3E7VA

Crystal structure of human haspin with a pyrazolo-pyrimidine ligand
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
GPVPFSHCLPTEKLQRCEKIGEGVFGEVFQTIADHTPVAIKIIAIEGPDLVNGSHQKTFEEILPEIIISKELSLLSGEVCNRTEGFIGLNSVHCVQGSYPPLLLKAWDHYNSTKGSANDRPDFFKDDQLFIVLEFEFGGIDLEQMRTKLSSLATAKSILHQLTASLAVAEASLRFEHRDLHWGNVLLKKTSLKKLHYTLNGKSSTIPSCGLQVSIIDYTLSRLERDGIVVFCDVSMDEDLFTGDGDYQFDIYRLMKKENNNRWGEYHPYSNVLWLHYLTDKMLKQMTFKTKCNTPAMKQIKRKIQEFHRTMLNFSSATDLLCQHSLFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Human Haspin with a pyrazolo-pyrimidine ligand
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase haspin
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 109
structure length 328
sequence length 328
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-08-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3e7vA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3e7vA01
5LVLA 4BWPA 2JBPA 2WMBA 4X6RA 4O22A 4XYFA 1P14A 2XK6A 3QTIA 4NCTA 4H36A 1K3AA 4AA0A 2J9MA 4AOJA 2XMYA 4E93A 5JMSA 5L6WL 3PZEA 3ANRA 4Y5QA 1BL7A 2BVAA 3RHKA 5CALA 1ZYSA 3QD4A 1OIYA 2YCQA 1H1PA 4RIYA 1GIIA 3P23A 4E1ZA 4IACA 4RWIA 2C3JA 4DFNA 4O7SA 5IA2A 3NIZA 4QPSA 2V55A 4YJSA 2Q83A 1H1WA 4YO6A 3R0TA 4FX3A 3TKHA 4XG8A 3D4QA 1P4FA 2NRUA 3MFUA 4FTKA 2XF0A 4FSNA 1GZKA 5HESA 3ALNA 1NVSA 3KFAA 4U45A 4D9UA 3UJGA 4UXLA 2W99B 3L9MA 1UNLA 1W83A 1UU7A 3IO7A 4TWCA 5FWKK 5A54A 5FP5A 2AC5A 4MBJA 4XV3A 1OIQA 1OKWA 3R9OA 3C0GA 3DTCA 3VN9A 1SM2A 2JDOA 3ZCLA 4EKKA 5CAOA 3MJ1A 5HX8A 3KA0A 3DAJA 4JRNA 1I44A 3R00A 3HRBA 4D55A 4TY1A 5CY3A 3TZMA 4O91A 1REKA 4FUYA 5JGDA 4RJ7A 5EW9A 3FUPA 5HZNA 4J98A 3E93A 5IISA 5FDXA 3C5IA 4FTMA 5E8TA 3F7WA 3O51A 3NUAA 4QQJA 3QZHA 3BYOA 4IVCA 5I4NA 1UNHA 2WU7A 3IDBA 4HGLA 1CKIA 2QHMA 2C69A 2G1TA 2HY81 3ORZA 4I6QA 1PW2A 3QZIA 3NWWA 4FKVA 1OI9A 3ZXTA 3GCSA 3RINA 5K5NA 3W18A 4OAUC 2PMOX 3LXNA 4ZY5A 4AA5A 3GU5A 4NFMA 3PG1A 3GXLA 2Y7JA 4FUXA 2UVXA 4C59A 3PVGA 2PZPA 4K1BA 3GU8A 5A4CA 1ZY4A 2I0EA 3BHYA 3GU7A 3GEQA 4LGDA 5FQDC 2OZAB 4BCFA 3F3VA 2IVTA 3P7CA 5KMJA 4DH7A 4QMTA 3NCGA 