3FKNA

P38 kinase crystal structure in complex with ro7125
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
349
structure length
346
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mapping Binding Pocket Volume: Potential Applications towards Ligand Design and Selectivity
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Signaling protein, transferase
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 346
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fknA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fknA01
3SG8A 2JDVA 3NS9A 5H2UA 3AT4A 4CFXA 4NJ3A 3P7CA 3ORPA 4F9CA 2XB7A 4EH4A 3SG9A 5IQHA 4YNEA 3BV3A 5BVEA 5HQ0A 5KMIA 4C4IA 3EN4A 4QMXA 4WRSA 4D4RA 2VRXA 3NW6A 3HVCA 3N51A 4IB1A 5HLPA 4RWLA 1JPAA 5DR2A 3QRIA 4QMZA 4EOJA 3I81A 2AC5A 1G3NA 2V55A 3RPVA 1M2QA 3NMUF 3TZMA 4NFNA 4A9TA 3QQGA 4PPCA 3D9VA 2YDJA 3NUPA 3E63A 2B0QA 2YM5A 3GFEA 4AW0A 2R3OA 4Y72A 4EKLA 4Z7GA 2P2HA 1PF8A 2OF4A 2ZVAA 4OR5A 5DNRA 4AZTA 3C5IA 4G2FA 4FEWA 3G9LX 1F0QA 4IM3A 1UNHA 2W5HA 2R3RA 4F08A 3QKMA 4UMRA 2PULA 2C6OA 5AV1A 5JRQA 4O0XA 3QTSA 3SXSA 5IUIA 2GPHA 2YISA 2OFUA 3AQVA 4G31A 2R0UA 4B0GA 1OKYA 2ESMA 3Q9ZA 3DDPA 4FSWA 3FQEA 4LUEA 3SD0A 4PWNA 3DLZA 3OHTA 5CWZA 4WNOA 4Z16A 5JK3A 4RPVA 2OK1A 3PVWA 3RINA 2NRYA 5B2LA 3G33A 4V0GB 1E1VA 3ZZEA 1YKRA 3FKLA 3QLFA 2BILB 2E9UA 4M0YA 4DEHA 2UZBA 3GP0A 3QA8A 5CNNA 4I20A 3DJ7A 5C9CA 2BCJA 1H1RA 4EZ5A 4FVQA 3V6SA 1YRPA 2VWXA 3R28A 4L00A 5IQDA 4GH2A 3RJCA 2F9GA 1UU8A 2RFEA 4E8AA 5JSMA 2ETMA 4FE2A 1RJBA 5KHWA 4FA2A 2JFMA 3QZIA 4ASDA 4FNWA 4M97A 1ZZLA 3IW6A 1PHKA 3LFAA 4O0VA 5L4QA 4BCMA 1ZAOA 4V01A 3R8MA 4IVCA 2PL0A 3ACKA 3GXLA 4C4JA 4EOLA 2JKKA 4MCVA 5J87A 5JN2A 4YHTA 4NW5A 2OZAA 4F1MA 4NSTA 5K9IA 4Z55A 2REIA 4L45A 3CGOA 5M57A 5CEPA 4QP2A 4X0MA 2W06A 1MQ4A 1OKWA 3BWFA 3GU6A 2XNGA 3G9NA 3C4ZA 4G5PA 4IAFA 3V6RA 4PDPA 2UW8A 5ETFA 2ZM1A 3CTJA 4YC6A 5D7VA 3LXNA 3COMA 5FEEA 4K0YA 3WOWA 3ODYX 3KXMA 3IONA 4ZSEA 4EHZA 5L6WL 4DTBA 3KL8A 3V04A 4BWXA 