3EIDA

Cdk2/cyclina complexed with a pyrazolopyridazine inhibitor
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
297
structure length
292
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Synthesis and evaluation of pyrazolo[1,5-b]pyridazines as selective cyclin dependent kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein kinase 2
molecule tags Transferase/cell cycle
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 292
sequence length 297
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2008-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3eidA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3eidA01
1YWVA 4GKHA 2UVZA 2SRCA 4EI4A 3KA0A 3Q9YA 4YC8A 3RNYA 5DN3A 3IW4A 5F4NA 2ZV9A 4C37A 4DFLA 4BCIA 5EFQA 4FKJA 1K3AA 2C3KA 4USDA 2QG5A 4YLJA 4PNKA 3GCUA 2UW6A 5CENA 3ROYA 2GNLA 2PZYA 3MPMA 3FEGA 4EQUA 4E1ZA 2R9SA 3IKAA 4JG8A 4P90A 4MXZA 4AP7A 2GNHA 2ZM4A 4FKTA 4BCGA 3MESA 4DC2A 5E8WA 3PTGA 4I41A 5AP7A 4X2FA 3ENHA 4EKKA 5E1EA 3R8MA 2F49A 5HIDA 3BX5A 4NFNA 4JIKA 1O6YA 2OG8A 4D4RA 1LEWA 5EOLA 1U46A 5AEPA 4OAUC 1Z5MA 3ZBXA 2YACA 3VBTA 3V5PA 3OOGA 4ZY4A 4DH8A 4I92A 4MTAA 3QQUA 5D1JA 3ZHPC 4PMSA 4NM5A 3GCSA 3SC1A 3EKKA 4OUCA 3RJCA 3FE3A 2VTTA 3CGOA 4M8TA 4ALUA 4I5HA 1YW2A 4BHNA 3N4UA 3LLTA 5B2LA 3HRFA 3RZBA 1PXMA 2IZUA 1LEZA 3BV2A 3PE1A 3SOAA 3DJ5A 3RMFA 3II5A 3ALOA 4RPVA 3G6GA 3U51A 1DI8A 4DBXA 1Q3DA 3ALNA 4QP3A 2R3KA 2RG5A 4TPTA 2R7IA 4EK8A 5I9UA 5EYMA 1XKKA 1OI9A 5DEWA 2YA9A 3MPTA 2JIIA 3B2TA 4C4GA 5BPYA 1NT2A 2WMQA 3FHIA 3QD4A 3BBWA 4GMYA 4LV5A 1PXIA 2IZSA 2YFXA 5IA5A 4TYEA 4BYIA 2VTHA 3D9VA 3BYVA 3RINA 2JKOA 4TWOA 1DI9A 4FBXA 1BI7A 1XR1A 4M66A 4EBWA 4D28A 3G15A 3QCXA 2JAMA 1XQZA 2RSVA 2W0JA 3NLBA 5C9CA 3VO3A 4DLIA 5F9EA 5JK3A 4AGWA 1UU8A 3F88A 3ZRLA 5CAPA 3NW6A 3HVCA 3EHAA 4FTMA 3LFDA 2JFMA 4ZTRA 4BCOA 4BBMA 1M2PA 4D0WA 4DEEA 5CQUA 2BROA 5JZNA 1H08A 3VBQA 2PPQA 3RVGA 1QPDA 2R3NA 1NVSA 5EW9A 5CU3A 5CNOA 3R7UA 4QMLA 3UVQA 4Z3VA 5FUTA 4WUNA 1H1WA 2DUVA 2WTKC 3QU0A 4NKSA 4F9CA 