3FC2A

Plk1 in complex with bi6727
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
AKEIPEVLVDPRSRRRYVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKVLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title BI 6727, A Polo-like Kinase Inhibitor with Improved Pharmacokinetic Profile and Broad Antitumor Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PLK1
total genus 82
structure length 293
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.11.21: Polo kinase.
pdb deposition date 2008-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fc2A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fc2A01
1BL6A 5EI8A 3CCNA 4MYGA 3UIUA 2A19B 3FXXA 4J8NA 3EQFA 1BMKA 4YPSA 4AU8A 3HEGA 2WD1A 4YBKA 4TNBA 4H3PA 4MNEB 2YM8A 3L9PA 3ZONA 1OKWA 3NVMB 3UZPA 4IWPA 3P86A 4XV2A 5A54A 4MWIA 4D4SA 4DH3A 4AW2A 5IQBA 4C2WA 3AOXA 5IH6A 4F6UA 4FTUA 1KSWA 1WFCA 3IO7A 4XOZA 2GNHA 3VUIA 2VU3A 3HKOA 3MTLA 3C5UA 1CM8A 2UVXA 5B0XA 3ZM9A 1OZ1A 4MEDA 4FG7A 3MH3A 1PYEA 2HXQA 2Q0NA 1OPLA 2UZEA 2XNMA 3LAUA 4EK3A 2WHBA 4CGAA 3R7OA 4FZAB 5AR5A 4IAKA 5EDPA 4F0GA 2R3NA 4KIKB 2YIRA 4C38A 3NNVA 4GEOA 5CSHA 5HORA 3DA6A 4E26A 4MWHA 5D9HA 4BCIA 3W55A 5IMEA 4IWQA 2WU7A 4BIDA 2C68A 4O27B 4CVAA 5L6PA 1UA2A 4EZ5A 4BR3A 2Z60A 4O7LA 5AR2A 4FTMA 5T68A 4JI9A 3DOGA 4TN6A 3GU4A 4JNWA 2JKQA 4G9CA 2PY3A 5JQ5A 5CI7A 3P0MA 5EFQA 3HA8A 3PIYA 3JY0A 4EH9A 4W4YA 5A6OA 3QTZA 4WG4A 2C5YA 3HRBA 5IQGA 1K9AA 1ZWSA 4JT3A 5J87A 2HCKA 4NIFA 5EHOA 4B4LA 4D4VA 5FM2A 3A2CA 3M11A 4CFMA 4FSWA 4QMZA 5FP6A 4IAZA 3UC4A 5ACBC 2IZUA 4S30A 4C35A 4K0YA 4G1WA 4IVCA 5D10A 5M08A 3H4JA 3ZUTA 4C58A 5EQPA 4G9RA 3S1HA 4Q5HA 4MXZA 3W2OA 4XRLA 2PUNA 2XVDA 1NW1A 3C0HA 4XCUA 5EM5A 3CD3A 3VQHA 2YFXA 4JR3A 4YJQA 2NP8A 2BTSA 3WZEA 4EHVA 3Q4TA 5BVOA 5HBJA 3AMYA 2DS1A 2CKOA 5GIOE 2G2IA 2RIOA 