4I5HA 4PUZA 4FVPA 5FG8A 5FQDC 3ZO4A 3R02A 1K9AA 3Q96A 2PE1A 3CGFA 2O64A 1Y6BA 3GCSA 1L8TA 1A06A 4H58A 2VWYA 2PVRA 3Q4TA 5EDQA 5AP1A 4GYGA 3WF7A 3QCSA 4RBLA 4EH8A 2ZMDA 3IS5A 5M4IA 2C6MA 5CAVA 2PUNA 4J52A 4KNBA 3UJGA 1YHVA 2VNYA 3ZFXA 4F7SA 4FTIA 2OJJA 2UZLA 4NU1A 3C50A 4RX7A 4GFGA 4GT3A 3TL8A 3ZRMA 5AAEA 3PXFA 4S2ZA 4EZ3A 1U4DA 1M52A 3IW8A 4FODA 4FTRA 4G17A 4C35A 2NNWB 2W1GA 4FKIA 2XRWA 1JKKA 2OFVA 4D2PA 3PTGA 4D0WA 3ULZA 4D4YA 5A54A 5HIBA 3GB2A 3HMOA 2I7QA 3RHKA 1OL7A 4L9IA 4BDFA 4D2WA 4QYGA 2UVZA 5AUTA 2ACXA 5CY3A 2XIXA 3LPBA 3VHKA 5C8MA 2OH4A 2PMNX 2Y6OA 5KKRB 2YAKA 4U3ZA 4MXYA 3ZZWA 4FSQA 2R0IA 4DEAA 1ZY5A 3D15A 4O0UA 3NAXA 3TKIA 3KVWA 4AN2A 2CN8A 3KMUA 4JS8A 1URCA 2A0CX 4WG4A 4NYEA 3AD5A 4FKOA 1OIRA 2AUHA 1FINA 5DPVA 5ACKA 3U8WA 4AE9A 3NGAA 5HO8A 5TR6A 4YSMA 5E8ZA 3SOCA 2VTJA 4UWBA 4C33A 5L2WA 4FSTA 3VC4A 3EQRA 4OUCA 4Y85A 4AGCA 4OGRA 2OW3A 5I9UA 4BKYA 3L9MA 4FTTA 2ETKA 2XK6A 1IEPA 3L9LA 5IQIA 1OPLA 3KKVA 3Q5ZA 2JKOA 4G5JA 1FOTA 3SHEA 4RWJA 3FI2A 4IAIA 2CN5A 4TN6A 2OJIA 5F20A 1F5QA 3BLHA 3W2CA 5K0XA 3LQ8A 4M69A 4BN1A 5E7RA 5AV3A 4CFVA 5J79A 4DGLC 3DS6A 3F3ZA 3FMEA 3GCQA 4H1MA 1RQQA 5KZ0A 3VUMA 2VX0A 3MTLA 2QURA 1P4FA 3A99A 4E3CA 4BIEA 2CKPA 4RQVA 4FKGA 3QX4A 3Q9YA 1AGWA 3PA5A 4RT7A 1M2RA 3OWLA 4FV1A 5EQPA 1H01A 1TQPA 3BKBA 4JQ7A 4QP1A 3R83A 2YDIA 2OZOA 2CKEA 3PSCA 5BVWA 2X0GA 3SRVB 2B9IA 4RIYA 1V0PA 3ZRKA 4PRJA 1GAGA 4FOCA 4UN0C 3K54A 2W0JA 4F0IA 3OY1A 3ZYAA 4MD7E 2OG8A 2WO6A 3GC7A 3GNIB 3Q04A 4L3PA 2UZUE 4N6ZA 3UZPA 4I6BA 4IXPA 4IC8A 3LQ3A 4YU2A 1OPKA 4NTSA 3PVUA 5L8JA 4E73A 2CPKE 5HICA 3SC1A 2XK8A 2UW9A 2C1BA 5E4HA 3EOCA 3TJCA 5FM3A 3NYXA 3DLSA 2XNBA 3RP9A 3DBEA 2B7AA 5EYCA 3NUAA 1H0WA 3FMNA 1XH8A 3FUPA 3LXKA 2YLEA 5CTPA 4UMUA 2PZIA 2OO8X 4DBNA 1BUHA 4BCGA 1SVEA 1PMUA 3WF8A 4GUBA 1R39A 3PJ3A 3HDMA 4IMYA 5EW8A 1QPCA 2PHKA 4L68A 2W05A 2Y9QA 4U45A 3AT3A 2QOHA 3AC8A 3MPMA 2XEZA 4E6CA 2XM9A 5K0KA 4MEDA 2XJ1A 5AADA 5B7VA 4YR8A 3FXZA 4XOZA 2PVYA 2CGUA 3E7VA 3FMMA 4JVGA 