3EJ1A

Cdk2/cyclina complexed with a pyrazolopyridazine inhibitor
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
298
structure length
295
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Synthesis and evaluation of pyrazolo[1,5-b]pyridazines as selective cyclin dependent kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein kinase 2
molecule tags Transferase/cell cycle
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 295
sequence length 298
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2008-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ej1A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ej1A01
3BQRA 5A46A 2UVYA 3C50A 3QHRA 4I5MA 2XNBA 4IX6A 2A1AB 3SHEA 2B1PA 4R7BA 4FVRA 4NM5A 3PVGA 4BDBA 4CG8A 2RFSA 2W9FB 1U54B 2YITA 3NUUA 3UPZA 1B6CB 2BHEA 4LOPA 3LFNA 4ZSEA 4JX7A 2YM8A 2Y7JA 4CQGA 4EC9A 3CTHA 2BPMA 4ZXTA 1TQMA 4EOQA 3NUPA 1SVEA 4Z7HA 5LVOA 4DYMA 3UQGA 4BIBA 2B53A 1CKIA 2W1EA 4KSPA 4I0RA 4ANSA 3O8PA 2ETKA 4U79A 3UO6A 5LVMA 5DPVA 1WBVA 2IN6A 1BKXA 3DFCB 3VVHA 5BMSA 2ZMDA 5KMLA 5DWRA 1W8CA 3QZFA 2GNHA 4EQUA 3HV5A 2OF2A 3GXLA 3H30A 3QD0A 2G1TA 2OIDA 4GT5A 2QOIA 3WARA 4CV8A 4EK3A 4FNZA 2WOTA 5DEYA 4O1OA 1PRYA 2P0CA 4BF2A 3CTQA 3I6UA 3C0HA 1UU7A 3BGQA 3UO4A 2QODA 4IVBA 1P14A 2R64A 2W4OA 3NLBA 4AUAA 2O0UA 4W8DA 4FK3A 4ZEGA 3OZ6A 4BHZA 3RNYA 1JWHA 4K0YA 4RX5A 4FV2A 5ANEA 1KE8A 2G15A 4AE6A 4XH6A 3K3JA 5EG3A 2XNEA 3GEQA 4IANA 4BDJA 3OOGA 2PVJA 4R5YA 3Q52A 2FSOX 4FT3A 4RJ6A 2HK5A 3VUDA 4D2VA 4YUQA 3E8EA 4L53A 2UZDA 4J97A 2PE2A 4GT3A 2XF0A 4EUUA 3OP5A 3FV8A 3RTPA 2R3MA 3H4JA 1P2AA 2C68A 3WIGA 4V01A 5IQCA 4E93A 1OZ1A 4XV3A 1YI6A 3E93A 3OT8A 1B39A 4KRCA 4W4XA 3U8WA 4BWPA 4MXXA 1PXOA 2X2LA 5HX8A 4M97A 2GMXA 3FE3A 4D1SA 2YCFA 2Z7SA 3GP0A 2FUMA 5AP0A 5GIOE 4HGEA 2C1AA 2WTVA 3NX8A 1B38A 2UZVA 3G90X 3KMMA 4I0SA 3QUEA 4G16A 2W17A 3RAWA 4IBMA 5LMKC 3OBGA 4H36A 3P0MA 4XCUA 4IW0A 3FXXA 3GCPA 2CSNA 4KBAA 3AG9A 4ZLOA 3FKNA 2H34A 3TUDA 3TV7A 2ZDUA 1Y6AA 2XKCA 1HCLA 3KF4A 5CU4A 4XG9A 