3FLNC

P38 kinase crystal structure in complex with r1487
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
350
structure length
343
Chain Sequence
QERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSKPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Discovery of Pamapimod, R1503 and R1487 as Orally Bioavailable and Highly Selective Inhibitors of p38 Map Kinase
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Signaling protein, transferase
source organism Homo sapiens
total genus 110
structure length 343
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3flnC02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3flnC01
1JAMA 4ACDA 3W2RA 2E9OA 4OW8A 4O84A 4F0FA 2HZIA 3BE9A 3GQLA 4U43A 5CSPA 2VTHA 3KF7A 3GBZA 4MD7E 3QTWA 2YM7A 2R2PA 4IC7A 5HI2A 1IEPA 4PP7A 2RGPA 4PTCA 2IW6A 3F5XA 1YDTE 4O7WA 4ZSEA 5EOBA 4CV8A 4EK5A 5I3OA 3KC3A 3DBFA 4YTIA 2ZV7A 4J96A 4O7TA 3A62A 4TW9A 2YLFA 3F6XA 4LRKA 4YZDA 3DTCA 4O0WA 1ZRZA 3VBXA 3RWQA 5EKNA 4L6QA 2IWIA 4NIFB 3UG1A 5HGIA 3SAYA 3MA3A 4IIRA 4IM3A 4BGGA 3DB6A 3BX5A 5FQDC 3ZH8A 2WMXA 5E4HA 1YHVA 5IU2A 4E5AX 2ERZE 4ARKA 4C4FA 4XRLA 4EHVA 1J7LA 1M52A 4FTQA 4QMLA 2UW7A 3V04A 2O2UA 3LW0A 3ZZEA 1VYWA 4NW5A 1OI9A 4U0IA 3V01A 5IQHA 4IVBA 5AX9A 3KMUA 4UZHA 4BIEA 2PMIA 3CGOA 1Q8WA 2X9FA 4FVRA 5M53A 3FYJX 3OFMA 5EDPA 4BDJA 1OKWA 2ITXA 1CDKA 4USDA 4U8ZA 4EOOA 2Y7JA 3W2CA 4HVHA 4DTAA 2BVAA 4MK0A 3VUMA 1JWHA 3EN7A 4E73A 2BIYA 2XZSA 5DN3A 4W8EA 2C6LA 4U7ZA 4UEUA 5ETAA 3RAHA 2RIOA 2OG8A 2HOGA 1LP4A 2QOKA 1PMEA 3Q9XA 4ID7A 4X3FB 3W2PA 5IA4A 5ANJA 4MYGA 1OL6A 4BTFA 4RA4A 3W33A 1Q24A 3WF8A 4J95A 3HV5A 3FC2A 2BUJA 2IZRA 2BROA 4O1OA 3QC9A 3VVHA 5IQIA 1H27A 5IMXA 3MFRA 4ZXTA 4BCNA 4F08A 4O0SA 2JLDA 3V5TA 3QD3A 4KIQA 3NUYA 5CVFA 1H1RA 5KBQA 2Q83A 4O7SA 5DVRA 2CHLA 4FZAB 5BMSA 1H4LA 5J7BA 1GIJA 4R5YA 4KRCA 2F7XE 3UP2A 4BDAA 1R0PA 3QQLA 4QMXA 4IX6A 1S9IA 2YM8A 3W8QA 2WMRA 3JYAA 4ZZMA 3DXNA 3ZBXA 1PXLA 2JKMA 4R3CA 3FEGA 4RLLA 4AAAA 2RG6A 3V5WA 3POZA 3FI3A 3WYYA 4U40A 1KV2A 