3EQGA

X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (mek1) in a ternary complex with pd, adp and mg2p
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
343
structure length
314
Chain Sequence
ELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of MEK1 Binary and Ternary Complexes with Nucleotides and Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 92
structure length 314
sequence length 343
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3eqgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3eqgA01
4EK8A 5IISA 2CKOA 3FLWA 4PP9A 4XYFA 1YWRA 5HEZA 1J7IA 3T9IA 3LIJA 3E64A 2C3JA 3ORXA 2C5XA 4JAJA 5F1ZA 3R7UA 3LMHA 4XG6A 4DHFA 1NVQA 5E4HA 4ZSAA 4AT4A 5DHJA 2JITA 3NUUA 4FC0A 1V0OA 5EQYA 3QQLA 2OWBA 3CR0A 3R0TA 4FEUA 4ZY4A 2VWIA 1M14A 3B8RA 2GFSA 5DEWA 1QMZA 4L43A 3QTIA 3NNVA 5EYMA 1E1VA 4A4OA 3JVRA 4AFJA 2YIYA 4O2PA 5IPJA 2GDOA 4QTCA 1UV5A 4FEWA 2G15A 3EHAA 2PVKA 3DDPA 4FTAA 3IOKA 4Y5HA 3NS9A 4E8AA 3HMMA 3HV4A 5LVPA 5DG5A 4ZSGA 2VAGA 2R5TA 4FTLA 4Y73A 3EOCA 3GCSA 4BDKA 4HGTA 2V7OA 4RZWA 4D1SA 3QQJA 2WELA 4QMOA 4S30A 3BU5A 4AOJA 2XKCA 3KRJA 4QYFA 4F9AA 4GSBA 3ZHPC 3COHA 4AA4A 2HAKA 4RSSA 5HG8A 1H0WA 2PE1A 2W7XA 3EFLA 3F3WA 4QMPA 5LMKC 4XG7A 5L3AA 2YIQA 4ZJJA 2GS6A 2F57A 3W2SA 5IU2A 3FY2A 4J8MA 2OIDA 4AFEA 2QONA 4EH3A 1JQHA 3O96A 5EFQA 2WOUA 2W4KA 5AR4A 2P4IA 4ZAUA 3M1SA 3AC1A 3OG7A 3GCPA 3QXOA 3LM0A 4RWJA 4S2ZA 4U41A 4AX8A 4BTJA 2CKQA 1W83A 2QD9A 4JS8A 4WNMA 4JX7A 3MJ2A 4ACGA 4MTAA 4BCHA 4E5WA 3AD6A 3LFEA 4I6QA 2WTIA 1M7QA 3HDNA 4ITIA 5CX9A 3WZDA 5ETIA 4JJRA 4P7EA 5FQDC 3RGFA 4YJRA 3EFKA 3GXLA 4IX5A 3UODA 4BDFA 3A8WA 3ZU7A 3PPJA 4GVJA 3R1SA 2WQBA 3NNWA 4PDYA 3QKKA 3GBZA 2W1IA 1OECA 3BHHA 3F7ZA 4WBOA 3T3UA 4U81A 5L2SA 5ANDA 1QL6A 4FT0A 4O7WA 3D0EA 3FLZA 2RFEA 3AD5A 5HOAA 4C34A 1YWNA 5B2LA 4XP0A 1APME 4OTQA 3PXRA 4A9TA 3U6JA 4I24A 4JBPA 4OTGA 2C4GA 2RFDA 3MPTA 2ESMA 3DK7A 4BIDA 1GZKA 3IGOA 1NVSA 1RQQA 1M7NA 5CSPA 4L01A 4X2FA 4EQCA 5CF6A 1OL1A 4GCJA 