3G9NA 1OKVA 1KUTA 4F0FA 4DG0E 4HZRA 4MD7E 2PMNX 4RT7A 2F7ZE 4UMTA 3R8VA 5LWNA 2F49A 4NTSA 5HG5A 4FTOA 1Q8UA 5IF1A 1BYGA 3BHUA 3NX8A 4BKZA 2YN8A 5HTCA 5CAUA 3Q32A 4X2KA 5ETFA 3EMGA 3PRIA 4V0GB 1UV5A 3R1YA 3DXNA 4DFZE 4GG5A 4EUTA 2B7AA 2XKCA 2XYNA 3C4WA 3CCNA 3IONA 4UWYA 3AMYA 3OWLA 2QONA 4EOKA 5ACKA 4TW9A 3R6XA 3DB6A 3COIA 4FEXA 3BHVA 4F1TA 4NL0A 2G9XA 3NAXA 1H00A 1JSTA 5E8ZA 1M17A 2WQMA 3VS5A 1H28A 2C0IA 3U6JA 3QA8A 5L2WA 2HWPA 2CGXA 4DEIA 2XNBA 5CF5A 4GKIA 3RPVA 1URWA 4E6AA 3OW4A 4JQEA 4FICA 4A9SA 5I9YA 2IVSA 2GQRA 5CSXA 1FOTA 3PSCA 4U41A 2W1GA 3THBA 4LG4A 2O65A 4QPAA 3FQHA 3W1FA 1J7LA 5A4QA 5HOAA 1LUFA 2YLEA 3RTPA 4G5JA 3BLHA 2I7QA 3SHEA 2YM3A 3DKGA 4O7TA 1OZ1A 4KNBA 1PYEA 3M1SA 4FBXA 4TPTA 3UOHA 2E9VA 3NNUA 3WE8A 3E7OA 4FVQA 3HNGA 3V5JA 3DBFA 3UQCA 2FGIA 1J1CA 4TNDA 2ZOQA 3E62A 5AR4A 1RE8A 2GQGA 2QLQA 4KSPA 4NSTA 5BQ0A 3TNHA 2UZTA 1Q62A 4CQGA 4WRSA 4L46A 2YDIA 1PXKA 3HZTA 4DGLC 5DMZA 5ITAA 1F3MC 1DI9A 3A60A 2ZVAA 1REJA 4U81A 3D15A 5ETAA 4PY1A 4ANQA 4LOOA 5BYYA 3G9LX 5DT3A 4CKJA 3OXIA 2EXEA 2R3RA 3D7ZA 1XH4A 4JBPA 5C03A 3PY0A 4R7BA 4FNZA 5JT2A 3N9XA 5FG8A 4GSBA 2VX1A 4EBVA 5L4QA 2JDTA 3POOA 3LCTA 1W82A 1YXVA 3QLFA 4GYGA 3A8XA 4JIKA 4X21A 1H1SA 2W7XA 4EQCA 3S1HA 1U4DA 3MH3A 3U6HA 3BU3A 5E90A 3BGZA 4BCGA 3ENMA 4K77A 4AW0A 4PNIA 1UU3A 1GJOA 1XBCA 4AN2A 1AGWA 5IQBA 4KIQA 5DOSA 2SRCA 4FSYA 3OS3A 1XO2B 4IDTA 2HAKA 1WVYA 3FQEA 4S30A 5A3XA 4BIBA 4LI5A 4L01A 4WG4A 4MVFA 3ZO1A 4O7VA 2RFNA 2HELA 3ZC6A 1XHAA 3F88A 2ITTA 4YZCA 2C47A 3W32A 4XHKB 2J5EA 3ULIA 4S34A 3UTOA 4O0TA 5CNOA 3RZBA 4QP4A 4YMJA 2PVNA 2UZDA 1PMVA 5ANKA 3TL8A 4PMPA 4DAWA 3ZM9A 3K5UA 1IRKA 3GI3A 2VO6A 2PHKA 1YI6A 2IVUA 2WTKC 4KBAA 5J9YA 4ZTRA 1O6KA 2GNLA 2FH9A 3P9JA 4CRSA 4BC6A 3FZ1A 4H39A 3FJQE 4CCUA 4YLLA 3VIDA 3V5PA 1Y8GA 1OVEA 4R3CA 5HD7A 5HI2A 3ZHPC 3GCVA 2JAMA 2UW0A 4F65A 5AEPA 5F9EA 4AW2A 5HO7A 3ORMA 4LQMA 4Z55A 5HVKA 3VUDA 1OB3A 2W17A 3ELJA 2NO3A 4J52A 1YWRA 3AOXA 4FR4A 2G2HA 4GV1A 1Q5KA 5AV1A 5JRSA 1ZAOA 3BGQA 3CS9A 4RZVA 5CWZA 4IIRA 3R8MA 2WMRA 3RCJA 4EORA 3MPMA 5HLNA 5IQEA 2YERA 4OBOA 3OBGA 