3ANRA 3CPBA 5AP0A 4CCBA 2Y6MA 2IVUA 5IDPA 3U6JA 5FXRA 4DFUA 5AUXA 4GIIA 1OM1A 4EYJA 3WF7A 3S0OA 1URWA 2R7BA 2X9FA 1XH6A 2BHEA 5E8WA 3QF9A 3QQKA 5J79A 1AGWA 2UZNA 3TV7A 4FKQA 1PXLA 2B52A 3F5UA 2OU7A 4BIEA 4ERKA 4OTGA 4QMMA 3AT4A 4KIKB 4YJPA 3JUHA 2W1ZA 4EOOA 4W9XA 4FKRA 4YZDA 2XCKA 4YHJA 2CMWA 3DFCB 3HEGA 4CEGA 5C26A 2RG6A 2YIWA 3NX8A 2IVSA 4NM0A 1RW8A 2I0EA 3BYSA 4QMTA 4ZXTA 5L8KA 4EQMA 1JVPP 4ZJIA 3PXFA 2GHGA 5HTIA 4N70A 5D7VA 3Q04A 4I4FA 4TYGA 5EI8A 4E5BA 5IH5A 4JX3A 3PYYA 4FT5A 3BCEA 5IA1A 1UU8A 1YHSA 4FNZA 5BVWA 2RFNA 5M4IA 3SA0A 4G3DA 4CTCA 5H8GA 3KXGA 3E63A 2W1HA 4BL1A 4FKIA 2AUHA 4YHFA 4LG4A 3ZRLA 4HCUA 4WG3A 4FIFA 2PVYA 5CVHA 1SVGA 4YTIA 2YN8A 4IFCA 2CNUA 2O8YA 2E9NA 3T9IA 4FKWA 5FDPA 2J9MA 2VWVA 3HDMA 4BYIA 4XOZA 4F09A 5AP3A 4FGRA 5JRSA 4BCGA 2BRGA 1V0PA 2YCQA 5E8VA 4L46A 3VBXA 3FAAA 4G5JA 3E3BX 2JKOA 4QD6A 4QNYA 2IZUA 1PXKA 2YAKA 3OEFX 4G3CA 1VZOA 3C50A 4BWKA 1CKPA 1YKRA 3O2MA 3TM0A 5J1VA 3OHTA 4HJOA 1OKYA 2W4KA 2WPAA 2XJ2A 3BKBA 3VC4A 3VRYA 5EHYA 3F2RA 3I4BA 3LJ0A 3E62A 5JQ5A 3LCDA 4YC8A 4YJNA 4BDFA 3OXZA 4O86A 4DH1A 5DRBA 5EI6A 2B4SB 5BX0A 4FT9A 3ROCA 3PIYA 4I6BA 1ND4A 4EH8A 5I9WA 1SZMA 1SNUA 3KVXA 3OTUA 2G01A 4GL9A 4HYSA 4ANQA 2YDJA 2GDOA 3UVRA 4U79A 4U81A 3HNGA 3V8TA 4JRNA 3MN3A 4FTMA 2QKRA 2W05A 4GK3A 3KN6A 3NDMA 3GC7A 3K5UA 2QURA 1M7NA 2CJMA 1PXPA 3LXNA 4L01A 3DZQA 4Z3VA 1NXKA 4D55A 4USDA 2BIKB 3E8DA 4O0SA 3CY2A 3PRIA 4PDSA 5F1ZA 3DDQA 3LMGA 4ANMA 3KRRA 3GU8A 4Y46A 4TTHB 3R9NA 3TKUA 3EL7A 3M2WA 3UIBA 2DYLA 4PV0A 4JXFA 2XJ1A 5CENA 1KE6A 5L4QA 5DYJA 3VS5A 3SG9A 3UGCA 3R73A 1OPJA 4PX6A 5AX3A 4GYGA 4RZVA 2PK9A 3HX4A 2VO7A 3R9HA 1PMUA 4HNIA 1H25A 1OL2A 4OBOA 4CV9A 3VS1A 4DEDA 4QQCA 4KUJA 5HCXA 4XYFA 4LI5A 5BMSA 2GPHA 2VTQA 3D14A 4BCPA 4YNEA 2GSFA 2GS2A 3ZFXA 3GC8A 5JFSA 2X6EA 2OKRA 4X2GA 2C69A 2W1DA 3OP5A 4FG9A 4O0UA 1B39A 4UY9A 3KF4A 4V05A 