2H6DA 3MB6A 5J1VA 4I0RA 4B99A 2R3QA 5CY3A 2QOLA 3L8SA 3BLRA 1WCCA 5H8EA 5DRBA 4BCHA 2RSVA 4S2ZA 2W4KA 4QRCA 2R2PA 1OL6A 4YSMA 3LE6A 3QKMA 5HG8A 1YI3A 4CMTA 5EM7A 3W32A 5I9XA 2Y6OA 4O7SA 2ZV7A 2FSMX 4ACGA 3UOHA 5GZAA 4JG6A 3DXQA 4KS7A 5D11A 3CY2A 1Z5MA 2HENA 2PUPA 3QGYA 4ONAA 2XIYA 2J0LA 1JVPP 5LMBA 2VTTA 1UV5A 3NCGA 4ZP5A 3UDBA 4USFA 3O50A 5JGAA 4RC2A 4G34A 1W0XC 3UG1A 3RWQA 1KV2A 5EK7A 4G5PA 5J9YA 5CEPA 3THBA 3SVVA 3E8CA 5K9IA 4G6OA 1YHWA 4JDHA 4OTDA 4R1VA 4D4YA 4FUYA 3NNXA 5CEQA 4YHTA 4KUJA 3HP2A 3ZEWA 3KA0A 4ZY6A 4CCBA 3O23A 5M55A 4AZTA 4EKLA 5CU0A 4RX8A 1TKIA 4EL9A 3FYKX 2BHHA 2BALA 3PJ3A 5DRDA 4JDJA 3DJ7A 3SXRA 4U79A 1H26A 4BDFA 4DHFA 4ZLOA 2A1AB 4ZSJA 2DUVA 5DR6A 3HUBA 4DGGA 3PZHA 2BUJA 5FGKA 3QYWA 4WA9A 1UVRA 2PVNA 3JUHA 3CE3A 3FKNA 4NIFB 1XBBA 4K11A 3UG2A 3ZFMA 3C4CA 3DK3A 4I6HA 3POZA 5BVWA 5AV1A 5I9WA 2G2HA 2OI4X 2BFYA 2G1TA 3SX9A 3V6RA 4PP7A 3WIKA 3OP5A 4BHNA 1F3MC 4B8LA 2P2IA 4ZTHA 1IRKA 2EXEA 4FSMA 2EWAA 4X2NA 3QRJA 4D0XA 5CEKA 4AFEA 3VAPA 4YZNA 1S9JA 1J7UA 4OTGA 4OLIA 3VBWA 3ZO1A 2GNFA 5IZFA 1U46A 2XKFA 3TUBA 4BCJA 1YWRA 3R6XA 2EXMA 5JK3A 3U4UA 1PXIA 1ZYLA 2AYPA 3JVSA 3QTRA 4L9IA 5CU3A 5C03A 4FIGA 2R3PA 3OC1A 3QD2B 1CKIA 4FT3A 3K3JA 4YC8A 1SZMA 3Q6WA 4YR8A 4ZJVA 5J9LA 3QZGA 4UEUA 5HIEA 3BU6A 2UZLA 3UNJA 1WBWA 4NK9A 1A48A 3QQKA 2C6MA 4EH5A 2JITA 3RMFA 3FZ1A 4FKPA 2PE1A 4QQ5A 3CJFA 3CS9A 4ITJA 1XKKA 2HK5A 1NVQA 2C6TA 3C4EA 3DQWA 3GUBA 3Q52A 4G31A 2E2BA 2YIYA 4DFYA 4MF1A 4PF4A 4TYHA 3F3WA 4ASZA 3GFEA 4YJNA 4GSBA 3L8VA 1M2QA 4OTFA 3MYGA 4IWOA 3ROCA 4ANQA 5LXMA 5FTGA 3TJDA 4UX9A 5AUZA 2A4LA 3DKGA 4KD1A 5CU4A 3ELJA 3UMXA 1YOLA 5IQHA 4CEGA 4MTAA 2AC5A 3QZHA 4UZDA 2VTPA 3F6XA 3TZ7A 4O82A 4C62A 4QMWA 1CSNA 1G5SA 3HLLA 4HVDA 5HICA 4C02A 3QKLA 4QP3A 2X4FA 3NPCA 4EZ7A 3EQCA 3PXYA 3FLWA 4M15A 2O0UA 4PWNA 4WRGA 