3E93A

Crystal structure of p38 kinase in complex with a biaryl amide inhibitor
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
350
structure length
346
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDELKILDFGLTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Kinase array design, back to front: Biaryl amides
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 111
structure length 346
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3e93A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3e93A01
3KB7A 2JGZA 2R4BA 3W10A 4CMOA 4FV8A 3DNEA 4NM3A 5CSVA 2GTNA 2ZM4A 2XM8A 5HIBA 2HELA 5E8UA 4CGAA 4GT3A 3EZVA 4O1OA 1SM2A 1OKZA 2QD9A 4CYIA 2P2IA 3IDCA 3WF9A 2GNJA 5IQAA 4O82A 4AT3A 2XH5A 4BHNA 3BKBA 4UMTA 1OIUA 2J0LA 3RAHA 3R7IA 4GFMA 3HP5A 4D4SA 4J99A 4MBLA 3R7GA 1WCCA 2QLUA 2UW9A 4GW8A 2ETKA 3BGQA 5CYIA 4EHGA 3VHEA 4TNDA 3LFCA 3PE1A 4QMPA 5C01A 2Q0BA 3VUHA 4WNPA 5CAUA 3U4UA 3MS9A 3TDVA 4O7WA 5L2SA 1OM1A 5GJFA 5DRDA 4JX7A 3NDMA 4TTHB 1K2PA 4RZWA 5CF5A 4C4EA 4O38A 3T3UA 5HE3A 3DNDA 4YMJA 3MVJA 4RIYA 3MBLA 2P33A 4NKSA 5T6KA 1H8FA 2EVAA 4EOLA 2XIRA 4O2PA 2VTOA 3ODYX 4E6DA 3TI1A 1ZWSA 4DN5A 1WVYA 3BYUA 4Y5QA 5C4LA 4PQNA 4Y8DA 4J98A 3H9OA 4RRVA 4M7IA 3GC9A 2ERKA 4BDFA 3IW6A 5HG5A 4OAVB 2YABA 2XA4A 4R77A 1OPLA 3CE3A 3ATSA 4ANSA 3ZFYA 3ZFMA 2VWYA 4C7TA 5HNIX 5E1SA 5J1WA 4QP9A 1FMKA 3E7OA 2G2HA 5AUWA 4EORA 1H07A 3EOCA 5CEKA 4HYSA 3LCDA 1Q5KA 2AC3A 3H30A 3QQKA 2XNEA 3R28A 1ZOGA 2W9FB 4ZIMA 2CLQA 4ZZNA 3NW7A 5EDRA 3RJCA 3IDPA 4JRNA 2QG7A 1Q41A 3U55A 3VUKA 5EK7A 1H1WA 3WIGA 4QT1A 4MX9A 4PF4A 5EW9A 4KKHA 1PXLA 2XEYA 3T9IA 4JG6A 3IW7A 2ZYBA 3PPZA 4PDSA 4YJNA 3TKUA 3QZHA 4IDVA 3TIYA 3NR9A 4FTCA 2YAKA 4RLKA 1W83A 1JSUA 1JKTA 3NAXA 3BHHA 5IEVA 4M67A 1FGKA 5EM7A 5I4NA 2XNGA 3SOCA 3GCPA 3A61A 4A4OA 2VX1A 4U81A 3EQPA 3PY0A 4Y72A 5EOLA 3NIEA 3G33A 2ZV9A 3P4KA 3PXRA 5EG3A 4QTAA 4AS0A 2XKFA 4RX9A 4PNIA 3GC7A 4IJ9A 2FA2A 1W82A 4L45A 4DBXA 3RINA 4ZXTA 4EK5A 2HY81 2XMYA 3OCGA 