3FLYA

P38 kinase crystal structure in complex with 6-(2,4-difluoro-phenoxy)-2-isopropylamino-8-methyl-8h-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
349
structure length
347
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Discovery of Pamapimod, R1503 and R1487 as Orally Bioavailable and Highly Selective Inhibitors of p38 Map Kinase
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Signaling protein, transferase
source organism Homo sapiens
total genus 111
structure length 347
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3flyA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3flyA01
2RF9A 2VGPA 3ZM4A 5CAUA 4E5AX 3GT8A 3KMUA 2ETMA 4DINA 4F0IA 4OTPA 1WBOA 5ACKA 2BTSA 5I3OA 2ERZE 3FLWA 3UOLA 3VAPA 3C0IA 3QQFA 3MFUA 4G2FA 4NIFA 5GNKA 3RALA 4DFXE 2HOGA 1GZ8A 1R78A 4PMMA 3FLYA 4NWMA 1U59A 3KA0A 4FOCA 4WBBB 5H3QA 2SRCA 4JI9A 2F2CB 2B53A 4O38A 5TOZA 4C2VA 3DBQA 2VZ6A 2J6MA 4NK9A 3D5VA 5CF6A 1YQJA 4FTOA 3OVVA 2XIRA 4IB5A 3SW4A 3VHKA 4XOYA 3W1FA 3ZZWA 3C4XA 3EHAA 4FV6A 2VTSA 4FNYA 4FSWA 2XB7A 3CY3A 3EFLA 4KNBA 2ZMCA 5I9ZA 3QX2A 3DNEA 2VWUA 3DT1A 4EH4A 3RPOA 4AF3A 2GHLA 4B7TA 3BWFA 5BVNA 4RLKA 3RKBA 3CTQA 3QQHA 3V8SA 2PY3A 5F4NA 2PPQA 5HO6A 4FV2A 3UO4A 5E8TA 2B9FA 4I4FA 3UP7A 1WVYA 3NW5A 4X2NA 3P5KA 1U54A 3HMOA 3E3PA 3FYJX 3SA0A 2XCHA 5AV4A 3PRFA 1YDSE 3PIYA 4TYJA 4M8TA 1BLXA 4UEUA 4FKIA 3MJ2A 2UW4A 5HQ0A 4M97A 2GNLA 4PPBA 4RFZA 4UWCA 3MI9A 3TJCA 2ZVAA 5JMSA 1OL1A 2EU9A 4ZSJA 4AP7A 2HZ4A 2VGOA 2NPQA 4UALA 3OG7A 5H8EA 3OD6X 5CSWA 3TV7A 3MY5A 5B2MA 4GH2A 3DFCB 1H25A 3LXKA 4RWIA 4U45A 4FMQA 4WG4A 4K2RA 4NZWB 1IEPA 4UMPA 2H8HA 1JSUA 3C9WA 5EW8A 3HRBA 3C1XA 4OTIA 5CZHA 5JK3A 2J0MB 5CU3A 4BCMA 2XYNA 2J7TA 2C5YA 4RA4A 4BCIA 4ALVA 4HZSA 1LPUA 4LL0A 5E4HA 3GCQA 4AGDA 3GC9A 4E4NA 3TDVA 1QPJA 1OB3A 3E8DA 3PZHA 4ZOGA 5HTIA 3LXPA 4G5JA 5AAFA 3LQ3A 1DS5A 4F6WA 3BBWA 3TV4A 5JKGA 2NRUA 2UW3A 3KRXA 4PNIA 5ANOA 2C6OA 4EZ7A 4FEVA 4R7IA 3TXOA 4CZTA 3FZSA 4YO4A 4D2RA 1W98A 3ZYAA 4EWQA 3C4FA 5AUTA 2ZDTA 1VEBA 2Y6OA 4BDFA 