3F2AA

Crystal structure of human pim-1 in complex with dappa
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
277
structure length
276
Chain Sequence
EPLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHSLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Hit to lead account of the discovery of a new class of inhibitors of Pim kinases and crystallographic studies revealing an unusual kinase binding mode.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene serine/threonine-protein kinase Pim-1
total genus 83
structure length 276
sequence length 277
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-10-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3f2aA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3f2aA01
5AP7A 1OIQA 3LW0A 5DA3A 3IECA 1ND4A 2BKKA 5F4NA 5F1ZA 3W2OA 2BZHB 2O65A 4YO4A 1XKKA 3ACJA 2XJ1A 2R3LA 2XBJA 3B2WA 3RHXA 4EZ3A 2OJGA 2FGIA 2GQGA 1U4DA 2VWWA 3E93A 4FF8A 2W96B 4F0GA 3MJ2A 2J0MB 1B6CB 1OITA 5AWMA 5C26A 3O8UA 4JR3A 4U5JA 3OWKA 4AS0A 5IUHA 3FMHA 4V05A 4PF4A 5HCZA 3T8OA 5KMIA 3V8WA 1KE7A 2C4GA 4QMWA 2IWIA 5F94A 4ZS4A 3F2AA 4R1YA 1KE8A 2F7XE 2NP8A 4G6LA 4IFCA 4KA3A 4L68A 5AUWA 4HVHA 4FIHA 4CKIA 2J51A 5LOHA 4AW1A 4G2FA 4BCHA 1ZOGA 4FTNA 3M2WA 4MXZA 4ZTNA 5EHOA 4HYHA 3U9NA 3LOKA 4IAIA 4EH2A 4V0GB 2WKMA 4NM0A 3EFKA 5CI7A 4EQCA 1XH6A 1T45A 4XOYA 4OLIA 3JXWA 4EUTA 3BKBA 4GUEA 2HWPA 3D0EA 4JDIA 5CLPA 2QOQA 3RP9A 3GBZA 3CQUA 3HA6A 3OC1A 4DGNA 3NRMA 4EOOA 3TUDA 5CT0A 4PTGA 4ZLZA 1Q61A 3VUMA 2R3IA 3LXKA 1UNHA 1UVRA 4N70A 4PTCA 4E1ZA 2F2UA 2X2KA 4XV1A 5M44A 4AWIA 3D2IA 2ZV8A 1XH5A 2BTRA 3BQCA 2YDJA 4PMMA 3GU4A 1GJOA 5GNKA 5K5XA 4OAVB 3KF4A 1EH4A 2YJRA 1G5SA 1YDRE 4L44A 3IQ7A 4WG4A 4E4LA 4QP8A 3OWJA 4L45A 1UU9A 5AR7A 4MYGA 2FSOX 3QKMA 3IK3A 1SZMA 2XCKA 4E7WA 3FKLA 3PJ2A 4O1PA 4DYMA 3ZUTA 5HX8A 3D7TA 2IPXA 3I60A 3MIAA 5KMLA 1H8FA 5M4CA 1WVXA 2JIVA 4ALUA 4Y95A 3ZSHA 3IOPA 2A1AB 2X7OA 4ITJA 4O2PA 3KMWA 3N51A 4YHTA 5HHWA 3MPMA 4FV7A 5A4TA 4WNKA 5LMKA 4BKJA 1XH9A 2HY0A 2PU8A 1BX6A 3UYSA 3VF9A 4F7JA 