3EL7A

Crystal structure of c-src in complex with pyrazolopyrimidine 3
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
277
structure length
254
Chain Sequence
KDAWEIPRESLRLEVKLGQGGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEIYIVTEYMSKGSLLDFLKGEMGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKDPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Small molecule recognition of c-Src via the Imatinib-binding conformation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
total genus 68
structure length 254
sequence length 277
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3el7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3el7A01
1CKPA 3DQWA 4LRMA 2FGIA 2C1AA 3ZC5A 3QUDA 3ZFMA 3NWWA 5EHOA 3FE3A 1GZOA 3Q52A 2V62A 4FUYA 4LI5A 2WAJA 4RZWA 4QPMA 4TYGA 1OIUA 4IX4A 5F95A 4QMNA 3KK9A 4ERWA 3PG1A 4X21A 4GFGA 3EFWA 4NTTA 2WQOA 1UU7A 3DCVA 4YR8A 1NVSA 3EKNA 3MH0A 5CQUA 2O0UA 4H3PA 4MXOA 5EM8A 2PE0A 2Y0AA 3IGGA 4FTKA 4FSNA 4LOOA 4GYGA 1GZ8A 1WVXA 2XNGA 5LOHA 4PY1A 2WQEA 4FL1A 2OO8X 4EBVA 2XP2A 3LQ8A 4S33A 4IVBA 5JFSA 1YHWA 1UVRA 5JGDA 4C33A 2BKZA 2E9VA 3DQXA 3MJ2A 2WTKB 3AXWA 2QONA 2VWWA 4BKYA 2HWOA 1HOWA 3NUXA 4FIGA 3VUDA 4CCUA 5H8EA 2XUUA 3C51A 2WMTA 3LFEA 3UZRA 3DK6A 4M7IA 1OBDA 4D28A 5K5XA 4NJ3A 4G3FA 4ACCA 1KE7A 3PLSA 5M51A 2ZM3A 4F1OA 1OPLA 3LMIA 2YISA 4DH8A 4RIYB 3HEGA 5AEPA 2X8IA 4D58A 5HG5A 4WIHA 3MA3A 5IEVA 2OG8A 5IQFA 4YSMA 3WF7A 1OL6A 4A07A 3IDBA 3QD3A 3R22A 4ASZA 5AUYA 3Q5IA 1KOAA 3JY0A 4M67A 3TKIA 3O8TA 5IUIA 3S95A 1PXMA 4BC6A 2PU8A 5DLSA 4RA5A 2BAJA 2OXYA 4YJRA 4TPTA 4B7TA 2QOLA 2XJ0A 5CF5A 2IN6A 5BYLA 3IG7A 3RCDA 4EZ3A 4ALWA 3U6HA 1G8AA 5JGAA 2RG6A 3QXPA 4IADA 4FKGA 4W8EA 3SG8A 3DNDA 3ZXTA 4EOPA 2PUNA 1YHSA 2ZDUA 2C47A 2B52A 4FG9A 4FKOA 4BWPA 1FVTA 3BV2A 5EM6A 2YWVA 5L4QA 4YC3A 2I6LA 5DH3A 5KMIA 4NM0A 5CAOA 4YPSA 3E7VA 2J5EA 1WCCA 3OWJA 3LCKA 1Q4LA 4U6RA 4XG8A 3W18A 4F70A 1CTPE 2QOOA 4HYSA 4RPVA 3ZRMA 4RX7A 4UN0C 3HDNA 5IH4A 4O7YA 4BCOA 2FA2A 3DDQA 3M42A 4IZAA 5DT3A 3WOWA 3Q2MA 3R1QA 2P2HA 5FTQA 5HLWA 5IA4A 5C4LA 4FKIA 3NLBA 5GZAA 