3R9NA 4CYIA 3R1YA 3CQWA 2YFXA 3DJ7A 2X0GA 1NY3A 3F2NA 4LGDA 3V8WA 3QU0A 4AGWA 4KKGA 4ZY5A 2FB8A 2XK4A 4I4EA 2CGXA 2VWBA 2W0JA 4H3QA 4OT5A 1ZOGA 3ZFYA 3MGYA 3V6RA 3PWYA 4KKHA 5HVYA 1ZAOA 3NCZA 2B9FA 2XK8A 4P5ZA 2A4LA 3MIAA 4PMPA 3WF7A 2YZAA 5DFPA 1J1BA 4YC8A 3ZSIA 3PG1A 1SNXA 1QPJA 4RRVA 3PA3A 3QF9A 4DEDA 3ACJA 3NVKI 4O0TA 4KRCA 5EI8A 2C6MA 4ANMA 1URCA 2QNJA 4I0SA 3LFNA 4YMJA 2RIOA 3FYKX 2XMYA 4CG9A 4RX8A 4BBMA 5GZAA 1H1PA 3QBNA 2BKKA 4FTUA 4G17A 1JOWB 5JGAA 5CEQA 3DS6A 5AP2A 5HIEA 3SGCA 3HV5A 3T8OA 1GAGA 4M13A 5CALA 3VQHA 1UNLA 3QCQA 2REIA 3GCQA 3VO3A 5J5SA 4EWHA 3HX4A 4TT7A 5H8BA 4HCUA 3V5JA 3OY1A 2EB3A 5C27A 2QHNA 2B0QA 4B7TA 5E1SA 2WNTA 4BKZA 3ULIA 2UZWE 3OBJA 3E8NA 3FLNC 4MX9A 3Q9ZA 4MD8E 2O0UA 3V6SA 4XOYA 2ETRA 3RHXA 4ZLYA 3ITZA 3OCGA 3R01A 4U80A 3KQ7A 1Q62A 3FI2A 5F4NA 4IAFA 3CIKA 3A4PA 3NR9A 4WG3A 1BL7A 3OXZA 1H07A 3CQEA 2F2UA 2R0UA 2QURA 3VNTA 5HE1A 1CKJA 5J9LA 2PZIA 3QD3A 3TNQB 2BZIB 2HZ0A 1EH4A 4Z7HA 3QGYA 4O7LA 4ZS4A 3KULA 2CDZA 4H39A 1WAKA 3MS9A 2BRGA 3R8ZA 4ALUA 4NYEA 3I79A 4GW8A 3LJ0A 1YI3A 1URWA 3C4CA 2VTJA 4IACA 4MWIA 3RHKA 3UOLA 2YIRA 3PXZA 5AUVA 1RW8A 4J8NA 4OR5A 1FMOE 2W1EA 3UO6A 2PVLA 3QD0A 3ZSGA 3DB8A 2OJFE 5FM2A 1OKVA 3QTZA 4LYNA 2IVUA 4V0GB 4NIFA 3K2LA 2W5AA 3S95A 4WNOA 3NPCA 2C3LA 3EYHA 3H0ZA 4HJOA 5AP3A 3RWQA 4F99A 2B1PA 3HMNA 3IQ7A 3MFUA 3UZTA 4MBJA 4PMSA 4QMYA 3U54A 3KEXA 3U6IA 3MV5A 4D2WA 4UMRA 2OU7A 4A06A 2BHEA 2VUWA 3A99A 3IDCA 5B7VA 5JKGA 3AC4A 2E9OA 3PIXA 4NH1A 1OB3A 4RIXB 4ZIMA 3OWJA 4EOLA 2VWUA 4GU9A 4RIYB 2CSNA 3SV0A 4I5MA 5M4UA 2OIBA 4NKAA 1G5SA 5DT4A 1TQMA 4FKWA 1SVGA 4QYYA 5CT7A 4C58A 3R7VA 4ZZNA 1DM2A 3PP0A 3QZHA 1ZWSA 2CGVA 1V0PA 4OAVB 4TYHA 3RPVA 4D1XA 4W8DA 4IWOA 3EN4A 3PSBA 3G6HA 3QQGA 4FSYA 4I20A 3UVQA 4Z55A 3NMUF 3DNEA 4DH8A 3KCKA 5EHLA 3HMOA 3LXKA 3Q32A 2NPQA 2ITUA 4WRGA 3ZC5A 2UZVA 3HEGA 4O83A 4TYGA 3UYTA 4NCTA 4CLIA 1Y8GA 3ZRLA 3DTCA 1K3AA 3MH3A 4XUFA 2HWPA 4PF4A 4AN3A 3D5UA 5EW8A 3KXMA 1SYKA 4QMVA 2VO7A 4LL5A 4DGMA 4CFWA 