3DT1A

P38 complexed with a quinazoline inhibitor
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
356
structure length
356
Chain Sequence
HMLEMSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of highly selective and potent p38 inhibitors based on a phthalazine scaffold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 109
structure length 356
sequence length 356
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3dt1A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3dt1A01
3VBWA 4BKZA 4RJ5A 3E64A 4UY9A 5HVJA 3KC3A 1LEZA 4I5MA 4PNKA 3H0YA 4DFYA 4GK3A 3RGFA 4ASDA 4MX9A 1YOJA 5AP5A 2GDOA 5JFWA 3RWPA 1A9UA 2XCHA 4P2KA 5G6VA 3P5KA 4HVSA 4XOYA 1OIRA 4GKIA 5BX0A 4U44A 5F95A 3W16A 4LUDA 4EZ3A 4AUAA 1BYGA 3DDPA 3FXWA 4JDHA 3QCQA 5ETCA 4IFCA 5CS6A 4FTCA 2OJJA 4FSRA 3R7EA 3Q9WA 3HDMA 4AW0A 4EK6A 3P7CA 4CFNA 4BZNA 2JKOA 4KA3A 4DEEA 1PXOA 2C5YA 3WILA 4YJTA 2A19B 2GCDA 2WTJA 3EQBA 4IB0A 5HTCA 3F5PA 5AEPA 2WGJA 2WMWA 3QRIA 3MPMA 2O63A 4RQKA 1PW2A 2ITOA 4FTIA 3G9LX 3V5WA 3AC1A 5EK7A 3RAKA 2GPHA 3O71A 2CKEA 2QKRA 4PWNA 4S34A 4WHZA 3RINA 3V04A 4EH7A 4F65A 5JFXA 5IA0A 1Q8TA 3AXWA 2R0IA 4IXPA 3OTVA 1Y8GA 4M14A 2OFVA 3FJQE 2WMVA 3MJ2A 1R78A 4O7WA 4PPBA 1LR4A 4FKQA 3D7TA 1RW8A 4NCTA 3PIYA 4AN2A 3P9JA 4I24A 3QD3A 3GT8A 2BRHA 4IEBA 5HLPA 4EBWA 1JKSA 5AA8A 4IZYA 4AU8A 2PU8A 3A62A 4D4VA 2GMXA 4KBAA 4OTIA 5C8KA 3LM0A 2XNPA 1U5RA 4JQEA 4KBKA 2QODA 1SM2A 4YPDA 5IQIA 3H0ZA 1VYWA 1Q97A 2YIYA 3JYAA 3NUNA 4FZ6A 3U4UA 3DA6A 4OTWA 4BDJA 2B53A 3V01A 4FG8A 3W33A 2BTSA 2WIPA 3B8QA 2EWAA 2OSCA 3EL8A 4QT1A 4TYGA 4ZSJA 3R9DA 1FOTA 1Q8YA 2IZUA 2ZDUA 3LQ3A 3QYZA 3FMHA 3Q6UA 4CG8A 3VBQA 4BN1A 4E5AX 2ITXA 2UUEA 3FWQA 3ZXZA 5ETFA 2R3QA 4IX4A 4LM5A 3W10A 1SYKA 5EKOA 3W2CA 1H1WA 2EXEA 2OIQA 3E3BX 4Z7HA 2PY3A 4AS0A 5AP7A 2VN9A 3BU6A 5JQ8A 4O7LA 4YU2A 2PVNA 3CSVA 4F4PA 2W4KA 2GNJA 3QLFA 5ICPA 5C03A 1CKPA 1WAKA 3VW8A 4YZBA 5JGBA 3AG9A 3AC4A 3BEAA 3A4OX 3LXPA 3O51A 4F6WA 1BI7A 3W32A 2RGPA 4A4LA 