2IW6A 4O0XA 3GOPA 4IAIA 3AGLA 3R28A 2WZJA 5DFPA 2XNBA 4ZZOA 4ALUA 4YSMA 2OLCA 4KRDA 4U7ZA 2UZUE 4NKAA 3TNQB 4A4LA 1XH6A 5AR8A 3V5WA 5M57A 2GTMA 2CKQA 3GU4A 3PY1A 4IVDA 4YJOA 1GIJA 3HKOA 3QQLA 2AC3A 4WSYA 1YDTE 2YM8A 2VO7A 3QXPA 4QP3A 1XHAA 4XG7A 3ZRLA 5JFXA 4PDPA 2YEXA 3Q4CA 5CZIA 4M67A 4XG2A 3WIGA 3C50A 4YZDA 4HPUE 4G34A 3EQBA 3ZXTA 5IQFA 4JT3A 4FV8A 2VO3A 3MH2A 4YMJA 3UMWA 3NYNA 4ACMA 4IFCA 1QL6A 4YC6A 3FKOA 2OIBA 5IA5A 2VTPA 5CY3A 5HO8A 2HZNA 5HE2A 5I9YA 4FKRA 2GNJA 3KREA 5EQYA 2FGIA 4WRGA 1YWRA 2R3HA 5FM3A 3FL5A 5I9VA 5GIOE 4CQGA 2UW8A 3FHRA 3CKWA 2VV9A 3WZKA 4BWKA 3SG8A 2BZKB 2JGZA 3FLNC 2OIQA 1JKSA 3KEXA 2C30A 2ETKA 2OH0E 3KRJA 5CVFA 3RAKA 2W4KA 4D2TA 2OWBA 4X2JA 5B2LA 4S34A 2O0UA 5AR5A 4F09A 4OBOA 1OL5A 2EB2A 3D15A 3HEGA 4GYGA 4PF4A 5TT7A 1RE8A 1BI7A 4D2SA 4Q2AA 3NNWA 1TQPA 2O5KA 2IVVA 3PIXA 3PVUA 2ZB0A 3ENMA 3P86A 4YURA 3IDCA 3C4EA 3GOKA 5IPJA 2Z7RA 5K5XA 1YHSA 4Z7GA 2BRMA 3G0EA 3NAXA 4OGRA 4YJPA 5DGZA 4I3ZA 4EQMA 3BBTB 4JDHA 3UC4A 4YLJA 4ZMFA 1URWA 1XH7A 4BDAA 4AQCA 5E1SA 2O64A 3FZOA 4BIBA 3I6WA 1J3HA 4RIXB 5A3XA 3BWJA 3H4JA 5HD7A 5K4IA 2JFMA 2G1TA 4IFGA 3BHVA 4KBKA 3KGAA 1OIYA 3ZSHA 5CAPA 4UBAA 4H39A 3F2AA 4FK6A 2A1AB 3KN6A 5C8NA 3BEGA 4FV1A 4APPA 4DG3E 2WMQA 3HZTA 4KIPA 2R3MA 3IW8A 2WMBA 4W9WA 3LFCA 2GDOA 4FV5A 4EHGA 3QUPA 3FI2A 3DV3A 3D14A 3D83A 3CJGA 3W8LA 3ZH8A 3LMHA 4X7QA 1KE7A 4GIIA 4NT4A 1SNUA 5IKWA 4A9RA 3ZHPC 2UW5A 5IUHA 5GINE 1OKVA 4WG5A 2JKKA 1J91A 3PIZA 3LXLA 4FTLA 4O0WA 4JQEA 5EM7A 2XUUA 4EOLA 4TNBA 3OCGA 5BVDA 5K9IA 5M4CA 3DKGA 5CEKA 1UNHA 2CHLA 2C4GA 3IW6A 4YTHA 5B2KA 2VTJA 2C5NA 5HICA 4QP9A 2A19B 4GFMA 3GU8A 3PLSA 1YI3A 4O7RA 4QTBA 3NVKI 2IW8A 2HY0A 2AUHA 2Y7JA 2WTKC 4U0IA 4V0GA 5EYDA 3Q9WA 4KBAA 2XKCA 4UWYA 1H01A 4O21A 1LUFA 1NVQA 4QP1A 3HVCA 4IACA 3BLQA 3UTOA 3UOHA 4AG8A 3EL8A 3PYYA 3I60A 5IMEA 1PXLA 4IWOA 3MDYA 4KIQA 4C62A 2VTRA 4YTCA 2XJ2A 3LCDA 2YIYA 4NFMA 3LKMA 1G3NA 5D7AA 3KCFA 3C4WA 3T3VA 4OBQA 4ERWA 4OBPA 3AT4A 2GSFA 5J7BA 2XCKA 3BU5A 4AE9A 1UU8A 2PUIA 3FLQA 2QNJA 2O3PA 1BL7A 3QZHA 