2R3IA 3TKIA 3UODA 1BI7A 5CSHA 3OVVA 2ZJWA 1FPUA 3SXSA 2WEVA 1BL6A 2EVAA 2XEZA 2G2FA 5HVYA 4ASZA 1V0OA 3KU2A 1ZZLA 2CSNA 4HCUA 4FV2A 1T45A 3ZONA 3RM6A 3C9WA 5AP1A 5KBRA 3Q6WA 5GIPE 2VN9A 3G6GA 3MVMA 4FTQA 4TRLA 1ZOGA 3C51A 4B7TA 1ZMVA 1JKKA 3QF9A 4CFXA 2YM5A 5I9VA 4Q9ZA 4AT5A 4LRKA 4GEOA 4NIFB 4D4VA 1H4LA 3VW8A 2OLCA 1SYKA 4FOBA 2VTAA 3VUMA 3GT8A 5AM7A 3S00A 3NW7A 2JDRA 4KBKA 1UNGA 4AGUA 4G34A 5JZJA 1FGIA 4A4OA 4DG3E 4EOLA 2PYWA 1WVWA 3R9DA 1PHKA 2UVYA 1TKIA 1PXLA 3EKNA 4E6DA 3R8LA 2WMTA 3AD4A 3LJ0A 4U43A 4CTCA 4OT6A 3G90X 4DN5A 4AX8A 2WAJA 1O6YA 3NUXA 5GINE 5BNJA 1XH6A 3EQGA 3VUIA 5CVGA 4U9AA 1KE5A 5HE3A 2A19B 3N4VA 1HOWA 1OL5A 4ZTNA 2AUHA 2VU3A 3CD8A 4MX9A 4H05A 2GNIA 4IVBA 3FMLA 4R1YA 3GC9A 3TDWA 3QRIA 4EHEA 4N6YA 3V8WA 1YHWA 2WQEA 1DI8A 4PTGA 3UC4A 2RF9A 3ZFMA 1NXKA 3DBDA 3MPTA 4M3QA 4TYGA 2WMVA 3VF8A 3MH0A 4YC8A 5J8IA 4DF3A 2XRUA 2BPMA 2CN8A 1A9UA 4X2GA 2VZ6A 5KE0A 4EL9A 4ASDA 4EOSA 4RIWB 3SRVA 2QURA 1IAJA 4F7LA 4FVRA 4GIHA 1WFCA 3LMGA 2UW3A 2Y0AA 4WO5A 4XG4A 4I92A 2UVZA 2PVJA 4D1ZA 3NYVA 3E7VA 2R4BA 3C0HA 2X2KA 2Y4IB 3DNDA 2X9EA 4MXYA 5KHXA 1RQQA 4D9TA 2NNWB 1J3HA 1JAMA 2VTJA 1FMOE 3KRRA 3ORPA 3LFEA 1J7IA 2YEXA 3MY0A 2UZLA 1XBBA 2FVDA 3EZRA 4RWKA 3EN5A 2BIYA 1XH8A 2QCSA 4FOCA 4R3RA 3II5A 3KY2A 4FG9A 1Y57A 4IWDA 3I79A 5ANJA 2R3FA 4LFIA 4YNOA 3VBQA 2KULA 4PPAA 5HNBA 5HTBA 5CQWA 4IFCA 2B9FA 4R8QA 3EB0A 4M69B 1Y6BA 3KK9A 3PE1A 3Q3BA 4IAIA 2HWOA 4GJ3A 5TKDA 3KCKA 4G9RA 5KMNA 2B1PA 2ZV7A 1O6LA 2XNGA 3FMJA 2F2CB 4QYGA 5CU2A 3UVQA 3WZJA 4QMSA 5J1VA 3IW6A 3IW5A 2ZDUA 2RFSA 4HGSA 3KCFA 2XUUA 3Q4ZA 2YWPA 4F08A 4FSUA 4XBUA 3TZ9A 3FZOA 3CSVA 2J0JA 3C13A 5HGIA 4MCVA 4BGHA 2KTYA 1K9AA 5FTQA 5HNGA 4BTJA 4PMMA 4RG0A 4ZSAA 2BRNA 5CASA 3VC4A 1LR4A 4XV1A 2FA2A 4R7IA 3QQKA 4JT3A 3WF7A 4OTGA 3MFTA 2WTCA 4AT4A 3QZFA 2OBJA 2QOOA 2OI4X 1WVXA 3A7IA 3GBZA 4J97A 3DJ7A 4BCJA 3VHEA 3FSFA 5HIEA 3ROCA 3L8SA 1NVRA 2GS7A 4RA4A 3CE3A 3MIYA 4GVAA 4Z9LA 5I3OA 3SLSA 3NCZA 1J91A 2W1HA 3KMUA 3ZFYA 4F9CA 2ZB1A 3H9RA 4O0YA 3EFJA 1BX6A 5IQAA 4KS8A 5EFQA 4O6LA 3HX4A 4WG3A 5A4LA 3KXGA 4F09A 3FC1X 