4DINA 4FG7A 3AQVA 4QMWA 2ZYBA 5KMLA 2Y7JA 5BVNA 3ZUVA 1XR1A 3UPXA 5CAQA 4RG0A 4BFMA 1YHWA 3EQDA 5DR2A 4IBMA 3GP0A 3LFCA 4BIBA 4FKIA 3KMMA 4X21A 3UBDA 2J0MB 2VWZA 3MESA 3E62A 4L3PA 3TNIA 3FSFA 5J5TA 2F9GA 3KK8A 4BICA 2GNHA 2WIPA 3EQPA 1GZOA 1TKIA 4KUJA 4BI2A 3P78A 1FVTA 1OVEA 5EW3A 1BI8A 3NNUA 5IEYA 4RVKA 5AP6A 3ALOA 3R8LA 2X4ZA 2W05A 3IW4A 3F66A 2OZOA 2ZV7A 1YQJA 4NL0A 4RJ6A 2J0JA 4AF3A 1JKTA 3HYHA 2BTSA 3PVBA 1PMVA 4E4XA 3LM5A 2UW4A 3GI3A 4R7IA 2R3LA 3KRLA 4WSYA 1M2RA 4R6VA 5TOZA 4BI0A 4D5HA 3KRWA 1YDSE 4ZSEA 2JDRA 4MXOA 5ICPA 5IUHA 5JFSA 3BEGA 5HE0A 3IDPA 3GU4A 1KSWA 5K5NA 2G9XA 5DH3A 1XH8A 4FEQA 2YM3A 3MYGA 2J4ZA 3PRFA 3ZLXA 4NM3A 5E8VA 3E3BX 4E26A 5FM3A 4YO4A 5AIRA 5IQEA 3O23A 2JKOA 4FZAB 4JNWA 1H1SA 3R1NA 2ZVAA 5HO8A 4I22A 3D9VA 5FRIA 4ALWA 3MJ1A 1Z5MA 1R3CA 4MHAA 3ATTA 3DLZA 4FTKA 4R3RA 2OFVA 3P79A 2Z2WA 2GMXA 2JLDA 5KE0A 4CFNA 4FBXA 1NXKA 4QTDA 5CEOA 2J0LA 5G6VA 5LVMA 2BRMA 2WPAA 4OTIA 3RPRA 4JDJA 5I9YA 2ITQA 3BWJA 4QO9A 3RM6A 3BHVA 4ZMFA 2CMWA 4L9IA 4C4EA 2VGPA 4F65A 3VW8A 2UW6A 5LWMA 1YRPA 3ZFXA 4KBKA 2JDSA 1ZXEA 2XJ1A 4GVAA 3BWFA 5KMMA 3D14A 1OZ1A 4XP3A 5FP5A 5KMJA 3V5PA 1KV2A 4FZDB 2CJMA 3ZO4A 5GZ8A 3TV4A 1PXOA 1WBPA 2PWLA 3ALNA 4GFGA 4A9UA 5M4FA 1H26A 4KSQA 5ANIA 2WZJA 5D12A 4F4PA 3FEGA 5HTIA 4G16A 2XM8A 3Q4CA 3R1QA 4AGCA 5L2WA 4RIWA 5TE0A 1RJBA 4BHNA 2QG7A 2CPKE 4GUEA 5HLNA 4FIHA 5HGIA 4OBPA 3SG9A 3AGLA 3LCTA 2VTRA 5EYDA 5L6OA 2VNYA 3R9HA 3CE3A 3K5UA 3G0FA 2P2HA 2YJRA 1FMKA 4IFGA 5TT7A 5BQ0A 1IA9A 2YIXA 3V8TA 4L52A 1Q8WA 5T68A 4HYHA 3LKMA 4RLLA 5BPYA 2GS2A 3NAXA 2BKZA 3LZBA 3SAYA 4X6RA 4XG9A 3BHYA 5AP7A 4EJNA 3Q04A 3WYYA 3VJNA 1JKKA 5K0XA 4LFIA 1ERKA 4L3JA 4NTTA 5IQFA 4ZJVA 5JFWA 2QLUA 5IQHA 2YM6A 3ORPA 4FTQA 4NUSA 3O7LB 4FIIA 4R3CA 4TWOA 3PE1A 4QYGA 5AX9A 3R7IA 5M07A 2W1DA 3QQUA 5FEEA 4DTKA 2YDKA 3IONA 4KIKA 4LMNA 3FUPA 3E88A 1UU8A 5AM6A 2PHKA 1L8TA 2ITPA 4IMYA 3TCPA 3OTUA 3CC6A 2YDIA 3QTUA 5K3YA 3P5KA 1BX6A 5L8LA 2BDFA 4YLJA 3DY7A 2UZDA 2E9NA 2JFMA 4ZK5A 