4O38A 1HCLA 2WTJA 4AACA 4CFVA 3KEXA 4BI0A 1H0VA 4GK4A 2WGJA 3COIA 3F61A 3FQEA 3POZA 4U7ZA 5CNNA 2OWBA 3E63A 1LEZA 2WMXA 2YHVA 3MPAA 4BCGA 4HYIA 5EI6A 2VTRA 4BFMA 4CYIA 4HVIA 2ITYA 4WG4A 5JT2A 2CNUA 3RPYA 3Q9ZA 4P4CA 5CI6A 5HG7A 3E5AA 3CS9A 4EJNA 1GIIA 4F6SA 4EC9A 5CF6A 3DKGA 2ETKA 5L2IA 2CGVA 3G2FA 4OUCA 3I1AA 3RWQA 4R3PA 2YJSA 4RWLA 2JFLA 2W06A 3K5UA 4Q9SA 2G1TA 2W1EA 4YJUA 3VF9A 2F4JA 3KXMA 3GGFA 2QR8A 4J97A 2E9OA 2CNQA 4E4XA 3PJ2A 2UVXA 4AZTA 2X9FA 5LQFA 4R3RA 4EK8A 4O6EA 1YI3A 3GOPA 5E8ZA 1ZYCA 2UW3A 5FXRA 2GHLA 1CKIA 3FXXA 3VUMA 4PDOA 4V05A 2YIYA 3TNWA 5EKNA 3BHYA 4RWIA 4FSQA 4ALUA 4C4EA 2VZ6A 3LLTA 3KFAA 1REJA 4QMPA 2X4ZA 4HGSA 4MD9E 4QMTA 3ZEPA 4EUUA 4EYJA 3NUPA 3BE9A 2VO0A 2FSOX 4N6YA 4C7TA 4E8AA 3ZFXA 3V04A 4QMVA 3KN5A 4DH5A 2CSNA 2G2HA 4N70A 2J4ZA 1PXPA 2QG5A 3G90X 4K11A 5LVLA 3L8SA 5K9IA 4X3FB 3VUIA 2CPKE 1Q24A 3BHHA 2F7EE 2QO2A 2UVZA 5FXSA 4DF3A 5HO7A 5M4IA 5M56A 1P14A 3DZOA 3ENHA 4FIHA 2HXQA 3SXFA 2PZRA 4UMRA 3E3PA 1OKZA 4RJ4A 2ITZA 3QHRA 3UQCA 2JBOA 4XBUA 1M17A 1IEPA 2CCHA 3C4ZA 4B9DA 3BKBA 4MXZA 3KXNA 4F09A 3HYHA 3G51A 4QMYA 2Z8CA 3IKAA 4GH2A 4GIIA 3MY5A 3VBYA 3VJNA 3GU8A 2PULA 2GS2A 1H28A 2E9UA 5C26A 4M68A 1UWHA 5IA1A 4NCTA 4JG7A 2F7XE 3P78A 4E4LA 4O7ZA 3VULA 4MXCA 3AT2A 2QOFA 2YM7A 4ZJJA 3KC3A 3L8XA 1M2PA 2HIWA 4A9TA 3K2LA 4FKWA 3JVRA 3QTRA 4RC2A 4RJ7A 4YZBA 3R8LA 3R9DA 3VHKA 4CQGA 4CGAA 3QKKA 4NIFB 4GVJA 3EL8A 3CGFA 4BGGA 4YSJA 2B1PA 4AZEA 3NAYA 3FZOA 5ETCA 4QP1A 4PRJA 2V7AA 3LHJA 4M69B 3D2KA 5AP7A 5TOZA 3R7UA 3ZUVA 4AF3A 4RG0A 5HCYA 1V0BA 4G5PA 3NSZA 4TT7A 4YP8A 5H8GA 4X3JA 1MRYA 4XOYA 3UYTA 4DH7A 3QCQA 1OL7A 4CZUA 2C5VA 4I6FA 4DEGA 5A3XA 1R78A 4MK0A 5ETIA 1ZYDA 4JL9A 4U43A 1XH5A 3R1YA 3KA0A 3CC6A 3LPBA 3SDJA 4BCQA 4NM3A 4UMPA 3VAPA 5CSWA 4RC4A 3F3ZA 4FV8A 3UZTA 5BUEA 4X7QA 3F7WA 4FTRA 3W2PA 3NUUA 3LCOA 1ZOEA 3FMJA 2ZVAA 2VV9A 4L67A 4YZDA 4GMYA 1M7QA 1BYGA 2WELA 2WO6A 2C68A 1PJKA 3E92A 2XIKA 3H9OA 2UZEA 4UEUA 2QHMA 3AMYA 4BB4A 2QU5A 2Z7SA 1ZLTA 3GC0A 3DBQA 3ZEWA 3HAVA 4DT8A 3DKCA 4EOQA 4GVAA 5HCXA 2GMXA 3ZZEA 2ZV8A 3VO3A 2BR1A 1HCKA 2ACXA 2X2MA 4TNBA 