5DHJA 2R3QA 4CFXA 2ZYBA 1ZXEA 3HZTA 2G2IA 4EQCA 3QZIA 3BHHA 3PA3A 3RAKA 2HZIA 2XYUA 3QHWA 3U9NA 4O84A 1BL7A 4DEIA 2C4GA 4AZEA 1PRYA 4Z55A 4R7BA 4S34A 5KNJA 2WO6A 3LE6A 4LV8A 5CNOA 3ZLYA 2YACA 4BDAA 3IDPA 4BCMA 5FTGA 2OLCA 4YNOA 1HOWA 5HBHA 3MH1A 4I41A 4NM3A 3WI6A 2CNQA 2R3MA 5DOSA 3UO6A 4II5A 1YOLA 5FM2A 1ZYCA 3NW7A 2F7EE 4G16A 2VWYA 5J7BA 4YJUA 4E5AX 4MX9A 4XG3A 5GJFA 5HESA 3KFAA 3L9MA 3SC1A 1QL6A 4AF3A 3B2WA 2IPXA 4GK2A 1GOLA 3WYXA 2OFVA 3EN7A 2VX1A 1Q3WA 2C6OA 2Y6OA 4QQ5A 5EM5A 5CTPA 3BLRA 3G2FA 4G17A 3KREA 4FZ7A 3TEIA 1Y6BA 1T46A 2WTKC 3G6GA 4BKYA 1X8BA 2JITA 4WG4A 1KE5A 1CKJA 4LRKA 4AWIA 5AAGA 4RBLA 5DFPA 3KGAA 3R1SA 2QHNA 3DAKA 4K18A 4KIQA 1F5QA 4KBCA 4LV5A 5IDNA 1YI4A 5KHWA 2C0TA 3KA0A 2G1TA 3TZMA 3TWJA 3KMMA 4IZ7A 4L52A 4N4SA 4C4HA 4GU6A 2G2FA 4FC0A 3ANQA 1FQ1B 2PVNA 5CAOA 5HI2A 5HVKA 1A06A 3R01A 5DEYA 5AR3A 3DKFA 4ANLA 4CQGA 3TXOA 2HWPA 3CQEA 2RFSA 5CU3A 3ODZX 4TYIA 4XBUA 2KULA 4EH6A 4CMOA 3NW6A 4S32A 2BUJA 1REJA 1WBWA 3AMBA 4FV1A 3VUTA 2PE0A 5FP6A 4NM7A 4YC3A 5KBQA 1SM2A 2WOUA 4MVFA 4KRCA 4IBMA 3OXIA 5FTQA 4W8EA 3FE3A 5IA2A 5TR6A 3PXZA 4UB7A 5M4CA 2IZTA 3A8WA 3HAVA 3ORMA 5FP5A 5CXHA 4PNKA 3RZBA 3BYVA 2UW5A 2WQBA 3KXZA 3OWKA 3E5AA 3EJ1A 3E8EA 5DG5A 2XEYA 4FTJA 2RKUA 4ERWA 2BZJA 2RGPA 3E87A 5F94A 3L9PA 3ZS5A 2W17A 4ANSA 4R3RA 3FKNA 4D1ZA 2UW0A 4K33A 4IX5A 3EL8A 1AQ1A 4EZ7A 5HU9A 3DK6A 3OXTA 3V3VA 4ZAUA 3MB6A 4JLCA 4RX9A 2PMNX 3NUPA 4JG7A 4FICA 4A9YA 4HVIA 2NP8A 3DXQA 4RT7A 4CFFA 3F3UA 3QTSA 1WVXA 4EH3A 3HKOA 1UA2A 1JLUE 4F7LA 3QD4A 3O50A 4RWIA 2BAJA 4D4RA 4MF0A 1XHAA 4BTMA 3EZRA 2G9XA 3IK3A 4GVJA 3ZUTA 5KE0A 4F7NA 2ITZA 4TY1A 1BX6A 5CEQA 3BIZA 1GNGA 3OT3A 5FLFA 1Q8UA 3MFTA 5HD7A 4BVUA 4XP3A 1GZKA 5AADA 1UNGA 4JAJA 4GU9A 3ELJA 3DA6A 4JDIA 2J90A 4CFUA 5BVNA 4XEYA 5ANKA 1PYEA 4P5QA 1OKVA 3QUEA 3LQ8A 4ZTQA 4IX6A 4FIGA 4GJ3A 3NCZA 3VVHA 2CDZA 4UMUA 