3ORIA 4QP1A 3VQUA 4DH7A 4EH5A 4RJ3A 5LVPA 3BYOA 2VTQA 4FKPA 3R9HA 3TNPC 1JAMA 3G51A 2QG7A 4GRBA 3JYAA 5TKDA 1U46A 3UE4A 3VS0A 3TZ9A 5HCZA 1KE6A 4R3RA 2PVMA 2OBJA 2WMSA 5K4IA 3BU6A 4YHFA 2XYUA 3DBFA 1UNGA 4PV0A 5AP4A 5LOHA 3VF8A 1NVSA 3WBLA 1P4OA 3PLAE 3CBLA 4FUXA 4FVPA 3R1YA 3E88A 4NKSA 3O51A 3DNEA 4FKTA 4IX4A 4IAKA 3VBWA 5KMKA 5I0BA 3L8SA 3AD4A 4O2PA 4BCJA 4FEUA 4TYJA 5AV1A 2YAKA 4MQ2A 3S0OA 5IH4A 2G01A 3OBJA 1Z9XA 1CSNA 5ANJA 2OJ9A 4F6WA 3MB7A 3TL8A 4EH2A 2A0CX 4KIPA 4U3YA 3GFEA 4G3DA 1KOBA 1ZRZA 5LARA 3R7VA 5E8YA 1NVQA 4PY1A 3L8VA 3PVBA 4AG8A 3CP9A 4TN6A 5IA3A 1O6LA 1QPDA 3COIA 2IW9A 2OH0E 5AFVA 5C8KA 3EQPA 5AUXA 2I0YA 1OUKA 1XBBA 3O7LD 4DA5A 4RQVA 3HRCA 2BCJA 4I23A 4FV7A 3ZH8A 4KNBA 4D1ZA 4DFLA 5KNJA 5M4CA 4K6ZA 3T3UA 4R3PA 3GCUA 5M06A 1WVXA 4ZMFA 2B55A 4IADA 2PUUA 3E62A 4TWPA 3VUKA 2J90A 2QOOA 2OXDA 2OFUA 2VWWA 3ATTA 3S00A 3D5UA 4XP3A 5IEYA 4CMOA 2V7AA 4G5PA 2C47A 1K2PA 4MX9A 2BAKA 3CIKA 1LEZA 4Y73A 1DI9A 2Z2WA 4UMQA 4FA2A 1DS5A 4FKLA 2IW6A 3F5GA 2XIXA 3QWKA 3JVSA 1OMWA 2GS6A 2HY0A 4OUCA 3ZC5A 5K4JA 3LHJA 3QAME 3QU0A 2YIQA 3OC1A 4PDSA 3C0GA 3CTJA 4NT4A 5BVEA 3GFWA 2BRGA 3EKNA 4FL3A 3NCGA 3KXNA 5F94A 3NUXA 4OTFA 4YPDA 3KRRA 3LMGA 5LMAA 3RCJA 4NCTC 2XKEA 4YTCA 4KRDA 4AF3A 2GNIA 1PJKA 3LLAA 5E92A 2FSTX 5I3OA 2B4SB 3PXYA 2LGCA 3PG3A 5EM6A 4LFIA 3R7GA 5IDPA 3OWPA 3ORPA 3RKBA 3IGGA 4CT1A 3RI1A 4AZTA 2YJRA 3MYGA 3KN6A 1RDQE 3LXLA 4RWIA 2ESMA 3U4WA 4F1OA 5CF5A 2A27A 4O22A 4U80A 3VUGA 5IA2A 3U6IA 3LMIA 2WQOA 1P5EA 4B99A 1SM2A 4BCNA 5EDRA 4FTLA 3Q4TA 1ZARA 3UNKA 2VTRA 3TV4A 4DHFA 4OAUC 5CAVA 4G6NA 3NW6A 4XNEA 3U6HA 5JKGA 5DIAA 4U42A 3WF6A 4I41A 4DLJA 2J2IB 1KV2A 1WBPA 2VWZA 2C6MA 3CCNA 4F09A 4I5CA 2R3NA 3WZJA 4GK3A 2PVHA 3LPBA 1REJA 3SXFA 3SXRA 3ZC6A 4IVCA 5FP6A 3EJ1A 1Q8TA 4DITA 5H3QA 4QTDA 3W10A 5AUTA 4AWIA 3OVVA 1PXIA 5DRBA 2ONLA 4BZDA 4ZP5A 4QP4A 2VO6A 3EMGA 1FMOE 3OTUA 2IW8A 3D14A 3OG7A 5HNIX 5K0XA 3O2MA 3HL7A 4CQEA 3ZM9A 4NFMA 1GZKA 2CCHA 3C4EA 3UMXA 1V0BA 2BDWA 4IEBA 4WRSA 2XP2A 4IB0A 2W1CA 