3EFWA

Structure of auroraa with pyridyl-pyrimidine urea inhibitor
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
263
structure length
240
Chain Sequence
RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFLDYLPPEMIEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Pyridyl-pyrimidine benzimidazole derivatives as potent, selective, and orally bioavailable inhibitors of Tie-2 kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase 6
total genus 68
structure length 240
sequence length 263
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3efwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3efwA01
3E62A 3NR9A 3PVWA 3FLYA 2AUHA 3PXRA 3HYHA 4ZS0A 4NTTA 2Z8CA 4ZS4A 3ZRKA 1Y8YA 3G0FA 2W05A 3PY3A 3ZM4A 3QRJA 3NEWA 4LGGA 3Q2MA 2PMOX 5IPJA 3C4FA 3HV4A 5L2IA 5IQDA 2QD9A 3VO3A 2WD1A 3E63A 3BGQA 2W9FB 5E8VA 3SV0A 2QI8A 4ERWA 5ETFA 4WSYA 1G5SA 2X39A 4FX3A 2R0IA 5DT4A 3ZO3A 2XNEA 4NM5A 1OI9A 4RLLA 2IW8A 4O6LA 3RK9A 4RQVA 4FV3A 1UKHA 2W06A 2ZVAA 2GQGA 3MJ1A 4OTWA 3OOMA 2WZJA 2YERA 3L1SA 2YA9A 1PXOA 4K9YA 3OMVA 3W2CA 3WZJA 4XRLA 3KXHA 4ZIMA 4EZ7A 2W1CA 5J5TA 1LP4A 4EI4A 4UX9A 3TT0A 3QZIA 2UZTA 4WNMA 4QPSA 5EH0A 4Y73A 4NZWB 5DR9A 3DXQA 3UYSA 2YCFA 3N9XA 4X2GA 5A54A 1YOLA 4HVGA 4TWNA 3TJCA 1TKIA 1YKRA 3SG8A 4L44A 4NK9A 5J8IA 5J7HA 3AT4A 4UYAA 4Z16A 2XM9A 4AE9A 4C4JA 3SDJA 2JKOA 4L45A 4U81A 5EKNA 3U6JA 4H05A 1G3NA 4YMJA 4BBEA 4B99A 3OW4A 2ONLA 3KK8A 3UP2A 4A4XA 3C5UA 3WBLA 4BDCA 5B7VA 2J6MA 3EB0A 2ETRA 4U42A 4KIKA 2VTAA 2WU6A 1OL1A 4XX9A 4M3QA 2RFNA 4UEUA 2PTKA 3QZHA 3QKMA 3IW7A 1A06A 3LMGA 4JR3A 4UALA 4AW1A 2JKKA 2UW4A 3R83A 3H0YA 4AZVA 4FSRA 5GJDA 3W2SA 4PMSA 3ORXA 5CSHA 1ND4A 4KA3A 3MVLA 4B0GA 1H1WA 4ZZOA 1MRUA 4Q9SA 4B8LA 4ZXTA 4LV8A 5J9LA 1NT2A 1XH4A 2XJ0A 2ZDUA 5EYCA 2G1TA 3BLRA 2ETKA 2WQMA 1OIUA 2UW0A 2YEXA 3QYZA 2XVDA 3VQUA 4JQ8A 5HG7A 3UNKA 2HK5A 2C6LA 3EKKA 2X9EA 2VTRA 4OR5A 5CNOA 3IG7A 4DC2A 4HYSA 3W2QA 4UYNA 3RK5A 1V0OA 3UVRA 5CXZA 1JQHA 5FP6A 2JDOA 3PWDA 1Q5KA 4I0RA 3UVQA 4O7SA 