4O7RA 3Q9ZA 2C6TA 5IA2A 4GG7A 3TV4A 4J7BA 1OIUA 1X8BA 3OWJA 4FKLA 4U42A 4B6LA 2BFXA 3LFBA 4YLJA 4AZEA 3NUYA 4L3PA 3UODA 4RX7A 5HEZA 3UG1A 1W7HA 4IWDA 3G6HA 1PXMA 2C6EA 4ONAA 3FLQA 5IQEA 3UNKA 2H8HA 1QCFA 2OJFE 3ORIA 4YC6A 3MH2A 4XS2A 5HX6A 3EQFA 4I21A 3TJDA 2GNLA 1STCE 2QU6A 4N4SA 3MW1A 4L7FA 4OAUC 2C5NA 3NUXA 3GVUA 3IW6A 2PMIA 3FYJX 2VWXA 4ANMA 2YJSA 3MIAA 3SXFA 1WVXA 1TVOA 3E8NA 3LJ1A 3OXTA 5CF4A 5CLPA 2OZAB 3C4ZA 4ZZMA 1ZLTA 3P79A 2P55A 4F7SA 1OI9A 3R7GA 4TRLA 4DT9A 3R83A 4YZ9A 3WBLA 5M4IA 1PMNA 2B0QA 4EHGA 4IIRA 2JGZA 3F5XA 3RM6A 3WF8A 3LMIA 3K3IA 3IONA 4RJ8A 3GC0A 5A4LA 4EH5A 1YI6A 1M2RA 3MFRA 4ALUA 4EOPA 1H0VA 3NSZA 4L7SA 4U3YA 3R7IA 4BDCA 4FG7A 2J90A 4WT6A 3UOLA 2R9SA 4A4OA 5H8EA 3DJ6A 4RRVA 3UVRA 4KB8A 1S9IA 2WMAA 4HGLA 4ERKA 2CDZA 2XK7A 5IEVA 3JXWA 2W5AA 4GFOA 4BBEA 5C8MA 4DBNA 3MY5A 3PLAE 4C2WA 4FTAA 1WVWA 1SNXA 4OTFA 4U41A 5ANOA 5CYIA 3WZUA 4D2WA 5EKNA 4ALWA 4CVAA 3GQLA 4TZRA 4V0GB 2J0IA 1U4DA 4H1JA 4W9WA 5CF8A 1ZZLA 4AT5A 3EL7A 3O7LD 3ZLXA 3M2WA 3PJCA 4IC7A 3VHKA 4EH6A 5DYJA 3ZCLA 5AR5A 4MXZA 2ESMA 3PVBA 2Y4IB 4F7NA 4O21A 2BVAA 5FWKK 5L4QA 5J1WA 2Z7SA 2XK4A 4MF1A 4P4CA 3ZRMA 4RJ6A 1KE9A 3BHVA 3CR0A 4O91A 4PPCA 5LVOA 1QPJA 5HLNA 5JEBA 4NZWB 4JBPA 3VS5A 5HQ0A 3QD2B 4ORKA 2JKQA 2F7XE 3GUBA 3ZZWA 5JRQA 1UVRA 3R8VA 1OL6A 2IVSA 4WUNA 3RHKA 3F7WA 3OP5A 4I4FA 5KNJA 2CHLA 4AF3A 2AC3A 3I0QA 2QOOA 2XIXA 2E9NA 3VWAA 2IVVA 2WQMA 2WZJA 3PIXA 2GFSA 3WF7A 4Z55A 4RJ4A 3D5UA 4WNKA 1PXJA 1OKZA 1GOLA 3I5NA 3JUHA 4QMUA 3EYGA 5DNRA 3FZPA 3SAYA 3ZLSA 1URWA 4EH8A 2WIHA 4MBJA 3A8XA 5IEXA 5E8WA 5EW8A 4DG0E 3SLSA 2QU5A 3BIZA 3QD0A 5E1SA 2QURA 2H6DA 2XNMA 2YM6A 4RWKA 4U0IA 4L6QA 4ZMEA 5AP0A 3G0EA 2WXVA 3ODYX 3QX2A 2XNEA 4GVJA 4GSBA 5LOHA 3TN8A 3OCTA 3VBTA 1JSUA 1H27A 2XS0A 2ONLA 3CY2A 3ZTXA 4DGGA 3ZOSA 5K9IA 4PNIA 4ANNA 5LMAA 1DI8A 4KKGA 4QMTA 4E93A 2OIDA 3IGGA 3ZM4A 4Q9ZA 3NUAA 4RG0A 5AR8A 2ZV8A 3UOHA 3EQRA 4OTHA 5KCVA 2ZAZA 2YLEA 4MXAA 3SDJA 3UO5A 3VF9A 4O2ZA 4UV0A 3LCSA 