5KCVA 4AW1A 4BIBA 2IVVA 5JZNA 5K0KA 3EYGA 4L3LA 3C4ZA 3WYYA 4TYJA 5G1XA 3PJCA 5AR5A 3RK7A 5DI1A 2R5TA 4IM2A 5E8TA 4U8ZA 3NAYA 1YDSE 1W7HA 3ZTXA 3O96A 5B7VA 5IQGA 3QA0A 3RPSA 4A4XA 5T68A 5KMMA 2FO0A 4MXCA 4YPDA 4C2VA 5K5NA 4OW8A 4AT4A 4BCHA 1M52A 4DAWA 4RC4A 1WMKA 2X8EA 4WNKA 3A4PA 1OMWA 2WTDA 3MVMA 3FLZA 2PWLA 2ZB1A 2R3GA 4P4CA 2WMAA 4CT1A 4EOJA 3LQ3A 5GNKA 1XH8A 2BRMA 5AUUA 4P90A 2C5NA 2XS0A 3WF9A 2WFYA 4I22A 3ZLWA 1UKIA 3SQQA 2Q0NA 3H30A 3GU6A 3LFAA 2BMCA 3POZA 4KB8A 2C0OA 5FXSA 2UZVA 1KE9A 4QMZA 2QR7A 5FEEA 3UODA 3MA3A 2C6IA 2UVZA 3BI6A 4ZLZA 3U6IA 3F66A 3QD3A 4LGHA 3UVPA 4M12A 5AIRA 5M07A 4D2PA 4PNIA 5BVOA 4RWLA 1PMVA 3WF8A 3WOWA 5CALA 4JT3A 4PTEA 4U41A 1V0BA 2ZM4A 3DU8A 3LCKA 4IHPA 5FGKA 4AOTA 5DR6A 3U6HA 5LWMA 3M11A 3GVUA 3P7AA 3MI9A 4HGEA 3S4QA 4F0GA 2X4FA 2QG5A 5CANA 2WQOA 4Y5QA 2UW4A 3WIGA 2R3FA 4XG6A 3U51A 4EOIA 5CF8A 4L7FA 2R3HA 2FVDA 4XG8A 5E1EA 1KE7A 5LWNA 1PXJA 4CLIA 2WEIA 3GCUA 4YJVA 3OW4A 2RIOA 4JG6A 5AV1A 1KOAA 4H58A 2PZ5A 1CDKA 4NFNA 4V0GB 4RLLA 5DH3A 5DR9A 1H1QA 2DS1A 3DLZA 3EQHA 3KULA 2JBOA 3F6XA 4I5PA 4M68A 4QPSA 2X7OA 3V8SA 4AT5A 4GMYA 2GHMA 5B2LA 4YZMA 3D5WA 3F88A 3A62A 2Z7LA 2VRXA 2J0MB 2UW7A 1OUKA 3OBGA 4Y8DA 3SLSA 3HV3A 3QCSA 5AP5A 2R3RA 4GW8A 4AGWA 4JL9A 4UWYA 4ZTRA 2VU3A 4CFMA 3NYNA 2ITUA 2C3JA 5DA3A 3RM7A 5CY3A 4IM0A 4JBQA 4RX5A 4TYEA 5ANJA 3UIUA 3A7GA 4C57A 4CKRA 1LEZA 1LP4A 4LMNA 3CE3A 4BGHA 4YTFA 2EXCX 3MPTA 2IZSA 3H9FA 3OVVA 3N4TA 2IJMA 3HV6A 4FV0A 4OTRA 3TTJA 5EQYA 3R1YA 3FDNA 5EDQA 3ZFMA 3TACA 3F9NA 3OY1A 3LJ2A 3D7TB 4CRLA 3UO5A 3NUUA 2OICA 3MFSA 5K5XA 5EDPA 3SRVA 5KMKA 1BLXA 1FOTA 3V01A 3FI8A 2QOCA 3SHEA 1G8SA 4WD5A 4LMUA 4DGMA 3FPMA 2HIWA 2QOIA 1OBDA 1WZYA 4E20A 4ZY4A 5GINE 2NPQA 3KXXA 4UYAA 2BDFA 1G3NA 4EQUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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