5L2IA 3OTUA 4XBRA 5E1SA 2O0UA 3FHRA 5AP7A 4BYJA 5C4LA 3NMUF 4PWNA 4S2ZA 4GG7A 2JC6A 5DHJA 4O7RA 1GIJA 3P4KA 4NW6A 4O0XA 3FEGA 2WB8A 2IG7A 3SG8A 3ETAA 3NYXA 3CTJA 4GMYA 2YA9A 4I4FA 2BCJA 1H26A 1H08A 2QHNA 2QOBA 3GC0A 4YHJA 3VWAA 1W8CA 4YO4A 4KB8A 3TZ7A 2WIHA 5CT0A 3KF4A 2FB8A 3QCYA 4AG8A 2ITWA 2H6DA 3QTZA 3HV5A 2BKKA 2ZB0A 2OJJA 4A9YA 4L3JA 3R2YA 1O9UA 4U3ZA 3IOKA 1WMKA 2WELA 2C30A 3DJ5A 3ZXZA 4DYMA 2FSLX 5CZHA 5EHLA 1YXXA 5K4IA 3E3BX 3PRFA 3BELA 4RSSA 2G2IA 4USDA 2JIVA 5DE2A 1M14A 1BLXA 5M44A 4E6CA 4F70A 4G16A 1P2AA 2RKUA 3BBWA 3IGOA 4HPUE 5AP5A 4C3PA 3DY7A 2V5QA 2OJFE 3BPRA 4EHZA 2B9HA 2X2MA 3WZUA 4AQCA 3FZRA 1ZWSA 4NK9A 3S3IA 3UZTA 1IEPA 5C8KA 4C2WA 2WEIA 2BALA 1OKYA 3QQJA 4BCQA 3U4WA 4CMOA 5EG3A 3ITZA 1APME 1S9JA 5BVKA 3LLTA 2W9FB 5GJGA 2F2UA 5HCYA 5EKNA 1OIRA 1ZOHA 2XH5A 1OPKA 2H8HA 3NS9A 5H8GA 4ZTQA 2C5YA 3W2SA 4MXOA 5K4JA 2QOIA 4EUUA 1RDQE 2J0MB 3C4XA 4U5JA 3UP2A 3FLWA 4AP7A 5JFXA 4O84A 2JKOA 4RVTA 4TWPA 4DGMA 3R1NA 1YOLA 4W8EA 4ALVA 1MRVA 2PMLX 4QMQA 4QP6A 4L7FA 1YXTA 5KNJA 2CKEA 5TO8A 5FM2A 4MXAA 5CI6A 4PQNA 4IADA 3E8CA 1PYXA 5FP6A 3ZFXA 1R78A 1XH5A 4FV7A 4M68A 4OBQA 2UZVA 3TXOA 4UZDA 2FSMX 5CZIA 1R0EA 3BU5A 4PDSA 1YDTE 2VTIA 4WT6A 3WZDA 4EOPA 2O64A 5CYIA 5D7VA 4EC9A 3MSSA 3OUNB 3LIJA 4D2WA 4EKLA 2GQSA 5KMLA 3QHRA 4UMQA 2I0YA 4E8AA 2R7BA 4IB1A 4LGHA 5AIRA 2RFEA 4YPSA 2YM8A 3ZRKA 3TIZA 4HVSA 3S4QA 3Q4TA 1R39A 4YUQA 4RQVA 4O1OA 3OT3A 5CU4A 4CYJA 3V5WA 4ALUA 4OAVB 4JBQA 4X6QC 2QD9A 2J4ZA 4RWLA 3QD3A 1JQHA 3RWPA 2BFYA 5HIDA 1TQIA 3BYVA 4WNMA 2C68A 2OIBA 3Q4CA 2OJGA 1JOWB 2Z7RA 4BI1A 2C5XA 3F3UA 1R0PA 5C8NA 4FIIA 4YZNA 2HXLA 3I6WA 2A4LA 3TI1A 5HU9A 5AV3A 3AT3A 3GVUA 3P79A 4KRDA 3U87A 5JKGA 4UV0A 4R78A 4XG2A 5AP2A 5D10A 1JSUA 3ZUVA 4JLCA 4LV8A 5C4KA 3MPAA 1U54A 2OH0E 4RLLA 3RPSA 1W84A 3EQRA 4OBPA 4ZMFA 3FXWA 5K3YA 5KZ0A 3L9PA 4C3FA 2HIWA 1H07A 2R0UA 3M2WA 4RWJA 2Z8CA 5EW3A 3VBWA 3BYUA 2XRWA 4IANA 4ASEA 5JN2A 4YHTA 3ZLWA 5KKRB 2R5TA 5KO1A 3F82A 4HNIA 2R0IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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