4ZS0A 3CBLA 2BRMA 5J1VA 4O7LA 2JDRA 1VYZA 2UZNA 4AGDA 2BCJA 1YRPA 5J7BA 2R5TA 5AP2A 4AUAA 3W2QA 3MTFA 4UWYA 2WIHA 2G01A 1H26A 4RIXB 4TWPA 4XLVA 1UKHA 3QC9A 2OF4A 2ZV7A 4GU9A 2CN8A 5IF1A 2FSLX 4J99A 2E9NA 3LE6A 2V22A 3UOLA 4BDKA 2PYWA 3TI1A 3BU6A 3U9CA 2OH0E 3BU5A 5CEQA 4DCAA 3IW4A 5DHJA 3GENA 3TT0A 4F7LA 3BX5A 2CGXA 2HZ4A 3QCYA 4YGAA 4LRJA 1AGWA 3GOKA 4LV8A 3PVBA 3LM5A 3BBTB 2B55A 4EH7A 4NM7A 3OXZA 1JSTA 3HMMA 4B99A 3U54A 5KKRB 1KE6A 3PXZA 3NW6A 2JGZA 2BMCA 5HO8A 3CGOA 3VHEA 3NS9A 4G3EA 1TQPA 4F99A 3RTPA 2YZLA 3BI6A 4FTLA 3ZXZA 2C0OA 4CZTA 3BELA 2V7OA 5AP0A 5D7VA 3UE4A 3W8QA 2F7ZE 2Y8OA 4I22A 2WEVA 4JOAA 4EHVA 5BUIA 4BBMA 3R6XA 1M2QA 2AUHA 5GZ9A 3OWPA 3U4WA 4DHFA 4TL0A 1XBBA 3LQ5A 2ITWA 2XK8A 2W9ZB 4JRNA 2YDIA 4FK6A 4RFMA 4XX9A 3RJCA 3HP2A 3FI4A 2XCHA 5DR9A 3VWAA 3ORNA 1PXIA 2XB7A 3MB7A 1IA8A 4AA0A 4EQMA 5JZJA 4RFYA 3I0QA 4BIEA 3U6JA 3DU8A 5E7RA 4DTBA 4BY9E 3FY2A 3DTWA 4FIJA 2VTQA 4TTHB 4BCKA 1OECA 4M12A 1RJBA 2ZMCA 2JD5A 3WZKA 3HV6A 3KF4A 1MQ4A 4RSSA 2OXDA 4D2WA 2IZUA 2OZAA 5CXHA 3LFFA 4EOLA 4JG8A 3CJGA 4USDA 3LCTA 1UU9A 3O7LD 3I7CA 1J7LA 2WTIA 3PJ3A 4AFEA 1PMVA 3GU5A 4F65A 2P55A 2GS6A 5FD2A 4D4YA 4C35A 4W4WA 3U55A 3L8VA 3EFLA 4JDKA 2W0JA 3BGQA 3C4XA 2UW6A 3DJ5A 2B9IA 3F7ZA 3WILA 5FDPA 4I0SA 4CVAA 4PX6A 3L9NA 3QWJA 4BDBA 3I4BA 2KULA 2I1MA 1WBOA 2VO6A 4ZTMA 5KMLA 2O5KA 2Z7QA 3EN9A 4TW9A 2IWIA 3A7JA 5CXZA 4O2ZA 4ANBA 4Z55A 1OITA 3QTZA 3L9LA 1Q62A 4F64A 2BROA 5AUWA 3KL8A 2OKRA 3F9NA 3POOA 2VTPA 2B9JA 4BR3A 2CLXA 2IW8A 2IG7A 5JFXA 1FGKA 4Z7HA 3OWKA 5CASA 1WBNA 3C4CA 2NP8A 1PHKA 3SLSA 3GCPA 5CSXA 3LLAA 4FSYA 4ZXTA 4C02A 3DOGA 3UOHA 5HCZA 2B4SB 3FC2A 4U44A 4HGTA 5I0BA 2F49A 3A7IA 1JKTA 1YDRE 4P7EA 4XH6A 5B0XA 3R1NA 5C9CA 4F9AA 5ICPA 2VGPA 1Q61A 2ITXA 2W17A 4JG6A 1ZARA 2F9GA 4AQCA 1W98A 2PSQA 3FMDA 4L9IA 4IDVA 5BQ0A 3MFUA 2JKOA 4F9BA 4FK3A 4FTTA 5GJDA 5I3RA 1BUHA 2UZTA 3QD0A 2VX1A 4ANSA 1O9UA 2ITTA 4D55A 2RFSA 4CG8A 5T3QA 4FZAB 3TIYA 5D41A 3V5JA 2QODA 2VWXA 4I5MA 3O51A 5EQPA 3T9TA 4JJRA 4MNEB 3W8LA 2REIA 4FTUA 4X2JA 2A19B 2J6MA 3PA3A 4BYIA 1ZOHA 3F82A 1J91A 2WMSA 4LGHA 2YCFA 