5HO6A 2G01A 5KMMA 2VO3A 4HGLA 4IVCA 4GU6A 4LOOA 5AAGA 1VZOA 4FTLA 5DRBA 2XNPA 3PJ1A 3IOKA 4WBBB 3JUHA 3S95A 3ANRA 4S32A 4DGLC 3TT0A 2Z7LA 4EH7A 2YCSA 3ORIA 3E93A 3FAAA 4UB7A 4QYHA 2PUIA 3NAYA 4YTFA 4YNEA 5IEXA 4NM0A 3BE2A 3MPAA 5BUJA 2HWOA 3GU4A 4A7CA 2H96A 1G8SA 3R1YA 1Q97A 3MFRA 2UVXA 3UTOA 4ITHA 5HBHA 5TE0A 4EOIA 3QTWA 2B4SB 3FKOA 4FEQA 4NT4A 4S33A 3Q52A 3O17A 2XK9A 3QX2A 4FGBA 3AGLA 3C4FA 3GU7A 2JKMA 4EH6A 1PRYA 5M57A 3NNVA 1OL5A 3B8RA 4FIIA 3UPZA 3VS5A 3OT8A 4TWPA 5J87A 2UZVA 2C68A 4RJ7A 2WNTA 3P23A 3QTXA 2IW6A 4FV9A 2ZV7A 4PDPA 4YJUA 3ATTA 5HTCA 1AD5A 4CG9A 3UOHA 1FINA 3MVHA 3W16A 2OSCA 5CAUA 3UZPA 1I44A 2BUJA 3P4KA 1WBOA 3R7EA 4MF0A 2BIYA 2ZOQA 3FC1X 2WKMA 2HOGA 3EFLA 3R7IA 3LMIA 3DY7A 4ZJIA 3U9CA 5HZNA 4GFMA 3IDPA 4KAOA 5CTPA 2GU8A 3C9WA 2GTMA 2G9XA 3GXLA 5JQ5A 3FMLA 1V1KA 3W2CA 2ITUA 3FI3A 3W8LA 3ZLWA 3ZO2A 4CQEA 4EOQA 5IF1A 4CFMA 5CAVA 3LM0A 2R3HA 2XEYA 4L3LA 4QT1A 3TL8A 4BZOA 5IA3A 3AMYA 3DLSA 4FT0A 3RK9A 3GB2A 1Q62A 5HBEA 3GUBA 5HE2A 4F4PA 2YCQA 3UP2A 4KSPA 2EB2A 5FBNC 4G1WA 3SLSA 3FZOA 1OB3A 2F2UA 4LUEA 4M12A 3TIZA 3WF5A 3ORNA 3D0EA 4O38A 1OBGA 3COHA 4ZS0A 4BDBA 1PHKA 3PVGA 2P2HA 2BFYA 3MB6A 1CTPE 3QRIA 3ZCLA 4F65A 4AE6A 3CKXA 5DT3A 4G3EA 3GI3A 4AFJA 1A48A 3PWYA 3Q4TA 1OM1A 2YN8A 3LVPA 4M15A 4UEUA 3UODA 4BDGA 2EXEA 4YTCA 2WTJA 5HG8A 2F2CB 4HNIA 2W06A 5KMNA 3CSVA 2QD9A 3AMBA 4HNFA 2GPHA 5JFVA 4XLIA 4R7BA 2UZDA 3VF8A 1KSWA 1RE8A 4XG3A 2CPKE 3FMHA 3RPOA 4IZ5A 4B0GA 3H0YA 3VRYA 3NSZA 4YLLA 4O83A 4BICA 1IR3A 2RFEA 3OUNB 4KKGA 3UPXA 3WOWA 5GIOE 2W1FA 1KV2A 2XJ2A 3V5TA 2WIPA 3ZXTA 2YHVA 2PUUA 4U40A 4F9YA 5IDPA 3EQCA 3DFAA 3V8SA 4LRMA 1ZOGA 2R3OA 3OXIA 4HPTE 4Q2AA 4X2NA 3SOCA 3N4VA 3ZO4A 2VTRA 1XO2B 1NVQA 2B9JA 2ITZA 4FKRA 4PL5A 1MRVA 4TZRA 2BILB 4AN2A 4E5AX 5FXSA 3ULIA 4W8DA 4A9TA 3WZKA 3UOKA 2X1NA 5CYIA 3R73A 5I9WA 3UE4A 4Q9ZA 4C59A 4WNPA 4NJDA 1YHVA 4C57A 3IDBA 1E9HA 2XCHA 2GTNA 1DM2A 3MB7A 5KKRC 4GIHA 4ITIA 4AA4A 4DCAA 4F0FA 3LQ3A 1SNXA 2BAJA 3KKVA 1WZYA 2VN9A 5IEYA 3O71A 3VF9A 3ZM4A 