4ALVA 4KWPA 5HBHA 4XYFA 4O21A 5FEEA 3HNGA 4MHAA 5HG9A 4F64A 3UPXA 2PE0A 5EKOA 5DT3A 4O7YA 3GU7A 1YOLA 4MWHA 3D94A 4L01A 4P7EA 3SDJA 3GU5A 4Z3VA 2V62A 4F65A 3O8PA 3KF7A 4EH9A 2UZUE 3JY0A 5I9WA 2RGPA 4CZTA 3BX5A 1DAYA 4XG3A 3ZC6A 3VS3A 2RFDA 3R8UA 2XNPA 3PPKA 4DEBA 4EYMA 3JUHA 1O9UA 3IO7A 2UZOA 4A4XA 4PMPA 2X39A 4KIOA 4O86A 4ZLZA 3KL8A 3FAAA 3U9NA 3MN3A 4IAZA 3NYOA 4L52A 1H1PA 2UZVA 3DAKA 3ZLYA 2QONA 1J91A 5JEBA 5HG7A 3D15A 2JKKA 2JAVA 3R21A 4NZWB 2O63A 2ZB0A 2WKMA 5KCVA 2PWLA 2PVMA 1RQQA 2QU6A 3NAYA 3QUEA 4H1MA 4O0VA 3DKCA 2WMUA 2QVSE 4QQTA 4ERWA 3DBDA 4RC2A 5CI7A 5G1XA 3U9CA 3LMIA 3D5WA 4Z7GA 2HWOA 5CS6A 4PL3A 2C69A 2GNHA 1ZYDA 2WELA 3RKBA 5ANDA 3UJGA 4C4GA 1JKSA 3R2BA 4ENYA 5IDPA 1Q8UA 4EH2A 2AYPA 3ORIA 3PA3A 4YZCA 4EQCA 2PE1A 3UIBA 4OBOA 4KB8A 4IXPA 3ZLXA 4EHZA 3B2TA 5GNKA 3NS9A 3DBEA 3F2RA 3GU6A 5F9EA 4I5MA 2B4SB 1X8BA 4BY9E 2OZAB 2J9MA 4AOTA 2YCFA 3F66A 5KBQA 2QU5A 3ZO1A 5EQPA 2OKRA 4JR7A 3PLAE 4EHVA 2CKQA 4MYGA 2UW8A 3OWKA 3HEGA 4DG2E 2IVVA 4WSYA 4FTTA 3QRIA 5HESA 5EQYA 4ZAUA 4JI9A 1PHKA 5FBNC 3PSCA 5ANEA 4U0IA 3F3WA 4U7ZA 4KS7A 4C4JA 1PMVA 3FL5A 3DA6A 2IW9A 3IW4A 3V8TA 3R7UA 4KBKA 3RPOA 4OTFA 4PV0A 3FPQA 4IZ7A 4AA5A 1VEBA 2PULA 2W1GA 4EJNA 3P9JA 3TKHA 2IPXA 1V0BA 3VUGA 5A6OA 3QTSA 1CM8A 1LR4A 4GKIA 4DFBA 2Z8CA 3LQ3A 2R5TA 3Q4CA 4NW5A 2JDOA 4O6LA 2BTRA 3UGCA 4Q5EA 4W9XA 4CMUA 2VTIA 4PDPA 4UMPA 3TV7A 1P4OA 2YACA 3B2WA 4ZS0A 4ENXA 5E9EA 4JIKA 4OUCA 1H4LA 5FEQA 1ZZLA 5B2MA 3U87A 4EYJA 1IR3A 2RL5A 2YCRA 4U3ZA 4C36A 3L8SA 3POZA 2ITUA 4YBJA 2OI4X 4R3PA 1UNLA 1F5QA 3TZ9A 2R3MA 3MFRA 3W2SA 4EKLA 2IG7A 3FI8A 1GY3A 1QPJA 1REJA 1WBTA 3QA0A 3REPA 1FQ1B 2YA9A 2GS2A 2EB2A 2W99B 4FSTA 4BTJA 2GU8A 3RBWA 4IWQA 1YI4A 3BZ3A 3QGYA 1OITA 2P2HA 3ITZA 4IX6A 4TYGA 3R8ZA 3R9NA 3AXWA 2WMVA 4ZZMA 2EU9A 4FGBA 5IQDA 3ERKA 2HCKA 2BZJA 3JS2A 4Q9SA 3VBQA 3ACJA 1OBGA 1APME 1KV2A 3U54A 3R1SA 3UQCA 4XP3A 1V1KA 4U8ZA 4CRLA 1FGIA 3OT3A 5JQ5A 3FHIA 2V5QA 2WMQA 2PZRA 4C2VA 4DFZE 3OS3A 4TYEA 2X2KA 4UXQA 