2GHMA 3CKXA 3IECA 4PTCA 5F20A 4MAOA 4OBQA 2B55A 5HBJA 3BV3A 1ZARA 4E73A 2QOKA 3VJOA 4GFMA 4C4FA 2Y4IC 3TCPA 3V6SA 5LARA 4WA9A 3COMA 5D7VA 3D5VA 5CNNA 2IZSA 4H36A 4EH3A 2HYYA 3AGMA 3KRWA 4FI1A 4JDKA 5EQPA 3PG1A 4M84A 4X21A 4FIJA 3RMFA 3FMLA 3TI1A 4FV1A 5IMXA 4YHJA 4F64A 3DFAA 3Q3BA 4MBLA 1OITA 1L8TA 4Z3VA 2YA9A 3ZO1A 4YZCA 4AGCA 1GZKA 1YHWA 4I5HA 4IAIA 3TNHA 3OWPA 4FTJA 1XH6A 3O96A 5BVWA 4HJOA 2PVMA 4YBJA 4YNEA 3UE4A 5IU2A 2YFXA 4GU9A 4U5JA 1H25A 2RSVA 4TN6A 4R8QA 5C01A 4IVCA 5CEIA 1OUKA 2VO3A 5L2IA 3UYSA 3ORPA 5FEEA 4L9IA 3K3JA 3IW4A 3ZSGA 5KBRA 2ZV2A 4Y72A 5CANA 2C1BA 4USDA 2WO6A 4EUTA 1HCKA 5CEMA 4NL0A 2BRNA 4I6BA 4CV9A 2QD9A 4TNDA 2IN6A 3T3VA 3KXNA 1OECA 4WG5A 2YWPA 3QCYA 4FMQA 3TACA 4EOOA 4AGUA 4YMJA 3F88A 4D0WA 2I0HA 4EK4A 2F7EE 4JG7A 1H1RA 2OXXA 3EOCA 3RPSA 1ZY4A 5IDPA 4XH6A 5LMKC 3Q5ZA 5AA9A 3OWKA 3VBYA 1RQQA 2X9FA 3L8XA 3R7OA 3TTIA 4YURA 2W17A 2VWIA 3WI6A 5HVKA 3QKLA 4DE4A 1WBSA 3VS6A 3SXSA 4E6CA 2W4JA 3ENHA 4CFXA 4FEVA 4FKOA 2R3PA 4ZP5A 3UBDA 3NNVA 5CAOA 3RK7A 3MPAA 5IA3A 3DLZA 4RFYA 5A54A 2PMLX 4F9CA 4FODA 4Q5HA 2WU6A 4R1VA 4O0XA 3W2QA 4EUUA 2OJGA 3DAKA 3MA6A 4AGWA 4EOJA 3LKMA 3VS1A 2PK9A 3FZRA 3NAXA 4NW5A 4CRSA 4ZLOA 5BMSA 2UVZA 3DT1A 1GJOA 4J8NA 5ANDA 3RKBA 3U8WA 1JLUE 3K2LA 5BYLA 5L2SA 2XJ2A 3HNGA 3WZKA 2BROA 3BU5A 4FV0A 4U6RA 4FR4A 3ORNA 2B4SB 4WKQA 2QNJA 4C35A 4LV5A 5HG9A 4DLIA 4O0YA 3Q04A 3HECA 5LCKA 4DFZE 3LPBA 4UX9A 5K5XA 4X2JA 1YXTA 2FSTX 3NYOA 2QOQA 4NKAA 4PF4A 1NY3A 3LFNA 3S2PA 3LCTA 4TYIA 2C69A 2FB8A 5DBXA 3FQSA 3ORZA 5DGZA 5CAPA 5K0XA 4PTGA 4UWCA 3FMNA 2XCKA 4EI4A 4CG9A 3ZSIA 2W1EA 2VX0A 2XIRA 3OBGA 4FT9A 4KRDA 5GZAA 4C3PA 5J7HA 1IA9A 4BF2A 4QYYA 5A3XA 3TZ8A 4N6YA 3NR9A 5CAVA 2OWBA 1L3RE 4FKUA 4RFMA 4CKJA 4RZVA 2WMRA 4DEGA 3ZU7A 3A99A 4MNFA 4QQJA 5C8NA 5KKRC 1DAWA 1JBPE 2XIYA 2I0EA 2IVUA 3EKKA 2SRCA 4UYNA 3IDBA 5FXQA 5B2KA 3UC4A 3UP2A 4EOQA 3E8DA 4AW2A 2CPKE 1KUTA 3GCVA 4GUEA 3UPXA 5FRIA 1OBDA 2G01A 2XP2A 2JAVA 2CKPA 3KRLA 5EYCA 5A46A 1R3CA 