3R22A 4K1BA 5LXMA 5M09A 4HVSA 4O7WA 2ZV7A 3R7IA 2VGOA 4ENXA 2W1DA 5EHOA 3REPA 4D4VA 4DEDA 4KBAA 4AN3A 5A4EA 5CASA 1QMZA 2CNQA 3OCBA 2CLXA 3PE2A 2VX1A 4NW6A 5C03A 4BCKA 2BKKA 3CEKA 1VZOA 4R5SA 2VWIA 3SX9A 1WVYA 4Z3VA 4L7FA 5K5NA 3FSKA 2DYLA 1K3AA 4CMTA 5CQUA 3Q32A 5TKDA 1YWNA 2EVAA 4GIHA 4LMUA 4C59A 3UO5A 4OTQA 4QNYA 3LKMA 4ZTQA 1SYKA 4FEQA 4BI1A 1W0XC 3OEZA 4E6QA 3BLRA 4KWPA 2VO3A 1OL2A 3ORIA 1SVGA 4IBMA 4UXQA 1KE9A 4C4GA 3F5PA 2F49A 3VS7A 5AR4A 4F65A 4BHZA 1B39A 3B2WA 5IU2A 3BGZA 4RC2A 1IAHA 3QFVA 4C37A 4D2VA 3V8TA 3BHVA 1MRUA 2V7OA 1J3HA 3RM7A 3EH9A 3V8SA 2RF9A 3BWJA 4ZTMA 4IX6A 2BZJA 3MFSA 3LVPA 4NJDA 3R8UA 2YAAA 2A27A 4NKSA 2R7BA 2IN6A 4EL9A 3QZHA 1JAMA 2GCDA 2RSVA 4LGHA 4ZOGA 3O0GA 4LV8A 5CEOA 3RK9A 4FSYA 2OICA 5HD7A 1MRYA 1O6YA 4FSUA 5FEDA 3RBWA 4JG6A 5IDPA 3IG7A 1OVEA 2QO2A 3VS4A 4M84A 4D2SA 3HYHA 4ZIMA 3WZEA 4C4FA 4C02A 4RJ4A 4I0TA 2BR1A 2WTCA 2XBAA 3EWHA 2ITNA 3LMHA 4F6WA 1BLXA 1ZWSA 4F7NA 2O2UA 4OT5A 4XNEA 3DZOA 5D9HA 3A7GA 3GOPA 5CSVA 3FXWA 5G6VA 3MH3A 4HVDA 1Y8YA 2J4ZA 4WOVA 3PJCA 3FMLA 2WQBA 3VNTA 4BI0A 3TNIA 3FZOA 2C0OA 4OTGA 3BU6A 5GNKA 1P14A 3VUIA 1Q8UA 4ZJIA 3LFDA 3ZLYA 1DM2A 3FSFA 3ZS5A 4S32A 4CG8A 3E87A 2V5QA 2W5BA 1U54B 5IISA 3PY0A 3VJOA 2Y0AA 3UP2A 2HAKA 4RWKA 4O22A 2JDRA 2ITXA 2QR8A 2YZAA 3DGKA 3FI4A 3QQJA 3BBWA 2FH9A 4AUAA 4BBFA 4Z9LA 4F4PA 4FV4A 2RG6A 2VV9A 2X6DA 3RKBA 4EH2A 3COKA 4GIIA 3MTFA 1M7NA 2WMVA 3GEQA 4FIGA 4EOOA 5J1WA 3QF9A 4HZSA 4ACDA 4WG5A 5E8XA 3ZUUA 2VWWA 4OTFA 4CKIA 5E8YA 2VTHA 4BBMA 3GT8A 3A2CA 4JQEA 4F9WA 1MP8A 4GK4A 1REKA 3EQHA 2QNJA 2YDKA 1SNXA 4ZZOA 5GIOE 2WIPA 3TI1A 2BIKB 3H0ZA 4FTLA 3E64A 3BYMA 4GCJA 1UU7A 4TY1A 3FYKX 3F6XA 4R1YA 3ZH8A 3MESA 3Q9XA 1WBTA 2Z2WA 1NT2A 1P4OA 3QX2A 2XZSA 3W18A 2W1ZA 1L3RE 1MRVA 3RAKA 4X3JA 3OBJA 2GHMA 3P0MA 2WB8A 4A9RA 1CKPA 5CZIA 4O1PA 3UQGA 5GINE 3QTZA 3LCOA 1W84A 4GVAA 5DOSA 3E62A 3QRUA 4OTIA 4CEGA 4DG0E 1FBNA 3GGFA 3NZ0A 3MFTA 4BCOA 3OTUA 3R30A 5A4QA 1A9UA 1LUFA 2QC6A 3I0OA 4JBOA 4R7IA 4RZVA 4BVUA 