5AP1A 3R8VA 5B2LA 5M55A 3QLFA 3RHXA 3D7TA 4P5QA 2JEDA 2CJMA 4P90A 1RW8A 4OLIA 4FYOA 2WTWA 1I09A 3C0IA 3L9MA 4M13A 3GC7A 3BYVA 3GP0A 4A7CA 5IQCA 5FLFA 4ERKA 5L6WL 4C4HA 4O7SA 2PZ5A 4D4VA 4DINA 4HZRA 3KK8A 4MQ1A 3LKMA 2BTSA 4FKTA 5CSVA 4YLKA 5LWNA 2VWZA 4MAOA 2Z7LA 2QQ7A 5CSPA 1OBGA 4ZTHA 4CYJA 2XEZA 4NCTC 5HTBA 4Z9LA 4BCPA 2VNWA 4DFLA 2XA4A 2AYPA 2X7OA 1YKRA 4AZSA 2GHGA 5HOAA 1KSWA 4F6UA 2W5BA 3Q5ZA 5CLPA 3V5LA 5HZNA 3VS3A 1UKIA 3OP5A 4MF1A 3PXYA 3BPRA 4R5SA 1ZY5A 1WAKA 2BIYA 3O17A 4FGBA 1XH7A 4IX6A 4YJQA 4GG7A 4Y72A 4UYAA 5HICA 4CLJA 2YIXA 4IB0A 3EQRA 3IW8A 4H36A 2XIZA 4C37A 1G3NA 1Y91A 4YLJA 3TKHA 3SG9A 3NUSA 2R3IA 4D2TA 4LGDA 3MW1A 4RGJA 5H9BA 5HBJA 3P4KA 4HYHA 2YCSA 3PTGA 3QQHA 3UODA 4QNAA 5KMNA 4F9YA 5LXMA 5KHWA 2OGVA 4D2SA 1GOLA 3HL7A 3UG2A 3RGFA 2BHHA 3F3TA 3FWQA 3ZDUA 4BDEA 4EJ7A 3W2RA 3RM7A 2UW9A 4LM5A 3TNQB 5IMXA 5CTPA 3SKCA 3CY3A 4O6LA 3EQPA 5DWRA 3COKA 3P1AA 4APPA 5DNRA 4FTIA 4C36A 1KWPA 3NRMA 1APME 3EQCA 4IAAA 4WO5A 4CFXA 2B7AA 3QZFA 4NWMA 4FE2A 4FX3A 5HQ0A 5HG8A 3N4UA 1JBPE 4IWPA 3QD4A 4X2KA 2QHNA 5KMMA 4U8ZA 2VX3A 3QTWA 2VWUA 3BLRA 3F3WA 4FT9A 1RQQA 5HG9A 3ZCLA 4B8MA 5L3AA 3LIJA 3A2CA 3ZFYA 5CQWA 4AT4A 4S34A 2OJFE 1OL5A 4XOZA 5EK7A 3IW7A 5AAEA 4G9CA 1SVHA 3F6XA 3DKFA 4E73A 3OT3A 3MDYA 3KGAA 1U4DA 1OZ1A 3FV8A 2X9EA 3R83A 4Y95A 4AGWA 2QC6A 4GUEA 1W83A 5IA0A 4QQ5A 4M84A 2R3HA 4EK6A 4PMTA 4FSWA 2PHKA 3MVHA 4RLLA 1WVWA 2F2CB 3R63A 3R8UA 5KMOA 3FKNA 1PRYA 1ZYJA 3GUBA 3NNVA 5J8IA 4DFZE 5AAFA 4DFYA 3IW5A 3MH1A 4LOPA 5KO1A 2PVYA 4YLLA 4YC8A 5TE0A 3ZLWA 4D2PA 2J7TA 2CKOA 5GINE 3R00A 5AR8A 3LXKA 4TN6A 1STCE 3UIBA 2OSCA 4C4FA 2HY0A 3AC1A 3D7ZA 3I60A 5ETFA 5HD4A 2R3KA 4L3LA 3UC3A 3OWLA 3K54A 4DEBA 1PW2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4GJ3 A;  2HEN A;  4X0M A;  5CEK A;  3QYZ A;  4KIK B;  3KRW A;  4FG7 A;  5AM6 A;  5DRD A;  4R8Q A;  3ZUU A;  5CZI A;  3G9N A;  4D9T A;  2YWP A;  2WOT A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CKP A;  3DQW A;  4LRM A;  2FGI A;  2C1A A;  3ZC5 A;  3QUD A;  3ZFM A;  3NWW A;  5EHO A;  3FE3 A;  1GZO A;  3Q52 A;  