4AACA 3FHRA 4EH6A 4Y46A 3FSKA 3AT4A 2ITOA 3MVJA 1Z9XA 4KWPA 5DGZA 4O7ZA 4FIJA 1PXKA 1IAHA 4NEUA 4EZ3A 2PMOX 4CZTA 4QP2A 4J52A 2C6OA 4BBEA 2V7AA 4BI1A 3WF8A 4EH4A 4MEDA 3RKBA 4CFFA 1YI6A 4IAAA 2X1NA 5HD7A 3VBTA 4FSNA 3SW7A 3CP9A 4YJVA 2R3QA 3KXGA 4L44A 5EG3A 2I0EA 4RA5A 4A4LA 3NZ0A 2R7BA 3DJ5A 3U9CA 2BRNA 5DIAA 3EN9A 5DWRA 2WIHA 1PXLA 2YIWA 3HRCA 4PDSA 2QKWB 3R04A 5CSXA 3ZLYA 3F5PA 1Q8UA 3BYOA 3NGAA 1XHAA 4IJ9A 4L7FA 5CI6A 4IM0A 5TKDA 3NX8A 3SRVA 4FV1A 2QOOA 2WTCA 3QRUA 4DGLC 4MAOA 2ZMCA 3RVGA 4QQCA 4EEVA 4GYIA 5HI2A 1Y8YA 4GIIA 5K4JA 1BL6A 3L9MA 1J7UA 2IO6A 4Y5QA 3JVSA 4FUYA 4YZ9A 2OGVA 3KKVA 2GQRA 3A7JA 4PDOA 4FTNA 3VF8A 4TYJA 3LCOA 4DEGA 2UW7A 1Q3DA 4S33A 4AG8A 4O0WA 3FKLA 1E9HA 3C4WA 4C61A 4ITJA 4JG6A 5HNGA 3R7YA 3SC1A 1G8AA 5KX8A 5HVKA 4FV2A 3KXZA 3V5TA 5CVGA 4PL5A 3DK6A 3D7ZA 4KB8A 4CSVA 3FZSA 4ZTMA 5BYZA 2YAAA 4H1JA 3MSSA 4MK0A 3WF5A 2F7ZE 2B54A 5DN3A 2XKEA 1Q99A 3RM7A 1H27A 3FMEA 2C5YA 3KRRA 4CYJA 5HBEA 4C36A 4E5BA 1Q3WA 2PZPA 3FZPA 4K11A 4MF0A 5HVJA 4MH7A 5H3QA 2XK7A 1UU7A 3O51A 4IM3A 3Q52A 5IA4A 3QQKA 2VO3A 3LJ2A 4HNIA 4ZTNA 3DT1A 4MNEA 4O22A 4XS2A 1YVJA 5T3QA 2X6EA 4TPTA 5KCVA 4B4LA 4OTDA 3NUPA 5FGKA 3ETAA 2GS7A 4G5PA 2F4JA 4IM2A 3KULB 4LOQA 4Q2AA 4YBJA 2G2HA 4QP6A 3FXXA 4C57A 4O7VA 4E6AA 1J7LA 4CKIA 3DQXA 3Q2MA 5IH4A 1XH4A 3ZH8A 3DLSA 3IECA 1AQ1A 4OW8A 5HBHA 1NW1A 3QZFA 5FXQA 3P7CA 1MP8A 4YBKA 1Q5KA 4E7WA 2WEVA 2WTWA 3EFWA 3OFMA 2GTMA 2Y9QA 4UY9A 4NIFB 4FYOA 2EXMA 3VUKA 5I9XA 2XJ0A 4J71A 4LOPA 4UX9A 3ZXTA 4N70A 3FPQA 4BCJA 2O8YA 4AOTA 3KF4A 3MFSA 4QOXA 3BKBA 4XEYA 2O2UA 5JGBA 4IZYA 1JBPE 4D1ZA 3F88A 3DAEA 4IE9A 4N6YA 3QUPA 3EKNA 4HPUE 5HX8A 2A19B 5E8XA 3UE4A 3IO7A 2KULA 3O7LD 3W2PA 3II5A 2IW6A 4C37A 2EUFB 3O0GA 4NM7A 4USDA 4OBQA 2R3MA 4C2VA 5I9UA 3OROA 3WZJA 3H9OA 4DN5A 4IWPA 4NM5A 5CAOA 1FGKA 3K3IA 2RG6A 3GNIB 4H1MA 5F9EA 4E93A 4C3FA 5E9EA 4WG4A 3OD6X 4GT4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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