2E9PA 2HWOA 3QQFA 3IGOA 5HO7A 4QYHA 3D0EA 4W8EA 3JS2A 4XRLA 1ZYLA 2UW0A 5CSWA 2UZBA 2UW9A 4DTKA 4M0YA 4JDJA 2CNQA 5CSXA 4I20A 4KSPA 3QQLA 4C7TA 4G34A 3V8TA 4GJ3A 4D9UA 4UXQA 2UZVA 3WF6A 3MH0A 2RFSA 5GNKA 3OEZA 2HIWA 2VWZA 2PMNX 5CNOA 3H9RA 4LL0A 4TY1A 4EYMA 1WZYA 1XJDA 4O86A 3OWLA 4NU1A 1Q8UA 3RPRA 1KE8A 3PDTA 5KMJA 1CKJA 3RZBA 2YN8A 3AC5A 4C59A 4AE6A 4D9TA 1YXSA 3A60A 4IAKA 5HICA 4LGGA 3VC4A 4K8AA 5I9XA 4FV7A 1ZOGA 2O0UA 4EWHA 2V55A 4FK6A 1KOAA 3SOCA 4ZTQA 3TZ7A 1UU3A 1XWSA 5BUIA 3FI8A 2JDSA 4ASEA 4IVDA 1KV2A 5EOBA 3V5LA 2W5HA 3F3UA 3JVSA 5FTOA 1YWNA 4AQCA 4IC8A 4YJRA 5EDQA 3QRUA 3O8PA 4IVAA 5EI8A 4YP8A 4G3GA 1YDSE 4JRVA 3BX5A 1OKYA 4IM3A 4R7BA 1IASA 2UVXA 2QOIA 3FQHA 2C0TA 2OICA 4DC2A 2G2HA 3DFCB 3F66A 3HRCA 3LXLA 4F9BA 4D2SA 4DH3A 1OZ1A 2HAKA 4FTNA 1YOLA 5DE2A 5LMKA 2C0IA 2IJMA 3FMJA 3KU2A 5CVHA 3F69A 3G6GA 3PXYA 4JBOA 3RPOA 4AE9A 4D55A 1PF8A 3HUBA 3SRVB 1TQMA 3GOPA 3CQEA 3VIDA 4DGOA 5M57A 3SGCA 3LCDA 1SZMA 2C47A 4YC8A 1NA7A 3TT0A 2W96B 4FT3A 5AR3A 4G9CA 5A6NA 4BDGA 4RGJA 2B1PA 1WBPA 4TWPA 5H8GA 3ET7A 5M4FA 3FSKA 3U55A 5CEPA 3MB7A 4F9AA 3UZTA 3FXZA 3C1XA 4LL5A 3GOKA 4D5HA 2PVRA 2W06A 2VO7A 3FPQA 3PXKA 4L3LA 5CI7A 2XIKA 2IG7A 3Q4CA 4WO5A 3IK3A 2R2PA 4FSNA 4RVKA 2A0CX 5HKMA 2BDWA 1QL6A 4ERWA 4OW8A 2OFUA 3BI6A 2XUUA 4ZY5A 1S9JA 2O64A 4ZXTA 4BDHA 5FXSA 5CAQA 3DKGA 5AWMA 4DA5A 2G2FA 5AUUA 5DVRA 4G3EA 3QALE 4E20A 3D14A 3PA4A 5J79A 3SHEA 2G1TA 3OG7A 4D1SA 3GU5A 4X0MA 2ITPA 2R3LA 1P14A 2OF2A 4Q5EA 5DR6A 3RI1A 5C4LA 3MESA 4L46A 4X3FB 4IM0A 3UGCA 4L00A 3DY7A 2OH0E 4BKYA 3IQ7A 2C0OA 3GCQA 3D94A 3Q2MA 3ZO4A 3CTHA 1Y6BA 4ARKA 5HU3A 1ZY5A 5EI2A 5LVLA 3R8UA 3QTWA 5JH6A 5J1VA 3DB8A 3KFAA 3RBWA 1YW2A 4Q9SA 3IG7A 4DT8A 5C4KA 3EFLA 3ROCA 2QR8A 2XJ1A 4HYUA 3W18A 4M66A 4PP7A 4O81A 3LZBA 5KZIA 3FHIA 2DYLA 4OTGA 2R3MA 3S95A 1O6LA 3DNEA 4OT5A 5C26A 3F3VA 4D2RA 2WNTA 3FMEA 3FZ1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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