5AWMA 3FAAA 5K5NA 3PP1A 5HCYA 1OKVA 3KREA 4FKRA 2YCFA 5CZHA 3P78A 2RFSA 3CC6A 5I9UA 3U9CA 4TZRA 2GU8A 2XCKA 2YZLA 3GU6A 4D2RA 3ETAA 4JVGA 4ZLZA 3NUYA 3QC4A 3PLSA 4RFMA 2YM6A 3DKFA 4YHJA 4YJUA 3ZUVA 2JEDA 3LXPA 1OL7A 4APCA 4FA2A 4YURA 4MKCA 3LFSA 4D2SA 5I5ZA 3FKLA 3Q2MA 2ITPA 3QFVA 3K5VA 4FIHA 1MQ4A 3BELA 3NAYA 2QLUA 1WBVA 3I6WA 2CKQA 3HRCA 1UU7A 4NM5A 1YOMA 4RQKA 3NUUA 5HHWA 3RTPA 3PUPA 2OIQA 1AD5A 3CTJA 3FC1X 2PWLA 4D4RA 1JWHA 3S3IA 4A9SA 4PP9A 4C33A 2RGPA 4RJ3A 3SW7A 2XK4A 4FTQA 1JNKA 4TYJA 2J50A 4FT7A 5EYDA 5GJGA 3VBVA 3GENA 4CZYB 4O7RA 1Q4LA 3R21A 3EKKA 3WE8A 1REJA 2OZOA 4H36A 4L52A 4DGNA 5AR4A 4EZ3A 3FLNC 1ZOGA 2X7FA 4HGLA 4NSTA 4DYMA 4V05A 2R3MA 2WMUA 4FL2A 3NUSA 4RWKA 4ERWA 3KMUA 4PDSA 4XV3A 4AN3A 1FBNA 2I40A 4F9AA 2OICA 1Q8ZA 4FV7A 2XK6A 3VN9A 4DFUA 4AW1A 4QP7A 4JRNA 1Y6BA 3D7TA 4E93A 1YXXA 4FKSA 3DCVA 2W4JA 2X2LA 2Y7JA 3VUGA 3W2CA 3WE4A 4DEDA 3N4TA 4TYHB 2J5FA 1UKIA 3QQJA 5E8ZA 5E1SA 3N9XA 1G8SA 4DT8A 3QHRA 3N4UA 2QR7A 4O84A 4FNXA 2V7AA 4CQGA 3O51A 1V0PA 3HUCA 3VUDA 2UW3A 4Q5EA 4FKJA 4GL9A 2XYUA 4QD6A 3UZTA 3VUHA 4R6VA 4X3FA 3BHHA 4MD7E 3ALOA 4ZZOA 4IBMA 4ZSGA 2PMOX 3W1FA 3BHUA 4EOKA 1Y6AA 4XS2A 4LGDA 3QGWA 4MVFA 2B4SB 4L44A 2X1NA 3TZMA 4TL0A 4WRSA 3BGQA 3NNWA 3U6JA 1GIJA 2B1PA 2HZ4A 2O3PA 2ZV2A 3FQSA 3MVMA 4QQTA 5A4QA 5JT2A 4P7EA 4LQMA 5KHWA 5LVPA 3R73A 5LWNA 5DG5A 2XK9A 5EHYA 3VUTA 3O0GA 2Y6MA 1PXNA 2BRGA 2ITZA 4L3PA 3ZLWA 3R7EA 2ITYA 5KBRA 3T3UA 4C4GA 2HY0A 2WMTA 2I1MA 2R3RA 4ZTNA 2VTJA 4A07A 1RDQE 4C3PA 5BX0A 4PQNA 3NUNA 2V22A 3QRKA 5ANIA 5HVJA 4U81A 4C4JA 2QO7A 4QMOA 5ETFA 4HZRA 3DBFA 4M69A 5AP1A 5IDPA 3CSVA 3NMUF 3O2MA 3ZLXA 3LZBA 5AR3A 3TCPA 4HCVA 1QPDA 3SA0A 4G3CA 4U7ZA 4ACHA 4MXXA 3F2NA 3AT4A 3QKKA 3F3VA 5CT7A 2QKRA 1XH8A 5CU6A 1YHSA 5HG7A 2WTDA 4MK0A 2VTQA 3AMAA 5GHVA 4DH1A 5JFVA 2X81A 2OZAB 3ANQA 