4IX5A 4R7HA 4GKIA 5IQAA 1CM8A 4L3PA 4ENXA 3ZFXA 1JBPE 2YDJA 3HMNA 5J87A 3DBCA 3QUDA 5ICPA 1S9JA 3MYGA 1OVEA 2B55A 5HQ0A 2ZM1A 2OJ9A 5DYJA 5ANEA 1YXVA 3TNIA 5AP2A 4RWJA 5K0KA 4E3CA 3G9LX 3TUDA 1U5QA 3KXXA 3QU0A 5KUPA 5FXRA 5I9VA 2JBPA 4CTBA 4CGAA 2H8HA 2G2HA 2W5AA 3NWWA 3F5GA 3S4QA 4D1XA 4JX3A 3FQHA 1P4OA 3Q5IA 1GY3A 2Z60A 1R78A 4X2FA 3VUTA 3CLYA 4YTFA 4GYGA 2PE1A 4YC8A 2CKPA 2R3QA 4F9CA 3P4KA 3HKOA 2J0LA 1H24A 3VS3A 4KD1A 4JJRA 5L8JA 2PVYA 5JGDA 2C0TA 2VUWA 3ENHA 4E4XA 3SX9A 3BPRA 2BDFA 4M0ZA 5EM7A 1RDQE 3MFSA 3WF6A 1FQ1B 3E7OA 5AR2A 5AR3A 5HKMA 4IM0A 4IAKA 3DPKA 3Q3BA 4XG6A 5CF5A 2WMTA 3NR9A 1FMOE 3AGLA 2PE0A 5E7RA 3TV7A 4W9XA 5HU3A 1MUOA 2W4KA 4MEDA 4IB0A 3ZFYA 2C4GA 3DK6A 3OXIA 3PLSA 5GINE 2KTYA 1H01A 2HZ4A 3QQJA 5FLFA 3QCQA 4J8MA 5CF6A 3R01A 1OIUA 3S95A 3FMKA 4JOAA 2QURA 4A9RA 4XP3A 3U9NA 3UYTA 1ZY4A 1XH6A 2QVSE 3ZHPC 2WTWA 2A27A 2BZKB 2PVHA 2VTQA 1PXPA 3RCJA 3NUUA 4P5ZA 5M08A 2QOIA 2WU7A 3ZC6A 2GNJA 4I5HA 4LOPA 3VQHA 1JKTA 3ELJA 3LXNA 4MAOA 4ZTQA 4YURA 4BDIA 1XH7A 4KA3A 3E8EA 3WZUA 3QZFA 1AD5A 3U4WA 4CLIA 4PMPA 4B8MA 2OIBA 5E91A 2R3KA 4QPAA 3HRCA 3O51A 2R3MA 4U81A 4E4NA 5HG8A 2CDZA 3DNDA 4D5HA 3F2NA 3HGKA 4D2VA 2IO6A 3N4VA 4ANOA 4R3PA 3EQFA 3WIGA 1UV5A 3O2MA 4CSVA 4FKQA 4EH4A 4O7ZA 3EMGA 4NM7A 4DH1A 5AAGA 5J8IA 3LOKA 5AV3A 3ZRMA 4FBXA 5IUIA 3WZDA 1QPCA 3BHTA 1YI4A 2GMXA 3UPZA 2ITOA 2QHNA 4CG8A 3EL7A 3LLTA 2HK5A 4P7EA 4PNKA 4O0YA 1ZOEA 3KVXA 4QP1A 3IECA 1R0EA 3WZKA 4F9WA 3G90X 5B2MA 1RE8A 3A2CA 2J51A 4E5BA 3QKLA 2P2HA 5C4LA 1RJBA 3LM0A 4G5PA 3HX4A 4FV9A 5HX6A 1PKDA 2FH9A 3QYZA 4KKGA 4OTGA 4MXCA 4D4RA 3EB0A 2YIYA 4L7SA 3LFEA 4EZ3A 3UE4A 3RAIA 2Y4IC 5A4TA 4Z3VA 3R8VA 4G34A 4XG3A 2VX1A 2QOQA 4JDIA 2UW3A 3F69A 5J1WA 1OIQA 3PPKA 4RA5A 2OGVA 2BAJA 5FP6A 2R0UA 4IWOA 4YSMA 4MD9E 3UNKA 4R1VA 4I5CA 2BHEA 3D9VA 3LJ2A 3ORPA 4JQEA 3Q4CA 4DGOA 1WBTA 4ZMFA 5HG7A 3VQUA 3RJCA 4Z9LA 3I7CA 2PK9A 4WT6A 3RPRA 2OF2A 4PY1A 3ATTA 3HAVA 3NEWA 3BE2A 3UVQA 4C59A 4FV6A 4XMOA 1BLXA 3R22A 3SXRA 1E9HA 3R83A 4FIIA 4PDYA 3ZXZA 