3R8PA 4E7WA 3OT8A 4FYOA 4PMTA 2WMWA 5D10A 3VBXA 2C68A 3B8RA 4BZNA 1U59A 4FTAA 3RWPA 3TV6A 2R3LA 4N0SA 3KK8A 5KO1A 3HAVA 1QPDA 3LCSA 3ETAA 1OL1A 3TDVA 2BRBA 4XV1A 2WTJA 3BYVA 5A6OA 4O83A 3LFCA 5B2MA 3TXOA 1YOMA 4FZFB 3PIYA 2H8HA 2UZOA 3R0TA 4AOJA 4IX5A 4AZEA 3F7WA 2H96A 4MF1A 1KSWA 2AC3A 3BU5A 2W1HA 4TWCA 5LVMA 4BBEA 5IQBA 5DA3A 3HA8A 4F1OA 4PP7A 4II5A 2PVMA 2X2KA 4HYSA 4I93A 4ZTSA 3NEWA 3CIKA 5KUPA 4D1ZA 4EK8A 3FC2A 3HDNA 3UE4A 2ZAZA 3CY2A 4DEIA 3FL5A 1XBAA 3U6IA 3VWAA 2ZV8A 4BCHA 2R9SA 1G5SA 1MQBA 2ZJWA 4QMNA 2OLCA 4FGRA 3ZO1A 2E9PA 1PYXA 4U40A 4JL9A 3R8VA 5AFVA 3KQ7A 2J7TA 4YJVA 4FK6A 2OI4X 3UG1A 4S34A 4KS8A 1H1PA 2E9NA 4X7QA 4QPSA 4BRXA 1R0EA 3QHWA 4AW2A 3C0GA 3R9DA 5KZIA 4ZY5A 5I3OA 3HA6A 4I92A 4LRKA 4GW8A 3EQGA 4BZDA 1H1WA 2WMRA 5AM7A 4BTJA 4L6QA 1SVHA 2WZJA 4PL4A 3S1HA 3SKCA 3WI6A 1WCCA 1LP4A 4QP7A 4X6RA 5JKGA 3ZUVA 2XRUA 4YTFA 1HCKA 3UNKA 2HW6A 4AX8A 3UVRA 2HCKA 3EZVA 4EYMA 2B55A 3ZTXA 2QONA 1PXMA 4I24A 1UU9A 5AV0A 3IPHA 3BHHA 4FV9A 3VN9A 4KKGA 2XJ2A 4G3GA 3UOHA 2NO3A 1WBOA 3AGMA 5ETCA 4E6DA 4O7TA 1R3CA 3N4VA 3LLAA 3Q2JA 3GQLA 4XOYA 2O5KA 4AOIA 2JKQA 4UWYA 1YOLA 5FBNC 4IVBA 4FUXA 5CNOA 4WKQA 4F9YA 2PUUA 3GU7A 2YCRA 3G5DA 3ENMA 3ERKA 1XBBA 3D83A 2YABA 3MSSA 4FK3A 4GFOA 4M69B 2IVSA 4F7JA 3QTQA 3WBLA 4QQTA 1XH7A 4RC4A 5LMBA 2UW6A 5CU4A 3BIZA 5I9VA 3F7ZA 3WARA 4NFMA 2JDTA 2CSNA 3CBLA 2C0TA 2X2MA 2BHHA 4FV3A 4APPA 3D14A 3Q52A 3FY0A 4BI2A 2QKWB 3E92A 4JIKA 5HCZA 5D1JA 5KMNA 4LL5A 4RSSA 1XKKA 2UVXA 3KC3A 3RZBA 2R64A 3B8QA 1PXOA 2BUJA 2XNEA 4I5CA 5HE3A 4OTWA 2IZUA 4APCA 2BHEA 2IO6A 2Y6MA 3DKCA 4I1ZA 4O7LA 4W4WA 4CFNA 2FB8A 4RIYB 3QL8A 1ZMWA 4W8DA 3MH0A 4XRJA 2Q0BA 3I5ZA 3HECA 4L3JA 2HW7A 4FIFA 4ACMA 3P9JA 4IZ5A 1YXVA 3R2YA 2F57A 4E1ZA 3EQDA 4DITA 2UVYA 3DNDA 4G9RA 3VS6A 4PP9A 3W33A 4GSBA 4DHFA 1UU3A 4O81A 2KULA 4DG3E 2GS6A 4YLJA 2VUWA 3C4CA 4M7IA 3LCDA 2C3KA 5CANA 2XMYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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