3P7BA 3E8DA 1O9UA 3QTQA 2W5AA 5IMXA 4FZ7A 4EH2A 2VWZA 4C4GA 4N0SA 4XBUA 4I6BA 4HZSA 2YCRA 3JY0A 5AV2A 4IAAA 5LVLA 1WBPA 4AUAA 1YXSA 2JFLA 3FDNA 3R04A 3R9HA 4J97A 3FXZA 4LYNA 1U54A 3RALA 3VBVA 5HE3A 2GHGA 1PXLA 3FBVA 4O7VA 3KEXA 4EOQA 1KWPA 4AQCA 5IU2A 3MVMA 1LUFA 2R3KA 2X2KA 4FZAB 4O96A 3LFDA 3ITZA 4ALWA 4A9RA 2C47A 2PHKA 3AG9A 4BCJA 2NRUA 3RKBA 1W0XC 3POZA 5HO8A 4BHNA 3AC1A 3FMLA 4KAOA 1YI3A 5D9HA 3ZSHA 5I9XA 4XUFA 5TE0A 3O8TA 2Z7LA 3PSCA 4CXAA 3B8RA 4DCEA 4FNYA 3ZLSA 3DAKA 2A4LA 3DPKA 3H30A 3W8LA 3NUAA 3IW8A 4AT3A 2R0UA 1FINA 4V04A 4E1ZA 5IQCA 4M67A 3NIEA 5I9WA 5JMSA 5LVPA 1F3MC 4G3DA 1HCLA 4RG0A 4FTRA 4EUUA 4QTEA 2WMSA 2XF0A 5EOBA 2VNYA 5CZHA 1BKXA 2JIUA 5J95A 1WFCA 5JGDA 4FV6A 3BYUA 4K11A 4JAIA 4F1MA 5HZNA 2OW3A 3FMHA 4FZDB 3ODZX 4Q5EA 4JAJA 4KS8A 3EQBA 3JVRA 1YDRE 4WT6A 2CMWA 1Q3DA 3HKOA 1MQBA 2W1HA 4ACMA 3RVGA 4E6DA 2CKQA 5IUHA 5FGKA 2F2CB 3LFCA 3NWWA 4DGOA 4HVSA 5J7BA 4L6QA 3QRKA 3MH2A 1R39A 4BI2A 3QFVA 2P0CA 4MXXA 2RL5A 3BQRA 4D2SA 2XCHA 5K0XA 1JPAA 4QD6A 3UQGA 2I0YA 4EQUA 2GHLA 2H9VA 3A7FA 3KFAA 4AG8A 4RX7A 4K33A 1R78A 5E8YA 3GEQA 2BZIB 4X21A 5ANOA 3VNTA 1CKJA 4Y46A 3OXZA 5FXRA 4IB5A 5AA9A 4RWLA 3TACA 3UQCA 2VWIA 1XH9A 4FT7A 3C4EA 3GU4A 1YWNA 3QAME 4ZZNA 3QTIA 2BUJA 4DT9A 2YM7A 4NT4A 4J95A 1FOTA 4RIYA 4I5CA 2YFXA 5DNRA 4F7JA 3PPZA 4XRJA 3SRVB 4PPAA 3FL5A 4H3QA 5KHXA 3OWKA 2EVAA 2QR8A 4AN9A 5HD7A 2QOBA 3GOKA 5EHOA 2JIVA 1V1KA 4D2TA 4PDYA 3F69A 2WOTA 3MVHA 2QOHA 5AUVA 4F09A 1W82A 3GNIB 5BYZA 4APCA 2PVRA 2BHHA 4D58A 2UVYA 3LQ8A 4HVIA 5JFWA 5CF4A 3EQFA 3FZRA 4AT4A 1YI4A 3NNVA 4IWOA 4DH7A 3KB7A 2VO7A 2EXMA 4MD9E 4NH1A 4JT3A 5A4LA 1E1XA 3L9NA 2FSLX 4G6OA 4BDBA 1MQ4A 4I0SA 4BDEA 1A48A 5L6WL 4GW8A 4XV1A 4BIBA 5IEYA 4C02A 2BTSA 1B6CB 3E8NA 4HGTA 1Q8ZA 3LCKA 4J8NA 3VJNA 4M69A 1KOAA 2XS0A 4TNBA 4G3CA 4AGUA 3BZ3A 4S34A 5A46A 2W9ZB 4W4VA 5FP5A 3A7HA 3KCKA 1UVRA 4UBAA 4TYJA 4YNOA 3NW7A 4O0TA 3DCVA 2W96B 3CPBA 3P23A 2SRCA 4U43A 3EH9A 3I0OA 4I0TA 3VUKA 1AQ1A 2WFYA 4E4MA 1KE8A 2XRWA 4A9TA 2QODA 2V62A 