3OZ6A 5DR6A 3ROYA 3C4CA 4GIHA 4ASZA 4CYJA 3LXNA 4EOKA 3R6XA 1ZYLA 3QZIA 1LPUA 2RFEA 3E3PA 4KIPA 4D2VA 3R0TA 4FKLA 5AR2A 3VUTA 4DG0E 4LYNA 2ITZA 2YAKA 2J5EA 4P90A 1TKIA 2YN8A 4QMXA 2Z02A 4FNWA 5CYIA 1M52A 1JSTA 2RFSA 4EZ7A 4A4OA 4A7CA 4D4SA 4Z7HA 5T6KA 4E4XA 3MIYA 4BDEA 1TQIA 2VZ6A 3NCGA 4FVRA 4CLJA 4IZ7A 5EM6A 5AR3A 1PXNA 4F99A 5HOAA 2W4OA 3ET7A 3FDNA 4AGWA 3OY1A 5DT0A 3DS6A 3WF7A 3NEWA 3SVVA 3E88A 4H39A 4FKIA 3SOCA 2X6EA 2PVKA 3PFQA 3MGYA 5TE0A 3G9LX 1IEPA 4D58A 4ASDA 4EQUA 4C61A 3F2RA 5BVEA 2V55A 3W10A 5AR8A 3U9CA 4DC2A 4AACA 5IZFA 3I5ZA 3LJ2A 3N4TA 2ERZE 5J79A 5HBEA 5KHXA 4QMLA 3R8PA 3PP1A 4O0WA 2PZYA 2XS0A 3LQ5A 4UEUA 4IZ5A 5AV2A 3PLSA 3ZZWA 5JMSA 3UNKA 5FQDC 4QOXA 2B52A 2YIXA 4NTTA 5CSXA 5JZJA 3O96A 4LV5A 4TNDA 2UZNA 3WI6A 4G17A 2WQEA 3MFRA 3O71A 5A6OA 4K18A 5AP2A 5T3QA 3RAWA 4ZY5A 4BDAA 3PZEA 2NRYA 3LE6A 2FYSA 5CY3A 5J1VA 2BKZA 1BL7A 4I21A 3RGFA 3JS2A 5J8IA 3AC4A 2PL0A 2OLCA 3SGCA 2Z7QA 4L9IA 3GGFA 4ZJVA 2UZWE 4AGUA 4GMYA 1R0EA 4MNEA 5CS6A 4JI9A 3HMMA 5FRIA 3BYSA 4D1ZA 5CVHA 5C03A 3RMFA 5IISA 2JDSA 3ZC6A 2Z7RA 3EQBA 3TJCA 4B0GA 4D4VA 3LVPA 3RPVA 4F9YA 3R8VA 2JLDA 2E9UA 2HW7A 5EI6A 5F20A 4O82A 3LM5A 4IAKA 4AZFA 4I3ZA 4FYOA 4F1MA 2I0YA 3DJ6A 2JEDA 3QRKA 2C3KA 5HORA 3E63A 4BZNA 2W06A 5CZIA 3G6HA 3JUHA 4S31A 3CTHA 4NW5A 2Y4IB 4FMQA 3FPMA 3MFSA 3FLYA 2X7GA 2GQRA 3HP5A 4RLLA 2B9HA 1DAWA 1U5QA 2XM9A 2OK1A 4IVCA 3VUIA 3C5IA 2VN9A 3RCJA 4TWOA 4UXLA 5L6OA 2YZLA 4OAUC 5ETIA 4AA5A 4A9UA 5DR9A 3O7LD 3UIUA 2HCKA 3CCNA 4C58A 2XBAA 3U87A 3COHA 3NDMA 1U59A 4FSYA 3VS4A 1S9IA 4BWKA 3DGKA 4RJ3A 3R7OA 3WYXA 4MCVA 3V6SA 3UP7A 1QPJA 3FMMA 2NNWB 4Z7GA 5CF4A 4XS2A 3W2PA 4QTAA 1H25A 4PRJA 3MBLA 3OTUA 4TZRA 3UVPA 3VQUA 1W0XC 4DT9A 5JZNA 3D7ZA 2X1NA 4BWPA 3I6WA 4E93A 1NW1A 1JWHA 3DB6A 2J0KA 2CKPA 3MN3A 3A2CA 5CVGA 3HDNA 2PUPA 4JG8A 1H0VA 4I5PA 5BVWA 2AC5A 3HDMA 3DTWA 3UZPA 3AMYA 4H3BA 3U51A 3C0HA 4JS8A 1GZOA 4V0GA 2J4ZA 1TVOA 3QWKA 1H1SA 2PUUA 2R3FA 3BELA 4O91A 1QPDA 3OWLA 4FV9A 4RVKA 1PMVA 4FTAA 5E8VA 4PNIA 1Q8ZA 4XV3A 5I9VA 3LKMA 5L2WA 