4YTIA 4NM7A 1WZYA 3VBTA 3D83A 4ZLYA 2PPQA 2W9ZB 3AC8A 4FSYA 4FEQA 5IMXA 5AP6A 3NGAA 2AC3A 4BTJA 5CEIA 3PWYA 4ZY5A 1YRPA 3FMDA 1TVOA 4RSSA 3EZRA 4FX3A 4HVIA 1VYZA 4RIYB 1A9UA 4GYIA 3UO5A 1XHAA 5EHOA 5G6VA 4C61A 5JEBA 2VO3A 2BRHA 5AUYA 3VO3A 4DT8A 2J5FA 3DLZA 4D9UA 3N51A 2RFDA 3DJ7A 2PVYA 3C4XA 4LGDA 3LXKA 4NIFA 3TIZA 4WG4A 2Z8CA 4IB3A 4BTMA 4Z7GA 1ZYSA 3EQFA 5J8IA 3W8QA 5JRQA 2BRBA 4KIKA 3PXQA 3E8CA 3BGZA 4KS7A 4UXLA 3VJOA 5IUHA 3GQIA 4U40A 3F3VA 4C34A 5A6NA 3KXHA 2WPAA 1KV1A 5A3XA 4ZTLA 4WG3A 1Q8WA 4NH1A 2Y0AA 4XMOA 3DNDA 4QNAA 1VEBA 2YWPA 2ZB0A 5BUJA 3ENMA 5E1SA 3GCSA 4JRVA 2SRCA 1UU9A 2C4GA 4PMTA 3ZONA 4C33A 4I0TA 3A7GA 1QPEA 2C1BA 3T9IA 4U81A 4RJ8A 5FQDC 4IMYA 4CFVA 2ZV7A 5IQFA 2W05A 5AMNA 4FE2A 4ZJIA 2WELA 3IPHA 3R0TA 3VS3A 5TT7A 3QRTA 3QX2A 3UZTA 5L4QA 1UVRA 1OBGA 3AGLA 5M4UA 2E9OA 4QOXA 2EXEA 3OHTA 4CRLA 3CD8A 3BCEA 4QD6A 4TPTA 3UP7A 2YA9A 2PE0A 5LWMA 5AAGA 4TWNA 1W84A 2PULA 4U9AA 1G5SA 1OUYA 3PJ8A 2GDOA 4FTQA 2JKMA 2ZM3A 4DEDA 5M56A 2YERA 1OECA 3RMFA 4CLJA 1W98A 4ITHA 5IF1A 3ZRLA 5E8UA 1A06A 3WE4A 3RAIA 2RKUA 4BDKA 4DBXA 3KXMA 4Q9SA 4ALVA 5JFXA 2X9EA 4EH9A 4FTJA 3GI3A 1ERKA 5K3YA 3A7IA 5H8GA 4WUNA 4BVUA 2G2FA 5EW8A 4AW2A 2ITXA 5BMMA 5M08A 3QHWA 4XP0A 4FGBA 4CTBA 3KC3A 5HVYA 5DMZA 2QLQA 3MPTA 4UALA 4UB7A 1R39A 4TYGA 4EK8A 1OKZA 4FSWA 3DLSA 4OTWA 2CN8A 3PIYA 2WGJA 5EKOA 4BCGA 4CXAA 4USEA 2VRXA 5M44A 3G0FA 4PP7A 2UZNA 3QQHA 4JXFA 2P2HA 4K8AA 3KRXA 5IQAA 4S32A 3ACKA 1G8SA 2YZAA 4IQ6A 3BI6A 4ZS0A 1FVRA 5CEKA 4C4JA 4PWNA 4RFYA 4XG8A 4Y85A 1UA2A 3KULB 4ZSAA 3CC6A 3RAKA 4IB1A 4XOYA 2F7EE 5HTIA 5CSVA 4JBOA 4MKCA 4MK0A 2QNJA 2QLUA 4LGGA 4XJ0A 5KBRA 2QO2A 1IA8A 4ITJA 3OXZA 4MD9E 3HAVA 4XX9A 3JXWA 2CLXA 3RP9A 4ERKA 5HO7A 4JR3A 3MVJA 4AT5A 4YJUA 5DR2A 5HVJA 1OIUA 3R63A 1LEWA 4RLLA 3BHTA 4QQTA 2WEVA 4GVAA 4HOKA 4TXCA 4YNOA 3PXRA 4GS6A 4OW8A 4E6QA 2OK1A 3F7ZA 4IDVA 5ANOA 5CSXA 2HIWA 4AGWA 2JGZA 3HZTA 4WD5A 5DEWA 5EM8A 4M69B 3KL8A 4NJDA 3SX9A 4C62A 3DTWA 2G2HA 2PZ5A 1I44A 2VGOA 2WB8A 3N9XA 3G2FA 4FVQA 3UOHA 