2V62 A;  4FUY A;  4LI5 A;  2WAJ A;  4RZW A;  4QPM A;  4TYG A;  1OIU A;  4IX4 A;  5F95 A;  4QMN A;  3KK9 A;  4ERW A;  3PG1 A;  4X21 A;  4GFG A;  3EFW A;  4NTT A;  2WQO A;  1UU7 A;  3DCV A;  4YR8 A;  1NVS A;  3EKN A;  3MH0 A;  5CQU A;  2O0U A;  4H3P A;  4MXO A;  5EM8 A;  2PE0 A;  2Y0A A;  3IGG A;  4FTK A;  4FSN A;  4LOO A;  4GYG A;  1GZ8 A;  1WVX A;  2XNG A;  5LOH A;  4PY1 A;  2WQE A;  4FL1 A;  2OO8 X;  4EBV A;  2XP2 A;  3LQ8 A;  4S33 A;  4IVB A;  5JFS A;  1YHW A;  1UVR A;  5JGD A;  4C33 A;  2BKZ A;  2E9V A;  3DQX A;  3MJ2 A;  2WTK B;  3AXW A;  2QON A;  2VWW A;  4BKY A;  2HWO A;  1HOW A;  3NUX A;  4FIG A;  3VUD A;  4CCU A;  5H8E A;  2XUU A;  3C51 A;  2WMT A;  3LFE A;  3UZR A;  3DK6 A;  4M7I A;  1OBD A;  4D28 A;  5K5X A;  4NJ3 A;  4G3F A;  4ACC A;  1KE7 A;  3PLS A;  5M51 A;  2ZM3 A;  4AXF A;  4F1O A;  1OPL A;  3LMI A;  2YIS A;  4DH8 A;  4RIY B;  3HEG A;  5AEP A;  2X8I A;  4D58 A; 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 3NLB A;  5GZA A;  4O38 A;  1HCL A;  2WTJ A;  4AAC A;  4CFV A;  3KEX A;  4BI0 A;  1H0V A;  4GK4 A;  2WGJ A;  3COI A;  3F61 A;  3FQE A;  3POZ A;  4U7Z A;  5CNN A;  2OWB A;  3E63 A;  1LEZ A;  2WMX A;  2YHV A;  3MPA A;  4BCG A;  4HYI A;  5EI6 A;  2VTR A;  4BFM A;  4CYI A;  4HVI A;  2ITY A;  4WG4 A;  5JT2 A;  2CNU A;  3RPY A;  3Q9Z A;  4P4C A;  5CI6 A;  5HG7 A;  3E5A A;  3CS9 A;  4EJN A;  1GII A;  4F6S A;  4EC9 A;  5CF6 A;  3DKG A;  2ETK A;  5L2I A;  2CGV A;  3G2F A;  4OUC A;  3I1A A;  3RWQ A;  4R3P A;  2YJS A;  4RWL A;  2JFL A;  2W06 A;  3K5U A;  4Q9S A;  2G1T A;  2W1E A;  4YJU A;  3VF9 A;  2F4J A;  3KXM A;  3GGF A;  2QR8 A;  4J97 A;  2E9O A;  2CNQ A;  4E4X A;  3PJ2 A;  2UVX A;  4AZT A;  2X9F A;  5LQF A;  4R3R A;  4EK8 A;  4O6E A;  1YI3 A;  3GOP A;  5E8Z A;  1ZYC A;  2UW3 A;  5FXR A;  2GHL A;  1CKI A;  3FXX A;  3VUM A;  4PDO A;  4V05 A;  2YIY A;  3TNW A;  5EKN A;  3BHY A;  4RWI A;  4FSQ A;  4ALU A;  4C4E A;  2VZ6 A;  3LLT A;  3KFA A;  1REJ A;  4QMP A;  2X4Z A;  4HGS A;  4MD9 E;  4QMT A;  3ZEP A; 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