2W05A 4LGDA 4W9WA 3TV6A 3A7IA 3DPKA 3IGOA 3NVMB 1KWPA 4KUJA 1JSUA 4RVTA 1ZYDA 2X0GA 3ACKA 2BHHA 3QTRA 2WELA 3R83A 4KKHA 3BYOA 2XNMA 1Q3WA 3DKOA 3QLGA 4F64A 4F70A 5B2LA 4DE4A 4J71A 4EBVA 4A9TA 2R3KA 3DQXA 2XNEA 1NA7A 3HV6A 4QP4A 3L9PA 3PXFA 5EOBA 3SRVB 1CKIA 2OH0E 3TZ7A 1FMOE 4BICA 1DM2A 4DH5A 4F0IA 4ZZOA 5FDPA 5M56A 4HGTA 2QODA 1FPUA 3IG7A 3MH2A 4GK4A 3DAKA 4XG8A 3UBDA 2XRUA 2HOGA 1W83A 3QGWA 4GT5A 3QTWA 4I0SA 5LJJA 3BX5A 5FTQA 4MVFA 1Q24A 5BX0A 4H1MA 3GVUA 1PF8A 5CASA 3ORNA 2X8DA 3H30A 5DBXA 4YLJA 3FHRA 1BKXA 5AMNA 4HJOA 4WBBB 5EFQA 3TNIA 2RIOA 4CXAA 4DBNA 3KQ7A 5LMKC 2EB3A 3PPZA 3ATSA 3QAME 5CU6A 5TT7A 2R9SA 3GQIA 3O17A 5DR2A 5AUZA 4EBWA 4WRGA 1M2QA 3IS5A 4LOPA 5AIKA 4DFYA 3LFDA 5KO1A 3QUDA 2QOBA 1OPKA 3QTQA 2C5OA 2BRHA 2GNIA 4X3JA 4AZTA 1YI4A 1TQMA 2PWLA 3ID6C 3HV4A 3UOKA 5KMMA 3D14A 2EXMA 2O8YA 4N6ZA 5DVRA 3RZFA 3POZA 1XQZA 3PY1A 4I0RA 4QP9A 4C0TA 5IH4A 4QTBA 1L3RE 2E9PA 4IAZA 5JRSA 2ZAZA 2HK5A 4QMTA 5M4IA 2GHMA 4AF3A 5M51A 2JFMA 4I6HA 1XH8A 1OIRA 3NW6A 5JFWA 3Q53A 3UP2A 3ZTXA 5GIOE 4BDGA 1E9HA 5L6WL 4QP2A 4YHJA 4BTMA 4DF3A 5KNJA 4MAOA 3D5XA 3RKBA 5HCYA 3FC2A 3P7AA 4H05A 3CKXA 3MB6A 4QYGA 4FI1A 4LOOA 4EC9A 3FLZA 3PE2A 3OEFX 4GK2A 5M07A 1QPCA 3KK8A 4GG7A 5B0XA 2IVTA 3EKNA 4YJOA 4FIIA 4R3RA 4YBKA 2XIYA 4M13A 3QBNA 1BLXA 4EZ5A 3WIGA 4KBAA 1GIIA 2OZAA 4FGBA 1BYGA 2JKOA 4XJ0A 2XM8A 3UO6A 3QHWA 4PPCA 4QTDA 3AOXA 5I5ZA 3DK3A 2QQ7A 4YZMA 1P4FA 4FOBA 2QONA 4TWPA 5GZ8A 3T3VA 2DWBA 4F9BA 3I6UA 5IPJA 4CMTA 3KXMA 5CI6A 5JGBA 3BLHA 3BV2A 4ACDA 3QD4A 4BF2A 1CKPA 3W8LA 4A06A 5C1QB 1T46A 4U9AA 3UO5A 3TM0A 5I3RA 3V8TA 4CFVA 4ID7A 3ZBFA 5LWMA 4ASXA 3GUBA 4D4YA 4B4LA 3D5UA 3R30A 3PIXA 3TDVA 3OUNB 1W84A 5A3XA 3CBLA 5LVLA 4DCAA 3S3IA 5TKDA 3CC6A 2C3LA 4JBOA 4CFUA 4DFUA 5IQEA 4FZAB 3DZOA 4I23A 3AMAA 1REJA 4WBOA 4IXPA 3DBCA 5I4NA 2IJMA 3N9XA 4ZY4A 3U6HA 2LAVA 5CU4A 1CKJA 2X2MA 4D9TA 2CKOA 4BDCA 3PP0A 2HWOA 4BI2A 3LFSA 3GC8A 2GTMA 2VO0A 2HXLA 1V1KA 3P0MA 4RG0A 1OECA 1G3NA 3DU8A 3VJNA 4C4GA 3R2BA 2PE2A 1PJKA 4EWQA 3LFBA 5A14A 1V0PA 1YQJA 4FR4A 