5BUEA 2WTWA 5EYDA 3P9JA 5EYMA 3CPBA 4RLKA 2BRNA 5E7RA 4G3GA 1O6YA 2OJGA 4JL9A 3AT4A 4WUAA 2JKKA 3Q4UA 4ANOA 2CGXA 4YTFA 2J4ZA 3QLFA 4PMMA 3PWDA 4OBPA 4M0YA 1QPJA 3VW6A 4A4LA 4EJ7A 4D4SA 3SOAA 5LMBA 3H3CA 1UNLA 3B2WA 2H8HA 4FV4A 4BDIA 3GENA 3ZBFA 4CKRA 3KF7A 2PZYA 4XOZA 4WKQA 5JZNA 3GCQA 1YXVA 4EUTA 1JLUE 3DKOA 3ZO4A 4F0IA 3COMA 3KQ7A 3TDWA 1SYKA 3GGFA 3WIKA 2QO9A 4FSTA 5FXRA 4M12A 1S9JA 3F6XA 4AOJA 5L2IA 2I7QA 3HV7A 5DBXA 3QTRA 2BUJA 4S31A 3BEAA 3SRVA 5ACKA 4P4CA 3ORLA 3ORNA 5ANGA 4AOTA 2HXQA 3WF7A 4D5HA 5HCXA 4U45A 3VNTA 2W1GA 4H1MA 5DNRA 3HRFA 3QTIA 5IPJA 2XRUA 3UOLA 3LQ5A 5JMSA 3AMYA 5HU9A 2NPQA 2UZWE 4G17A 4P2KA 2BZIB 2W1DA 3ZFMA 4D1XA 5CSPA 1GIIA 5E1EA 2RG5A 3P79A 4C4IA 4CFUA 2Q83A 4XV2A 3WZKA 2BIYA 5LCJA 3ORZA 5ANKA 4QP3A 3DB6A 2XJ2A 5CNOA 3FAAA 1ZMVA 4ZSLA 3CD3A 3NEWA 3TUCA 5I5ZA 3EN5A 3VF9A 5H9BA 2Y4IB 4PMPA 3CE3A 3PDTA 5AX3A 4YBKA 3EB0A 4RIOA 4NZWB 2ITZA 4O7LA 2YLEA 3RM6A 3N4VA 4HVGA 2YCSA 4ALUA 3MH1A 4I4EA 5HZNA 5IUGA 2UW3A 1FGIA 1WBWA 3R2BA 4H39A 4LV5A 1ZMUA 4CEGA 1JKLA 3DU8A 1YXUA 3I5ZA 3MVLA 2O5KA 3QTQA 3LMHA 5JGAA 2PYWA 5FTGA 3POOA 4F9CA 4IXPA 4IB5A 4MBLA 3PP0A 3BKBA 3LCSA 4CZYB 3R7UA 3ATSA 3RK5A 4JDHA 2QOCA 3SLSA 4I20A 2PVNA 3MFUA 4YHTA 4EOKA 4RPVA 4O83A 1TQIA 4CTCA 4O21A 3ERKA 3NNWA 5IQBA 5EHYA 4GUEA 2IVSA 2UZEA 1J7IA 5FM2A 3BIZA 2ITTA 3IOPA 2OJJA 3K2LA 4XG2A 4TWCA 5FTQA 4N57A 4IM2A 1PXJA 2C0TA 5M09A 2KTYA 4C3RA 4IC8A 3V5TA 3MIYA 5J87A 3MVMA 2OU7A 3QZHA 4FICA 4YC3A 5J7BA 4CKJA 3A8XA 2XBAA 3TKUA 4ONAA 3KXGA 2NRYA 1YWVA 5ANDA 5IZFA 4HPUE 3UP2A 3QA0A 4DEBA 5CASA 4MF1A 4JT3A 4U43A 4XS2A 1MUOA 2WXVA 1HCKA 2I6LA 4EYJA 5BYYA 1PXPA 4I5PA 2PZPA 1KE7A 4CRSA 3EL8A 4IX5A 3TJCA 4DEAA 3QCYA 4M14A 4MD8E 4EK6A 2XK9A 5HD4A 2JEDA 4W4WA 3TTIA 5BNJA 1Q99A 4OTGA 3BYUA 1YOLA 4F1MA 4U6RA 4ZAUA 5GZAA 5J1WA 4IAIA 2WTDA 2WU7A 4HZSA 5KMIA 4FUYA 5EYKA 3CS9A 4CZUA 4HPTE 5FDXA 3RAHA 4GG7A 4ASDA 3IOKA 4EOLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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