1VEBA 2XBJA 4L67A 3Q9ZA 4AA0A 5CTPA 4AFEA 5LMKA 3ZXTA 4LMUA 3EN7A 1OITA 1M2PA 5FXSA 3UZTA 3F5UA 3GC7A 4KKGA 5FG8A 2C6MA 2R3OA 4QQCA 3RHKA 2CNVA 2R3NA 4M15A 1GIHA 1XO2B 1DM2A 4FG9A 5A14A 2DYLA 4DA5A 3LCTA 4XG2A 1O6LA 3RGFA 4EOSA 1G8AA 4F7SA 2XIZA 3QQLA 3PPJA 3BU3A 3AC4A 1SYKA 4FTLA 2JDRA 4BCGA 4F7LA 1UU7A 3R21A 4MNFA 3C5IA 3S3IA 2QOOA 2VX0A 3BE9A 3PE2A 3V5QA 3WE4A 3W2RA 3ERKA 4J7BA 3I79A 1F5QA 4FSZA 3OBJA 5HE1A 3V5PA 4AFJA 5EHYA 2QR7A 4ASXA 4KSPA 4JBPA 3E7VA 4AE6A 3OY3A 4O27B 3D5VA 5AIKA 4RSSA 4KRCA 4JL9A 4U97A 4D4YA 4PMMA 3O7LB 4EKLA 2XIRA 3RP9A 4XLIA 3MYGA 2FVDA 3F66A 4FG8A 4RZVA 4TRLA 5KMMA 2YWVA 4JNWA 4Y83A 4H3PA 2QU6A 1M2RA 1ZWSA 2OLCA 3BHTA 1QCFA 2J7TA 5L8JA 4XG3A 3NW5A 1WBOA 4AZWA 4I6HA 5I9YA 3NLBA 2YACA 2WMWA 5IA2A 3TN8A 3DTCA 4R3RA 4X2FA 2JIIA 3U4WA 3SAYA 5CENA 5F4NA 3FKLA 2BCJA 2VO0A 4Y8DA 3QX4A 4EH9A 3KRWA 3PXYA 4PX6A 4TYGA 3SC1A 3ZS5A 1BLXA 5AMNA 5FDPA 3AC2A 3MFTA 2GCDA 5DGZA 1MP8A 4Q5HA 1H0WA 2DQ7X 5HO7A 3ANRA 4GCJA 5HCXA 3R8ZA 3Q96A 4ZTNA 3HMOA 3L8SA 3ETAA 3HV7A 3R7IA 3SHEA 5A4CA 3LCDA 4EH8A 1OL7A 2WOUA 3K2LA 5AP4A 1FMKA 4CFFA 3LXNA 4XG4A 2OFVA 4ZSEA 3QLGA 4QP6A 3KC3A 2FB8A 4G3FA 2Z60A 4TYIA 4AZFA 3LE6A 2R7IA 4C4IA 2X9FA 4CG8A 4RWJA 4KABA 3UOJA 4RQKA 3PYYA 3A60A 3HDNA 4FSNA 4FKJA 4FYOA 3QTZA 4I21A 3M2WA 4LRMA 1URWA 5DPVA 4BR3A 3CKXA 4ARKA 5ANDA 1R0EA 2CCIA 3FAAA 2FSOX 4R1VA 1XH5A 3BHYA 2ESMA 3PSDA 3UO6A 2UW3A 4C62A 2PY3A 4F6SA 3R9NA 3NGAA 3QLFA 4PRJA 5F94A 3K5VA 3RHXA 3D4QA 4EOIA 3FLNC 1T45A 4J8MA 2FSTX 1ZOHA 3FI4A 5AUXA 3OS3A 3KN5A 2PYWA 3BELA 4FZFB 4L00A 4USDA 2R5TA 4LUEA 2UW8A 3RPSA 5BVOA 2ITWA 5K9IA 4ORKA 3FKOA 3BHHA 3FHIA 3R7VA 2PZYA 2VAGA 3MA3A 4BCPA 3DXNA 3SVVA 4O83A 3FE3A 4Y85A 4EJ7A 4ACDA 4I6FA 4XG9A 2FGIA 3FZSA 4L7SA 5CLPA 2LAVA 4C58A 2ITVA 2Y8OA 2BMCA 3BI6A 5HVYA 1NXKA 5HHWA 4ZEGA 2JD5A 4QMMA 3DJ6A 1WBNA 4YTHA 4F70A 3FC1X 1IASA 2O5KA 2WQOA 3R8PA 5AAEA 5CAPA 4WNKA 4X6QC 3R6XA 2R7BA 4W4YA 5E92A 2VWBA 3P08A 4IANA 2NNWB 4EBWA 3EKNA 3FI2A 5EM8A 3V3VA 3FMEA 4QMTA 1Y6AA 