4XEYA 4CT1A 4UZDA 3SA0A 4O7VA 5CEQA 4ZLYA 2I0EA 4M69B 4FICA 4S31A 3QD2B 4H58A 4WUAA 3G51A 2PVYA 1H1SA 5AAFA 3BIZA 1UNGA 1ZYSA 5M4CA 4QO9A 4XLIA 3NLBA 2EWAA 1IRKA 4G1WA 1O6KA 4L43A 1OBDA 1ZY5A 2WQOA 4IEBA 5CY3A 4BWPA 5CEMA 4OTPA 3FSKA 2G2FA 2VWUA 3OBGA 5AR5A 4CRSA 4USFA 1U59A 4JBVA 2W1HA 2WU6A 3R7OA 2ZV8A 5J9YA 3LCKA 2V0DA 1DM2A 3HMIA 5HO6A 5KZ0A 3TUBA 1J1CA 4FSUA 4CKRA 3HLLA 2JEDA 3LFBA 3C5UA 3P7BA 2E9UA 4FEUA 3TV6A 2C6IA 4ORKA 1Y91A 3TJCA 1KE8A 3NPCA 3M11A 3PJCA 4TKSA 1Q24A 4XG4A 3K5VA 4I5PA 3O7LD 2QO2A 3OWLA 3V5QA 1SVGA 2YITA 4X2KA 1ZAOA 4BC6A 4C57A 3WF6A 1Q8ZA 4GH2A 3R01A 1PYXA 4RPVA 2Z02A 3EFWA 1R0EA 1YWNA 4LM5A 2QOOA 2OW3A 3QRTA 4I0SA 3FLSA 4NT4A 3W55A 3EZRA 5AUVA 3ORTA 4DG0E 4AE9A 4FV1A 4QP2A 3R7VA 4BDKA 3HV5A 4FC0A 4XV3A 3GU4A 4A9YA 2PPQA 3FMMA 3HDNA 3CLYA 5CF4A 4NEUA 4BKYA 2C30A 4O7LA 4IFCA 4ZZOA 2YJSA 2NPQA 4NW6A 5HCZA 3PG1A 2Z7RA 4QMVA 3NVMB 2HWPA 4YJTA 2WAJA 1ZLTA 1SNXA 4CFVA 3G90X 1H28A 4N57A 4UV0A 1YHSA 4ACCA 2OG8A 5C4KA 1XWSA 3QTZA 2GS7A 2OIBA 3AC4A 5HKMA 3SRVB 2CCIA 5CU3A 1OB3A 1PW2A 5I9YA 3QCXA 3VF9A 4M14A 2G01A 3IGGA 4QYEA 4MNEB 5EH0A 5K0KA 5IDNA 1BX6A 4CQGA 2OFVA 4WKQA 3QQJA 2JBOA 2Y6MA 4JLCA 3FYJX 3PY3A 3D14A 3LAUA 4C3PA 5K9IA 4TN6A 5B7VA 3FZRA 5J9LA 3O2MA 4NTTA 2W1CA 1ERKA 2WMAA 4FKQA 5LXMA 4B8MA 2RFEA 4JDIA 4FZ6A 3BE2A 2GHMA 4MQ1A 5A4QA 4MKCA 2J0KA 3KRLA 3AMBA 3ENHA 4II5A 1QPCA 4AGUA 2DYLA 3N4TA 2ITQA 5HOAA 5CAPA 5JMSA 4C2WA 3EN9A 2W1FA 3UBDA 3DB8A 5HD7A 3GCVA 2OU7A 4RFZA 5DN3A 4PDOA 3ROYA 1M2PA 3NGAA 2C6MA 1GJOA 2C0OA 2A1AB 3OD6X 4FTAA 4IAYA 4AE6A 2VO7A 4YUQA 5CNOA 4FG9A 2RFNA 4OGRA 3KEXA 4W4VA 2C3JA 3E5AA 3OWPA 3PWYA 4OTQA 5LVPA 4IAAA 2F49A 2CGWA 3ZSGA 3E8DA 3LQ5A 1I44A 3LPBA 4FVQA 3F3ZA 2BTSA 2BFXA 4C38A 4RA4A 4DEAA 4E1ZA 4EK8A 5KMMA 2HXQA 2X8IA 4P5ZA 2VO6A 4J8NA 4E73A 4O0WA 1BUHA 2ITYA 3EB0A 4G16A 3BLHA 5C27A 3VJOA 4TT7A 4BI1A 2YM3A 3PVBA 4FL1A 3PRIA 4BBMA 4UYNA 3H9FA 3OMVA 4GK2A 4JJRA 5EI6A 4EUUA 4D0XA 3BCEA 4UMQA 3DQXA 4CXAA 4MXXA 5JN2A 4XG9A 