4G3DA 3ID6C 2QO7A 4RX9A 5CVHA 3PA5A 4QP2A 2WELA 3VS4A 2OBJA 3ORIA 2Q0BA 3TZ9A 4DGGA 3MYGA 5M51A 1OIUA 4FKTA 3NNXA 3R9HA 1K3AA 2JEDA 4F7NA 2J2IB 3S95A 1XBAA 4FYNA 1VJYA 4LOQA 3R7GA 5AV2A 2FVDA 3GC8A 3TTJA 2LAVA 4C58A 4I5HA 3I79A 5C26A 5IUGA 1JAMA 5JRQA 4D58A 2VTOA 3RPYA 5E8YA 3A8WA 2XZSA 3MH1A 3AMBA 3WBLA 3QWJA 4BKYA 4PY1A 4FEUA 3KF4A 1XH4A 2YCRA 4IAFA 3UVPA 5KMMA 3QYZA 4AGCA 3Q52A 2VRXA 1OZ1A 2Z7SA 4DTKA 4JBQA 3W55A 2ITZA 1R39A 3DU8A 3KXHA 3ZO2A 3O17A 1IRKA 5AX9A 4EC8A 4DBNA 2UW9A 5J1VA 2QO9A 2QOQA 4PP9A 3G5DA 3LLTA 3LZBA 1U46A 3EQHA 4XRJA 2X2KA 4I21A 3RZBA 5M44A 4BCOA 3LM0A 3BKBA 2VTNA 5ANJA 4F7SA 1KUTA 1SVGA 3CGOA 5IQGA 5FP6A 4PTGA 4ZJJA 2XM9A 4KABA 4TXCA 3ZO4A 5CU0A 3ERKA 3IQ7A 3LIJA 4B9DA 4QMTA 3UNKA 4WO5A 3QC4A 1XQZA 2Z8CA 5EYCA 2A2AA 2HY81 4FSMA 1Q8UA 3PZEA 4U40A 4X3FA 4O84A 2XMYA 2XRWA 4CCUA 2EB3A 4YJVA 3BU6A 3TWJA 2G01A 3DBEA 3CP9A 5AIRA 5DLSA 1BYGA 3GB2A 3EKNA 4G6NA 4CFWA 5D11A 4X21A 3JPVA 4DFLA 5AFVA 4ASXA 3NW6A 3OROA 2XK9A 3EMGA 3V6SA 3P9JA 2JITA 4Q5HA 5AX3A 5KMOA 2OXDA 3QLGA 4JDIA 3SRVB 4ITIA 4AGUA 2OJJA 5GZ8A 4GG7A 4LOOA 4LG4A 5M53A 4FSNA 3OOGA 3EQPA 1JWHA 3COKA 4X2GA 2WQNA 1LEWA 4FT9A 3JUHA 5ICPA 1WZYA 5CALA 4IJ9A 4EH3A 2W0JA 4PPAA 4BF2A 1M2PA 3KXXA 4MXOA 1EH4A 3GQIA 4BC6A 4BVUA 3VBYA 1GJOA 4TTHB 1YXTA 4GIHA 1PXMA 3EZVA 2HW6A 4IZ5A 3PG1A 3MFRA 3GP0A 4HYHA 4PWNA 4O96A 2CSNA 5KBQA 3VS5A 1YHWA 1F0QA 4JG7A 4I5MA 3DBFA 1IR3A 3AC3A 2UVZA 2JIVA 3FXXA 4YU2A 4FTMA 4KRCA 1QMZA 4U8ZA 3QCXA 4UMUA 2R0IA 2REIA 3R1SA 2EXMA 3FMKA 2W99B 4YLKA 3C5IA 2JBPA 4QQ5A 2WMSA 3F3WA 1BX6A 4AA0A 5C8KA 1TQIA 2B4SB 4IJPA 5HKMA 3IW7A 1NY3A 1GIHA 2UZVA 3PUPA 4RPVA 1R0PA 2JKOA 1AQ1A 2WTIA 1SYKA 3KULA 2GHMA 3GU6A 4D4RA 2AC5A 4G5PA 4GT4A 4IWQA 3ANQA 4OTWA 2GQSA 3I5ZA 4OW8A 3MY1A 3QA8A 2CN5A 2X8EA 4CG9A 2I0HA 3GQLA 3AMYA 1XO2B 3M2WA 4USEA 4M69B 2YZAA 2UZNA 4GU9A 3JR1A 4I6BA 1VZOA 5AV3A 3UIXA 4IX4A 3VUMA 3VS1A 4CQEA 1T46A 3EN7A 4YO6A 4FEXA 4B0GA 2OKRA 4RJ7A 3VO3A 3F66A 4FT3A 3ZLSA 3E8NA 4RIYB 1R1WA 5DWRA 3HDNA 4BDDA 2WTVA 5TE0A 2QG5A 1MRVA 4BYJA 