2AC5A 2W7XA 1QPCA 5HI2A 5TOZA 5HESA 4X2NA 3V8TA 4FIJA 1ZXEA 2E9NA 4F9AA 1M17A 5LVMA 4R78A 1OVEA 3E5AA 4FT3A 4ANMA 5IF1A 4BDJA 5HOAA 3R1YA 2ZDTA 5GZ9A 2FA2A 3UTOA 2PU8A 3F3TA 3F5XA 2OJJA 4L52A 4O38A 2QG7A 4EC8A 2PZ5A 5CSXA 3OCSA 4ITJA 5DE2A 5H8BA 2OXDA 4D0WA 3NNWA 3KREA 1OM1A 5AR5A 3FMMA 1XBAA 4FKSA 4FIEA 2Q83A 2VWUA 2J5FA 1OBGA 4EOJA 5AR2A 3EFWA 5CASA 1LEWA 5AR7A 4C35A 5B2MA 4BL1A 2RFEA 3KK9A 1U5QA 4QQTA 2CNUA 3PJ1A 4YU2A 4I5MA 1H00A 4BVUA 3QRIA 4D28A 4DGLC 5KBRA 4CYIA 3WE8A 3VUMA 5M57A 4WBOA 4GH2A 3WF6A 4O0UA 5CU2A 1O6KA 5GZ8A 3L8PA 4OAUC 3E8EA 2OJGA 5ANEA 1W83A 4F0FA 4NYEA 4WG3A 4XOZA 1XHAA 1YI6A 3JXWA 2YM3A 4AZEA 4CKIA 3ZLWA 5DYJA 2QONA 3IONA 4EZ5A 3ULZA 1JVPP 5D10A 3G9NA 4EOMA 2BTRA 3WF5A 2WIPA 5LCKA 2JDTA 5J5SA 2UZWE 5HICA 1YHSA 5CU6A 4FSWA 2VN9A 4IJ9A 4DEBA 4AP7A 4DBXA 4B9DA 3FI3A 5KZ0A 4PL3A 4RRVA 3EN6A 4ASEA 2ACXA 2QHMA 2CKEA 3BU5A 3DZQA 3IQ7A 3ORKA 2YLFA 4PDPA 4O84A 1ZAOA 3C50A 3IDPA 5K3YA 2W4JA 5A4QA 3AMYA 4LGHA 3LCOA 4RWIA 1IEPA 5HLNA 3R9DA 4EOKA 5M09A 2QOIA 2GMXA 4GK3A 1YHWA 4KS7A 1RJBA 3FUPA 3PVBA 3V01A 3VVHA 4FGRA 4C37A 3NYVA 3HRCA 2QOQA 3UIXA 1OBDA 2PE0A 3ZUUA 4EORA 3GB2A 2R4BA 2EXCX 2XNGA 3F3WA 4NEUA 2C1BA 4USEA 4PUZA 3RPVA 3PP1A 2ZB0A 4LFIA 3KMUA 5HLPA 2BDFA 2A0CX 3DK3A 4QMWA 4U6RA 4FSUA 5HCYA 4A9YA 3MH3A 3MIYA 3TDVA 2HZ0A 1WVXA 2FUMA 3QTXA 3TZ7A 1U4DA 5JFSA 3PJ8A 4I92A 2P4IA 4GKIA 4F08A 5ETCA 4IX3A 1EH4A 4TN6A 3LW0A 3GQIA 4ZAUA 4YJQA 5EW9A 4GT5A 4NUSA 1FQ1B 4DEGA 5CI7A 4FOBA 2VV9A 4X0MA 2Y4IB 3LM5A 5AUTA 3ZCLA 2XK7A 5CVHA 5IQAA 3LFSA 4GRBA 4IC8A 4IVCA 4WRGA 3TZMA 4EOOA 4AW0A 4NCTC 4O81A 4XNEA 3HL7A 4BFMA 4USFA 5JGAA 3QCQA 3TNPC 4AAAA 5IISA 3MTLA 4ACHA 4A06A 2GTMA 4FV4A 4LL0A 2B55A 3R1SA 4QMLA 2O8YA 3OXTA 3PXKA 5BVKA 4YHTA 2IZRA 2OZAA 1JSTA 4ENYA 5LWNA 5EOLA 3EQCA 3IW6A 2H34A 3DAEA 3VRZA 5CVFA 5IQHA 2C69A 3R9OA 2IJMA 5HBHA 2J0JA 4TPTA 2ZV2A 3GT8A 4RLKA 2I6LA 4CFMA 1Q4LA 3COMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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