3I60A 2WMXA 1HOWA 2PYWA 2OXYA 2GS7A 2JDOA 2YM5A 4GVAA 4Y85A 5HVKA 2XCHA 5H8BA 2B0QA 4PTCA 1T46A 3FLZA 1PMNA 4RRVA 3D5XA 4YLLA 1JQHA 2C6EA 4JIKA 3EQPA 2HY81 4ZJIA 2IVTA 1JKSA 4C57A 3N4VA 5A4CA 2WTIA 3ZH8A 1TVOA 3OY3A 3E3PA 5E8UA 5GJFA 4BWKA 3BHYA 4BCPA 2O64A 2RFDA 3VBYA 5LWMA 4F0FA 1VEBA 2NNWB 3HZTA 4IM0A 4BVUA 1WBPA 2CHLA 5DBXA 4C4HA 4DH7A 5IH4A 3R8LA 3HMIA 5LMKC 2GFCA 1YWNA 4XG7A 4YZCA 4BCOA 1Q41A 2VTRA 3V5LA 3QZFA 4FSQA 2VV9A 5FXRA 2XF0A 3KCFA 4R7HA 3S95A 3R1QA 4QP6A 3P79A 1B38A 2YJSA 1M2PA 1W8CA 4BWPA 4RIYA 4BRXA 3GI3A 2WU6A 5FDPA 5IQIA 1SVHA 3V8TA 4X6RA 4XYFA 2X9EA 3C4ZA 4O7VA 3UJGA 4D2TA 3HMMA 2F7ZE 4AZVA 2GQSA 3PRIA 4EOIA 3TG1A 1JPAA 3UQGA 3LQ8A 3PA5A 5K5XA 1FINA 2G01A 3WF7A 4DBXA 4E4NA 3TM0A 2RG6A 2QO9A 2J0JA 4LUDA 3WF6A 1FVVA 4X2JA 2PVLA 4NYEA 4FKTA 4NKSA 4QMVA 4XG9A 3MBLA 4TY1A 3BIZA 4UMQA 4A4XA 4A4OA 3Q2JA 4QYHA 2XA4A 3BBTB 3FYJX 4FIIA 3E62A 3EQDA 4FTIA 4QMLA 1IAJA 3E7OA 4RJ8A 4EOSA 3HAVA 4QMPA 4K6ZA 1RW8A 4X2FA 4BTJA 2IW8A 4GKHA 3CQUA 4CFNA 4OTRA 4RIXB 4RMZA 4TW9A 2ZDUA 3P7BA 3R9RA 2BMCA 3PXFA 4QTBA 3KRRA 2OJGA 5AA8A 3TDWA 2IWIA 3EZVA 3BU3A 3BYMA 4Y73A 4EH4A 4UN0C 4YSJA 2AUHA 4V0GB 2XM9A 4OBPA 4CNHA 2ZMDA 4KABA 4CZTA 4BI2A 3HDMA 4DG0E 5BMMA 3BCEA 4RC4A 4WNKA 5A3XA 4J1RA 2QOKA 4IE9A 4D1ZA 4O83A 3PLAE 4WNMA 2ZV8A 3VO3A 3W33A 3FMLA 2PMLX 5AUUA 1ZAOA 1ZLTA 3K3IA 2Z02A 5BUIA 4RX9A 4M14A 3ZO4A 2CSNA 1Q8WA 2UZOA 3PSCA 5K0KA 3ZC5A 1OIRA 3CTHA 3FZOA 2J6MA 5DT4A 4IFCA 1JKTA 2BTRA 4FKUA 1SMHA 2GQGA 2JDTA 2NO3A 2VO3A 3LOKA 3QXOA 4GK2A 4EH6A 1ZYDA 5JEBA 3S00A 2OF4A 3PSBA 2BFXA 2C3JA 3DDQA 4IX6A 4O0YA 5AUVA 4AZFA 3IS5A 4BBMA 2WTWA 3O7LB 5KZIA 3OUKA 2UW6A 5FRIA 5C01A 1YHVA 2W1EA 5JSMA 2OG8A 4BYIA 3EL8A 3MI9A 4YZBA 4R3PA 4X6QC 4BC6A 4EJNA 2QQ7A 3LM5A 1SNXA 5K3YA 4RPVA 2YJRA 4OBQA 4S33A 4RIYB 2XKDA 4G17A 3PA4A 3DPKA 