3HV5A 2OZAB 4ZY4A 5IDNA 1PYXA 1Q3WA 2EWAA 2H96A 3LFDA 4YZNA 5LMAA 3R00A 3A2CA 4XV3A 4HGTA 2FYSA 4IB3A 3CR0A 2FA2A 3IPHA 3Q3BA 5TO8A 2QOIA 5EOBA 4I92A 4M68A 5DMZA 2WTKB 3QHWA 3S0OA 3O50A 1KE5A 3QZGA 5I9UA 3QCYA 3R01A 4QMVA 5IMXA 2H34A 4MF1A 3FZRA 2XIXA 5BYYA 4U79A 1TQMA 4FR4A 4BCJA 4UYAA 3VIDA 3LJ2A 2V22A 5LVPA 2GPHA 4MD7E 1P4OA 2C6LA 3Q9YA 4GSBA 4C4IA 4O7VA 2R3FA 3VRYA 2P55A 3BHYA 1ZMWA 3MVJA 4MXXA 4EONA 5KKRC 5LMBA 3AGMA 2VWBA 2W4JA 4BHNA 3MY0A 3UDBA 5J9YA 3DLZA 4C35A 3JY9A 4C3FA 3CPCA 4XX9A 3IG7A 5K4JA 4EL9A 5IUIA 4FL3A 1KSWA 4G9RA 3DB6A 5BNJA 4ZSLA 2HWPA 3DDQA 2YIXA 3HX4A 3LQ5A 4FZ7A 4RIWB 3ZXZA 2R3PA 5A4CA 5LMKC 5FTGA 4AUAA 1ZARA 4F1TA 5IQCA 3CC6A 4RQVA 2GU8A 1M2RA 4DLJA 4WNMA 4E6QA 5KMIA 3KL8A 4BDBA 1NW1A 5JZJA 3OC1A 4L00A 5EI2A 3Q9ZA 2XK8A 3OF0A 2ONLC 4AZVA 3FMDA 5HTBA 3COHA 3A60A 2B52A 4C36A 3VUKA 2UZDA 1FMOE 3A7JA 3U6HA 4BRXA 4DEIA 1J1BA 4X6RA 3ZRMA 4A06A 4Y8DA 4JAJA 3WF6A 4IM0A 1FVTA 2VTMA 3C0HA 2ITXA 3FQHA 2ITQA 2Y0AA 3D2KA 3QQJA 3ANRA 4PMSA 3FMJA 4ENYA 1V1KA 4KS7A 4FI1A 5EOLA 3U4WA 1VYZA 2JDRA 2OIDA 3WI6A 5JSMA 3Q96A 1H07A 2JLDA 5L3AA 4FA2A 3QKLA 3OXTA 2CNQA 2QCSA 4KD1A 3DGKA 3VWAA 1ZLTA 3RK7A 2HYYA 1H28A 1UV5A 2VX3A 4DEDA 4JX7A 4D2WA 5EDRA 4DN5A 3QA0A 5EM6A 3MTFA 1QPEA 3Q6WA 4BTMA 4BTFA 4F7JA 2C5OA 4BIEA 3KRLA 1Q3DA 2X7FA 4MNEB 1FINA 5DR2A 1M2QA 1Q8TA 1WBTA 4ZIMA 3KC3A 2X0GA 3EOCA 2C0OA 4JAIA 4FC0A 3F5XA 3W2CA 4N6ZA 2H6DA 2OK1A 2DYLA 3NLBA 3RZFA 3K5UA 2Z2WA 4I0TA 4KSPA 1W84A 2I0EA 3R2YA 3WARA 4E5WA 3HGKA 2OO8X 5IQHA 2VTTA 3WYXA 4AOTA 3EFJA 4EH2A 1YOJA 4DTAA 4E6AA 4MEDA 1A06A 3KMWA 2Y8OA 3QD4A 4N70A 4FICA 1PHKA 2BRNA 5LVLA 4DEAA 4BBEA 4G3GA 4EORA 3Q6UA 3WE4A 4FG8A 4EH8A 5C1QB 4AZWA 3ALOA 3R8ZA 3U51A 3FPMA 4FV7A 4ZP5A 3RK5A 2Z02A 1CKPA 3PWYA 3D0EA 4IHPA 3PXRA 1LR4A 3MV5A 3BYOA 4HNFA 4K9YA 3QQKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1IA8 A;  5ANG A;  3UO6 A;  4W9X A;  4J71 A;  4C34 A;  1Q8Y A;  2VWZ A;  1H1P A;  4O6E A;  1MRY A;  1H0V A;  4LV5 A;  2YA9 A;  3DND A;  2DS1 A;  2JAV A;  5HVJ A;  