4A9YA 3LMGA 3U54A 4N6YA 3QZIA 1XH4A 2IVSA 3FZTA 1EH4A 2B52A 3FQEA 3HA8A 5DMZA 3PVBA 5KZ0A 3KN6A 3LZBA 5A4EA 4JL9A 2YM8A 4FTCA 2ESMA 4Z7HA 5IEVA 1XBCA 2QR7A 4Z55A 4H1MA 5AM6A 4BDAA 1Q8YA 4J1RA 4U7ZA 5DGZA 3TZ8A 2BTRA 3DAKA 4YTIA 1XJDA 3BHTA 1S9JA 3O51A 4DHFA 4B6LA 2X8IA 3BU5A 3MIYA 5G6VA 5LMAA 4DEAA 4GS6A 2BKZA 3DGKA 3OF0A 4P5QA 3VS2A 1IEPA 3FQHA 4ZS4A 4CMOA 4PMMA 4L68A 3PXYA 3MN3A 5CS6A 2PVJA 3GOPA 4FSWA 2YITA 4LM5A 2RGPA 3R7VA 5J1VA 4DG0E 2NRUA 3FXZA 5G1XA 3A7FA 3R8ZA 1BYGA 3GNIB 3GFEA 1OUKA 5AUYA 3D14A 3UC4A 3FLWA 4J96A 5HCXA 2EU9A 3MA3A 5EI2A 1ZRZA 3QLFA 2OXDA 1JWHA 4K77A 1J7IA 2YEXA 4DH1A 5HORA 4AE9A 5C4KA 3QQLA 4CZYB 1OMWA 4CRLA 4IAIA 3TKHA 2C5YA 3G0EA 4BYJA 3ZEWA 2XBAA 2P55A 2RF9A 5LVMA 1YXVA 3B8QA 3HX4A 1PXPA 1ZAOA 2OICA 4BGGA 3IPHA 3RP9A 4EOOA 3OEFX 2X9FA 5IA2A 2I0YA 3FXXA 3A7IA 2BRMA 4J53A 4EK6A 2P2IA 4PP9A 4MAOA 4NM7A 4ZSGA 1ZMUA 3LE6A 4IXPA 3FZRA 1FBNA 3R8UA 4WA9A 3FSKA 3QX4A 1J1BA 4O1OA 4PF4A 5M4IA 4PPBA 1ZY5A 4X3JA 4I0RA 4EYJA 3LJ1A 3BU3A 3BYSA 4P5ZA 5HNIX 4RJ6A 4CFVA 5FWKK 3C5UA 4IHPA 2QODA 2UZWE 2J0LA 5FRIA 4AOIA 5IPJA 3C51A 3Q32A 3N9XA 2I40A 3FV8A 2YAKA 3OTVA 4Y72A 3I1AA 3V5QA 4AW5A 3CC6A 2UW3A 1JSUA 5KO1A 4I6FA 2CGVA 4CSVA 1BKXA 3QQKA 2QKWB 4L3JA 3GCVA 3WF7A 4TN6A 5HTIA 4R7HA 1B38A 3EWHA 4G34A 3FWQA 5FEEA 4F63A 3C1XA 2GQRA 4LYNA 2VWWA 4GVJA 4IQ6A 5LMKC 3I4BA 3FMEA 3RAIA 1FPUA 5EKNA 3PA5A 3RPVA 2J50A 3QTRA 3JY0A 1RQQA 1YOJA 4FZ6A 4KRCA 2CHLA 4RZWA 4FTRA 3TWJA 2ZYBA 4C58A 2CGUA 1VEBA 4ASXA 5HLNA 5DLSA 5AFVA 4OLIA 1RW8A 4BCQA 4W8EA 1FQ1B 4IB0A 2FO0A 4AU8A 4DH5A 2J7TA 1K9AA 4RFMA 2PY3A 3V01A 5AR7A 3P9JA 4KS8A 3MIAA 2VO0A 5DHJA 2OFUA 3V3VA 4YJQA 5A6NA 4HGEA 3M11A 3QZFA 2BZKB 4IB3A 5CF8A 3CTJA 4JT3A 2WQBA 4I0SA 4NEUA 3HKOA 3UOJA 4UX9A 4OAVB 3PJ3A 4YHTA 2YM6A 1ZMVA 1U59A 3UVRA 4U6RA 5E8UA 3NUNA 4FG8A 1H00A 1SVGA 2NO3A 2UZBA 4HYUA 2HZ0A 2VAGA 3SW4A 2W4KA 3EFJA 1WVWA 3WE4A 3TV7A 3IW5A 2Q0BA 2Z7RA 1HOWA 1FMOE 4O84A 3QTSA 4L52A 2E2BA 4YNOA 5EM8A 5IH5A 5CXHA 1OPKA 3KMMA 5LVOA 4GK2A 1WBSA 3H9RA 