5GINE 3O17A 1SVGA 5C26A 4RZWA 3SG8A 2BAQA 4DCAA 3QYZA 4E20A 2XEYA 3GP0A 4NFNA 3KCKA 4J95A 3UP7A 2LAVA 1L3RE 4ARKA 2IVUA 3UGCA 4FYOA 2QOOA 4RJ7A 1R78A 2RFEA 2B7AA 1OMWA 4FZ7A 4YJRA 3U51A 4DFNA 2WIPA 4JDKA 4EOOA 4A06A 2A0CX 2XNBA 2UW8A 5L2WA 3FL5A 4RLKA 4XNEA 2WMBA 4FOBA 5AM6A 4ENYA 3EN7A 2PU8A 2EB3A 2GCDA 4FVRA 2VWVA 5CVGA 3DY7A 4RIWB 4C0TA 4PTEA 4EQMA 4EK8A 4XG8A 4IADA 4C37A 1OECA 3IPHA 1ZZLA 2WMQA 2C69A 2CGVA 1ZMWA 4AOTA 3UIMA 3G9NA 3MJ2A 5C1QB 4NU1A 3LW0A 3KK9A 3GOKA 4YLKA 4QMXA 3FXZA 3O8TA 4LV5A 4IDTA 3TV7A 4TWCA 4IAYA 1H25A 4I94A 2OH0E 1OIQA 3RPSA 3BZ3A 2YDJA 3W2RA 2UW0A 4UYAA 3BHTA 3JS2A 3QQGA 3DKCA 3PYYA 3NW7A 4LGGA 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 2GHL A;  3OS3 A;  4I5H A;  4PL5 A;  3EFK A;  3VQU A;  4EEV A;  2CCI A;  5CEM A;  4U43 A;  2W5B A;  2CN5 A;  1DAW A;  2SRC A;  5BYZ A;  2Z7S A;  4FV3 A;  1H08 A;  4FV8 A;  1G3N A;  5BVN A;  4OUC A;  3II5 A;  4XG4 A;  3HV4 A;  4KAO A;  5D1J A;  1JST A;  1U4D A;  3FMH A;  4WHZ A;  5F20 A;  1KE7 A;  2Z2W A;  3D2I A;  5AND A;  3VS2 A;  1GY3 A;  3PY1 A;  4LOO A;  3ITZ A;  1VYW A;  4NM7 A;  3VUK A;  3LXN A;  1PF8 A;  4R8Q A;  3QUD A;  3NCZ A;  4W9X A;  4IVB A;  4MD9 E;  4QYY A;  2QOQ A;  2XS0 A;  5J8I A;  3ULZ A;  4O0V A;  5M06 A;  5DNR A;  4E3C A;  5AP5 A;  3FME A;  3ORM A;  4YO4 A;  1UNG A;  4JG7 A;  2OO8 X;  1O6L A;  4Y8D A;  3MY0 A;  2WOU A;  4FK3 A;  2PVH A;  5ETC A;  3EN6 A;  3W18 A;  5IQA A;  2NRY A;  4JL9 A;  4WBO A;  1YKR A;  4L00 A;  4YO6 A;  5E91 A;  3KU2 A;  3R1Y A;  4A7C A;  3A60 A;  4LMN A;  4J97 A;  2C47 A;  1L8T A;  4RVK A;  2WGJ A;  1XWS A;  2C0I A;  2CKE A;  3LFQ A;  3OT3 A;  3PFQ A;  4GJ2 A;  4M68 A;  4XLV A;  5EKN A;  5JRS A;  5LQF A;  3TUC A;  2C30 A;  4NZW B;  4HCU A;  1OUY A; 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