1VJYA 4JG8A 1P4FA 4FEXA 3ZTXA 4FKLA 3FQSA 3B8QA 1H28A 2VO0A 4X2GA 4C0TA 2CKQA 2YWVA 4U79A 4NYEA 3U4UA 3PA4A 4YJPA 3QALE 2BPMA 4DITA 4E6QA 2OJGA 3P0MA 2VNWA 4W8DA 4ENYA 2R3GA 3FZSA 3FZ1A 3P7BA 2VZ6A 4P5QA 4L52A 2VTMA 4KABA 2YJSA 4RC4A 3VUDA 2Z7QA 4LV5A 2OH0E 4BWPA 3CR0A 4I5MA 1YOJA 4FZ7A 3CJFA 1B39A 3H3CA 5EDQA 5D41A 5E90A 1ZMVA 3LMIA 2CPKE 3MB6A 4M67A 5KKRB 1XH8A 5I9YA 3HZTA 4KSQA 3S1HA 3DZQA 3RBWA 2AUHA 4YR8A 1R3CA 1J3HA 5CT0A 2XM8A 3MWUA 5HTCA 3EHAA 2IPXA 4ZJIA 3Q04A 2C0OA 5AR8A 3OZ6A 3PPJA 2VNYA 2QOBA 3MVMA 1J1BA 5I9ZA 1GZOA 2R3NA 4RSSA 3HNGA 2CGWA 5GIPE 4D4VA 4EHEA 4OBOA 3Q52A 3AD5A 1FVTA 1W7HA 4BB4A 4DEDA 4OTWA 2VTJA 1DAWA 3ZSGA 4YJUA 5JH6A 2JAVA 3T9IA 3HUBA 4I92A 2XRUA 4XCUA 3ZLXA 4F7NA 4MNFA 1UU8A 2X39A 5B7VA 2QR8A 2W9FB 3G6HA 4D55A 3Q32A 3KRRA 4WNPA 1O6LA 2JDSA 3IS5A 3IW5A 4D2SA 3VHEA 2GQGA 3QXOA 5AP6A 2XBAA 5GZ9A 1JOWB 3QZIA 3RAKA 3ZCLA 1J91A 4L01A 4CXAA 3FXXA 2P55A 4L7FA 3FI4A 3GU7A 3MH1A 1SYKA 4HNIA 3PFQA 2R3PA 3L8VA 4JAJA 4BGHA 1ND4A 3VWAA 3NUSA 4ANBA 4O7NA 5M56A 2RG5A 3LXPA 4FNWA 3C0GA 3VAPA 4RQVA 4TXCA 2XA4A 4RJ6A 3FBVA 5CZIA 5IA5A 3MH2A 4HJOA 5JQ5A 3OCGA 3U51A 4CRLA 3LAUA 3AG9A 5BYYA 2I0VA 2PUUA 2YDIA 4EH3A 1G8AA 3R00A 2V22A 4N6ZA 5C4KA 2FGIA 2GFCA 2JIUA 5ACKA 4EH9A 4BI1A 3AC3A 1SVGA 4I22A 5FEQA 1ZWSA 4H3QA 4MCVA 4RJ7A 3RCDA 4XX9A 1YXSA 5FRIA 3FHRA 5IH5A 2X4FA 3E8DA 4KIOA 3R2YA 3BEAA 3PG3A 2ZV8A 5AAEA 1Z57A 4NW6A 5FGKA 2VO3A 4RX7A 3NUPA 4J98A 4J53A 4OBPA 1YDRE 4CMOA 4F63A 3C5UA 3G51A 2XEYA 4FSWA 4MHAA 3WZJA 1L3RE 4PDPA 1Y8YA 3I7BA 3PZEA 4TYJA 1FMKA 2ONLC 2OJIA 4X3FC 3ZONA 5CZHA 4ANSA 2JDOA 5TF9A 5FXSA 1Y6BA 5LMKA 3QZHA 5CEPA 2B9FA 5M44A 4CFFA 4IDVA 4AOJA 3TACA 4G17A 1DAYA 4GT5A 2HZ0A 2WXVA 5L2SA 3IW6A 4AGDA 3RM7A 4DH8A 3GC0A 2P4IA 4EKLA 2X2LA 2NRUA 2PZ5A 4FTJA 4R5SA 4RIOA 4F4PA 2WD1A 3IO7A 3KEXA 1Q3WA 2VWUA 4QP6A 1WAKA 4JXFA 4K11A 2PVJA 1YWRA 1YVJA 3E8NA 4BDBA 3EH9A 4IMYA 2B9IA 4XNEA 1OIRA 3GT8A 4QTEA 1ZXEA 2BTRA 2O5KA 1F0QA 3GNIB 3OS3A 4FKVA 4IADA 2XKEA 3IW7A 3OUKA 4AT3A 4KAOA 