4FV7A 2R4BA 3NYVA 3PJCA 3S4QA 2RG6A 4L6QA 4CFFA 3KRXA 5IA1A 3RK7A 4YO6A 2CGXA 2W96B 2JKQA 2J0KA 4XLVA 2DQ7X 5DT4A 3DBEA 2PK9A 3E87A 3RAKA 5AV2A 4JS8A 5B2KA 4AW2A 4WO5A 3W18A 3VUKA 4A07A 4C4IA 1NY3A 2Q83A 3PA3A 2OH4A 3PSCA 2XUUA 4C36A 3LJ0A 3MJ1A 3DS6A 1YXTA 2BZIB 5L2IA 4DG3E 4O7SA 5CASA 3KRLA 2JIUA 3TJCA 4YP8A 4W4YA 2PTKA 2UW4A 4AT3A 2VO6A 2IVUA 4A4OA 3QFVA 4O82A 3EOCA 3ZM9A 3DDPA 4WNKA 4CXAA 4O7WA 2QCSA 1XBAA 4ZTSA 4AA0A 2A27A 2WGJA 2YISA 3C4CA 3CTQA 2ITXA 4RQKA 3BBTB 3EYHA 3KFAA 4I5PA 1Q3WA 2V0DA 5HLPA 5IDNA 5C4LA 3WZEA 4AGDA 4U41A 3GGFA 3ODYX 4G5PA 5LVLA 3DB8A 2RFNA 1BL6A 2ERZE 3COMA 2IJMA 3QC4A 4G17A 2PZ5A 3KL8A 4U43A 5AR8A 3T9IA 3QA8A 3JPVA 5BVNA 3OWPA 4E7WA 3OCTA 2HIWA 2OIQA 3ZFMA 4GG7A 2X7GA 4CYJA 3CKWA 3OD6X 4YJPA 4AOJA 3D5UA 5CT0A 4EOLA 3U6HA 3U4WA 4DAWA 1H1QA 1NA7A 2W9FB 4IM2A 3HV7A 5FTOA 5ACKA 3PXKA 5A54A 4FYOA 4ANMA 2VNYA 5KHXA 2V55A 4EZ5A 5ANDA 3R1NA 4CT1A 4FEXA 1P4OA 3DQWA 2JBOA 2OBJA 4WG5A 5IQCA 3PLAE 5E8TA 2YZAA 3LMHA 3K5UA 5K3YA 3EQFA 3LIJA 2V5QA 2VV9A 3POZA 4JX7A 2ZDTA 4FZAB 4E4LA 4K1BA 3AD6A 4FA2A 5AP3A 3F2AA 4UMPA 4BDDA 4QTBA 4D1SA 4U0IA 1XH7A 4FZFB 4IEBA 4QTDA 3C5IA 3ANQA 4CV9A 2VWBA 5AR2A 1WBTA 3EYGA 4CNHA 2QNJA 2WQOA 4HVSA 3JVSA 3EQHA 4CFWA 1URWA 1IAHA 3BYUA 2QOIA 3I6UA 2YJRA 4AZSA 3VNTA 2C6IA 2R3IA 3Q9WA 4GT4A 3QZGA 1LPUA 1OZ1A 4QP2A 4RIYA 3R8PA 3NMUF 5CI6A 3FSFA 2F57A 3NYOA 1KE6A 3FY2A 4IW0A 1JAMA 3PXFA 2BMCA 1ZYLA 2OJ9A 2Q0NA 3TI1A 4A9SA 3TKIA 3VQUA 2O2UA 3VC4A 1H1PA 4QMTA 2GNFA 5AIKA 2IN6A 2C5XA 4JBPA 4ZXTA 5JFXA 3NRMA 3TCPA 5M08A 3R0TA 3PVUA 4FV8A 4ZMFA 3NWWA 1M52A 5ANOA 4MD7E 4EWQA 4R77A 4RX8A 4IB5A 2ZV2A 2CKEA 4ZP5A 3D7ZA 3GFWA 4F7NA 5JQ8A 3RNIA 2Y7JA 4F99A 4E6AA 5CF6A 5EI6A 5LXMA 3CQWA 3F5XA 3NR9A 1TQIA 3BHUA 3G90X 5EYCA 2YIQA 4YGAA 3PXRA 4JXFA 1YQJA 2QONA 3E3BX 3KXGA 3PYYA 4P2KA 3RBWA 5CZHA 3OWKA 5T68A 2LGCA 4GK4A 5H8EA 5AV1A 5M44A 3ZH8A 5AUUA 4OW8A 4FTQA 2GDOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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