3QUEA 2C1BA 2QD9A 4FL1A 4P2KA 3SQQA 2YFXA 4KS7A 2GFSA 3FI4A 3QX4A 5A4EA 1OKYA 3COMA 1OB3A 5I9YA 3QRJA 2CGXA 3KVXA 3PVWA 2ZV9A 2CHLA 1QMZA 2B9IA 1E1XA 4JBQA 2P0CA 2QKRA 4QP3A 4BB4A 1OBGA 3MSSA 3FC1X 4EH9A 4FTIA 2GNGA 4BBEA 4OTGA 2O64A 4NH1A 2OICA 1OIUA 4D2TA 5CSHA 1URCA 1URWA 4X6RA 5FXRA 3ZFXA 4KRDA 4ZZMA 4ZK5A 2F7EE 3R7UA 1ZY4A 2P33A 5CAPA 4QP7A 3BU3A 4IWQA 3CPCA 5HZNA 2YWVA 3L8VA 4MHAA 4QMSA 2IVVA 1WVYA 5DOSA 2UW4A 4WHZA 2R5TA 3R1QA 5DWRA 3P08A 4B99A 3K2LA 3A8WA 4BI1A 3W2SA 5K4IA 3ERKA 3NYOA 4M15A 4FICA 3C50A 4KD1A 4BWXA 2CLXA 4QMUA 2EWAA 4QMNA 2UZVA 2XNPA 5JN2A 3LQ3A 4FKRA 4F6UA 2JDTA 4JQEA 2B54A 1S9JA 4FV5A 1WZYA 5I0BA 4QMZA 2JDOA 4YJPA 2E2BA 3DBEA 4UWBA 3HNGA 1ZYCA 4BN1A 3FYJX 4HOKA 1IASA 5AUUA 3P5KA 4MXAA 1OUYA 1LR4A 2Q0BA 4DTBA 5HVJA 4JL9A 2Z60A 5IG1A 1J7UA 1YHSA 3Q32A 4FVPA 3F66A 1VR2A 4NU1A 3QCXA 4RIWB 1LEWA 4CZTA 3R22A 4QQJA 3LCKA 3BEGA 2ONLA 3UIBA 2UVZA 3NX8A 4HCVA 3ZO1A 3PA3A 3SRVA 2WGJA 4XH6A 1Y8GA 5ANGA 2RKUA 2PZRA 2JD5A 5HNIX 5DT4A 4YJSA 4YMJA 4G16A 3SXRA 5A46A 2IW6A 4IANA 2FSTX 3JVRA 3HZTA 3VS6A 4DN5A 3AT2A 3E87A 4HW7A 4TL0A 3R04A 4HZRA 5DLSA 5HE1A 1O6LA 4BTKA 2EB2A 4DGLC 3DKFA 2BDWA 4E6QA 1PXMA 4IIRA 4FTKA 4G5PA 4PL4A 4BR3A 5M06A 2HY81 5HG7A 1J7LA 1H01A 1AD5A 1Y6BA 3UPXA 3Q9XA 3O8PA 5D9HA 3DNDA 4ZTSA 5EDRA 4PNKA 1Y6AA 2BAQA 2JAMA 3QA0A 4FG7A 3FQHA 4MD9E 4TYHB 5TR6A 5AA8A 4QMMA 4M84A 4O0UA 3VUHA 4M8TA 2Y6OA 1ZLTA 2OXDA 5FXSA 3TTIA 5AFVA 4R6VA 3HL7A 5HE3A 1UWHA 1SM2A 2XF0A 3P7CA 4LFIA 2VTSA 4I0TA 4PY1A 3EN4A 1F5QA 1H1PA 2JBPA 3E64A 3GXLA 3FSKA 4H1JA 4XG7A 3EOCA 4C37A 3MVHA 1JNKA 4NW6A 3V5WA 4CV9A 4PUZA 5DT3A 4E4NA 5JEBA 1PMUA 1M14A 2WMRA 1MQ4A 3VS1A 2DS1A 5CEIA 1KOAA 5CEKA 4OGRA 5A6NA 2P2IA 4ZOGA 4M3QA 3N4UA 4W4YA 3CEKA 1JKLA 2FH9A 2J90A 4EOPA 2B1PA 2YIQA 3MH0A 4A4XA 4AT5A 4DFXE 5L6PA 2VWXA 4L6QA 3W2CA 3BWFA 3EL8A 5L8LA 3FKOA 1APME 4L00A 2VV9A 4K33A 4D2RA 3ZUUA 2SRCA 1OKWA 3C51A 4RJ7A 4ANNA 4MXCA 4FT3A 5ITAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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