1HOWA 3FLZA 2PZPA 3FLNC 3A7FA 3KGAA 4C8BA 2P33A 1SVEA 3F3UA 3HA8A 4QRCA 5AR5A 3EYGA 3S3IA 2H96A 2GNFA 4FZDB 2ITZA 4PTGA 1ZOGA 3CE3A 1YKRA 2ETRA 4QMPA 2EB2A 3LM5A 4DF3A 1XH5A 4I6BA 4G2FA 4P90A 2PVRA 3PXQA 4YO6A 3UNJA 2BFYA 5TT7A 1GZ8A 3G5DA 3QGWA 4YPDA 3LLAA 4YTCA 5J9ZA 4ITJA 3C4WA 3GCUA 4FOBA 1QPDA 4M84A 4EHGA 3EYHA 5EG3A 4AZVA 3AC2A 3OF0A 1ERKA 3R8ZA 2QD9A 4A4LA 2C5OA 3ZMMA 2PVKA 1BKXA 3GU5A 4GCJA 3WE4A 2WFYA 2VTRA 4PPBA 3OROA 3CJGA 3FUPA 5CVGA 4F1OA 5AEPA 2XVDA 2CLQA 4JT3A 1ZYDA 4FTTA 5HO7A 4KNBA 3TJDA 3EQHA 5A54A 1OBDA 2E9UA 5AP7A 3C4EA 5EQYA 2PVMA 3OWLA 4PWNA 5HHWA 1OB3A 3QKMA 4QMZA 5JZNA 4PP9A 5ETIA 3MSSA 4ZTRA 3VC4A 4I6HA 3Q5ZA 3O23A 3MGYA 5E92A 2QHMA 3COIA 4UZDA 4FV4A 5DT3A 4Q9SA 1QCFA 3BGPA 4DYMA 5L2WA 3QRTA 1YQJA 4IB1A 4ITIA 4RIXB 4C35A 4JQ8A 3EFWA 3VS5A 4YLJA 3TT0A 3MI9A 2GDOA 4GT4A 4IJPA 4IVAA 3WOWA 5BX0A 1UKIA 3FHIA 3S2PA 2IVTA 4I23A 4MKCA 1U54B 5AUUA 2JFMA 3BWFA 4TTHB 3FMMA 3II5A 4PRJA 4FT3A 4GUBA 5C27A 1H1SA 3GXLA 3R1SA 4D4SA 4ERKA 4HNFA 5F1ZA 3NW6A 4C4IA 4I24A 4S2ZA 2GS2A 1PKGA 1NW1A 1PRYA 5IQDA 5KMIA 4WNMA 2R7IA 4Y83A 4K18A 4O83A 1KE5A 4F7LA 3RPSA 1YWNA 3VJOA 4BY9E 2GFSA 4WNOA 3KRJA 4PQNA 3AT3A 4PMMA 3A8XA 1YRPA 2YERA 3NCZA 4FV0A 4G6NA 5LQFA 3Q9ZA 5J9YA 4O22A 5IQCA 4I20A 2BILB 4C7TA 5L2IA 3U54A 1KE7A 3E3PA 4L68A 3RP9A 4EWHA 2WMBA 4LQMA 3DAEA 2VTPA 3I5ZA 2UZLA 3DDQA 4GJ2A 3VUHA 5D10A 1ZYJA 4LGDA 2O63A 4DT8A 2XS0A 2UUEA 3QHRA 4F9AA 1TVOA 1LPUA 1ZYCA 3FMJA 2QG7A 2NP8A 2B54A 4YJVA 3CGFA 5JT2A 3R9OA 1PW2A 4J7BA 4F7SA 5FM2A 3RALA 5HTIA 1NVQA 3HUCA 3NAXA 3QKKA 5IEVA 3NRMA 2BRHA 3SG9A 4N70A 3VS7A 4WIHA 3DK7A 3OWJA 1XBAA 5T68A 2GQSA 2J0MB 1BMKA 4IX3A 3PIZA 1YHWA 3WF5A 3OXZA 3LZBA 4GK3A 4MD8E 4YHJA 5HBHA 1NT2A 4AU8A 2YWPA 5ETCA 5AADA 1O9UA 4DFNA 3PDTA 3MS9A 2AYPA 4MBJA 4W9WA 2XKCA 3CKXA 5AAFA 2Y0AA 4CYIA 4OAUC 4BBEA 4BDGA 3F3TA 2IJMA 3K5VA 2Y9QA 4IC8A 5AUWA 2UVYA 1OPLA 2VO6A 4TNBA 4FVPA 4C4EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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