5KHX A;  3W2S A;  4CV8 A;  2YM4 A;  4EEV A;  5FUT A;  4JXF A;  3PP0 A;  3DZQ A;  3MA3 A;  5EH0 A;  2ITW A;  3R7E A;  3FKL A;  5CU2 A;  3R22 A;  3QLF A;  3BV2 A;  4FYO A;  5HD4 A;  4AZT A;  2HWO A;  3S3I A;  5C4L A;  5G1X A;  4PMT A;  4L9I A;  3THB A;  2C3I B;  3F61 A;  3OP5 A;  4FUX A;  4FEQ A;  2OZO A;  2IN6 A;  1YDR E;  2X7G A;  2BHH A;  2XRU A;  3GCP A;  2XIK A;  4FVQ A;  4MF0 A;  5ANI A;  3TNI A;  2C6E A;  3VW8 A;  4TYG A;  3MIA A;  4HJO A;  4OTF A;  4L01 A;  5EW3 A;  5KKR B;  2WMR A;  1OBD A;  2GQR A;  4BZD A;  5HOA A;  2WIH A;  5DE2 A;  3Q9X A;  4IDT A;  2P33 A;  3TJD A;  4L53 A;  4R1Y A;  1ZMU A;  4TKS A;  5DBX A;  3RWP A;  4CCB A;  3SD0 A;  5CXZ A;  1APM E;  2X9F A;  2HEN A;  4UMT A;  3FZP A;  3CD3 A;  4YPS A;  3SKC A;  3ZON A;  4DEH A;  4AE6 A;  2YDJ A;  5GZ9 A;  5BVE A;  3FME A;  4O6L A;  4YTI A;  4IB0 A;  5CAN A;  3ZBX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2RF9 A;  2VGP A;  3ZM4 A;  5CAU A;  4E5A X;  3GT8 A;  3KMU A;  2ETM A;  4DIN A;  4F0I A;  4OTP A;  1WBO A;  5ACK A;  2BTS A;  5I3O A;  2ERZ E;  3FLW A;  3UOL A;  3VAP A;  3C0I A;  3QQF A;  3MFU A;  4G2F A;  4NIF A;  5GNK A;  3RAL A;  4DFX E;  2HOG A;  1GZ8 A;  1R78 A;  4PMM A;  3FLY A;  4NWM A;  1U59 A;  3KA0 A;  4FOC A;  4WBB B;  5H3Q A;  2SRC A;  4JI9 A;  2F2C B;  2B53 A;  4O38 A;  5TOZ A;  4C2V A;  3DBQ A;  2VZ6 A;  2J6M A;  4O4C A;  4NK9 A;  3D5V A;  5CF6 A;  1YQJ A;  4BJJ B;  4FTO A;  3OVV A;  2XIR A;  4IB5 A;  3SW4 A;  3VHK A;  4XOY A;  3W1F A;  3ZZW A;  3C4X A;  3EHA A;  4FV6 A;  2VTS A;  4FNY A;  4FSW A;  2XB7 A;  4AAY A;  3CY3 A;  3EFL A;  4KNB A;  2ZMC A;  5I9Z A;  3QX2 A;  3DNE A;  2VWU A;  3DT1 A;  4EH4 A;  3RPO A;  4AF3 A;  2GHL A;  4B7T A;  3BWF A;  5BVN A;  4RLK A;  3RKB A;  3CTQ A;  3QQH A;  3V8S A;  2PY3 A;  5F4N A;  2PPQ A;  5HO6 A;  4FV2 A;  3UO4 A;  5E8T A;  2B9F A;  4I4F A;  3UP7 A;  1WVY A;  3NW5 A;  4X2N A;  3P5K A;  1U54 A;  3HMO A;  3E3P A;  3FYJ X;  3SA0 A;  2XCH A; 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