3U6HA 4AOIA 4PRJA 3UZRA 4FSZA 3ZO4A 3NUPA 4AX8A 4J7BA 2Y4PA 4C4FA 1JVPP 1YOJA 3WARA 3IPHA 2XIZA 4RQVA 4AZFA 4CNHA 5M4UA 3ULIA 2XBAA 2RIOA 2YIWA 3NMUF 3UIUA 2W1EA 3EQDA 4M97A 4I23A 4FSQA 5L6PA 1IASA 2FSOX 4D55A 2C0TA 2O3PA 4EK6A 2UVXA 4R7IA 4RFYA 4BCMA 3GUBA 4EI4A 5C1QB 3MYGA 5M07A 3CTJA 4LRKA 3CQWA 5DT0A 5FWKK 1J7IA 4C02A 3DPKA 2IN6A 4I3ZA 4BDAA 2Z2WA 4YTIA 5L8LA 2OWBA 4IWPA 1Q62A 4FOBA 4LOQA 3WE4A 4Y5HA 4EONA 1ZRZA 3ACKA 3NNWA 5HORA 1H08A 4GT5A 3W2PA 4BYJA 4G5JA 4AOJA 2IZRA 4ID7A 1ZZ2A 4F9AA 1Z5MA 4A9TA 1YVJA 3W16A 4EOMA 1PXOA 5M57A 4F6UA 2CKOA 2YIRA 5IQEA 3JY9A 3VIDA 2AC5A 1Z9XA 2HYYA 2W06A 2UZWE 3VULA 3NUNA 1Q8YA 4O0RA 5CU2A 3E3BX 3PJ1A 1H27A 5I5ZA 5BPYA 3NYXA 3SGCA 3S0OA 5CASA 5FM3A 3I0QA 4QQ5A 4GYIA 1O6YA 3BE9A 4LG4A 1JPAA 2QOLA 4H36A 4XBRA 5FTQA 4AP7A 3FMDA 4EHEA 5FXRA 4AACA 2G2IA 2OFUA 3EQRA 3H4JA 4GUBA 3RCJA 2VUWA 3R73A 3C4CA 3PY1A 1H0WA 2ZVAA 3FZSA 3F61A 2IWIA 2WFYA 4G6LA 4YJSA 4YJQA 3DLZA 4X21A 5TF9A 3KXNA 3D5VA 2W4JA 3BRBA 3DKOA 4I20A 3W2OA 2JBPA 5HLWA 2WQBA 3GENA 3UC3A 2OZAA 4DTKA 5L2QA 4NFMA 1WAKA 4JQEA 2VZ6A 3QFVA 3BGPA 4IIRA 4D58A 5ETFA 3HYHA 2I0YA 3NUXA 1MUOA 4D1XA 4DT8A 4FKLA 4IB5A 1U5QA 3CEKA 4B6LA 3GXLA 4CD0A 4CV9A 5A4EA 4IC7A 5CAOA 3VS1A 4XMOA 2V55A 5LMAA 4YTFA 3RGFA 4X3FC 5IUIA 5DHJA 5L8KA 4S2ZA 5LMBA 1SMHA 3DKFA 3VUIA 1WMKA 2XBJA 4FTMA 3TNHA 4PMSA 5CT7A 4DEEA 2BKKA 1KOAA 3E63A 5H2UA 1LPUA 4FT0A 3DT1A 4JG7A 4DCEA 3ZTXA 3QCQA 3UDBA 4BDCA 2WB8A 3RM7A 4BICA 5IMXA 3OCBA 4G34A 3ORXA 4RX8A 2C5NA 4HPUE 3KN6A 3RVGA 1QL6A 4FTQA 4XLVA 5LVNA 3LE6A 1YOMA 4U80A 4FE2A 5DMZA 3TKIA 4FIEA 4OT6A 2RG6A 2C6LA 4BN1A 3GCUA 2VX0A 4UALA 1YDRE 2X2MA 5B2LA 4RC3A 3VBWA 4C62A 1MP8A 3VWAA 2HIWA 3TJDA 2UW3A 3HV6A 4E4MA 4UX9A 2F4JA 4IB3A 3UO6A 4K9YA 3VNTA 4FV0A 1M52A 2HZNA 5EKNA 3DTWA 2EXMA 5BNJA 3QGWA 5I3OA 3UG1A 4X3FB 2JIIA 1KE7A 3PVUA 4RJ7A 2IW8A 4MNFA 3NIZA 3VUTA 4ZEGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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